Chromosome X

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome X


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Band Xq13

chrX:68500000-76800000 (8300 Kb)

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    Chromosomal abnormalities in band Xq13

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    Genes in band Xq13

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    chrX:71096149-71103534 + Xq13 11q23 Gene [K]   FOXO4/KMT2A FOXO4 KMT2A Acute Nonlymphoblastic Leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chrX:71096149-71103534 + Xq13 19q13 Gene [COF]   CIC/FOXO4 FOXO4 CIC [Fusion 1710] soft_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71096149-71103534 + Xq13 19q13 Gene [COF]   CIC/FOXO4 FOXO4 CIC [Fusion 1711] soft_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71096149-71103534 + Xq13 11q23 Gene [COF]   KMT2A/FOXO4 FOXO4 KMT2A [Fusion 1976] haematopoietic_and_lymphoid_tissue NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chrX:71096149-71103534 + Xq13 11q23 Gene [H2]   FOXO4/KMT2A FOXO4 KMT2A acute lymphoblastic leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chrX:71096149-71103534 + Xq13 19q13 Gene [M]   CIC/FOXO4 FOXO4 CIC [Mitelman] Soft tissue Undifferentiated round cell sarcoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chrX:71096149-71103534 + Xq13 2q36 Gene [M]   PAX3/FOXO4 FOXO4 PAX3 [Mitelman] Soft tissue Alveolar rhabdomyosarcoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chrX:71107406-71111631 - Xq13 Xq13 Gene [NOR]   IL2RG/CXorf65 IL2RG CXorf65 Lymph_node Normal tissue [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chrX:71118556-71142454 + Xq13 11q14 Gene [MA]   EED/MED12 MED12 EED   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chrX:71118556-71142454 + Xq13 7p12 Gene [MA]   IKZF1/MED12 MED12 IKZF1   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71118556-71142454 + Xq13 1p31 Gene [MA]   JAK1/MED12 MED12 JAK1   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71118556-71142454 + Xq13 17q11 Gene [MA]   NF1/MED12 MED12 NF1   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71118556-71142454 + Xq13 11p13 Gene [MA]   WT1/MED12 MED12 WT1   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71118556-71142454 + Xq13 7p15 Gene [M]   MED12/HOXA9 MED12 HOXA9 [Mitelman] Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71118556-71142454 + Xq13 11q24 Gene [M]   MED12/PRDM10 MED12 PRDM10 [Mitelman] Soft tissue Undifferentiated pleomorphic sarcoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71144831-71171201 + Xq13 Xq13 Gene [CT]   NLGN3/NLGN3 NLGN3 NLGN3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chrX:71144831-71171201 + Xq13   Gene [G]     NLGN3       [Omim] [Entrez]
    chrX:71215212-71225215 + Xq13   Gene [G]     GJB1       [Omim] [Entrez]
    chrX:71215212-71225215 + Xq13 22q12 Gene [M]   MTMR3/GJB1 GJB1 MTMR3 [Mitelman] Uterus, corpus Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71239624-71254188 - Xq13   Gene [CEN]   ZMYM3/E ZMYM3 E [Census] breast cancer yes   [Omim] [Entrez]
    chrX:71239624-71254188 - Xq13   Gene [G]     ZMYM3       [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13   Gene [AM]   IGHG1/NONO NONO IGHG1 [TCGA-LUSC]     [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13   Gene [CEN]   NONO/E NONO E [Census] papillary renal Xq13.1   [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [COF]   NONO/TFE3 NONO TFE3 [Fusion 865] kidney NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [COF]   NONO/TFE3 NONO TFE3 [Fusion 866] kidney NS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [H2]   NONO/TFE3 NONO TFE3 kidney carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [H2]   NONO/TFE3 NONO TFE3 papillaryrenalcancer   [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [H2]   TFE3/NONO NONO TFE3 papillaryrenal, alveolar soft part sarcoma   [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [L]   NONO/TFE3 NONO TFE3   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [M]   NONO/TFE3 NONO TFE3 [Mitelman] Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [M]   NONO/TFE3 NONO TFE3 [Mitelman] Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [M]   NONO/TFE3 NONO TFE3 [Mitelman] Prostate