Chromosome 3

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 3


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Band 3q13

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  • Chromosomal abnormalities in band 3q13
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    Chromosomal abnormalities in band 3q13

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    Xq223q13Cosmic_SVu(X;3)(q22;q13)  Cosmic_SV [COST150901]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]

    Genes in band 3q13

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38 (Kb)Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
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    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105366713-105576913 + 3q13 3q25 Gene [M]   ALCAM/EIF2A ALCAM EIF2A [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105366713-105576913 + 3q13 3q11 Gene [M]   ALCAM/EPHA6 ALCAM EPHA6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105366713-105576913 + 3q13 Xp22 Gene [M]   ALCAM/SH3KBP1 ALCAM SH3KBP1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105366713-105576913 + 3q13 19q13 Gene [M]   ALCAM/YIF1B ALCAM YIF1B [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105366713-105576913 + 3q13 1p36 Gene [TF]   AHDC1/ALCAM ALCAM AHDC1 [Cosmic]
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    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105366713-105576913 + 3q13 3q25 Gene [TF]   ALCAM/EIF2A ALCAM EIF2A [Cosmic]
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    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105366713-105576913 + 3q13 Xp22 Gene [TF]   ALCAM/SH3KBP1 ALCAM SH3KBP1 [Cosmic]
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    [TCGA-BLCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr3:105655461-105868381 - 3q13   Gene [CEN]   CBLB/Mis CBLB Mis [Cosmic]
    [Census]
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        [Omim] [GenBank]
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        [Omim] [GenBank]
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        [Omim] [GenBank]
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        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr3:105655461-105868381 - 3q13 3q13 Gene [M]   CBLB/KIAA1524 CBLB KIAA1524 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105655461-105868381 - 3q13 5q15 Gene [M]   MCTP1/CBLB CBLB MCTP1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105655461-105868381 - 3q13 3q13 Gene [TF]   CBLB/KIAA1524 CBLB KIAA1524 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:105655461-105868381 - 3q13 5q15 Gene [TF]   MCTP1/CBLB CBLB MCTP1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:107109790-107240638 - 3q13 6q21 Gene [CT]   LINC00882/CD164 LINC00882 CD164 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chr3:107522936-107811329 + 3q13 8q21 Gene [G]   RUNX1T1/BBX BBX RUNX1T1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Ovary Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:107522936-107811329 + 3q13 1p36 Gene [M]   PRDM16/BBX BBX PRDM16 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:107522936-107811329 + 3q13 13q14 Gene [M]   BBX/RB1 BBX RB1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:107522936-107811329 + 3q13 3q13 Gene [M]   TMEM39A/BBX BBX TMEM39A [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:107522936-107811329 + 3q13 16p13 Gene [TF]   AXIN1/BBX BBX AXIN1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:107522936-107811329 + 3q13 1p36 Gene [TF]   PRDM16/BBX BBX PRDM16 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:107522936-107811329 + 3q13 13q14 Gene [TF]   BBX/RB1 BBX RB1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:107522936-107811329 + 3q13 3q13 Gene [TF]   TMEM39A/BBX BBX TMEM39A [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr3:107841662-107878068 - 3q13   Gene [G]     LINC00635       [Omim] [Entrez]
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    chr3:108043094-108091088 - 3q13 4q13 Gene [CT]   ANKRD17/CD47 CD47 ANKRD17 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr3:108043094-108091088 - 3q13 7p12 Gene [CT]   CD47/IGFBP3 CD47 IGFBP3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr3:108043094-108091088 - 3q13 4p14 Gene [CT]   TBC1D1/CD47 CD47 TBC1D1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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