Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

BRD1 (bromodomain containing 1)

Identity

Alias_namesbromodomain-containing 1
Alias_symbol (synonym)BRL
BRPF2
Other aliasBRPF1
HGNC (Hugo) BRD1
LocusID (NCBI) 23774
Atlas_Id 835
Location 22q13.33  [Link to chromosome band 22q13]
Location_base_pair Starts at 49773278 and ends at 49824331 bp from pter ( according to hg38-Dec_2013)
Fusion genes
(updated 2017)
Data from Atlas, Mitelman, Cosmic Fusion, Fusion Cancer, TCGA fusion databases with official HUGO symbols (see references in chromosomal bands)
BRD1 (22q13.33) / APOL5 (22q12.3)BRD1 (22q13.33) / BRD1 (22q13.33)BRD1 (22q13.33) / MAPK12 (22q13.33)
BRD1 (22q13.33) / MLC1 (22q13.33)C22orf34 (22q13.33) / BRD1 (22q13.33)KLHL7 (7p15.3) / BRD1 (22q13.33)
PAX5 (9p13.2) / BRD1 (22q13.33)BRD1 22q13.33 / APOL5 22q12.3BRD1 22q13.33 / MAPK12 22q13.33
BRD1 22q13.33 / MLC1 22q13.33C22orf34 22q13.33 / BRD1 22q13.33

Note

Non-annotated gene. Preliminary data : if you are an author
who wish to write a full paper/card on this gene, go to  How to contribute

DNA/RNA

 

Protein

 


Other Leukemias implicated (Data extracted from papers in the Atlas) [ 3 ]
  t(9;22)(p13;q13) PAX5/BRD1
t(22;22)(q13;q13) C22orf34/BRD1
t(22;22)(q13;q13) PIM3/BRD1


Other Solid tumors implicated (Data extracted from papers in the Atlas) [ 3 ]
  t(22;22)(q12;q13) BRD1/APOL5
BRD1/MAPK12 (22q13)
BRD1/MLC1 (22q13)


