Chromosome 5

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 5


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Band 5q14

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  • Chromosomal abnormalities in band 5q14
  • Genes in band 5q14 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 5q14

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    Genes in band 5q14

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
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    chr5:77773357-77776333 - 5q14   Gene [G]     LOC105379045       [Omim] [Entrez]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    chr5:78002844-78294631 - 5q14   Gene [G]   BRAF/AP3B1 AP3B1 BRAF [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:78002844-78294631 - 5q14   Gene [M]   AP3B1/BRAF AP3B1 BRAF [Cosmic]
    [Mitelman]
    Thyroid Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78002844-78294631 - 5q14   Gene [M]   BRAF/AP3B1 AP3B1 BRAF [Cosmic]
    [Mitelman]
    Thyroid Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78002844-78294631 - 5q14 5q33 Gene [M]   AP3B1/DCTN4 AP3B1 DCTN4 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78002844-78294631 - 5q14   Gene [TF]   BRAF/AP3B1 AP3B1 BRAF [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-THCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78002844-78294631 - 5q14 5q33 Gene [TF]   AP3B1/DCTN4 AP3B1 DCTN4 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78358801-78359475 - 5q14   Gene [G]     SCAMP1-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:78360667-78475742 + 5q14   Gene [G]     SCAMP1       [Omim] [Entrez]
    chr5:78624817-78642162 - 5q14 12q13 Gene [AM]   PMEL/LHFPL2 LHFPL2 PMEL [Cosmic]
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    chr5:78624817-78642162 - 5q14   Gene [CT]   LHFPL2/ANXA2 LHFPL2 ANXA2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78624817-78642162 - 5q14   Gene [CT]   LHFPL2/CRK LHFPL2 CRK [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78624817-78642162 - 5q14 10q22 Gene [CT]   KCNMA1/LHFPL2 LHFPL2 KCNMA1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:78624817-78642162 - 5q14   Gene [G]     LHFPL2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:78624817-78642162 - 5q14 6p22 Gene [M]   HIST1H2AC/LHFPL2 LHFPL2 HIST1H2AC [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78624817-78642162 - 5q14 6p22 Gene [M]   LHFPL2/HIST1H2AC LHFPL2 HIST1H2AC [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78624817-78642162 - 5q14 6p22 Gene [TF]   HIST1H2AC/LHFPL2 LHFPL2 HIST1H2AC [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:78624817-78642162 - 5q14 6p22 Gene [TF]   LHFPL2/HIST1H2AC LHFPL2 HIST1H2AC [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79069760-79089129 + 5q14 20p12 Gene [CT]   BHMT2/SPTLC3 BHMT2 SPTLC3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79069760-79089129 + 5q14   Gene [G]   BIRC6/BHMT2 BHMT2 BIRC6 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:79069760-79089129 + 5q14   Gene [M]   BIRC6/BHMT2 BHMT2 BIRC6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Undifferentiated carcinoma, small cell [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79111809-79131392 + 5q14 3q26 Gene [CT]   GOLIM4/BHMT BHMT GOLIM4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79111809-79131392 + 5q14   Gene [G]     BHMT   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:79325263-79327209 + 5q14   Gene [G]     JMY   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:79325263-79327209 + 5q14 11p15 Gene [GT]   JMY/EPS8L2 JMY EPS8L2 [Cosmic]
    [GenenTech]
    HCC2270__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79325263-79327209 + 5q14   Gene [M]   JMY/DMGDH JMY DMGDH [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79612573-79686279 + 5q14 20q11 Gene [CT]   CPNE1/PAPD4 PAPD4 CPNE1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79612573-79686279 + 5q14 5q14 Gene [CT]   PAPD4/PAPD4 PAPD4 PAPD4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79612573-79686279 + 5q14 Xp11 Gene [CT]   RBM10/PAPD4 PAPD4 RBM10 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79612573-79686279 + 5q14 6q25 Gene [CT]   TIAM2/PAPD4 PAPD4 TIAM2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79612573-79686279 + 5q14   Gene [G]     PAPD4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:79733971-79736382 + 5q14 17q11 Gene [CT]   CMYA5/RPL23A CMYA5 RPL23A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79733971-79736382 + 5q14   Gene [G]     CMYA5   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:79733971-79736382 + 5q14 1p36 Gene [M]   MIIP/CMYA5 CMYA5 MIIP [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79733971-79736382 + 5q14 1p36 Gene [TF]   MIIP/CMYA5 CMYA5 MIIP [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-GBM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:79985941-79991243 - 5q14 5q14 Gene [CT]   MTX3/MTX3 MTX3 MTX3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:79985941-79991243 - 5q14   Gene [G]     MTX3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80036023-80083282 + 5q14 17q25 Gene [AM]   THBS4/TIMP2 THBS4 TIMP2 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr5:80036023-80083282 + 5q14   Gene [G]     THBS4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80066350-80083654 - 5q14   Gene [G]     CTD-2201I18.1       [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14   Gene [AM]   ACPP/SERINC5 SERINC5 ACPP [Cosmic]
