Chromosome 12

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 12


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Band 12q14

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  • Chromosomal abnormalities in band 12q14
  • Genes in band 12q14 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 12q14

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    6q1212q14Cosmic_SVu(6;12)(q12;q14)  Cosmic_SV [COST340297]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q1212q14Cosmic_SVu(6;12)(q12;q14)  Cosmic_SV [COST350709]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q1212q14Cosmic_SVu(6;12)(q12;q14)  Cosmic_SV [COST358018]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q1212q14Cosmic_SVu(6;12)(q12;q14)  Cosmic_SV [COST470548]liver__NScarcinoma__NS [COSU322]
    6q2112q14Cosmic_SVu(6;12)(q21;q14)  Cosmic_SV [COST452187]liver__NScarcinoma__NS [COSU322]
    6q2312q14Cosmic_SVu(6;12)(q23;q14)  Cosmic_SV [COST216950]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    6q2312q14Cosmic_SVu(6;12)(q23;q14)  Cosmic_SV [COST452188]liver__NScarcinoma__NS [COSU322]
    6q2512q14Cosmic_SVu(6;12)(q25;q14)  Cosmic_SV [COST154745]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    6q2512q14Cosmic_SVu(6;12)(q25;q14)  Cosmic_SV [COST331617]breast__NScarcinoma__NS [COSU652]
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    6q2512q14Cosmic_SVu(6;12)(q25;q14)  Cosmic_SV [COST464022]liver__NScarcinoma__NS [COSU322]
    7p1112q14Cosmic_SVu(7;12)(p11;q14)  Cosmic_SV [COST214417]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    7p1212q14Cosmic_SVu(7;12)(p12;q14)  Cosmic_SV [COST213324]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    7p1412q14Cosmic_SVu(7;12)(p14;q14)  Cosmic_SV [COST129366]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    7p1412q14Cosmic_SVu(7;12)(p14;q14)  Cosmic_SV [COST16801]breast__NScarcinoma__NS[PubMed] 
    7q1112q14Cosmic_SVu(7;12)(q11;q14)  Cosmic_SV [COST362299]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    7q3612q14Cosmic_SVu(7;12)(q36;q14)  Cosmic_SV [COST320217]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    7q3612q14Cosmic_SVu(7;12)(q36;q14)  Cosmic_SV [COST386567]NS__NSNS__NS [COSU652]
    8p1112q14Cosmic_SVu(8;12)(p11;q14)  Cosmic_SV [COST189607]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU538]
    8p2112q14Cosmic_SVu(8;12)(p21;q14)  Cosmic_SV [COST191096]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU538]
    8p2112q14Cosmic_SVu(8;12)(p21;q14)  Cosmic_SV [COST191887]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU538]
    8q2112q14Cosmic_SVu(8;12)(q21;q14)  Cosmic_SV [COST114977]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    8q2112q14Cosmic_SVu(8;12)(q21;q14)  Cosmic_SV [COST117665]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    8q2112q14Cosmic_SVu(8;12)(q21;q14)  Cosmic_SV [COST370264]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    8q2112q14Cosmic_SVu(8;12)(q21;q14)  Cosmic_SV [COST385454]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    8q2112q14Cosmic_SVu(8;12)(q21;q14)  Cosmic_SV [COST402628]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    8q2212q14Cosmic_SVu(8;12)(q22;q14)  Cosmic_SV [COST359186]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    8q2312q14Cosmic_SVu(8;12)(q23;q14)  Cosmic_SV [COST348674]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    8q2312q14Cosmic_SVu(8;12)(q23;q14)  Cosmic_SV [COST375057]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    8q2412q14Cosmic_SVu(8;12)(q24;q14)  Cosmic_SV [COST25525]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed][COSU385]
    8q2412q14Cosmic_SVu(8;12)(q24;q14)  Cosmic_SV [COST332998]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    8q2412q14Cosmic_SVu(8;12)(q24;q14)  Cosmic_SV [COST338284]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    8q2412q14Cosmic_SVu(8;12)(q24;q14)  Cosmic_SV [COST364500]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    8q2412q14Cosmic_SVu(8;12)(q24;q14)  Cosmic_SV [COST390773]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    9p1312q14Cosmic_SVu(9;12)(p13;q14)  Cosmic_SV [COST114435]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9p2112q14Cosmic_SVu(9;12)(p21;q14)  Cosmic_SV [COST159745]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9p2112q14Cosmic_SVu(9;12)(p21;q14)  Cosmic_SV [COST452872]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    9p2212q14Cosmic_SVu(9;12)(p22;q14)  Cosmic_SV [COST134100]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU534]
    9p2212q14Cosmic_SVu(9;12)(p22;q14)  Cosmic_SV [COST134176]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU534]
    9p2312q14Cosmic_SVu(9;12)(p23;q14)  Cosmic_SV [COST375680]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    9p2412q14Cosmic_SVu(9;12)(p24;q14)  Cosmic_SV [COST347677]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    9q2112q14Cosmic_SVu(9;12)(q21;q14)  Cosmic_SV [COST391862]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    Xq2112q14Cosmic_SVu(X;12)(q21;q14)  Cosmic_SV [COST450812]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]