Malignant epithelial tumor, special type [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [M]   NONO/TFE3 NONO TFE3 [Mitelman] Soft tissue PEComa [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [M]   TFE3/NONO NONO TFE3 [Mitelman] Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [M]   TFE3/NONO NONO TFE3 [Mitelman] Kidney Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 2p21 Gene [M]   NONO/ZFP36L2 NONO ZFP36L2 [Mitelman] Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13   Gene [A]     NONO       [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [S]   NONO/TFE3 NONO TFE3   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [TIC]   NONO/TFE3 NONO TFE3 [TICdb]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71283192-71301171 + Xq13 Xp11 Gene [URK]   NONO/TFE3 NONO TFE3   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71301734-71305371 + Xq13   Gene [G]     ITGB1BP2       [Omim] [Entrez]
    chrX:71301734-71305371 + Xq13 Xq13 Gene [M]   TAF1/ITGB1BP2 ITGB1BP2 TAF1 [Mitelman] Uterus, cervix Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71366239-71466005 + Xq13   Gene [G]     TAF1       [Omim] [Entrez]
    chrX:71366239-71466005 + Xq13 Xq13 Gene [M]   TAF1/ITGB1BP2 TAF1 ITGB1BP2 [Mitelman] Uterus, cervix Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71366239-71466005 + Xq13 9q34 Gene [PM]   TAF1/NUP214 TAF1 NUP214   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71491681-71492449 - Xq13   Gene [A]     INGX       [Omim] [Entrez]
    chrX:71533062-71575897 + Xq13 6p21 Gene [FC]   HLA-B/OGT OGT HLA-B [FusCancer]   Burkitt lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71533062-71575897 + Xq13   Gene [G]     OGT       [Omim] [Entrez]
    chrX:71533062-71575897 + Xq13 Xp11 Gene [GT]   SLC9A7/OGT OGT SLC9A7 [GenenTech] NCI-H1975(IVCC)__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71533062-71575897 + Xq13 3q22 Gene [M]   ACPP/OGT OGT ACPP [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71533062-71575897 + Xq13 7p22 Gene [M]   OGT/ACTB OGT ACTB [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71533062-71575897 + Xq13 10q25 Gene [M]   ADD3/OGT OGT ADD3 [Mitelman] Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71533062-71575897 + Xq13 Xp22 Gene [M]   OGT/POLA1 OGT POLA1 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chrX:71714374-71718285 - Xq13   Gene [G]     CXorf49B       [Omim] [Entrez]
    chrX:71714374-71718285 - Xq13   Gene [FM]   RP11-402P6.11/CXorf49 CXorf49 RP11-402P6.11   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:71714374-71718285 - Xq13   Gene [G]     CXorf49       [Omim] [Entrez]
    chrX:71911088-72143574 + Xq13   Gene [G]     NHSL2       [Omim] [Entrez]
    chrX:72044409-72044961 + Xq13   Gene [G]     RPS26P11       [Omim] [Entrez]
    chrX:72127111-72131901 - Xq13   Gene [G]     RTL5       [Omim] [Entrez]
    chrX:72127111-72131901 - Xq13   Gene [G]     RTL5       [Omim] [Entrez]
    chrX:72144184-72161750 + Xq13 6p21 Gene [CT]   BTBD9/FLJ44635 FLJ44635 BTBD9 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72144184-72161750 + Xq13 6p21 Gene [CT]   FLJ44635/BTBD9 FLJ44635 BTBD9 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72144184-72161750 + Xq13 14q11 Gene [FC]   RBM23/FLJ44635 FLJ44635 RBM23 [FusCancer]   Lung cancer|Cervical cancer|Lung cancer|Lung cancer|Lung cancer|Lung cancer|Lung cancer|Lung cancer|Lung cancer [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:72144184-72161750 + Xq13   Gene [G]     FLJ44635       [Omim] [Entrez]
    chrX:72181676-72198344 + Xq13 7q36 Gene [CT]   PIN4/ABCF2 PIN4 ABCF2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chrX:72204655-72239047 - Xq13   Gene [G]     ERCC6L       [Omim] [Entrez]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 20q13 Gene [AM]   DIDO1/RPS4X RPS4X DIDO1 [TCGA-LUSC]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 14q24 Gene [CT]   RPS4X/AHSA1 RPS4X AHSA1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chrX:72272603-72277291 - Xq13 7q22 Gene [CT]   EPHB4/RPS4X RPS4X EPHB4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 12q24 Gene [CT]   GIT2/RPS4X RPS4X GIT2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 3p25 Gene [CT]   NUP210/RPS4X RPS4X NUP210 