External links

Nomenclature
HGNC (Hugo)BRD1   1102
Cards
Entrez_Gene (NCBI)BRD1  23774  bromodomain containing 1
AliasesBRL; BRPF1; BRPF2
GeneCards (Weizmann)BRD1
Ensembl hg19 (Hinxton)ENSG00000100425 [Gene_View]
Ensembl hg38 (Hinxton)ENSG00000100425 [Gene_View]  ENSG00000100425 [Sequence]  chr22:49773278-49824331 [Contig_View]  BRD1 [Vega]
ICGC DataPortalENSG00000100425
TCGA cBioPortalBRD1
AceView (NCBI)BRD1
Genatlas (Paris)BRD1
WikiGenes23774
SOURCE (Princeton)BRD1
Genetics Home Reference (NIH)BRD1
Genomic and cartography
GoldenPath hg38 (UCSC)BRD1  -     chr22:49773278-49824331 -  22q13.33   [Description]    (hg38-Dec_2013)
GoldenPath hg19 (UCSC)BRD1  -     22q13.33   [Description]    (hg19-Feb_2009)
EnsemblBRD1 - 22q13.33 [CytoView hg19]  BRD1 - 22q13.33 [CytoView hg38]
Mapping of homologs : NCBIBRD1 [Mapview hg19]  BRD1 [Mapview hg38]
OMIM604589   
Gene and transcription
Genbank (Entrez)AA969405 AB209216 AF005067 AK292428 AK302736
RefSeq transcript (Entrez)NM_001304808 NM_001304809 NM_001349940 NM_001349941 NM_001349942 NM_014577
RefSeq genomic (Entrez)
Consensus coding sequences : CCDS (NCBI)BRD1
Cluster EST : UnigeneHs.127950 [ NCBI ]
CGAP (NCI)Hs.127950
Alternative Splicing GalleryENSG00000100425
Gene ExpressionBRD1 [ NCBI-GEO ]   BRD1 [ EBI - ARRAY_EXPRESS ]   BRD1 [ SEEK ]   BRD1 [ MEM ]
Gene Expression Viewer (FireBrowse)BRD1 [ Firebrowse - Broad ]
SOURCE (Princeton)Expression in : [Datasets]   [Normal Tissue Atlas]  [carcinoma Classsification]  [NCI60]
GenevestigatorExpression in : [tissues]  [cell-lines]  [cancer]  [perturbations]  
BioGPS (Tissue expression)23774
GTEX Portal (Tissue expression)BRD1
Human Protein AtlasENSG00000100425-BRD1 [pathology]   [cell]   [tissue]
Protein : pattern, domain, 3D structure
UniProt/SwissProtO95696   [function]  [subcellular_location]  [family_and_domains]  [pathology_and_biotech]  [ptm_processing]  [expression]  [interaction]
NextProtO95696  [Sequence]  [Exons]  [Medical]  [Publications]
With graphics : InterProO95696
Splice isoforms : SwissVarO95696
PhosPhoSitePlusO95696
Domaine pattern : Prosite (Expaxy)BROMODOMAIN_1 (PS00633)    BROMODOMAIN_2 (PS50014)    EPHD (PS51805)    PWWP (PS50812)    ZF_PHD_1 (PS01359)    ZF_PHD_2 (PS50016)   
Domains : Interpro (EBI)BR140-rel_PWWD    Bromodomain    Bromodomain-like_sf    Bromodomain_CS    Enhancer_polycomb-like_N    EPHD    PWWP_dom    Zinc_finger_PHD-type_CS    Znf_FYVE_PHD    Znf_PHD    Znf_PHD-finger    Znf_RING/FYVE/PHD   
Domain families : Pfam (Sanger)Bromodomain (PF00439)    EPL1 (PF10513)    PWWP (PF00855)   
Domain families : Pfam (NCBI)pfam00439    pfam10513    pfam00855   
Domain families : Smart (EMBL)BROMO (SM00297)  PHD (SM00249)  PWWP (SM00293)  
Conserved Domain (NCBI)BRD1
DMDM Disease mutations23774
Blocks (Seattle)BRD1
PDB (SRS)2KU3    2L43    2LQ6    3LYI    3RCW    4Z02    5AME    5AMF    5FG6    5GK9    5N49    5PNX    5PNY    5PNZ    5PO0    5PO1    5PO2    5PO3    5PO4    5PO5    5PO6    5PO7    5PO8    5PO9    5POA    5POB    5POC    5POD    5POE    5POF    5POG    5POH    5POI    5POJ    5POK    5POL    5POM    5PON    5POO    5POP    5POQ    5POR    5POS    5POT    5POU    5POV    5POW    5POX    5POY    5POZ    5PP0    5PP1    5PP2    5PP3    5PP4    5PP5    5PP6    5PP7    5PP8    5PP9    5PPA    5PPB    5PPC    5PPD    5PPE    5PPF    5PPG    5PPH    5PPI    5PPJ    5PPK    5PPL    5PPM    5PPN    5PPO    5PPP    5PPQ    5PPR    5PPS    5PPT    5PPU    5PPV    5PPW    