Chromosome 13

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 13


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Band 13q13

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  • Chromosomal abnormalities in band 13q13
  • Genes in band 13q13
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  • References

    Chromosomal abnormalities in band 13q13

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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    13q1313q14Mitelmandel(13)(q13q14)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
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    13q1313q21Mitelmandel(13)(q13q21)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
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    13q1313q21Mitelmandel(13)(q13q21)  Mitelman (CGAP) Idiopathic myelofibrosis  
    13q1313q21Mitelmandel(13)(q13q21)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    13q1313q21Mitelmandel(13)(q13q21)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    13q1313q21Mitelmandel(13)(q13q21)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with ringed sideroblasts  
    13q1313q21Mitelmandel(13)(q13q21)  Mitelman (CGAP) Refractory cytopenia with multilineage dysplasia  
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    13q1313q22Mitelmandel(13)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    13q1313q22Mitelmandel(13)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    13q1313q22Mitelmandel(13)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    13q1313q22Mitelmandel(13)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    13q1313q22Mitelmandel(13)(q13q22)  Mitelman (CGAP)EyeRetinoblastoma  
    13q1313q22Mitelmandel(13)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    13q1313q22Mitelmandel(13)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    13q1313q22Mitelmandel(13)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia  
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    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Idiopathic myelofibrosis  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic syndrome, NOS  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Polycythemia vera  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
    13q1313q31Mitelmandel(13)(q13q31)  Mitelman (CGAP)Soft tissueLipoma  
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    13q1313q32Mitelmandel(13)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    13q1313q32Mitelmandel(13)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
    13q1313q32Mitelmandel(13)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Idiopathic myelofibrosis  
    1q4313q13Mitelmander(1)t(1;13)(q43;q13)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Heart Nonneoplastic mesenchymal disorder/lesion [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Stomach Nonneoplastic epithelial disorder/lesion [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr13:33006625-33113022 - 13q13 13q13 Gene [GT]   BRCA2/N4BP2L2 N4BP2L2 BRCA2 [Cosmic]
    [GenenTech]
    C2BBe1__Colo-Rectal   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33006625-33113022 - 13q13 4q12 Gene [GT]   DCUN1D4/N4BP2L2 N4BP2L2 DCUN1D4 [Cosmic]
    [GenenTech]
    BT-20__Breast   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33006625-33113022 - 13q13 13q22 Gene [GT]   MYCBP2/N4BP2L2 N4BP2L2 MYCBP2 [Cosmic]
    [GenenTech]
    NCI-H1623__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 17q11 Gene [G]   NF1/PDS5B PDS5B NF1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 7q21 Gene [GT]   GTPBP10/PDS5B PDS5B GTPBP10 [Cosmic]
    [GenenTech]
    COV413B__Ovary   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 19q13 Gene [M]   PDS5B/CD3EAP PDS5B CD3EAP [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 22q12 Gene [M]   PDS5B/CRYBB1 PDS5B CRYBB1 [Cosmic]
    [Mitelman]
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    chr13:33160564-33352158 + 13q13 17q11 Gene [M]   NF1/PDS5B PDS5B NF1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 12q23 Gene [M]   POLR3B/PDS5B PDS5B POLR3B [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 13q34 Gene [M]   TUBGCP3/PDS5B PDS5B TUBGCP3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Large intestine Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 6p21 Gene [M]   PDS5B/UBR2 PDS5B UBR2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 19q13 Gene [TF]   PDS5B/CD3EAP PDS5B CD3EAP [Cosmic]
    [TCGA]
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    chr13:33160564-33352158 + 13q13 22q12 Gene [TF]   PDS5B/CRYBB1 PDS5B CRYBB1 [Cosmic]