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 Xq13 Gene [CT]   RPS4X/RPS4X RPS4X RPS4X [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 Xq13 Gene [CT]   RPS4X/RPS4X RPS4X RPS4X [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 2p16 Gene [CT]   SPTBN1/RPS4X RPS4X SPTBN1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 2p16 Gene [CT]   SPTBN1/RPS4X RPS4X SPTBN1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 19q13 Gene [CT]   RPS4X/SUPT5H RPS4X SUPT5H [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 18q12 Gene [CT]   RPS4X/ZNF24 RPS4X ZNF24 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 1q22 Gene [FC]   MEX3A/RPS4X RPS4X MEX3A [FusCancer]   Burkitt lymphoma|Burkitt lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13   Gene [G]     RPS4X       [Omim] [Entrez]
    chrX:72272603-72277291 - Xq13 7q22 Gene [GT]   GNB2/RPS4X RPS4X GNB2 [GenenTech] C-33A__Cervix   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:72301638-72306987 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 CITED1 HDAC8 [TCGA-BRCA]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72301638-72306987 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 CITED1 HDAC8 [TCGA-CESC]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72301638-72306987 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 CITED1 HDAC8 [TCGA-COAD]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72301638-72306987 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 CITED1 HDAC8 [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72301638-72306987 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 CITED1 HDAC8 [TCGA-HNSC]     [Omim] [Entrez]
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    chrX:72301638-72306987 - Xq13 17q25 Gene [CT]   RPL38/CITED1 CITED1 RPL38 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72301638-72306987 - Xq13 17q25 Gene [CT]   RPL38/CITED1 CITED1 RPL38 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72301638-72306987 - Xq13 17q25 Gene [CT]   RPL38/CITED1 CITED1 RPL38 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72301638-72306987 - Xq13   Gene [G]     CITED1       [Omim] [Entrez]
    chrX:72301638-72306987 - Xq13 Xq13 Gene [M]   HDAC8/CITED1 CITED1 HDAC8 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-BRCA]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-CESC]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-COAD]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-GBM]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-HNSC]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-KIRC]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-LGG]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-LUAD]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-LUSC]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [AM]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [TCGA-THCA]     [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 19q13 Gene [CT]   GPI/HDAC8 HDAC8 GPI [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 1q23 Gene [CT]   HDAC8/NDUFS2 HDAC8 NDUFS2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13   Gene [G]     HDAC8       [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 16p13 Gene [GT]   AXIN1/HDAC8 HDAC8 AXIN1 [GenenTech] NCI-H889__Lung   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [M]   HDAC8/CITED1 HDAC8 CITED1 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:72329516-72573103 - Xq13 Xq13 Gene [M]   HDAC8/PHKA1 HDAC8 PHKA1 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:72578814-72714181 - Xq13 1q23 Gene [CT]   PHKA1/OLFML2B PHKA1 OLFML2B [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72578814-72714181 - Xq13 Xq13 Gene [CT]   PHKA1/PHKA1 PHKA1 PHKA1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:72578814-72714181 - Xq13   Gene [G]     PHKA1       [Omim] [Entrez]
    chrX:72578814-72714181 - Xq13 Xq13 Gene [M]   HDAC8/PHKA1 PHKA1 HDAC8 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:72688949-72712348 + Xq13   Gene [G]     PHKA1-AS1       [Omim] [Entrez]
    chrX:72777073-72779095 + Xq13   Gene [G]     FAM226B       [Omim] [Entrez]
    chrX:72781865-72782660 - Xq13   Gene [G]     FAM236A       [Omim] [Entrez]
    chrX:72781865-72782660 - Xq13   Gene [G]     FAM236B       [Omim] [Entrez]
