Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

H3C1 (H3 clustered histone 1)

Identity

Alias (NCBI)H3/A
H3C10
H3C11
H3C12
H3C2
H3C3
H3C4
H3C6
H3C7
H3C8
H3FA
HIST1H3A
HGNC (Hugo) H3C1
HGNC Alias symbH3/A
HGNC Previous nameH3FA
 HIST1H3A
HGNC Previous nameH3 histone family, member A
 histone 1, H3a
 histone cluster 1, H3a
 histone cluster 1 H3 family member a
LocusID (NCBI) 8350
Atlas_Id 55548
Location 6p22.2  [Link to chromosome band 6p22]
Location_base_pair Starts at 26020451 and ends at 26020958 bp from pter ( according to hg38-Dec_2013)
Fusion genes
(updated 2017)
Data from Atlas, Mitelman, Cosmic Fusion, Fusion Cancer, TCGA fusion databases with official HUGO symbols (see references in chromosomal bands)
Note

Non-annotated gene. Preliminary data : if you are an author
who wish to write a full paper/card on this gene, go to  How to contribute



External links

Nomenclature
HGNC (Hugo)H3C1   4766
Cards
Entrez_Gene (NCBI)H3C1  8350  H3 clustered histone 1
AliasesH3/A; H3C10; H3C11; H3C12; 
H3C2; H3C3; H3C4; H3C6; H3C7; H3C8; H3FA; HIST1H3A
GeneCards (Weizmann)H3C1
Ensembl hg19 (Hinxton)ENSG00000275714 [Gene_View]
Ensembl hg38 (Hinxton)ENSG00000275714 [Gene_View]  ENSG00000275714 [Sequence]  chr6:26020451-26020958 [Contig_View]  H3C1 [Vega]
ICGC DataPortalENSG00000275714
TCGA cBioPortalH3C1
AceView (NCBI)H3C1
Genatlas (Paris)H3C1
WikiGenes8350
SOURCE (Princeton)H3C1
Genetics Home Reference (NIH)H3C1
Genomic and cartography
GoldenPath hg38 (UCSC)H3C1  -     chr6:26020451-26020958 +  -   [Description]    (hg38-Dec_2013)
GoldenPath hg19 (UCSC)H3C1  -     -   [Description]    (hg19-Feb_2009)
GoldenPathH3C1 - - [CytoView hg19]  H3C1 - - [CytoView hg38]
ImmunoBaseENSG00000275714
genome Data Viewer NCBIH3C1 [Mapview hg19]  
OMIM602810   
Gene and transcription
Genbank (Entrez)BC066245 BC066246 BC066247 BC067490 BC067491
RefSeq transcript (Entrez)NM_003529
RefSeq genomic (Entrez)
Consensus coding sequences : CCDS (NCBI)H3C1
Alternative Splicing GalleryENSG00000275714
Gene ExpressionH3C1 [ NCBI-GEO ]   H3C1 [ EBI - ARRAY_EXPRESS ]   H3C1 [ SEEK ]   H3C1 [ MEM ]
Gene Expression Viewer (FireBrowse)H3C1 [ Firebrowse - Broad ]
GenevisibleExpression of H3C1 in : [tissues]  [cell-lines]  [cancer]  [perturbations]  
BioGPS (Tissue expression)8350
GTEX Portal (Tissue expression)H3C1
Human Protein AtlasENSG00000275714-H3C1 [pathology]   [cell]   [tissue]
Protein : pattern, domain, 3D structure
UniProt/SwissProtP68431   [function]  [subcellular_location]  [family_and_domains]  [pathology_and_biotech]  [ptm_processing]  [expression]  [interaction]
