Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

BAZ2B (bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B)

Identity

Alias_symbol (synonym)WALp4
Other alias
HGNC (Hugo) BAZ2B
LocusID (NCBI) 29994
Atlas_Id 758
Location 2q24.2  [Link to chromosome band 2q24]
Location_base_pair Starts at 159318979 and ends at 159616601 bp from pter ( according to hg38-Dec_2013)
Fusion genes
(updated 2017)
Data from Atlas, Mitelman, Cosmic Fusion, Fusion Cancer, TCGA fusion databases with official HUGO symbols (see references in chromosomal bands)
BAZ2B (2q24.2) / DMTF1 (7q21.12)BAZ2B (2q24.2) / FAP (2q24.2)BAZ2B (2q24.2) / LRRC7 (1p31.1)
BAZ2B (2q24.2) / PRKAA1 (5p13.1)C3orf52 (3q13.2) / BAZ2B (2q24.2)LAPTM4A (2p24.1) / BAZ2B (2q24.2)
NBAS (2p24.3) / BAZ2B (2q24.2)TNFAIP8L1 (19p13.3) / BAZ2B (2q24.2)WDSUB1 (2q24.2) / BAZ2B (2q24.2)
WDSUB1 2q24.2 / BAZ2B 2q24.2

Note

Non-annotated gene. Preliminary data : if you are an author
who wish to write a full paper/card on this gene, go to  How to contribute

DNA/RNA

 


Other Solid tumors implicated (Data extracted from papers in the Atlas) [ 2 ]
  t(2;2)(p24;q24) NBAS/BAZ2B
WDSUB1/BAZ2B (2q24)


