Chromosome Y

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome Y


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Band Yq11

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  • Genes in band Yq11 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band Yq11

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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    Yq1112q24Atlas - Leukemiat(Y;12)(q11;q24) KDM2B/UTYKDM2BUTYTL_tY12q11q24ID2860[Biblio] 
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    Yq11Yq11Atlas - Solid Tumort(Y;Y)(q11;q11) NLGN4Y/TXLNGYNLGN4YTXLNGYTT_t0Y0Yq11q11ID108795Lung, Heart, Skin, Other: Skin[Biblio] 
    Yq11Yq11Atlas - Solid Tumort(Y;Y)(q11;q11) TTTY15/USP9YTTTY15USP9YTT_t0Y0Yq11q11ID108796Male organs: Prostate[Biblio] 
    Yq11Yq11Atlas - Solid Tumort(Y;Y)(q11;q11) USP9Y/TTTY15USP9YTTTY15TT_t0Y0Yq11q11ID108797Male organs: Prostate[Biblio] 
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    Yq11Xp22Cosmic_SVu(Y;X)(q11;p22)  Cosmic_SV [COST766592]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
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    Genes in band Yq11

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   Y Yp Yq Yp11 Yq11 Yq12   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint Yq11

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in Yq11  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatednov. 2020Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band Yq11. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/Yq11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. nov. 30 10:29:49 CET 2020

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