Chromosome 5

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 5


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Band 5q13

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  • Chromosomal abnormalities in band 5q13
  • Genes in band 5q13 (reference hg38)
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  • References

    Chromosomal abnormalities in band 5q13

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    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP)BladderTransitional cell carcinoma  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP)KidneyAdenocarcinoma  
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    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP)LungUndifferentiated carcinoma  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP) Mycosis fungoides/SÚzary syndrome  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic syndrome, NOS  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP)Oral cavitySquamous cell carcinoma  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess blasts-2  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP)SkeletonChondrosarcoma, NOS  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP)Soft tissueSynovial sarcoma  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP)TestisCombined germ cell tumors  
    5q13 Mitelmandel(5)(q13)  Mitelman (CGAP)TestisTeratoma (mature and immature)  
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    5q135q31Mitelmandel(5)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Idiopathic myelofibrosis  
    5q135q31Mitelmandel(5)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Mastocytosis  
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    5q135q31Mitelmandel(5)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
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    5q135q32Mitelmandel(5)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
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    Genes in band 5q13

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    chr5:69167010-69178243 + 5q13 5q13 Gene [M]   CDK7/CCNB1 CCNB1 CDK7 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69167010-69178243 + 5q13 5q13 Gene [M]   OCLN/CCNB1 CCNB1 OCLN [Mitelman] Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69167010-69178243 + 5q13 17p13 Gene [M]   TP53/CCNB1 CCNB1 TP53 [Mitelman] Skeleton Osteosarcoma, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69167010-69178243 + 5q13 5q13 Gene [TF]   CDK7/CCNB1 CCNB1 CDK7 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:69234795-69277430 + 5q13 5q31 Gene [GT]   CDK7/MATR3 CDK7 MATR3 [GenenTech] HCC2218__Breast   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69234795-69277430 + 5q13 5q13 Gene [M]   CDK7/CCNB1 CDK7 CCNB1 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69234795-69277430 + 5q13 8q11 Gene [M]   CDK7/RGS20 CDK7 RGS20 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69234795-69277430 + 5q13 14q32 Gene [M]   CDK7/RIN3 CDK7 RIN3 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69234795-69277430 + 5q13 21q22 Gene [M]   CDK7/SH3BGR CDK7 SH3BGR [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:69364743-69369582 - 5q13 5q12 Gene [M]   TAF9/ADAMTS6 TAF9 ADAMTS6 [Mitelman] Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:69369812-69414801 + 5q13 5q31 Gene [G]   RAD17/SEC24A RAD17 SEC24A     [Omim] [Entrez]
