Chromosome 2

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 2


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Band 2q13

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  • Chromosomal abnormalities in band 2q13
  • Genes in band 2q13 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 2q13

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    Genes in band 2q13

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [K]   ALK/RANBP2 RANBP2 ALK [Cosmic] Tumors [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 6q27 Gene [CEN]   RANBP2/T RANBP2 T [Cosmic]
    [Census]
    M inflammatory myofibroblastic tumour   [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [COF]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Fusion 415]
    haematopoietic_and_lymphoid_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [COF]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Fusion 416]
    haematopoietic_and_lymphoid_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [COF]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Fusion 417]
    soft_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [COF]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Fusion 418]
    soft_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [COF]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Fusion 415]
    soft_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [COF]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Fusion 416]
    soft_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 1p34 Gene [CT]   RANBP2/INPP5B RANBP2 INPP5B [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2q34 Gene [CT]   RANBP2/MAP2 RANBP2 MAP2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 15q23 Gene [CT]   RPLP1/RANBP2 RANBP2 RPLP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [H2]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic] Inflammatory myofibroblastic tumour [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2q12 Gene [H2]   RANBP2/GCC2 RANBP2 GCC2 [Cosmic] testis and HeLa Cell [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [H3]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic] acute myeloid leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [H3]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [H3]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [H3]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic] acute myeloid leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [H3]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic] myeloid leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [H3]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic] leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [H3]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13   Gene [H3]   RANBP2/NUP358 RANBP2 NUP358 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [L]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 9q34 Gene [M]   RANBP2/ABL1 RANBP2 ABL1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [M]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute myeloid leukemia, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [M]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [M]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Mitelman]
    Myelodysplastic syndrome, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [M]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Mitelman]
    Diffuse large B-cell lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [M]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Mitelman]
    Intraabdominal Inflammatory myofibroblastic tumor/myofibroblastic sarcoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [M]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [Mitelman]
    Juvenile myelomonocytic leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 6p12 Gene [M]   RANBP2/BMP5 RANBP2 BMP5 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [PM]   ALK/RANBP2 RANBP2 ALK [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [PM]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 9q34 Gene [A]   RANBP2/ABL1 RANBP2 ABL1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [A]   ALK/RANBP2 RANBP2 ALK [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [A]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 6p12 Gene [A]   RANBP2/BMP5 RANBP2 BMP5 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2q12 Gene [A]   RANBP2/GCC2 RANBP2 GCC2 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 1p34 Gene [A]   RANBP2/INPP5B RANBP2 INPP5B [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2q34 Gene [A]   RANBP2/MAP2 RANBP2 MAP2 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 15q23 Gene [A]   RPLP1/RANBP2 RANBP2 RPLP1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [S]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 6p12 Gene [TF]   RANBP2/BMP5 RANBP2 BMP5 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [TIC]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]
    [TICdb]
      [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108719481-108785811 + 2q13 2p23 Gene [URK]   RANBP2/ALK RANBP2 ALK [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108786750-108876591 + 2q13   Gene [G]     CCDC138   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:108786750-108876591 + 2q13 6p12 Gene [M]   CCDC138/GFRAL CCDC138 GFRAL [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108786750-108876591 + 2q13 6p12 Gene [TF]   CCDC138/GFRAL CCDC138 GFRAL [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:108894471-108989372 - 2q13   Gene [G]     EDAR   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:109127328-109130119 - 2q13   Gene [G]     SH3RF3-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr2:109129541-109504636 + 2q13 3p13 Gene [CT]   LINC00877/SH3RF3 SH3RF3 LINC00877 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:109129541-109504636 + 2q13 19p13 Gene [CT]   PBX4/SH3RF3 SH3RF3 PBX4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:109129541-109504636 + 2q13 20q11 Gene [CT]   SH3RF3/PPP1R16B SH3RF3 PPP1R16B [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:109129541-109504636 + 2q13 2q13 Gene [CT]   SH3RF3/SH3RF3 SH3RF3 SH3RF3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:109129541-109504636 + 2q13   Gene [G]     SH3RF3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:109129541-109504636 + 2q13 6p25 Gene [M]   EXOC2/SH3RF3 SH3RF3 EXOC2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:109129541-109504636 + 2q13 6p25 Gene [TF]   EXOC2/SH3RF3 SH3RF3 EXOC2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:109141490-109141588 - 2q13   Gene [G]     MIR4265       [Omim] [Entrez]
    chr2:109313571-109313625 - 2q13   Gene [G]     MIR4266       [Omim] [Entrez]
