Chromosome 9

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 9

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Band 9q13

chr9:61500000-65000000 (3500 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 9q13
  • Genes in band 9q13 (reference hg38)
  • External links
  • References

    Chromosomal abnormalities in band 9q13

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
    9q119q13Mitelmandel(9)(q11q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST118993]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST130562]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST141992]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9q139q13dbCRIDdel(9)(q13.1q13.4)  10760Mesenchymal Hamartoma of Liver[PubMed] 
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST222498]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST450810]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Anaplastic large cell lymphoma, systemic type  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP)BreastAdenocarcinoma  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST154189]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST184000]skin__NScarcinoma__NS [COSU656]
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST184916]skin__NScarcinoma__NS [COSU656]
    9q139q22Cosmic_SVdel(9)(q13q22)  Cosmic_SV [COST159068]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute monoblastic leukemia (FAB type M5)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute promyelocytic leukemia (FAB type M3)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Adult T-cell lymphoma/leukemia (HTLV-1+)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Bilineage or biphenotypic leukemia  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Mycosis fungoides/SÚzary syndrome  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic syndrome, NOS  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
    9q139q31dbCRIDdel(9)(q13q31)  11160Myelodysplastic Syndrome[PubMed] 
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute monoblastic leukemia (FAB type M5)  
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    9q139q33Mitelmandel(9)(q13q33)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q139q33Mitelmandel(9)(q13q33)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    9q139q34Mitelmandel(9)(q13q34)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9q139q34Mitelmandel(9)(q13q34)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q1312q24Mitelmander(12)t(9;12)(q13;q24)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    9q1317p11Mitelmander(17)t(9;17)(q13;p11)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    1p369q13Mitelmander(1)t(1;9)(p36;q13)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    1q129q13Mitelmander(9)t(1;9)(q12;q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    9q13 Cosmic_SVdup(9)(q13)  Cosmic_SV [COST442852]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    9q139q13Cosmic_SVdup(9)(q13q13)  Cosmic_SV [COST126375]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q139q13Cosmic_SVdup(9)(q13q13)  Cosmic_SV [COST129503]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q139q22Cosmic_SVdup(9)(q13q22)  Cosmic_SV [COST134583]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9p119q13dbCRIDinv(9)(p11q13)  10012Psoriasis[PubMed] 
    9p119q13dbCRIDinv(9)(p11q13)  10653Isolated Growth Hormone Deficiency[PubMed] 
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Chronic myelomonocytic leukemia  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP)LungSquamous cell carcinoma  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Nonneoplastic hematologic disorder/lesion  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Bilineage or biphenotypic leukemia  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP)BreastAdenocarcinoma  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    9p139p13Cosmic_SVinv(9)(p13p13)  Cosmic_SV [COST116673]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9p139p13Cosmic_SVinv(9)(p13p13)  Cosmic_SV [COST119217]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9p139q13dbCRIDinv(9)(p13q13)  10673Hypohidrotic Ectodermal Dysplasia[PubMed] 
    1p369q13Mitelmant(1;9)(p36;q13)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    1q129q13Mitelmant(1;9)(q12;q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    8p119q13dbCRIDt(8;9)(p11.2;q13)  11732[PubMed] 
    8q249q13Mitelmant(8;9)(q24;q13)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
    8q249q13Atlas - Leukemiat(8;9)(q24;q13)  t0809q24q13ID1550NHL::B-ALL[Biblio] 
    9q1312q24Mitelmant(9;12)(q13;q24)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    9q1317p11Mitelmant(9;17)(q13;p11)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9q1321q22Mitelmant(9;21)(q13;q22)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)[PubMed] 
    16q249q13Cosmic_SVu(16;9)(q24;q13)  Cosmic_SV [COST153238]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    18q129q13Cosmic_SVu(18;9)(q12;q13)  Cosmic_SV [COST133273]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    1q219q13Cosmic_SVu(1;9)(q21;q13)  Cosmic_SV [COST446270]liver__NScarcinoma__NS [COSU322]
    7q349q13Cosmic_SVu(7;9)(q34;q13)  Cosmic_SV [COST358574]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    9q1312q23Cosmic_SVu(9;12)(q13;q23)  Cosmic_SV [COST170489]adrenal_gland__adrenal_glandadrenal_cortical_carcinoma__cortisol_and_virilizing_syndrome-producing[PubMed] 
    9q1314q11Cosmic_SVu(9;14)(q13;q11)  Cosmic_SV [COST127949]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q1315q25Cosmic_SVu(9;15)(q13;q25)  Cosmic_SV [COST379320]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    9q1318p11Cosmic_SVu(9;18)(q13;p11)  Cosmic_SV [COST216605]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    9q1318q12Cosmic_SVu(9;18)(q13;q12)  Cosmic_SV [COST238637]bone__NSosteosarcoma__NS[PubMed] 
    9q1320q13Cosmic_SVu(9;20)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST330658]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    9q1321p13Cosmic_SVu(9;21)(q13;p13)  Cosmic_SV [COST219009]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    9p219q13Cosmic_SVu(9)(p21;q13)  Cosmic_SV [COST373927]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    9q139p24Cosmic_SVu(9)(q13;p24)  Cosmic_SV [COST342660]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST134316]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU534]
    9q139q21Cosmic_SVu(9)(q13;q21)  Cosmic_SV [COST238953]bone__NSosteosarcoma__NS[PubMed] 
    9q139q21Cosmic_SVu(9)(q13;q21)  Cosmic_SV [COST341328]breast__NScarcinoma__NS [COSU652]
    9q139q21Cosmic_SVu(9)(q13;q21)  Cosmic_SV [COST457629]breast__NScarcinoma__HER-positive_carcinoma [COSU668]
    9q139q21Cosmic_SVu(9)(q13;q21)  Cosmic_SV [COST467104]breast__NScarcinoma__HER-positive_carcinoma [COSU668]
    9q139q22Cosmic_SVu(9)(q13;q22)  Cosmic_SV [COST238882]bone__NSosteosarcoma__NS[PubMed] 

