Chromosome 15

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 15


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Band 15q11

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  • Chromosomal abnormalities in band 15q11
  • Genes in band 15q11 (reference hg38)
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  • References

    Chromosomal abnormalities in band 15q11

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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    Xp1115q11Mitelmander(X)t(X;15)(p11;q11)  Mitelman (CGAP)Soft tissueSynovial sarcoma  
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    15q1115q13dbCRIDdup(15)(q11q13)  10248Mental Retardation Syndrome[PubMed] 
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    9q2215q11Cosmic_SVu(9;15)(q22;q11)  Cosmic_SV [COST156272]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    Xp2215q11Cosmic_SVu(X;15)(p22;q11)  Cosmic_SV [COST170355]adrenal_gland__adrenal_glandadrenal_cortical_carcinoma__virilizing_syndrome_producing[PubMed] 
    Xq2615q11Cosmic_SVu(X;15)(q26;q11)  Cosmic_SV [COST170351]adrenal_gland__adrenal_glandadrenal_cortical_carcinoma__virilizing_syndrome_producing[PubMed] 

    Genes in band 15q11

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    chr15:22479153-22482374 - 15q11 19p13 Gene [G]   ELL/HERC2P7 HERC2P7 ELL     [Omim] [Entrez]
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    chr15:22494837-22590831 + 15q11 15q13 Gene [FC]   HERC2/HERC2P2 HERC2P2 HERC2 [FusCancer]   Chronic myelogenous leukemia|Melanoma|Neuroblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22869465-22917313 - 15q11 15q11 Gene [M]   CYFIP1/TUBGCP5 CYFIP1 TUBGCP5 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22869465-22917313 - 15q11 15q21 Gene [TF]   TEX9/CYFIP1 CYFIP1 TEX9 [Cosmic]
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    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22869465-22917313 - 15q11 15q11 Gene [TF]   CYFIP1/TUBGCP5 CYFIP1 TUBGCP5 [Cosmic]
    [TCGA]
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    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:23000285-23039673 - 15q11 15q11 Gene [TF]   CYFIP1/TUBGCP5 TUBGCP5 CYFIP1 [Cosmic]
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    [TCGA-BLCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:23000285-23039673 - 15q11 15q11 Gene [TF]   CYFIP1/TUBGCP5 TUBGCP5 CYFIP1 [Cosmic]
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        [Omim] [GenBank]
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    chr15:24856512-24978723 + 15q11 15q11 Gene [CT]   SNRPN/SNRPN SNRPN SNRPN [Cosmic]
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    chr15:24856512-24978723 + 15q11 15q24 Gene [H3]   SNRPN/PML SNRPN PML [Cosmic] Prader Willi syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 15q11

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    Gene Expression (MSigDB) in 15q11  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjuin 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 15q11. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/15q11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mer. juin 7 12:29:56 CEST 2017


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