NextProtP68431  [Sequence]  [Exons]  [Medical]  [Publications]
With graphics : InterProP68431
Splice isoforms : SwissVarP68431
PhosPhoSitePlusP68431
Domaine pattern : Prosite (Expaxy)HISTONE_H3_1 (PS00322)    HISTONE_H3_2 (PS00959)   
Domains : Interpro (EBI)Histone-fold    Histone_H2A/H2B/H3    Histone_H3/CENP-A   
Domain families : Pfam (Sanger)Histone (PF00125)   
Domain families : Pfam (NCBI)pfam00125   
Domain families : Smart (EMBL)H3 (SM00428)  
Conserved Domain (NCBI)H3C1
DMDM Disease mutations8350
Blocks (Seattle)H3C1
PDB (RSDB)1CS9    1CT6    1O9S    1Q3L    2B2T    2B2U    2B2V    2B2W    2C1J    2C1N    2CO0    2CV5    2FSA    2KWJ    2KWK    2L75    2LBM    2LGG    2M0O    2NDF    2NDG    2OQ6    2OT7    2OX0    2RI7    2RR4    2UXN    2V85    2V89    2VNF    2VPG    2X0L    3A1B    3AFA    3AVR    3AYW    3AZE    3AZF    3AZG    3AZH    3AZI    3AZJ    3AZK    3AZL    3AZM    3AZN    3B95    3FDT    3KMT    3KQI    3LQI    3LQJ    3MP1    3O34    3O35    3O37    3QJ6    3RIG    3RIY    3SOU    3SOW    3U31    3U3D    3U4S    3U5N    3U5O    3U5P    3UEE    3UEF    3UIG    3UII    3UIK    3V43    3W96    3W97    3W98    3W99    3WA9    3WAA    3WKJ    3X1S    3X1T    3X1U    3X1V    3ZG6    3ZVY    4A0J    4A0N    4A7J    4BD3    4C1Q    4F4U    4F56    4FWF    4HON    4I51    4L7X    4LK9    4LKA    4LLB    4LXL    4N4H    4QBQ    4QBR    4QBS    4TN7    4U68    4UP0    4UY4    4X3K    4Y6L    4YHP    4YHZ    4YM5    4YM6    4Z0R    4Z2M    5AV5    5AV6    5AV8    5AV9    5AVB    5AVC    5B24    5B2I    5B2J    5B31    5C11    5C13    5C3I    5CPI    5CPJ    5CPK    5D6Y    5DAH    5FB0    5FB1    5FFV    5GH9    5GSE    5GSU    5GT0    5GT3    5GTC    5H6Q    5H6R    5HJB    5HJC    5HJD    5HYN    5IQL    5J3V    5J9S    5JHN    5JIN    5JIY    5JJ0    5JRG    5KJH    5KJI    5KKL    5LUG    5M5G    5MR8    5NNC    5NND    5OY3    5SVX    5SVY    5SZB    5SZC    5T0K    5T0M    5T1G    5T1I    5T8R    5TBN    5TDR    5TDW    5U2J    5V21    5V22    5VA6    5VAB    5VGE    5VNB    5WFC    5WLE    5WVO    5WXG    5WXH    5WYI    5X60    5XF3    5XF4    5XF5    5XFQ    5XFR    5XNV    5XTZ    5Y0C    5Y0D    5Y20    5Y2F    5Z23    5Z30    6AXJ    6AZE    6BHD    6BHE    6BHG    6BHH    6BHI    6D07    6D08    6E83    6E86    6F6D    6HKT    6HTS    6IEU    6IIS    6IIT    6IPU    6IQ4    6JR0    6JR1    6JXD    6K1I    6K1J    6K1K    6KVD    6L49    6L4A    6MIL    6MIM    6MIN    6MIO    6MIQ    6R8Y    6R8Z    6R90    6R91    6R92    6R93    6R94    6UPK    6UPL    6V41    6V92   
