Chromosome 5

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 5


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Band 5q15

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  • Chromosomal abnormalities in band 5q15
  • Genes in band 5q15 (reference hg38)
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  • References

    Chromosomal abnormalities in band 5q15

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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      Mitelmandel(5)(q12q15)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(5)(q13q15)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
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    5q15 dbCRIDdel(5)(q15) 11045Myeloperoxidase-negative Acute Leukemia[PubMed] 
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      Mitelmandel(5)(q15)  Mitelman (ISB-CGC) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
      Mitelmandel(5)(q15)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(5)(q15)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(5)(q15)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with minimal differentiation (FAB type M0)  
      Mitelmandel(5)(q15)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(5)(q15)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(5)(q15)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
      Mitelmandel(5)(q15)  Mitelman (ISB-CGC)Soft tissueSynovial sarcoma  
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      Mitelmandel(5)(q15q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q22)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
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      Mitelmandel(5)(q15q23)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(5)(q15q23)  Mitelman (ISB-CGC)Oral cavitySquamous cell carcinoma  
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      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute monoblastic leukemia (FAB type M5)  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Adult T-cell lymphoma/leukemia (HTLV-1+)  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic myeloid leukemia, t(9;22)  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC)Large intestineAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia  
      Mitelmandel(5)(q15q31)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
    5q155q33Cosmic_SVdel(5)(q15q33)  Cosmic_SV [COST28708]haematopoietic_and_lymphoid_tissue__NSlymphoid_neoplasm__acute_lymphoblastic_T_cell_leukaemia  
    5q155q33dbCRIDdel(5)(q15q33.3) 10012Rheumatoid Arthritis[PubMed] 
    5q155q33dbCRIDdel(5)(q15q33.3) 11242Acute Myelocytic Leukemia[PubMed] 
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Acute monoblastic leukemia without differentiation (FAB type M5a)  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with minimal differentiation (FAB type M0)  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic myeloid leukemia, t(9;22)  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic myelomonocytic leukemia  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Essential thrombocythemia  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic/myeloproliferative disease, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess blasts-2  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with ringed sideroblasts  
      Mitelmandel(5)(q15q33)  Mitelman (ISB-CGC)SkeletonEwing sarcoma  
      Mitelmandel(5)(q15q34)  Mitelman (ISB-CGC) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
      Mitelmandel(5)(q15q34)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q34)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q35)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(5)(q15q35)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q35)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(5)(q15q35)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(5)(q15q35)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
      Mitelmander(3)t(3;5)(p12;q15)  Mitelman (ISB-CGC)KidneyAdenocarcinoma  
      Mitelmander(3)t(3;5)(p13;q15)  Mitelman (ISB-CGC)KidneyAdenocarcinoma  
      Mitelmander(3)t(3;5)(p14;q15)  Mitelman (ISB-CGC)KidneyAdenocarcinoma  
      Mitelmander(3)t(3;5)(p21;q15)  Mitelman (ISB-CGC)KidneyAdenocarcinoma  
      Mitelmander(5)t(1;5)(q10;q15)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmander(5)t(5;11)(q15;q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
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    Genes in band 5q15

