Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 20

Chromosome 20 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Leukaemia     

dic(9;20)(p11-13;q11)
t(X;20)(q13;q13.3)
t(11;20)(p15;q11)
t(11;20)(q23;q11)
t(12;20)(q15;q11.2).
del(20q) in myeloid malignancies
ider(20q) in Myeloid Malignancies
t(20;21)(q11;q22)
t(20;21)(q13;q22)

Solid Tumors     

t(X;20)(p11;q13)

Cancer prone diseases     

Alagille syndrome (AGS)

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 20 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 20 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 20 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 20 - Ensembl Project
  • Chromosome 20 - Map View - NCBI
  • Chromosome 20 - GDB (Genome Data Base)
  • Chromosome 20 - OMIM Gene map
  • Chromosome 20 - Genomic Variants
  • Chromosome 20 - HAPMAP Project
  • Chromosome 20 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 20 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 20 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 20 - SpliceNest
  • Human BAC Resource (NCBI)
  • FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Positional Cloning Project (Berlin Dahlem)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Cancer GeneWeb
  • GeneCards (Weizmann)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

    • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    PLCB1 8061.296 20p12
    JAG1 10566.334 20p12.1-p11.23
    NKX2-2 21439.664 20pter-q11.23
    PLAGL2 30243.968 20q11.21
    MAPRE1 30871.435 20q11.1-q11.23
    BLCAP 35579.234 20q11.2-q12
    TOP1 39090.876 20q12-q13.1
    WISP2 42777.299 20q12-q13.1
    STK4 43028.534 20q11.2-q13.2
    MMP9 44070.954 20q11.2-q13.1
    NCOA3 45564.064 20q12
    BCAS4 48844.874 20q13.13
    ZNF217 51617.019 20q13.2
    SS18L1 60152.217 20q13.3
    EEF1A2 61589.810 20q13.3
    TNFRSF6B 61796.732 20q13.3
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    TRIB3 309.308 20p13-p12.2
    CSNK2A1 411.338 20p13
    ANGPT4 801.299 20p13
    SIRPB2 1403.235 20p13
    SIRPB1 1493.029 20p13
    SIRPA 1823.826 20p13
    PDYN 1907.403 20pter-p12
    STK35 2031.519 20p13
    TGM3 2224.675 20q11.2
    PTPRA 2802.142 20p13
    GNRH2 2972.268 20p13
    OXT 3000.266 20p13
    AVP 3011.203 20p13
    UBOX5 3036.220 20p13
    ADAM33 3596.621 20p13
    HSPA12B 3661.356 20p13
    CENPB 3712.500 20p13
    CDC25B 3724.401 20p13
    RNF24 3861.730 20p13-p12.1
    SMOX 4077.450 20p13
    PRNP 4614.797 20p13
    RASSF2 4708.672 20pter-p12.1
    PCNA 5043.600 20pter-p12
    CDS2 5055.482 20p13
    MCM8 5879.298 20p12.3
    BMP2 6696.745 20p12
    PLCB4 9024.932 20p12
    PAK7 9466.037 20p12
    SPTLC3 12937.627 20p12.1
    OTOR 16677.003 20p12.1-p11.23
    PCSK2 17155.631 20p11.2
    DSTN 17498.599 20p12.1
    RBBP9 18415.190 20p11.2
    RIN2 19818.210 20p11.22
    INSM1 20296.765 20p11.2
    XRN2 21231.942 20p11.2-p11.1
    FOXA2 22509.823 20p11
    SSTR4 22964.057 20p11.2
    THBD 22974.271 20p11.2
    CST3 23562.294 20p11.21
    CST7 24877.866 20p11.21
    PYGB 25176.706 20p11.2-p11.1
    ID1 29656.753 20q11
    COX4I2 29689.352 20q11.21
    BCL2L1 29715.924 20q11.21
    TPX2 29790.565 20q11.2
    MYLK2 29871.045 20q13.31
    HCK 30103.718 20q11-q12
    POFUT1 30259.357 20q11
    DNMT3B 30813.852 20q11.2
    BPIL1 31059.068 20q11.21
    RP11-49G10.8 31245.071 20q11.21
    PLUNC 31287.463 20q11.2
    C20orf114 31334.602 20q11.21
    CDK5RAP1 31410.306 20pter-q11.23
    CBFA2T2 31613.832 20q11
    E2F1 31727.150 20q11.2
    ASIP 32311.832 20q11.2-q12