PDB Europe1CS9    1CT6    1O9S    1Q3L    2B2T    2B2U    2B2V    2B2W    2C1J    2C1N    2CO0    2CV5    2FSA    2KWJ    2KWK    2L75    2LBM    2LGG    2M0O    2NDF    2NDG    2OQ6    2OT7    2OX0    2RI7    2RR4    2UXN    2V85    2V89    2VNF    2VPG    2X0L    3A1B    3AFA    3AVR    3AYW    3AZE    3AZF    3AZG    3AZH    3AZI    3AZJ    3AZK    3AZL    3AZM    3AZN    3B95    3FDT    3KMT    3KQI    3LQI    3LQJ    3MP1    3O34    3O35    3O37    3QJ6    3RIG    3RIY    3SOU    3SOW    3U31    3U3D    3U4S    3U5N    3U5O    3U5P    3UEE    3UEF    3UIG    3UII    3UIK    3V43    3W96    3W97    3W98    3W99    3WA9    3WAA    3WKJ    3X1S    3X1T    3X1U    3X1V    3ZG6    3ZVY    4A0J    4A0N    4A7J    4BD3    4C1Q    4F4U    4F56    4FWF    4HON    4I51    4L7X    4LK9    4LKA    4LLB    4LXL    4N4H    4QBQ    4QBR    4QBS    4TN7    4U68    4UP0    4UY4    4X3K    4Y6L    4YHP    4YHZ    4YM5    4YM6    4Z0R    4Z2M    5AV5    5AV6    5AV8    5AV9    5AVB    5AVC    5B24    5B2I    5B2J    5B31    5C11    5C13    5C3I    5CPI    5CPJ    5CPK    5D6Y    5DAH    5FB0    5FB1    5FFV    5GH9    5GSE    5GSU    5GT0    5GT3    5GTC    5H6Q    5H6R    5HJB    5HJC    5HJD    5HYN    5IQL    5J3V    5J9S    5JHN    5JIN    5JIY    5JJ0    5JRG    5KJH    5KJI    5KKL    5LUG    5M5G    5MR8    5NNC    5NND    5OY3    5SVX    5SVY    5SZB    5SZC    5T0K    5T0M    5T1G    5T1I    5T8R    5TBN    5TDR    5TDW    5U2J    5V21    5V22    5VA6    5VAB    5VGE    5VNB    5WFC    5WLE    5WVO    5WXG    5WXH    5WYI    5X60    5XF3    5XF4    5XF5    5XFQ    5XFR    5XNV    5XTZ    5Y0C    5Y0D    5Y20    5Y2F    5Z23    5Z30    6AXJ    6AZE    6BHD    6BHE    6BHG    6BHH    6BHI    6D07    6D08    6E83    6E86    6F6D    6HKT    6HTS    6IEU    6IIS    6IIT    6IPU    6IQ4    6JR0    6JR1    6JXD    6K1I    6K1J    6K1K    6KVD    6L49    6L4A    6MIL    6MIM    6MIN    6MIO    6MIQ    6R8Y    6R8Z    6R90    6R91    6R92    6R93    6R94    6UPK    6UPL    6V41    6V92   
PDB (PDBSum)1CS9    1CT6    1O9S    1Q3L    2B2T    2B2U    2B2V    2B2W    2C1J    2C1N    2CO0    2CV5    2FSA    2KWJ    2KWK    2L75    2LBM    2LGG    2M0O    2NDF    2NDG    2OQ6    2OT7    2OX0    2RI7    2RR4    2UXN    2V85    2V89    2VNF    2VPG    2X0L    3A1B    3AFA    3AVR    3AYW    3AZE    3AZF    3AZG    3AZH    3AZI    3AZJ    3AZK    3AZL    3AZM    3AZN    3B95    3FDT    3KMT    3KQI    3LQI    3LQJ    3MP1    3O34    3O35    3O37    3QJ6    3RIG    3RIY    3SOU    3SOW    3U31    3U3D    3U4S    3U5N    3U5O    3U5P    3UEE    3UEF    3UIG    3UII    3UIK    3V43    3W96    3W97    3W98    3W99    3WA9    3WAA    3WKJ    3X1S    3X1T    3X1U    3X1V    