Chromosome 6

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 6


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Band 6q13

chr6:69200000-75200000 (6000 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 6q13
  • Genes in band 6q13 (reference hg38)
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  • References

    Chromosomal abnormalities in band 6q13

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Adult T-cell lymphoma/leukemia (HTLV-1+)  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)BladderTransitional cell carcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)BrainAstrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Burkitt lymphoma/leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Chronic myeloid leukemia, t(9;22)  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)EyeMalignant melanoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)Gallbladder/Biliary systemAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)KidneyAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)Large intestineAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)LungAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Mature T- and NK-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)OvaryAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)PancreasAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)SkeletonOsteosarcoma, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)SkinMalignant melanoma  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)Soft tissueMalignant peripheral nerve sheath tumor/Triton  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)TestisCombined germ cell tumors  
      Mitelmandel(6)(q13)  Mitelman (CGAP)TestisTeratoma (mature and immature)  
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    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.2) 11051[PubMed] 
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.2) 11052[PubMed] 
    6q136q14Cosmic_SVdel(6)(q13q14)  Cosmic_SV [COST227609]haematopoietic_and_lymphoid_tissue__NSlymphoid_neoplasm__adult_T_cell_lymphoma-leukaemia  
    6q136q14dbCRIDdel(6)(q13q14.3) 11049[PubMed] 
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      Mitelmandel(6)(q13q15)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q15)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
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      Mitelmandel(6)(q13q16)  Mitelman (CGAP) Nodal marginal zone B-cell lymphoma  
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      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q21)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
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      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q23)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
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      Mitelmandel(6)(q13q25)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
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      Mitelmandel(6)(q13q26)  Mitelman (CGAP)EyeMalignant melanoma  
      Mitelmandel(6)(q13q26)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
    6q136q27Cosmic_SVdel(6)(q13q27)  Cosmic_SV [COST196037]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
      Mitelmandel(6)(q13q27)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q27)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(6)(q13q27)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
      Mitelmander(21)t(6;21)(q13;p13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    6q136q27dbCRIDder(6)t(6;6)(q13;q27) 11718Chondromyxoid Fibroma[PubMed] 
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    9p226q13Cosmic_SVu(9;6)(p22;q13)  Cosmic_SV [COST114668]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
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    Genes in band 6q13

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    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr6:69675749-69797157 - 6q13 14q21 Gene [AM]   L2HGDH/LMBRD1 LMBRD1 L2HGDH [Cosmic]
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    chr6:69675749-69797157 - 6q13 12q13 Gene [CT]   SLC4A8/LMBRD1 LMBRD1 SLC4A8 [Cosmic]
