Chromosome 6

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 6


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Band 6q16

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  • Chromosomal abnormalities in band 6q16
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    Chromosomal abnormalities in band 6q16

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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    Genes in band 6q16

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg19 (Kb)Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
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    chr6:96023048-96025327 - 6q16   Gene [G]     MANEA-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr6:96025373-96057328 + 6q16   Gene [G]     MANEA   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:96463845-96663488 + 6q16 6p21 Gene [CT]   FUT9/LEMD2 FUT9 LEMD2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    chr6:96969702-97003151 + 6q16   Gene [G]     UFL1       [Omim] [Entrez]
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    chr6:97241998-97285353 - 6q16   Gene [G]     GPR63   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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        [Omim] [Entrez]
    chr6:97337187-97345767 - 6q16 Xp22 Gene [AM]   RBBP7/NDUFAF4 NDUFAF4 RBBP7 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr6:97337187-97345767 - 6q16 Xp22 Gene [AM]   RBBP7/NDUFAF4 NDUFAF4 RBBP7 [Cosmic]
        [Omim] [Entrez]
    chr6:97337187-97345767 - 6q16 17q23 Gene [CT]   NDUFAF4/CCDC47 NDUFAF4 CCDC47 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:97337187-97345767 - 6q16 11q13 Gene [CT]   CHKA/NDUFAF4 NDUFAF4 CHKA [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:97337187-97345767 - 6q16 6q16 Gene [CT]   NDUFAF4/NDUFAF4 NDUFAF4 NDUFAF4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:97337187-97345767 - 6q16   Gene [G]     NDUFAF4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    chr6:97372496-97588630 + 6q16 16q24 Gene [M]   ANKRD11/KLHL32 KLHL32 ANKRD11 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Ovary Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:97372496-97588630 + 6q16 6q23 Gene [M]   MED23/KLHL32 KLHL32 MED23 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:97372496-97588630 + 6q16 16q24 Gene [TF]   ANKRD11/KLHL32 KLHL32 ANKRD11 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-OV]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:97372496-97588630 + 6q16 6q23 Gene [TF]   MED23/KLHL32 KLHL32 MED23 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:97537843-97862283 - 6q16 9q22 Gene [CT]   ANP32B/MIR548H3 MIR548H3 ANP32B [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:97537843-97862283 - 6q16 2p13 Gene [CT]   MIR548H3/EXOC6B MIR548H3 EXOC6B [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chr6:97537843-97862283 - 6q16 15q21 Gene [CT]   MIR548H3/TCF12 MIR548H3 TCF12 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:97537843-97862283 - 6q16 11q13 Gene [G]   MALAT1/MIR548H3 MIR548H3 MALAT1     [Omim] [Entrez]
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    [ChiTaRS]  
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    [ChiTaRS]  
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    [ChiTaRS]  
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    chr6:99720793-99797531 - 6q16 6q16 Gene [CT]   FAXC/FAXC FAXC FAXC [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:99720793-99797531 - 6q16 20q13 Gene [CT]   FAXC/GNAS FAXC GNAS [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:99720793-99797531 - 6q16   Gene [G]     FAXC       [Omim] [Entrez]
    chr6:99720793-99797531 - 6q16 6q16 Gene [M]   FAXC/ASCC3 FAXC ASCC3 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:99720793-99797531 - 6q16 6q16 Gene [TF]   FAXC/ASCC3 FAXC ASCC3 [TCGA] [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:99817348-99842082 - 6q16   Gene [G]     COQ3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:99845927-99873221 - 6q16 6q16 Gene [CT]   PNISR/PNISR PNISR PNISR [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
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    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:99880184-99963252 - 6q16   Gene [G]     USP45   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:99968870-99981059 + 6q16 10p13 Gene [CT]   CUBN/TSTD3 TSTD3 CUBN [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chr6:99968870-99981059 + 6q16 12q24 Gene [CT]   UBC/TSTD3 TSTD3 UBC [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:99968870-99981059 + 6q16   Gene [G]     TSTD3       [Omim] [Entrez]
    chr6:99990263-100016690 - 6q16   Gene [G]     CCNC       [Omim] [Entrez]
    chr6:100054650-100063454 + 6q16   Gene [G]     PRDM13   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:100367786-100442099 - 6q16   Gene [G]     MCHR2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:100367786-100442099 - 6q16 6q27 Gene [M]   RPS6KA2/MCHR2 MCHR2 RPS6KA2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:100367786-100442099 - 6q16 6q27 Gene [TF]   RPS6KA2/MCHR2 MCHR2 RPS6KA2 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LGG]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:100441914-100524295 + 6q16 14q32 Gene [CT]   MCHR2-AS1/PPP4R3A MCHR2-AS1 PPP4R3A [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr6:100441914-100524295 + 6q16   Gene [G]     MCHR2-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr6:100836750-100911551 - 6q16 3p25 Gene [CT]   BRK1/SIM1 SIM1 BRK1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:100836750-100911551 - 6q16   Gene [G]     SIM1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:100836750-100911551 - 6q16 6q16 Gene [M]   SIM1/ASCC3 SIM1 ASCC3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:100836750-100911551 - 6q16 6q16 Gene [TF]   SIM1/ASCC3 SIM1 ASCC3 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 5q11 Gene [CT]   ARL15/ASCC3 ASCC3 ARL15 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16   Gene [G]     ASCC3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 14q22 Gene [M]   ASCC3/ATL1 ASCC3 ATL1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 6q16 Gene [M]   FAXC/ASCC3 ASCC3 FAXC [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 6q16 Gene [M]   ASCC3/GRIK2 ASCC3 GRIK2 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 1p34 Gene [M]   HIVEP3/ASCC3 ASCC3 HIVEP3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 15q13 Gene [M]   OTUD7A/ASCC3 ASCC3 OTUD7A [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 6p21 Gene [M]   PPP2R5D/ASCC3 ASCC3 PPP2R5D [Cosmic]
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 6q22 Gene [M]   ASCC3/SERINC1 ASCC3 SERINC1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 6q25 Gene [M]   ASCC3/SYNE1 ASCC3 SYNE1 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 14q22 Gene [TF]   ASCC3/ATL1 ASCC3 ATL1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101163007-101329248 - 6q16 6q16 Gene [TF]   FAXC/ASCC3 ASCC3 FAXC [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [TCGA]
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    [TCGA]
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    chr6:101846861-102517958 + 6q16   Gene [G]     GRIK2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:101846861-102517958 + 6q16 6q16 Gene [M]   ASCC3/GRIK2 GRIK2 ASCC3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101846861-102517958 + 6q16 17q23 Gene [M]   BCAS3/GRIK2 GRIK2 BCAS3 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101846861-102517958 + 6q16 6q22 Gene [M]   TRMT11/GRIK2 GRIK2 TRMT11 [Cosmic]
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    Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:101846861-102517958 + 6q16 6q16 Gene [TF]   ASCC3/GRIK2 GRIK2 ASCC3 [Cosmic]
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    chr6:105404923-105531207 + 6q16 6q23 Gene [M]   LIN28B/STX7 LIN28B STX7 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Diffuse large B-cell lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   6 6p 6q 6p25 6p24 6p23 6p22 6p21 6p12 6p11 6p10 6q10 6q11 6q12 6q13 6q14 6q15 6q16 6q21 6q22 6q23 6q24 6q25 6q26 6q27   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 6q16

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 6q16  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedfévr. 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 6q16. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/6q16.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mar. févr. 14 12:27:10 CET 2017


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