Chromosome 14

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 14


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Band 14q13

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  • Chromosomal abnormalities in band 14q13
  • Genes in band 14q13 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 14q13

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    Xp2214q13Cosmic_SVu(X;14)(p22;q13)  Cosmic_SV [COST335741]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
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    Genes in band 14q13

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
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    chr14:32939253-33804176 + 14q13 7q32 Gene [G]   SMO/NPAS3 NPAS3 SMO [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr14:32939253-33804176 + 14q13 4p14 Gene [GT]   FAM114A1/NPAS3 NPAS3 FAM114A1 [Cosmic]
    [GenenTech]
    NCI-H2810__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:32939253-33804176 + 14q13 14q12 Gene [M]   NPAS3/AKAP6 NPAS3 AKAP6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:32939253-33804176 + 14q13 14q23 Gene [M]   ARID4A/NPAS3 NPAS3 ARID4A [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:32939253-33804176 + 14q13 14q12 Gene [M]   FOXG1/NPAS3 NPAS3 FOXG1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:32939253-33804176 + 14q13 14q24 Gene [M]   RGS6/NPAS3 NPAS3 RGS6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:32939253-33804176 + 14q13 14q12 Gene [TF]   NPAS3/AKAP6 NPAS3 AKAP6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:32939253-33804176 + 14q13 14q23 Gene [TF]   ARID4A/NPAS3 NPAS3 ARID4A [Cosmic]
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    chr14:32939253-33804176 + 14q13 14q13 Gene [TF]   MIPOL1/NPAS3 NPAS3 MIPOL1 [Cosmic]
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    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:32939253-33804176 + 14q13 14q24 Gene [TF]   RGS6/NPAS3 NPAS3 RGS6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LGG]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:32939253-33804176 + 14q13   Gene [TF]   RP11-468E2.1/NPAS3 NPAS3 RP11-468E2.1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33708937-33709113 + 14q13   Gene [G]     SNORA89       [Omim] [Entrez]
    chr14:33924215-33951078 - 14q13 17p13 Gene [CT]   EGLN3/NCBP3 EGLN3 NCBP3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr14:33924215-33951078 - 14q13 5q13 Gene [CT]   UTP15/EGLN3 EGLN3 UTP15 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [TCGA]
    [TCGA-GBM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33924215-33951078 - 14q13 14q12 Gene [TF]   STRN3/EGLN3 EGLN3 STRN3 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr14:34432938-34462262 - 14q13   Gene [G]     SPTSSA       [Omim] [Entrez]
    chr14:34515929-34539737 - 14q13 4q12 Gene [CT]   REST/EAPP EAPP REST [Cosmic]
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        [Omim] [GenBank]
    chr14:34515929-34539737 - 14q13 4q12 Gene [G]   REST/EAPP EAPP REST [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr14:34515929-34539737 - 14q13 14q13 Gene [G]   EAPP/SNX6 EAPP SNX6 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34515929-34539737 - 14q13 3q26 Gene [TF]   EAPP/USP13 EAPP USP13 [Cosmic]
    [TCGA]
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    chr14:34561093-34630183 - 14q13 15q22 Gene [CT]   SNX6/HERC1 SNX6 HERC1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13   Gene [FC]   AD_1/SNX6 SNX6 AD_1 [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Lung cancer [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13   Gene [FC]   cytochrome_b/SNX6 SNX6 cytochrome_b [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Burkitt lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13   Gene [G]   AD_1/SNX6 SNX6 AD_1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13   Gene [G]   cytochrome_b/SNX6 SNX6 cytochrome_b [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13 14q13 Gene [G]   EAPP/SNX6 SNX6 EAPP [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13 14q13 Gene [G]   SNX6/MIPOL1 SNX6 MIPOL1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13 20q13 Gene [G]   PCMTD2/SNX6 SNX6 PCMTD2 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13 19p13 Gene [G]   SNX6/TCF3 SNX6 TCF3 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    chr14:34561093-34630183 - 14q13 20q13 Gene [M]   PCMTD2/SNX6 SNX6 PCMTD2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13 14q13 Gene [TF]   EAPP/SNX6 SNX6 EAPP [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13 14q13 Gene [TF]   SNX6/MIPOL1 SNX6 MIPOL1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34561093-34630183 - 14q13 20q13 Gene [TF]   PCMTD2/SNX6 SNX6 PCMTD2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34710382-34714823 - 14q13 2q24 Gene [CT]   CFL2/NOSTRIN CFL2 NOSTRIN [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr14:34710382-34714823 - 14q13 2q24 Gene [CT]   CFL2/NOSTRIN CFL2 NOSTRIN [Cosmic]
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        [Omim] [GenBank]
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    chr14:34752731-34875647 - 14q13 10q21 Gene [CT]   CCAR1/BAZ1A BAZ1A CCAR1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr14:34752731-34875647 - 14q13 13q32 Gene [CT]   BAZ1A/DOCK9 BAZ1A DOCK9 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    HCC2688(UTSW)__Breast   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [GenenTech]
    NCI-H510A__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr14:35085468-35122542 - 14q13 14q32 Gene [TF]   WARS/PPP2R3C PPP2R3C WARS [Cosmic]
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    [ChiTaRS]  
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    NCI-H2170__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    NCI-H2198__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Lung cancer|Lung Cancer Non-Small Cell|Lung cancer [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 14q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 14q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedfevr. 2018Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 14q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/14q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : ven. fevr. 23 13:19:07 CET 2018


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