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        [Omim] [Entrez]
    chr5:95391366-95450441 + 5q15 5q14 Gene [GDB]   TMEM161B::FAM81B FAM81B TMEM161B [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95391366-95450441 + 5q15 5q14 Gene [TF]   TMEM161B::FAM81B FAM81B TMEM161B [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 1q32 Gene [CT]   TTC37::MFSD4A TTC37 MFSD4A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 1q32 Gene [CT]   TTC37::MFSD4A TTC37 MFSD4A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 17q11 Gene [CT]   NOS2::TTC37 TTC37 NOS2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 16q22 Gene [CT]   NQO1::TTC37 TTC37 NQO1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 Xp11 Gene [CT]   NUDT10::TTC37 TTC37 NUDT10 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 8p12 Gene [CT]   TTC37::RBPMS TTC37 RBPMS [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 1p21 Gene [CT]   RNPC3::TTC37 TTC37 RNPC3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 8q22 Gene [CT]   TTC37::RPL30 TTC37 RPL30 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15   Gene [G]     TTC37   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 5q15 Gene [GDB]   ELL2::TTC37 TTC37 ELL2 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 17q11 Gene [GDB]   NOS2::TTC37 TTC37 NOS2 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 16q22 Gene [GDB]   NQO1::TTC37 TTC37 NQO1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 Xp11 Gene [GDB]   NUDT10::TTC37 TTC37 NUDT10 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 8p12 Gene [GDB]   TTC37::RBPMS TTC37 RBPMS [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 1p21 Gene [GDB]   RNPC3::TTC37 TTC37 RNPC3 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 8q22 Gene [GDB]   TTC37::RPL30 TTC37 RPL30 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 5q33 Gene [GDB]   SLC36A1::TTC37 TTC37 SLC36A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95463894-95554977 - 5q15 5q33 Gene [TF]   SLC36A1::TTC37 TTC37 SLC36A1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:95555101-95605102 + 5q15   Gene [G]     ARSK   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:95555101-95605102 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   RHOBTB3::ARSK ARSK RHOBTB3 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95620087-95622142 + 5q15   Gene [G]     GPR150   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:95646879-95657145 + 5q15 5q15 Gene [DDR]   RHOBTB3::RFESD RFESD RHOBTB3 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:95646879-95657145 + 5q15   Gene [G]     RFESD   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:95646879-95657145 + 5q15 3q13 Gene [GDB]   TIMMDC1::RFESD RFESD TIMMDC1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95658316-95682991 - 5q15   Gene [G]     SPATA9   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:95658316-95682991 - 5q15 1p36 Gene [GDB]   KAZN::SPATA9 SPATA9 KAZN [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95731336-95796361 + 5q15 10q22 Gene [CT]   DLG5::RHOBTB3 RHOBTB3 DLG5 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95731336-95796361 + 5q15 5q15 Gene [CT]   RHOBTB3::RHOBTB3 RHOBTB3 RHOBTB3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95731336-95796361 + 5q15 5q15 Gene [DDR]   RHOBTB3::RFESD RHOBTB3 RFESD [Cosmic] [TCGA_LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:95731336-95796361 + 5q15   Gene [FC]   cytochrome_b::RHOBTB3 RHOBTB3 cytochrome_b [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Lung cancer [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:95731336-95796361 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   RHOBTB3::ARSK RHOBTB3 ARSK [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95731336-95796361 + 5q15 10q22 Gene [GDB]   DLG5::RHOBTB3 RHOBTB3 DLG5 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95731336-95796361 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   RHOBTB3::RHOBTB3 RHOBTB3 RHOBTB3 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95731336-95796361 + 5q15   Gene [A]     RHOBTB3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:95813849-95822726 - 5q15 5q15 Gene [CT]   GLRX::GLRX GLRX GLRX [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95813849-95822726 - 5q15   Gene [G]     GLRX   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:95813849-95822726 - 5q15 5q15 Gene [GDB]   GLRX::GLRX GLRX GLRX [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95834827-95849857 + 5q15   Gene [E]     LOC102724720       [Omim] [Entrez]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15 17q21 Gene [CT]   COL1A1::ELL2 ELL2 COL1A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15 19p13 Gene [CT]   SPPL2B::ELL2 ELL2 SPPL2B [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15   Gene [G]     ELL2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15 5q15 Gene [GDB]   ELL2::CAST ELL2 CAST [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15 17q21 Gene [GDB]   COL1A1::ELL2 ELL2 COL1A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15 5q11 Gene [GDB]   PARP8::ELL2 ELL2 PARP8 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15 19p13 Gene [GDB]   SPPL2B::ELL2 ELL2 SPPL2B [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15 5q15 Gene [GDB]   ELL2::TTC37 ELL2 TTC37 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15 2q36 Gene [GT]   DNER::ELL2 ELL2 DNER [Cosmic]
    [GenenTech]
