Chromosome 6

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 6


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Band 6q13

chr6:69200000-75200000 (6000 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 6q13
  • Genes in band 6q13 (reference hg38)
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  • References

    Chromosomal abnormalities in band 6q13

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Adult T-cell lymphoma/leukemia (HTLV-1+)  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)BladderTransitional cell carcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)BrainAstrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Burkitt lymphoma/leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic myeloid leukemia, t(9;22)  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)EyeMalignant melanoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)Gallbladder/Biliary systemAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)KidneyAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)Large intestineAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)LungAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Mantle cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Mature T- and NK-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)OvaryAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)PancreasAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)SkeletonOsteosarcoma, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)SkinMalignant melanoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)Soft tissueMalignant peripheral nerve sheath tumor/Triton  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)TestisCombined germ cell tumors  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)TestisTeratoma (mature and immature)  
    6q136q14Cosmic_SVdel(6)(q13q14)  Cosmic_SV [COST156780]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.2) 11048[PubMed] 
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.2) 11051[PubMed] 
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.2) 11052[PubMed] 
    6q136q14Cosmic_SVdel(6)(q13q14)  Cosmic_SV [COST227609]haematopoietic_and_lymphoid_tissue__NSlymphoid_neoplasm__adult_T_cell_lymphoma-leukaemia  
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.3) 11049[PubMed] 
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      Mitelmandel(6)(q13q15)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q15)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
    6q136q16Cosmic_SVdel(6)(q13q16)  Cosmic_SV [COST160082]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
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      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
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      Mitelmandel(6)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
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      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
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      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(6)(q13q26)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q26)  Mitelman (ISB-CGC)EyeMalignant melanoma  
      Mitelmandel(6)(q13q26)  Mitelman (ISB-CGC) Mantle cell lymphoma  
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      Mitelmandel(6)(q13q27)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
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    Genes in band 6q13