3ZG6    3ZVY    4A0J    4A0N    4A7J    4BD3    4C1Q    4F4U    4F56    4FWF    4HON    4I51    4L7X    4LK9    4LKA    4LLB    4LXL    4N4H    4QBQ    4QBR    4QBS    4TN7    4U68    4UP0    4UY4    4X3K    4Y6L    4YHP    4YHZ    4YM5    4YM6    4Z0R    4Z2M    5AV5    5AV6    5AV8    5AV9    5AVB    5AVC    5B24    5B2I    5B2J    5B31    5C11    5C13    5C3I    5CPI    5CPJ    5CPK    5D6Y    5DAH    5FB0    5FB1    5FFV    5GH9    5GSE    5GSU    5GT0    5GT3    5GTC    5H6Q    5H6R    5HJB    5HJC    5HJD    5HYN    5IQL    5J3V    5J9S    5JHN    5JIN    5JIY    5JJ0    5JRG    5KJH    5KJI    5KKL    5LUG    5M5G    5MR8    5NNC    5NND    5OY3    5SVX    5SVY    5SZB    5SZC    5T0K    5T0M    5T1G    5T1I    5T8R    5TBN    5TDR    5TDW    5U2J    5V21    5V22    5VA6    5VAB    5VGE    5VNB    5WFC    5WLE    5WVO    5WXG    5WXH    5WYI    5X60    5XF3    5XF4    5XF5    5XFQ    5XFR    5XNV    5XTZ    5Y0C    5Y0D    5Y20    5Y2F    5Z23    5Z30    6AXJ    6AZE    6BHD    6BHE    6BHG    6BHH    6BHI    6D07    6D08    6E83    6E86    6F6D    6HKT    6HTS    6IEU    6IIS    6IIT    6IPU    6IQ4    6JR0    6JR1    6JXD    6K1I    6K1J    6K1K    6KVD    6L49    6L4A    6MIL    6MIM    6MIN    6MIO    6MIQ    6R8Y    6R8Z    6R90    6R91    6R92    6R93    6R94    6UPK    6UPL    6V41    6V92   
PDB (IMB)1CS9    1CT6    1O9S    1Q3L    2B2T    2B2U    2B2V    2B2W    2C1J    2C1N    2CO0    2CV5    2FSA    2KWJ    2KWK    2L75    2LBM    2LGG    2M0O    2NDF    2NDG    2OQ6    2OT7    2OX0    2RI7    2RR4    2UXN    2V85    2V89    2VNF    2VPG    2X0L    3A1B    3AFA    3AVR    3AYW    3AZE    3AZF    3AZG    3AZH    3AZI    3AZJ    3AZK    3AZL    3AZM    3AZN    3B95    3FDT    3KMT    3KQI    3LQI    3LQJ    3MP1    3O34    3O35    3O37    3QJ6    3RIG    3RIY    3SOU    3SOW    3U31    3U3D    3U4S    3U5N    3U5O    3U5P    3UEE    3UEF    3UIG    3UII    3UIK    3V43    3W96    3W97    3W98    3W99    3WA9    3WAA    3WKJ    3X1S    3X1T    3X1U    3X1V    3ZG6    3ZVY    4A0J    4A0N    4A7J    4BD3    4C1Q    4F4U    4F56    4FWF    4HON    4I51    4L7X    4LK9    4LKA    4LLB    4LXL    4N4H    4QBQ    4QBR    4QBS    4TN7    4U68    4UP0    4UY4    4X3K    4Y6L    4YHP    4YHZ    4YM5    4YM6    4Z0R    4Z2M    5AV5    5AV6    5AV8    5AV9    5AVB    5AVC    5B24    5B2I    5B2J    5B31    5C11    5C13    5C3I    5CPI    5CPJ    5CPK    5D6Y    5DAH    5FB0    5FB1    5FFV    5GH9    5GSE    5GSU    5GT0    5GT3    5GTC    5H6Q    5H6R    5HJB    5HJC    5HJD    5HYN    5IQL    5J3V    5J9S    5JHN    5JIN    5JIY    5JJ0    5JRG    5KJH    