Chromosome 5

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 5


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Band 5q14

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  • Chromosomal abnormalities in band 5q14
  • Genes in band 5q14 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 5q14

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    5q145q33Cosmic_SVu(5)(q14;q33)  Cosmic_SV [COST380411]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    5q145q33Cosmic_SVu(5)(q14;q33)  Cosmic_SV [COST384978]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    5q145q35Cosmic_SVu(5)(q14;q35)  Cosmic_SV [COST28362]large_intestine__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    5q145q35Cosmic_SVu(5)(q14;q35)  Cosmic_SV [COST339454]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    5q145q35Cosmic_SVu(5)(q14;q35)  Cosmic_SV [COST449406]breast__NScarcinoma__HER-positive_carcinoma [COSU668]
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    5q14Xp22Cosmic_SVu(5;X)(q14;p22)  Cosmic_SV [COST370438]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
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    Genes in band 5q14

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr5:77628712-77638697 - 5q14 6q26 Gene [CT]   OTP/PACRG OTP PACRG [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:77628712-77638697 - 5q14   Gene [G]     OTP   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:77691169-77776361 - 5q14   Gene [G]     TBCA   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:77773357-77776333 - 5q14   Gene [G]     LOC105379045       [Omim] [Entrez]
    chr5:77884656-77959096 + 5q14   Gene [G]     LOC101929154       [Omim] [Entrez]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 7q34 Gene [AM]   BRAF/AP3B1 AP3B1 BRAF [Cosmic]
    [TCGA-THCA]     [Omim] [Entrez]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 5q14 Gene [CT]   AP3B1/AP3B1 AP3B1 AP3B1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 5q14 Gene [CT]   AP3B1/AP3B1 AP3B1 AP3B1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 9q31 Gene [CT]   EPB41L4B/AP3B1 AP3B1 EPB41L4B [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 7q34 Gene [G]   AP3B1/BRAF AP3B1 BRAF [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 7q34 Gene [G]   BRAF/AP3B1 AP3B1 BRAF [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 7q34 Gene [M]   AP3B1/BRAF AP3B1 BRAF [Cosmic]
    [Mitelman]
    Thyroid Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 7q34 Gene [M]   BRAF/AP3B1 AP3B1 BRAF [Cosmic]
    [Mitelman]
    Thyroid Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 5q33 Gene [M]   AP3B1/DCTN4 AP3B1 DCTN4 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 7q34 Gene [TF]   BRAF/AP3B1 AP3B1 BRAF [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-THCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78002326-78294755 - 5q14 5q33 Gene [TF]   AP3B1/DCTN4 AP3B1 DCTN4 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78358764-78360541 - 5q14   Gene [G]     SCAMP1-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:78360503-78480739 + 5q14   Gene [G]     SCAMP1       [Omim] [Entrez]
    chr5:78485215-78648825 - 5q14 12q13 Gene [AM]   PMEL/LHFPL2 LHFPL2 PMEL [Cosmic]
    [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
    chr5:78485215-78648825 - 5q14 15q22 Gene [CT]   LHFPL2/ANXA2 LHFPL2 ANXA2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78485215-78648825 - 5q14 17p13 Gene [CT]   LHFPL2/CRK LHFPL2 CRK [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78485215-78648825 - 5q14 10q22 Gene [CT]   KCNMA1/LHFPL2 LHFPL2 KCNMA1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78485215-78648825 - 5q14   Gene [G]     LHFPL2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:78485215-78648825 - 5q14 6p22 Gene [M]   HIST1H2AC/LHFPL2 LHFPL2 HIST1H2AC [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78485215-78648825 - 5q14 6p22 Gene [M]   LHFPL2/HIST1H2AC LHFPL2 HIST1H2AC [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78485215-78648825 - 5q14 6p22 Gene [TF]   HIST1H2AC/LHFPL2 LHFPL2 HIST1H2AC [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78485215-78648825 - 5q14 6p22 Gene [TF]   LHFPL2/HIST1H2AC LHFPL2 HIST1H2AC [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78777211-78986534 - 5q14 7q34 Gene [CT]   ARSB/DENND2A ARSB DENND2A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78777211-78986534 - 5q14 13q32 Gene [CT]   ARSB/NALCN ARSB NALCN [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78777211-78986534 - 5q14   Gene [G]     ARSB   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:78777211-78986534 - 5q14 5p13 Gene [M]   DAB2/ARSB ARSB DAB2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Adrenal Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78777211-78986534 - 5q14 5q14 Gene [M]   ARSB/DMGDH ARSB DMGDH [Cosmic]
    [Mitelman]
    Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78997564-79069674 - 5q14   Gene [G]     DMGDH   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:78997564-79069674 - 5q14 5q14 Gene [M]   ARSB/DMGDH DMGDH ARSB [Cosmic]
    [Mitelman]
    Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78997564-79069674 - 5q14 5q14 Gene [M]   JMY/DMGDH DMGDH JMY [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78997564-79069674 - 5q14 1q25 Gene [M]   DMGDH/NMNAT2 DMGDH NMNAT2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78997564-79069674 - 5q14 1q25 Gene [TF]   DMGDH/NMNAT2 DMGDH NMNAT2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79069724-79090074 + 5q14 20p12 Gene [CT]   BHMT2/SPTLC3 BHMT2 SPTLC3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79069724-79090074 + 5q14 2p22 Gene [G]   BIRC6/BHMT2 BHMT2 BIRC6 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:79069724-79090074 + 5q14 2p22 Gene [M]   BIRC6/BHMT2 BHMT2 BIRC6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Undifferentiated carcinoma, small cell [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79111781-79132290 + 5q14 3q26 Gene [CT]   GOLIM4/BHMT BHMT GOLIM4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79111781-79132290 + 5q14   Gene [G]     BHMT   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:79236102-79327215 + 5q14   Gene [G]     JMY   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:79236102-79327215 + 5q14 11p15 Gene [GT]   JMY/EPS8L2 JMY EPS8L2 [Cosmic]
    [GenenTech]
    HCC2270__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79236102-79327215 + 5q14 5q14 Gene [M]   JMY/DMGDH JMY DMGDH [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79373824-79513836 - 5q14 17p13 Gene [CT]   HOMER1/EFNB3 HOMER1 EFNB3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79373824-79513836 - 5q14 12p11 Gene [CT]   ITPR2/HOMER1 HOMER1 ITPR2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79373824-79513836 - 5q14   Gene [G]     HOMER1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:79373824-79513836 - 5q14 5q12 Gene [GT]   HOMER1/SREK1 HOMER1 SREK1 [Cosmic]
    [GenenTech]
    YMB-1__Breast   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79373824-79513836 - 5q14 5q12 Gene [GT]   SREK1/HOMER1 HOMER1 SREK1 [Cosmic]
    [GenenTech]
    YMB-1__Breast   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79373824-79513836 - 5q14 1p34 Gene [M]   HOMER1/MAST2 HOMER1 MAST2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79373824-79513836 - 5q14 5q23 Gene [PM]   LMNB1/HOMER1 HOMER1 LMNB1 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79373824-79513836 - 5q14 1p34 Gene [TF]   HOMER1/MAST2 HOMER1 MAST2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LGG]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79612417-79688243 + 5q14 20q11 Gene [CT]   CPNE1/PAPD4 PAPD4 CPNE1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79612417-79688243 + 5q14 5q14 Gene [CT]   PAPD4/PAPD4 PAPD4 PAPD4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79612417-79688243 + 5q14 Xp11 Gene [CT]   RBM10/PAPD4 PAPD4 RBM10 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79612417-79688243 + 5q14 6q25 Gene [CT]   TIAM2/PAPD4 PAPD4 TIAM2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79689836-79800226 + 5q14 1p36 Gene [TF]   MIIP/CMYA5 CMYA5 MIIP [Cosmic]
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    [ChiTaRS]  