External links

Nomenclature
HGNC (Hugo)BAZ2B   963
Cards
Entrez_Gene (NCBI)BAZ2B  29994  bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B
AliasesWALp4
GeneCards (Weizmann)BAZ2B
Ensembl hg19 (Hinxton)ENSG00000123636 [Gene_View]
Ensembl hg38 (Hinxton)ENSG00000123636 [Gene_View]  ENSG00000123636 [Sequence]  chr2:159318979-159616601 [Contig_View]  BAZ2B [Vega]
ICGC DataPortalENSG00000123636
TCGA cBioPortalBAZ2B
AceView (NCBI)BAZ2B
Genatlas (Paris)BAZ2B
WikiGenes29994
SOURCE (Princeton)BAZ2B
Genetics Home Reference (NIH)BAZ2B
Genomic and cartography
GoldenPath hg38 (UCSC)BAZ2B  -     chr2:159318979-159616601 -  2q24.2   [Description]    (hg38-Dec_2013)
GoldenPath hg19 (UCSC)BAZ2B  -     2q24.2   [Description]    (hg19-Feb_2009)
EnsemblBAZ2B - 2q24.2 [CytoView hg19]  BAZ2B - 2q24.2 [CytoView hg38]
Mapping of homologs : NCBIBAZ2B [Mapview hg19]  BAZ2B [Mapview hg38]
OMIM605683   
Gene and transcription
Genbank (Entrez)AB032255 AB040909 AK000386 AK023566 AK027612
RefSeq transcript (Entrez)NM_001289975 NM_001329857 NM_001329858 NM_013450
RefSeq genomic (Entrez)
Consensus coding sequences : CCDS (NCBI)BAZ2B
Cluster EST : UnigeneHs.731786 [ NCBI ]
CGAP (NCI)Hs.731786
Alternative Splicing GalleryENSG00000123636
Gene ExpressionBAZ2B [ NCBI-GEO ]   BAZ2B [ EBI - ARRAY_EXPRESS ]   BAZ2B [ SEEK ]   BAZ2B [ MEM ]
Gene Expression Viewer (FireBrowse)BAZ2B [ Firebrowse - Broad ]
SOURCE (Princeton)Expression in : [Datasets]   [Normal Tissue Atlas]  [carcinoma Classsification]  [NCI60]
GenevestigatorExpression in : [tissues]  [cell-lines]  [cancer]  [perturbations]  
BioGPS (Tissue expression)29994
GTEX Portal (Tissue expression)BAZ2B
Human Protein AtlasENSG00000123636-BAZ2B [pathology]   [cell]   [tissue]
Protein : pattern, domain, 3D structure
UniProt/SwissProtQ9UIF8   [function]  [subcellular_location]  [family_and_domains]  [pathology_and_biotech]  [ptm_processing]  [expression]  [interaction]
NextProtQ9UIF8  [Sequence]  [Exons]  [Medical]  [Publications]
With graphics : InterProQ9UIF8
Splice isoforms : SwissVarQ9UIF8
PhosPhoSitePlusQ9UIF8
Domaine pattern : Prosite (Expaxy)BROMODOMAIN_1 (PS00633)    BROMODOMAIN_2 (PS50014)    DDT (PS50827)    MBD (PS50982)    ZF_PHD_2 (PS50016)   
Domains : Interpro (EBI)BAZ2A/B_Bromo    Bromodomain    Bromodomain-like_sf    Bromodomain_CS    DDT_dom    DNA-bd_dom_sf    Methyl_CpG_DNA-bd    WHIM2_dom    Znf_FYVE_PHD    Znf_PHD    Znf_PHD-finger    Znf_RING/FYVE/PHD   
Domain families : Pfam (Sanger)Bromodomain (PF00439)    DDT (PF02791)    MBD (PF01429)    PHD (PF00628)    WSD (PF15613)   
Domain families : Pfam (NCBI)pfam00439    pfam02791    pfam01429    pfam00628    pfam15613   
Domain families : Smart (EMBL)BROMO (SM00297)  DDT (SM00571)  MBD (SM00391)  PHD (SM00249)  
Conserved Domain (NCBI)BAZ2B
DMDM Disease mutations29994
Blocks (Seattle)BAZ2B
