Chromosome 19

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 19


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Band 19q12

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  • Chromosomal abnormalities in band 19q12
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    Chromosomal abnormalities in band 19q12

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    Genes in band 19q12

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    chr19:29698167-29704136 - 19q12   Gene [CT]   RNR2/UQCRFS1 UQCRFS1 RNR2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr19:29698167-29704136 - 19q12   Gene [G]     UQCRFS1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr19:29777918-30016659 - 19q12 Xp22 Gene [CT]   LOC284395/MID1 LOC284395 MID1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr19:29777918-30016659 - 19q12   Gene [G]     LOC284395       [Omim] [Entrez]
    chr19:30017491-30055226 + 19q12   Gene [G]     VSTM2B   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr19:30017491-30055226 + 19q12 8p11 Gene [M]   HGSNAT/VSTM2B VSTM2B HGSNAT [Cosmic]
    [Mitelman]
    Ovary Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30017491-30055226 + 19q12 19q13 Gene [M]   RHPN2/VSTM2B VSTM2B RHPN2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30017491-30055226 + 19q12 8p11 Gene [TF]   HGSNAT/VSTM2B VSTM2B HGSNAT [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30017491-30055226 + 19q12 19q13 Gene [TF]   RHPN2/VSTM2B VSTM2B RHPN2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30017491-30055226 + 19q12 19q12 Gene [TF]   URI1/VSTM2B VSTM2B URI1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30097170-30108162 + 19q12 9q34 Gene [CT]   POP4/LCN2 POP4 LCN2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr19:30097170-30108162 + 19q12   Gene [G]     POP4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr19:30097170-30108162 + 19q12 1p35 Gene [M]   EYA3/POP4 POP4 EYA3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30097170-30108162 + 19q12 1p35 Gene [TF]   EYA3/POP4 POP4 EYA3 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30156327-30166383 + 19q12 7p22 Gene [CT]   PLEKHF1/EIF3B PLEKHF1 EIF3B [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr19:30156327-30166383 + 19q12   Gene [G]     PLEKHF1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr19:30189793-30205963 - 19q12   Gene [G]     C19orf12   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr19:30302901-30315224 + 19q12   Gene [CEN]   CCNE1/A CCNE1 A [Cosmic]
    [Census]
    E serous ovarian   [Omim] [Entrez]
    chr19:30302901-30315224 + 19q12 5q31 Gene [CT]   CCNE1/C5orf66 CCNE1 C5orf66 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr19:30302901-30315224 + 19q12 3p22 Gene [CT]   CCNE1/HIGD1A CCNE1 HIGD1A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr19:30302901-30315224 + 19q12 14q32 Gene [G]   IGH/CCNE1 CCNE1 IGH [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q13 Gene [AM]   URI1/ARHGAP33 URI1 ARHGAP33 [TCGA-UCEC]     [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q13 Gene [AM]   URI1/IFNL1 URI1 IFNL1 [TCGA-BRCA]     [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q12 Gene [CT]   URI1/URI1 URI1 URI1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q12 Gene [CT]   URI1/URI1 URI1 URI1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12   Gene [G]     URI1       [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/IFNL1 URI1 IFNL1 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/XRCC1 URI1 XRCC1 [Mitelman] Ovary Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q13 Gene [M]   URI1/ZNF383 URI1 ZNF383 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q13 Gene [TF]   URI1/IFNL1 URI1 IFNL1 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q12 Gene [TF]   URI1/VSTM2B URI1 VSTM2B [TCGA] [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q13 Gene [TF]   URI1/XRCC1 URI1 XRCC1 [TCGA] [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30414551-30507519 + 19q12 19q13 Gene [TF]   URI1/ZNF383 URI1 ZNF383 [TCGA] [TCGA-SKCM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30863300-31048966 + 19q12 1p36 Gene [AM]   UBE4B/ZNF536 ZNF536 UBE4B [Cosmic]
    [TCGA-BLCA]     [Omim] [Entrez]
    chr19:30863300-31048966 + 19q12 4q13 Gene [CT]   ZNF536/ALB ZNF536 ALB [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr19:30863300-31048966 + 19q12   Gene [G]     ZNF536   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr19:30863300-31048966 + 19q12 10q24 Gene [M]   BLNK/ZNF536 ZNF536 BLNK [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30863300-31048966 + 19q12 16q12 Gene [M]   FTO/ZNF536 ZNF536 FTO [Cosmic]
    [Mitelman]
    Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30863300-31048966 + 19q12 2q32 Gene [M]   MYO1B/ZNF536 ZNF536 MYO1B [Cosmic]
    [Mitelman]
    Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30863300-31048966 + 19q12 10q24 Gene [TF]   BLNK/ZNF536 ZNF536 BLNK [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30863300-31048966 + 19q12 16q12 Gene [TF]   FTO/ZNF536 ZNF536 FTO [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:30863300-31048966 + 19q12 2q32 Gene [TF]   MYO1B/ZNF536 ZNF536 MYO1B [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:31765851-31840431 - 19q12 10q24 Gene [CT]   SH3PXD2A/TSHZ3 TSHZ3 SH3PXD2A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr19:31765851-31840431 - 19q12   Gene [G]     TSHZ3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr19:31765851-31840431 - 19q12 19q13 Gene [M]   TSHZ3/CEACAM7 TSHZ3 CEACAM7 [Cosmic]
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    Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:31765851-31840431 - 19q12 19q13 Gene [M]   TSHZ3/IFNL1 TSHZ3 IFNL1 [Cosmic]
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    Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:31765851-31840431 - 19q12 19q13 Gene [TF]   TSHZ3/CEACAM7 TSHZ3 CEACAM7 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LGG]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:31765851-31840431 - 19q12 19q13 Gene [TF]   TSHZ3/IFNL1 TSHZ3 IFNL1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr19:32078947-32086626 - 19q12   Gene [G]     LOC101927277       [Omim] [Entrez]
    chr19:32083187-32084456 + 19q12   Gene [G]     THEG5       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 19q12

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 19q12  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjanv. 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 19q12. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/19q12.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mar. janv. 10 13:02:01 CET 2017


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