    ITCH 32414.745 20q11.22-q11.23
    DYNLRB1 32567.865 20q11.21
    PIGU 32612.008 20q11.22
    TP53INP2 32755.809 20q11.22
    NCOA6 32766.240 20q11
    GGT7 32896.186 20q11.22
    GGT7 32896.186 20q11.22
    ACSS2 32928.036 20q11.22
    GSS 32979.898 20q11.2
    PROCR 33223.435 20q11.2
    MMP24 33278.117 20q11.2
    EIF6 33330.139 20q12
    MLRG 33484.559 20q11.2-q12
    GDF5 33484.563 20q11.2
    ERGIC3 33593.192 20pter-q12
    CPNE1 33677.382 20q11.22
    C20orf52 33750.646 20q11.22
    TGIF2 34635.424 20q11.2-q12
    SLA2 34674.336 20q11.23
    RBL1 35065.391 20q11.2
    GHRH 35312.906 20q11.2
    SRC 35407.971 20q12-q13
    NNAT 35583.021 20q11.2-q12
    CTNNBL1 35755.848 20q11.23-q12
    TGM2 36199.767 20q12
    PPP1R16B 36867.762 20q11.23
    DHX35 37024.414 20q11.22-q12
    MAFB 38747.933 20q11.2-q13.1
    PLCG1 39199.575 20q12-q13.1
    EMILIN3 39422.020 20q11.2-q12
    CHD6 39464.584 20q12
    PTPRT 40134.806 20q12-q13
    SFRS6 41519.932 20q12-q13.1
    L3MBTL 41576.467 20q13.12
    SGK2 41621.100 20q13.2
    MYBL2 41729.123 20q13.1
    HNF4A 42417.855 20q12-q13.1
    SERINC3 42558.278 20q13.1-q13.3
    ADA 42681.578 20q12-q13.11
    YWHAB 42947.758 20q13.1
    TOMM34 43004.185 -
    WFDC5 43171.507 20q13.12
    SEMG1 43269.088 20q12-q13.2
    SLPI 43314.293 20q12
    SDC4 43387.345 20q12
    PIGT 43478.138 20q12-q13.12
    WFDC2 43531.808 20q12-q13.2
    ITS 43746.704 22q12.1-q12.2
    UBE2C 43874.662 20q13.12
    NEURL2 43950.674 20q13.12
    CTSA 43952.998 20q13.1
    NCOA5 44123.035 20q12-q13.12
    CD40 44180.313 20q12-q13.2
    SLC35C2 44411.585 20q13.12
    TP53RK 44746.412 20q13.2
    EYA2 44956.916 20q13.1
    ZMYND8 45271.788 20q13.12
    SULF2 45719.559 20q12-q13.2
    PREX1 46674.200 20q13.13
    ARFGEF2 46971.682 20q13.13
    CSE1L 47096.245 20q13
    STAU1 47163.285 20q13.1
    DDX27 47269.291 20q13.13
    ZNFX1 47295.846 20q13.13
    PTGIS 47553.818 20q13.13
    B4GALT5 47682.892 20q13.1-q13.2
    SNAI1 48032.934 20q13.1-q13.2
    UBE2V1 48131.068 20q13.2
    TMEM189-UBE2V1 48131.070 20q13.2
    CEBPB 48240.783 20q13.1
    PTPN1 48560.298 20q13.1-q13.2
    ADNP 48940.290 20q13.13
    NFATC2 49441.173 20q13.2-q13.3
    SALL4 49833.992 20q13.13-q13.2
    BCAS1 51993.924 20q13.2-q13.3
    CYP24A1 52203.395 20q13
    CSTF1 54401.114 20q13.31
    TFAP2C 54637.765 20q13.2
    BMP7 55178.962 20q13
    CTCFL 55505.630 20q13.31
    PMEPA1 55656.858 20q13.31-q13.33
    C20orf85 56159.389 20q13.32
    PPP4R1L 56246.380 20q13.32
    RAB22A 56318.177 20q13.32
    GNAS 56900.164 20q13.3
    CTSZ 57003.636 20q13
    TUBB1 57027.704 20q13.32
    PPP1R3D 57945.287 20q13.3
    CDH4 59260.954 20q13.3
    PSMA7 60145.186 20q13.33
    ADRM1 60311.422 20q13.33
    LAMA5 60317.518 20q13.2-q13.3
    GATA5 60471.948 20q13.33
    MLLT10L 60471.948 -
    NTSR1 60810.634 20q13
    OGFR 60906.622 20q13.3
    DIDO1 60979.535 20q13.33
    BIRC7 61337.721 20q13.3
    CHRNA4 61445.109 20q13.2-q13.3
    PTK6 61630.222 20q13.3
    SRMS 61642.607 -
    RTEL1 61760.091 20q13.3
    ARFRP1 61801.253 20q13.3
    TPD52L2 61967.034 20q13.2-q13.3
    DNAJC5 61996.962 20q13.33
    RGS19 62174.981 20q13.33

    GeneCards   GDB - List of genes

    This page should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL Chromosome 20. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. 2002.
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_20.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Tue Jul 1 08:54:03 2008
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