Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumours   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

BACE1 (beta-site APP-cleaving enzyme 1)

Identity

Alias_namesBACE
beta-site APP-cleaving enzyme
beta-site APP-cleaving enzyme 1
Other aliasASP2
HSPC104
HGNC (Hugo) BACE1
LocusID (NCBI) 23621
Atlas_Id 54008
Location 11q23.3  [Link to chromosome band 11q23]
Location_base_pair Starts at 117156402 and ends at 117166386 bp from pter ( according to hg19-Feb_2009)

Note

Non-annotated gene. Preliminary data : if you are an author
who wish to write a full paper/card on this gene, go to  How to contribute

DNA/RNA

 


External links

Nomenclature
HGNC (Hugo)BACE1   933
Cards
Entrez_Gene (NCBI)BACE1  23621  beta-site APP-cleaving enzyme 1
AliasesASP2; BACE; HSPC104
GeneCards (Weizmann)BACE1
Ensembl hg19 (Hinxton)ENSG00000186318 [Gene_View]  chr11:117156402-117166386 [Contig_View]  BACE1 [Vega]
Ensembl hg38 (Hinxton)ENSG00000186318 [Gene_View]  chr11:117156402-117166386 [Contig_View]  BACE1 [Vega]
ICGC DataPortalENSG00000186318
TCGA cBioPortalBACE1
AceView (NCBI)BACE1
Genatlas (Paris)BACE1
WikiGenes23621
SOURCE (Princeton)BACE1
Genetics Home Reference (NIH)BACE1
Genomic and cartography
GoldenPath hg19 (UCSC)BACE1  -     chr11:117156402-117166386 -  11q23.3   [Description]    (hg19-Feb_2009)
GoldenPath hg38 (UCSC)BACE1  -     11q23.3   [Description]    (hg38-Dec_2013)
EnsemblBACE1 - 11q23.3 [CytoView hg19]  BACE1 - 11q23.3 [CytoView hg38]
Mapping of homologs : NCBIBACE1 [Mapview hg19]  BACE1 [Mapview hg38]
OMIM604252   
Gene and transcription
Genbank (Entrez)AB032975 AB050436 AB050437 AB050438 AB089958
RefSeq transcript (Entrez)NM_001207048 NM_001207049 NM_012104 NM_138971 NM_138972 NM_138973
RefSeq genomic (Entrez)NC_000011 NC_018922 NG_029372 NT_033899 NW_004929381
Consensus coding sequences : CCDS (NCBI)BACE1
Cluster EST : UnigeneHs.504003 [ NCBI ]
CGAP (NCI)Hs.504003
Alternative Splicing GalleryENSG00000186318
Gene ExpressionBACE1 [ NCBI-GEO ]   BACE1 [ EBI - ARRAY_EXPRESS ]   BACE1 [ SEEK ]   BACE1 [ MEM ]
Gene Expression Viewer (FireBrowse)BACE1 [ Firebrowse - Broad ]
SOURCE (Princeton)Expression in : [Datasets]   [Normal Tissue Atlas]  [carcinoma Classsification]  [NCI60]
GenevisibleExpression in : [tissues]  [cell-lines]  [cancer]  [perturbations]  
BioGPS (Tissue expression)23621
GTEX Portal (Tissue expression)BACE1
Protein : pattern, domain, 3D structure
UniProt/SwissProtP56817   [function]  [subcellular_location]  [family_and_domains]  [pathology_and_biotech]  [ptm_processing]  [expression]  [interaction]
NextProtP56817  [Sequence]  [Exons]  [Medical]  [Publications]
With graphics : InterProP56817
Splice isoforms : SwissVarP56817
Catalytic activity : Enzyme3.4.23.46 [ Enzyme-Expasy ]   3.4.23.463.4.23.46 [ IntEnz-EBI ]   3.4.23.46 [ BRENDA ]   3.4.23.46 [ KEGG ]   
PhosPhoSitePlusP56817
Domaine pattern : Prosite (Expaxy)ASP_PROTEASE (PS00141)    PEPTIDASE_A1 (PS51767)   
Domains : Interpro (EBI)Aspartic_peptidase_A1    Aspartic_peptidase_AS    BACE    BACE1    Peptidase_aspartic_dom   
Domain families : Pfam (Sanger)
Domain families : Pfam (NCBI)
Conserved Domain (NCBI)BACE1
DMDM Disease mutations23621
Blocks (Seattle)BACE1