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    chr6:69675749-69797157 - 6q13 20q12 Gene [H3]   LMBRD1/CHD6 LMBRD1 CHD6 [Cosmic] acute myeloid leukemia;myeloid leukemia;leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:69675749-69797157 - 6q13 6q11 Gene [M]   KHDRBS2/LMBRD1 LMBRD1 KHDRBS2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:69675749-69797157 - 6q13 14q21 Gene [M]   L2HGDH/LMBRD1 LMBRD1 L2HGDH [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:69675749-69797157 - 6q13 6q24 Gene [M]   LMBRD1/REPS1 LMBRD1 REPS1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:69675749-69797157 - 6q13 6q23 Gene [M]   STX7/LMBRD1 LMBRD1 STX7 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Eye Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:69675749-69797157 - 6q13 19q13 Gene [M]   LMBRD1/ZBTB45 LMBRD1 ZBTB45 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:69675749-69797157 - 6q13 6q12 Gene [TF]   LMBRD1/EYS LMBRD1 EYS [Cosmic]
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    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:69675749-69797157 - 6q13 6q12 Gene [TF]   LMBRD1/LGSN LMBRD1 LGSN [Cosmic]
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    chr6:69866556-70212454 + 6q13 19p13 Gene [CT]   AP3D1/COL19A1 COL19A1 AP3D1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:69866556-70212454 + 6q13 19p13 Gene [CT]   AP3D1/COL19A1 COL19A1 AP3D1 [Cosmic]
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    chr6:69866556-70212454 + 6q13   Gene [FM]   COL19A1/RP3-410C9.1 COL19A1 RP3-410C9.1 [Cosmic] breast HER2 [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:69866556-70212454 + 6q13   Gene [FM]   COL19A1/RP3-410C9.1 COL19A1 RP3-410C9.1 [Cosmic] breast TN [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:69866556-70212454 + 6q13   Gene [G]     COL19A1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:69866556-70212454 + 6q13 6q13 Gene [GDB]   COL19A1/COL19A1 COL19A1 COL19A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:70216040-70283208 - 6q13 12q15 Gene [AM]   CPSF6/COL9A1 COL9A1 CPSF6 [Cosmic]
    		     [Omim] [Entrez]
    chr6:70216040-70283208 - 6q13 2p13 Gene [CT]   ZNF638/COL9A1 COL9A1 ZNF638 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:70216040-70283208 - 6q13   Gene [G]     COL9A1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:70216040-70283208 - 6q13 13q12 Gene [M]   PARP4/COL9A1 COL9A1 PARP4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Unknown site Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70394202-70399417 + 6q13   Gene [G]     EVADR       [Omim] [Entrez]
    chr6:70412828-70413958 - 6q13   Gene [G]     LOC105377849       [Omim] [Entrez]
    chr6:70413404-70561174 + 6q13 12q13 Gene [CT]   FAM135A/NACA FAM135A NACA [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:70413404-70561174 + 6q13 12q14 Gene [FC]   FAM135A/RASSF3 FAM135A RASSF3 [Cosmic]
    [FusCancer]      		 Lung cancer|Lung cancer [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70413404-70561174 + 6q13   Gene [G]     FAM135A   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:70413404-70561174 + 6q13 6q16 Gene [M]   FAM135A/FBXL4 FAM135A FBXL4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70413404-70561174 + 6q13 6q22 Gene [M]   FAM135A/LAMA2 FAM135A LAMA2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Oesophagus Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70566922-70588903 + 6q13   Gene [G]     SDHAF4       [Omim] [Entrez]
    chr6:70566922-70588903 + 6q13 18q21 Gene [M]   CTIF/SDHAF4 SDHAF4 CTIF [Mitelman] Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70566922-70588903 + 6q13 6q14 Gene [M]   SDHAF4/SH3BGRL2 SDHAF4 SH3BGRL2 [Mitelman] Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 6q13 Gene [CT]   B3GAT2/SMAP1 SMAP1 B3GAT2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 3q26 Gene [CT]   MYNN/SMAP1 SMAP1 MYNN [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 13q13 Gene [CT]   SMAP1/NBEA SMAP1 NBEA [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 11q12 Gene [CT]   SMAP1/POLR2G SMAP1 POLR2G [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 6q13 Gene [GDB]   SMAP1/SMAP1 SMAP1 SMAP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 14q32 Gene [M]   SMAP1/C14orf132 SMAP1 C14orf132 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 6q14 Gene [M]   SMAP1/CGA SMAP1 CGA [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 17q21 Gene [M]   DCAKD/SMAP1 SMAP1 DCAKD [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 12p11 Gene [M]   SMAP1/FAR2 SMAP1 