    chr5:69369812-69414801 + 5q13 17q24 Gene [M]   BPTF/RAD17 RAD17 BPTF [Mitelman] Uterus, corpus Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69369812-69414801 + 5q13 11q22 Gene [M]   RAD17/CNTN5 RAD17 CNTN5 [Mitelman] Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69369812-69414801 + 5q13 5q33 Gene [M]   GRIA1/RAD17 RAD17 GRIA1 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69369812-69414801 + 5q13 12p11 Gene [M]   ITPR2/RAD17 RAD17 ITPR2 [Mitelman] Stomach Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69369812-69414801 + 5q13 5q31 Gene [M]   RAD17/SEC24A RAD17 SEC24A [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:69415112-69442063 + 5q13 4p14 Gene [M]   MARVELD2/WDR19 MARVELD2 WDR19 [Mitelman] Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:69492292-69558104 + 5q13 7q21 Gene [G]   OCLN/CDK14 OCLN CDK14     [Omim] [Entrez]
    chr5:69492292-69558104 + 5q13 5q14 Gene [M]   OCLN/ADGRV1 OCLN ADGRV1 [Mitelman] Liver Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69492292-69558104 + 5q13 5q13 Gene [M]   OCLN/CCNB1 OCLN CCNB1 [Mitelman] Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69492292-69558104 + 5q13 7q21 Gene [M]   OCLN/CDK14 OCLN CDK14 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69492292-69558104 + 5q13 5q13 Gene [M]   NAIP/OCLN OCLN NAIP [Mitelman] Lung Undifferentiated carcinoma, small cell [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69492292-69558104 + 5q13 5q13 Gene [M]   NAIP/OCLN OCLN NAIP [Mitelman] Uterus, corpus Endometrial stromal sarcoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:69492292-69558104 + 5q13 7q21 Gene [TF]   OCLN/CDK14 OCLN CDK14 [TCGA] [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:69639463-69710527 - 5q13   Gene [G]     GUSBP3       [Omim] [Entrez]
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    chr5:72320367-72359353 + 5q13 10q25 Gene [M]   ABLIM1/PTCD2 PTCD2 ABLIM1 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:72848103-72914388 + 5q13 8p11 Gene [M]   TNPO1/IKBKB TNPO1 IKBKB [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:72848103-72914388 + 5q13 5q14 Gene [M]   TNPO1/MEF2C TNPO1 MEF2C [Mitelman] Adrenal Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:73813518-73941993 + 5q13 2p22 Gene [CT]   SRSF7/ARHGEF28 ARHGEF28 SRSF7 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:73813518-73941993 + 5q13   Gene [G]     ARHGEF28       [Omim] [Entrez]
    chr5:73813518-73941993 + 5q13 5q13 Gene [M]   ARHGEF28/UTP15 ARHGEF28 UTP15 [Mitelman] Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74306410-74308325 - 5q13   Gene [G]     LINC01335       [Omim] [Entrez]
    chr5:74322486-74328357 + 5q13 2q32 Gene [CT]   LINC01333/COL3A1 LINC01333 COL3A1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74322486-74328357 + 5q13   Gene [G]     LINC01333       [Omim] [Entrez]
    chr5:74369376-74536976 - 5q13   Gene [G]     LINC01331       [Omim] [Entrez]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 5q13 Gene [CT]   ENC1/ENC1 ENC1 ENC1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 20q13 Gene [CT]   ENC1/GNAS ENC1 GNAS [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 4q31 Gene [CT]   ENC1/LRBA ENC1 LRBA [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 4q31 Gene [CT]   ENC1/LRBA ENC1 LRBA [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 1q21 Gene [CT]   MLLT11/ENC1 ENC1 MLLT11 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 4p16 Gene [CT]   NSG1/ENC1 ENC1 NSG1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 19p13 Gene [CT]   PRKCSH/ENC1 ENC1 PRKCSH [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 5q13 Gene [H2]   ENC1/ENC1 ENC1 ENC1 Sandhoff disease [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 5q13 Gene [H3]   ENC1/ENC1 ENC1 ENC1 Sandhoff disease [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 11q13 Gene [M]   POLD3/ENC1 ENC1 POLD3 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 5q13 Gene [M]   TNPO1/ENC1 ENC1 TNPO1 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74627406-74641424 - 5q13 1q21 Gene [A]   MLLT11/ENC1 ENC1 MLLT11     [Omim] [Entrez]
    chr5:74640023-74721288 + 5q13 5q13 Gene [AM]   NSA2/HEXB HEXB NSA2 [TCGA-BRCA]     [Omim] [Entrez]