PDB (SRS)1FKN    1M4H    1PY1    1SGZ    1TQF    1UJJ    1UJK    1W50    1W51    1XN2    1XN3    1XS7    1YM2    1YM4    2B8L    2B8V    2F3E    2F3F    2FDP    2G94    2HIZ    2HM1    2IQG    2IRZ    2IS0    2NTR    2OAH    2OF0    2OHK    2OHL    2OHM    2OHN    2OHP    2OHQ    2OHR    2OHS    2OHT    2OHU    2P4J    2P83    2P8H    2PH6    2PH8    2Q11    2Q15    2QK5    2QMD    2QMF    2QMG    2QP8    2QU2    2QU3    2QZK    2QZL    2VA5    2VA6    2VA7    2VIE    2VIJ    2VIY    2VIZ    2VJ6    2VJ7    2VJ9    2VKM    2VNM    2VNN    2WEZ    2WF0    2WF1    2WF2    2WF3    2WF4    2WJO    2XFI    2XFJ    2XFK    2ZDZ    2ZE1    2ZHR    2ZHS    2ZHT    2ZHU    2ZHV    2ZJH    2ZJI    2ZJJ    2ZJK    2ZJL    2ZJM    2ZJN    3BRA    3BUF    3BUG    3BUH    3CIB    3CIC    3CID    3CKP    3CKR    3DM6    3DUY    3DV1    3DV5    3EXO    3FKT    3H0B    3HVG    3HW1    3I25    3IGB    3IN3    3IN4    3IND    3INE    3INF    3INH    3IVH    3IVI    3IXJ    3IXK    3K5C    3K5D    3K5F    3K5G    3KMX    3KMY    3KN0    3KYR    3L38    3L3A    3L58    3L59    3L5B    3L5C    3L5D    3L5E    3L5F    3LHG    3LNK    3LPI    3LPJ    3LPK    3MSJ    3MSK    3MSL    3N4L    3NSH    3OHF    3OHH    3OOZ    3PI5    3QBH    3QI1    3R1G    3R2F    3RSV    3RSX    3RTH    3RTM    3RTN    3RU1    3RVI    3S2O    3S7L    3S7M    3SKF    3SKG    3TPJ    3TPL    3TPP    3TPR    3U6A    3UDH    3UDJ    3UDK    3UDM    3UDN    3UDP    3UDQ    3UDR    3UDY    3UFL    3UQP    3UQR    3UQU    3UQW    3UQX    3VEU    3VF3    3VG1    3VV6    3VV7    3VV8    3WB4    3WB5    3ZMG    3ZOV    4ACU    4ACX    4AZY    4B00    4B05    4B0Q    4B1C    4B1D    4B1E    4B70    4B72    4B77    4B78    4BEK    4BFD    4D83    4D85    4D88    4D89    4D8C    4DH6    4DI2    4DJU    4DJV    4DJW    4DJX    4DJY    4DPF    4DPI    4DUS    4DV9    4DVF    4EWO    4EXG    4FCO    4FGX    4FM7    4FM8    4FRI    4FRJ    4FRK    4FRS    4FS4    4FSE    4FSL    4GID    4GMI    4H1E    4H3F    4H3G    4H3I    4H3J    4HA5    4HZT    4I0D    4I0E    4I0F    4I0G    4I0H    4I0I    4I0J    4I0Z    4I10    4I11    4I12    4I1C    4IVS    4IVT    4J0P    4J0T    4J0V    4J0Y    4J0Z    4J17    4J1C    4J1E    4J1F    4J1H    4J1I    4J1K    4JOO    4JP9    4JPC    4JPE    4K8S    4K9H    4KE0    4KE1    4L7G    4L7H    4L7J    4LC7    4LXA    4LXK    4LXM    4N00    4PZW    4PZX    4R5N    4R8Y    4R91    4R92    4R93    4R95    4RCD    4RCE    4RCF    4RRN    4RRO    4RRS    4TRW    4TRY    4TRZ    4WTU    4WY1    4WY6    4X2L    4X7I    4XKX    4XXS    4YBI    4ZPE    4ZPF    4ZPG    4ZSM    4ZSP    4ZSQ    4ZSR    5CLM   
PDB (PDBSum)1FKN    1M4H    1PY1    1SGZ    1TQF    1UJJ    1UJK    1W50    1W51    1XN2    1XN3    1XS7    1YM2    1YM4    2B8L    2B8V    2F3E    2F3F    2FDP    2G94    2HIZ    2HM1    2IQG    2IRZ    2IS0    2NTR    2OAH    2OF0    2OHK    2OHL    2OHM    2OHN    2OHP    2OHQ    2OHR    2OHS    2OHT    2OHU    2P4J    2P83    2P8H    2PH6    2PH8    2Q11    2Q15    2QK5    2QMD    2QMF    2QMG    2QP8    2QU2    2QU3    2QZK    2QZL    2VA5    2VA6    2VA7    2VIE    2VIJ    2VIY    2VIZ    2VJ6    2VJ7    2VJ9    2VKM    2VNM    2VNN    2WEZ    2WF0    2WF1    2WF2    2WF3    2WF4    2WJO    2XFI    2XFJ    2XFK    2ZDZ    2ZE1    2ZHR    2ZHS    2ZHT    2ZHU    2ZHV    2ZJH    2ZJI    