    chrX:72807425-72808210 - Xq13   Gene [G]     FAM236C       [Omim] [Entrez]
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    chrX:72845042-72848802 + Xq13   Gene [G]     DMRTC1B       [Omim] [Entrez]
    chrX:72845042-72848802 + Xq13   Gene [G]     DMRTC1       [Omim] [Entrez]
    chrX:72998388-73002856 - Xq13   Gene [G]     PABPC1L2B-AS1       [Omim] [Entrez]
    chrX:73003513-73005712 + Xq13   Gene [G]     PABPC1L2B       [Omim] [Entrez]
    chrX:73077338-73079512 - Xq13   Gene [G]     PABPC1L2A       [Omim] [Entrez]
    chrX:73126037-73128080 - Xq13   Gene [G]     NAP1L6       [Omim] [Entrez]
    chrX:73212301-73214874 - Xq13   Gene [G]     NAP1L2       [Omim] [Entrez]
    chrX:73447254-73454585 + Xq13   Gene [G]     CDX4       [Omim] [Entrez]
    chrX:73447254-73454585 + Xq13 Xq13 Gene [M]   CHIC1/CDX4 CDX4 CHIC1 [Mitelman] Uterus, corpus Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:73524275-73563085 - Xq13   Gene [G]     MAP2K4P1       [Omim] [Entrez]
    chrX:73563148-73687109 + Xq13 19q13 Gene [CT]   CHIC1/ZNF350-AS1 CHIC1 ZNF350-AS1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73563148-73687109 + Xq13   Gene [G]     CHIC1       [Omim] [Entrez]
    chrX:73563148-73687109 + Xq13 Xq13 Gene [M]   CHIC1/CDX4 CHIC1 CDX4 [Mitelman] Uterus, corpus Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:73792205-73829231 + Xq13 16p13 Gene [CT]   TSIX/DECR2 TSIX DECR2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73792205-73829231 + Xq13 13q14 Gene [CT]   ELF1/TSIX TSIX ELF1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73792205-73829231 + Xq13 7p15 Gene [CT]   GPNMB/TSIX TSIX GPNMB [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
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    chrX:73792205-73829231 + Xq13   Gene [CT]   ND6/TSIX TSIX ND6 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73792205-73829231 + Xq13 1q23 Gene [CT]   TSIX/TOMM40L TSIX TOMM40L [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73792205-73829231 + Xq13 Xq13 Gene [CT]   TSIX/TSIX TSIX TSIX [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73792205-73829231 + Xq13   Gene [G]     TSIX       [Omim] [Entrez]
    chrX:73820651-73852753 - Xq13 2q14 Gene [CT]   ACTR3/XIST XIST ACTR3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73820651-73852753 - Xq13 3q23 Gene [CT]   XIST/COPB2 XIST COPB2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73820651-73852753 - Xq13 11q13 Gene [CT]   XIST/MALAT1 XIST MALAT1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73820651-73852753 - Xq13   Gene [CT]   RNR2/XIST XIST RNR2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73820651-73852753 - Xq13 20q13 Gene [CT]   RPS21/XIST XIST RPS21 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73820651-73852753 - Xq13 7p22 Gene [CT]   SDK1/XIST XIST SDK1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73820651-73852753 - Xq13 1q21 Gene [CT]   SPRR1B/XIST XIST SPRR1B [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73820651-73852753 - Xq13   Gene [G]     XIST       [Omim] [Entrez]
    chrX:73944324-74070382 + Xq13   Gene []     JPX       [Omim] [Entrez]
    chrX:73944324-74070382 + Xq13 7q22 Gene [CT]   JPX/ATXN7L1 JPX ATXN7L1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73944324-74070382 + Xq13 10q23 Gene [CT]   JPX/GHITM JPX GHITM [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73944324-74070382 + Xq13 6p25 Gene [CT]   JPX/SERPINB1 JPX SERPINB1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:73944324-74070382 + Xq13 13q12 Gene [CT]   JPX/USP12 JPX USP12 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74028136-74293574 - Xq13 17q21 Gene [CT]   FTX/ARL17A FTX ARL17A [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74028136-74293574 - Xq13 20q11 Gene [CT]   ASXL1/FTX FTX ASXL1 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74028136-74293574 - Xq13 3p12 Gene [CT]   CADM2/FTX FTX CADM2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74028136-74293574 - Xq13 7q36 Gene [CT]   DNAJB6/FTX FTX DNAJB6 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74028136-74293574 - Xq13 Xq13 Gene [CT]   FTX/FTX FTX FTX [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74028136-74293574 - Xq13 17p13 Gene [CT]   FTX/PITPNA FTX PITPNA [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74028136-74293574 - Xq13 11q12 Gene [CT]   TKFC/FTX FTX TKFC [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74028136-74293574 - Xq13   Gene [G]     FTX       [Omim] [Entrez]
