Chromosome 19

Chromosome 19 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Leukaemia
t(1;19)(q23;p13)

t(1;19)(p13;p13.1)

t(2;19)(p11;p13)

t(2;19)(p12;q13) IGK/BCL3

t(3;19)(q27;q13) (NHL; BCL6 and NAPA; rare)

t(7;19)(q34;p13)

t(8;19) (p11;q13)

t(8;19)(p12;q13)

t(11;19)(q23;p13.1)

t(11;19)(q23;p13.3)

t(14;19)(q32;q13) IGH/BCL3

t(14;19)(q32;q13) IGH/CEBPA

t(17;19)(q22;p13)

Trisomy 19

t(19;21)(q13.4;q22)

t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL

Solid Tumors
t(2;19)(p23;p13)

t(2;19)(p23;p13.1)

t(2;19)(p23;p13.1)

t(11;19)(q21;p13)

t(11;19)(q11;q13.4)

t(11;19)(q21-22;p13)

t(15;19)(q14;p13)

Cancer prone diseases
Congenital neutropenia

Diamond-Blackfan anemia (DBA)

Peutz-Jeghers syndrome

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 19 by location

Losses / Amplicons

BONE/SOFT TISSUE

BREAST

DIGESTIVE TRACT

ENDOCRINE GLANDS

EYE

FEMAL GENITAL

HEMATOLOGIC

MALE GENITAL

NERVOUS SYSTEM

RESPIRATORY TRACT

SKIN

URINARY TRACT

External links

Chromosome 19 - HUGO Chromosomes

Chromosome 19 - GoldenPath - Santa Cruz

Chromosome 19 - Ensembl Project

Chromosome 19 - Map View - NCBI

Chromosome 19 - GDB (Genome Data Base)

Chromosome 19 - OMIM Gene map

Chromosome 19 - Genomic Variants

Chromosome 19 - HAPMAP Project

Chromosome 19 - Genome Channel - ORNL

Chromosome 19 - LaunchPad HGMIS

Chromosome 19 - Human Protein Atlas

Chromosome 19 - SpliceNest

Human BAC Resource (NCBI)

FISH-mapped BACs (CCAP)

Genetic Maps (CHLC)

YACs mapped by FISH (Bari)

PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)

Positional Cloning Project (Berlin Dahlem)

Mouse homology - OMIM - NCBI

Cancer GeneWeb

GeneCards (Weizmann)

Human Proteomics Initiative (Expasy)