PDB (SRS)2E7O    3G0L    3Q2F    4CUP    4CUQ    4CUR    4CUS    4CUT    4CUU    4IR3    4IR4    4IR5    4IR6    4NR9    4NRA    4NRB    4NRC    4QC1    4QC3    4QF3    4RVR    4XUA    4XUB    5CQ3    5CQ4    5CQ5    5CQ6    5CQ7    5CQ8    5CQA    5CU8    5CUA    5CUB    5CUC    5CUD    5CUE    5CUG    5DYU    5DYX    5E73    5E74    5E9I    5E9K    5E9L    5E9M    5E9Y    5L8T    5L8U    5L96    5L97    5L98    5L99    5MGE    5MGF    5MGG    5OR9    5ORB    5PB7    5PB8    5PB9    5PBA    5PBB    5PBC    5PBD    5PBE    5PBF    5PBG    5PBH    5PBI    5PBJ    5PBK    5PBL    5PBM    5PBN    5PBO    5PBP    5PBQ    5PBR    5PBS    5PBT    5PBU    5PBV    5PBW    5PBX    5PBY    5PBZ    5PC0    5PC1    5PC2    5PC3    5PC4    5PC5    5PC6    5PC7    5PC8    5PC9    5PCA    5PCB    5PCC    5PCD    5PCE    5PCF    5PCG    5PCH    5PCI    5PCJ    5PCK    5PCL    5PCM    5PCN    5PCO    5PCP    5PCQ    5PCR    5PCS    5PCT    5PCU    5PCV    5PCW    5PCX    5PCZ    5PD0    5PD1    5PD2    5PD3    5PD4    5PD5    5PD6    5PD7    5PD8    5PD9    5PDA    5PDB    5PDC    5PDD    5PDE    5PDF    5PDG    5PDH    5PDI    5PDJ    5PDK    5PDL    5PDM    5PDN    5PDO    5PDP    5PDQ    5PDR    5PDS    5PDT    5PDU    5PDV    5PDW    5PDX    5PDY    5PDZ    5PE0    5PE1    5PE2    5PE3    5PE4    5PE5    5PE6    5PE7    5PE8    5PE9    5PEA    5PEB    5PEC    5PED    5PEE    5PEF    5PEG    5PEH    5PEI    5PEJ    5PEK    5PEL    5PEM    5PEN    5PEO    5PEQ    5PER    5PES    5PET    5PEU    5PEV    5PEW    5PEX    5PEY    5PEZ    5PF0    5PF1    5PF2    5PF3    5PF4    5PF5    5PF6    5PF7    5PF8    5PF9    5PFA    5PFB    5PFC    5PFD    5PFE    5PFF    5PFG    5PFH    5PFI    5PFJ    5PFL    5PFM    5PFN    5PFO    5PFP    5PFQ    5PFR    5PFS    5PFT    5PFU    5PFV    5PFW    5PFX    5PFY    5PFZ    5PG0    5PG1    5PG2    5PG3    5PG4    5PG5    5PG6    5PG7    5PG8    5PG9    5PGA    5PGB    5PGC    5PGD    5PGE    5PGF    5PGG    5PGH    5PGI    5PGJ    5PGK    5PGL    5PGN    5PGO    5PGP    5PGQ    5PGR    5PGS    5PGT   
PDB (PDBSum)2E7O    3G0L    3Q2F    4CUP    4CUQ    4CUR    4CUS    4CUT    4CUU    4IR3    4IR4    4IR5    4IR6    4NR9    4NRA    4NRB    4NRC    4QC1    4QC3    4QF3    4RVR    4XUA    4XUB    5CQ3    5CQ4    5CQ5    5CQ6    5CQ7    5CQ8    5CQA    5CU8    5CUA    5CUB    5CUC    5CUD    5CUE    5CUG    5DYU    5DYX    5E73    5E74    5E9I    5E9K    5E9L    5E9M    5E9Y    5L8T    5L8U    5L96    5L97    5L98    5L99    5MGE    5MGF    5MGG    5OR9    5ORB    5PB7    5PB8    5PB9    5PBA    5PBB    5PBC    5PBD    5PBE    5PBF    5PBG    5PBH    5PBI    5PBJ    5PBK    5PBL    5PBM    5PBN    5PBO    5PBP    5PBQ    5PBR    5PBS    5PBT    5PBU    5PBV    5PBW    5PBX    5PBY    5PBZ    5PC0    5PC1    5PC2    5PC3    5PC4    5PC5    5PC6    5PC7    5PC8    5PC9    5PCA    5PCB    5PCC    5PCD    5PCE    5PCF    5PCG    5PCH    5PCI    5PCJ    5PCK    5PCL    5PCM    5PCN    5PCO    5PCP    5PCQ    5PCR    5PCS    5PCT    5PCU    5PCV    5PCW    5PCX    5PCZ    5PD0    5PD1    5PD2    5PD3    5PD4    5PD5    5PD6    5PD7    5PD8    5PD9    5PDA    5PDB    5PDC    5PDD    