    [TCGA]
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    chr13:33160564-33352158 + 13q13 17q11 Gene [TF]   NF1/PDS5B PDS5B NF1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 12q23 Gene [TF]   POLR3B/PDS5B PDS5B POLR3B [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33160564-33352158 + 13q13 6p21 Gene [TF]   PDS5B/UBR2 PDS5B UBR2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33383328-33485790 - 13q13   Gene [G]     LINC00423       [Omim] [Entrez]
    chr13:33590571-33640282 + 13q13   Gene [G]     KL   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:33590571-33640282 + 13q13 13q12 Gene [GT]   MTMR6/KL KL MTMR6 [Cosmic]
    [GenenTech]
    G111__Brain   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33691685-33760216 - 13q13 10q21 Gene [CT]   BICC1/STARD13 STARD13 BICC1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:33691685-33760216 - 13q13 5q31 Gene [CT]   DDX46/STARD13 STARD13 DDX46 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:33691685-33760216 - 13q13 7q22 Gene [CT]   POLR2J/STARD13 STARD13 POLR2J [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:33691685-33760216 - 13q13 6q25 Gene [CT]   STARD13/PPP1R14C STARD13 PPP1R14C [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:33691685-33760216 - 13q13 13q13 Gene [CT]   STARD13/STARD13 STARD13 STARD13 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:33691685-33760216 - 13q13 Xp11 Gene [CT]   STARD13/TSR2 STARD13 TSR2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:33691685-33760216 - 13q13 1p36 Gene [M]   STARD13/TNFRSF8 STARD13 TNFRSF8 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33691685-33760216 - 13q13   Gene [A]     STARD13   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:33691685-33760216 - 13q13 1p36 Gene [TF]   STARD13/TNFRSF8 STARD13 TNFRSF8 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:33851691-33855471 + 13q13   Gene [G]     STARD13-AS       [Omim] [Entrez]
    chr13:34392206-34411644 + 13q13 7q31 Gene [K]   FOXP2/RFC3 RFC3 FOXP2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:34392206-34411644 + 13q13 10q11 Gene [CT]   RASSF4/RFC3 RFC3 RASSF4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:34392206-34411644 + 13q13   Gene [G]     RFC3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:34392206-34411644 + 13q13 13q12 Gene [M]   PAN3/RFC3 RFC3 PAN3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Large intestine Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:35009591-35214822 - 13q13   Gene [G]     LINC00457       [Omim] [Entrez]
    chr13:36047926-36050832 - 13q13   Gene [G]     MAB21L1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:36050886-36246874 + 13q13 13q31 Gene [AM]   NBEA/NDFIP2 NBEA NDFIP2 [Cosmic]
    [TCGA-LUAD]     [Omim] [Entrez]
    chr13:36050886-36246874 + 13q13 10p14 Gene [CT]   CELF2/NBEA NBEA CELF2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:36050886-36246874 + 13q13 9p24 Gene [CT]   NBEA/RANBP6 NBEA RANBP6 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:36050886-36246874 + 13q13 6q13 Gene [CT]   SMAP1/NBEA NBEA SMAP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:36050886-36246874 + 13q13 6q13 Gene [G]   SMAP1/NBEA NBEA SMAP1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:36050886-36246874 + 13q13 8q24 Gene [H2]   PVT1/NBEA NBEA PVT1 [Cosmic] multiple myeloma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36050886-36246874 + 13q13 8q24 Gene [H2]   PVT1/NBEA NBEA PVT1 [Cosmic] multiple myeloma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36050886-36246874 + 13q13 13q14 Gene [M]   GTF2F2/NBEA NBEA GTF2F2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36050886-36246874 + 13q13 8q24 Gene [M]   PVT1/NBEA NBEA PVT1 [Cosmic]
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    Multiple myeloma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr13:36050886-36246874 + 13q13 13q31 Gene [TF]   NBEA/NDFIP2 NBEA NDFIP2 [Cosmic]
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    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36271864-36273392 + 13q13   Gene [G]     LINC00445       [Omim] [Entrez]
    chr13:36342789-36429998 - 13q13 14q22 Gene [CT]   DCLK1/KTN1 DCLK1 KTN1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:36342789-36429998 - 13q13 Yp11 Gene [FC]   DCLK1/RPS4Y1 DCLK1 RPS4Y1 [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Hepatocellular cancer [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36342789-36429998 - 13q13 2q32 Gene [G]   DCLK1/COL3A1 DCLK1 COL3A1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:36342789-36429998 - 13q13 2q32 Gene [M]   DCLK1/COL3A1 DCLK1 COL3A1 [Cosmic]