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        [Omim] [Entrez]
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    chr5:80111227-80256082 - 5q14 3q22 Gene [AM]   SERINC5/ACPP SERINC5 ACPP [Cosmic]
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        [Omim] [GenBank]
    chr5:80111227-80256082 - 5q14 22q13 Gene [CT]   SERINC5/CERK SERINC5 CERK [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    chr5:80111227-80256082 - 5q14 6p21 Gene [CT]   NUDT3/SERINC5 SERINC5 NUDT3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80111227-80256082 - 5q14 13q21 Gene [FC]   TDRD3/SERINC5 SERINC5 TDRD3 [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Melanoma|Melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256082 - 5q14 5q14 Gene [G]   SSBP2/SERINC5 SERINC5 SSBP2 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256082 - 5q14 16q23 Gene [M]   SERINC5/CDYL2 SERINC5 CDYL2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256082 - 5q14 5q14 Gene [M]   SSBP2/SERINC5 SERINC5 SSBP2 [Cosmic]
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    Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256082 - 5q14 1p32 Gene [M]   SERINC5/TTC39A SERINC5 TTC39A [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [TCGA]
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    chr5:80111227-80256082 - 5q14 5q14 Gene [TF]   SSBP2/SERINC5 SERINC5 SSBP2 [Cosmic]
    [TCGA]
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    [TCGA]
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    [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
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        [Omim] [GenBank]
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    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:80487981-80542563 + 5q14 11q22 Gene [M]   FAM151B/CASP12 FAM151B CASP12 [Cosmic]
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    [ChiTaRS]  
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    chr5:80626226-80654981 - 5q14 3q27 Gene [CT]   DHFR/PSMD2 DHFR PSMD2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    chr5:80626226-80654981 - 5q14 12q24 Gene [CT]   DHFR/SPPL3 DHFR SPPL3 [Cosmic]
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    chr5:80650000-80651035 - 5q14 1p36 Gene [NOR]   MIR6723/MTRNR2L2 MTRNR2L2 MIR6723 [Cosmic] adrenal_gland Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80650000-80651035 - 5q14 1p36 Gene [NOR]   MIR6723/MTRNR2L2 MTRNR2L2 MIR6723 [Cosmic] colon Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80650000-80651035 - 5q14 1p36 Gene [NOR]   MIR6723/MTRNR2L2 MTRNR2L2 MIR6723 [Cosmic] small_intestine Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80650000-80651035 - 5q14 1p36 Gene [NOR]   MIR6723/MTRNR2L2 MTRNR2L2 MIR6723 [Cosmic] testis Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80650000-80651035 - 5q14   Gene [NOR]   MTATP6P1/MTRNR2L2 MTRNR2L2 MTATP6P1 [Cosmic] esophagus Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:81233320-81266398 + 5q14 5q14 Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 CKMT2 ZCCHC9 [Cosmic] adrenal_gland Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81233320-81266398 + 5q14 5q14 Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 CKMT2 ZCCHC9 [Cosmic] esophagus Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81233320-81266398 + 5q14 5q14 Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 CKMT2 ZCCHC9 [Cosmic] heart Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81233320-81266398 + 5q14 5q14 Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 CKMT2 ZCCHC9 [Cosmic] heart Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81237565-81301569 - 5q14   Gene [G]     CKMT2-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:81301583-81313146 + 5q14   Gene [G]     ZCCHC9   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:81301583-81313146 + 5q14 5q14 Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 ZCCHC9 CKMT2 [Cosmic] adrenal_gland Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81301583-81313146 + 5q14 5q14 Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 ZCCHC9 CKMT2 [Cosmic] adrenal_gland Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81301583-81313146 + 5q14 5q14 Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 ZCCHC9 CKMT2 [Cosmic] esophagus Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81301583-81313146 + 5q14 5q14 Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 ZCCHC9 CKMT2 [Cosmic] heart Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81301583-81313146 + 5q14 5q14 Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 ZCCHC9 CKMT2 [Cosmic] heart Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81330128-81394169 - 5q14   Gene [G]     ACOT12   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:81330128-81394169 - 5q14 5q13 Gene [M]   IQGAP2/ACOT12 ACOT12 IQGAP2 [Cosmic]
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    haematopoietic_and_lymphoid_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    haematopoietic_and_lymphoid_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr5:81412807-81751253 - 5q14 5q32 Gene [M]   SSBP2/CSF1R SSBP2 CSF1R [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 5q21 Gene [M]   SSBP2/FER SSBP2 FER [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 9p24 Gene [M]   SSBP2/JAK2 SSBP2 JAK2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 22q13 Gene [M]   SSBP2/LGALS2 SSBP2 LGALS2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 1q23 Gene [M]   SSBP2/NTRK1 SSBP2 NTRK1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Thyroid Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 5q14 Gene [M]   SSBP2/SERINC5 SSBP2 SERINC5 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 9p24 Gene [PM]   SSBP2/JAK2 SSBP2 JAK2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 9p24 Gene [PM]   SSBP2/JAK2 SSBP2 JAK2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 22q13 Gene [TF]   SSBP2/LGALS2 SSBP2 LGALS2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-SKCM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 1q23 Gene [TF]   SSBP2/NTRK1 SSBP2 NTRK1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-THCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 5q14 Gene [TF]   SSBP2/SERINC5 SSBP2 SERINC5 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 9p24 Gene [TIC]   SSBP2/JAK2 SSBP2 JAK2 [Cosmic]
    [TICdb]
      [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 9p24 Gene [URK]   SSBP2/JAK2 SSBP2 JAK2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 9p24 Gene [URK]   SSBP2/JAK2 SSBP2 JAK2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81412807-81751253 - 5q14 9p24 Gene [URK]   SSBP2/JAK2 SSBP2 JAK2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81972025-82255396 + 5q14   Gene [G]     ATG10   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:81972025-82255396 + 5q14 16p13 Gene [M]   CREBBP/ATG10 ATG10 CREBBP [Cosmic]
    [Mitelman]
    Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81972025-82255396 + 5q14 16p13 Gene [TF]   CREBBP/ATG10 ATG10 CREBBP [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14 3q13 Gene [CT]   RPS23/CCDC80 RPS23 CCDC80 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14 6p21 Gene [CT]   CUTA/RPS23 RPS23 CUTA [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14 5q21 Gene [CT]   EFNA5/RPS23 RPS23 EFNA5 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14 2q11 Gene [CT]   MRPL30/RPS23 RPS23 MRPL30 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14 2q11 Gene [CT]   RPS23/MRPL30 RPS23 MRPL30 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14 Xp22 Gene [CT]   NLGN4X/RPS23 RPS23 NLGN4X [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14 10q22 Gene [CT]   RPS23/RPS24 RPS23 RPS24 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14 11q24 Gene [CT]   SNX19/RPS23 RPS23 SNX19 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14 12q13 Gene [CT]   TUBA1C/RPS23 RPS23 TUBA1C [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:82273320-82278416 - 5q14   Gene [G]     RPS23   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:82279462-82319932 + 5q14   Gene [G]     ATP6AP1L   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:82840155-82840224 + 5q14   Gene [G]     MIR3977       [Omim] [Entrez]
    chr5:82850865-82859836 - 5q14   Gene [G]     LINC01338       [Omim] [Entrez]