FAR2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 11q23 Gene [M]   KMT2A/SMAP1 SMAP1 KMT2A [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute myeloid leukemia, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13   Gene [A]     SMAP1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 14q32 Gene [TF]   SMAP1/C14orf132 SMAP1 C14orf132 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 6q14 Gene [TF]   SMAP1/CGA SMAP1 CGA [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 12p11 Gene [TF]   SMAP1/FAR2 SMAP1 FAR2 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-SKCM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70667771-70862013 + 6q13 6q15 Gene [TF]   RARS2/SMAP1 SMAP1 RARS2 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr6:70861366-70957085 - 6q13 6q14 Gene [M]   ZNF292/B3GAT2 B3GAT2 ZNF292 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:70861366-70957085 - 6q13 6q14 Gene [TF]   ZNF292/B3GAT2 B3GAT2 ZNF292 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:71288442-71309059 + 6q13   Gene [G]     OGFRL1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:71376960-71377031 - 6q13   Gene [G]     MIR30C2       [Omim] [Entrez]
    chr6:71403551-71403621 - 6q13   Gene [A]     MIR30A       [Omim] [Entrez]
    chr6:71407865-71420745 - 6q13   Gene [G]     LINC00472       [Omim] [Entrez]
    chr6:71421027-71458872 + 6q13   Gene [G]     LINC01626       [Omim] [Entrez]
    chr6:71886703-72403143 + 6q13 4q13 Gene [CT]   HTN3/RIMS1 RIMS1 HTN3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:71886703-72403143 + 6q13 1p21 Gene [CT]   OLFM3/RIMS1 RIMS1 OLFM3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:71886703-72403143 + 6q13 6q13 Gene [CT]   RIMS1/RIMS1 RIMS1 RIMS1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:71886703-72403143 + 6q13   Gene [G]     RIMS1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:71886703-72403143 + 6q13 6q13 Gene [GDB]   RIMS1/RIMS1 RIMS1 RIMS1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 6p12 Gene [AM]   KCNQ5/DST KCNQ5 DST [Cosmic]
    		 [TCGA-LUSC]     [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 7q31 Gene [CT]   GRM8/KCNQ5 KCNQ5 GRM8 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13   Gene [G]     KCNQ5   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 6q13 Gene [GDB]   KCNQ5/KCNQ5 KCNQ5 KCNQ5 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 6q13 Gene [GT]   MTO1/KCNQ5 KCNQ5 MTO1 [Cosmic]
    [GenenTech]    		 DMS454__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 8q24 Gene [H3]   KCNQ5/KCNQ3 KCNQ5 KCNQ3 [Cosmic] benign neonatal convulsion;rolandic epilepsy [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 2p23 Gene [M]   KCNQ5/ALK KCNQ5 ALK [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 7p14 Gene [M]   KCNQ5/AMPH KCNQ5 AMPH [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 13q12 Gene [M]   KCNQ5/CRYL1 KCNQ5 CRYL1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 6p12 Gene [M]   KCNQ5/DST KCNQ5 DST [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 11q22 Gene [M]   DYNC2H1/KCNQ5 KCNQ5 DYNC2H1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 6q14 Gene [M]   FILIP1/KCNQ5 KCNQ5 FILIP1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Eye Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 2p23 Gene [TF]   KCNQ5/ALK KCNQ5 ALK [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-SKCM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72621843-73198850 + 6q13 6p12 Gene [TF]   KCNQ5/DST KCNQ5 DST [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-LUSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:72630495-72678558 + 6q13   Gene [G]     KCNQ5-IT1       [Omim] [Entrez]
    chr6:72967687-72967753 - 6q13   Gene [G]     MIR4282       [Omim] [Entrez]
    chr6:73134803-73143514 - 6q13   Gene [G]     KCNQ5-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr6:73223545-73225452 - 6q13   Gene [G]     KHDC1L   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73241315-73263196 - 6q13 15q22 Gene [CT]   PDCD7/KHDC1 KHDC1 PDCD7 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73241315-73263196 - 6q13   Gene [G]     KHDC1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73241315-73263196 - 6q13 17q11 Gene [M]   KHDC1/NLK KHDC1 NLK [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73241315-73263196 - 6q13 17q11 Gene [TF]   KHDC1/NLK KHDC1 NLK [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73241315-73263196 - 6q13 6q13 Gene [TF]   KHDC1/OOEP KHDC1 OOEP [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73353062-73354276 - 6q13   Gene [G]     DPPA5   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73362677-73364175 + 6q13   Gene [G]     KHDC3L       [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 1p36 Gene [AM]   RERE/OOEP OOEP RERE [Cosmic]
