Chromosome 5

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 5


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Band 5q11

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  • Chromosomal abnormalities in band 5q11
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    Chromosomal abnormalities in band 5q11

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    Genes in band 5q11

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    chr5:52989326-53094779 + 5q11 22q11 Gene [M]   DGCR8/ITGA2 ITGA2 DGCR8 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:52989326-53094779 + 5q11 22q12 Gene [M]   ITGA2/MYO18B ITGA2 MYO18B [Mitelman] Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:52989326-53094779 + 5q11 5q11 Gene [M]   ITGA2/PARP8 ITGA2 PARP8 [Mitelman] Uterus, cervix Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:52989326-53094779 + 5q11 5q12 Gene [M]   ITGA2/RNF180 ITGA2 RNF180 [Mitelman] Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:53095679-53109772 - 5q11 2q34 Gene [CT]   MOCS2/PTH2R MOCS2 PTH2R [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chr5:53095679-53109772 - 5q11 5q11 Gene [M]   ARL15/MOCS2 MOCS2 ARL15 [Mitelman] Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53095679-53109772 - 5q11 5q11 Gene [TF]   ARL15/MOCS2 MOCS2 ARL15 [TCGA] [TCGA-LUSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:53560633-53683341 + 5q11 8p21 Gene [M]   NDUFS4/EXTL3 NDUFS4 EXTL3 [Mitelman] Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53560633-53683341 + 5q11 5q11 Gene [M]   NDUFS4/GZMA NDUFS4 GZMA [Mitelman] Uterus, cervix Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53560633-53683341 + 5q11 21q22 Gene [M]   NDUFS4/TMPRSS2 NDUFS4 TMPRSS2 [Mitelman] Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53560633-53683341 + 5q11 5q31 Gene [M]   NDUFS4/UBE2D2 NDUFS4 UBE2D2 [Mitelman] Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:53776051-53819682 - 5q11   Gene [G]     LINC02105       [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q12 Gene [AM]   ERBIN/ARL15 ARL15 ERBIN [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
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    chr5:53884784-54310573 - 5q11 19q13 Gene [CT]   ARL15/GPI ARL15 GPI [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q31 Gene [G]   ARL15/CDC42SE2 ARL15 CDC42SE2     [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q31 Gene [G]   / ARL15 HSPA9     [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q31 Gene [G]   HSPA9/ARL15 ARL15 HSPA9     [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 16q22 Gene [G]   ZFHX3/ARL15 ARL15 ZFHX3     [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q31 Gene [M]   ARL15/CDC42SE2 ARL15 CDC42SE2 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q31 Gene [M]   HSPA9/ARL15 ARL15 HSPA9 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q11 Gene [M]   ARL15/ITGA1 ARL15 ITGA1 [Mitelman] Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q11 Gene [M]   ARL15/MOCS2 ARL15 MOCS2 [Mitelman] Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q11 Gene [M]   ARL15/PARP8 ARL15 PARP8 [Mitelman] Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 16q22 Gene [M]   ZFHX3/ARL15 ARL15 ZFHX3 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:53884784-54310573 - 5q11 5q31 Gene [TF]   ARL15/CDC42SE2 ARL15 CDC42SE2 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:53951504-53951599 - 5q11   Gene [G]     MIR581       [Omim] [Entrez]
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    chr5:54517763-54521004 + 5q11 5q11 Gene [CT]   SNX18/SNX18 SNX18 SNX18 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 5q11 Gene [CT]   SNX18/SNX18 SNX18 SNX18 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 5q11 Gene [CT]   SNX18/SNX18 SNX18 SNX18 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 2q37 Gene [G]   / SNX18 HDAC4     [Omim] [Entrez]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 2q37 Gene [G]   HDAC4/SNX18 SNX18 HDAC4     [Omim] [Entrez]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 5q11 Gene [M]   SNX18/ANKRD55 SNX18 ANKRD55 [Mitelman] Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 2q37 Gene [M]   HDAC4/SNX18 SNX18 HDAC4 [Mitelman] Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 15q26 Gene [M]   SNX18/WDR93 SNX18 WDR93 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 5q11 Gene [TF]   SNX18/ANKRD55 SNX18 ANKRD55 [TCGA] [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 2q37 Gene [TF]   HDAC4/SNX18 SNX18 HDAC4 [TCGA] [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:54517763-54521004 + 5q11 15q26 Gene [TF]   SNX18/WDR93 SNX18 WDR93 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:54660158-54703324 - 5q11   Gene [G]     LOC102467080       [Omim] [Entrez]
