Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 22

Chromosome 22 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 22 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

t(1;22)(q21;q11)
t(1;22)(p13;q13)
t(2;22)(p13;q11) (NHL; REL and IgL; rare)
t(2;22)(p23;q11.2)
t(2;22)(p23;q11.2)
t(3;22)(q27;q11)
t(4;22)(q12;q11.2)
t(7;22)(q21;q11)
t(8;22)(q24;q11)
t(8;22)(p11;q11)
t(8;22) (p11;q13)
t(9;22)(q34;q11) in ALL
t(9;22)(q34;q11) in ANLL
t(9;22)(q34;q11) in CML
t(9;22)(p24;q11.2)
t(9;22)(q34;q11) in treatment related leukemia
t(11;12)(p15;q13)
t(11;22)(q23;q11.2)
t(11;22)(q23;q13)
t(12;22)(p13;q11) (NHL; CCND2 and IgL; rare)
t(12;22)(p13;q11) (AML; MN1 and ETV6; rare)
t(12;22)(p13;q12)
t(12;22)(p13;q11-12)
t(14;22)(q32;q11) (MPD, AML, ALL, T-NHL, CLD; -; not rare)
t(14;22)(q32;q11)
t(18;22)(q21;q11)
t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL
+22 or trisomy 22 (solely?)

Solid Tumors     

t(2;22)(q23;q12)
t(7;22)(p22;q12)
t(7;22)(p22;q12)
t(9;22)(q22;q12)
t(11;22)(p13;q11)
t(11;22)(q24;q12)
t(11;22)(p13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;16)(q13;p11)
t(17;22)(q22;q13)
t(12;22)(q13;q12)
t(21;22)(q12;q12)
t(17;22)(q12;q12)
del(22)(q13.1)
del(22q)
t(17;22)(q22;q13)
t(21;22)(q22;q12)

Cancer prone diseases     

Neurofibromatosis type 2 (NF2)
Rhabdoid predisposition syndrome
Schwannomatosis

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 22 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 22 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 22 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 22 - Ensembl Project
  • Chromosome 22 - Map View - NCBI
  • Chromosome 22 - GDB (Genome Data Base)
  • Chromosome 22 - OMIM Gene map
  • Chromosome 22 - Genomic Variants
  • Chromosome 22 - HAPMAP Project
  • Chromosome 22 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 22 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 22 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 22 - SpliceNest
  • Chromosome 22 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 22 Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 22 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 22 Cancer GeneWeb
  • Chromosome 22 GeneCards (Weizmann)
  • IMGT, the international ImMunoGeneTics database (Montpellier,France)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

    • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    CLTCL1 17546.987 22q11.2|22q11.21
    SEPT5 18081.987 22q11.21
    IGL@ 21577.412 22q11.1-q11.2
    BCR 21852.552 22q11|22q11.23
    MMP11 22445.036 22q11.2|22q11.23
    SMARCB1 22459.150 22q11.23|22q11
    MN1 26474.265 22q11|22q12.1
    CHEK2 27413.731 22q11|22q12.1
    EWSR1 27994.017 22q12.2
    NF2 28329.545 22q12.2
    MYH9 35007.270 22q13.1
    RAC2 35951.256 22q13.1
    PDGFB 37949.633 22q12.3-q13.1|22q13.1
    ATF4 38246.515 22q13.1
    MKL1 39136.238 22q13
    RBX1 39677.331 22q13.2
    EP300 39818.560 22q13.2
    MAPK12 49033.458 22q13.33
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    CECR1 16040.194 22q11.2
    BCL2L13 16501.485 22q11.1
    BID 16596.906 22q11.1
    USP18 17012.758 22q11.21
    PRODH 17280.294 22q11.21
    MRPL40 17800.036 22q11.21
    UFD1L 17817.701 22q11.21
    CDC45L 17847.416 22q11.21
    CLDN5 17890.547 22q11.21
    TBX1 18124.226 22q11.21
    GNB1L 18155.934 22q11.2
    TXNRD2 18243.040 22q11.21
    COMT 18309.263 22q11.21-q11.23|22q11.21
    ZNF74 19078.480 22q11.2|22q11.21
    MED15 19191.886 22q11.2
    CRKL 19601.714 22q11|22q11.21
    AIFM3 19649.418 22q11.21
    P2RX6 19699.464 22q11.21
    HIC2 20101.693 22q11.21
    UBE2L3 20251.957 22q11.21
    SDF2L1 20326.542 22q11.21
    PPIL2 20350.273 22q11.21
    YPEL1 20381.826 22q11.2
    MAPK1 20443.947 22q11.2|22q11.21
    PPM1F 20603.793 22q11.22
    TOP3B 20641.403 22q11.22
    PRAMEL 20675.496 22q11.22
    VPREB1 20929.200 22q11.2|22q11.22
    PRAME 21220.123 22q11.22
    POM121L1P 21311.647 22q11.22
    RTDR1 21731.593 22q11.2
    GNAZ 21742.669 22q11.22
    RAB36 21817.513 22q11.22
    RGL4 22363.048 22q11.23
    VPREB3 22424.933 22q11.23|22q11
    MIF 22566.565 22q11.23
    DDT 22643.554 22q11.23
    GSTT2 22652.314 22q11.2|22q11.23
    GSTT1 22706.139 22q11.23
    ADORA2A 23153.530 22q11.23
    GGT1 23329.180 22q11.23
    ADRBK2 24290.861 22q11|22q12.1
    MYO18B 24468.120 22q11.2-q12.1
    SEZ6L 24895.480 22q12.1
    PITPNB 26577.657 22q12.1
    HSCB 27468.043 22q12.1
    XBP1 27520.548 22q12.1|22q12
    RASL10A 28038.922 22q12.2
    AP1B1 28053.669 22q12|22q12.2
    THOC5 28234.156 22q12.2
    MTMR3 28609.158 22q12.2
    LIF 28966.442 22q12.2
    OSM 28988.819 22q12.2
    SEC14L2 29122.933 22q12.2
    GAL3ST1 29280.624 22q12.2
    PES1 29302.612 22q12.1
    OSBP2 29420.793 22q12.2
    SMTN 29807.305 22q12.2
    INPP5J 29848.961 22q11.2-q13.2
    PLA2G3 29860.793 22q11.2-q13.2
    LIMK2 29974.348 22q12.2
    PIK3IP1 30007.580 22q12.2
    PATZ1 30051.790 22q12.2
    DRG1 30125.539 22q12.2
    YWHAH 30670.479 22q12.3
    SLC5A1 30769.037 22q13.1|22q12.3
    SYN3 31238.540 22q12.3
    TIMP3 31526.802 22q12.1-q13.2|22q12.3
    LARGE 31999.062 22q12.3
    HMGXB4 33983.489 22q13.1
    TOM1 34025.268 22q13.1
    HMOX1 34107.087 22q12|22q13.1
    MCM5 34126.116 22q13.1
    RASD2 34267.298 22q13.1
    MB 34332.757 22q13.1
    APOL6 34374.370 22q12.3
    APOL3 34866.323 22q13.1
    RABL4 35484.201 22q13.1
    CSF2RB 35639.621 22q13.1
    TMPRSS6 35791.425 22q12.3
    IL2RB 35851.826 22q13|22q13.1
    C1QTNF6 35906.152 22q13.1
    SSTR3 35932.191 22q13.1
    CYTH4 36008.441 22q12.3-q13.1
    MFNG 36195.049 22q12
    CARD10 36216.346 22q13.1
    LGALS2 36296.199 22q12-q13|22q13.1
    LGALS1 36401.559 22q13.1
    H1F0 36531.060 22q13.1
    GCAT 36533.901 22q13.1
    GALR3 36549.335 22q13.1
    POLR2F 36679.620 22q13.1
    SOX10 36698.265 22q13.1
    PLA2G6 36837.448 22q13.1
    MAFF 36927.944 22q13.1
    CSNK1E 37016.643 22q13.1
    KCNJ4 37152.279 22q13.1
    DDX17 37209.389 22q13.1
    DMC1 37244.900 22q13.1
    CBY1 37382.604 22q12
    TOMM22 37407.900 22q12-q13
    CBX6 37590.194 22q13.1
    APOBEC3A 37683.473 22q13.1-q13.2
    APOBEC3B 37708.351 22q13.1-q13.2
    APOBEC3C 37740.211 22q13.1
    APOBEC3G 37802.971 22q13.1-q13.2
    APOBEC3H 37823.236 22q13.1
    CBX7 37856.725 22q13.1
    MAP3K7IP1 38125.705 22q13.1
    TAB1 38125.705 22q13.1
    GRAP2 38627.032 22q13.2
    ADSL 39072.450 22q13.1|22q13.2
    ST13 39550.547 22q13.2
    DNAJB7 39585.500 22q13.2
    TEF 40093.338 22q13|22q13.2
    TOB2 40159.438 22q13.2-q13.31
    ACO2 40195.075 22q11.2-q13.31|22q13.2
    XRCC6 40347.241 22q13.2-q13.31
    NHP2L1 40399.883 22q13.2-q13.31
    SREBF2 40559.052 22q13
    TNFRSF13C 40650.982 22q13.1-q13.31
    SEPT3 40702.877 22q13.2
    NAGA 40784.284 22q13-qter|22q11
    CYP2D6 40852.445 22q13.1
    CYP2D7P1 40867.195 22q13
    A4GALT 41418.071 22q11.2-q13.2
    BIK 41836.701 22q13.31
    TSPO 41877.479 22q13.31
    PARVB 42726.506 22q13.2-q13.33
    PARVG 42900.169 22q13.2-q13
    LDOC1L 43267.114 22q13.31
    PRR5 43443.257 22q13
    ARHGAP8 43527.102 22q13.31
    UPK3A 44059.553 22q13.31
    FBLN1 44277.383 22q13.31
    WNT7B 44694.914 22q13
    PPARA 44925.163 22q12-q13.1|22q13.31
    GTSE1 45071.359 22q13.2-q13.3
    CERK 45458.971 22q13.31
    BRD1 48552.941 22q13.33
    PIM3 48740.147 22q13
    MOV10L1 48870.621 22q13.33
    PANX2 48951.287 22q13.33
    HDAC10 49025.742 22q13.31
    MAPK11 49044.269 22q13.33
    PLXNB2 49055.535 22q13.33
    SBF1 49232.101 22q13.33
    ADM2 49266.878 22q13.33
    SCO2 49308.863 22q13.33
    TYMP 49311.048 22q13|22q13.33
    MAPK8IP2 49385.997 22q13.33
    RABL2B 49552.786 22q13.33

    GeneCards  

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    Updated Jean-Loup Huret, Philippe Dessen

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Mon Mar 8 20:27:46 CET 2010
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