    chr2:109542797-109614206 - 2q13 12q21 Gene [CT]   PPP1R12A/SEPT10 SEPT10 PPP1R12A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:109542797-109614206 - 2q13   Gene [G]     SEPT10   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:109542797-109614206 - 2q13 12q21 Gene [GT]   PPP1R12A/SEPT10 SEPT10 PPP1R12A [Cosmic]
    [GenenTech]
    KPL-4__Breast   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:109542797-109614206 - 2q13 17q25 Gene [M]   CDC42EP4/SEPT10 SEPT10 CDC42EP4 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:109542797-109614206 - 2q13 12q21 Gene [M]   PPP1R12A/SEPT10 SEPT10 PPP1R12A [Cosmic]
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    chr2:109614334-109618987 + 2q13   Gene [G]     SOWAHC       [Omim] [Entrez]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
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    chr2:109898432-109906456 + 2q13   Gene [G]     LIMS4       [Omim] [Entrez]
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    chr2:110083870-110116566 - 2q13 2q13 Gene [K]   NPHP1/MALL MALL NPHP1 [Cosmic] Juvenile Nephronophthisis [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr2:110083870-110116566 - 2q13   Gene [CT]   MALL/ND6 MALL ND6 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
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    chr2:110083870-110116566 - 2q13   Gene [G]     MALL   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    chr2:110123336-110205062 - 2q13 2q13 Gene [K]   NPHP1/MALL NPHP1 MALL [Cosmic] Juvenile Nephronophthisis [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:110123336-110205062 - 2q13 6q13 Gene [CT]   CD109/NPHP1 NPHP1 CD109 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    chr2:110123336-110205062 - 2q13 10q11 Gene [CT]   NPHP1/PARG NPHP1 PARG [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:110123336-110205062 - 2q13 17q21 Gene [CT]   NPHP1/RAMP2 NPHP1 RAMP2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:110123336-110205062 - 2q13   Gene [G]     NPHP1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:110211529-110222940 - 2q13   Gene [G]     LINC00116       [Omim] [Entrez]
    chr2:110245638-110266558 + 2q13   Gene [G]     LOC100507334       [Omim] [Entrez]
    chr2:110375109-110384536 - 2q13 10q25 Gene [CT]   LINC01106/ATRNL1 LINC01106 ATRNL1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr2:110375109-110384536 - 2q13 12q21 Gene [CT]   LINC01106/MGAT4C LINC01106 MGAT4C [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr2:110375109-110384536 - 2q13 12q21 Gene [CT]   LINC01106/MGAT4C LINC01106 MGAT4C [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr2:110375109-110384536 - 2q13   Gene [G]     LINC01106       [Omim] [Entrez]
    chr2:110611126-110612695 + 2q13   Gene [G]     LOC105373553       [Omim] [Entrez]
    chr2:110637698-110678107 - 2q13   Gene [A]     BUB1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:110637698-110678107 - 2q13 2q13 Gene [CT]   BUB1/BUB1 BUB1 BUB1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:110637698-110678107 - 2q13 1q31 Gene [CT]   BUB1/RGS2 BUB1 RGS2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [GenenTech]
    U-2OS(parental)__Sarcomatoid   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:110658150-110658249 - 2q13   Gene [G]     SNORD132       [Omim] [Entrez]
    chr2:110732573-111118222 + 2q13 21q22 Gene [CT]   DYRK1A/ACOXL ACOXL DYRK1A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:110732573-111118222 + 2q13 2p11 Gene [CT]   ACOXL/IGKC ACOXL IGKC [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:110732573-111118222 + 2q13   Gene [G]     ACOXL   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:110732573-111118222 + 2q13 1p22 Gene [PM]   RPL5/ACOXL ACOXL RPL5 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr2:110732573-111118222 + 2q13 2q13 Gene [TF]   BCL2L11/ACOXL ACOXL BCL2L11 [Cosmic]
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    chr2:110732573-111118222 + 2q13 2q13 Gene [TF]   BCL2L11/ACOXL ACOXL BCL2L11 [Cosmic]
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    chr2:110732573-111118222 + 2q13 8p12 Gene [TF]   ACOXL/UNC5D ACOXL UNC5D [Cosmic]
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    chr2:111098341-111115588 - 2q13   Gene [E]     ACOXL-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr2:111120914-111168445 + 2q13 7q34 Gene [A]   BCL2L11/BRAF BCL2L11 BRAF [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr2:111120914-111168445 + 2q13 16q24 Gene [CT]   MAP1LC3B/BCL2L11 BCL2L11 MAP1LC3B [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:111120914-111168445 + 2q13   Gene [CT]   RNR2/BCL2L11 BCL2L11 RNR2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr2:111120914-111168445 + 2q13 17q25 Gene [M]   BCL2L11/AFMID BCL2L11 AFMID [Cosmic]
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    chr2:111383836-111384259 + 2q13   Gene [G]     PAFAH1B1P2       [Omim] [Entrez]
    chr2:111767637-111884164 - 2q13 2q33 Gene [CT]   ANAPC1/CLK1 ANAPC1 CLK1 [Cosmic]
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    chr2:111767637-111884164 - 2q13   Gene [CT]   ND6/ANAPC1 ANAPC1 ND6 [Cosmic]
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    chr2:111767637-111884164 - 2q13 9q33 Gene [GT]   ANAPC1/PSMB7 ANAPC1 PSMB7 [Cosmic]
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    chr2:111898614-112029368 + 2q13 2q13 Gene [AM]   TMEM87B/MERTK MERTK TMEM87B [Cosmic]
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    chr2:111898614-112029368 + 2q13 2q13 Gene [CT]   MERTK/MERTK MERTK MERTK [Cosmic]
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    chr2:111898614-112029368 + 2q13 22q13 Gene [CT]   PLXNB2/MERTK MERTK PLXNB2 [Cosmic]
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    chr2:111898614-112029368 + 2q13 3p21 Gene [CT]   MERTK/SHISA5 MERTK SHISA5 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    chr2:111898614-112029368 + 2q13 2q13 Gene [GT]   TMEM87B/MERTK MERTK TMEM87B [Cosmic]
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    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   2 2p 2q 2p25 2p24 2p23 2p22 2p21 2p16 2p15 2p14 2p13 2p12 2p11 2q11 2q12 2q13 2q14 2q21 2q22 2q23 2q24 2q31 2q32 2q33 2q34 2q35 2q36 2q37   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 2q13

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    Gene Expression (MSigDB) in 2q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjuin 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 2q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/2q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mer. juin 7 12:21:23 CEST 2017


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