5PPX    5PPY    5PPZ    5PQ0    5PQ1    5PQ2    5PQ3    5PQ4    5PQ5    5PQ6    5PQ7    5PQ8    5PQ9    5PQA    5PQB    5PQC    5PQD    5PQE    5PQF    5PQG    5PQH    5PQI    5PQJ    5PQK    5PQL    5PQM    5PQN    5PQO    5PQP    5PQQ    5PQR    5PQS    5PQT    5PQU    5PQV    5PQW    5PQX    5PQY    5PQZ    5PR0    5PR1    5PR2    5PR4    5PR5    5PR6    5PR7    5PR8    5PR9    5PRA    5PRB    5PRD    5PRE    5PRF    5PRG    5PRH    5PRI    5PRJ    5PRK    5PRL    5PRM    5PRO    5PRP    5PRQ    5PRR    5PRS    5PRT    5PRU    5PRV    5PRW    5PRX    5PRY    5PRZ    5PS0    5PS1    5PS2    5PS3    5PS4    5PS5    5PS6    5PS7    5PS8    5PS9    5PSA    5PSB    5PSC    5PSD    5PSE    5PSF    5PSG    5PSH    5PSI    5PSJ    5PSK    5PSL    5PSM    5PSN    5PSO    5PSP    5PSQ    5PSR    5PSS    5PST    5PSU    5PSV    5PSW    5PSX    5PSY    5PSZ    5PT0    5PT1    5PT2    5PT3    5PT4    5PT5    5PT6    5PT7    5PT8    5PT9    5PTA    5PTB    5PTC    5PTE    5PTF    5PTG    5PTH    5PTJ    5PTK    5PTL    5PTM    5PTN    5PTO    5PTQ    5PTR    5PTS    5PTT    5PTU    5PTV    5PTW    5PTX    5PTY    5PTZ    5PU0    5PU1    5PU2    5PU3    5PU4    5PU5    5PU6    5PU7    5PU8    5PU9    5PUA    5PUB    5PUC    5PUD    5PUE    5PUF    5PUG    5PUH    5PUI    5PUJ    5PUK    5PUL    5PUM    5PUN    5PUO    5PUP    5PUQ    5PUR    5PUS    5PUT    5PUU    5PUV    5PUW    5PUX    5PUY    5PUZ    5PV0    5PV1    5PV2    5PV3    5PV4    5PV5    5PV6    5PV7    5PV8    5PV9    5PVA    5PVB    5PVC    5PVD    5PVE    5PVF    5PVG    5PVH    5PVI    5PVJ    5PVK    5PVL    5PVM    5PVN    5PVO    5PVP    5PVQ    5PVR    5PVS    5PVT    5PVU    5PVV    5PVW    5PVX    5PVY    5PVZ    5PW0    5PW1    5PW2    5PW3    5PW4    5PW5    5PW6    5PW7    5PW8    5PW9    5PWA    5PWB   
PDB (PDBSum)2KU3    2L43    2LQ6    3LYI    3RCW    4Z02    5AME    5AMF    5FG6    5GK9    5N49    5PNX    5PNY    5PNZ    5PO0    5PO1    5PO2    5PO3    5PO4    5PO5    5PO6    5PO7    5PO8    5PO9    5POA    5POB    5POC    5POD    5POE    5POF    5POG    5POH    5POI    5POJ    5POK    5POL    5POM    5PON    5POO    5POP    5POQ    5POR    5POS    5POT    5POU    5POV    5POW    5POX    5POY    5POZ    5PP0    5PP1    5PP2    5PP3    5PP4    5PP5    5PP6    5PP7    5PP8    5PP9    5PPA    5PPB    5PPC    5PPD    5PPE    5PPF    5PPG    5PPH    5PPI    5PPJ    5PPK    5PPL    5PPM    5PPN    5PPO    5PPP    5PPQ    5PPR    5PPS    5PPT    5PPU    5PPV    5PPW    5PPX    5PPY    5PPZ    5PQ0    5PQ1    5PQ2    5PQ3    5PQ4    5PQ5    5PQ6    5PQ7    5PQ8    5PQ9    5PQA    5PQB    5PQC    5PQD    5PQE    5PQF    5PQG    5PQH    5PQI    5PQJ    5PQK    5PQL    5PQM    5PQN    5PQO    5PQP    5PQQ    5PQR    5PQS    5PQT    5PQU    5PQV    5PQW    5PQX    5PQY    5PQZ    5PR0    5PR1    5PR2    5PR4    5PR5    5PR6    5PR7    5PR8    5PR9    5PRA    5PRB    5PRD    5PRE    5PRF    5PRG    5PRH    5PRI    5PRJ    5PRK    5PRL    5PRM    5PRO    5PRP    5PRQ    5PRR    5PRS    5PRT    5PRU    5PRV    5PRW    5PRX    5PRY    5PRZ    5PS0    5PS1    5PS2    5PS3    5PS4    5PS5    5PS6    5PS7    5PS8    5PS9    5PSA    5PSB    5PSC    5PSD    5PSE    5PSF    5PSG    5PSH    5PSI    5PSJ    5PSK    5PSL    5PSM    5PSN    5PSO    5PSP    5PSQ    5PSR    5PSS    5PST    5PSU    5PSV    5PSW    5PSX    5PSY    5PSZ    5PT0    5PT1    5PT2    5PT3    5PT4    5PT5    5PT6    5PT7    5PT8    5PT9    5PTA    5PTB    5PTC    5PTE    