Genes
Annotated genes
Ordered by Name	Ordered by Location
	Kb	pter-qter
AKT2	45428.064	19q13.1-q13.2
AMP19	61084.442	19q13
BBC3	52415.921	19q13.3-q13.4
BCL2L12	54860.211	19q13.3
BRD4	15218.847	19p13.1
CARD8	53403.155	19q13.3
CBLC	49972.988	19q13.2
CD97	14353.213	19p13
CEBPA	38482.776	19q13.1
CRTC1	18655.425	19p13
DNMT1	10105.022	19p13.2
DYRK1B	45007.830	19q12-q13.1
ELAVL1	7929.457	19p13.2
ELL	18414.473	19p13.1
ERCC1	50604.712	19q13.32
ERCC2	50546.686	19q13.3
FXYD5	40337.467	19q13.12
GDF15	18357.968	19p13.11
ICAM1	10242.517	19p13.3-p13.2
JAK3	17796.593	19p13.1
JUNB	12763.310	19p13.13
JUND	18251.563	19p13.2
KLK10	56207.812	19q13
KLK11	56217.299	19q13.33
KLK5	56138.371	19q13.33
LIG1	53310.515	19
LYL1	13070.847	19p13.2
MARK4	50446.682	19q13.3
MIRN125A	56888.319	19
MLLT1	6161.392	19p13.3
MUC16	8820.520	19p13.2
NOTCH3	15131.444	19p13.2-p13.1
PAF1	44568.110	19q13.1
PPP1R13L	50574.737	19q13.32
RELB	50196.552	19q13.32
SH3GL1	4311.367	19p13.3
SMARCA4	10932.598	19p13.2
STK11	1156.798	19p13.3
TCF3	1560.295	19p13.3
TFPT	59302.142	19q13
TPM4	16048.325	19p13.1
VAV1	6723.722	19p13.2
ZNF146	41397.344	19q13.1
Other genes possibly implicated in cancer
Ordered by Name	Ordered by Location
	Kb	pter-qter
ABHD9	15198.730	19p13.13
ACP5	11546.475	19p13.3-p13.2
ACPT	55985.484	19q13.4
ACTN4	43830.167	19q13
ADAMTS10	8551.126	19p13.3
ADCK4	45889.274	19q13.2
AES	3003.908	19p13.3
AKAP8	15325.335	19p13.1
AKT1S1	55064.109	19q13.33
ALKBH6	41191.862	19q13.12
ALKBH7	6323.444	19p13.3
AMH	2200.113	19p13.3
ANGPTL4	8335.011	19p13.3
ANGPTL6	10064.013	19p13.2
AP1M2	10544.347	19p13.2
AP2A1	54961.992	19q13.3
AP3D1	2051.993	19p13.3
APC2	1401.148	19p13.3
APLP1	41051.241	19q13.1
APOC1	50109.761	19q13.2
APOE	50100.879	19q13.31
ARHGEF1	47079.107	19q13.13
ARHGEF18	7351.866	19p13.3
ARID3A	877.037	19p13.3
ASF1B	14091.321	19p13.12
ATF5	55123.786	19q13.3
ATG4D	10515.647	19p13.2
ATP8B3	1733.074	19p13.3
AURKC	62434.240	19q13.3-qter
AXL	46416.948	19q13.1
AZU1	778.831	19p13.3
B3GNT8	46623.104	19q13
BAX	54149.929	19q13.3-q13.4
BCAM	50004.178	19q12-q13
BCL3	49943.818	19q13.1-q13.2
BIRC8	58484.666	-
BRSK1	60487.346	19q13.4
BSG	523.537	19p13.3
BTBD14B	13090.109	19p13.13
C19orf33	43486.644	19q13.2
C19orf40	38154.988	19q13.11
C19orf48	55992.773	19q13.33
C19orf53	13746.257	19p13.13
C19orf6	960.650	19p13.3
C3	6628.846	19p13.3-p13.2
CADM4	48818.362	19q13.32
CALR	12910.423	19p13.3-p13.2
CALR3	16450.875	19p13.11
CARM1	10843.253	19p13.2
CASP14	15024.015	19p13.1
CCL25	8023.934	19p13.2
CCNE1	34994.741	19q12
CD209	7710.882	19p13
CD22	40511.919	19q13.1
CD33	56420.147	19q13.3
CD37	54530.489	19q13.3
CD3EAP	50601.307	19q13.3