    chr5:83052846-83077453 - 5q14 1q25 Gene [CT]   DHX9/TMEM167A TMEM167A DHX9 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83052846-83077453 - 5q14 2q24 Gene [CT]   TMEM167A/KCNH7 TMEM167A KCNH7 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83052846-83077453 - 5q14 1p35 Gene [CT]   SNHG3/TMEM167A TMEM167A SNHG3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83052846-83077453 - 5q14   Gene [G]     TMEM167A   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:83064204-83064337 - 5q14   Gene [G]     SCARNA18       [Omim] [Entrez]
    chr5:83077409-83353760 + 5q14 20q13 Gene [CT]   TPD52L2/XRCC4 XRCC4 TPD52L2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83077409-83353760 + 5q14 Xq22 Gene [G]   COL4A5/XRCC4 XRCC4 COL4A5 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:83077409-83353760 + 5q14 9q31 Gene [GT]   XRCC4/MSANTD3 XRCC4 MSANTD3 [Cosmic]
    [GenenTech]
    SW780__UrinaryBladder   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83077409-83353760 + 5q14 Xq22 Gene [M]   COL4A5/XRCC4 XRCC4 COL4A5 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83077409-83353760 + 5q14 9p23 Gene [M]   NFIB/XRCC4 XRCC4 NFIB [Cosmic]
    [Mitelman]
    Salivary gland Adenoid cystic carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83077409-83353760 + 5q14 Xq22 Gene [TF]   COL4A5/XRCC4 XRCC4 COL4A5 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83471674-83582303 + 5q14   Gene [AM]   C9ORF3/VCAN VCAN C9ORF3 [Cosmic]
    [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
    chr5:83471674-83582303 + 5q14 11q13 Gene [AM]   VCAN/MALAT1 VCAN MALAT1 [Cosmic]
    [TCGA-UCEC]     [Omim] [Entrez]
    chr5:83471674-83582303 + 5q14 14q32 Gene [CT]   LGMN/VCAN VCAN LGMN [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83471674-83582303 + 5q14 17q25 Gene [CT]   VCAN/ST6GALNAC2 VCAN ST6GALNAC2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83471674-83582303 + 5q14   Gene [M]   ?VCAN? VCAN   [Cosmic]
    [Mitelman]
    Soft tissue Dermatofibrosarcoma protuberans/Bednar tumor/giant cell fibroblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83471674-83582303 + 5q14   Gene [A]     VCAN   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:83531352-83562314 - 5q14   Gene [G]     VCAN-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:83638198-83721077 - 5q14 20q13 Gene [CT]   HAPLN1/GNAS HAPLN1 GNAS [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83638198-83721077 - 5q14   Gene [G]     HAPLN1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:83940595-84384867 - 5q14 16p13 Gene [CT]   EDIL3/ABAT EDIL3 ABAT [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83940595-84384867 - 5q14 17q21 Gene [CT]   ETV4/EDIL3 EDIL3 ETV4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83940595-84384867 - 5q14   Gene [A]     EDIL3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:83940595-84384867 - 5q14 1p21 Gene [M]   DPYD/EDIL3 EDIL3 DPYD [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83940595-84384867 - 5q14 7q32 Gene [M]   EDIL3/MKLN1 EDIL3 MKLN1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83940595-84384867 - 5q14 1p21 Gene [TF]   DPYD/EDIL3 EDIL3 DPYD [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:86282444-86297547 + 5q14   Gene [G]     NBPF22P       [Omim] [Entrez]
    chr5:86617967-86620766 + 5q14   Gene [G]     COX7C   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:86620506-86620568 + 5q14   Gene [E]     SNORD138       [Omim] [Entrez]
    chr5:86746818-86749772 + 5q14   Gene [E]     LINC02059       [Omim] [Entrez]
    chr5:87048897-87055455 - 5q14   Gene [G]     LOC645261       [Omim] [Entrez]
    chr5:87114879-87114954 - 5q14   Gene [G]     MIR4280       [Omim] [Entrez]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14 1q32 Gene [CT]   ATP2B4/LOC101929380 LOC101929380 ATP2B4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14 1p22 Gene [CT]   BCAR3/LOC101929380 LOC101929380 BCAR3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14 15q21 Gene [CT]   LOC101929380/FBN1 LOC101929380 FBN1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14 8q24 Gene [CT]   NSMCE2/LOC101929380 LOC101929380 NSMCE2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14 8q24 Gene [CT]   NSMCE2/LOC101929380 LOC101929380 NSMCE2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14 12q13 Gene [CT]   LOC101929380/OR7E47P LOC101929380 OR7E47P [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14   Gene [G]     LOC101929380       [Omim] [Entrez]