5PTF    5PTG    5PTH    5PTJ    5PTK    5PTL    5PTM    5PTN    5PTO    5PTQ    5PTR    5PTS    5PTT    5PTU    5PTV    5PTW    5PTX    5PTY    5PTZ    5PU0    5PU1    5PU2    5PU3    5PU4    5PU5    5PU6    5PU7    5PU8    5PU9    5PUA    5PUB    5PUC    5PUD    5PUE    5PUF    5PUG    5PUH    5PUI    5PUJ    5PUK    5PUL    5PUM    5PUN    5PUO    5PUP    5PUQ    5PUR    5PUS    5PUT    5PUU    5PUV    5PUW    5PUX    5PUY    5PUZ    5PV0    5PV1    5PV2    5PV3    5PV4    5PV5    5PV6    5PV7    5PV8    5PV9    5PVA    5PVB    5PVC    5PVD    5PVE    5PVF    5PVG    5PVH    5PVI    5PVJ    5PVK    5PVL    5PVM    5PVN    5PVO    5PVP    5PVQ    5PVR    5PVS    5PVT    5PVU    5PVV    5PVW    5PVX    5PVY    5PVZ    5PW0    5PW1    5PW2    5PW3    5PW4    5PW5    5PW6    5PW7    5PW8    5PW9    5PWA    5PWB   
PDB (IMB)2KU3    2L43    2LQ6    3LYI    3RCW    4Z02    5AME    5AMF    5FG6    5GK9    5N49    5PNX    5PNY    5PNZ    5PO0    5PO1    5PO2    5PO3    5PO4    5PO5    5PO6    5PO7    5PO8    5PO9    5POA    5POB    5POC    5POD    5POE    5POF    5POG    5POH    5POI    5POJ    5POK    5POL    5POM    5PON    5POO    5POP    5POQ    5POR    5POS    5POT    5POU    5POV    5POW    5POX    5POY    5POZ    5PP0    5PP1    5PP2    5PP3    5PP4    5PP5    5PP6    5PP7    5PP8    5PP9    5PPA    5PPB    5PPC    5PPD    5PPE    5PPF    5PPG    5PPH    5PPI    5PPJ    5PPK    5PPL    5PPM    5PPN    5PPO    5PPP    5PPQ    5PPR    5PPS    5PPT    5PPU    5PPV    5PPW    5PPX    5PPY    5PPZ    5PQ0    5PQ1    5PQ2    5PQ3    5PQ4    5PQ5    5PQ6    5PQ7    5PQ8    5PQ9    5PQA    5PQB    5PQC    5PQD    5PQE    5PQF    5PQG    5PQH    5PQI    5PQJ    5PQK    5PQL    5PQM    5PQN    5PQO    5PQP    5PQQ    5PQR    5PQS    5PQT    5PQU    5PQV    5PQW    5PQX    5PQY    5PQZ    5PR0    5PR1    5PR2    5PR4    5PR5    5PR6    5PR7    5PR8    5PR9    5PRA    5PRB    5PRD    5PRE    5PRF    5PRG    5PRH    5PRI    5PRJ    5PRK    5PRL    5PRM    5PRO    5PRP    5PRQ    5PRR    5PRS    5PRT    5PRU    5PRV    5PRW    5PRX    5PRY    5PRZ    5PS0    5PS1    5PS2    5PS3    5PS4    5PS5    5PS6    5PS7    5PS8    5PS9    5PSA    5PSB    5PSC    5PSD    5PSE    5PSF    5PSG    5PSH    5PSI    5PSJ    5PSK    5PSL    5PSM    5PSN    5PSO    5PSP    5PSQ    5PSR    5PSS    5PST    5PSU    5PSV    5PSW    5PSX    5PSY    5PSZ    5PT0    5PT1    5PT2    5PT3    5PT4    5PT5    5PT6    5PT7    5PT8    5PT9    5PTA    5PTB    5PTC    5PTE    5PTF    5PTG    5PTH    5PTJ    5PTK    5PTL    5PTM    5PTN    5PTO    5PTQ    5PTR    5PTS    5PTT    5PTU    5PTV    5PTW    5PTX    5PTY    5PTZ    5PU0    5PU1    5PU2    5PU3    5PU4    5PU5    5PU6    5PU7    5PU8    5PU9    5PUA    5PUB    5PUC    5PUD    5PUE    5PUF    5PUG    5PUH    5PUI    5PUJ    5PUK    5PUL    5PUM    5PUN    5PUO    5PUP    5PUQ    5PUR    5PUS    5PUT    5PUU    5PUV    5PUW    5PUX    5PUY    5PUZ    5PV0    5PV1    5PV2    5PV3    5PV4    5PV5    5PV6    5PV7    5PV8    5PV9    5PVA    5PVB    5PVC    5PVD    5PVE    5PVF    5PVG    5PVH    5PVI    5PVJ    5PVK    5PVL    5PVM    5PVN    5PVO    5PVP    5PVQ    5PVR    5PVS    5PVT    5PVU    5PVV    5PVW    5PVX    5PVY    5PVZ    5PW0    5PW1    5PW2    5PW3    5PW4    5PW5    5PW6    5PW7    5PW8    5PW9    5PWA    5PWB   
