Chromosome 6

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 6


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Band 6q11

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  • Chromosomal abnormalities in band 6q11
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    Chromosomal abnormalities in band 6q11

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    chr6:61679960-62286227 - 6q11 6q13 Gene [M]   KHDRBS2/LMBRD1 KHDRBS2 LMBRD1 [Mitelman] Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:61679960-62286227 - 6q11 15q25 Gene [TF]   EFL1/KHDRBS2 KHDRBS2 EFL1 [TCGA] [TCGA-LUSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:61679960-62286227 - 6q11 6q13 Gene [TF]   KHDRBS2/LMBRD1 KHDRBS2 LMBRD1 [TCGA] [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 6q11

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 6q11  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Gene list (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updateddec. 2018Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 6q11. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/6q11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : jeu. dec. 13 11:11:40 CET 2018


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