    chr5:87216606-87239790 - 5q14   Gene [E]     LINC01949       [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87391926 + 5q14 5q31 Gene [AM]   RASA1/RAPGEF6 RASA1 RAPGEF6 [Cosmic]
    [TCGA-LUAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87391926 + 5q14 5q14 Gene [CT]   RASA1/RASA1 RASA1 RASA1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:87268253-87391926 + 5q14 3q26 Gene [CT]   TNFSF10/RASA1 RASA1 TNFSF10 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:87268253-87391926 + 5q14 3p14 Gene [CT]   RASA1/WNT5A RASA1 WNT5A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:87268253-87391926 + 5q14   Gene [G]     RASA1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87391926 + 5q14 5q31 Gene [M]   RASA1/FNIP1 RASA1 FNIP1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87391926 + 5q14 5q31 Gene [M]   RASA1/VDAC1 RASA1 VDAC1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87391926 + 5q14 5q31 Gene [TF]   RASA1/FNIP1 RASA1 FNIP1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:87318415-87323628 - 5q14   Gene [G]     LOC644285       [Omim] [Entrez]
    chr5:87394262-87412904 - 5q14 10p14 Gene [CT]   CELF2/CCNH CCNH CELF2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:87394262-87412904 - 5q14   Gene [G]     CCNH   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:87394262-87412904 - 5q14 5q21 Gene [M]   CCNH/C5orf30 CCNH C5orf30 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88189633-88268879 - 5q14 5q14 Gene [AM]   TMEM161B/LINC00461 TMEM161B LINC00461 [Cosmic]
    [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88189633-88268879 - 5q14 12q24 Gene [CT]   CLIP1/TMEM161B TMEM161B CLIP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88189633-88268879 - 5q14 5q21 Gene [CT]   PPIP5K2/TMEM161B TMEM161B PPIP5K2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88189633-88268879 - 5q14 5q14 Gene [CT]   TMEM161B/TMEM161B TMEM161B TMEM161B [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88189633-88268879 - 5q14   Gene [G]     TMEM161B   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88189633-88268879 - 5q14 5q14 Gene [GT]   TMEM161B/CETN3 TMEM161B CETN3 [Cosmic]
    [GenenTech]
    G120__Brain   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88189633-88268879 - 5q14 5q15 Gene [M]   TMEM161B/FAM81B TMEM161B FAM81B [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88189633-88268879 - 5q14 5q15 Gene [TF]   TMEM161B/FAM81B TMEM161B FAM81B [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88268882-88436674 + 5q14   Gene [G]     TMEM161B-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:88408982-88439090 - 5q14   Gene [E]     LINC02060       [Omim] [Entrez]
    chr5:88540779-88684803 - 5q14 5q14 Gene [AM]   TMEM161B/LINC00461 LINC00461 TMEM161B [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88540779-88684803 - 5q14 5q14 Gene [CT]   LINC00461/LINC00461 LINC00461 LINC00461 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:88540779-88684803 - 5q14 5q14 Gene [CT]   LINC00461/LINC00461 LINC00461 LINC00461 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:88540779-88684803 - 5q14 5q14 Gene [CT]   LINC00461/LINC00461 LINC00461 LINC00461 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:88540779-88684803 - 5q14   Gene [CT]   LINC00461/WBSCR22 LINC00461 WBSCR22 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:88540779-88684803 - 5q14   Gene [G]     LINC00461       [Omim] [Entrez]
    chr5:88666853-88666939 - 5q14   Gene [G]     MIR9-2       [Omim] [Entrez]
