Chromosome 11

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 11


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Band 11q12

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  • Chromosomal abnormalities in band 11q12
  • Genes in band 11q12 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 11q12

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    10q2211q12Atlas - Solid Tumort(10;11)(q22;q12) LGALS12/PLAC9LGALS12PLAC9TT_t1011q22q12ID100323Female organs: Breast[Biblio] 
    11p1111q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(p11;q12) NUP160/SLC43A3NUP160SLC43A3TT_t1111p11q12ID100481Soft Tissues: Soft Tissues[Biblio] 
    11p1111q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(p11;q12) OR9Q1/OR4C46OR9Q1OR4C46TT_t1111p11q12ID6946Lung[Biblio] 
    11p1511q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(p15;q12) TMEM109/CTSDTMEM109CTSDTT_t1111p15q12ID100561Female organs: Breast[Biblio] 
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    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) CTNND1/TMX2CTNND1TMX2TT_t1111q12q12ID100572Urinary system: Kidney[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) CTNND1/ZDHHC5CTNND1ZDHHC5TT_t1111q12q12ID100573Lung, Heart, Skin, Other: Lung[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) DAGLA/PPP1R32DAGLAPPP1R32TT_t1111q12q12ID100574Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) DDB1/TMEM258DDB1TMEM258TT_t1111q12q12ID100575Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) FAM111B/GLYATL1FAM111BGLYATL1TT_t1111q12q12ID100576Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) FAM111B/MS4A5FAM111BMS4A5TT_t1111q12q12ID100577Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) GANAB/LBHD1GANABLBHD1TT_t1111q12q12ID100578Neuro-Endocrine/Endocrine system: Adrenal gland[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) HNRNPUL2/AHNAKHNRNPUL2AHNAKTT_t1111q12q12ID100579Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) HNRNPUL2/TTC9CHNRNPUL2TTC9CTT_t1111q12q12ID100580Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) MTA2/MS4A18MTA2MS4A18TT_t1111q12q12ID100581Nervous system: Central Nervous system[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) NXF1/WDR74NXF1WDR74TT_t1111q12q12ID100582Lung, Heart, Skin, Other: Lung[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) P2RX3/RTN4RL2P2RX3RTN4RL2TT_t1111q12q12ID6947Lung[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) PRPF19/DDB1PRPF19DDB1TT_t1111q12q12ID100583Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) SLC3A2/NXF1SLC3A2NXF1TT_t1111q12q12ID100584Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) SLC3A2/POLR2GSLC3A2POLR2GTT_t1111q12q12ID100585Head and Neck: Mouth-Oropharynx[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) SSRP1/MED19SSRP1MED19TT_t1111q12q12ID100586Female organs: Ovary[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) STX5/WDR74STX5WDR74TT_t1111q12q12ID100587Lung, Heart, Skin, Other: Lung[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) TAF6L/GLYATL1TAF6LGLYATL1TT_t1111q12q12ID100588Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) TKFC/TMEM109TKFCTMEM109TT_t1111q12q12ID100589Female organs: Ovary[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) TMEM179B/SCGB1D1TMEM179BSCGB1D1TT_t1111q12q12ID100590Female organs: Ovary[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) TMEM223/STX5TMEM223STX5TT_t1111q12q12ID100591Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) TUT1/BSCL2TUT1BSCL2TT_t1111q12q12ID100592Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) UBXN1/BSCL2UBXN1BSCL2TT_t1111q12q12ID100593Neuro-Endocrine/Endocrine system: Adrenal gland[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) UBXN1/BSCL2UBXN1BSCL2TT_t1111q12q12ID100594Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) VPS37C/SLC3A2VPS37CSLC3A2TT_t1111q12q12ID100595Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) ZDHHC5/SMTNL1ZDHHC5SMTNL1TT_t1111q12q12ID100596Female organs: Ovary[Biblio] 