5PDE    5PDF    5PDG    5PDH    5PDI    5PDJ    5PDK    5PDL    5PDM    5PDN    5PDO    5PDP    5PDQ    5PDR    5PDS    5PDT    5PDU    5PDV    5PDW    5PDX    5PDY    5PDZ    5PE0    5PE1    5PE2    5PE3    5PE4    5PE5    5PE6    5PE7    5PE8    5PE9    5PEA    5PEB    5PEC    5PED    5PEE    5PEF    5PEG    5PEH    5PEI    5PEJ    5PEK    5PEL    5PEM    5PEN    5PEO    5PEQ    5PER    5PES    5PET    5PEU    5PEV    5PEW    5PEX    5PEY    5PEZ    5PF0    5PF1    5PF2    5PF3    5PF4    5PF5    5PF6    5PF7    5PF8    5PF9    5PFA    5PFB    5PFC    5PFD    5PFE    5PFF    5PFG    5PFH    5PFI    5PFJ    5PFL    5PFM    5PFN    5PFO    5PFP    5PFQ    5PFR    5PFS    5PFT    5PFU    5PFV    5PFW    5PFX    5PFY    5PFZ    5PG0    5PG1    5PG2    5PG3    5PG4    5PG5    5PG6    5PG7    5PG8    5PG9    5PGA    5PGB    5PGC    5PGD    5PGE    5PGF    5PGG    5PGH    5PGI    5PGJ    5PGK    5PGL    5PGN    5PGO    5PGP    5PGQ    5PGR    5PGS    5PGT   
PDB (IMB)2E7O    3G0L    3Q2F    4CUP    4CUQ    4CUR    4CUS    4CUT    4CUU    4IR3    4IR4    4IR5    4IR6    4NR9    4NRA    4NRB    4NRC    4QC1    4QC3    4QF3    4RVR    4XUA    4XUB    5CQ3    5CQ4    5CQ5    5CQ6    5CQ7    5CQ8    5CQA    5CU8    5CUA    5CUB    5CUC    5CUD    5CUE    5CUG    5DYU    5DYX    5E73    5E74    5E9I    5E9K    5E9L    5E9M    5E9Y    5L8T    5L8U    5L96    5L97    5L98    5L99    5MGE    5MGF    5MGG    5OR9    5ORB    5PB7    5PB8    5PB9    5PBA    5PBB    5PBC    5PBD    5PBE    5PBF    5PBG    5PBH    5PBI    5PBJ    5PBK    5PBL    5PBM    5PBN    5PBO    5PBP    5PBQ    5PBR    5PBS    5PBT    5PBU    5PBV    5PBW    5PBX    5PBY    5PBZ    5PC0    5PC1    5PC2    5PC3    5PC4    5PC5    5PC6    5PC7    5PC8    5PC9    5PCA    5PCB    5PCC    5PCD    5PCE    5PCF    5PCG    5PCH    5PCI    5PCJ    5PCK    5PCL    5PCM    5PCN    5PCO    5PCP    5PCQ    5PCR    5PCS    5PCT    5PCU    5PCV    5PCW    5PCX    5PCZ    5PD0    5PD1    5PD2    5PD3    5PD4    5PD5    5PD6    5PD7    5PD8    5PD9    5PDA    5PDB    5PDC    5PDD    5PDE    5PDF    5PDG    5PDH    5PDI    5PDJ    5PDK    5PDL    5PDM    5PDN    5PDO    5PDP    5PDQ    5PDR    5PDS    5PDT    5PDU    5PDV    5PDW    5PDX    5PDY    5PDZ    5PE0    5PE1    5PE2    5PE3    5PE4    5PE5    5PE6    5PE7    5PE8    5PE9    5PEA    5PEB    5PEC    5PED    5PEE    5PEF    5PEG    5PEH    5PEI    5PEJ    5PEK    5PEL    5PEM    5PEN    5PEO    5PEQ    5PER    5PES    5PET    5PEU    5PEV    5PEW    5PEX    5PEY    5PEZ    5PF0    5PF1    5PF2    5PF3    5PF4    5PF5    5PF6    5PF7    5PF8    5PF9    5PFA    5PFB    5PFC    5PFD    5PFE    5PFF    5PFG    5PFH    5PFI    5PFJ    5PFL    5PFM    5PFN    5PFO    5PFP    5PFQ    5PFR    5PFS    5PFT    5PFU    5PFV    5PFW    5PFX    5PFY    5PFZ    5PG0    5PG1    5PG2    5PG3    5PG4    5PG5    5PG6    5PG7    5PG8    5PG9    5PGA    5PGB    5PGC    5PGD    5PGE    5PGF    5PGG    5PGH    5PGI    5PGJ    5PGK    5PGL    5PGN    5PGO    5PGP    5PGQ    5PGR    5PGS    5PGT   
