Chromosome 6

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 6


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Band 6q11

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  • Chromosomal abnormalities in band 6q11
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    Chromosomal abnormalities in band 6q11

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    6q11 Mitelmandel(6)(q11)  Mitelman (CGAP)BreastAdenocarcinoma  
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    6q11 Mitelmandel(6)(q11)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    6q11 Mitelmandel(6)(q11)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    6q11 Mitelmandel(6)(q11)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    6q11 Mitelmandel(6)(q11)  Mitelman (CGAP)PleuraMesothelioma  
    6q11 Mitelmandel(6)(q11)  Mitelman (CGAP)SkeletonOsteosarcoma, NOS  
    6q11 Mitelmandel(6)(q11)  Mitelman (CGAP)Soft tissueLeiomyosarcoma  
    6q11 Mitelmandel(6)(q11)  Mitelman (CGAP)Uterus, corpusLeiomyosarcoma  
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    6q116q27Cosmic_SVu(6)(q11;q27)  Cosmic_SV [COST349731]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q116q27Cosmic_SVu(6)(q11;q27)  Cosmic_SV [COST370883]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q116q27Cosmic_SVu(6)(q11;q27)  Cosmic_SV [COST391839]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q11Xp22Cosmic_SVu(6;X)(q11;p22)  Cosmic_SV [COST349368]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q11Xq12Cosmic_SVu(6;X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST229849]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    6q11Xq12Cosmic_SVu(6;X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST358050]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q11Xq12Cosmic_SVu(6;X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST379250]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q11Xq21Cosmic_SVu(6;X)(q11;q21)  Cosmic_SV [COST146249]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9p136q11Cosmic_SVu(9;6)(p13;q11)  Cosmic_SV [COST351408]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    Xq216q11Cosmic_SVu(X;6)(q21;q11)  Cosmic_SV [COST146157]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]

    Genes in band 6q11

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg19 (Kb)Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr6:62284008-62284534 + 6q11   Gene [G]     MTRNR2L9       [Omim] [Entrez]
    chr6:62284008-62284534 + 6q11   Gene [NOR]   RNA28S5/MTRNR2L9 MTRNR2L9 RNA28S5 heart Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:62284008-62284534 + 6q11   Gene [NOR]   RNA28S5/MTRNR2L9 MTRNR2L9 RNA28S5 ovary Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:62389865-62996132 - 6q11 6q13 Gene [G]   KHDRBS2/LMBRD1 KHDRBS2 LMBRD1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:62389865-62996132 - 6q11 15q25 Gene [M]   EFL1/KHDRBS2 KHDRBS2 EFL1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:62389865-62996132 - 6q11 6q13 Gene [M]   KHDRBS2/LMBRD1 KHDRBS2 LMBRD1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:62389865-62996132 - 6q11 15q25 Gene [TF]   EFL1/KHDRBS2 KHDRBS2 EFL1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:62389865-62996132 - 6q11 6q13 Gene [TF]   KHDRBS2/LMBRD1 KHDRBS2 LMBRD1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   6 6p 6q 6p25 6p24 6p23 6p22 6p21 6p12 6p11 6p10 6q10 6q11 6q12 6q13 6q14 6q15 6q16 6q21 6q22 6q23 6q24 6q25 6q26 6q27   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 6q11

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 6q11  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjanv. 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 6q11. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/6q11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mar. janv. 10 12:53:41 CET 2017


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