Chromosome 6

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 6


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Band 6q15

chr6:88000000-93100000 (5100 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 6q15
  • Genes in band 6q15
  • External links
  • References

    Chromosomal abnormalities in band 6q15

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
    6q116q15Mitelmandel(6)(q11q15)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    6q116q15Mitelmandel(6)(q11q15)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    6q126q15Mitelmandel(6)(q12q15)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    6q136q15Mitelmandel(6)(q13q15)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    6q136q15Mitelmandel(6)(q13q15)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
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    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Adult T-cell lymphoma/leukemia (HTLV-1+)  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Anaplastic large cell lymphoma, systemic type  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)BladderTransitional cell carcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)BrainAstrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)BreastAdenocarcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Burkitt lymphoma/leukemia  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Chronic myeloid leukemia, t(9;22)  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)KidneyAdenocarcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)KidneyWilms tumor  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)Large intestineAdenocarcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)LarynxSquamous cell carcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)LungAdenocarcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)LungUndifferentiated carcinoma, large cell  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Nodal marginal zone B-cell lymphoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)Oral cavitySquamous cell carcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)OvaryAdenocarcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)PancreasAdenocarcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Plasma cell leukemia  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)PleuraMesothelioma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)SkinMalignant melanoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)Soft tissueLeiomyosarcoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)Soft tissueMalignant peripheral nerve sheath tumor/Triton  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)Soft tissueSynovial sarcoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)Soft tissueUndifferentiated pleomorphic sarcoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP) Splenic marginal zone B-cell lymphoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)StomachAdenocarcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)TestisTeratoma (mature and immature)  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)TongueSquamous cell carcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)Unknown siteAdenocarcinoma  
    6q15 Mitelmandel(6)(q15)  Mitelman (CGAP)Uterus, corpusEndometrial stromal sarcoma  
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    6q156q21Mitelmandel(6)(q15q21)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    6q156q21Mitelmandel(6)(q15q21)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    6q156q21Mitelmandel(6)(q15q21)  Mitelman (CGAP) Mature T- and NK-cell neoplasm, NOS  
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    6q156q23Mitelmandel(6)(q15q23)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    6q156q23Mitelmandel(6)(q15q23)  Mitelman (CGAP) Chronic myeloid leukemia, t(9;22)  
    6q156q23Mitelmandel(6)(q15q23)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    6q156q23Mitelmandel(6)(q15q23)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    6q156q23Mitelmandel(6)(q15q23)  Mitelman (CGAP)LungAdenocarcinoma  
    6q156q23Mitelmandel(6)(q15q23)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    6q156q23Mitelmandel(6)(q15q23)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    6q156q23Mitelmandel(6)(q15q23)  Mitelman (CGAP) Nonneoplastic hematologic disorder/lesion  
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    6q156q25Mitelmandel(6)(q15q25)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    6q156q25Mitelmandel(6)(q15q25)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    6q156q25Mitelmandel(6)(q15q25)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    6q156q25Mitelmandel(6)(q15q25)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    6q156q25Mitelmandel(6)(q15q25)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    6q156q25Mitelmandel(6)(q15q25)  Mitelman (CGAP) Peripheral T-cell lymphoma, unspecified  
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    6q156q26Mitelmandel(6)(q15q26)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    6q156q27Mitelmandel(6)(q15q27)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    6q156q27Mitelmandel(6)(q15q27)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    6q156q27Mitelmandel(6)(q15q27)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia  
    4q356q15Mitelmander(4)t(4;6)(q35;q15)  Mitelman (CGAP)PleuraMesothelioma  
    3q216q15Mitelmander(6)t(3;6)(q21;q15)  Mitelman (CGAP)KidneyAdenocarcinoma  
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    Genes in band 6q15