    chr5:88676218-88722831 + 5q14   Gene [E]     MEF2C-AS2       [Omim] [Entrez]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 6p22 Gene [CT]   HLA-F/MEF2C MEF2C HLA-F [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 1p36 Gene [CT]   HNRNPR/MEF2C MEF2C HNRNPR [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14   Gene [CT]   IGHG1/MEF2C MEF2C IGHG1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 5q14 Gene [CT]   MEF2C/MEF2C MEF2C MEF2C [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 1q21 Gene [CT]   RPRD2/MEF2C MEF2C RPRD2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 19q13 Gene [CT]   TBC1D17/MEF2C MEF2C TBC1D17 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 6q21 Gene [CT]   TRAF3IP2-AS1/MEF2C MEF2C TRAF3IP2-AS1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 11q23 Gene [G]   MEF2C/KMT2A MEF2C KMT2A [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 5q33 Gene [M]   CLINT1/MEF2C MEF2C CLINT1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 11q23 Gene [M]   MEF2C/KMT2A MEF2C KMT2A [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute monoblastic leukemia (FAB type M5) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88718241-88904105 - 5q14 5q13 Gene [M]   TNPO1/MEF2C MEF2C TNPO1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Adrenal Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88889308-88967279 + 5q14   Gene [G]     MEF2C-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:90016621-90016720 - 5q14   Gene [G]     MIR3660       [Omim] [Entrez]
    chr5:90158339-90290071 - 5q14   Gene [G]     LINC01339       [Omim] [Entrez]
    chr5:90393335-90409786 - 5q14   Gene [G]     CETN3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:90393335-90409786 - 5q14 5q14 Gene [GT]   TMEM161B/CETN3 CETN3 TMEM161B [Cosmic]
    [GenenTech]
    G120__Brain   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90393335-90409786 - 5q14 5q11 Gene [M]   SKIV2L2/CETN3 CETN3 SKIV2L2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90393335-90409786 - 5q14 5q11 Gene [TF]   SKIV2L2/CETN3 CETN3 SKIV2L2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90410000-90410669 + 5q14   Gene [G]     LOC731157       [Omim] [Entrez]
    chr5:90458203-90474768 - 5q14   Gene [G]     MBLAC2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:90474864-90514552 + 5q14   Gene [G]     POLR3G   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:90515626-90529584 - 5q14   Gene [G]     LYSMD3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:90558800-91164216 + 5q14 14q22 Gene [CT]   ADGRV1/FBXO34 ADGRV1 FBXO34 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:90558800-91164216 + 5q14 12q24 Gene [CT]   GCN1/ADGRV1 ADGRV1 GCN1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:90558800-91164216 + 5q14   Gene [G]     ADGRV1       [Omim] [Entrez]
    chr5:90558800-91164216 + 5q14 3q23 Gene [M]   ADGRV1/ATR ADGRV1 ATR [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90558800-91164216 + 5q14 5p15 Gene [M]   ADGRV1/CLPTM1L ADGRV1 CLPTM1L [Mitelman] Adrenal Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90558800-91164216 + 5q14 5q21 Gene [M]   PJA2/ADGRV1 ADGRV1 PJA2 [Mitelman] Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90558800-91164216 + 5q14 3q23 Gene [TF]   ADGRV1/ATR ADGRV1 ATR [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:91280097-91281142 - 5q14   Gene [G]     LOC729040       [Omim] [Entrez]
    chr5:91302986-91314402 - 5q14   Gene [G]     LUCAT1       [Omim] [Entrez]
    chr5:91368632-91380297 - 5q14 Xq23 Gene [CT]   ACSL4/ARRDC3 ARRDC3 ACSL4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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        [Omim] [GenBank]
    chr5:91368632-91380297 - 5q14 5q14 Gene [CT]   ARRDC3/ARRDC3 ARRDC3 ARRDC3 [Cosmic]
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    chr5:91380347-91420715 + 5q14   Gene [G]     ARRDC3-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:92199537-92406644 + 5q14   Gene [G]     LOC105379674       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 5q14

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 5q14  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjuin 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 5q14. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/5q14.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mer. juin 7 12:23:59 CEST 2017


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