Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 11

Chromosome 11 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 11 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

t(1;11)(p32;q23) (AML, ALL; AF1P and MLL; not rare)
t(1;11)(q23;p15)
t(1;11)(q21;q23)
t(2;11)(p21;q23)
t(2;11)(q11;q23)
t(2;11)(q31;p15) (MDS, AML; NUP98 and HOXD13; rare)
t(2;11)(q31;p15) (MDS, AML; NUP98 and HOXD11; rare)
t(2;11)(q37;q23) (AML; SEPT2 and MLL; rare)
t(2;11)(q37;q23) in AML
t(3;11)(p21;q23)
t(3;11)(p24;p15) (AML; NUP98 and TOP2B; rare)
t(3;11)(q21;q23) (AML; EEFSEC and MLL; rare)
t(3;11)(q26;p15)
t(3;11)(q27;q23) (NHL; BCL6 and OBF1, rare)
t(3;11)(q28;q23)
t(3;11)(q29;p15)
t(4;11)(p12;q23)
t(4;11)(q21;p15)
t(4;11)(q35;q23)
t(4;11)(q21;q23)
ins(5;11)(q31;q13q23)
t(5;11)(q31;q23)
t(5;11)(q33;p13)
t(5;11)(q35;p15.5)
t(6;11)(q13;q23)
t(6;11)(q15;q23)
t(6;11)(q21;q23) (AML, T-NHL; AF6q21 and MLL; rare)
t(6;11)(q27;q23)
t(7;11)(p15;p15)
t(7;11)(q35;p13)
t(8;11)(p11;p15)
t(8;11)(p12;p15)
t(9;11)(q34;q23) FBP17/MLL
t(9;11)(p22;p15)
t(9;11)(q34;p15)
t(9;11)(q34;q23) (AF9q34-MLL)
t(9;11)(p22;q23)
t(X;11)(q13;q23)
t(X;11)(q21;q23)
t(X;11)(q24;q23) (AML; SEPT6 and MLL; rare)
t(10;11)(p13;q21)
t(10;11)(p11.2;q23)
t(10;11)(q22;q23)
t(10;11)(q25;p15)
t(10;11)(p12;q23)
11p15 rearrangements in treatment related leukemia
11q23 rearrangements in childhood acute lymphoblastic leukemia
11q23 rearrangements in leukaemia
11q23 rearrangements in therapy related leukaemias
del(11)(p12p13)
del(11q) in non-Hodgkin's lymphoma (NHL)
inv(11)(p15q22)
inv(11)(q21;q23) in therapy related leukemias
MLL amplification in leukemia
+11 or trisomy 11 (solely)
t(11;11)(q13;q23)
t(11;12)(p15;p13)
t(11;12)(q23;q13) (/HMGA2)
t(11;12)(q23;q13) (MLL/CIP29)
t(11;14)(p13;q11)
t(11;14)(q13;q32)
t(11;14)(q13;q32) in multiple myeloma
t(11;14)(p11;q32)
t(11;14)(p15;q11)
t(11;14)(q23;q24)
t(11;14)(q23;q32)
t(11;15)(q23;q14)
t(11;16)(q23;p13.3)
t(11;17)(q23;q21)
t(11;17)(q13;q21)
t(11;17)(q23;q25)
t(11;17)(q23;p13)
t(11;17)(q23;q12) MLL/RARa
t(11;17)(p15;p13)
t(11;17)(q23;q12-21) MLL/AF17
t(11;17)(q23;q12-21) MLL/LASP1
t(11;18)(q21;q21)
t(11;19)(q23;p13.1)
t(11;19)(q23;p13.3)
t(11;19)(q23;p13.3) MLL/ACER1
t(11;20)(p15;q11)
t(11;20)(q23;q11)
t(11;21)(q13;q22)
t(11;12)(p15;q13)
t(11;22)(q23;q11.2)
t(11;22)(q23;q13)

Solid Tumors     

t(2;11)(p23;p15)
t(2;11)(p23;p15)
t(6;11)(p21;q12)
t(11;12)(q23;q15)
t(12;13)(q14;q12)
t(11;16)(q13;p13)
t(11;19)(q21;p13)
t(11;19)(q11;q13.4)
t(11;19)(q21-22;p13)
t(11;22)(p13;q11)
t(11;22)(q24;q12)
t(11;22)(p13;q12)

Cancer prone diseases     

Ataxia telangiectasia
Beckwith-Wiedemann syndrome
Frasier syndrome (FS)
Hemihyperplasia isolated
Multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1)
Multiple endocrine neoplasia type 2 (MEN2)
WAGR (Wilms' tumor/aniridia/genitourinary anomalies/mental retardation syndrome)

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 11 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 11 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 11 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 11 - Ensembl Project
  • Chromosome 11 - Map View - NCBI
  • Chromosome 11 - OMIM Gene map
  • Chromosome 11 - Genomic Variants
  • Chromosome 11 - HAPMAP Project
  • Chromosome 11 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 11 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 11 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 11 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 11 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 11 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 11 Cancer GeneWeb
  • Chromosome 11 GeneCards (Weizmann)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

    • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    APLNR 57001.054 11q12
    ARHGAP20 110447.766 11q23.1
    ARHGEF12 120207.946 11q23.3
    ATM 108093.559 11q22-q23
    B3GNT6 76745.435 11q13.4
    BAD 64037.301 11q13.1
    BIRC2 102217.966 11q22
    BIRC3 102188.194 11q22
    BRMS1 66104.804 11q13-q13.2
    C11orf30 76156.069 11q13.5
    CARS 3022.160 11p15.5
    CASP1 104896.246 11q23
    CBL 119076.990 11q23.3
    CCND1 69455.873 11q13
    CD151 832.952 11p15.5
    CD248 66081.958 11q13
    CD44 35160.417 11p13
    CD82 44587.141 11p11.2
    CHKA 67820.328 11q13.2
    CRYAB 111779.350 11q22.3-q23.1
    CST6 65779.462 11q13
    CTNND1 57529.234 11q11
    DDB2 47236.493 11p12-p11
    DDX10 108535.816 11q22-q23
    EIF3F 8008.867 11p15.4
    ESRRA 64073.044 11q13
    ETS1 128328.656 11q23.3
    EXT2 44117.099 11p12-p11
    FANCF 22644.079 11p15
    FEN1 61560.150 11q12
    GAB2 77926.337 11q14.1
    H2AFX 118964.587 11q23.2-q23.3
    HRAS 532.243 11p15.5
    HTATIP2 20385.289 11p15.1
    INPPL1 71935.882 11q23
    KAT5 65479.489 11q13
    LMO2 33880.125 11p13
    MACROD1 63766.031 11q11
    MAML2 95711.440 11q21
    MEN1 64570.996 11q13
    MIR125B1 121970.458 11q24.1
    MLL 118307.205 11q23
    MRE11A 94150.469 11q21
    MUC2 1074.875 11p15.5
    MUC5AC 1151.579 11p15.5
    MUC6 1012.824 11p15.5-p15.4
    MYEOV 69061.622 11q13
    NNMT 114166.535 11q23.1
    NUMA1 71713.911 11q13
    NUP98 3733.059 11p15.5
    OPCML 132284.877 11q25
    ORAOV1 69480.334 11q13.3
    PAK1 77033.061 11q13-q14
    PAX6 31806.341 11p13
    PICALM 85668.486 11q14
    POU2AF1 111222.983 11q23.1
    RAD9A 67159.423 11q13.1-q13.2
    RELA 65421.068 11q13
    RRM1 4115.924 11p15.5
    RSF1 77377.275 11q14.1
    SDHD 111957.571 11q23
    SIPA1 65405.578 11q13
    SPA17 124543.740 11q24.2
    SPI1 47376.409 11p11.2
    THY1 119288.656 11q22.3-q23
    TMPRSS4 117947.727 11q23.3
    WT1 32409.325 11p13
    YAP1 101981.210 11q13
    ZBTB16 113931.288 11q23.1
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ACAT1 107992.258 11q22.3-q23.1
    ACP2 47267.070 11p11.2-p11.11|11p12-p11
    ADAMTS15 130318.869 11q25
    ADAMTS8 130274.820 11q25
    ADM 10326.642 11p15.4
    ADRBK1 67033.905 11q13.1
    AHNAK 62283.375 11q12.2
    AIP 67250.505 11q13.3
    ALDH3B2 67429.634 11q13
    ALKBH3 43902.357 11p11.2
    ALKBH8 107373.454 11q22.3
    ALX4 44282.278 11p11.2
    AMPD3 10472.224 11p15
    ANKK1 113258.513 11q23.2
    ANO1 69924.408 11q13.3
    ANO9 417.930 11p15.5
    APBB1 6416.355 11p15
    API5 43333.505 11p11.2
    APOA1 116706.469 11q23-q24
    APOA4 116691.418 11q23
    APOC3 116700.624 11q23.1-q23.2
    ARAP1 72396.115 11q13.4
    ARCN1 118443.102 11q23.3
    ARFIP2 6496.928 11p15
    ARHGAP1 46698.634 11p12-q12
    ARHGAP32 128834.956 11q24-q25
    ARHGEF17 73019.663 11q13.4
    ARL2 64781.586 11q13
    ARNTL 13299.325 11p15
    ARRB1 74976.482 11q13
    ART1 3666.361 11p15
    ASCL2 2289.729 11p15.5
    ASRGL1 62104.774 11q12.3
    B3GAT1 134248.400 11q25
    B3GNT1 66112.844 11q13.2
    BARX2 129245.881 11q25
    BCL9L 118766.852 11q23.3
    BDNF 27676.444 11p13
    BRSK2 1411.129 11p15.5
    BTG4 111338.258 11q23
    C11orf17 8932.701 11p15.3
    C11orf68 65684.284 11q13.1
    C1QTNF4 47611.216 11q11
    C1QTNF5 119209.652 11q23.3
    CADM1 115044.346 11q23.2
    CALCA 14990.048 11p15.2-p15.1
    CAPN1 64949.343 11q13
    CAPN5 76777.992 11q14
    CARD16 104912.053 -
    CARD18 105008.448 11q21-q22
    CASP4 104813.594 11q22.2-q22.3
    CASP5 104864.967 11q22.2-q22.3
    CAT 34460.472 11p13
    CCDC73 32623.627 11p13
    CCKBR 6280.966 11p15.4