    chrX:74218377-74218461 - Xq13   Gene [G]     MIR421       [Omim] [Entrez]
    chrX:74218547-74218618 - Xq13   Gene [G]     MIR374B       [Omim] [Entrez]
    chrX:74218549-74218618 + Xq13   Gene [G]     MIR374C       [Omim] [Entrez]
    chrX:74287104-74287209 - Xq13   Gene [G]     MIR545       [Omim] [Entrez]
    chrX:74287286-74287357 - Xq13   Gene [G]     MIR374A       [Omim] [Entrez]
    chrX:74304190-74305034 + Xq13   Gene [G]     ZCCHC13       [Omim] [Entrez]
    chrX:74421493-74533929 + Xq13 8q24 Gene [CT]   SLC16A2/ZNF16 SLC16A2 ZNF16 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74421493-74533929 + Xq13   Gene [G]     SLC16A2       [Omim] [Entrez]
    chrX:74421493-74533929 + Xq13 Xq13 Gene [H2]   SLC16A2/SLC16A2 SLC16A2 SLC16A2 AHDS disease [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:74421493-74533929 + Xq13 Xq13 Gene [H2]   SLC16A2/SLC16A2 SLC16A2 SLC16A2 AHDS disease [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:74421493-74533929 + Xq13 4p14 Gene [M]   KLHL5/SLC16A2 SLC16A2 KLHL5 [Mitelman] Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:74421493-74533929 + Xq13 4p14 Gene [TF]   KLHL5/SLC16A2 SLC16A2 KLHL5 [TCGA] [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:74582976-74614626 - Xq13 8q24 Gene [CT]   RLIM/LRRC24 RLIM LRRC24 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74582976-74614626 - Xq13   Gene [CT]   RLIM/ND6 RLIM ND6 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:74582976-74614626 - Xq13   Gene [G]     RLIM       [Omim] [Entrez]
    chrX:74582976-74614626 - Xq13 2q32 Gene [M]   TMEFF2/RLIM RLIM TMEFF2 [Mitelman] Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:74732856-74925452 - Xq13   Gene [G]     NEXMIF       [Omim] [Entrez]
    chrX:75051049-75156283 - Xq13 11p14 Gene [CT]   LUZP2/ABCB7 ABCB7 LUZP2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:75051049-75156283 - Xq13   Gene [G]     ABCB7       [Omim] [Entrez]
    chrX:75051049-75156283 - Xq13 Xq21 Gene [M]   ATRX/ABCB7 ABCB7 ATRX [Mitelman] Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:75051049-75156283 - Xq13 Xq21 Gene [M]   CHM/ABCB7 ABCB7 CHM [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:75051049-75156283 - Xq13 Xq21 Gene [TF]   CHM/ABCB7 ABCB7 CHM [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:75274059-75304897 + Xq13   Gene [G]     UPRT       [Omim] [Entrez]
    chrX:75274059-75304897 + Xq13 16q12 Gene [H2]   NOD2/UPRT UPRT NOD2 syngeneic lymphoma ,mammary carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:75274059-75304897 + Xq13 2q33 Gene [PM]   CTLA4/UPRT UPRT CTLA4   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:75274059-75304897 + Xq13 2q33 Gene [PM]   CTLA4/UPRT UPRT CTLA4   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chrX:75368427-75523502 - Xq13 12q24 Gene [CT]   ZDHHC15/PLBD2 ZDHHC15 PLBD2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:75368427-75523502 - Xq13   Gene [G]     ZDHHC15       [Omim] [Entrez]
    chrX:75740538-75743079 - Xq13   Gene [G]     TTC3P1       [Omim] [Entrez]
    chrX:75782988-75785244 - Xq13   Gene [G]     MAGEE2       [Omim] [Entrez]
    chrX:76172929-76178310 + Xq13 12q24 Gene [CT]   PBDC1/MED13L PBDC1 MED13L [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chrX:76172929-76178310 + Xq13   Gene [G]     PBDC1       [Omim] [Entrez]
    chrX:76427653-76431353 + Xq13   Gene [G]     MAGEE1       [Omim] [Entrez]
    chrX:76657798-77014532 - Xq13   Gene [G]     MIR325HG       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint Xq13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in Xq13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Gene list (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updateddec. 2018Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band Xq13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/Xq13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. dec. 10 09:46:36 CET 2018


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