5KJI    5KKL    5LUG    5M5G    5MR8    5NNC    5NND    5OY3    5SVX    5SVY    5SZB    5SZC    5T0K    5T0M    5T1G    5T1I    5T8R    5TBN    5TDR    5TDW    5U2J    5V21    5V22    5VA6    5VAB    5VGE    5VNB    5WFC    5WLE    5WVO    5WXG    5WXH    5WYI    5X60    5XF3    5XF4    5XF5    5XFQ    5XFR    5XNV    5XTZ    5Y0C    5Y0D    5Y20    5Y2F    5Z23    5Z30    6AXJ    6AZE    6BHD    6BHE    6BHG    6BHH    6BHI    6D07    6D08    6E83    6E86    6F6D    6HKT    6HTS    6IEU    6IIS    6IIT    6IPU    6IQ4    6JR0    6JR1    6JXD    6K1I    6K1J    6K1K    6KVD    6L49    6L4A    6MIL    6MIM    6MIN    6MIO    6MIQ    6R8Y    6R8Z    6R90    6R91    6R92    6R93    6R94    6UPK    6UPL    6V41    6V92   
Structural Biology KnowledgeBase1CS9    1CT6    1O9S    1Q3L    2B2T    2B2U    2B2V    2B2W    2C1J    2C1N    2CO0    2CV5    2FSA    2KWJ    2KWK    2L75    2LBM    2LGG    2M0O    2NDF    2NDG    2OQ6    2OT7    2OX0    2RI7    2RR4    2UXN    2V85    2V89    2VNF    2VPG    2X0L    3A1B    3AFA    3AVR    3AYW    3AZE    3AZF    3AZG    3AZH    3AZI    3AZJ    3AZK    3AZL    3AZM    3AZN    3B95    3FDT    3KMT    3KQI    3LQI    3LQJ    3MP1    3O34    3O35    3O37    3QJ6    3RIG    3RIY    3SOU    3SOW    3U31    3U3D    3U4S    3U5N    3U5O    3U5P    3UEE    3UEF    3UIG    3UII    3UIK    3V43    3W96    3W97    3W98    3W99    3WA9    3WAA    3WKJ    3X1S    3X1T    3X1U    3X1V    3ZG6    3ZVY    4A0J    4A0N    4A7J    4BD3    4C1Q    4F4U    4F56    4FWF    4HON    4I51    4L7X    4LK9    4LKA    4LLB    4LXL    4N4H    4QBQ    4QBR    4QBS    4TN7    4U68    4UP0    4UY4    4X3K    4Y6L    4YHP    4YHZ    4YM5    4YM6    4Z0R    4Z2M    5AV5    5AV6    5AV8    5AV9    5AVB    5AVC    5B24    5B2I    5B2J    5B31    5C11    5C13    5C3I    5CPI    5CPJ    5CPK    5D6Y    5DAH    5FB0    5FB1    5FFV    5GH9    5GSE    5GSU    5GT0    5GT3    5GTC    5H6Q    5H6R    5HJB    5HJC    5HJD    5HYN    5IQL    5J3V    5J9S    5JHN    5JIN    5JIY    5JJ0    5JRG    5KJH    5KJI    5KKL    5LUG    5M5G    5MR8    5NNC    5NND    5OY3    5SVX    5SVY    5SZB    5SZC    5T0K    5T0M    5T1G    5T1I    5T8R    5TBN    5TDR    5TDW    5U2J    5V21    5V22    5VA6    5VAB    5VGE    5VNB    5WFC    5WLE    5WVO    5WXG    5WXH    5WYI    5X60    5XF3    5XF4    5XF5    5XFQ    5XFR    5XNV    5XTZ    5Y0C    5Y0D    5Y20    5Y2F    5Z23    5Z30    6AXJ    6AZE    6BHD    6BHE    6BHG    6BHH    6BHI    6D07    6D08    6E83    6E86    6F6D    6HKT    6HTS    6IEU    6IIS    6IIT    6IPU    6IQ4    6JR0    6JR1    6JXD    6K1I    6K1J    6K1K    6KVD    6L49    6L4A    6MIL    6MIM    6MIN    6MIO    6MIQ    6R8Y    6R8Z    6R90    6R91    6R92    6R93    6R94    6UPK    6UPL    6V41    6V92   