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    [TCGA]
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    chr6:70667883-70861993 + 6q13 12p11 Gene [TF]   SMAP1::FAR2 SMAP1 FAR2 [Cosmic]
    [TCGA]
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr6:71421027-71458872 + 6q13   Gene [G]     LINC01626       [Omim] [Entrez]
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    chr6:71886703-72403143 + 6q13 1p21 Gene [GDB]   OLFM3::RIMS1 RIMS1 OLFM3 [Cosmic]
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    chr6:72622064-73198853 + 6q13 6q13 Gene [DDG]   KCNQ5::RIMS1 KCNQ5 RIMS1 [Cosmic] [GTEx_BRAIN]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72622064-73198853 + 6q13   Gene [G]     KCNQ5   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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        [Omim] [Entrez]
    chr6:72622064-73198853 + 6q13 6q13 Gene [GT]   MTO1::KCNQ5 KCNQ5 MTO1 [Cosmic]
    [GenenTech]
    DMS454__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72622064-73198853 + 6q13 2p23 Gene [TF]   KCNQ5::ALK KCNQ5 ALK [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-SKCM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72622064-73198853 + 6q13 6p12 Gene [TF]   KCNQ5::DST KCNQ5 DST [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72630495-72678558 + 6q13   Gene [G]     KCNQ5-IT1       [Omim] [Entrez]
    chr6:72630495-72678558 + 6q13 6q13 Gene [GDB]   CD109::KCNQ5-IT1 KCNQ5-IT1 CD109 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr6:72967687-72967753 - 6q13   Gene [G]     MIR4282       [Omim] [Entrez]
    chr6:73134803-73143514 - 6q13   Gene [G]     KCNQ5-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr6:73223545-73225496 - 6q13   Gene [G]     KHDC1L   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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        [Omim] [Entrez]
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    chr6:73241315-73263196 - 6q13 11q14 Gene [PC]   NDUFC2-KCTD14::KHDC1 KHDC1 NDUFC2-KCTD14 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73241315-73263196 - 6q13 17q11 Gene [TF]   KHDC1::NLK KHDC1 NLK [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr6:73353063-73354276 - 6q13 6q13 Gene [GDB]   DPPA5::KHDC3L DPPA5 KHDC3L [Cosmic]
    [FusionGDB]  
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    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
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    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 6q14 Gene [GDB]   SENP6::OOEP OOEP SENP6 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 12q14 Gene [GDB]   TAFA2::OOEP OOEP TAFA2 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13   Gene [A]     OOEP   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 1p36 Gene [PC]   RERE::OOEP OOEP RERE [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 6q13 Gene [TF]   KHDC1::OOEP OOEP KHDC1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 6q14 Gene [TF]   SENP6::OOEP OOEP SENP6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73394828-73417566 + 6q13 7p13 Gene [CT]   DDX43::NUDCD3 DDX43 NUDCD3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73394828-73417566 + 6q13   Gene [A]     DDX43   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73394828-73417566 + 6q13 7p13 Gene [GDB]   DDX43::NUDCD3 DDX43 NUDCD3 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73423711-73452297 - 6q13   Gene [G]     CGAS   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    chr6:73461737-73509236 + 6q13 6q13 Gene [GT]   CD109::MTO1 MTO1 CD109 [Cosmic]
    [GenenTech]
    UCSD-242l__Skin   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73461737-73509236 + 6q13 6q13 Gene [GT]   MTO1::KCNQ5 MTO1 KCNQ5 [Cosmic]
    [GenenTech]
    DMS454__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 12p13 Gene [CT]   APOLD1::EEF1A1 EEF1A1 APOLD1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 14q32 Gene [CT]   BTBD7::EEF1A1 EEF1A1 BTBD7 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 14q32 Gene [CT]   BTBD7::EEF1A1 EEF1A1 BTBD7 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6q22 Gene [CT]   CEP85L::EEF1A1 EEF1A1 CEP85L [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6p21 Gene [CT]   HCG25::EEF1A1 EEF1A1 HCG25 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13   Gene [CT]   HIST1H1E::EEF1A1 EEF1A1 HIST1H1E [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13   Gene [CT]   HIST1H2AM::EEF1A1 EEF1A1 HIST1H2AM [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 9p21 Gene [CT]   EEF1A1::IFT74 EEF1A1 IFT74 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 11q12 Gene [CT]   SNHG1::EEF1A1 EEF1A1 SNHG1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 1q21 Gene [CT]   EEF1A1::TPM3 EEF1A1 TPM3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13   Gene [A]     EEF1A1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 3p21 Gene [FC]   RNF123::EEF1A1 EEF1A1 RNF123 [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Chronic myelogenous leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 11q24 Gene [FC]   VWA5A::EEF1A1 EEF1A1 VWA5A [Cosmic]
    [FusCancer]  
    Chronic myelogenous leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 12p13 Gene [GDB]   APOLD1::EEF1A1 EEF1A1 APOLD1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 14q32 Gene [GDB]   BTBD7::EEF1A1 EEF1A1 BTBD7 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6q22 Gene [GDB]   CEP85L::EEF1A1 EEF1A1 CEP85L [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6p22 Gene [GDB]   H2BC9::EEF1A1 EEF1A1 H2BC9 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6p21 Gene [GDB]   HCG25::EEF1A1 EEF1A1 HCG25 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13   Gene [GDB]   HIST1H1E::EEF1A1 EEF1A1 HIST1H1E [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13   Gene [GDB]   HIST1H2AM::EEF1A1 EEF1A1 HIST1H2AM [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 9p21 Gene [GDB]   EEF1A1::IFT74 EEF1A1 IFT74 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 17q12 Gene [GDB]   LASP1::EEF1A1 EEF1A1 LASP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 17q22 Gene [GDB]   EEF1A1::MPO EEF1A1 MPO [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 2q32 Gene [GDB]   EEF1A1::PMS1 EEF1A1 PMS1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 12q13 Gene [GDB]   EEF1A1::RPL41 EEF1A1 RPL41 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 17q25 Gene [GDB]   EEF1A1::SEC14L1 EEF1A1 SEC14L1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 11q12 Gene [GDB]   SNHG1::EEF1A1 EEF1A1 SNHG1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 1q21 Gene [GDB]   EEF1A1::TPM3 EEF1A1 TPM3 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 5q35 Gene [GT]   CANX::EEF1A1 EEF1A1 CANX [Cosmic]