    [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14   Gene [AM]   SERINC5/ACPP SERINC5 ACPP [Cosmic]
    [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14   Gene [AM]   SERINC5/ACPP SERINC5 ACPP [Cosmic]
    [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 16q23 Gene [AM]   SERINC5/CDYL2 SERINC5 CDYL2 [Cosmic]
    [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 1p32 Gene [AM]   OSBPL9/SERINC5 SERINC5 OSBPL9 [Cosmic]
    [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 1p32 Gene [AM]   SERINC5/TTC39A SERINC5 TTC39A [Cosmic]
    [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 11p13 Gene [CT]   CD44/SERINC5 SERINC5 CD44 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 22q13 Gene [CT]   SERINC5/CERK SERINC5 CERK [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 6p21 Gene [CT]   NUDT3/SERINC5 SERINC5 NUDT3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 6p21 Gene [CT]   NUDT3/SERINC5 SERINC5 NUDT3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14   Gene [FC]   TDRD3/SERINC5 SERINC5 TDRD3 [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Melanoma|Melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14   Gene [G]   SSBP2/SERINC5 SERINC5 SSBP2 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 16q23 Gene [M]   SERINC5/CDYL2 SERINC5 CDYL2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 1p32 Gene [M]   OSBPL9/SERINC5 SERINC5 OSBPL9 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14   Gene [M]   SSBP2/SERINC5 SERINC5 SSBP2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Ovary Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 1p32 Gene [M]   SERINC5/TTC39A SERINC5 TTC39A [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 5q14 Gene [M]   SERINC5/ZFYVE16 SERINC5 ZFYVE16 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 16q23 Gene [TF]   SERINC5/CDYL2 SERINC5 CDYL2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14   Gene [TF]   SERINC5/CTC-236F12.4 SERINC5 CTC-236F12.4 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 1p32 Gene [TF]   OSBPL9/SERINC5 SERINC5 OSBPL9 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14   Gene [TF]   SSBP2/SERINC5 SERINC5 SSBP2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 1p32 Gene [TF]   SERINC5/TTC39A SERINC5 TTC39A [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80111227-80256051 - 5q14 5q14 Gene [TF]   SERINC5/ZFYVE16 SERINC5 ZFYVE16 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80299096-80300478 - 5q14   Gene [G]     LOC644936       [Omim] [Entrez]
    chr5:80320004-80321832 + 5q14   Gene [G]     SPZ1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80408073-80479140 + 5q14 5q14 Gene [AM]   ZFYVE16/FAM151B ZFYVE16 FAM151B [Cosmic]
    [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80408073-80479140 + 5q14   Gene [CT]   ZFYVE16/ZFP90 ZFYVE16 ZFP90 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80408073-80479140 + 5q14 5q14 Gene [CT]   ZFYVE16/ZFYVE16 ZFYVE16 ZFYVE16 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80408073-80479140 + 5q14   Gene [G]     ZFYVE16   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80408073-80479140 + 5q14 5q14 Gene [M]   SERINC5/ZFYVE16 ZFYVE16 SERINC5 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80408073-80479140 + 5q14 5q14 Gene [TF]   SERINC5/ZFYVE16 ZFYVE16 SERINC5 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80487981-80542387 + 5q14 5q14 Gene [AM]   ZFYVE16/FAM151B FAM151B ZFYVE16 [Cosmic]
    [TCGA-SKCM]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80487981-80542387 + 5q14   Gene [G]     FAM151B   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80487981-80542387 + 5q14 11q22 Gene [M]   FAM151B/CASP12 FAM151B CASP12 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:80557796-80570264 - 5q14 11q14 Gene [CT]   CHORDC1/ANKRD34B ANKRD34B CHORDC1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80557796-80570264 - 5q14   Gene [G]     ANKRD34B   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:80960739-81225767 + 5q14   Gene [CT]   CCNB1IP1/RASGRF2 RASGRF2 CCNB1IP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80960739-81225767 + 5q14 18q23 Gene [CT]   RASGRF2/MBP RASGRF2 MBP [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:80960739-81225767 + 5q14 18q23 