    Genes in band 12q14

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr12:57724293-57738246 - 12q14 17q21 Gene [AM]   COL1A1/AGAP2 AGAP2 COL1A1 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr12:57724293-57738246 - 12q14 17q21 Gene [AM]   COL1A1/AGAP2 AGAP2 COL1A1 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr12:57724293-57738246 - 12q14 12q15 Gene [AM]   YEATS4/AGAP2 AGAP2 YEATS4 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr12:57724293-57738246 - 12q14   Gene [A]     AGAP2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr12:57724293-57738246 - 12q14 7q22 Gene [CT]   BUD31/AGAP2 AGAP2 BUD31 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr12:57724293-57738246 - 12q14 19q13 Gene [CT]   AGAP2/IL11 AGAP2 IL11 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr12:57724293-57738246 - 12q14 12q13 Gene [CT]   ZNF740/AGAP2 AGAP2 ZNF740 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr12:57724293-57738246 - 12q14 8q22 Gene [M]   AGAP2/TMEM67 AGAP2 TMEM67 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr12:57724293-57738246 - 12q14 8q22 Gene [TF]   AGAP2/TMEM67 AGAP2 TMEM67 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-GBM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr12:57726240-57728356 + 12q14   Gene [G]     AGAP2-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 5q31 Gene [AM]   CTNNA1/TSPAN31 TSPAN31 CTNNA1 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 5q31 Gene [AM]   CTNNA1/TSPAN31 TSPAN31 CTNNA1 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 1q31 Gene [AM]   DENND1B/TSPAN31 TSPAN31 DENND1B [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 1q31 Gene [AM]   DENND1B/TSPAN31 TSPAN31 DENND1B [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 17q21 Gene [AM]   GFAP/TSPAN31 TSPAN31 GFAP [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 17q21 Gene [AM]   TSPAN31/GFAP TSPAN31 GFAP [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 17q21 Gene [AM]   TSPAN31/GFAP TSPAN31 GFAP [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 17q21 Gene [AM]   TSPAN31/GFAP TSPAN31 GFAP [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 12q15 Gene [AM]   MDM2/TSPAN31 TSPAN31 MDM2 [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 12q15 Gene [AM]   MDM2/TSPAN31 TSPAN31 MDM2 [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 7q32 Gene [AM]   METTL2B/TSPAN31 TSPAN31 METTL2B [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 7q32 Gene [AM]   METTL2B/TSPAN31 TSPAN31 METTL2B [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr12:57744989-57748243 + 12q14 7q32 Gene [AM]   METTL2B/TSPAN31