CD70	6536.850	19p13
CD79A	47073.030	19q13.2
CDC34	482.733	19p13.3
CDC37	10362.809	19p13.2
CDKN2D	10538.138	19p13
CEACAM1	47703.298	19q13.2
CEACAM3	46992.374	19q13.2
CEACAM4	46817.184	19q13.2
CEACAM5	46904.370	19q13.1-q13.2
CEACAM6	46951.341	19q13.2
CEACAM7	46869.075	19q13.2
CEACAM8	47776.235	19q13.2
CEBPG	38556.449	19q13.11
CGB	54217.939	19q13.3
CGB5	54238.914	19q13.32
CHAF1A	4353.660	19p13.3
CHMP2A	63754.745	19q13.43
CIB3	16133.179	19p13.12
CIC	47480.657	19q13.2
CIRBP	1220.267	19p13.3
CLC	44913.735	19q13.1
CLPP	6312.463	19p13.3
CLPTM1	50150.478	19q13.3
CNN1	11510.579	19p13.2-p13.1
COMP	18754.583	19p13.1
COPE	18871.323	19p13.11
COX6B1	40830.995	19q13.1
COX6B2	60552.882	19q13.42
COX7A1	41333.664	19q13.1
CSNK1G2	1892.161	19p13.3
CXCL17	47624.535	19q13.2
CYP2A13	46286.208	19q13.2
CYP2A6	46041.283	19q13.2
CYP2B6	46189.044	19q13.2
CYP2F1	46312.193	19q13.2
CYP2S1	46390.955	19q13.1
CYTH2	53664.424	19q13.32
DACT3	51842.709	19q13.32
DAND5	12941.432	19p13
DAPK3	3909.452	19p13.3
DDX39	14380.631	19p13.13
DDX49	18891.494	19p12
DHX34	52544.386	19q13.3
DIRAS1	2665.565	19p13.3
DLL3	44681.397	19q13.2
DMPK	50964.816	19q13.3
DNAJB1	14486.582	19p13.2
DOT1L	2115.148	19p13.3
DPP9	4626.244	19p13.3
EEF2	3927.054	19pter-q12
EFNA2	1237.168	19p13
EGLN2	45998.021	19q13
EID2	44721.287	19q13.2
ELA2	803.291	19p13.3
EMP3	53520.441	19q13.3
EPOR	11349.475	19p13.3-p13.2
ERF	47443.557	19q13
ETV2	40824.487	19q13.11
EXOC3L2	50407.719	19q13.32
EXOSC5	46584.116	19q13.1
F2RL3	16860.826	19p12
FARSA	12894.284	19p13.2
FBL	45016.938	19q13.1
FBXL12	9781.943	19p13.2
FBXO46	50905.727	19q13.3
FCAR	60077.361	19q13.2-q13.4
FCER2	7659.662	19p13.3
FEM1A	4742.728	19p13.3
FFAR1	40534.295	19q13.1
FGF21	53951.156	19q13.1-qter
FGF22	590.926	19p13.3
FKBP8	18503.568	19p12
FLT3LG	54669.298	19q13.3
FOSB	50663.093	19q13.32
FOXA3	51059.358	19q13.2-q13.4
FPR1	56940.838	19q13.41
FPR2	56956.265	19q13.3-q13.4
FSD1	4255.691	19p13.3
FSTL3	627.389	19p13
FTL	54160.378	19q13.3-q13.4\|19q13.3
FUT1	53943.080	19q13.3
FUT2	53891.040	19q13.3
FUT3	5793.899	19p13.3
FUT5	5816.837	19p13.3
FUT6	5781.637	19p13.3
FXYD3	40298.639	19q13.11-q13.12
FZR1	3473.954	19p13.3
GADD45B	2427.135	19p13.3
GADD45GIP1	12925.972	19p13.2
GAPDHS	40716.154	19q13.1
GDF1	18840.361	19p12
GIPC1	14449.571	19p13.1
GLTSCR1	52803.265	19q13.3
GLTSCR2	52940.620	19q13.3
GNA11	3045.408	19p13.3
GNA15	3087.191	19p13.3
GNG7	2462.218	19p13.3
GNG8	51829.173	19q13.32
GPI	39547.909	19q13.1
GPR4	50784.865	19q13.3
GPX4	1054.936	19p13.3
GSK3A	47426.178	19q13
GTF2F1	6330.580	19p13.3
GZMM	495.027	19p13.3
HAMP	40465.250	19q13.1
HAS1	56908.177	19q13.4
HCST	41085.222	19q13.1
HIF3A	51493.499	19q13