2ZJJ    2ZJK    2ZJL    2ZJM    2ZJN    3BRA    3BUF    3BUG    3BUH    3CIB    3CIC    3CID    3CKP    3CKR    3DM6    3DUY    3DV1    3DV5    3EXO    3FKT    3H0B    3HVG    3HW1    3I25    3IGB    3IN3    3IN4    3IND    3INE    3INF    3INH    3IVH    3IVI    3IXJ    3IXK    3K5C    3K5D    3K5F    3K5G    3KMX    3KMY    3KN0    3KYR    3L38    3L3A    3L58    3L59    3L5B    3L5C    3L5D    3L5E    3L5F    3LHG    3LNK    3LPI    3LPJ    3LPK    3MSJ    3MSK    3MSL    3N4L    3NSH    3OHF    3OHH    3OOZ    3PI5    3QBH    3QI1    3R1G    3R2F    3RSV    3RSX    3RTH    3RTM    3RTN    3RU1    3RVI    3S2O    3S7L    3S7M    3SKF    3SKG    3TPJ    3TPL    3TPP    3TPR    3U6A    3UDH    3UDJ    3UDK    3UDM    3UDN    3UDP    3UDQ    3UDR    3UDY    3UFL    3UQP    3UQR    3UQU    3UQW    3UQX    3VEU    3VF3    3VG1    3VV6    3VV7    3VV8    3WB4    3WB5    3ZMG    3ZOV    4ACU    4ACX    4AZY    4B00    4B05    4B0Q    4B1C    4B1D    4B1E    4B70    4B72    4B77    4B78    4BEK    4BFD    4D83    4D85    4D88    4D89    4D8C    4DH6    4DI2    4DJU    4DJV    4DJW    4DJX    4DJY    4DPF    4DPI    4DUS    4DV9    4DVF    4EWO    4EXG    4FCO    4FGX    4FM7    4FM8    4FRI    4FRJ    4FRK    4FRS    4FS4    4FSE    4FSL    4GID    4GMI    4H1E    4H3F    4H3G    4H3I    4H3J    4HA5    4HZT    4I0D    4I0E    4I0F    4I0G    4I0H    4I0I    4I0J    4I0Z    4I10    4I11    4I12    4I1C    4IVS    4IVT    4J0P    4J0T    4J0V    4J0Y    4J0Z    4J17    4J1C    4J1E    4J1F    4J1H    4J1I    4J1K    4JOO    4JP9    4JPC    4JPE    4K8S    4K9H    4KE0    4KE1    4L7G    4L7H    4L7J    4LC7    4LXA    4LXK    4LXM    4N00    4PZW    4PZX    4R5N    4R8Y    4R91    4R92    4R93    4R95    4RCD    4RCE    4RCF    4RRN    4RRO    4RRS    4TRW    4TRY    4TRZ    4WTU    4WY1    4WY6    4X2L    4X7I    4XKX    4XXS    4YBI    4ZPE    4ZPF    4ZPG    4ZSM    4ZSP    4ZSQ    4ZSR    5CLM   
PDB (IMB)1FKN    1M4H    1PY1    1SGZ    1TQF    1UJJ    1UJK    1W50    1W51    1XN2    1XN3    1XS7    1YM2    1YM4    2B8L    2B8V    2F3E    2F3F    2FDP    2G94    2HIZ    2HM1    2IQG    2IRZ    2IS0    2NTR    2OAH    2OF0    2OHK    2OHL    2OHM    2OHN    2OHP    2OHQ    2OHR    2OHS    2OHT    2OHU    2P4J    2P83    2P8H    2PH6    2PH8    2Q11    2Q15    2QK5    2QMD    2QMF    2QMG    2QP8    2QU2    2QU3    2QZK    2QZL    2VA5    2VA6    2VA7    2VIE    2VIJ    2VIY    2VIZ    2VJ6    2VJ7    2VJ9    2VKM    2VNM    2VNN    2WEZ    2WF0    2WF1    2WF2    2WF3    2WF4    2WJO    2XFI    2XFJ    2XFK    2ZDZ    2ZE1    2ZHR    2ZHS    2ZHT    2ZHU    2ZHV    2ZJH    2ZJI    2ZJJ    2ZJK    2ZJL    2ZJM    2ZJN    3BRA    3BUF    3BUG    3BUH    3CIB    3CIC    3CID    3CKP    3CKR    3DM6    3DUY    3DV1    3DV5    3EXO    3FKT    3H0B    3HVG    3HW1    3I25    3IGB    3IN3    3IN4    3IND    3INE    3INF    3INH    3IVH    3IVI    3IXJ    3IXK    3K5C    3K5D    3K5F    3K5G    3KMX    3KMY    3KN0    3KYR    3L38    3L3A    3L58    3L59    3L5B    3L5C    3L5D    3L5E    3L5F    3LHG    3LNK    3LPI    3LPJ    3LPK    3MSJ    3MSK    3MSL    3N4L    3NSH    3OHF    3OHH    3OOZ    3PI5    3QBH    3QI1    3R1G    3R2F    3RSV    3RSX    3RTH    3RTM    3RTN    3RU1    3RVI    3S2O    3S7L    