    11q1211q12Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q12) ZFP91/LPXNZFP91LPXNTT_t1111q12q12ID100597Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) AHNAK/RPS6KA4AHNAKRPS6KA4TT_t1111q12q13ID100598Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) AHNAK/STIP1AHNAKSTIP1TT_t1111q12q13ID100599Lung, Heart, Skin, Other: Lung[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) ARHGEF17/WDR74ARHGEF17WDR74TT_t1111q12q13ID100600Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) CNIH2/MS4A4ACNIH2MS4A4ATT_t1111q12q13ID100601Lung, Heart, Skin, Other: Skin[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) EEF1G/PPP6R3EEF1GPPP6R3TT_t1111q12q13ID6948Lung[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) FADS1/SHANK2FADS1SHANK2TT_t1111q12q13ID100602Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) FCHSD2/DTX4FCHSD2DTX4TT_t1111q12q13ID100603Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) FCHSD2/UQCC3FCHSD2UQCC3TT_t1111q12q13ID100604Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) INTS5/SYT12INTS5SYT12TT_t1111q12q13ID100605Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) LRP5/VPS37CLRP5VPS37CTT_t1111q12q13ID100606Nervous system: Central Nervous system[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) MRPL48/DTX4MRPL48DTX4TT_t1111q12q13ID100607Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) MS4A7/ATG2AMS4A7ATG2ATT_t1111q12q13ID100608Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) MS4A7/C2CD3MS4A7C2CD3TT_t1111q12q13ID100609Head and Neck: Mouth-Oropharynx[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) OSBP/GALOSBPGALTT_t1111q12q13ID100610Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) RNF121/VPS37CRNF121VPS37CTT_t1111q12q13ID100611Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) RTN3/HRASLS5RTN3HRASLS5TT_t1111q12q13ID100612Lung, Heart, Skin, Other: Lung[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) SDHAF2/RIN1SDHAF2RIN1TT_t1111q12q13ID100613Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) SF1/SYT7SF1SYT7TT_t1111q12q13ID100614Lung, Heart, Skin, Other: Lung[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) SHANK2/MS4A8BSHANK2MS4A8BTT_t1111q12q13ID6949Lung[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) SHANK2/MS4A8SHANK2MS4A8TT_t1111q12q13ID100615Lung, Heart, Skin, Other: Lung[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) SHANK2/PATL1SHANK2PATL1TT_t1111q12q13ID100616Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) SLC22A25/PACS1SLC22A25PACS1TT_t1111q12q13ID100617Lung, Heart, Skin, Other: Lung[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) SYT7/KCNK4SYT7KCNK4TT_t1111q12q13ID100618Male organs: Prostate[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) SYT7/PACS1SYT7PACS1TT_t1111q12q13ID100619Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) TMX2/C11orf80TMX2C11orf80TT_t1111q12q13ID100620Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) ZDHHC5/GPR137ZDHHC5GPR137TT_t1111q12q13ID100621Female organs: Vulva and vagina[Biblio] 
    11q1211q13Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q13) ZFP91/RAB6AZFP91RAB6ATT_t1111q12q13ID100622Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q14Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q14) AAMDC/SCGB1D1AAMDCSCGB1D1TT_t1111q12q14ID100623Head and Neck: Mouth-Oropharynx[Biblio] 
    11q1211q14Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q14) SYTL2/CHRM1SYTL2CHRM1TT_t1111q12q14ID100624Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q14Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q14) ZFP91/NOX4ZFP91NOX4TT_t1111q12q14ID100625Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q23Atlas - Leukemiat(11;11)(q12;q23) KMT2A/BTBD18KMT2ABTBD18TL_t1111q12q23ID3469MPD[Biblio] 
    11q1211q23Atlas - Leukemiat(11;11)(q12;q23) KMT2A/PRPF19KMT2APRPF19TL_t1111q12q23ID2893MPD[Biblio] 
    11q1211q23Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q23) KMT2A/SLC22A10KMT2ASLC22A10TT_t1111q12q23ID100626Urinary system: Bladder[Biblio] 
    11q1211q23Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q23) PATL1/TECTAPATL1TECTATT_t1111q12q23ID100627Nervous system: Central Nervous system[Biblio] 
    11q1211q23Atlas - Leukemiat(11;11)(q12;q23) YPEL4/KMT2AYPEL4KMT2ATL_t1111q12q23ID3338MPD[Biblio] 
    11q1211q24Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q24) ARHGAP32/AHNAKARHGAP32AHNAKTT_t1111q12q24ID100628Female organs: Breast[Biblio] 
    11q1211q25Atlas - Solid Tumort(11;11)(q12;q25) NTM/CCDC86NTMCCDC86TT_t1111q12q25ID100629Nervous system: Central Nervous system[Biblio] 
    11q1212p13Atlas - Leukemiat(11;12)(q12;p13) ETV6/LPXNETV6LPXNTL_t1112q12p13ID2707MPD[Biblio] 
    11q1215q25Atlas - Solid Tumort(11;15)(q12;q25) ARNT2/MS4A3ARNT2MS4A3TT_t1115q12q25ID100926Urinary system: Kidney[Biblio] 
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    Genes in band 11q12