    		 [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 10q26 Gene [CT]   OOEP/EIF3A OOEP EIF3A [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13   Gene [G]     OOEP   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 11q12 Gene [M]   EEF1G/OOEP OOEP EEF1G [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 6p25 Gene [M]   EXOC2/OOEP OOEP EXOC2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 1p36 Gene [M]   RERE/OOEP OOEP RERE [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 6q14 Gene [M]   SENP6/OOEP OOEP SENP6 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 6q13 Gene [TF]   KHDC1/OOEP OOEP KHDC1 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73368557-73369792 - 6q13 6q14 Gene [TF]   SENP6/OOEP OOEP SENP6 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73394562-73417566 + 6q13 7p13 Gene [CT]   DDX43/NUDCD3 DDX43 NUDCD3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73394562-73417566 + 6q13   Gene [A]     DDX43   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73394562-73417566 + 6q13 6q13 Gene [GDB]   DDX43/DDX43 DDX43 DDX43 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:73425133-73452320 - 6q13   Gene [G]     CGAS       [Omim] [Entrez]
    chr6:73461731-73501456 + 6q13   Gene [G]     MTO1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73461731-73501456 + 6q13 6q13 Gene [GT]   CD109/MTO1 MTO1 CD109 [Cosmic]
    [GenenTech]    		 UCSD-242l__Skin   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73461731-73501456 + 6q13 6q13 Gene [GT]   MTO1/KCNQ5 MTO1 KCNQ5 [Cosmic]
    [GenenTech]    		 DMS454__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 12p13 Gene [CT]   APOLD1/EEF1A1 EEF1A1 APOLD1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 14q32 Gene [CT]   BTBD7/EEF1A1 EEF1A1 BTBD7 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 14q32 Gene [CT]   BTBD7/EEF1A1 EEF1A1 BTBD7 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6q22 Gene [CT]   CEP85L/EEF1A1 EEF1A1 CEP85L [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6p21 Gene [CT]   HCG25/EEF1A1 EEF1A1 HCG25 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6p22 Gene [CT]   HIST1H1E/EEF1A1 EEF1A1 HIST1H1E [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6p22 Gene [CT]   HIST1H2AM/EEF1A1 EEF1A1 HIST1H2AM [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6p22 Gene [CT]   HIST1H2BH/EEF1A1 EEF1A1 HIST1H2BH [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 9p21 Gene [CT]   EEF1A1/IFT74 EEF1A1 IFT74 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 17q12 Gene [CT]   LASP1/EEF1A1 EEF1A1 LASP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 2q32 Gene [CT]   EEF1A1/PMS1 EEF1A1 PMS1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 12p13 Gene [CT]   EEF1A1/PRH1-PRR4 EEF1A1 PRH1-PRR4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 12q13 Gene [CT]   EEF1A1/RPL41 EEF1A1 RPL41 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 17q25 Gene [CT]   EEF1A1/SEC14L1 EEF1A1 SEC14L1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 11q12 Gene [CT]   SNHG1/EEF1A1 EEF1A1 SNHG1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 1q21 Gene [CT]   EEF1A1/TPM3 EEF1A1 TPM3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13   Gene [A]     EEF1A1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 3p21 Gene [FC]   RNF123/EEF1A1 EEF1A1 RNF123 [Cosmic]
    [FusCancer]      		 Chronic myelogenous leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 11q24 Gene [FC]   VWA5A/EEF1A1 EEF1A1 VWA5A [Cosmic]
    [FusCancer]      		 Chronic myelogenous leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 6q13 Gene [GDB]   EEF1A1/EEF1A1 EEF1A1 EEF1A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 5q35 Gene [GT]   CANX/EEF1A1 EEF1A1 CANX [Cosmic]
    [GenenTech]    		 OUMS-23__Colo-Rectal   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 19p13 Gene [GT]   EEF1A1/DDX49 EEF1A1 DDX49 [Cosmic]
    [GenenTech]    		 Panc05.04__Pancreas   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 8q24 Gene [GT]   EEF1A1/EXT1 EEF1A1 EXT1 [Cosmic]