SCOP (Structural Classification of Proteins)1CS9    1CT6    1O9S    1Q3L    2B2T    2B2U    2B2V    2B2W    2C1J    2C1N    2CO0    2CV5    2FSA    2KWJ    2KWK    2L75    2LBM    2LGG    2M0O    2NDF    2NDG    2OQ6    2OT7    2OX0    2RI7    2RR4    2UXN    2V85    2V89    2VNF    2VPG    2X0L    3A1B    3AFA    3AVR    3AYW    3AZE    3AZF    3AZG    3AZH    3AZI    3AZJ    3AZK    3AZL    3AZM    3AZN    3B95    3FDT    3KMT    3KQI    3LQI    3LQJ    3MP1    3O34    3O35    3O37    3QJ6    3RIG    3RIY    3SOU    3SOW    3U31    3U3D    3U4S    3U5N    3U5O    3U5P    3UEE    3UEF    3UIG    3UII    3UIK    3V43    3W96    3W97    3W98    3W99    3WA9    3WAA    3WKJ    3X1S    3X1T    3X1U    3X1V    3ZG6    3ZVY    4A0J    4A0N    4A7J    4BD3    4C1Q    4F4U    4F56    4FWF    4HON    4I51    4L7X    4LK9    4LKA    4LLB    4LXL    4N4H    4QBQ    4QBR    4QBS    4TN7    4U68    4UP0    4UY4    4X3K    4Y6L    4YHP    4YHZ    4YM5    4YM6    4Z0R    4Z2M    5AV5    5AV6    5AV8    5AV9    5AVB    5AVC    5B24    5B2I    5B2J    5B31    5C11    5C13    5C3I    5CPI    5CPJ    5CPK    5D6Y    5DAH    5FB0    5FB1    5FFV    5GH9    5GSE    5GSU    5GT0    5GT3    5GTC    5H6Q    5H6R    5HJB    5HJC    5HJD    5HYN    5IQL    5J3V    5J9S    5JHN    5JIN    5JIY    5JJ0    5JRG    5KJH    5KJI    5KKL    5LUG    5M5G    5MR8    5NNC    5NND    5OY3    5SVX    5SVY    5SZB    5SZC    5T0K    5T0M    5T1G    5T1I    5T8R    5TBN    5TDR    5TDW    5U2J    5V21    5V22    5VA6    5VAB    5VGE    5VNB    5WFC    5WLE    5WVO    5WXG    5WXH    5WYI    5X60    5XF3    5XF4    5XF5    5XFQ    5XFR    5XNV    5XTZ    5Y0C    5Y0D    5Y20    5Y2F    5Z23    5Z30    6AXJ    6AZE    6BHD    6BHE    6BHG    6BHH    6BHI    6D07    6D08    6E83    6E86    6F6D    6HKT    6HTS    6IEU    6IIS    6IIT    6IPU    6IQ4    6JR0    6JR1    6JXD    6K1I    6K1J    6K1K    6KVD    6L49    6L4A    6MIL    6MIM    6MIN    6MIO    6MIQ    6R8Y    6R8Z    6R90    6R91    6R92    6R93    6R94    6UPK    6UPL    6V41    6V92   
CATH (Classification of proteins structures)1CS9    1CT6    1O9S    1Q3L    2B2T    2B2U    2B2V    2B2W    2C1J    2C1N    2CO0    2CV5    2FSA    2KWJ    2KWK    2L75    2LBM    2LGG    2M0O    2NDF    2NDG    2OQ6    2OT7    2OX0    2RI7    2RR4    2UXN    2V85    2V89    2VNF    2VPG    2X0L    3A1B    3AFA    3AVR    3AYW    3AZE    3AZF    3AZG    3AZH    3AZI    3AZJ    3AZK    3AZL    3AZM    