    chr5:74640023-74721288 + 5q13 11q12 Gene [CT]   HEXB/SSRP1 HEXB SSRP1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74640023-74721288 + 5q13 5q22 Gene [G]   TRIM36/HEXB HEXB TRIM36     [Omim] [Entrez]
    chr5:74640023-74721288 + 5q13 5q13 Gene [M]   HEXB/FAM169A HEXB FAM169A [Mitelman] Stomach Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74640023-74721288 + 5q13 5q13 Gene [M]   NSA2/HEXB HEXB NSA2 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74640023-74721288 + 5q13 14q11 Gene [M]   HEXB/SUPT16H HEXB SUPT16H [Mitelman] Large intestine Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74640023-74721288 + 5q13 5q22 Gene [M]   TRIM36/HEXB HEXB TRIM36 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74640023-74721288 + 5q13 5q13 Gene [TF]   NSA2/HEXB HEXB NSA2 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74640023-74721288 + 5q13 5q22 Gene [TF]   TRIM36/HEXB HEXB TRIM36 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74721204-74767371 - 5q13 10p12 Gene [CT]   GFM2/SPAG6 GFM2 SPAG6 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74721204-74767371 - 5q13   Gene [G]     GFM2       [Omim] [Entrez]
    chr5:74766991-74776912 + 5q13 5q13 Gene [AM]   NSA2/HEXB NSA2 HEXB [TCGA-BRCA]     [Omim] [Entrez]
    chr5:74766991-74776912 + 5q13 5q13 Gene [CT]   NSA2/NSA2 NSA2 NSA2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74766991-74776912 + 5q13   Gene [G]     NSA2       [Omim] [Entrez]
    chr5:74766991-74776912 + 5q13 5q13 Gene [M]   NSA2/HEXB NSA2 HEXB [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74766991-74776912 + 5q13 5q31 Gene [M]   NSA2/PCDHA3 NSA2 PCDHA3 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74766991-74776912 + 5q13 5q13 Gene [TF]   NSA2/HEXB NSA2 HEXB [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74777574-74866838 - 5q13 1q25 Gene [CT]   TNFSF4/FAM169A FAM169A TNFSF4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:74777574-74866838 - 5q13 5q13 Gene [GAO]   FAM169A/ANKRD31 FAM169A ANKRD31 BLCA   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74777574-74866838 - 5q13   Gene [G]     FAM169A       [Omim] [Entrez]
    chr5:74777574-74866838 - 5q13 5q13 Gene [M]   FAM169A/ANKRD31 FAM169A ANKRD31 [Mitelman] Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74777574-74866838 - 5q13 5q13 Gene [M]   HEXB/FAM169A FAM169A HEXB [Mitelman] Stomach Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74777574-74866838 - 5q13 5q13 Gene [TF]   FAM169A/ANKRD31 FAM169A ANKRD31 [TCGA] [TCGA-BLCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74777574-74866838 - 5q13 5q13 Gene [TF]   FAM169A/ANKRD31 FAM169A ANKRD31 [TCGA] [TCGA-BLCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:74865893-74867276 + 5q13   Gene [G]     LOC441086       [Omim] [Entrez]
    chr5:75027464-75030899 - 5q13   Gene [G]     GCNT4       [Omim] [Entrez]
    chr5:75047719-75052643 - 5q13   Gene [G]     LINC01336       [Omim] [Entrez]
    chr5:75068297-75236878 - 5q13 5q13 Gene [GAO]   FAM169A/ANKRD31 ANKRD31 FAM169A   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75068297-75236878 - 5q13 5q12 Gene [G]   NDUFAF2/ANKRD31 ANKRD31 NDUFAF2     [Omim] [Entrez]
    chr5:75068297-75236878 - 5q13 5q13 Gene [M]   FAM169A/ANKRD31 ANKRD31 FAM169A [Mitelman] Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75068297-75236878 - 5q13 5q12 Gene [M]   NDUFAF2/ANKRD31 ANKRD31 NDUFAF2 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75068297-75236878 - 5q13 5p13 Gene [M]   RICTOR/ANKRD31 ANKRD31 RICTOR [Mitelman] Adrenal Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75068297-75236878 - 5q13 5q13 Gene [TF]   FAM169A/ANKRD31 ANKRD31 FAM169A [TCGA] [TCGA-BLCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75068297-75236878 - 5q13 5q13 Gene [TF]   FAM169A/ANKRD31 ANKRD31 FAM169A [TCGA] [TCGA-BLCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75068297-75236878 - 5q13 5q12 Gene [TF]   NDUFAF2/ANKRD31 ANKRD31 NDUFAF2 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75337168-75362101 + 5q13 5q11 Gene [AM]   NDUFS4/HMGCR HMGCR NDUFS4 [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