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg19 (Kb)Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr6:88032306-88052046 + 6q15   Gene [G]     SMIM8       [Omim] [Entrez]
    chr6:88032306-88052046 + 6q15 6q25 Gene [M]   TAB2/SMIM8 SMIM8 TAB2 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:88054571-88075181 + 6q15   Gene [G]     C6orf163   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:88106840-88109459 + 6q15   Gene [G]     LINC01590       [Omim] [Entrez]
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    chr6:88117690-88174191 + 6q15   Gene [G]     CFAP206       [Omim] [Entrez]
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    chr6:88182643-88222057 + 6q15 2p16 Gene [G]   BCL11A/SLC35A1 SLC35A1 BCL11A [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:88182643-88222057 + 6q15 6q14 Gene [M]   SENP6/SLC35A1 SLC35A1 SENP6 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:88182643-88222057 + 6q15 6q14 Gene [TF]   SENP6/SLC35A1 SLC35A1 SENP6 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:88223653-88299750 - 6q15 7p15 Gene [CT]   C7orf31/RARS2 RARS2 C7orf31 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:88223653-88299750 - 6q15 5q13 Gene [CT]   MAP1B/RARS2 RARS2 MAP1B [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:88223653-88299750 - 6q15 6q15 Gene [CT]   RARS2/RARS2 RARS2 RARS2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:88223653-88299750 - 6q15 6q15 Gene [CT]   RARS2/RARS2 RARS2 RARS2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:88223653-88299750 - 6q15 6q13 Gene [G]   RARS2/SMAP1 RARS2 SMAP1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:88223653-88299750 - 6q15 6q13 Gene [TF]   RARS2/SMAP1 RARS2 SMAP1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:88299785-88377172 + 6q15 18q23 Gene [CT]   ORC3/CTDP1 ORC3 CTDP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:88299785-88377172 + 6q15 18q23 Gene [CT]   ORC3/CTDP1 ORC3 CTDP1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:88299785-88377172 + 6q15   Gene [G]     ORC3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:88384578-88411985 - 6q15 6p22 Gene [AM]   E2F3/AKIRIN2 AKIRIN2 E2F3 [Cosmic]
    [TCGA-BRCA]     [Omim] [Entrez]
    chr6:88384578-88411985 - 6q15 10q21 Gene [CT]   AKIRIN2/CTNNA3 AKIRIN2 CTNNA3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:88384578-88411985 - 6q15   Gene [G]     AKIRIN2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:88384578-88411985 - 6q15 5q11 Gene [M]   AKIRIN2/ANKRD55 AKIRIN2 ANKRD55 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:88384578-88411985 - 6q15 5q11 Gene [TF]   AKIRIN2/ANKRD55 AKIRIN2 ANKRD55 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:88494578-88621449 + 6q15 17q24 Gene [CT]   ABCA10/LOC101928911 LOC101928911 ABCA10 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:88494578-88621449 + 6q15   Gene [G]     LOC101928911       [Omim] [Entrez]
    chr6:88757507-88776550 + 6q15   Gene [G]     SPACA1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:88849585-88875767 - 6q15   Gene [G]     CNR1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:89235643-89249088 - 6q15   Gene [G]     LOC101928936       [Omim] [Entrez]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
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    chr6:89319616-89673348 - 6q15 9p13 Gene [GT]   FAM219A/RNGTT RNGTT FAM219A [Cosmic]
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    [TCGA]
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    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:90036344-90062619 - 6q15 6q15 Gene [CT]   UBE2J1/UBE2J1 UBE2J1 UBE2J1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [TCGA]
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    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:90142897-90343553 + 6q15 6q25 Gene [TF]   ANKRD6/ZDHHC14 ANKRD6 ZDHHC14 [Cosmic]
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    chr6:90348251-90399200 + 6q15   Gene [G]     LOC101929057       [Omim] [Entrez]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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        [Omim] [GenBank]
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    Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr6:90539619-90584155 + 6q15 11q23 Gene [COF]   KMT2A/CASP8AP2 CASP8AP2 KMT2A [Cosmic]
    [Fusion 2058]
    haematopoietic_and_lymphoid_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:90539619-90584155 + 6q15 14q32 Gene [CT]   CASP8AP2/IGHG1 CASP8AP2 IGHG1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
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    chr6:90539619-90584155 + 6q15 2q31 Gene [CT]   PPIG/CASP8AP2 CASP8AP2 PPIG [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:90539619-90584155 + 6q15 11q23 Gene [M]   KMT2A/CASP8AP2 CASP8AP2 KMT2A [Cosmic]
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    chr6:90604188-90605819 + 6q15   Gene [G]     GJA10   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   6 6p 6q 6p25 6p24 6p23 6p22 6p21 6p12 6p11 6p10 6q10 6q11 6q12 6q13 6q14 6q15 6q16 6q21 6q22 6q23 6q24 6q25 6q26 6q27   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 6q15

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 6q15  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjanv. 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 6q15. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/6q15.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mar. janv. 10 12:53:50 CET 2017


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