3AZN    3B95    3FDT    3KMT    3KQI    3LQI    3LQJ    3MP1    3O34    3O35    3O37    3QJ6    3RIG    3RIY    3SOU    3SOW    3U31    3U3D    3U4S    3U5N    3U5O    3U5P    3UEE    3UEF    3UIG    3UII    3UIK    3V43    3W96    3W97    3W98    3W99    3WA9    3WAA    3WKJ    3X1S    3X1T    3X1U    3X1V    3ZG6    3ZVY    4A0J    4A0N    4A7J    4BD3    4C1Q    4F4U    4F56    4FWF    4HON    4I51    4L7X    4LK9    4LKA    4LLB    4LXL    4N4H    4QBQ    4QBR    4QBS    4TN7    4U68    4UP0    4UY4    4X3K    4Y6L    4YHP    4YHZ    4YM5    4YM6    4Z0R    4Z2M    5AV5    5AV6    5AV8    5AV9    5AVB    5AVC    5B24    5B2I    5B2J    5B31    5C11    5C13    5C3I    5CPI    5CPJ    5CPK    5D6Y    5DAH    5FB0    5FB1    5FFV    5GH9    5GSE    5GSU    5GT0    5GT3    5GTC    5H6Q    5H6R    5HJB    5HJC    5HJD    5HYN    5IQL    5J3V    5J9S    5JHN    5JIN    5JIY    5JJ0    5JRG    5KJH    5KJI    5KKL    5LUG    5M5G    5MR8    5NNC    5NND    5OY3    5SVX    5SVY    5SZB    5SZC    5T0K    5T0M    5T1G    5T1I    5T8R    5TBN    5TDR    5TDW    5U2J    5V21    5V22    5VA6    5VAB    5VGE    5VNB    5WFC    5WLE    5WVO    5WXG    5WXH    5WYI    5X60    5XF3    5XF4    5XF5    5XFQ    5XFR    5XNV    5XTZ    5Y0C    5Y0D    5Y20    5Y2F    5Z23    5Z30    6AXJ    6AZE    6BHD    6BHE    6BHG    6BHH    6BHI    6D07    6D08    6E83    6E86    6F6D    6HKT    6HTS    6IEU    6IIS    6IIT    6IPU    6IQ4    6JR0    6JR1    6JXD    6K1I    6K1J    6K1K    6KVD    6L49    6L4A    6MIL    6MIM    6MIN    6MIO    6MIQ    6R8Y    6R8Z    6R90    6R91    6R92    6R93    6R94    6UPK    6UPL    6V41    6V92   
SuperfamilyP68431
Human Protein Atlas [tissue]ENSG00000275714-H3C1 [tissue]
Peptide AtlasP68431
HPRD04155
IPIIPI00465070   
Protein Interaction databases
DIP (DOE-UCLA)P68431
IntAct (EBI)P68431
FunCoupENSG00000275714
BioGRIDH3C1
STRING (EMBL)H3C1
ZODIACH3C1
Ontologies - Pathways
QuickGOP68431
Ontology : AmiGOchromatin silencing at rDNA  nuclear chromosome  nucleosome  nuclear nucleosome  DNA binding  protein binding  extracellular region  nucleus  nucleus  nucleoplasm  chromatin organization  nucleosome assembly  nucleosome assembly  DNA replication-dependent nucleosome assembly  blood coagulation  membrane  telomere organization  protein-containing complex  interleukin-7-mediated signaling pathway  cellular protein metabolic process  cadherin binding  regulation of megakaryocyte differentiation  negative regulation of gene expression, epigenetic  protein heterodimerization activity  regulation of gene silencing by miRNA  regulation of gene silencing  extracellular exosome  
