Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 22

Chromosome 22 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 22 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

t(1;22)(q21;q11)
t(1;22)(q21;q11)
t(1;22)(p13;q13)
t(2;22)(p13;q11) (NHL; REL and IgL; rare)
t(2;22)(p23;q11.2)
t(2;22)(p23;q11.2)
t(3;22)(q27;q11)
t(4;22)(q12;q11.2)
t(7;22)(q21;q11)
t(8;22)(q24;q11)
t(8;22)(p11;q11)
t(8;22) (p11;q13)
t(9;22)(q34;q11) in ALL
t(9;22)(q34;q11) in ANLL
t(9;22)(q34;q11) in CML
t(9;22)(p24;q11.2)
t(9;22)(q34;q11) in treatment related leukemia
t(11;12)(p15;q13)
t(11;22)(q23;q11.2)
t(11;22)(q23;q13)
t(12;22)(p13;q11) (NHL; CCND2 and IgL; rare)
t(12;22)(p13;q11) (AML; MN1 and ETV6; rare)
t(12;22)(p13;q12)
t(12;22)(p13;q11-12)
t(14;22)(q32;q11) (MPD, AML, ALL, T-NHL, CLD; -; not rare)
t(14;22)(q32;q11)
t(18;22)(q21;q11)
t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL
+22 or trisomy 22 (solely?)

Solid Tumors     

t(2;22)(q23;q12)
t(7;22)(p22;q12)
t(7;22)(p22;q12)
t(9;22)(q22;q12)
t(11;22)(p13;q11)
t(11;22)(q24;q12)
t(11;22)(p13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;16)(q13;p11)
t(17;22)(q22;q13)
t(12;22)(q13;q12)
t(21;22)(q12;q12)
t(17;22)(q12;q12)
del(22)(q13.1)
del(22q)
t(17;22)(q22;q13)
t(21;22)(q22;q12)

Cancer prone diseases     

Neurofibromatosis type 2 (NF2)
Rhabdoid predisposition syndrome
Schwannomatosis

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 22 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 22 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 22 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 22 - Ensembl Project
  • Chromosome 22 - Map View - NCBI
  • Chromosome 22 - OMIM Gene map
  • Chromosome 22 - Genomic Variants
  • Chromosome 22 - HAPMAP Project
  • Chromosome 22 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 22 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 22 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 22 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 22 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 22 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 22 Cancer GeneWeb
  • Chromosome 22 GeneCards (Weizmann)
  • IMGT, the international ImMunoGeneTics database (Montpellier,France)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

    • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ATF4 39916.569 22q13.1
    BCR 23522.552 22q11|22q11.23
    CHEK2 29083.731 22q11|22q12.1
    CLTCL1 19166.989 22q11.2|22q11.21
    EP300 41488.614 22q13.2
    EWSR1 29663.998 22q12.2
    IGL@ 23247.412 22q11.1-q11.2
    MAPK1 22113.949 22q11.2|22q11.21
    MAPK12 50691.331 22q13.33
    MKL1 40806.292 22q13
    MMP11 24115.036 22q11.2|22q11.23
    MN1 28144.266 22q11|22q12.1
    MYH9 36677.324 22q13.1
    NF2 29999.545 22q12.2
    PARVB 44395.173 22q13.2-q13.33
    PDGFB 39619.687 22q12.3-q13.1|22q13.1
    RAC2 37621.312 22q13.1
    RBX1 41347.385 22q13.2
    SEPT5 19701.987 22q11.21
    SMARCB1 24129.150 22q11.23|22q11
    SOX10 38368.319 22q13.1
    TYMP 50964.184 22q13|22q13.33
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    A4GALT 43088.128 22q11.2-q13.2
    ACO2 41865.129 22q11.2-q13.31|22q13.2
    ADM2 50920.012 22q13.33
    ADORA2A 24823.530 22q11.23
    ADRBK2 25960.861 22q11|22q12.1
    ADSL 40742.504 22q13.1|22q13.2
    AIFM3 21319.418 22q11.21
    AP1B1 29723.671 22q12|22q12.2
    APOBEC3A 39353.527 22q13.1-q13.2
    APOBEC3B 39378.405 22q13.1-q13.2
    APOBEC3C 39410.265 22q13.1
    APOBEC3G 39473.025 22q13.1-q13.2
    APOBEC3H 39493.229 22q13.1
    APOL3 36536.372 22q13.1
    APOL6 36044.424 22q12.3
    ARHGAP8 45148.438 22q13.31
    BCL2L13 18121.485 22q11.1
    BID 18216.906 22q11.1
    BIK 43506.757 22q13.31
    BRD1 50166.938 22q13.33
    C1QTNF6 37576.206 22q13.1
    CARD10 37886.401 22q13.1
    CBX6 39260.264 22q13.1
    CBX7 39526.790 22q13.1
    CBY1 39052.658 22q12
    CDC45 19467.416 22q11.21
    CECR1 17660.194 22q11.2
    CERK 47080.308 22q13.31
    CHKB 51017.387 22q13.33
    CLDN5 19510.547 22q11.21
    COMT 19929.263 22q11.21-q11.23|22q11.21
    CRKL 21271.714 22q11|22q11.21
    CSF2RB 37309.675 22q13.1
    CSNK1E 38686.698 22q13.1
    CYP2D6 42522.502 22q13.1
    CYP2D7P1 42537.251 22q13
    CYTH4 37678.495 22q12.3-q13.1
    DDT 24313.555 22q11.23
    DDX17 38879.445 22q13.1
    DGCR6L 20301.802 22q11
    DMC1 38914.954 22q13.1
    DNAJB7 41255.555 22q13.2
    DRG1 31795.539 22q12.2
    FBLN1 45898.719 22q13.31
    GAL3ST1 30950.624 22q12.2
    GALR3 38219.389 22q13.1
    GCAT 38203.912 22q13.1
    GGT1 24999.180 22q11.23
    GNAZ 23412.669 22q11.22
    GNB1L 19775.934 22q11.2
    GRAP2 40297.086 22q13.2
    GSTT1 24376.141 22q11.23
    GSTT2 24322.314 22q11.2|22q11.23
    GTSE1 46692.638 22q13.2-q13.3
    H1F0 38201.114 22q13.1
    HDAC10 50683.615 22q13.31
    HIC2 21771.693 22q11.21
    HMGXB4 35653.445 22q13.1
    HMOX1 35777.087 22q12|22q13.1
    HSCB 29138.043 22q12.1
    IFT27 37154.255 22q13.1
    IL2RB 37521.880 22q13|22q13.1
    INPP5J 31518.961 22q11.2-q13.2
    KCNJ4 38822.333 22q13.1
    LARGE 33669.063 22q12.3
    LDOC1L 44888.450 22q13.31
    LGALS1 38071.613 22q13.1
    LGALS2 37966.254 22q12-q13|22q13.1
    LIF 30636.442 22q12.2
    LIMK2 31644.348 22q12.2
    MAFF 38597.939 22q13.1
    MAPK11 50702.143 22q13.33
    MAPK8IP2 51039.131 22q13.33
    MB 36002.812 22q13.1
    MCM5 35796.116 22q13.1
    MED15 20861.886 22q11.2
    MFNG 37865.101 22q12
    MGAT3 39885.802 22q13.1
    MIF 24236.565 22q11.23
    MOV10L1 50528.435 22q13.33
    MRPL40 19420.036 22q11.21
    MTMR3 30279.158 22q12.2
    MYO18B 26138.120 22q11.2-q12.1
    NAGA 42454.339 22q13-qter|22q11
    NHP2L1 42069.938 22q13.2-q13.31
    OSBP2 31090.793 22q12.2
    OSM 30658.821 22q12.2
    P2RX6 21369.442 22q11.21
    PANX2 50609.160 22q13.33
    PARVG 44568.836 22q13.2-q13
    PATZ1 31721.791 22q12.2
    PES1 30972.612 22q12.1
    PIK3IP1 31677.580 22q12.2
    PIM3 50354.143 22q13
    PITPNB 28247.658 22q12.1
    PLA2G3 31530.794 22q11.2-q13.2
    PLA2G6 38507.502 22q13.1
    PLXNB2 50713.408 22q13.33
    POLR2F 38349.674 22q13.1
    POM121L1P 22981.647 22q11.22
    PPARA 46546.499 22q12-q13.1|22q13.31
    PPIL2 22020.273 22q11.21
    PPM1F 22273.793 22q11.22
    PRAME 22890.124 22q11.22
    PRAMEL 22345.496 22q11.22
    PRODH 18900.295 22q11.21
    PRR5 45064.593 22q13
    RAB36 23487.513 22q11.22
    RABL2B 51205.920 22q13.33
    RASD2 35937.352 22q13.1
    RASL10A 29708.923 22q12.2
    RGL4 24033.048 22q11.23
    RTDR1 23401.594 22q11.2
    RTN4R 20229.226 22q11.21
    SBF1 50883.433 22q13.33
    SCO2 50961.999 22q13.33
    SDF2L1 21996.542 22q11.21
    SEC14L2 30792.933 22q12.2
    SEPT3 42372.931 22q13.2
    SEZ6L 26565.480 22q12.1
    SLC5A1 32439.019 22q13.1|22q12.3
    SMTN 31477.305 22q12.2
    SREBF2 42229.106 22q13
    SSTR3 37602.246 22q13.1
    ST13 41220.603 22q13.2
    SYN3 32908.542 22q12.3
    TAB1 39795.759 22q13.1
    TBX1 19744.226 22q11.21
    TCN2 31003.273 22q12.2
    TEF 41763.392 22q13|22q13.2
    THOC5 29904.157 22q12.2
    TIMP3 33196.802 22q12.1-q13.2|22q12.3
    TMPRSS6 37461.479 22q12.3
    TNFRSF13C 42321.036 22q13.1-q13.31
    TOB2 41829.492 22q13.2-q13.31
    TOM1 35695.268 22q13.1
    TOMM22 39077.954 22q12-q13
    TOP3B 22311.404 22q11.22
    TSPO 43547.535 22q13.31
    TXNRD2 19863.040 22q11.21
    UBE2L3 21921.957 22q11.21
    UFD1L 19437.464 22q11.21
    UPK3A 45680.868 22q13.31
    USP18 18632.758 22q11.21
    VPREB1 22599.200 22q11.2|22q11.22
    VPREB3 24094.934 22q11.23|22q11
    WNT7B 46316.248 22q13
    XBP1 29190.549 22q12.1|22q12
    XRCC6 42017.295 22q13.2-q13.31
    YPEL1 22051.828 22q11.2
    YWHAH 32340.479 22q12.3
    ZNF74 20748.480 22q11.2|22q11.21

    GeneCards  

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedJul 2010Jean-Loup Huret, Philippe Dessen

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2010 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Fri Jul 16 13:33:23 CEST 2010
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