    chr5:75337168-75362101 + 5q13 16q22 Gene [CT]   TANGO6/HMGCR HMGCR TANGO6 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:75337168-75362101 + 5q13 20q11 Gene [CT]   HMGCR/TP53INP2 HMGCR TP53INP2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:75337168-75362101 + 5q13 5q13 Gene [CT]   WDR41/HMGCR HMGCR WDR41 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:75337168-75362101 + 5q13   Gene [G]     HMGCR       [Omim] [Entrez]
    chr5:75371103-75511629 - 5q13 5q12 Gene [AM]   COL4A3BP/ELOVL7 COL4A3BP ELOVL7 [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
    chr5:75371103-75511629 - 5q13   Gene [G]     COL4A3BP       [Omim] [Entrez]
    chr5:75371103-75511629 - 5q13 5p13 Gene [M]   DAB2/COL4A3BP COL4A3BP DAB2 [Mitelman] Adrenal Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75371103-75511629 - 5q13 5q12 Gene [M]   COL4A3BP/ELOVL7 COL4A3BP ELOVL7 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75511750-75605819 + 5q13   Gene [G]     POLK       [Omim] [Entrez]
    chr5:75511750-75605819 + 5q13 5q23 Gene [M]   POLK/HSD17B4 POLK HSD17B4 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:75611476-75671846 + 5q13   Gene [G]     ANKDD1B       [Omim] [Entrez]
    chr5:75674199-75712455 - 5q13   Gene [G]     POC5       [Omim] [Entrez]
    chr5:75674199-75712455 - 5q13 11q22 Gene [M]   POC5/CUL5 POC5 CUL5 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76083414-76333956 + 5q13 8p11 Gene [CT]   RAB11FIP1/SV2C SV2C RAB11FIP1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:76083414-76333956 + 5q13   Gene [G]     SV2C       [Omim] [Entrez]
    chr5:76083414-76333956 + 5q13 12q14 Gene [M]   PPM1H/SV2C SV2C PPM1H [Mitelman] Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 7q31 Gene [CT]   CAV1/IQGAP2 IQGAP2 CAV1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 15q15 Gene [CT]   IQGAP2/CCDC32 IQGAP2 CCDC32 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 22q13 Gene [CT]   IQGAP2/PDGFB IQGAP2 PDGFB [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 Xq28 Gene [CT]   RPL10/IQGAP2 IQGAP2 RPL10 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 5q14 Gene [G]   IQGAP2/ACOT12 IQGAP2 ACOT12     [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 10q25 Gene [G]   IQGAP2/ATRNL1 IQGAP2 ATRNL1     [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 5q33 Gene [G]   PWWP2A/IQGAP2 IQGAP2 PWWP2A     [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 5q14 Gene [M]   IQGAP2/ACOT12 IQGAP2 ACOT12 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 19q13 Gene [M]   APOE/IQGAP2 IQGAP2 APOE [Mitelman] Liver Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 10q25 Gene [M]   IQGAP2/ATRNL1 IQGAP2 ATRNL1 [Mitelman] Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 5q33 Gene [M]   PWWP2A/IQGAP2 IQGAP2 PWWP2A [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 5q14 Gene [TF]   IQGAP2/ACOT12 IQGAP2 ACOT12 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 10q25 Gene [TF]   IQGAP2/ATRNL1 IQGAP2 ATRNL1 [TCGA] [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76403255-76708132 + 5q13 5q33 Gene [TF]   PWWP2A/IQGAP2 IQGAP2 PWWP2A [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76606611-76608969 - 5q13   Gene [G]     LOC101929109       [Omim] [Entrez]
    chr5:76615482-76623434 - 5q13   Gene [G]     F2RL2       [Omim] [Entrez]
    chr5:76712403-76712888 + 5q13   Gene [G]     NCRUPAR       [Omim] [Entrez]
