Chromosome 4

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 4


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Band 4q13

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    Chromosomal abnormalities in band 4q13

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    8q244q13Cosmic_SVu(8;4)(q24;q13)  Cosmic_SV [COST121893]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]

    Genes in band 4q13

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    GoldenPath hg19 (Kb)Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr4:59850000-59912677 + 4q13   Gene [G]     LOC105377247       [Omim] [Entrez]
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    chr4:62066974-62944053 + 4q13 7q33 Gene [CT]   CALD1/ADGRL3 ADGRL3 CALD1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 2p25 Gene [CT]   LINC01250/ADGRL3 ADGRL3 LINC01250 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 8q21 Gene [CT]   ADGRL3/SLC26A7 ADGRL3 SLC26A7 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 13q32 Gene [CT]   TMTC4/ADGRL3 ADGRL3 TMTC4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 4q12 Gene [G]   CHIC2/ADGRL3 ADGRL3 CHIC2     [Omim] [Entrez]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 4q13 Gene [M]   ADGRL3/AMTN ADGRL3 AMTN [Mitelman] Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 4q12 Gene [M]   CHIC2/ADGRL3 ADGRL3 CHIC2 [Mitelman] Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 6p12 Gene [M]   EFHC1/ADGRL3 ADGRL3 EFHC1 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 4q24 Gene [M]   ADGRL3/PPP3CA ADGRL3 PPP3CA [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 2p11 Gene [M]   ADGRL3/ST3GAL5 ADGRL3 ST3GAL5 [Mitelman] Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 4q13 Gene [TF]   ADGRL3/AMTN ADGRL3 AMTN [TCGA] [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 4q24 Gene [TF]   ADGRL3/PPP3CA ADGRL3 PPP3CA [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:62066974-62944053 + 4q13 2p11 Gene [TF]   ADGRL3/ST3GAL5 ADGRL3 ST3GAL5 [TCGA] [TCGA-LGG]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:62937473-63027483 - 4q13   Gene [G]     ADGRL3-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr4:65144177-65275178 - 4q13   Gene [G]     TECRL   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr4:65144177-65275178 - 4q13 8q24 Gene [PM]   TECRL/TSNARE1 TECRL TSNARE1 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:65779999-65870218 - 4q13   Gene [G]     LOC401134       [Omim] [Entrez]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 3q25 Gene [CT]   EPHA5/KPNA4 EPHA5 KPNA4 [Cosmic]
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        [Omim] [GenBank]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 11q13 Gene [CT]   EPHA5/MALAT1 EPHA5 MALAT1 [Cosmic]
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        [Omim] [GenBank]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 2q11 Gene [CT]   RPL31/EPHA5 EPHA5 RPL31 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 2q11 Gene [CT]   RPL31/EPHA5 EPHA5 RPL31 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 2q11 Gene [CT]   RPL31/EPHA5 EPHA5 RPL31 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 2q11 Gene [CT]   RPL31/EPHA5 EPHA5 RPL31 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 2p16 Gene [G]   BCL11A/EPHA5 EPHA5 BCL11A [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 11q13 Gene [G]   EPHA5/MALAT1 EPHA5 MALAT1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 2p16 Gene [M]   BCL11A/EPHA5 EPHA5 BCL11A [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 4q13 Gene [M]   EPHA5/RUFY3 EPHA5 RUFY3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:66185281-66536213 - 4q13 4q13 Gene [TF]   EPHA5/RUFY3 EPHA5 RUFY3 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:66535679-66559104 + 4q13   Gene [G]     EPHA5-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr4:67142542-67142646 + 4q13   Gene [G]     MIR1269A       [Omim] [Entrez]
    chr4:68283023-68287718 - 4q13   Gene [G]     LOC101927237       [Omim] [Entrez]
    chr4:68337989-68411256 - 4q13 4q12 Gene [CT]   CENPC/PAICS CENPC PAICS [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr4:68337989-68411256 - 4q13   Gene [G]     CENPC       [Omim] [Entrez]
    chr4:68424415-68473055 + 4q13   Gene [G]     STAP1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr4:68424415-68473055 + 4q13 20q13 Gene [M]   ELMO2/STAP1 STAP1 ELMO2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:68424415-68473055 + 4q13 4q13 Gene [M]   UBA6/STAP1 STAP1 UBA6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:68424415-68473055 + 4q13 20q13 Gene [TF]   ELMO2/STAP1 STAP1 ELMO2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:68424415-68473055 + 4q13 4q13 Gene [TF]   UBA6/STAP1 STAP1 UBA6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr4:68481479-68566889 - 4q13 4q13 Gene [CT]   UBA6/UBA6 UBA6