Chromosome 9

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 9


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Band 9q13

chr9:61500000-65000000 (3500 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 9q13
  • Genes in band 9q13 (reference hg38)
  • External links
  • References

    Chromosomal abnormalities in band 9q13

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
      Mitelmandel(9)(q11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST118993]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST130562]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST141992]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9q139q13dbCRIDdel(9)(q13.1q13.4) 10760Mesenchymal Hamartoma of Liver[PubMed] 
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST222498]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST450810]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST500207]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Anaplastic large cell lymphoma, systemic type  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (ISB-CGC)BreastAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (ISB-CGC) Mantle cell lymphoma  
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST154189]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST184000]skin__NScarcinoma__NS [COSU656]
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST184916]skin__NScarcinoma__NS [COSU656]
    9q139q22Cosmic_SVdel(9)(q13q22)  Cosmic_SV [COST159068]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute monoblastic leukemia (FAB type M5)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Acute promyelocytic leukemia (FAB type M3)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Adult T-cell lymphoma/leukemia (HTLV-1+)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Bilineage or biphenotypic leukemia  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Mycosis fungoides/Sézary syndrome  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
    9q139q31dbCRIDdel(9)(q13q31) 11160Myelodysplastic Syndrome[PubMed] 
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute monoblastic leukemia (FAB type M5)  
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q33)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13q33)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(9)(q13q34)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q34)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmander(11)t(9;11)(q13;q21)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmander(12)t(9;12)(q13;q24)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmander(17)t(9;17)(q13;p11)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmander(1)t(1;9)(p36;q13)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmander(5)t(5;9)(q11;q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
      Mitelmander(9)t(1;9)(q12;q13)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
    9q13 Cosmic_SVdup(9)(q13)  Cosmic_SV [COST442852]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    9q139q13Cosmic_SVdup(9)(q13q13)  Cosmic_SV [COST126375]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q139q13Cosmic_SVdup(9)(q13q13)  Cosmic_SV [COST129503]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q139q22Cosmic_SVdup(9)(q13q22)  Cosmic_SV [COST134583]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9p119q13dbCRIDinv(9)(p11q13) 10012Psoriasis[PubMed] 
    9p119q13dbCRIDinv(9)(p11q13) 10653Isolated Growth Hormone Deficiency[PubMed] 
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic myelomonocytic leukemia  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC)LungSquamous cell carcinoma  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (ISB-CGC) Nonneoplastic hematologic disorder/lesion  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (ISB-CGC) Bilineage or biphenotypic leukemia  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (ISB-CGC)BreastAdenocarcinoma  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
    9p139p13Cosmic_SVinv(9)(p13p13)  Cosmic_SV [COST116673]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9p139p13Cosmic_SVinv(9)(p13p13)  Cosmic_SV [COST119217]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9p139q13dbCRIDinv(9)(p13q13) 10673Hypohidrotic Ectodermal Dysplasia[PubMed] 
      Mitelmant(1;9)(p36;q13)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmant(1;9)(q12;q13)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmant(5;9)(q11;q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
    8p119q13dbCRIDt(8;9)(p11.2;q13)NM_033655.3 11732[PubMed] 
      Mitelmant(8;9)(q24;q13)  Mitelman (ISB-CGC) Mantle cell lymphoma  
    8q249q13Atlas - Leukemiat(8;9)(q24;q13)  t0809q24q13ID1550NHL::B-ALL[Biblio] 
      Mitelmant(9;11)(q13;q21)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmant(9;12)(q13;q24)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmant(9;17)(q13;p11)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    10q239q13Cosmic_SVu(10;9)(q23;q13)  Cosmic_SV [COST749482]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
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    1q219q13Cosmic_SVu(1;9)(q21;q13)  Cosmic_SV [COST446270]liver__NScarcinoma__NS [COSU322]
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      Cosmic_SVu(9;)(q13;)  Cosmic_SV [COST517961]lung__NScarcinoma__adenocarcinoma  
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    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST574482]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST577122]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
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    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST727083]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST729983]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST758597]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST767010]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST770859]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
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    9q139q22Cosmic_SVu(9)(q13;q22)  Cosmic_SV [COST238882]bone__NSosteosarcoma__NS  

    Genes in band 9q13

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    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr9:61861564-61862615 - 9q13   Gene [G]     LOC105379807       [Omim] [Entrez]
    chr9:61867082-61869138 - 9q13   Gene [G]     LOC102723709       [Omim] [Entrez]
    chr9:62452490-62522018 + 9q13   Gene [G]     LINC01189       [Omim] [Entrez]
    chr9:62532562-62542812 + 9q13   Gene [G]     LOC103908604       [Omim] [Entrez]
    chr9:62801465-62813486 + 9q13   Gene [G]     LINC01410       [Omim] [Entrez]
    chr9:62834248-62838346 - 9q13   Gene [G]     LOC100132249       [Omim] [Entrez]
    chr9:62897376-62899777 + 9q13   Gene [G]     LOC728673       [Omim] [Entrez]
    chr9:63017995-63028857 + 9q13   Gene [G]     LOC101928381       [Omim] [Entrez]
    chr9:63064491-63125869 - 9q13   Gene [G]     LOC101928195       [Omim] [Entrez]
    chr9:63112403-63127100 - 9q13   Gene [G]     LOC286297       [Omim] [Entrez]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13 22q12 Gene [CT]   AQP7P1/RBFOX2 AQP7P1 RBFOX2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13 22q13 Gene [CT]   AQP7P1/TSPO AQP7P1 TSPO [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13   Gene [G]     AQP7P1       [Omim] [Entrez]
    chr9:63334538-63348186 + 9q13   Gene [E]     LOC100996643       [Omim] [Entrez]
    chr9:63812941-63819029 + 9q13   Gene [G]     LINC00537       [Omim] [Entrez]
    chr9:63832050-63859634 - 9q13   Gene [G]     FRG1JP       [Omim] [Entrez]
    chr9:64016950-64061612 + 9q13 8q24 Gene [CT]   NDUFB9/FLJ43315 FLJ43315 NDUFB9 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:64016950-64061612 + 9q13   Gene [G]     FLJ43315       [Omim] [Entrez]
    chr9:64637845-64651576 + 9q13   Gene [E]     LOC105379443       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 9q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 9q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjuin 2020Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 9q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/9q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. juin 1 14:47:57 CEST 2020


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