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36342789-36429998 - 13q13 1p31 Gene [M]   NFIA/DCLK1 DCLK1 NFIA [Cosmic]
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36342789-36429998 - 13q13 13q14 Gene [M]   DCLK1/RCBTB1 DCLK1 RCBTB1 [Cosmic]
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36342789-36429998 - 13q13 13q14 Gene [M]   DCLK1/SERPINE3 DCLK1 SERPINE3 [Cosmic]
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36342789-36429998 - 13q13 13q32 Gene [TF]   GGACT/DCLK1 DCLK1 GGACT [Cosmic]
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    chr13:36342789-36429998 - 13q13 1p31 Gene [TF]   NFIA/DCLK1 DCLK1 NFIA [Cosmic]
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    chr13:36342789-36429998 - 13q13 13q14 Gene [TF]   DCLK1/RCBTB1 DCLK1 RCBTB1 [Cosmic]
    [TCGA]
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    chr13:36342789-36429998 - 13q13 13q14 Gene [TF]   DCLK1/SERPINE3 DCLK1 SERPINE3 [Cosmic]
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    chr13:36742345-36871992 - 13q13   Gene [G]     CCDC169-SOHLH2       [Omim] [Entrez]
    chr13:36756129-36788752 - 13q13 19q13 Gene [CT]   PPP6R1/SOHLH2 SOHLH2 PPP6R1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    chr13:36756129-36788752 - 13q13   Gene [G]     SOHLH2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:36804912-36871992 - 13q13   Gene [G]     CCDC169   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:36804912-36871992 - 13q13 13q32 Gene [M]   ABCC4/CCDC169 CCDC169 ABCC4 [Cosmic]
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    chr13:36804912-36871992 - 13q13 2q36 Gene [M]   AGFG1/CCDC169 CCDC169 AGFG1 [Cosmic]
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    chr13:36804912-36871992 - 13q13 13q12 Gene [M]   NUP58/CCDC169 CCDC169 NUP58 [Cosmic]
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    [TCGA]
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    chr13:36804912-36871992 - 13q13 13q12 Gene [TF]   NUP58/CCDC169 CCDC169 NUP58 [Cosmic]
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    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:36875775-36944317 - 13q13 16p13 Gene [CT]   RBFOX1/SPG20 SPG20 RBFOX1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:36875775-36944317 - 13q13   Gene [G]     SPG20   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:36920568-36943872 + 13q13   Gene [G]     SPG20-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr13:36920568-36943872 + 13q13 20q11 Gene [M]   TRPC4AP/SPG20-AS1 SPG20-AS1 TRPC4AP [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:37006409-37017019 + 13q13   Gene [A]     CCNA1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:37248049-37271975 + 13q13   Gene [G]     SERTM1       [Omim] [Entrez]
    chr13:37393339-37403740 + 13q13   Gene [G]     RFXAP   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:37418968-37494409 - 13q13 13q14 Gene [CT]   GTF2F2/SMAD9 SMAD9 GTF2F2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:37418968-37494409 - 13q13   Gene [G]     SMAD9   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    [TCGA-LUAD]     [Omim] [Entrez]
    chr13:37523908-37573504 - 13q13 20q11 Gene [CT]   ALG5/PIGU ALG5 PIGU [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:37523908-37573504 - 13q13 20q11 Gene [CT]   PIGU/ALG5 ALG5 PIGU [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:37523908-37573504 - 13q13 17q24 Gene [CT]   ALG5/PRKCA ALG5 PRKCA [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:37523908-37573504 - 13q13   Gene [G]     ALG5   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:37523908-37573504 - 13q13 20q11 Gene [M]   ALG5/PIGU ALG5 PIGU [Cosmic]
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    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:37523908-37573504 - 13q13 20q11 Gene [M]   PIGU/ALG5 ALG5 PIGU [Cosmic]
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    chr13:37523908-37573504 - 13q13 7q11 Gene [M]   ALG5/WBSCR17 ALG5 WBSCR17 [Cosmic]
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    Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:37523908-37573504 - 13q13 7q11 Gene [TF]   ALG5/WBSCR17 ALG5 WBSCR17 [Cosmic]