PDB (RSDB)2E7O    3G0L    3Q2F    4CUP    4CUQ    4CUR    4CUS    4CUT    4CUU    4IR3    4IR4    4IR5    4IR6    4NR9    4NRA    4NRB    4NRC    4QC1    4QC3    4QF3    4RVR    4XUA    4XUB    5CQ3    5CQ4    5CQ5    5CQ6    5CQ7    5CQ8    5CQA    5CU8    5CUA    5CUB    5CUC    5CUD    5CUE    5CUG    5DYU    5DYX    5E73    5E74    5E9I    5E9K    5E9L    5E9M    5E9Y    5L8T    5L8U    5L96    5L97    5L98    5L99    5MGE    5MGF    5MGG    5OR9    5ORB    5PB7    5PB8    5PB9    5PBA    5PBB    5PBC    5PBD    5PBE    5PBF    5PBG    5PBH    5PBI    5PBJ    5PBK    5PBL    5PBM    5PBN    5PBO    5PBP    5PBQ    5PBR    5PBS    5PBT    5PBU    5PBV    5PBW    5PBX    5PBY    5PBZ    5PC0    5PC1    5PC2    5PC3    5PC4    5PC5    5PC6    5PC7    5PC8    5PC9    5PCA    5PCB    5PCC    5PCD    5PCE    5PCF    5PCG    5PCH    5PCI    5PCJ    5PCK    5PCL    5PCM    5PCN    5PCO    5PCP    5PCQ    5PCR    5PCS    5PCT    5PCU    5PCV    5PCW    5PCX    5PCZ    5PD0    5PD1    5PD2    5PD3    5PD4    5PD5    5PD6    5PD7    5PD8    5PD9    5PDA    5PDB    5PDC    5PDD    5PDE    5PDF    5PDG    5PDH    5PDI    5PDJ    5PDK    5PDL    5PDM    5PDN    5PDO    5PDP    5PDQ    5PDR    5PDS    5PDT    5PDU    5PDV    5PDW    5PDX    5PDY    5PDZ    5PE0    5PE1    5PE2    5PE3    5PE4    5PE5    5PE6    5PE7    5PE8    5PE9    5PEA    5PEB    5PEC    5PED    5PEE    5PEF    5PEG    5PEH    5PEI    5PEJ    5PEK    5PEL    5PEM    5PEN    5PEO    5PEQ    5PER    5PES    5PET    5PEU    5PEV    5PEW    5PEX    5PEY    5PEZ    5PF0    5PF1    5PF2    5PF3    5PF4    5PF5    5PF6    5PF7    5PF8    5PF9    5PFA    5PFB    5PFC    5PFD    5PFE    5PFF    5PFG    5PFH    5PFI    5PFJ    5PFL    5PFM    5PFN    5PFO    5PFP    5PFQ    5PFR    5PFS    5PFT    5PFU    5PFV    5PFW    5PFX    5PFY    5PFZ    5PG0    5PG1    5PG2    5PG3    5PG4    5PG5    5PG6    5PG7    5PG8    5PG9    5PGA    5PGB    5PGC    5PGD    5PGE    5PGF    5PGG    5PGH    5PGI    5PGJ    5PGK    5PGL    5PGN    5PGO    5PGP    5PGQ    5PGR    5PGS    5PGT   
Structural Biology KnowledgeBase2E7O    3G0L    3Q2F    4CUP    4CUQ    4CUR    4CUS    4CUT    4CUU    4IR3    4IR4    4IR5    4IR6    4NR9    4NRA    4NRB    4NRC    4QC1    4QC3    4QF3    4RVR    4XUA    4XUB    5CQ3    5CQ4    5CQ5    5CQ6    5CQ7    5CQ8    5CQA    5CU8    5CUA    5CUB    5CUC    5CUD    5CUE    5CUG    5DYU    5DYX    5E73    5E74    5E9I    5E9K    5E9L    5E9M    5E9Y    5L8T    5L8U    5L96    5L97    5L98    5L99    5MGE    5MGF    5MGG    5OR9    5ORB    5PB7    5PB8    5PB9    5PBA    5PBB    5PBC    5PBD    5PBE    5PBF    5PBG    5PBH    5PBI    5PBJ    5PBK    5PBL    5PBM    5PBN    5PBO    5PBP    5PBQ    5PBR    5PBS    5PBT    5PBU    5PBV    5PBW    5PBX    5PBY    5PBZ    5PC0    5PC1    5PC2    5PC3    5PC4    5PC5    5PC6    5PC7    5PC8    5PC9    5PCA    5PCB    5PCC    5PCD    5PCE    5PCF    5PCG    5PCH    5PCI    5PCJ    5PCK    5PCL    