3S7M    3SKF    3SKG    3TPJ    3TPL    3TPP    3TPR    3U6A    3UDH    3UDJ    3UDK    3UDM    3UDN    3UDP    3UDQ    3UDR    3UDY    3UFL    3UQP    3UQR    3UQU    3UQW    3UQX    3VEU    3VF3    3VG1    3VV6    3VV7    3VV8    3WB4    3WB5    3ZMG    3ZOV    4ACU    4ACX    4AZY    4B00    4B05    4B0Q    4B1C    4B1D    4B1E    4B70    4B72    4B77    4B78    4BEK    4BFD    4D83    4D85    4D88    4D89    4D8C    4DH6    4DI2    4DJU    4DJV    4DJW    4DJX    4DJY    4DPF    4DPI    4DUS    4DV9    4DVF    4EWO    4EXG    4FCO    4FGX    4FM7    4FM8    4FRI    4FRJ    4FRK    4FRS    4FS4    4FSE    4FSL    4GID    4GMI    4H1E    4H3F    4H3G    4H3I    4H3J    4HA5    4HZT    4I0D    4I0E    4I0F    4I0G    4I0H    4I0I    4I0J    4I0Z    4I10    4I11    4I12    4I1C    4IVS    4IVT    4J0P    4J0T    4J0V    4J0Y    4J0Z    4J17    4J1C    4J1E    4J1F    4J1H    4J1I    4J1K    4JOO    4JP9    4JPC    4JPE    4K8S    4K9H    4KE0    4KE1    4L7G    4L7H    4L7J    4LC7    4LXA    4LXK    4LXM    4N00    4PZW    4PZX    4R5N    4R8Y    4R91    4R92    4R93    4R95    4RCD    4RCE    4RCF    4RRN    4RRO    4RRS    4TRW    4TRY    4TRZ    4WTU    4WY1    4WY6    4X2L    4X7I    4XKX    4XXS    4YBI    4ZPE    4ZPF    4ZPG    4ZSM    4ZSP    4ZSQ    4ZSR    5CLM   
PDB (RSDB)1FKN    1M4H    1PY1    1SGZ    1TQF    1UJJ    1UJK    1W50    1W51    1XN2    1XN3    1XS7    1YM2    1YM4    2B8L    2B8V    2F3E    2F3F    2FDP    2G94    2HIZ    2HM1    2IQG    2IRZ    2IS0    2NTR    2OAH    2OF0    2OHK    2OHL    2OHM    2OHN    2OHP    2OHQ    2OHR    2OHS    2OHT    2OHU    2P4J    2P83    2P8H    2PH6    2PH8    2Q11    2Q15    2QK5    2QMD    2QMF    2QMG    2QP8    2QU2    2QU3    2QZK    2QZL    2VA5    2VA6    2VA7    2VIE    2VIJ    2VIY    2VIZ    2VJ6    2VJ7    2VJ9    2VKM    2VNM    2VNN    2WEZ    2WF0    2WF1    2WF2    2WF3    2WF4    2WJO    2XFI    2XFJ    2XFK    2ZDZ    2ZE1    2ZHR    2ZHS    2ZHT    2ZHU    2ZHV    2ZJH    2ZJI    2ZJJ    2ZJK    2ZJL    2ZJM    2ZJN    3BRA    3BUF    3BUG    3BUH    3CIB    3CIC    3CID    3CKP    3CKR    3DM6    3DUY    3DV1    3DV5    3EXO    3FKT    3H0B    3HVG    3HW1    3I25    3IGB    3IN3    3IN4    3IND    3INE    3INF    3INH    3IVH    3IVI    3IXJ    3IXK    3K5C    3K5D    3K5F    3K5G    3KMX    3KMY    3KN0    3KYR    3L38    3L3A    3L58    3L59    3L5B    3L5C    3L5D    3L5E    3L5F    3LHG    3LNK    3LPI    3LPJ    3LPK    3MSJ    3MSK    3MSL    3N4L    3NSH    3OHF    3OHH    3OOZ    3PI5    3QBH    3QI1    3R1G    3R2F    3RSV    3RSX    3RTH    3RTM    3RTN    3RU1    3RVI    3S2O    3S7L    3S7M    3SKF    3SKG    3TPJ    3TPL    3TPP    3TPR    3U6A    3UDH    3UDJ    3UDK    3UDM    3UDN    3UDP    3UDQ    3UDR    3UDY    3UFL    3UQP    3UQR    3UQU    3UQW    3UQX    3VEU    3VF3    3VG1    3VV6    3VV7    3VV8    3WB4    3WB5    3ZMG    3ZOV    4ACU    4ACX    4AZY    4B00    4B05    4B0Q    4B1C    4B1D    4B1E    4B70    4B72    4B77    4B78    4BEK    4BFD    4D83    4D85    4D88    4D89    4D8C    4DH6    4DI2    4DJU    4DJV    4DJW    4DJX    4DJY    4DPF    4DPI    4DUS    4DV9    4DVF    4EWO    4EXG    4FCO    4FGX    4FM7    4FM8    4FRI    4FRJ    4FRK    4FRS    4FS4    4FSE    4FSL    4GID    