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    chr13:37574678-37583751 + 13q13   Gene [G]     EXOSC8   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:37583451-37633850 - 13q13 12q12 Gene [CT]   ARID2/SUPT20H SUPT20H ARID2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr13:37583451-37633850 - 13q13 9p13 Gene [CT]   RNF38/SUPT20H SUPT20H RNF38 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr13:37583451-37633850 - 13q13 13q13 Gene [CT]   SUPT20H/SUPT20H SUPT20H SUPT20H [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr13:37583451-37633850 - 13q13   Gene [G]     SUPT20H       [Omim] [Entrez]
    chr13:37583451-37633850 - 13q13 11p15 Gene [GT]   HTATIP2/SUPT20H SUPT20H HTATIP2 [GenenTech] NCI-H1623__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:37677397-37679801 - 13q13   Gene [G]     CSNK1A1L   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:38055601-38058921 - 13q13   Gene [G]     LINC01048       [Omim] [Entrez]
    chr13:38109077-38125673 + 13q13   Gene [G]     LINC00547       [Omim] [Entrez]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 7q21 Gene [AM]   COL1A2/POSTN POSTN COL1A2 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 8p23 Gene [AM]   CTSB/POSTN POSTN CTSB [Cosmic]
    [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 3q25 Gene [AM]   POSTN/WWTR1 POSTN WWTR1 [Cosmic]
    [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 2q37 Gene [CT]   COL6A3/POSTN POSTN COL6A3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 2q37 Gene [CT]   COL6A3/POSTN POSTN COL6A3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 2q37 Gene [CT]   COL6A3/POSTN POSTN COL6A3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 11q23 Gene [CT]   POSTN/NCAM1 POSTN NCAM1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 13q13 Gene [CT]   POSTN/POSTN POSTN POSTN [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 9p22 Gene [CT]   RPS6/POSTN POSTN RPS6 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 14q32 Gene [G]   POSTN/YY1 POSTN YY1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 10q24 Gene [M]   POSTN/TM9SF3 POSTN TM9SF3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 1p13 Gene [M]   POSTN/TRIM33 POSTN TRIM33 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 14q32 Gene [M]   POSTN/YY1 POSTN YY1 [Cosmic]
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:38136719-38172981 - 13q13 14q32 Gene [TF]   POSTN/YY1 POSTN YY1 [Cosmic]
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    chr13:38210773-38443939 - 13q13 11p15 Gene [CT]   SMPD1/TRPC4 TRPC4 SMPD1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38210773-38443939 - 13q13 13q13 Gene [CT]   TRPC4/TRPC4 TRPC4 TRPC4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38210773-38443939 - 13q13 13q13 Gene [CT]   TRPC4/TRPC4 TRPC4 TRPC4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38210773-38443939 - 13q13 13q13 Gene [CT]   TRPC4/TRPC4 TRPC4 TRPC4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38210773-38443939 - 13q13 13q13 Gene [CT]   TRPC4/TRPC4 TRPC4 TRPC4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38210773-38443939 - 13q13   Gene [G]     TRPC4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:38624954-38717369 - 13q13   Gene [G]     LINC00571       [Omim] [Entrez]
    chr13:38923908-38937144 + 13q13 12q13 Gene [CT]   UFM1/ASB8 UFM1 ASB8 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38923908-38937144 + 13q13 13q13 Gene [CT]   UFM1/UFM1 UFM1 UFM1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:38923908-38937144 + 13q13   Gene [G]     UFM1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:39106137-39260812 - 13q13   Gene [G]     LINC00437       [Omim] [Entrez]
    chr13:39141861-39153653 + 13q13   Gene [G]     LINC00366       [Omim] [Entrez]
    chr13:39261173-39461267 + 13q13 13q14 Gene [AM]   FREM2/MTRF1 FREM2 MTRF1 [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr13:39261173-39461267 + 13q13 6q26 Gene [CT]   FREM2/QKI FREM2 QKI [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39261173-39461267 + 13q13   Gene [G]     FREM2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:39261173-39461267 + 13q13 13q14 Gene [M]   FREM2/MTRF1 FREM2 MTRF1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39540062-39564996 - 13q13 Xp11 Gene [CT]   KDM6A/STOML3 STOML3 KDM6A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39540062-39564996 - 13q13   Gene [G]     STOML3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:39584002-39612213 - 13q13 2q23 Gene [CT]   PROSER1/FMNL2 PROSER1 FMNL2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr13:39584002-39612213 - 13q13 13q13 Gene [CT]   NHLRC3/PROSER1 PROSER1 NHLRC3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr13:39584002-39612213 - 13q13 6q25 Gene [CT]   SYTL3/PROSER1 PROSER1 SYTL3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr13:39584002-39612213 - 13q13 5q32 Gene [CT]   PROSER1/TCOF1 PROSER1 TCOF1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr13:39584002-39612213 - 13q13   Gene [G]     PROSER1       [Omim] [Entrez]