    MG-63__Sarcomatoid   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:95885098-95961851 - 5q15 2q36 Gene [GT]   ELL2::TRIP12 ELL2 TRIP12 [Cosmic]
    [GenenTech]
    MG-63__Sarcomatoid   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:95962001-96631085 + 5q15   Gene [G]     LOC101929710       [Omim] [Entrez]
    chr5:96079138-96079212 + 5q15   Gene [G]     MIR583       [Omim] [Entrez]
    chr5:96390336-96432159 - 5q15 2p21 Gene [CT]   PCSK1::EPCAM PCSK1 EPCAM [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96390336-96432159 - 5q15 3p25 Gene [CT]   PCSK1::TADA3 PCSK1 TADA3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96390336-96432159 - 5q15 2p21 Gene [GDB]   PCSK1::EPCAM PCSK1 EPCAM [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96390336-96432159 - 5q15 3p25 Gene [GDB]   PCSK1::TADA3 PCSK1 TADA3 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96390336-96432159 - 5q15   Gene [A]     PCSK1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [AM]   LNPEP::CAST CAST LNPEP [Cosmic]
    [TCGA-BRCA]     [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 2p11 Gene [AM]   SFTPB::CAST CAST SFTPB [Cosmic]
    [TCGA-LUAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 2p11 Gene [AM]   SFTPB::CAST CAST SFTPB [Cosmic]
    [TCGA-LUAD]     [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 4p16 Gene [CT]   ADD1::CAST CAST ADD1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [CT]   CAST::CAST CAST CAST [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [CT]   CAST::CAST CAST CAST [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [CT]   CAST::CAST CAST CAST [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 14q32 Gene [CT]   DYNC1H1::CAST CAST DYNC1H1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 Xp22 Gene [CT]   FRMPD4::CAST CAST FRMPD4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 3q22 Gene [CT]   CAST::NEK11 CAST NEK11 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 9q21 Gene [CT]   TMC1::CAST CAST TMC1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15   Gene [G]     CAST   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 4p16 Gene [GDB]   ADD1::CAST CAST ADD1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q31 Gene [GDB]   ARHGAP26::CAST CAST ARHGAP26 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   CAST::CAST CAST CAST [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 7q22 Gene [GDB]   CAST::CDHR3 CAST CDHR3 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 14q32 Gene [GDB]   DYNC1H1::CAST CAST DYNC1H1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   ELL2::CAST CAST ELL2 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   CAST::FAM172A CAST FAM172A [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 Xp22 Gene [GDB]   FRMPD4::CAST CAST FRMPD4 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   LNPEP::CAST CAST LNPEP [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   CAST::MCTP1 CAST MCTP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 3q22 Gene [GDB]   CAST::NEK11 CAST NEK11 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q35 Gene [GDB]   SCGB3A1::CAST CAST SCGB3A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 Xq22 Gene [GDB]   TIMM8A::CAST CAST TIMM8A [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 9q21 Gene [GDB]   TMC1::CAST CAST TMC1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 7q22 Gene [TF]   CAST::CDHR3 CAST CDHR3 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [TF]   CAST::FAM172A CAST FAM172A [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q15 Gene [TF]   LNPEP::CAST CAST LNPEP [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 3q25 Gene [TF]   CAST::PLCH1 CAST PLCH1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:96702660-96774681 + 5q15 5q35 Gene [TF]   SCGB3A1::CAST CAST SCGB3A1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:96760810-96808189 - 5q15 5q15 Gene [CT]   ERAP1::ERAP1 ERAP1 ERAP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96760810-96808189 - 5q15 7q11 Gene [CT]   ERAP1::POR ERAP1 POR [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96760810-96808189 - 5q15   Gene [G]     ERAP1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:96760810-96808189 - 5q15 5q15 Gene [GDB]   ERAP1::ERAP1 ERAP1 ERAP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96760810-96808189 - 5q15 7q11 Gene [GDB]   ERAP1::POR ERAP1 POR [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96876500-96919702 + 5q15   Gene [G]     ERAP2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:96876500-96919702 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   FAM172A::ERAP2 ERAP2 FAM172A [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96876500-96919702 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   ERAP2::FAM81B ERAP2 FAM81B [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96876500-96919702 + 5q15 4p12 Gene [GDB]   NFXL1::ERAP2 ERAP2 NFXL1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96876500-96919702 + 5q15 5q15 Gene [TF]   FAM172A::ERAP2 ERAP2 FAM172A [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-KIRC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15 5q15 Gene [AM]   LNPEP::CAST LNPEP CAST [Cosmic]