4GMI    4H1E    4H3F    4H3G    4H3I    4H3J    4HA5    4HZT    4I0D    4I0E    4I0F    4I0G    4I0H    4I0I    4I0J    4I0Z    4I10    4I11    4I12    4I1C    4IVS    4IVT    4J0P    4J0T    4J0V    4J0Y    4J0Z    4J17    4J1C    4J1E    4J1F    4J1H    4J1I    4J1K    4JOO    4JP9    4JPC    4JPE    4K8S    4K9H    4KE0    4KE1    4L7G    4L7H    4L7J    4LC7    4LXA    4LXK    4LXM    4N00    4PZW    4PZX    4R5N    4R8Y    4R91    4R92    4R93    4R95    4RCD    4RCE    4RCF    4RRN    4RRO    4RRS    4TRW    4TRY    4TRZ    4WTU    4WY1    4WY6    4X2L    4X7I    4XKX    4XXS    4YBI    4ZPE    4ZPF    4ZPG    4ZSM    4ZSP    4ZSQ    4ZSR    5CLM   
Structural Biology KnowledgeBase1FKN    1M4H    1PY1    1SGZ    1TQF    1UJJ    1UJK    1W50    1W51    1XN2    1XN3    1XS7    1YM2    1YM4    2B8L    2B8V    2F3E    2F3F    2FDP    2G94    2HIZ    2HM1    2IQG    2IRZ    2IS0    2NTR    2OAH    2OF0    2OHK    2OHL    2OHM    2OHN    2OHP    2OHQ    2OHR    2OHS    2OHT    2OHU    2P4J    2P83    2P8H    2PH6    2PH8    2Q11    2Q15    2QK5    2QMD    2QMF    2QMG    2QP8    2QU2    2QU3    2QZK    2QZL    2VA5    2VA6    2VA7    2VIE    2VIJ    2VIY    2VIZ    2VJ6    2VJ7    2VJ9    2VKM    2VNM    2VNN    2WEZ    2WF0    2WF1    2WF2    2WF3    2WF4    2WJO    2XFI    2XFJ    2XFK    2ZDZ    2ZE1    2ZHR    2ZHS    2ZHT    2ZHU    2ZHV    2ZJH    2ZJI    2ZJJ    2ZJK    2ZJL    2ZJM    2ZJN    3BRA    3BUF    3BUG    3BUH    3CIB    3CIC    3CID    3CKP    3CKR    3DM6    3DUY    3DV1    3DV5    3EXO    3FKT    3H0B    3HVG    3HW1    3I25    3IGB    3IN3    3IN4    3IND    3INE    3INF    3INH    3IVH    3IVI    3IXJ    3IXK    3K5C    3K5D    3K5F    3K5G    3KMX    3KMY    3KN0    3KYR    3L38    3L3A    3L58    3L59    3L5B    3L5C    3L5D    3L5E    3L5F    3LHG    3LNK    3LPI    3LPJ    3LPK    3MSJ    3MSK    3MSL    3N4L    3NSH    3OHF    3OHH    3OOZ    3PI5    3QBH    3QI1    3R1G    3R2F    3RSV    3RSX    3RTH    3RTM    3RTN    3RU1    3RVI    3S2O    3S7L    3S7M    3SKF    3SKG    3TPJ    3TPL    3TPP    3TPR    3U6A    3UDH    3UDJ    3UDK    3UDM    3UDN    3UDP    3UDQ    3UDR    3UDY    3UFL    3UQP    3UQR    3UQU    3UQW    3UQX    3VEU    3VF3    3VG1    3VV6    3VV7    3VV8    3WB4    3WB5    3ZMG    3ZOV    4ACU    4ACX    4AZY    4B00    4B05    4B0Q    4B1C    4B1D    4B1E    4B70    4B72    4B77    4B78    4BEK    4BFD    4D83    4D85    4D88    4D89    4D8C    4DH6    4DI2    4DJU    4DJV    4DJW    4DJX    4DJY    4DPF    4DPI    4DUS    4DV9    4DVF    4EWO    4EXG    4FCO    4FGX    4FM7    4FM8    4FRI    4FRJ    4FRK    4FRS    4FS4    4FSE    4FSL    4GID    4GMI    4H1E    4H3F    4H3G    4H3I    4H3J    4HA5    4HZT    4I0D    4I0E    4I0F    4I0G    4I0H    4I0I    4I0J    4I0Z    4I10    4I11    4I12    4I1C    4IVS    4IVT    4J0P    4J0T    4J0V    4J0Y    4J0Z    4J17    4J1C    4J1E    4J1F    4J1H    4J1I    4J1K    4JOO    4JP9    4JPC    4JPE    4K8S    4K9H    4KE0    4KE1    4L7G    4L7H    4L7J    4LC7    4LXA    4LXK    4LXM    4N00    4PZW    4PZX    4R5N    4R8Y    4R91    4R92    4R93    4R95    4RCD    4RCE    4RCF    4RRN    4RRO    4RRS    4TRW    4TRY    4TRZ    4WTU    4WY1    4WY6    4X2L    4X7I    4XKX    4XXS    4YBI    4ZPE    4ZPF    4ZPG    4ZSM    4ZSP    4ZSQ    4ZSR    5CLM   
