Chromosome 6

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 6


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Band 6q12

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  • Chromosomal abnormalities in band 6q12
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    Chromosomal abnormalities in band 6q12

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    Genes in band 6q12

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
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    [Mitelman]
    Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63572012-63583588 + 6q12 17q11 Gene [TF]   ATAD5/PTP4A1 PTP4A1 ATAD5 [Cosmic]
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        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:63635802-63715522 + 6q12 6q12 Gene [CT]   PHF3/PHF3 PHF3 PHF3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:63635802-63715522 + 6q12 6q12 Gene [CT]   PHF3/PHF3 PHF3 PHF3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:63635802-63715522 + 6q12   Gene [G]     PHF3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:63635802-63715522 + 6q12 8p21 Gene [M]   PHF3/R3HCC1 PHF3 R3HCC1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63635802-63715522 + 6q12 13q12 Gene [M]   SACS/PHF3 PHF3 SACS [Cosmic]
    [Mitelman]
    Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63635802-63715522 + 6q12 6q12 Gene [PM]   PHF3/EYS PHF3 EYS [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63635802-63715522 + 6q12 6q12 Gene [TF]   PHF3/EYS PHF3 EYS [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63635802-63715522 + 6q12 8p21 Gene [TF]   PHF3/R3HCC1 PHF3 R3HCC1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63635802-63715522 + 6q12 13q12 Gene [TF]   SACS/PHF3 PHF3 SACS [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63719980-65707225 - 6q12 4q21 Gene [CT]   EYS/SCARB2 EYS SCARB2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:63719980-65707225 - 6q12 6p22 Gene [G]   EYS/DEK EYS DEK [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:63719980-65707225 - 6q12 6q13 Gene [G]   LMBRD1/EYS EYS LMBRD1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:63719980-65707225 - 6q12 6p22 Gene [M]   EYS/DEK EYS DEK [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63719980-65707225 - 6q12 6p12 Gene [M]   DST/EYS EYS DST [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63719980-65707225 - 6q12 6p24 Gene [M]   EEF1E1/EYS EYS EEF1E1 [Cosmic]
    [Mitelman]
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    chr6:68055351-68060502 + 6q12   Gene [G]     LOC102723883       [Omim] [Entrez]
    chr6:68226970-68329899 - 6q12   Gene [G]     LOC101928280       [Omim] [Entrez]
    chr6:68632663-68634324 - 6q12   Gene [G]     LOC101928307       [Omim] [Entrez]
    chr6:68635740-69389511 + 6q12 17p13 Gene [CT]   ADGRB3/ALOXE3 ADGRB3 ALOXE3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:68635740-69389511 + 6q12 17p13 Gene [CT]   ADGRB3/ALOXE3 ADGRB3 ALOXE3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:68635740-69389511 + 6q12 1q21 Gene [CT]   ADGRB3/C1orf56 ADGRB3 C1orf56 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:68635740-69389511 + 6q12 7p14 Gene [CT]   ADGRB3/MTURN ADGRB3 MTURN [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:68635740-69389511 + 6q12 15q22 Gene [CT]   RORA/ADGRB3 ADGRB3 RORA [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:68635740-69389511 + 6q12 3q25 Gene [CT]   TM4SF1/ADGRB3 ADGRB3 TM4SF1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:68635740-69389511 + 6q12 3q26 Gene [CT]   ADGRB3/TNIK ADGRB3 TNIK [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chr6:68635740-69389511 + 6q12   Gene [G]     ADGRB3       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 6q12

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 6q12  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjuin 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 6q12. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/6q12.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mer. juin 7 12:24:44 CEST 2017


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