PDB (RSDB)2KU3    2L43    2LQ6    3LYI    3RCW    4Z02    5AME    5AMF    5FG6    5GK9    5N49    5PNX    5PNY    5PNZ    5PO0    5PO1    5PO2    5PO3    5PO4    5PO5    5PO6    5PO7    5PO8    5PO9    5POA    5POB    5POC    5POD    5POE    5POF    5POG    5POH    5POI    5POJ    5POK    5POL    5POM    5PON    5POO    5POP    5POQ    5POR    5POS    5POT    5POU    5POV    5POW    5POX    5POY    5POZ    5PP0    5PP1    5PP2    5PP3    5PP4    5PP5    5PP6    5PP7    5PP8    5PP9    5PPA    5PPB    5PPC    5PPD    5PPE    5PPF    5PPG    5PPH    5PPI    5PPJ    5PPK    5PPL    5PPM    5PPN    5PPO    5PPP    5PPQ    5PPR    5PPS    5PPT    5PPU    5PPV    5PPW    5PPX    5PPY    5PPZ    5PQ0    5PQ1    5PQ2    5PQ3    5PQ4    5PQ5    5PQ6    5PQ7    5PQ8    5PQ9    5PQA    5PQB    5PQC    5PQD    5PQE    5PQF    5PQG    5PQH    5PQI    5PQJ    5PQK    5PQL    5PQM    5PQN    5PQO    5PQP    5PQQ    5PQR    5PQS    5PQT    5PQU    5PQV    5PQW    5PQX    5PQY    5PQZ    5PR0    5PR1    5PR2    5PR4    5PR5    5PR6    5PR7    5PR8    5PR9    5PRA    5PRB    5PRD    5PRE    5PRF    5PRG    5PRH    5PRI    5PRJ    5PRK    5PRL    5PRM    5PRO    5PRP    5PRQ    5PRR    5PRS    5PRT    5PRU    5PRV    5PRW    5PRX    5PRY    5PRZ    5PS0    5PS1    5PS2    5PS3    5PS4    5PS5    5PS6    5PS7    5PS8    5PS9    5PSA    5PSB    5PSC    5PSD    5PSE    5PSF    5PSG    5PSH    5PSI    5PSJ    5PSK    5PSL    5PSM    5PSN    5PSO    5PSP    5PSQ    5PSR    5PSS    5PST    5PSU    5PSV    5PSW    5PSX    5PSY    5PSZ    5PT0    5PT1    5PT2    5PT3    5PT4    5PT5    5PT6    5PT7    5PT8    5PT9    5PTA    5PTB    5PTC    5PTE    5PTF    5PTG    5PTH    5PTJ    5PTK    5PTL    5PTM    5PTN    5PTO    5PTQ    5PTR    5PTS    5PTT    5PTU    5PTV    5PTW    5PTX    5PTY    5PTZ    5PU0    5PU1    5PU2    5PU3    5PU4    5PU5    5PU6    5PU7    5PU8    5PU9    5PUA    5PUB    5PUC    5PUD    5PUE    5PUF    5PUG    5PUH    5PUI    5PUJ    5PUK    5PUL    5PUM    5PUN    5PUO    5PUP    5PUQ    5PUR    5PUS    5PUT    5PUU    5PUV    5PUW    5PUX    5PUY    5PUZ    5PV0    5PV1    5PV2    5PV3    5PV4    5PV5    5PV6    5PV7    5PV8    5PV9    5PVA    5PVB    5PVC    5PVD    5PVE    5PVF    5PVG    5PVH    5PVI    5PVJ    5PVK    5PVL    5PVM    5PVN    5PVO    5PVP    5PVQ    5PVR    5PVS    5PVT    5PVU    5PVV    5PVW    5PVX    5PVY    5PVZ    5PW0    5PW1    5PW2    5PW3    5PW4    5PW5    5PW6    5PW7    5PW8    5PW9    5PWA    5PWB   
Structural Biology KnowledgeBase2KU3    2L43    2LQ6    3LYI    3RCW    4Z02    5AME    5AMF    5FG6    5GK9    5N49    5PNX    5PNY    5PNZ    5PO0    5PO1    5PO2    5PO3    5PO4    5PO5    5PO6    5PO7    5PO8    5PO9    5POA    5POB    5POC    5POD    5POE    5POF    5POG    5POH    5POI    5POJ    5POK    5POL    5POM    5PON    5POO    5POP    5POQ    5POR    5POS    5POT    5POU    5POV    5POW    5POX    5POY    5POZ    5PP0    5PP1    5PP2    5PP3    5PP4    5PP5    5PP6    5PP7    5PP8    5PP9    5PPA    5PPB    5PPC    5PPD    5PPE    5PPF    5PPG    5PPH    5PPI    5PPJ    5PPK    5PPL    5PPM    5PPN    5PPO    5PPP    5PPQ    5PPR    5PPS    5PPT    5PPU    5PPV    5PPW    5PPX    5PPY    5PPZ    5PQ0    5PQ1    5PQ2    5PQ3    5PQ4    5PQ5    5PQ6    5PQ7    5PQ8    5PQ9    5PQA    5PQB    5PQC    5PQD    5PQE    5PQF    5PQG    5PQH    5PQI    5PQJ    5PQK    5PQL    5PQM    5PQN    5PQO    5PQP    5PQQ    5PQR    5PQS    5PQT    5PQU    5PQV    5PQW    5PQX    5PQY    5PQZ    5PR0    5PR1    5PR2    5PR4    5PR5    5PR6    5PR7    5PR8    5PR9    5PRA    5PRB    5PRD    5PRE    5PRF    5PRG    5PRH    