Chromosome 19

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 19


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Band 19q11

chr19:26200000-28100000 (1900 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 19q11
  • Genes in band 19q11 (reference hg38)
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  • References

    Chromosomal abnormalities in band 19q11

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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      Mitelmander(19)t(15;19)(q22;q11)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
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    19q1319q11Cosmic_SVu(19)(q13;q11)  Cosmic_SV [COST176699]central_nervous_system__brainstemglioma__astrocytoma_Grade_IV  
    19q11Xp11Cosmic_SVu(19;X)(q11;p11)  Cosmic_SV [COST240939]bone__NSosteosarcoma__NS  
    19q11Xq26Cosmic_SVu(19;X)(q11;q26)  Cosmic_SV [COST349980]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    2p1619q11Cosmic_SVu(2;19)(p16;q11)  Cosmic_SV [COST147483]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    2p1619q11Cosmic_SVu(2;19)(p16;q11)  Cosmic_SV [COST151403]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    2p1619q11Cosmic_SVu(2;19)(p16;q11)  Cosmic_SV [COST151404]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
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    4p1219q11Cosmic_SVu(4;19)(p12;q11)  Cosmic_SV [COST163924]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
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    4q2219q11Cosmic_SVu(4;19)(q22;q11)  Cosmic_SV [COST241027]bone__NSosteosarcoma__NS  
    5q2319q11Cosmic_SVu(5;19)(q23;q11)  Cosmic_SV [COST724654]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    6q2319q11Cosmic_SVu(6;19)(q23;q11)  Cosmic_SV [COST315333]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q2319q11Cosmic_SVu(6;19)(q23;q11)  Cosmic_SV [COST445155]breast__NScarcinoma__HER-positive_carcinoma [COSU668]
    8p1119q11Cosmic_SVu(8;19)(p11;q11)  Cosmic_SV [COST159215]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    8p1119q11Cosmic_SVu(8;19)(p11;q11)  Cosmic_SV [COST403280]NS__NSNS__NS [COSU652]
    8q1219q11Cosmic_SVu(8;19)(q12;q11)  Cosmic_SV [COST159218]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    8q1219q11Cosmic_SVu(8;19)(q12;q11)  Cosmic_SV [COST497052]endometrium__NScarcinoma__carcinosarcoma-malignant_mesodermal_mixed_tumour [COSU677]
    8q2419q11Cosmic_SVu(8;19)(q24;q11)  Cosmic_SV [COST329607]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]

    Genes in band 19q11

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr19:27790493-27793940 - 19q11   Gene [G]     LINC00662       [Omim] [Entrez]
    chr19:27793895-27826411 + 19q11   Gene [G]     LOC101927151       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   19 19p 19q 19p13 19p12 19p11 19q11 19q12 19q13   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 19q11

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 19q11  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedoct. 2019Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 19q11. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/19q11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. oct. 28 16:38:47 CET 2019

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