    Genes in band 9q13

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    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr9:61861564-61862615 - 9q13   Gene [E]     LOC105379807       [Omim] [Entrez]
    chr9:61867082-61869138 - 9q13   Gene [G]     LOC102723709       [Omim] [Entrez]
    chr9:61982796-61986934 + 9q13   Gene [G]     LOC100132874       [Omim] [Entrez]
    chr9:62376161-62435199 + 9q13   Gene [G]     FGF7P6       [Omim] [Entrez]
    chr9:62376264-62892746 + 9q13   Gene [G]     FGF7P3       [Omim] [Entrez]
    chr9:62452490-62522018 + 9q13   Gene [G]     LINC01189       [Omim] [Entrez]
    chr9:62800841-62802639 - 9q13   Gene [G]     LOC107987020       [Omim] [Entrez]
    chr9:62801465-62813486 + 9q13   Gene [G]     LINC01410       [Omim] [Entrez]
    chr9:62834248-62838346 - 9q13   Gene [G]     LOC100132249       [Omim] [Entrez]
    chr9:62838445-62847206 + 9q13   Gene [G]     PTGER4P2-CDK2AP2P2       [Omim] [Entrez]
    chr9:62867989-62898087 - 9q13   Gene [G]     LOC403323       [Omim] [Entrez]
    chr9:62897376-62899777 + 9q13   Gene [G]     LOC728673       [Omim] [Entrez]
    chr9:63017995-63028857 + 9q13   Gene [G]     LOC101928381       [Omim] [Entrez]
    chr9:63064491-63125869 - 9q13   Gene [G]     LOC101928195       [Omim] [Entrez]
    chr9:63112403-63127100 - 9q13   Gene [G]     LOC286297       [Omim] [Entrez]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13 22q12 Gene [CT]   AQP7P1/RBFOX2 AQP7P1 RBFOX2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13 22q13 Gene [CT]   AQP7P1/TSPO AQP7P1 TSPO [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13   Gene [G]     AQP7P1       [Omim] [Entrez]
    chr9:63812941-63819029 + 9q13   Gene [G]     LINC00537       [Omim] [Entrez]
    chr9:63832050-63859634 - 9q13   Gene [G]     FRG1JP       [Omim] [Entrez]
    chr9:64016950-64061612 + 9q13 8q24 Gene [CT]   NDUFB9/FLJ43315 FLJ43315 NDUFB9 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:64016950-64061612 + 9q13   Gene [G]     FLJ43315       [Omim] [Entrez]
    chr9:64369394-64469242 + 9q13   Gene [E]     ANKRD20A4-ANKRD20A20P       [Omim] [Entrez]
    chr9:64369563-64412691 + 9q13   Gene [G]     ANKRD20A4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 9q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in 9q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]



    Writtenmay 2012Philippe Dessen
    Updatedjuin 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret


    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 9q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL :
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mer. juin 7 12:26:46 CEST 2017

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