    chr13:39612448-39624244 + 13q13 6q14 Gene [CT]   NHLRC3/PHIP NHLRC3 PHIP [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39612448-39624244 + 13q13 6q14 Gene [CT]   NHLRC3/PHIP NHLRC3 PHIP [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39612448-39624244 + 13q13 13q13 Gene [CT]   NHLRC3/PROSER1 NHLRC3 PROSER1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39612448-39624244 + 13q13   Gene [G]     NHLRC3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 6q27 Gene [CEN]   LHFP/T LHFP T [Cosmic]
    [Census]
    M lipoma   [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [COF]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic]
    [Fusion 976]
    soft_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [COF]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic]
    [Fusion 977]
    soft_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 16q22 Gene [CT]   AARS/LHFP LHFP AARS [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 7q11 Gene [CT]   AUTS2/LHFP LHFP AUTS2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 10q24 Gene [CT]   CYP17A1/LHFP LHFP CYP17A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 13q13 Gene [CT]   LHFP/LHFP LHFP LHFP [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 8p11 Gene [CT]   LHFP/PLEKHA2 LHFP PLEKHA2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 8p11 Gene [CT]   PLEKHA2/LHFP LHFP PLEKHA2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 8p21 Gene [CT]   LHFP/REEP4 LHFP REEP4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 11q22 Gene [CT]   LHFP/ZC3H12C LHFP ZC3H12C [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 13q14 Gene [GT]   VWA8/LHFP LHFP VWA8 [Cosmic]
    [GenenTech]
    HCC1493__Breast   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [H2]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic] mesenchymal tumor [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [H2]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic] lipoma   [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [H2]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic] lipoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [H2]   LHFP/HMGA2 LHFP HMGA2 [Cosmic] lipoma   [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [H2]   LHFP/HMGA2 LHFP HMGA2 [Cosmic] lipoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [H3]   LHFP/HMGA2 LHFP HMGA2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [H3]   LHFP/HMGA2 LHFP HMGA2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [H3]   LHFP/HMGA2 LHFP HMGA2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [H3]   LHFP/HMGA2 LHFP HMGA2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [A]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [A]   LHFP/HMGA2 LHFP HMGA2 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [L]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 13q14 Gene [M]   COG6/LHFP LHFP COG6 [Cosmic]
    [Mitelman]
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    [Mitelman]
    Soft tissue Lipoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 13q21 Gene [M]   TDRD3/LHFP LHFP TDRD3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 14q32 Gene [M]   UNC79/LHFP LHFP UNC79 [Cosmic]
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    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [PM]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [S]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 13q14 Gene [TF]   COG6/LHFP LHFP COG6 [Cosmic]
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    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 13q21 Gene [TF]   TDRD3/LHFP LHFP TDRD3 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 14q32 Gene [TF]   UNC79/LHFP LHFP UNC79 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:39917029-40177356 - 13q13 12q14 Gene [URK]   HMGA2/LHFP LHFP HMGA2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr13:40015301-40015941 - 13q13   Gene [G]     TNAP   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 13q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 13q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjanv. 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 13q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/13q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mar. janv. 10 12:58:37 CET 2017


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