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    chr5:55024279-55034132 + 5q11   Gene [G]     GZMK       [Omim] [Entrez]
    chr5:55102646-55110252 + 5q11   Gene [A]     GZMA       [Omim] [Entrez]
    chr5:55102646-55110252 + 5q11 5q11 Gene [M]   NDUFS4/GZMA GZMA NDUFS4 [Mitelman] Uterus, cervix Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55112971-55173177 - 5q11 2q35 Gene [CT]   CDC20B/ARPC2 CDC20B ARPC2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:55112971-55173177 - 5q11 12p11 Gene [CT]   DNM1L/CDC20B CDC20B DNM1L [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:55112971-55173177 - 5q11   Gene [G]     CDC20B       [Omim] [Entrez]
    chr5:55112971-55173177 - 5q11 5q11 Gene [GT]   MIER3/CDC20B CDC20B MIER3 [GenenTech] KYSE-140__Head-Neck   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55112971-55173177 - 5q11 5q11 Gene [M]   CDC20B/DHX29 CDC20B DHX29 [Mitelman] Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55112971-55173177 - 5q11 5q11 Gene [TF]   CDC20B/DHX29 CDC20B DHX29 [TCGA] [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55160118-55167301 + 5q11 22q13 Gene [G]   GPX8/TTLL1 GPX8 TTLL1     [Omim] [Entrez]
    chr5:55160118-55167301 + 5q11 5q12 Gene [M]   RNF180/GPX8 GPX8 RNF180 [Mitelman] Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55160118-55167301 + 5q11 22q13 Gene [M]   GPX8/TTLL1 GPX8 TTLL1 [Mitelman] Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55160118-55167301 + 5q11 22q13 Gene [TF]   GPX8/TTLL1 GPX8 TTLL1 [TCGA] [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55170532-55170622 - 5q11   Gene [A]     MIR449A       [Omim] [Entrez]
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    chr5:55219597-55227315 - 5q11   Gene [G]     MCIDAS       [Omim] [Entrez]
    chr5:55231153-55233717 - 5q11   Gene [G]     CCNO       [Omim] [Entrez]
    chr5:55231153-55233717 - 5q11 5q11 Gene [TF]   MTREX/CCNO CCNO MTREX [TCGA] [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:55256055-55307722 - 5q11   Gene [G]     DHX29       [Omim] [Entrez]
    chr5:55256055-55307722 - 5q11 5q11 Gene [M]   CDC20B/DHX29 DHX29 CDC20B [Mitelman] Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55256055-55307722 - 5q11 5q11 Gene [TF]   CDC20B/DHX29 DHX29 CDC20B [TCGA] [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55307748-55425581 + 5q11 5q11 Gene [CT]   MTREX/MTREX MTREX MTREX [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chr5:55307748-55425581 + 5q11 22q13 Gene [CT]   ST13/MTREX MTREX ST13 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:55307748-55425581 + 5q11   Gene [E]     MTREX       [Omim] [Entrez]
    chr5:55307748-55425581 + 5q11 1q25 Gene [GT]   MTREX/IVNS1ABP MTREX IVNS1ABP [GenenTech] SW900__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55307748-55425581 + 5q11 5q11 Gene [TF]   MTREX/CCNO MTREX CCNO [TCGA] [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55307748-55425581 + 5q11 5q14 Gene [TF]   MTREX/CETN3 MTREX CETN3 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55307748-55425581 + 5q11 5q13 Gene [TF]   MTREX/F2R MTREX F2R [TCGA] [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55307748-55425581 + 5q11 11q23 Gene [TF]   MTREX/USP28 MTREX USP28 [TCGA] [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55424842-55535078 - 5q11 3q22 Gene [AM]   PLPP1/ACPP PLPP1 ACPP [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:55424842-55535078 - 5q11 8q13 Gene [CT]   ARFGEF1/PLPP1 PLPP1 ARFGEF1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chr5:55424842-55535078 - 5q11 2q33 Gene [G]   ADAM23/PLPP1 PLPP1 ADAM23     [Omim] [Entrez]
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    chr5:55424842-55535078 - 5q11 5p15 Gene [GT]   PLPP1/ADCY2 PLPP1 ADCY2 [GenenTech] G120__Brain   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:55424842-55535078 - 5q11 2q37 Gene [TF]   PLPP1/MLPH PLPP1 MLPH [TCGA] [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:55738017-55817146 + 5q11 10q22 Gene [TF]   KAT6B/DDX4 DDX4 KAT6B [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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