    [TCGA-BRCA]     [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15 4q21 Gene [CT]   RASGEF1B::LNPEP LNPEP RASGEF1B [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15   Gene [G]     LNPEP   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   LNPEP::CAST LNPEP CAST [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15 5q35 Gene [GDB]   LNPEP::FLT4 LNPEP FLT4 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15 5q11 Gene [GDB]   LNPEP::GPBP1 LNPEP GPBP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15   Gene [GDB]   LNPEP::PART1 LNPEP PART1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15 5q21 Gene [GDB]   LNPEP::PPIP5K2 LNPEP PPIP5K2 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15 4q21 Gene [GDB]   RASGEF1B::LNPEP LNPEP RASGEF1B [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15 5q11 Gene [PC]   LNPEP::GPBP1 LNPEP GPBP1 [Cosmic] [Kidney-ChRCC] KICH-US [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:96958433-97037512 + 5q15 5q15 Gene [TF]   LNPEP::CAST LNPEP CAST [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:97091867-97142611 - 5q15   Gene [G]     LIX1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:97091867-97142611 - 5q15 5q15 Gene [GDB]   CHD1::LIX1 LIX1 CHD1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:97160867-97183247 - 5q15   Gene [G]     RIOK2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:97160867-97183247 - 5q15 14q11 Gene [GDB]   HNRNPC::RIOK2 RIOK2 HNRNPC [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:97504696-97671051 + 5q15   Gene [G]     LINC01340       [Omim] [Entrez]
    chr5:97840758-97923475 + 5q15   Gene [G]     LINC02234       [Omim] [Entrez]
    chr5:98085866-98161239 - 5q15   Gene [G]     LINC01846       [Omim] [Entrez]
    chr5:98769436-98796494 + 5q15 17q11 Gene [CT]   RGMB::CPD RGMB CPD [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:98769436-98796494 + 5q15 5q15 Gene [GAO]   CHD1::RGMB RGMB CHD1 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:98769436-98796494 + 5q15   Gene [G]     RGMB   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:98769436-98796494 + 5q15 5q22 Gene [GDB]   RGMB::CCDC112 RGMB CCDC112 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98769436-98796494 + 5q15 5q15 Gene [GDB]   CHD1::RGMB RGMB CHD1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98769436-98796494 + 5q15 17q11 Gene [GDB]   RGMB::CPD RGMB CPD [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98769618-98773084 - 5q15   Gene [G]     RGMB-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 3p22 Gene [CT]   CHD1::RPSA CHD1 RPSA [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 5q15 Gene [GAO]   CHD1::RGMB CHD1 RGMB [Cosmic] COAD   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15   Gene [G]     CHD1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 19q13 Gene [GDB]   CAPNS1::CHD1 CHD1 CAPNS1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 Xp22 Gene [GDB]   GPM6B::CHD1 CHD1 GPM6B [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 5q15 Gene [GDB]   CHD1::LIX1 CHD1 LIX1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 3p21 Gene [GDB]   MAP4::CHD1 CHD1 MAP4 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 1p36 Gene [GDB]   CHD1::MTOR CHD1 MTOR [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 5q13 Gene [GDB]   CHD1::POLK CHD1 POLK [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 5q15 Gene [GDB]   CHD1::RGMB CHD1 RGMB [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 3p22 Gene [GDB]   CHD1::RPSA CHD1 RPSA [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 1q21 Gene [GDB]   S100A2::CHD1 CHD1 S100A2 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 4p16 Gene [GDB]   S100P::CHD1 CHD1 S100P [Cosmic]
    [FusionGDB]  
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    chr5:98853986-98929007 - 5q15 1p35 Gene [GDB]   SDC3::CHD1 CHD1 SDC3 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 11q12 Gene [GDB]   SERPING1::CHD1 CHD1 SERPING1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
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    chr5:98853986-98929007 - 5q15 8p21 Gene [GDB]   SFTPC::CHD1 CHD1 SFTPC [Cosmic]
    [FusionGDB]  
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    chr5:98853986-98929007 - 5q15 5q21 Gene [GDB]   CHD1::SLCO6A1 CHD1 SLCO6A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 19q13 Gene [TF]   CAPNS1::CHD1 CHD1 CAPNS1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 16p11 Gene [TF]   FUS::CHD1 CHD1 FUS [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 Xp22 Gene [TF]   GPM6B::CHD1 CHD1 GPM6B [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LGG]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr5:98853986-98929007 - 5q15 1p36 Gene [TF]   CHD1::MTOR CHD1 MTOR [Cosmic]
    [TCGA]
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    chr5:98853986-98929007 - 5q15 4p16 Gene [TF]   S100P::CHD1 CHD1 S100P [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]

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    Gene Expression (MSigDB) in 5q15  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

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  • Genes list (tabulated txt file)
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  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
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    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedoct. 2021Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 5q15. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/5q15.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. oct. 11 15:18:47 CEST 2021


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