    chr5:76716043-76735780 + 5q13 1q23 Gene [CT]   ADAMTS4/F2R F2R ADAMTS4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:76716043-76735780 + 5q13 11p15 Gene [CT]   AKIP1/F2R F2R AKIP1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:76716043-76735780 + 5q13 4q31 Gene [CT]   MIR548G/F2R F2R MIR548G [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:76716043-76735780 + 5q13 20q13 Gene [CT]   F2R/SERINC3 F2R SERINC3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:76716043-76735780 + 5q13   Gene [G]     F2R       [Omim] [Entrez]
    chr5:76716043-76735780 + 5q13 5q11 Gene [TF]   MTREX/F2R F2R MTREX [TCGA] [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:76818977-76835315 + 5q13   Gene [G]     F2RL1       [Omim] [Entrez]
    chr5:76850001-76921231 + 5q13   Gene [G]     S100Z       [Omim] [Entrez]
    chr5:76952855-76969474 + 5q13   Gene [G]     CRHBP       [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 8q24 Gene [CT]   FBXO32/AGGF1 AGGF1 FBXO32 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 9q34 Gene [CT]   NUP214/AGGF1 AGGF1 NUP214 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 11p15 Gene [CT]   RIC8A/AGGF1 AGGF1 RIC8A [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [GAO]   AGGF1/RAF1 AGGF1 RAF1 THCA   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [GAO]   RAF1/AGGF1 AGGF1 RAF1   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 9q34 Gene [G]   NUP214/AGGF1 AGGF1 NUP214     [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [G]   AGGF1/RAF1 AGGF1 RAF1     [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [G]   RAF1/AGGF1 AGGF1 RAF1     [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [M]   AGGF1/RAF1 AGGF1 RAF1 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [M]   AGGF1/RAF1 AGGF1 RAF1 [Mitelman] Thyroid Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [M]   RAF1/AGGF1 AGGF1 RAF1 [Mitelman] Thyroid Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [TF]   AGGF1/RAF1 AGGF1 RAF1 [TCGA] [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [TF]   AGGF1/RAF1 AGGF1 RAF1 [TCGA] [TCGA-THCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77030385-77065233 + 5q13 3p25 Gene [TF]   AGGF1/RAF1 AGGF1 RAF1 [TCGA] [TCGA-THCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77076677-77087246 - 5q13   Gene [G]     ZBED3       [Omim] [Entrez]
    chr5:77080434-77080571 - 5q13   Gene [G]     SNORA47       [Omim] [Entrez]
    chr5:77086798-77148351 + 5q13   Gene [G]     ZBED3-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:77210881-77428255 + 5q13 6p25 Gene [COF]   GMDS/PDE8B PDE8B GMDS [Fusion 713] breast NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77210881-77428255 + 5q13 6p25 Gene [COF]   GMDS/PDE8B PDE8B GMDS [Fusion 715] breast NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77210881-77428255 + 5q13 16q23 Gene [CT]   PDE8B/TERF2IP PDE8B TERF2IP [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:77210881-77428255 + 5q13 6p25 Gene [G]   GMDS/PDE8B PDE8B GMDS     [Omim] [Entrez]
    chr5:77210881-77428255 + 5q13 6p25 Gene [URK]   GMDS/PDE8B PDE8B GMDS   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:77430933-77492540 - 5q13 5q13 Gene [CT]   WDR41/HMGCR WDR41 HMGCR [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:77430933-77492540 - 5q13 11p15 Gene [CT]   TEAD1/WDR41 WDR41 TEAD1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:77430933-77492540 - 5q13 5q13 Gene [CT]   WDR41/WDR41 WDR41 WDR41 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:77430933-77492540 - 5q13 5q13 Gene [CT]   WDR41/WDR41 WDR41 WDR41 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:77430933-77492540 - 5q13   Gene [G]     WDR41       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 5q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 5q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Gene list (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References