5PCM    5PCN    5PCO    5PCP    5PCQ    5PCR    5PCS    5PCT    5PCU    5PCV    5PCW    5PCX    5PCZ    5PD0    5PD1    5PD2    5PD3    5PD4    5PD5    5PD6    5PD7    5PD8    5PD9    5PDA    5PDB    5PDC    5PDD    5PDE    5PDF    5PDG    5PDH    5PDI    5PDJ    5PDK    5PDL    5PDM    5PDN    5PDO    5PDP    5PDQ    5PDR    5PDS    5PDT    5PDU    5PDV    5PDW    5PDX    5PDY    5PDZ    5PE0    5PE1    5PE2    5PE3    5PE4    5PE5    5PE6    5PE7    5PE8    5PE9    5PEA    5PEB    5PEC    5PED    5PEE    5PEF    5PEG    5PEH    5PEI    5PEJ    5PEK    5PEL    5PEM    5PEN    5PEO    5PEQ    5PER    5PES    5PET    5PEU    5PEV    5PEW    5PEX    5PEY    5PEZ    5PF0    5PF1    5PF2    5PF3    5PF4    5PF5    5PF6    5PF7    5PF8    5PF9    5PFA    5PFB    5PFC    5PFD    5PFE    5PFF    5PFG    5PFH    5PFI    5PFJ    5PFL    5PFM    5PFN    5PFO    5PFP    5PFQ    5PFR    5PFS    5PFT    5PFU    5PFV    5PFW    5PFX    5PFY    5PFZ    5PG0    5PG1    5PG2    5PG3    5PG4    5PG5    5PG6    5PG7    5PG8    5PG9    5PGA    5PGB    5PGC    5PGD    5PGE    5PGF    5PGG    5PGH    5PGI    5PGJ    5PGK    5PGL    5PGN    5PGO    5PGP    5PGQ    5PGR    5PGS    5PGT   
SCOP (Structural Classification of Proteins)2E7O    3G0L    3Q2F    4CUP    4CUQ    4CUR    4CUS    4CUT    4CUU    4IR3    4IR4    4IR5    4IR6    4NR9    4NRA    4NRB    4NRC    4QC1    4QC3    4QF3    4RVR    4XUA    4XUB    5CQ3    5CQ4    5CQ5    5CQ6    5CQ7    5CQ8    5CQA    5CU8    5CUA    5CUB    5CUC    5CUD    5CUE    5CUG    5DYU    5DYX    5E73    5E74    5E9I    5E9K    5E9L    5E9M    5E9Y    5L8T    5L8U    5L96    5L97    5L98    5L99    5MGE    5MGF    5MGG    5OR9    5ORB    5PB7    5PB8    5PB9    5PBA    5PBB    5PBC    5PBD    5PBE    5PBF    5PBG    5PBH    5PBI    5PBJ    5PBK    5PBL    5PBM    5PBN    5PBO    5PBP    5PBQ    5PBR    5PBS    5PBT    5PBU    5PBV    5PBW    5PBX    5PBY    5PBZ    5PC0    5PC1    5PC2    5PC3    5PC4    5PC5    5PC6    5PC7    5PC8    5PC9    5PCA    5PCB    5PCC    5PCD    5PCE    5PCF    5PCG    5PCH    5PCI    5PCJ    5PCK    5PCL    5PCM    5PCN    5PCO    5PCP    5PCQ    5PCR    5PCS    5PCT    5PCU    5PCV    5PCW    5PCX    5PCZ    5PD0    5PD1    5PD2    5PD3    5PD4    5PD5    5PD6    5PD7    5PD8    5PD9    5PDA    5PDB    5PDC    5PDD    5PDE    5PDF    5PDG    5PDH    5PDI    5PDJ    5PDK    5PDL    5PDM    5PDN    5PDO    5PDP    5PDQ    5PDR    5PDS    5PDT    5PDU    5PDV    5PDW    5PDX    5PDY    5PDZ    5PE0    5PE1    5PE2    5PE3    5PE4    5PE5    5PE6    5PE7    5PE8    5PE9    5PEA    5PEB    5PEC    5PED    5PEE    5PEF    5PEG    5PEH    5PEI    5PEJ    5PEK    5PEL    5PEM    5PEN    5PEO    5PEQ    5PER    5PES    5PET    5PEU    5PEV    5PEW    5PEX    5PEY    5PEZ    5PF0    5PF1    5PF2    5PF3    5PF4    5PF5    5PF6    5PF7    5PF8    5PF9    5PFA    5PFB    5PFC    5PFD    5PFE    5PFF    5PFG    5PFH    5PFI    5PFJ    5PFL    5PFM    5PFN    5PFO    5PFP    5PFQ    5PFR    5PFS    5PFT    5PFU    5PFV    5PFW    5PFX    5PFY    5PFZ    5PG0    5PG1    5PG2    5PG3    5PG4    5PG5    5PG6    5PG7    5PG8    5PG9    5PGA    5PGB    5PGC    5PGD    5PGE    5PGF    5PGG    5PGH    5PGI    5PGJ    5PGK    5PGL    5PGN    5PGO    5PGP    5PGQ    5PGR    5PGS    5PGT   