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    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
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    chr11:57299629-57324939 - 11q12 17q21 Gene [CT]   IGFBP4/TNKS1BP1 TNKS1BP1 IGFBP4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57299629-57324939 - 11q12 7q22 Gene [CT]   TNKS1BP1/LRCH4 TNKS1BP1 LRCH4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57299629-57324939 - 11q12 1p34 Gene [CT]   TNKS1BP1/MACF1 TNKS1BP1 MACF1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57299629-57324939 - 11q12 Xq13 Gene [CT]   NLGN3/TNKS1BP1 TNKS1BP1 NLGN3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57299629-57324939 - 11q12 19q13 Gene [CT]   TNKS1BP1/PSG3 TNKS1BP1 PSG3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57299629-57324939 - 11q12 3p21 Gene [CT]   TNKS1BP1/XCR1 TNKS1BP1 XCR1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57299629-57324939 - 11q12 17q11 Gene [CT]   ZNF207/TNKS1BP1 TNKS1BP1 ZNF207 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57299629-57324939 - 11q12   Gene [G]     TNKS1BP1       [Omim] [Entrez]
    chr11:57299629-57324939 - 11q12 7q34 Gene [M]   TNKS1BP1/PRSS1 TNKS1BP1 PRSS1 [Mitelman] Pancreas Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57299629-57324939 - 11q12 19p13 Gene [M]   TNKS1BP1/TYK2 TNKS1BP1 TYK2 [Mitelman] Pancreas Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 11p13 Gene [CT]   SSRP1/EIF3M SSRP1 EIF3M [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 11q12 Gene [CT]   SSRP1/FADS2 SSRP1 FADS2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 14q22 Gene [CT]   FBXO34/SSRP1 SSRP1 FBXO34 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 14q22 Gene [CT]   FBXO34/SSRP1 SSRP1 FBXO34 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 5q13 Gene [CT]   HEXB/SSRP1 SSRP1 HEXB [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 11q12 Gene [CT]   SSRP1/SSRP1 SSRP1 SSRP1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 22q11 Gene [CT]   SSRP1/TRMT2A SSRP1 TRMT2A [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 11q12 Gene [G]   SSRP1/MED19 SSRP1 MED19     [Omim] [Entrez]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 17q21 Gene [GT]   CBX1/SSRP1 SSRP1 CBX1 [GenenTech] NCI-H2122__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 11q12 Gene [M]   SSRP1/MED19 SSRP1 MED19 [Mitelman] Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 13q12 Gene [M]   XPO4/SSRP1 SSRP1 XPO4 [Mitelman] Stomach Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57325985-57335877 - 11q12 11q12 Gene [TF]   SSRP1/MED19 SSRP1 MED19 [TCGA] [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57338352-57372399 + 11q12 19p13 Gene [CT]   PCSK4/P2RX3 P2RX3 PCSK4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57338352-57372399 + 11q12   Gene [G]     P2RX3       [Omim] [Entrez]
    chr11:57338352-57372399 + 11q12 11q12 Gene [M]   RTN4RL2/P2RX3 P2RX3 RTN4RL2 [Mitelman] Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57376769-57381150 - 11q12 22q13 Gene [CT]   TBC1D22A/PRG3 PRG3 TBC1D22A [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chr11:57386787-57390657 - 11q12 1p35 Gene [CT]   EPB41/PRG2 PRG2 EPB41 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57386787-57390657 - 11q12 1p35 Gene [CT]   EPB41/PRG2 PRG2 EPB41 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57386787-57390657 - 11q12 1q23 Gene [CT]   PRG2/F11R PRG2 F11R [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57386787-57390657 - 11q12 Xq28 Gene [CT]   PRG2/FLNA PRG2 FLNA [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57386787-57390657 - 11q12 21p11 Gene [CT]   PRG2/LOC100507412 PRG2 LOC100507412 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57386787-57390657 - 11q12 20p12 Gene [CT]   PRG2/MACROD2 PRG2 MACROD2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57386787-57390657 - 11q12 1q42 Gene [CT]   PRG2/NTPCR PRG2 NTPCR [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57386787-57390657 - 11q12 4q12 Gene [CT]   PDGFRA/PRG2 PRG2 PDGFRA [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57386787-57390657 - 11q12 20q13 Gene [CT]   PRG2/SERINC3 PRG2 SERINC3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57386787-57390657 - 11q12 4q12 Gene [G]   PDGFRA/PRG2 PRG2 PDGFRA     [Omim] [Entrez]
    chr11:57406954-57427148 - 11q12   Gene [CT]   SLC43A3/FAM127A SLC43A3 FAM127A [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57406954-57427148 - 11q12   Gene [G]     SLC43A3       [Omim] [Entrez]
    chr11:57406954-57427148 - 11q12 11p11 Gene [M]   NUP160/SLC43A3 SLC43A3 NUP160 [Mitelman] Soft tissue Angiosarcoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57460537-57477539 + 11q12   Gene [G]     RTN4RL2       [Omim] [Entrez]
    chr11:57460537-57477539 + 11q12 11q12 Gene [M]   RTN4RL2/P2RX3 RTN4RL2 P2RX3 [Mitelman] Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57484531-57515719 - 11q12 13q14 Gene [CT]   LCP1/SLC43A1 SLC43A1 LCP1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57484531-57515719 - 11q12 13q14 Gene [CT]   LCP1/SLC43A1 SLC43A1 LCP1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr11:57484531-57515719 - 11q12   Gene [G]     SLC43A1       [Omim] [Entrez]
    chr11:57528463-57530759 - 11q12   Gene [G]     TIMM10       [Omim] [Entrez]
    chr11:57542641-57550274 + 11q12   Gene [G]     SMTNL1       [Omim] [Entrez]
    chr11:57542641-57550274 + 11q12 11q12 Gene [GT]   TMX2/SMTNL1 SMTNL1 TMX2 [GenenTech] GTL-16__Stomach   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57542641-57550274 + 11q12 11q12 Gene [M]   ZDHHC5/SMTNL1 SMTNL1 ZDHHC5 [Mitelman] Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:57542641-57550274 + 11q12 11q12 Gene [TF]   ZDHHC5/SMTNL1 SMTNL1 ZDHHC5 [TCGA] [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]