5PRI    5PRJ    5PRK    5PRL    5PRM    5PRO    5PRP    5PRQ    5PRR    5PRS    5PRT    5PRU    5PRV    5PRW    5PRX    5PRY    5PRZ    5PS0    5PS1    5PS2    5PS3    5PS4    5PS5    5PS6    5PS7    5PS8    5PS9    5PSA    5PSB    5PSC    5PSD    5PSE    5PSF    5PSG    5PSH    5PSI    5PSJ    5PSK    5PSL    5PSM    5PSN    5PSO    5PSP    5PSQ    5PSR    5PSS    5PST    5PSU    5PSV    5PSW    5PSX    5PSY    5PSZ    5PT0    5PT1    5PT2    5PT3    5PT4    5PT5    5PT6    5PT7    5PT8    5PT9    5PTA    5PTB    5PTC    5PTE    5PTF    5PTG    5PTH    5PTJ    5PTK    5PTL    5PTM    5PTN    5PTO    5PTQ    5PTR    5PTS    5PTT    5PTU    5PTV    5PTW    5PTX    5PTY    5PTZ    5PU0    5PU1    5PU2    5PU3    5PU4    5PU5    5PU6    5PU7    5PU8    5PU9    5PUA    5PUB    5PUC    5PUD    5PUE    5PUF    5PUG    5PUH    5PUI    5PUJ    5PUK    5PUL    5PUM    5PUN    5PUO    5PUP    5PUQ    5PUR    5PUS    5PUT    5PUU    5PUV    5PUW    5PUX    5PUY    5PUZ    5PV0    5PV1    5PV2    5PV3    5PV4    5PV5    5PV6    5PV7    5PV8    5PV9    5PVA    5PVB    5PVC    5PVD    5PVE    5PVF    5PVG    5PVH    5PVI    5PVJ    5PVK    5PVL    5PVM    5PVN    5PVO    5PVP    5PVQ    5PVR    5PVS    5PVT    5PVU    5PVV    5PVW    5PVX    5PVY    5PVZ    5PW0    5PW1    5PW2    5PW3    5PW4    5PW5    5PW6    5PW7    5PW8    5PW9    5PWA    5PWB   
SCOP (Structural Classification of Proteins)2KU3    2L43    2LQ6    3LYI    3RCW    4Z02    5AME    5AMF    5FG6    5GK9    5N49    5PNX    5PNY    5PNZ    5PO0    5PO1    5PO2    5PO3    5PO4    5PO5    5PO6    5PO7    5PO8    5PO9    5POA    5POB    5POC    5POD    5POE    5POF    5POG    5POH    5POI    5POJ    5POK    5POL    5POM    5PON    5POO    5POP    5POQ    5POR    5POS    5POT    5POU    5POV    5POW    5POX    5POY    5POZ    5PP0    5PP1    5PP2    5PP3    5PP4    5PP5    5PP6    5PP7    5PP8    5PP9    5PPA    5PPB    5PPC    5PPD    5PPE    5PPF    5PPG    5PPH    5PPI    5PPJ    5PPK    5PPL    5PPM    5PPN    5PPO    5PPP    5PPQ    5PPR    5PPS    5PPT    5PPU    5PPV    5PPW    5PPX    5PPY    5PPZ    5PQ0    5PQ1    5PQ2    5PQ3    5PQ4    5PQ5    5PQ6    5PQ7    5PQ8    5PQ9    5PQA    5PQB    5PQC    5PQD    5PQE    5PQF    5PQG    5PQH    5PQI    5PQJ    5PQK    5PQL    5PQM    5PQN    5PQO    5PQP    5PQQ    5PQR    5PQS    5PQT    5PQU    5PQV    5PQW    5PQX    5PQY    5PQZ    5PR0    5PR1    5PR2    5PR4    5PR5    5PR6    5PR7    5PR8    5PR9    5PRA    5PRB    5PRD    5PRE    5PRF    5PRG    5PRH    5PRI    5PRJ    5PRK    5PRL    5PRM    5PRO    5PRP    5PRQ    5PRR    5PRS    5PRT    5PRU    5PRV    5PRW    5PRX    5PRY    5PRZ    5PS0    5PS1    5PS2    5PS3    5PS4    5PS5    5PS6    5PS7    5PS8    5PS9    5PSA    5PSB    5PSC    5PSD    5PSE    5PSF    5PSG    5PSH    5PSI    5PSJ    5PSK    5PSL    5PSM    5PSN    5PSO    5PSP    5PSQ    5PSR    5PSS    5PST    5PSU    5PSV    5PSW    5PSX    5PSY    5PSZ    5PT0    5PT1    5PT2    5PT3    5PT4    5PT5    5PT6    5PT7    5PT8    5PT9    5PTA    5PTB    5PTC    5PTE    5PTF    5PTG    5PTH    5PTJ    5PTK    5PTL    5PTM    5PTN    5PTO    5PTQ    5PTR    5PTS    5PTT    5PTU    5PTV    5PTW    5PTX    5PTY    5PTZ    5PU0    5PU1    5PU2    5PU3    5PU4    5PU5    5PU6    5PU7    5PU8    5PU9    5PUA    5PUB    5PUC    5PUD    5PUE    5PUF    5PUG    5PUH    5PUI    5PUJ    5PUK    5PUL    5PUM    5PUN    5PUO    5PUP    5PUQ    5PUR    5PUS    5PUT    5PUU    5PUV    5PUW    5PUX    5PUY    5PUZ    5PV0    5PV1    5PV2    5PV3    5PV4    5PV5    5PV6    5PV7    5PV8    5PV9    5PVA    5PVB    5PVC    5PVD    5PVE    5PVF    5PVG    5PVH    5PVI    5PVJ    5PVK    5PVL    5PVM    5PVN    5PVO    5PVP    5PVQ    5PVR    5PVS    5PVT    5PVU    5PVV    5PVW    5PVX    5PVY    5PVZ    5PW0    5PW1    5PW2    5PW3    5PW4    5PW5    5PW6    5PW7    5PW8    5PW9    5PWA    5PWB   
