Chromosome 6

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 6


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Band 6q13

chr6:69200000-75200000 (6000 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 6q13
  • Genes in band 6q13 (reference hg38)
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  • References

    Chromosomal abnormalities in band 6q13

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Adult T-cell lymphoma/leukemia (HTLV-1+)  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)BladderTransitional cell carcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)BrainAstrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Burkitt lymphoma/leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic myeloid leukemia, t(9;22)  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)EyeMalignant melanoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)Gallbladder/Biliary systemAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)KidneyAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)Large intestineAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)LungAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Mantle cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Mature T- and NK-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)OvaryAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)PancreasAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)SkeletonOsteosarcoma, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)SkinMalignant melanoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)Soft tissueMalignant peripheral nerve sheath tumor/Triton  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)TestisCombined germ cell tumors  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)TestisTeratoma (mature and immature)  
    6q136q14Cosmic_SVdel(6)(q13q14)  Cosmic_SV [COST156780]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.2) 11048[PubMed] 
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.2) 11051[PubMed] 
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.2) 11052[PubMed] 
    6q136q14Cosmic_SVdel(6)(q13q14)  Cosmic_SV [COST227609]haematopoietic_and_lymphoid_tissue__NSlymphoid_neoplasm__adult_T_cell_lymphoma-leukaemia  
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.3) 11049[PubMed] 
    6q136q14Cosmic_SVdel(6)(q13q14)  Cosmic_SV [COST454816]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    6q136q15Cosmic_SVdel(6)(q13q15)  Cosmic_SV [COST237622]bone__NSosteosarcoma__NS  
      Mitelmandel(6)(q13q15)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q15)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
    6q136q16Cosmic_SVdel(6)(q13q16)  Cosmic_SV [COST160082]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
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    6q136q16Cosmic_SVdel(6)(q13q16)  Cosmic_SV [COST393563]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
      Mitelmandel(6)(q13q16)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q16)  Mitelman (ISB-CGC) Nodal marginal zone B-cell lymphoma  
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      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
    6q136q21dbCRIDdel(6)(q13q21)SENP6/TOP1 11062T-Cell Lymphoblastic Lymphoma[PubMed] 
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    6q136q22Cosmic_SVdel(6)(q13q22)  Cosmic_SV [COST218838]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
      Mitelmandel(6)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    6q136q23Cosmic_SVdel(6)(q13q23)  Cosmic_SV [COST466374]liver__NScarcinoma__NS [COSU322]
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      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
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      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(6)(q13q26)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q26)  Mitelman (ISB-CGC)EyeMalignant melanoma  
      Mitelmandel(6)(q13q26)  Mitelman (ISB-CGC) Mantle cell lymphoma  
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      Mitelmandel(6)(q13q27)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
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    6q136q23Cosmic_SVu(6)(q13;q23)  Cosmic_SV [COST580570]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
    6q136q23Cosmic_SVu(6)(q13;q23)  Cosmic_SV [COST758265]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU538]
    6q136q25Cosmic_SVu(6)(q13;q25)  Cosmic_SV [COST316097]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q136q25Cosmic_SVu(6)(q13;q25)  Cosmic_SV [COST339470]breast__NScarcinoma__ER-HER-positive_carcinoma [COSU652]
    6q136q25Cosmic_SVu(6)(q13;q25)  Cosmic_SV [COST369977]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q136q25Cosmic_SVu(6)(q13;q25)  Cosmic_SV [COST375493]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q136q25Cosmic_SVu(6)(q13;q25)  Cosmic_SV [COST441240]breast__NScarcinoma__HER-positive_carcinoma [COSU668]
    6q136q26Cosmic_SVu(6)(q13;q26)  Cosmic_SV [COST362603]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    6q13Xp11Cosmic_SVu(6;X)(q13;p11)  Cosmic_SV [COST563270]endometrium__NScarcinoma__carcinosarcoma-malignant_mesodermal_mixed_tumour [COSU677]
    6q13Xp11Cosmic_SVu(6;X)(q13;p11)  Cosmic_SV [COST566036]endometrium__NScarcinoma__carcinosarcoma-malignant_mesodermal_mixed_tumour [COSU677]
    6q13Xp21Cosmic_SVu(6;X)(q13;p21)  Cosmic_SV [COST318233]breast__NScarcinoma__ER-PR-HER-positive_carcinoma [COSU652]
    6q13Xq23Cosmic_SVu(6;X)(q13;q23)  Cosmic_SV [COST462570]liver__NScarcinoma__NS [COSU322]
    6q13Xq23Cosmic_SVu(6;X)(q13;q23)  Cosmic_SV [COST725342]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
    7q216q13Cosmic_SVu(7;6)(q21;q13)  Cosmic_SV [COST722767]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
    8q116q13Cosmic_SVu(8;6)(q11;q13)  Cosmic_SV [COST150304]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    8q116q13Cosmic_SVu(8;6)(q11;q13)  Cosmic_SV [COST157927]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9p226q13Cosmic_SVu(9;6)(p22;q13)  Cosmic_SV [COST114668]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    Xq236q13Cosmic_SVu(X;6)(q23;q13)  Cosmic_SV [COST744185]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]

    Genes in band 6q13

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   6 6p 6q 6p25 6p24 6p23 6p22 6p21 6p12 6p11 6q11 6q12 6q13 6q14 6q15 6q16 6q21 6q22 6q23 6q24 6q25 6q26 6q27   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 6q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 6q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatednov. 2020Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 6q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/6q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. nov. 30 10:16:40 CET 2020

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