SCOP (Structural Classification of Proteins)1FKN    1M4H    1PY1    1SGZ    1TQF    1UJJ    1UJK    1W50    1W51    1XN2    1XN3    1XS7    1YM2    1YM4    2B8L    2B8V    2F3E    2F3F    2FDP    2G94    2HIZ    2HM1    2IQG    2IRZ    2IS0    2NTR    2OAH    2OF0    2OHK    2OHL    2OHM    2OHN    2OHP    2OHQ    2OHR    2OHS    2OHT    2OHU    2P4J    2P83    2P8H    2PH6    2PH8    2Q11    2Q15    2QK5    2QMD    2QMF    2QMG    2QP8    2QU2    2QU3    2QZK    2QZL    2VA5    2VA6    2VA7    2VIE    2VIJ    2VIY    2VIZ    2VJ6    2VJ7    2VJ9    2VKM    2VNM    2VNN    2WEZ    2WF0    2WF1    2WF2    2WF3    2WF4    2WJO    2XFI    2XFJ    2XFK    2ZDZ    2ZE1    2ZHR    2ZHS    2ZHT    2ZHU    2ZHV    2ZJH    2ZJI    2ZJJ    2ZJK    2ZJL    2ZJM    2ZJN    3BRA    3BUF    3BUG    3BUH    3CIB    3CIC    3CID    3CKP    3CKR    3DM6    3DUY    3DV1    3DV5    3EXO    3FKT    3H0B    3HVG    3HW1    3I25    3IGB    3IN3    3IN4    3IND    3INE    3INF    3INH    3IVH    3IVI    3IXJ    3IXK    3K5C    3K5D    3K5F    3K5G    3KMX    3KMY    3KN0    3KYR    3L38    3L3A    3L58    3L59    3L5B    3L5C    3L5D    3L5E    3L5F    3LHG    3LNK    3LPI    3LPJ    3LPK    3MSJ    3MSK    3MSL    3N4L    3NSH    3OHF    3OHH    3OOZ    3PI5    3QBH    3QI1    3R1G    3R2F    3RSV    3RSX    3RTH    3RTM    3RTN    3RU1    3RVI    3S2O    3S7L    3S7M    3SKF    3SKG    3TPJ    3TPL    3TPP    3TPR    3U6A    3UDH    3UDJ    3UDK    3UDM    3UDN    3UDP    3UDQ    3UDR    3UDY    3UFL    3UQP    3UQR    3UQU    3UQW    3UQX    3VEU    3VF3    3VG1    3VV6    3VV7    3VV8    3WB4    3WB5    3ZMG    3ZOV    4ACU    4ACX    4AZY    4B00    4B05    4B0Q    4B1C    4B1D    4B1E    4B70    4B72    4B77    4B78    4BEK    4BFD    4D83    4D85    4D88    4D89    4D8C    4DH6    4DI2    4DJU    4DJV    4DJW    4DJX    4DJY    4DPF    4DPI    4DUS    4DV9    4DVF    4EWO    4EXG    4FCO    4FGX    4FM7    4FM8    4FRI    4FRJ    4FRK    4FRS    4FS4    4FSE    4FSL    4GID    4GMI    4H1E    4H3F    4H3G    4H3I    4H3J    4HA5    4HZT    4I0D    4I0E    4I0F    4I0G    4I0H    4I0I    4I0J    4I0Z    4I10    4I11    4I12    4I1C    4IVS    4IVT    4J0P    4J0T    4J0V    4J0Y    4J0Z    4J17    4J1C    4J1E    4J1F    4J1H    4J1I    4J1K    4JOO    4JP9    4JPC    4JPE    4K8S    4K9H    4KE0    4KE1    4L7G    4L7H    4L7J    4LC7    4LXA    4LXK    4LXM    4N00    4PZW    4PZX    4R5N    4R8Y    4R91    4R92    4R93    4R95    4RCD    4RCE    4RCF    4RRN    4RRO    4RRS    4TRW    4TRY    4TRZ    4WTU    4WY1    4WY6    4X2L    4X7I    4XKX    4XXS    4YBI    4ZPE    4ZPF    4ZPG    4ZSM    4ZSP    4ZSQ    4ZSR    5CLM   
CATH (Classification of proteins structures)1FKN    1M4H    1PY1    1SGZ    1TQF    1UJJ    1UJK    1W50    1W51    1XN2    1XN3    1XS7    1YM2    1YM4    2B8L    2B8V    2F3E    2F3F    2FDP    2G94    2HIZ    2HM1    2IQG    2IRZ    2IS0    2NTR    2OAH    2OF0    2OHK    2OHL    2OHM    2OHN    2OHP    2OHQ    2OHR    2OHS    2OHT    2OHU    2P4J    2P83    2P8H    2PH6    2PH8    2Q11    2Q15    2QK5    2QMD    2QMF    2QMG    2QP8    2QU2    2QU3    2QZK    2QZL    2VA5    2VA6    2VA7    2VIE    2VIJ    2VIY    2VIZ    2VJ6    2VJ7    