CATH (Classification of proteins structures)2KU3    2L43    2LQ6    3LYI    3RCW    4Z02    5AME    5AMF    5FG6    5GK9    5N49    5PNX    5PNY    5PNZ    5PO0    5PO1    5PO2    5PO3    5PO4    5PO5    5PO6    5PO7    5PO8    5PO9    5POA    5POB    5POC    5POD    5POE    5POF    5POG    5POH    5POI    5POJ    5POK    5POL    5POM    5PON    5POO    5POP    5POQ    5POR    5POS    5POT    5POU    5POV    5POW    5POX    5POY    5POZ    5PP0    5PP1    5PP2    5PP3    5PP4    5PP5    5PP6    5PP7    5PP8    5PP9    5PPA    5PPB    5PPC    5PPD    5PPE    5PPF    5PPG    5PPH    5PPI    5PPJ    5PPK    5PPL    5PPM    5PPN    5PPO    5PPP    5PPQ    5PPR    5PPS    5PPT    5PPU    5PPV    5PPW    5PPX    5PPY    5PPZ    5PQ0    5PQ1    5PQ2    5PQ3    5PQ4    5PQ5    5PQ6    5PQ7    5PQ8    5PQ9    5PQA    5PQB    5PQC    5PQD    5PQE    5PQF    5PQG    5PQH    5PQI    5PQJ    5PQK    5PQL    5PQM    5PQN    5PQO    5PQP    5PQQ    5PQR    5PQS    5PQT    5PQU    5PQV    5PQW    5PQX    5PQY    5PQZ    5PR0    5PR1    5PR2    5PR4    5PR5    5PR6    5PR7    5PR8    5PR9    5PRA    5PRB    5PRD    5PRE    5PRF    5PRG    5PRH    5PRI    5PRJ    5PRK    5PRL    5PRM    5PRO    5PRP    5PRQ    5PRR    5PRS    5PRT    5PRU    5PRV    5PRW    5PRX    5PRY    5PRZ    5PS0    5PS1    5PS2    5PS3    5PS4    5PS5    5PS6    5PS7    5PS8    5PS9    5PSA    5PSB    5PSC    5PSD    5PSE    5PSF    5PSG    5PSH    5PSI    5PSJ    5PSK    5PSL    5PSM    5PSN    5PSO    5PSP    5PSQ    5PSR    5PSS    5PST    5PSU    5PSV    5PSW    5PSX    5PSY    5PSZ    5PT0    5PT1    5PT2    5PT3    5PT4    5PT5    5PT6    5PT7    5PT8    5PT9    5PTA    5PTB    5PTC    5PTE    5PTF    5PTG    5PTH    5PTJ    5PTK    5PTL    5PTM    5PTN    5PTO    5PTQ    5PTR    5PTS    5PTT    5PTU    5PTV    5PTW    5PTX    5PTY    5PTZ    5PU0    5PU1    5PU2    5PU3    5PU4    5PU5    5PU6    5PU7    5PU8    5PU9    5PUA    5PUB    5PUC    5PUD    5PUE    5PUF    5PUG    5PUH    5PUI    5PUJ    5PUK    5PUL    5PUM    5PUN    5PUO    5PUP    5PUQ    5PUR    5PUS    5PUT    5PUU    5PUV    5PUW    5PUX    5PUY    5PUZ    5PV0    5PV1    5PV2    5PV3    5PV4    5PV5    5PV6    5PV7    5PV8    5PV9    5PVA    5PVB    5PVC    5PVD    5PVE    5PVF    5PVG    5PVH    5PVI    5PVJ    5PVK    5PVL    5PVM    5PVN    5PVO    5PVP    5PVQ    5PVR    5PVS    5PVT    5PVU    5PVV    5PVW    5PVX    5PVY    5PVZ    5PW0    5PW1    5PW2    5PW3    5PW4    5PW5    5PW6    5PW7    5PW8    5PW9    5PWA    5PWB   
SuperfamilyO95696
Human Protein Atlas [tissue]ENSG00000100425-BRD1 [tissue]
Peptide AtlasO95696
HPRD06848
IPIIPI00032214   IPI00384471   IPI00922474   IPI00941079   IPI01011372   IPI00556201   
Protein Interaction databases
DIP (DOE-UCLA)O95696
IntAct (EBI)O95696
FunCoupENSG00000100425
BioGRIDBRD1
STRING (EMBL)BRD1
ZODIACBRD1
Ontologies - Pathways
QuickGOO95696
Ontology : AmiGOnucleus  nucleus  nuclear speck  dendrite  response to immobilization stress  histone binding  perikaryon  histone H3 acetylation  metal ion binding  response to electrical stimulus  MOZ/MORF histone acetyltransferase complex  
