Chromosome 14

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 14


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Band 14q13

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    Chromosomal abnormalities in band 14q13

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    Genes in band 14q13

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    GoldenPath hg19 (Kb)Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
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    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33408459-34273382 + 14q13 14q12 Gene [M]   FOXG1/NPAS3 NPAS3 FOXG1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33408459-34273382 + 14q13 14q13 Gene [M]   MIPOL1/NPAS3 NPAS3 MIPOL1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33408459-34273382 + 14q13 14q11 Gene [M]   NPAS3/OXA1L NPAS3 OXA1L [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33408459-34273382 + 14q13 14q24 Gene [M]   RGS6/NPAS3 NPAS3 RGS6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33408459-34273382 + 14q13 14q12 Gene [TF]   NPAS3/AKAP6 NPAS3 AKAP6 [Cosmic]
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    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33408459-34273382 + 14q13 14q23 Gene [TF]   ARID4A/NPAS3 NPAS3 ARID4A [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33408459-34273382 + 14q13 14q13 Gene [TF]   MIPOL1/NPAS3 NPAS3 MIPOL1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33408459-34273382 + 14q13 14q24 Gene [TF]   RGS6/NPAS3 NPAS3 RGS6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LGG]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:33408459-34273382 + 14q13   Gene [TF]   RP11-468E2.1/NPAS3 NPAS3 RP11-468E2.1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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        [Omim] [GenBank]
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        [Omim] [GenBank]
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    chr14:34393421-34420032 - 14q13 14q12 Gene [M]   AKAP6/EGLN3 EGLN3 AKAP6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34393421-34420032 - 14q13 14q12 Gene [M]   STRN3/EGLN3 EGLN3 STRN3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34393421-34420032 - 14q13 14q12 Gene [TF]   AKAP6/EGLN3 EGLN3 AKAP6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-GBM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34393421-34420032 - 14q13 14q12 Gene [TF]   STRN3/EGLN3 EGLN3 STRN3 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34902144-34931468 - 14q13 14q13 Gene [CT]   SPTSSA/SPTSSA SPTSSA SPTSSA [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr14:34985135-35008943 - 14q13   Gene [G]     EAPP   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr14:34985135-35008943 - 14q13 14q13 Gene [M]   EAPP/SNX6 EAPP SNX6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34985135-35008943 - 14q13 3q26 Gene [M]   EAPP/USP13 EAPP USP13 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34985135-35008943 - 14q13 14q13 Gene [TF]   EAPP/SNX6 EAPP SNX6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:34985135-35008943 - 14q13 3q26 Gene [TF]   EAPP/USP13 EAPP USP13 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:35030618-35099315 - 14q13 15q22 Gene [CT]   SNX6/HERC1 SNX6 HERC1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr14:35030618-35099315 - 14q13 13q14 Gene [CT]   SNX6/ZC3H13 SNX6 ZC3H13 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr14:35030618-35099315 - 14q13   Gene [FC]   AD_1/SNX6 SNX6 AD_1 [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Lung cancer [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:35030618-35099315 - 14q13   Gene [FC]   cytochrome_b/SNX6 SNX6 cytochrome_b [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Burkitt lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:35030618-35099315 - 14q13 19p13 Gene [G]   SNX6/TCF3 SNX6 TCF3 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr14:35030618-35099315 - 14q13 14q13 Gene [M]   EAPP/SNX6 SNX6 EAPP [Cosmic]
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    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr14:35030618-35099315 - 14q13 20q13 Gene [TF]   PCMTD2/SNX6 SNX6 PCMTD2 [Cosmic]
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    chr14:35179588-35183761 - 14q13 2q24 Gene [CT]   CFL2/NOSTRIN CFL2 NOSTRIN [Cosmic]
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    chr14:35179588-35183761 - 14q13 2q24 Gene [CT]   CFL2/NOSTRIN CFL2 NOSTRIN [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr14:35179588-35183761 - 14q13 2q24 Gene [CT]   CFL2/NOSTRIN CFL2 NOSTRIN [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    chr14:35179588-35183761 - 14q13   Gene [G]     CFL2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    [ChiTaRS]  
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
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    chr14:35221937-35344853 - 14q13 19p13 Gene [TF]   ZNF253/BAZ1A BAZ1A ZNF253 [Cosmic]
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    chr14:35409128-35409702 + 14q13   Gene [G]     IGBP1P1       [Omim] [Entrez]
    chr14:35409128-35409702 + 14q13 14q21 Gene [M]   SEC23A/IGBP1P1 IGBP1P1 SEC23A [Mitelman] Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:35452104-35498773 + 14q13 14q21 Gene [CT]   ATP5S/SRP54 SRP54 ATP5S [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    [ChiTaRS]  
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    chr14:35514113-35552589 + 14q13 8q24 Gene [CT]   EXT1/FAM177A1 FAM177A1 EXT1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    chr14:35514113-35552589 + 14q13 14q13 Gene [CT]   FAM177A1/FAM177A1 FAM177A1 FAM177A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    [ChiTaRS]  
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    [ChiTaRS]  
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    [ChiTaRS]  
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    chr14:37667118-38020464 + 14q13 14q21 Gene [TF]   TTC6/MIPOL1 MIPOL1 TTC6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:37667118-38020464 + 14q13 14q21 Gene [TF]   TTC6/MIPOL1 MIPOL1 TTC6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:37667118-38020464 + 14q13 14q21 Gene [TF]   TTC6/MIPOL1 MIPOL1 TTC6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:37667118-38020464 + 14q13 14q21 Gene [TF]   TTC6/MIPOL1 MIPOL1 TTC6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr14:37667118-38020464 + 14q13 7p21 Gene [TIC]   DGKB/MIPOL1 MIPOL1 DGKB [Cosmic]
    [TICdb]
      [PubMed] [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 14q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 14q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedfévr. 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 14q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/14q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mar. févr. 14 12:32:35 CET 2017


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