    [GenenTech]    		 SNU-423__Liver   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73515750-73521032 - 6q13 2q24 Gene [GT]   EEF1A1/PSMD14 EEF1A1 PSMD14 [Cosmic]
    [GenenTech]    		 OUMS-23__Colo-Rectal   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73593379-73654014 - 6q13 16p13 Gene [AM]   SLC17A5/NTAN1 SLC17A5 NTAN1 [Cosmic]
    		 [TCGA-LUSC]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73593379-73654014 - 6q13 5q22 Gene [CT]   ATG12/SLC17A5 SLC17A5 ATG12 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73593379-73654014 - 6q13   Gene [G]     SLC17A5   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73593379-73654014 - 6q13 6q13 Gene [GDB]   SLC17A5/SLC17A5 SLC17A5 SLC17A5 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:73593379-73654014 - 6q13 16p13 Gene [M]   NTAN1/SLC17A5 SLC17A5 NTAN1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:73693903-73696131 - 6q13   Gene [G]     LOC101928489       [Omim] [Entrez]
    chr6:73696085-73828317 + 6q13   Gene [A]     CD109   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:73696085-73828317 + 6q13 11p11 Gene [CT]   CD109/CELF1 CD109 CELF1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73696085-73828317 + 6q13 2q24 Gene [CT]   DPP4/CD109 CD109 DPP4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73696085-73828317 + 6q13 2q13 Gene [CT]   CD109/NPHP1 CD109 NPHP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:73696085-73828317 + 6q13 6q13 Gene [GDB]   CD109/CD109 CD109 CD109 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:73696085-73828317 + 6q13 6q13 Gene [GT]   CD109/MTO1 CD109 MTO1 [Cosmic]
    [GenenTech]    		 UCSD-242l__Skin   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:74069451-74690727 + 6q13   Gene [G]     LOC101928516       [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 2q32 Gene [AM]   COL3A1/COL12A1 COL12A1 COL3A1 [Cosmic]
    		     [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 1q31 Gene [CT]   CFH/COL12A1 COL12A1 CFH [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 6q13 Gene [CT]   COL12A1/COL12A1 COL12A1 COL12A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 6q13 Gene [CT]   COL12A1/COL12A1 COL12A1 COL12A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 6q13 Gene [CT]   COL12A1/COL12A1 COL12A1 COL12A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 11p15 Gene [CT]   INS-IGF2/COL12A1 COL12A1 INS-IGF2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 1p36 Gene [CT]   KAZN/COL12A1 COL12A1 KAZN [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 5q12 Gene [CT]   MAST4/COL12A1 COL12A1 MAST4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 11q24 Gene [CT]   PRDM10/COL12A1 COL12A1 PRDM10 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 11q23 Gene [CT]   COL12A1/TAGLN COL12A1 TAGLN [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 16p12 Gene [CT]   COL12A1/TMC5 COL12A1 TMC5 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13   Gene [G]     COL12A1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 6q13 Gene [GDB]   COL12A1/COL12A1 COL12A1 COL12A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 Xq22 Gene [H2]   COL12A1/COL4A5 COL12A1 COL4A5 [Cosmic] subungual exostosis [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 7p22 Gene [H3]   RAC1/COL12A1 COL12A1 RAC1 [Cosmic] acute myeloid leukemia;myeloid leukemia;leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 6q24 Gene [M]   COL12A1/GRM1 COL12A1 GRM1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skeleton Chondromyxoid fibroma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:75084326-75205907 - 6q13 7p22 Gene [M]   RAC1/COL12A1 COL12A1 RAC1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:75128709-75128782 - 6q13   Gene [G]     SNORD156       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   6 6p 6q 6p25 6p24 6p23 6p22 6p21 6p12 6p11 6q11 6q12 6q13 6q14 6q15 6q16 6q21 6q22 6q23 6q24 6q25 6q26 6q27   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 6q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 6q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedmai 2019Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 6q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/6q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : jeu. mai 2 10:25:44 CEST 2019

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