2VJ9    2VKM    2VNM    2VNN    2WEZ    2WF0    2WF1    2WF2    2WF3    2WF4    2WJO    2XFI    2XFJ    2XFK    2ZDZ    2ZE1    2ZHR    2ZHS    2ZHT    2ZHU    2ZHV    2ZJH    2ZJI    2ZJJ    2ZJK    2ZJL    2ZJM    2ZJN    3BRA    3BUF    3BUG    3BUH    3CIB    3CIC    3CID    3CKP    3CKR    3DM6    3DUY    3DV1    3DV5    3EXO    3FKT    3H0B    3HVG    3HW1    3I25    3IGB    3IN3    3IN4    3IND    3INE    3INF    3INH    3IVH    3IVI    3IXJ    3IXK    3K5C    3K5D    3K5F    3K5G    3KMX    3KMY    3KN0    3KYR    3L38    3L3A    3L58    3L59    3L5B    3L5C    3L5D    3L5E    3L5F    3LHG    3LNK    3LPI    3LPJ    3LPK    3MSJ    3MSK    3MSL    3N4L    3NSH    3OHF    3OHH    3OOZ    3PI5    3QBH    3QI1    3R1G    3R2F    3RSV    3RSX    3RTH    3RTM    3RTN    3RU1    3RVI    3S2O    3S7L    3S7M    3SKF    3SKG    3TPJ    3TPL    3TPP    3TPR    3U6A    3UDH    3UDJ    3UDK    3UDM    3UDN    3UDP    3UDQ    3UDR    3UDY    3UFL    3UQP    3UQR    3UQU    3UQW    3UQX    3VEU    3VF3    3VG1    3VV6    3VV7    3VV8    3WB4    3WB5    3ZMG    3ZOV    4ACU    4ACX    4AZY    4B00    4B05    4B0Q    4B1C    4B1D    4B1E    4B70    4B72    4B77    4B78    4BEK    4BFD    4D83    4D85    4D88    4D89    4D8C    4DH6    4DI2    4DJU    4DJV    4DJW    4DJX    4DJY    4DPF    4DPI    4DUS    4DV9    4DVF    4EWO    4EXG    4FCO    4FGX    4FM7    4FM8    4FRI    4FRJ    4FRK    4FRS    4FS4    4FSE    4FSL    4GID    4GMI    4H1E    4H3F    4H3G    4H3I    4H3J    4HA5    4HZT    4I0D    4I0E    4I0F    4I0G    4I0H    4I0I    4I0J    4I0Z    4I10    4I11    4I12    4I1C    4IVS    4IVT    4J0P    4J0T    4J0V    4J0Y    4J0Z    4J17    4J1C    4J1E    4J1F    4J1H    4J1I    4J1K    4JOO    4JP9    4JPC    4JPE    4K8S    4K9H    4KE0    4KE1    4L7G    4L7H    4L7J    4LC7    4LXA    4LXK    4LXM    4N00    4PZW    4PZX    4R5N    4R8Y    4R91    4R92    4R93    4R95    4RCD    4RCE    4RCF    4RRN    4RRO    4RRS    4TRW    4TRY    4TRZ    4WTU    4WY1    4WY6    4X2L    4X7I    4XKX    4XXS    4YBI    4ZPE    4ZPF    4ZPG    4ZSM    4ZSP    4ZSQ    4ZSR    5CLM   
SuperfamilyP56817
Human Protein AtlasENSG00000186318
Peptide AtlasP56817
HPRD07255
IPIIPI00011518   IPI00216209   IPI00216210   IPI00216211   IPI00386093   IPI00411567   IPI00968051   IPI00964620   IPI00977638   IPI00979537   IPI00978929   
Protein Interaction databases
DIP (DOE-UCLA)P56817
IntAct (EBI)P56817
FunCoupENSG00000186318
BioGRIDBACE1
STRING (EMBL)BACE1
ZODIACBACE1
Ontologies - Pathways
QuickGOP56817
Ontology : AmiGObeta-amyloid binding  aspartic-type endopeptidase activity  protein binding  endosome  late endosome  multivesicular body  endoplasmic reticulum lumen  Golgi apparatus  trans-Golgi network  plasma membrane  plasma membrane  integral component of plasma membrane  proteolysis  membrane protein ectodomain proteolysis  membrane protein ectodomain proteolysis  peptidase activity  beta-aspartyl-peptidase activity  cell surface  endosome membrane  integral component of membrane  enzyme binding  protein catabolic process  axon  cytoplasmic vesicle membrane  cellular protein metabolic process  beta-amyloid metabolic process  Golgi-associated vesicle lumen  