Gene [G]   RASGRF2/MBP RASGRF2 MBP [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:81233341-81266397 + 5q14   Gene [G]     CKMT2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:81233341-81266397 + 5q14   Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 CKMT2 ZCCHC9 [Cosmic] adrenal_gland Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81233341-81266397 + 5q14   Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 CKMT2 ZCCHC9 [Cosmic] adrenal_gland Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81233341-81266397 + 5q14   Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 CKMT2 ZCCHC9 [Cosmic] esophagus Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81233341-81266397 + 5q14   Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 CKMT2 ZCCHC9 [Cosmic] heart Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81233341-81266397 + 5q14   Gene [NOR]   CKMT2/ZCCHC9 CKMT2 ZCCHC9 [Cosmic] heart Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81237565-81301544 - 5q14   Gene [G]     CKMT2-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:81330264-81394137 - 5q14   Gene [G]     ACOT12   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:81330264-81394137 - 5q14 5q13 Gene [M]   IQGAP2/ACOT12 ACOT12 IQGAP2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81330264-81394137 - 5q14 5q13 Gene [TF]   IQGAP2/ACOT12 ACOT12 IQGAP2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81972157-82147496 + 5q14 16p13 Gene [G]   CREBBP/ATG10 ATG10 CREBBP [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:81972157-82147496 + 5q14 16p13 Gene [M]   CREBBP/ATG10 ATG10 CREBBP [Cosmic]
    [Mitelman]
    Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:81972157-82147496 + 5q14 16p13 Gene [TF]   CREBBP/ATG10 ATG10 CREBBP [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:82279462-82318406 + 5q14   Gene [G]     ATP6AP1L   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:83064204-83064337 - 5q14   Gene [G]     SCARNA18       [Omim] [Entrez]
    chr5:83077632-83353338 + 5q14 20q13 Gene [CT]   TPD52L2/XRCC4 XRCC4 TPD52L2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83077632-83353338 + 5q14 Xq22 Gene [G]   COL4A5/XRCC4 XRCC4 COL4A5 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:83077632-83353338 + 5q14 9q31 Gene [GT]   XRCC4/MSANTD3 XRCC4 MSANTD3 [Cosmic]
    [GenenTech]
    SW780__UrinaryBladder   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83077632-83353338 + 5q14 Xq22 Gene [M]   COL4A5/XRCC4 XRCC4 COL4A5 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83077632-83353338 + 5q14 Xq22 Gene [TF]   COL4A5/XRCC4 XRCC4 COL4A5 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:83641496-83721032 - 5q14   Gene [CT]   HAPLN1/GNAS HAPLN1 GNAS [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:83641496-83721032 - 5q14   Gene [G]     HAPLN1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:86282460-86296463 + 5q14   Gene [G]     NBPF22P       [Omim] [Entrez]
    chr5:86617943-86620766 + 5q14   Gene [G]     COX7C   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:87048897-87055455 - 5q14   Gene [G]     LOC645261       [Omim] [Entrez]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14 1q32 Gene [CT]   ATP2B4/LOC101929380 LOC101929380 ATP2B4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14 1p22 Gene [CT]   BCAR3/LOC101929380 LOC101929380 BCAR3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14 15q21 Gene [CT]   LOC101929380/FBN1 LOC101929380 FBN1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14   Gene [CT]   NSMCE2/LOC101929380 LOC101929380 NSMCE2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14   Gene [CT]   NSMCE2/LOC101929380 LOC101929380 NSMCE2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14   Gene [CT]   LOC101929380/OR7E47P LOC101929380 OR7E47P [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:87120148-87248018 + 5q14   Gene [G]     LOC101929380       [Omim] [Entrez]
    chr5:87216606-87239790 - 5q14   Gene [G]     LINC01949       [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87390927 + 5q14 5q31 Gene [AM]   RASA1/RAPGEF6 RASA1 RAPGEF6 [Cosmic]
    [TCGA-LUAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87390927 + 5q14 5q14 Gene [CT]   RASA1/RASA1 RASA1 RASA1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:87268253-87390927 + 5q14 3q26 Gene [CT]   TNFSF10/RASA1 RASA1 TNFSF10 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:87268253-87390927 + 5q14   Gene [CT]   RASA1/WNT5A RASA1 WNT5A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:87268253-87390927 + 5q14   Gene [G]     RASA1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87390927 + 5q14 5q31 Gene [M]   RASA1/FNIP1 RASA1 FNIP1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87390927 + 5q14 5q31 Gene [M]   RASA1/VDAC1 RASA1 VDAC1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:87268253-87390927 + 5q14 5q31 Gene [TF]   RASA1/FNIP1 RASA1 FNIP1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:87318416-87320769 - 5q14   Gene [G]     LOC644285       [Omim] [Entrez]