    [GenenTech]
    OUMS-23__Colo-Rectal   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 19p13 Gene [GT]   EEF1A1::DDX49 EEF1A1 DDX49 [Cosmic]
    [GenenTech]
    Panc05.04__Pancreas   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 8q24 Gene [GT]   EEF1A1::EXT1 EEF1A1 EXT1 [Cosmic]
    [GenenTech]
    SNU-423__Liver   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 2q24 Gene [GT]   EEF1A1::PSMD14 EEF1A1 PSMD14 [Cosmic]
    [GenenTech]
    OUMS-23__Colo-Rectal   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73593379-73653992 - 6q13 16p13 Gene [AM]   SLC17A5::NTAN1 SLC17A5 NTAN1 [Cosmic]
    [TCGA-LUSC]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73593379-73653992 - 6q13 5q22 Gene [CT]   ATG12::SLC17A5 SLC17A5 ATG12 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73593379-73653992 - 6q13   Gene [G]     SLC17A5   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73593379-73653992 - 6q13 5q22 Gene [GDB]   ATG12::SLC17A5 SLC17A5 ATG12 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73593379-73653992 - 6q13 6q13 Gene [GDB]   KHDC1::SLC17A5 SLC17A5 KHDC1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13   Gene [A]     CD109   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13 11p11 Gene [CT]   CD109::CELF1 CD109 CELF1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13 2q24 Gene [CT]   DPP4::CD109 CD109 DPP4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13 2q13 Gene [CT]   CD109::NPHP1 CD109 NPHP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13 11p11 Gene [GDB]   CD109::CELF1 CD109 CELF1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13 2q24 Gene [GDB]   DPP4::CD109 CD109 DPP4 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13 6q13 Gene [GDB]   CD109::KCNQ5-IT1 CD109 KCNQ5-IT1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13 2q13 Gene [GDB]   CD109::NPHP1 CD109 NPHP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13 6q13 Gene [GT]   CD109::MTO1 CD109 MTO1 [Cosmic]
    [GenenTech]
    UCSD-242l__Skin   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73696203-73828313 + 6q13 6q21 Gene [PC]   TRAF3IP2::CD109 CD109 TRAF3IP2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:74069451-74690727 + 6q13   Gene [G]     LOC101928516       [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 2q32 Gene [AM]   COL3A1::COL12A1 COL12A1 COL3A1 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 1q31 Gene [CT]   CFH::COL12A1 COL12A1 CFH [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 6q13 Gene [CT]   COL12A1::COL12A1 COL12A1 COL12A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 6q13 Gene [CT]   COL12A1::COL12A1 COL12A1 COL12A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 6q13 Gene [CT]   COL12A1::COL12A1 COL12A1 COL12A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 11p15 Gene [CT]   INS-IGF2::COL12A1 COL12A1 INS-IGF2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 1p36 Gene [CT]   KAZN::COL12A1 COL12A1 KAZN [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 5q12 Gene [CT]   MAST4::COL12A1 COL12A1 MAST4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 11q24 Gene [CT]   PRDM10::COL12A1 COL12A1 PRDM10 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 11q23 Gene [CT]   COL12A1::TAGLN COL12A1 TAGLN [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 16p12 Gene [CT]   COL12A1::TMC5 COL12A1 TMC5 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13   Gene [G]     COL12A1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 1q31 Gene [GDB]   CFH::COL12A1 COL12A1 CFH [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 6q13 Gene [GDB]   COL12A1::COL12A1 COL12A1 COL12A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 11p15 Gene [GDB]   INS-IGF2::COL12A1 COL12A1 INS-IGF2 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 1p36 Gene [GDB]   KAZN::COL12A1 COL12A1 KAZN [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
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    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
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    [FusionGDB]  
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    chr6:75084326-75206053 - 6q13 11q24 Gene [GDB]   PRDM10::COL12A1 COL12A1 PRDM10 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
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    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 13q21 Gene [GDB]   COL12A1::TDRD3 COL12A1 TDRD3 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 16p12 Gene [GDB]   COL12A1::TMC5 COL12A1 TMC5 [Cosmic]
    [FusionGDB]  
        [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 Xq22 Gene [H2]   COL12A1::COL4A5 COL12A1 COL4A5 [Cosmic] subungual exostosis [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 7p22 Gene [H3]   RAC1::COL12A1 COL12A1 RAC1 [Cosmic] acute myeloid leukemia;myeloid leukemia;leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75206053 - 6q13 6p22 Gene [PC]   HCG18::COL12A1 COL12A1 HCG18 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:75128709-75128782 - 6q13   Gene [G]     SNORD156       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 6q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 6q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedoct. 2021Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 6q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/6q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. oct. 11 15:19:51 CEST 2021


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