HIPK4	45577.018	19q13.2
HKR1	42517.420	19q13.12
HMG20B	3523.943	19p13.3
HPN	40223.250	19q11-q13.2
HSPB6	40937.310	19q13.13
HSPBP1	60465.403	19q13.42
ICAM3	10305.452	19p13.3-p13.2
ICAM4	10258.650	19p13.2-cen
ICAM5	10261.655	19p13.2
IER2	13122.282	19p13.13
IFI30	18145.579	19p13.1
IL11	60567.569	19q13.3-q13.4
IL12RB1	18031.371	19p13.1
IL27RA	14003.262	19p13.11
IL28A	44450.997	19q13.13
IL29	44478.805	19q13.13
IL4I1	55084.723	19q13.3-q13.4
INSL3	17788.322	19p13.2-p12
INSR	7063.266	19p13.3-p13.2
IRF3	54854.641	19q13.3-q13.4
ISOC2	60656.168	19q13.42
ISYNA1	18406.625	19p13.11
ITGB1BP3	3884.101	19p13.3
JMJD2B	4920.124	19p13.3
KCNN4	48962.525	19q13.2
KEAP1	10457.796	19p13.2
KHSRP	6364.119	19p13.3
KIR2DL1	59973.077	19q13.4
KIR2DS4	60035.986	19q13.4
KIR3DL1	60019.705	19q13.4
KIR3DL2	60053.710	19q13.4
KISS1R	868.342	19p13.3
KLK1	56014.216	19q13.3
KLK12	56224.160	19q13.33
KLK13	56251.275	19q13.33
KLK14	56272.966	19q13.3-q13.4
KLK15	56020.357	19q13.4
KLK2	56068.501	19q13.33
KLK3	56049.983	19q13.41
KLK4	56101.420	19q13.3-q13.4
KLK6	56153.700	19q13.3
KLK7	56171.541	19q13.33
KLK8	56191.076	19q13
KLK9	56197.581	19q13.33
KLKP1	56077.163	19q13.41
LDLR	11061.057	19p13.3
LGALS13	44785.009	19q13.1
LGALS4	43984.151	19q13.2
LGALS7	43953.448	19q13.13
LGALS7B	43971.690	19q13.2
LHB	54211.049	19q13.32
LILRB4	59865.936	19q13.4
LPAR2	19595.466	19p12
LSM4	18278.717	19p13.11
LSR	40431.399	19q13.12
LTBP4	45794.981	19q13.1-q13.2
LYPD3	48656.786	19q13.31
M6PRBP1	4789.346	19p13.3
MAG	50534.289	19q13.1
MAP2K2	4041.320	19p13.3
MAP2K7	7874.765	19p13.3-p13.2
MAP3K10	45389.491	19q13.2
MAP4K1	43770.121	19q13.1-q13.4
MAST1	12810.348	19p13.2
MAST3	18069.603	19p13
MATK	3728.967	19p13.3
MBD3	1527.678	19p13.3
MBD3L1	8814.332	19p13.2
MBD3L2	7000.351	19p13.3
MBOAT7	59368.921	19q13.4
MED29	44573.803	19q13.2
MEX3D	1505.668	19p13.3
MIA	45973.140	19q13.32-q13.33
MIRN199A1	10789.102	19
MIRN372	58982.956	19
MIRN373	58983.771	19
MKNK2	1988.470	19p13.3
MLL4	40900.761	19q13.1
MORG1	12638.628	19p13.13
MUM1	1306.010	19p13.3
MYO1F	8491.997	19p13.3-p13.2
NACC1	13090.109	19p13.13
NAPA	52682.703	19q13.33
NAPSA	55553.546	19q13.33
NCR1	60109.338	19
NFKBIB	44082.455	19q13.1
NLRP2	60169.583	19q13.42
NLRP7	60126.689	19q13.42
NOVA2	51134.631	19q13.3
NR1H2	55571.497	19q13.3
NR2F6	17203.694	19p13.1
NRTN	5774.818	19p13.3
NTF4	54256.209	19q13.3
NUCB1	54095.853	19q13.33
NUMBL	45863.652	19q13.13-q13.2
NY-SAR-48	17021.571	19p13.11
OAZ1	2220.520	19p13.3
PAK4	44308.260	19q13.2
PBX4	19533.522	19p12
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PDE4A	10392.333	19p13.2
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VRK3