CATH (Classification of proteins structures)2E7O    3G0L    3Q2F    4CUP    4CUQ    4CUR    4CUS    4CUT    4CUU    4IR3    4IR4    4IR5    4IR6    4NR9    4NRA    4NRB    4NRC    4QC1    4QC3    4QF3    4RVR    4XUA    4XUB    5CQ3    5CQ4    5CQ5    5CQ6    5CQ7    5CQ8    5CQA    5CU8    5CUA    5CUB    5CUC    5CUD    5CUE    5CUG    5DYU    5DYX    5E73    5E74    5E9I    5E9K    5E9L    5E9M    5E9Y    5L8T    5L8U    5L96    5L97    5L98    5L99    5MGE    5MGF    5MGG    5OR9    5ORB    5PB7    5PB8    5PB9    5PBA    5PBB    5PBC    5PBD    5PBE    5PBF    5PBG    5PBH    5PBI    5PBJ    5PBK    5PBL    5PBM    5PBN    5PBO    5PBP    5PBQ    5PBR    5PBS    5PBT    5PBU    5PBV    5PBW    5PBX    5PBY    5PBZ    5PC0    5PC1    5PC2    5PC3    5PC4    5PC5    5PC6    5PC7    5PC8    5PC9    5PCA    5PCB    5PCC    5PCD    5PCE    5PCF    5PCG    5PCH    5PCI    5PCJ    5PCK    5PCL    5PCM    5PCN    5PCO    5PCP    5PCQ    5PCR    5PCS    5PCT    5PCU    5PCV    5PCW    5PCX    5PCZ    5PD0    5PD1    5PD2    5PD3    5PD4    5PD5    5PD6    5PD7    5PD8    5PD9    5PDA    5PDB    5PDC    5PDD    5PDE    5PDF    5PDG    5PDH    5PDI    5PDJ    5PDK    5PDL    5PDM    5PDN    5PDO    5PDP    5PDQ    5PDR    5PDS    5PDT    5PDU    5PDV    5PDW    5PDX    5PDY    5PDZ    5PE0    5PE1    5PE2    5PE3    5PE4    5PE5    5PE6    5PE7    5PE8    5PE9    5PEA    5PEB    5PEC    5PED    5PEE    5PEF    5PEG    5PEH    5PEI    5PEJ    5PEK    5PEL    5PEM    5PEN    5PEO    5PEQ    5PER    5PES    5PET    5PEU    5PEV    5PEW    5PEX    5PEY    5PEZ    5PF0    5PF1    5PF2    5PF3    5PF4    5PF5    5PF6    5PF7    5PF8    5PF9    5PFA    5PFB    5PFC    5PFD    5PFE    5PFF    5PFG    5PFH    5PFI    5PFJ    5PFL    5PFM    5PFN    5PFO    5PFP    5PFQ    5PFR    5PFS    5PFT    5PFU    5PFV    5PFW    5PFX    5PFY    5PFZ    5PG0    5PG1    5PG2    5PG3    5PG4    5PG5    5PG6    5PG7    5PG8    5PG9    5PGA    5PGB    5PGC    5PGD    5PGE    5PGF    5PGG    5PGH    5PGI    5PGJ    5PGK    5PGL    5PGN    5PGO    5PGP    5PGQ    5PGR    5PGS    5PGT   
SuperfamilyQ9UIF8
Human Protein Atlas [tissue]ENSG00000123636-BAZ2B [tissue]
Peptide AtlasQ9UIF8
HPRD09295
IPIIPI00873703   IPI00061354   IPI00220295   IPI00929198   IPI00916292   IPI01021362   IPI00917735   IPI00926311   
Protein Interaction databases
DIP (DOE-UCLA)Q9UIF8
IntAct (EBI)Q9UIF8
FunCoupENSG00000123636
BioGRIDBAZ2B
STRING (EMBL)BAZ2B
ZODIACBAZ2B
Ontologies - Pathways
QuickGOQ9UIF8
Ontology : AmiGODNA binding  protein binding  nucleus  chromatin remodeling  transcription, DNA-templated  regulation of transcription by RNA polymerase II  metal ion binding  
