Chromosome X

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome X


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Band Xq11

chrX:61000000-65400000 (4400 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band Xq11
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    Chromosomal abnormalities in band Xq11

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    Xq11Xq11Cosmic_SVu(X)(q11;q11)  Cosmic_SV [COST471389]breast__NScarcinoma__HER-positive_carcinoma [COSU668]
    Xq11Xq12Cosmic_SVu(X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST28234]large_intestine__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    Xq11Xq12Cosmic_SVu(X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST314905]breast__NScarcinoma__NS [COSU652]
    Xq11Xq12Cosmic_SVu(X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST320130]breast__NScarcinoma__NS [COSU652]
    Xq11Xq12Cosmic_SVu(X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST326209]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    Xq11Xq12Cosmic_SVu(X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST354162]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    Xq11Xq12Cosmic_SVu(X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST383402]breast__NScarcinoma__NS [COSU652]
    Xq11Xq12Cosmic_SVu(X)(q11;q12)  Cosmic_SV [COST471243]breast__NScarcinoma__HER-positive_carcinoma [COSU668]
    Xq11Xq13Cosmic_SVu(X)(q11;q13)  Cosmic_SV [COST336916]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    Xq11Xq13Cosmic_SVu(X)(q11;q13)  Cosmic_SV [COST363350]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    Xq11Xq21Cosmic_SVu(X)(q11;q21)  Cosmic_SV [COST330897]breast__NScarcinoma__NS [COSU652]
    Xq11Xq21Cosmic_SVu(X)(q11;q21)  Cosmic_SV [COST337049]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]
    Xq11Xq21Cosmic_SVu(X)(q11;q21)  Cosmic_SV [COST441445]breast__NScarcinoma__HER-positive_carcinoma [COSU668]
    Xq11Xq23Cosmic_SVu(X)(q11;q23)  Cosmic_SV [COST350607]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]

    Genes in band Xq11

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chrX:63347228-63351339 - Xq11   Gene [G]     SPIN4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chrX:63426559-63560993 - Xq11 3q21 Gene [CT]   LINC01278/RAB7A LINC01278 RAB7A [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:63426559-63560993 - Xq11   Gene [G]     LINC01278       [Omim] [Entrez]
    chrX:63634968-63785546 - Xq11 21q22 Gene [CT]   ARHGEF9/DIP2A ARHGEF9 DIP2A [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chrX:63634968-63785546 - Xq11   Gene [G]     ARHGEF9   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chrX:63634968-63785546 - Xq11 21q22 Gene [GT]   PRMT2/ARHGEF9 ARHGEF9 PRMT2 [Cosmic]
    [GenenTech]
    HCC366__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:63670196-63671502 - Xq11   Gene [G]     ARHGEF9-IT1       [Omim] [Entrez]
    chrX:63786002-63786087 - Xq11   Gene [G]     MIR1468       [Omim] [Entrez]
    chrX:64185117-64205744 - Xq11   Gene [CEN]   AMER1/F AMER1 F [Cosmic]
    [Census]
    O Wilms tumour   [Omim] [Entrez]
    chrX:64185117-64205744 - Xq11 1p36 Gene [CT]   AMER1/CAMTA1 AMER1 CAMTA1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chrX:64185117-64205744 - Xq11   Gene [A]     AMER1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chrX:64224192-64230631 - Xq11   Gene [G]     ASB12   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chrX:64268081-64395453 - Xq11 Xq11 Gene [CT]   MTMR8/MTMR8 MTMR8 MTMR8 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chrX:64268081-64395453 - Xq11 Xq11 Gene [CT]   MTMR8/MTMR8 MTMR8 MTMR8 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chrX:64268081-64395453 - Xq11   Gene [G]     MTMR8   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chrX:64915802-65034744 - Xq11 22q13 Gene [CT]   ZC4H2/JOSD1 ZC4H2 JOSD1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chrX:64915802-65034744 - Xq11 8q24 Gene [CT]   RAD21/ZC4H2 ZC4H2 RAD21 [Cosmic]
    [ChiTaRS]  
        [Omim] [GenBank]
    chrX:64915802-65034744 - Xq11   Gene [G]     ZC4H2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chrX:64915802-65034744 - Xq11 20q13 Gene [M]   ZMYND8/ZC4H2 ZC4H2 ZMYND8 [Cosmic]
    [Mitelman]
    Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:64915802-65034744 - Xq11   Gene [TF]   AL109749.1/ZC4H2 ZC4H2 AL109749.1 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:64915802-65034744 - Xq11 20q13 Gene [TF]   ZMYND8/ZC4H2 ZC4H2 ZMYND8 [Cosmic]
    [TCGA]
    [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   X Xp Xq Xp22 Xp21 Xp11 Xq11 Xq12 Xq13 Xq21 Xq22 Xq23 Xq24 Xq25 Xq26 Xq27 Xq28   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint Xq11

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]

    Gene Expression (MSigDB) in Xq11  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjuin 2017Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band Xq11. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/Xq11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mer. juin 7 12:32:59 CEST 2017


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