Ontology : EGO-EBIbeta-amyloid binding  aspartic-type endopeptidase activity  protein binding  endosome  late endosome  multivesicular body  endoplasmic reticulum lumen  Golgi apparatus  trans-Golgi network  plasma membrane  plasma membrane  integral component of plasma membrane  proteolysis  membrane protein ectodomain proteolysis  membrane protein ectodomain proteolysis  peptidase activity  beta-aspartyl-peptidase activity  cell surface  endosome membrane  integral component of membrane  enzyme binding  protein catabolic process  axon  cytoplasmic vesicle membrane  cellular protein metabolic process  beta-amyloid metabolic process  Golgi-associated vesicle lumen  
Pathways : KEGGAlzheimer's disease   
NDEx NetworkBACE1
Atlas of Cancer Signalling NetworkBACE1
Wikipedia pathwaysBACE1
Orthology - Evolution
OrthoDB23621
GeneTree (enSembl)ENSG00000186318
Phylogenetic Trees/Animal Genes : TreeFamBACE1
HOVERGENP56817
HOGENOMP56817
Homologs : HomoloGeneBACE1
Homology/Alignments : Family Browser (UCSC)BACE1
Gene fusions - Rearrangements
Polymorphisms : SNP and Copy number variants
NCBI Variation ViewerBACE1 [hg38]
dbSNP Single Nucleotide Polymorphism (NCBI)BACE1
dbVarBACE1
ClinVarBACE1
1000_GenomesBACE1 
Exome Variant ServerBACE1
ExAC (Exome Aggregation Consortium)BACE1 (select the gene name)
Genetic variants : HAPMAP23621
Genomic Variants (DGV)BACE1 [DGVbeta]
DECIPHER (Syndromes)11:117156402-117166386  ENSG00000186318
CONAN: Copy Number AnalysisBACE1 
Mutations
ICGC Data PortalBACE1 
TCGA Data PortalBACE1 
Broad Tumor PortalBACE1
OASIS PortalBACE1 [ Somatic mutations - Copy number]
Somatic Mutations in Cancer : COSMICBACE1  [overview]  [genome browser]  [tissue]  [distribution]  
Mutations and Diseases : HGMDBACE1
LOVD (Leiden Open Variation Database)Whole genome datasets
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD - Leiden Open Variation Database
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD 3.0 shared installation
BioMutasearch BACE1
DgiDB (Drug Gene Interaction Database)BACE1
DoCM (Curated mutations)BACE1 (select the gene name)
CIViC (Clinical Interpretations of Variants in Cancer)BACE1 (select a term)
intoGenBACE1
Cancer3DBACE1(select the gene name)
Impact of mutations[PolyPhen2] [SIFT Human Coding SNP] [Buck Institute : MutDB] [Mutation Assessor] [Mutanalyser]
Diseases
OMIM604252   
Orphanet
MedgenBACE1
Genetic Testing Registry BACE1
NextProtP56817 [Medical]
TSGene23621
GENETestsBACE1
Huge Navigator BACE1 [HugePedia]
snp3D : Map Gene to Disease23621
BioCentury BCIQBACE1
ClinGenBACE1
Clinical trials, drugs, therapy
Chemical/Protein Interactions : CTD23621
Chemical/Pharm GKB GenePA25232
Clinical trialBACE1
Miscellaneous
canSAR (ICR)BACE1 (select the gene name)
Probes
Litterature
PubMed312 Pubmed reference(s) in Entrez
GeneRIFsGene References Into Functions (Entrez)
CoreMineBACE1
EVEXBACE1
GoPubMedBACE1
iHOPBACE1
Genes in titleautomatic search in PubMed
REVIEW articlesautomatic search in PubMed
Last year publicationsautomatic search in PubMed

Search in all EBI   NCBI

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Thu Mar 30 14:53:41 CEST 2017

Home   Genes   Leukemias   Solid Tumours   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

For comments and suggestions or contributions, please contact us

jlhuret@AtlasGeneticsOncology.org.