    CD3E 118175.295 11q23
    CD5 60869.930 11q13
    CD59 33724.558 11p13
    CD6 60739.115 11q13
    CD81 2398.547 11p15.5
    CDC42EP2 65082.331 11q13
    CDK2AP2 67273.969 11q13
    CDKN1C 2904.450 11p15.5
    CDON 125826.715 11q23-q24
    CEP164 117198.571 11q23.3
    CEP57 95523.642 11q21
    CFL1 65622.287 11q13
    CHEK1 125495.036 11q24-q24
    CHORDC1 89933.597 11q14.3
    CHRDL2 74407.475 11q14
    CKAP5 46765.084 11p11.2
    CLCF1 67131.641 11q13.3
    CLP1 57425.216 11q12
    CNTF 58390.146 11q12.2
    CNTN5 98891.871 11q21-q22.2
    COX8A 63742.079 11q12-q13
    CPT1A 68522.091 11q13.1-q13.2
    CREB3L1 46299.228 11p11.2
    CRTAM 122709.255 11q22-q23
    CRY2 45868.669 11p11.2
    CTSD 1773.985 11p15.5
    CTSF 66330.936 11q13
    CTTN 70244.612 11q13
    CUL5 107879.408 11q22-q23
    CXCR5 118754.541 11q23.3
    CYB5R2 7686.327 11p15.4
    DCPS 126173.647 11q24.2
    DDB1 61066.920 11q12-q13
    DDX25 125774.272 11q24
    DDX6 118618.473 11q23.3
    DEAF1 644.225 11p15.5
    DGKZ 46383.145 11p11.2
    DIXDC1 111807.927 11q23.1
    DKFZp686O24166 17373.445 11p15.1
    DKK3 11984.545 11p15.2
    DLAT 111895.538 11q23.1
    DNAJC4 63997.753 11q13
    DPAGT1 118967.214 11q23.3
    DPF2 65101.346 11q13
    DPP3 66247.880 11q12-q13.1
    DRD2 113280.318 11q23
    DUSP8 1575.281 11p15.5
    DYNC2H1 102980.160 11q21-q22.1
    E2F8 19245.618 11p15.1
    EED 85955.815 11q14.2-q22.3
    EHF 34642.668 11p12
    EI24 125439.298 11q24
    EIF4G2 10818.594 11p15
    ELF5 34500.342 KNTC1AP
    F2 46740.743 11p11
    FADD 70049.269 11q13.3
    FADS2 61595.713 11q12-q13.1
    FAM10A5 18283.455 11p15.1
    FAM111B 58874.658 11q12.1
    FAM89B 65339.820 11q23
    FAT3 92085.262 11q14.3
    FAU 64888.103 11q13
    FCHSD2 72547.791 11q13.4
    FEZ1 125315.650 11q24.2
    FGF19 69513.007 11q13.1
    FGF3 69624.737 11q13
    FGF4 69587.797 11q13.3
    FLI1 128562.389 11q24.1-q24.3
    FLRT1 63871.362 11q12-q13
    FOLH1 49168.188 11p11.2
    FOLH1B 89392.465 11q14.3
    FOLR1 71900.959 11q13.3-q14.1
    FOLR2 71927.819 11q13.3-q13.5
    FOSL1 65659.692 11q13
    FOXR1 118842.417 11q23.3
    FSHB 30252.563 11p13
    FTH1 61731.759 11q13
    FUT4 94277.017 11q21
    FXC1 6502.677 11p15.5-p15.3
    FZD4 86656.722 11q14.2
    GAL 68451.983 11q13.3
    GAS2 22688.160 11p14.3-p15.2
    GCRG224 82533.408 11q13-q14
    GNG3 62475.114 11p11
    GRM5 88237.745 11q14.2-q14.3
    GSTP1 67351.066 11q13
    GTF2H1 18343.816 11p15.1-p14
    H19 2016.407 11p15.5
    HBB 5246.696 11p15.5
    HEPACAM 124789.148 11q24.2
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    SLC22A18 2923.512 11p15.5
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    SOX6 15987.996 11p15.3
    SPON1 13983.914 11p15.2
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    TYR 88911.040 11q14-q21
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    UPK2 118827.120 11q23
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    UVRAG 75526.212 11q13.5
    VEGFB 64002.266 11q13
    VWA5A 123986.111 11q23
    WEE1 9596.234 11p15.3-p15.1
    WIT1 32460.326 11p13
    WNT11 75897.371 11q13.5
    ZNF143 9482.512 11p15.4
    ZNF202 123594.997 11q23.3
    ZNF215 6947.654 11p15.4
    ZW10 113603.911 11q23.2

    GeneCards  

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedJul 2010Jean-Loup Huret, Philippe Dessen

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_11.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2010 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Fri Jul 16 13:33:20 CEST 2010
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