    chr5:87393417-87411294 - 5q14   Gene [CT]   CELF2/CCNH CCNH CELF2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:87393417-87411294 - 5q14   Gene [G]     CCNH   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88268938-88436669 + 5q14   Gene [G]     TMEM161B-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:88408982-88439090 - 5q14   Gene [G]     LINC02060       [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14   Gene [CT]   HLA-F/MEF2C MEF2C HLA-F [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 1p36 Gene [CT]   HNRNPR/MEF2C MEF2C HNRNPR [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14   Gene [CT]   IGHG1/MEF2C MEF2C IGHG1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 5q14 Gene [CT]   MEF2C/MEF2C MEF2C MEF2C [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14   Gene [CT]   RPRD2/MEF2C MEF2C RPRD2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 19q13 Gene [CT]   TBC1D17/MEF2C MEF2C TBC1D17 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 6q21 Gene [CT]   TRAF3IP2-AS1/MEF2C MEF2C TRAF3IP2-AS1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 5q33 Gene [G]   CLINT1/MEF2C MEF2C CLINT1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14   Gene [G]   HLA-F/MEF2C MEF2C HLA-F [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 1p36 Gene [G]   HNRNPR/MEF2C MEF2C HNRNPR [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 11q23 Gene [G]   MEF2C/KMT2A MEF2C KMT2A [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 5q14 Gene [G]   MEF2C/MEF2C MEF2C MEF2C [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14   Gene [G]   RPRD2/MEF2C MEF2C RPRD2 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 19q13 Gene [G]   TBC1D17/MEF2C MEF2C TBC1D17 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 6q21 Gene [G]   TRAF3IP2-AS1/MEF2C MEF2C TRAF3IP2-AS1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 5q33 Gene [M]   CLINT1/MEF2C MEF2C CLINT1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 11q23 Gene [M]   MEF2C/KMT2A MEF2C KMT2A [Cosmic]
    [Mitelman]
    Acute monoblastic leukemia (FAB type M5) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88722338-88883214 - 5q14 5q13 Gene [M]   TNPO1/MEF2C MEF2C TNPO1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Adrenal Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:88889335-88967279 + 5q14   Gene [G]     MEF2C-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:90393721-90409756 - 5q14   Gene [G]     CETN3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:90393721-90409756 - 5q14   Gene [GT]   TMEM161B/CETN3 CETN3 TMEM161B [Cosmic]
    [GenenTech]
    G120__Brain   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90393721-90409756 - 5q14 5q11 Gene [TF]   MTREX/CETN3 CETN3 MTREX [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90410000-90410666 + 5q14   Gene [G]     LOC731157       [Omim] [Entrez]
    chr5:90512168-90514553 + 5q14   Gene [G]     POLR3G   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:90516265-90518621 - 5q14   Gene [G]     LYSMD3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:90810579-91164215 + 5q14   Gene [CT]   ADGRV1/FBXO34 ADGRV1 FBXO34 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:90810579-91164215 + 5q14 12q24 Gene [CT]   GCN1/ADGRV1 ADGRV1 GCN1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr5:90810579-91164215 + 5q14   Gene [G]     ADGRV1       [Omim] [Entrez]
    chr5:90810579-91164215 + 5q14 3q23 Gene [M]   ADGRV1/ATR ADGRV1 ATR [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90810579-91164215 + 5q14   Gene [M]   ADGRV1/CLPTM1L ADGRV1 CLPTM1L [Mitelman] Adrenal Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90810579-91164215 + 5q14 5q21 Gene [M]   PJA2/ADGRV1 ADGRV1 PJA2 [Mitelman] Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:90810579-91164215 + 5q14 3q23 Gene [TF]   ADGRV1/ATR ADGRV1 ATR [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:91280097-91281142 - 5q14   Gene [G]     LOC729040       [Omim] [Entrez]
    chr5:91311021-91314402 - 5q14   Gene [G]     LUCAT1       [Omim] [Entrez]
    chr5:91368726-91383304 - 5q14 Xq23 Gene [CT]   ACSL4/ARRDC3 ARRDC3 ACSL4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    chr5:91380349-91420715 + 5q14   Gene [G]     ARRDC3-AS1       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 5q14

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 5q14  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjanv. 2018Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 5q14. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/5q14.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mar. janv. 23 16:33:27 CET 2018


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