Chromosome 11

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 11


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Band 11q11

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  • Chromosomal abnormalities in band 11q11
  • Genes in band 11q11 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 11q11

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    9q3411q11Mitelmant(9;11)(q34;q11)  Mitelman (CGAP) Chronic myeloid leukemia, aberrant translocation  
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    11q1111q14Cosmic_SVu(11)(q11;q14)  Cosmic_SV [COST176136]central_nervous_system__brainglioma__astrocytoma_Grade_IV[PubMed] 
    11q1111q14Cosmic_SVu(11)(q11;q14)  Cosmic_SV [COST371671]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    2p1311q11Cosmic_SVu(2;11)(p13;q11)  Cosmic_SV [COST318785]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    2q3611q11Cosmic_SVu(2;11)(q36;q11)  Cosmic_SV [COST326191]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
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    6p1111q11Cosmic_SVu(6;11)(p11;q11)  Cosmic_SV [COST347546]breast__NScarcinoma__lobular_carcinoma [COSU652]
    6p1211q11Cosmic_SVu(6;11)(p12;q11)  Cosmic_SV [COST239235]bone__NSosteosarcoma__NS[PubMed] 
    6p2111q11Cosmic_SVu(6;11)(p21;q11)  Cosmic_SV [COST151371]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    6q1311q11Cosmic_SVu(6;11)(q13;q11)  Cosmic_SV [COST331939]breast__NScarcinoma__lobular_carcinoma [COSU652]
    7q1111q11Cosmic_SVu(7;11)(q11;q11)  Cosmic_SV [COST403785]breast__NScarcinoma__metaplastic_carcinoma [COSU652]
    8p1211q11Cosmic_SVu(8;11)(p12;q11)  Cosmic_SV [COST221000]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    8p1211q11Cosmic_SVu(8;11)(p12;q11)  Cosmic_SV [COST341009]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    8p1211q11Cosmic_SVu(8;11)(p12;q11)  Cosmic_SV [COST372253]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    8q1211q11Cosmic_SVu(8;11)(q12;q11)  Cosmic_SV [COST318843]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]

    Genes in band 11q11

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    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr11:54603069-54603998 - 11q11   Gene [G]     OR4C46   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:54603069-54603998 - 11q11 11q12 Gene [M]   OR9Q1/OR4C46 OR4C46 OR9Q1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:54706832-54707902 + 11q11   Gene [G]     OR4A5   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55262182-55271119 + 11q11   Gene [G]     TRIM48   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55293703-55298232 - 11q11   Gene [G]     TRIM51HP       [Omim] [Entrez]
    chr11:55343201-55344187 + 11q11   Gene [G]     OR4A16   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55367884-55368918 + 11q11   Gene [G]     OR4A15   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55510106-55510444 + 11q11   Gene [G]     OR4C1P       [Omim] [Entrez]
    chr11:55554307-55555419 + 11q11   Gene [G]     OR4C15   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55572128-55573060 + 11q11   Gene [G]     OR4C16   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55603354-55604398 - 11q11   Gene [G]     OR4C11   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55638358-55639296 + 11q11   Gene [G]     OR4P4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55650904-55651839 + 11q11   Gene [G]     OR4S2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55665167-55666096 + 11q11   Gene [G]     OR4C6   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55773438-55774382 + 11q11   Gene [G]     OR5D13   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55795556-55796500 + 11q11   Gene [G]     OR5D14   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 11q11

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 11q11  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjuin 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 11q11. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/11q11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mer. juin 7 12:27:49 CEST 2017


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