Ontology : EGO-EBIDNA binding  protein binding  nucleus  chromatin remodeling  transcription, DNA-templated  regulation of transcription by RNA polymerase II  metal ion binding  
NDEx NetworkBAZ2B
Atlas of Cancer Signalling NetworkBAZ2B
Wikipedia pathwaysBAZ2B
Orthology - Evolution
OrthoDB29994
GeneTree (enSembl)ENSG00000123636
Phylogenetic Trees/Animal Genes : TreeFamBAZ2B
HOVERGENQ9UIF8
HOGENOMQ9UIF8
Homologs : HomoloGeneBAZ2B
Homology/Alignments : Family Browser (UCSC)BAZ2B
Gene fusions - Rearrangements
Fusion : MitelmanNBAS/BAZ2B [2p24.3/2q24.2]  [t(2;2)(p24;q24)]  
Fusion : MitelmanWDSUB1/BAZ2B [2q24.2/2q24.2]  [t(2;2)(q24;q24)]  
Fusion PortalWDSUB1 2q24.2 BAZ2B 2q24.2 BRCA
Fusion : QuiverBAZ2B
Polymorphisms : SNP and Copy number variants
NCBI Variation ViewerBAZ2B [hg38]
dbSNP Single Nucleotide Polymorphism (NCBI)BAZ2B
dbVarBAZ2B
ClinVarBAZ2B
1000_GenomesBAZ2B 
Exome Variant ServerBAZ2B
ExAC (Exome Aggregation Consortium)ENSG00000123636
GNOMAD BrowserENSG00000123636
Varsome BrowserBAZ2B
Genetic variants : HAPMAP29994
Genomic Variants (DGV)BAZ2B [DGVbeta]
DECIPHERBAZ2B [patients]   [syndromes]   [variants]   [genes]  
CONAN: Copy Number AnalysisBAZ2B 
Mutations
ICGC Data PortalBAZ2B 
TCGA Data PortalBAZ2B 
Broad Tumor PortalBAZ2B
OASIS PortalBAZ2B [ Somatic mutations - Copy number]
Somatic Mutations in Cancer : COSMICBAZ2B  [overview]  [genome browser]  [tissue]  [distribution]  
Mutations and Diseases : HGMDBAZ2B
intOGen PortalBAZ2B
LOVD (Leiden Open Variation Database)Whole genome datasets
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD - Leiden Open Variation Database
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD 3.0 shared installation
BioMutasearch BAZ2B
DgiDB (Drug Gene Interaction Database)BAZ2B
DoCM (Curated mutations)BAZ2B (select the gene name)
CIViC (Clinical Interpretations of Variants in Cancer)BAZ2B (select a term)
intoGenBAZ2B
Cancer3DBAZ2B(select the gene name)
Impact of mutations[PolyPhen2] [Provean] [Buck Institute : MutDB] [Mutation Assessor] [Mutanalyser]
Diseases
OMIM605683   
Orphanet
DisGeNETBAZ2B
MedgenBAZ2B
Genetic Testing Registry BAZ2B
NextProtQ9UIF8 [Medical]
TSGene29994
GENETestsBAZ2B
Target ValidationBAZ2B
Huge Navigator BAZ2B [HugePedia]
snp3D : Map Gene to Disease29994
BioCentury BCIQBAZ2B
ClinGenBAZ2B
Clinical trials, drugs, therapy
Chemical/Protein Interactions : CTD29994
Chemical/Pharm GKB GenePA25273
Clinical trialBAZ2B
Miscellaneous
canSAR (ICR)BAZ2B (select the gene name)
Probes
Litterature
PubMed24 Pubmed reference(s) in Entrez
GeneRIFsGene References Into Functions (Entrez)
CoreMineBAZ2B
EVEXBAZ2B
GoPubMedBAZ2B
iHOPBAZ2B
Genes in titleautomatic search in PubMed
REVIEW articlesautomatic search in PubMed
Last year publicationsautomatic search in PubMed

Search in all EBI   NCBI

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Mon Aug 27 11:11:12 CEST 2018

Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

For comments and suggestions or contributions, please contact us

jlhuret@AtlasGeneticsOncology.org.