Ontology : EGO-EBInucleus  nucleus  nuclear speck  dendrite  response to immobilization stress  histone binding  perikaryon  histone H3 acetylation  metal ion binding  response to electrical stimulus  MOZ/MORF histone acetyltransferase complex  
NDEx NetworkBRD1
Atlas of Cancer Signalling NetworkBRD1
Wikipedia pathwaysBRD1
Orthology - Evolution
OrthoDB23774
GeneTree (enSembl)ENSG00000100425
Phylogenetic Trees/Animal Genes : TreeFamBRD1
HOVERGENO95696
HOGENOMO95696
Homologs : HomoloGeneBRD1
Homology/Alignments : Family Browser (UCSC)BRD1
Gene fusions - Rearrangements
Fusion : MitelmanBRD1/APOL5 [22q13.33/22q12.3]  
Fusion : MitelmanBRD1/MAPK12 [22q13.33/22q13.33]  [t(22;22)(q13;q13)]  
Fusion : MitelmanBRD1/MLC1 [22q13.33/22q13.33]  [t(22;22)(q13;q13)]  
Fusion : MitelmanC22orf34/BRD1 [22q13.33/22q13.33]  [t(22;22)(q13;q13)]  
Fusion : MitelmanPAX5/BRD1 [9p13.2/22q13.33]  [t(9;22)(p13;q13)]  
Fusion PortalBRD1 22q13.33 APOL5 22q12.3 LUAD
Fusion PortalBRD1 22q13.33 MAPK12 22q13.33 GBM
Fusion PortalBRD1 22q13.33 MLC1 22q13.33 LUAD
Fusion PortalC22orf34 22q13.33 BRD1 22q13.33 LAML
Fusion : QuiverBRD1
Polymorphisms : SNP and Copy number variants
NCBI Variation ViewerBRD1 [hg38]
dbSNP Single Nucleotide Polymorphism (NCBI)BRD1
dbVarBRD1
ClinVarBRD1
1000_GenomesBRD1 
Exome Variant ServerBRD1
ExAC (Exome Aggregation Consortium)ENSG00000100425
GNOMAD BrowserENSG00000100425
Varsome BrowserBRD1
Genetic variants : HAPMAP23774
Genomic Variants (DGV)BRD1 [DGVbeta]
DECIPHERBRD1 [patients]   [syndromes]   [variants]   [genes]  
CONAN: Copy Number AnalysisBRD1 
Mutations
ICGC Data PortalBRD1 
TCGA Data PortalBRD1 
Broad Tumor PortalBRD1
OASIS PortalBRD1 [ Somatic mutations - Copy number]
Somatic Mutations in Cancer : COSMICBRD1  [overview]  [genome browser]  [tissue]  [distribution]  
Mutations and Diseases : HGMDBRD1
LOVD (Leiden Open Variation Database)Whole genome datasets
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD - Leiden Open Variation Database
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD 3.0 shared installation
BioMutasearch BRD1
DgiDB (Drug Gene Interaction Database)BRD1
DoCM (Curated mutations)BRD1 (select the gene name)
CIViC (Clinical Interpretations of Variants in Cancer)BRD1 (select a term)
intoGenBRD1
Cancer3DBRD1(select the gene name)
Impact of mutations[PolyPhen2] [Provean] [Buck Institute : MutDB] [Mutation Assessor] [Mutanalyser]
Diseases
OMIM604589   
Orphanet
DisGeNETBRD1
MedgenBRD1
Genetic Testing Registry BRD1
NextProtO95696 [Medical]
TSGene23774
GENETestsBRD1
Target ValidationBRD1
Huge Navigator BRD1 [HugePedia]
snp3D : Map Gene to Disease23774
BioCentury BCIQBRD1
ClinGenBRD1
Clinical trials, drugs, therapy
Chemical/Protein Interactions : CTD23774
Chemical/Pharm GKB GenePA25413
Clinical trialBRD1
Miscellaneous
canSAR (ICR)BRD1 (select the gene name)
Probes
Litterature
PubMed42 Pubmed reference(s) in Entrez
GeneRIFsGene References Into Functions (Entrez)
CoreMineBRD1
EVEXBRD1
GoPubMedBRD1
iHOPBRD1
Genes in titleautomatic search in PubMed
REVIEW articlesautomatic search in PubMed
Last year publicationsautomatic search in PubMed

Search in all EBI   NCBI

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Tue Nov 6 10:54:26 CET 2018

Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

For comments and suggestions or contributions, please contact us

jlhuret@AtlasGeneticsOncology.org.