Chromosome 19

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 19


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Band 19q12

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  • Chromosomal abnormalities in band 19q12
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    Chromosomal abnormalities in band 19q12

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    Genes in band 19q12

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    chr19:29665420-29675476 + 19q12 19p13 Gene [M]   DOT1L/PLEKHF1 PLEKHF1 DOT1L [Mitelman] Stomach Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q12 Gene [CT]   URI1/URI1 URI1 URI1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q12 Gene [GAO]   URI1/PLEKHF1 URI1 PLEKHF1 STAD   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr19:29942239-30016612 + 19q12 12p13 Gene [M]   URI1/CHD4 URI1 CHD4 [Mitelman] Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/FOXA3 URI1 FOXA3 [Mitelman] Uterus, corpus Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/IFNL1 URI1 IFNL1 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 4p15 Gene [M]   URI1/KCNIP4 URI1 KCNIP4 [Mitelman] Testis Germ cell tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/PEPD URI1 PEPD [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/RHPN2 URI1 RHPN2 [Mitelman] Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/RYR1 URI1 RYR1 [Mitelman] Liver Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 6q22 Gene [M]   URI1/SLC35F1 URI1 SLC35F1 [Mitelman] Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/XRCC1 URI1 XRCC1 [Mitelman] Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/ZNF383 URI1 ZNF383 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:29942239-30016612 + 19q12 19q13 Gene [TF]   URI1/IFNL1 URI1 IFNL1 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr19:30372393-30558059 + 19q12 19q13 Gene [M]   ANKRD27/ZNF536 ZNF536 ANKRD27 [Mitelman] Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30372393-30558059 + 19q12 10q24 Gene [M]   BLNK/ZNF536 ZNF536 BLNK [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30372393-30558059 + 19q12 16q12 Gene [M]   FTO/ZNF536 ZNF536 FTO [Mitelman] Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30372393-30558059 + 19q12 2q32 Gene [M]   MYO1B/ZNF536 ZNF536 MYO1B [Mitelman] Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30372393-30558059 + 19q12 17q11 Gene [M]   NSRP1/ZNF536 ZNF536 NSRP1 [Mitelman] Pleura Mesothelioma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30372393-30558059 + 19q12 2p16 Gene [M]   ZNF536/SPTBN1 ZNF536 SPTBN1 [Mitelman] Uterus, corpus Malignant epithelial tumor, special type [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30372393-30558059 + 19q12 10q24 Gene [TF]   BLNK/ZNF536 ZNF536 BLNK [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30372393-30558059 + 19q12 16q12 Gene [TF]   FTO/ZNF536 ZNF536 FTO [TCGA] [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30372393-30558059 + 19q12 2q32 Gene [TF]   MYO1B/ZNF536 ZNF536 MYO1B [TCGA] [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:31167510-31207663 + 19q12   Gene [G]     LINC01791       [Omim] [Entrez]
    chr19:31274945-31349525 - 19q12 10q24 Gene [CT]   SH3PXD2A/TSHZ3 TSHZ3 SH3PXD2A [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr19:31274945-31349525 - 19q12 19q13 Gene [G]   TSHZ3/CEACAM7 TSHZ3 CEACAM7     [Omim] [Entrez]
    chr19:31274945-31349525 - 19q12 19q13 Gene [G]   TSHZ3/IFNL1 TSHZ3 IFNL1     [Omim] [Entrez]
    chr19:31274945-31349525 - 19q12 10q24 Gene [G]   SH3PXD2A/TSHZ3 TSHZ3 SH3PXD2A     [Omim] [Entrez]
    chr19:31274945-31349525 - 19q12 11p15 Gene [M]   CARS/TSHZ3 TSHZ3 CARS [Mitelman] Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:31274945-31349525 - 19q12 18q12 Gene [M]   TSHZ3/CDH2 TSHZ3 CDH2 [Mitelman] Pancreas Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:31274945-31349525 - 19q12 19q13 Gene [M]   TSHZ3/CEACAM7 TSHZ3 CEACAM7 [Mitelman] Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:31274945-31349525 - 19q12 19q13 Gene [M]   TSHZ3/IFNL1 TSHZ3 IFNL1 [Mitelman] Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 19q12

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 19q12  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Gene list (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedaoût 2018Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 19q12. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/19q12.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : jeu. août 16 10:10:31 CEST 2018


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