Ontology : EGO-EBIchromatin silencing at rDNA  nuclear chromosome  nucleosome  nuclear nucleosome  DNA binding  protein binding  extracellular region  nucleus  nucleus  nucleoplasm  chromatin organization  nucleosome assembly  nucleosome assembly  DNA replication-dependent nucleosome assembly  blood coagulation  membrane  telomere organization  protein-containing complex  interleukin-7-mediated signaling pathway  cellular protein metabolic process  cadherin binding  regulation of megakaryocyte differentiation  negative regulation of gene expression, epigenetic  protein heterodimerization activity  regulation of gene silencing by miRNA  regulation of gene silencing  extracellular exosome  
NDEx NetworkH3C1
Atlas of Cancer Signalling NetworkH3C1
Wikipedia pathwaysH3C1
Orthology - Evolution
OrthoDB8350
GeneTree (enSembl)ENSG00000275714
Phylogenetic Trees/Animal Genes : TreeFamH3C1
HOGENOMP68431
Homologs : HomoloGeneH3C1
Homology/Alignments : Family Browser (UCSC)H3C1
Gene fusions - Rearrangements
Fusion : QuiverH3C1
Polymorphisms : SNP and Copy number variants
NCBI Variation ViewerH3C1 [hg38]
dbSNP Single Nucleotide Polymorphism (NCBI)H3C1
dbVarH3C1
ClinVarH3C1
MonarchH3C1
1000_GenomesH3C1 
Exome Variant ServerH3C1
GNOMAD BrowserENSG00000275714
Varsome BrowserH3C1
Genetic variants : HAPMAP8350
Genomic Variants (DGV)H3C1 [DGVbeta]
DECIPHERH3C1 [patients]   [syndromes]   [variants]   [genes]  
CONAN: Copy Number AnalysisH3C1 
Mutations
ICGC Data PortalH3C1 
TCGA Data PortalH3C1 
Broad Tumor PortalH3C1
OASIS PortalH3C1 [ Somatic mutations - Copy number]
Mutations and Diseases : HGMDH3C1
LOVD (Leiden Open Variation Database)Whole genome datasets
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD 3.0 shared installation
BioMutasearch H3C1
DgiDB (Drug Gene Interaction Database)H3C1
DoCM (Curated mutations)H3C1 (select the gene name)
CIViC (Clinical Interpretations of Variants in Cancer)H3C1 (select a term)
intoGenH3C1
Cancer3DH3C1(select the gene name)
Impact of mutations[PolyPhen2] [Provean] [Buck Institute : MutDB] [Mutation Assessor] [Mutanalyser]
Diseases
OMIM602810   
Orphanet
DisGeNETH3C1
MedgenH3C1
Genetic Testing Registry H3C1
NextProtP68431 [Medical]
TSGene8350
GENETestsH3C1
Target ValidationH3C1
Huge Navigator H3C1 [HugePedia]
snp3D : Map Gene to Disease8350
BioCentury BCIQH3C1
ClinGenH3C1
Clinical trials, drugs, therapy
Protein Interactions : CTD8350
Clinical trialH3C1
Miscellaneous
canSAR (ICR)H3C1 (select the gene name)
HarmonizomeH3C1
DataMed IndexH3C1
Probes
Litterature
PubMed394 Pubmed reference(s) in Entrez
GeneRIFsGene References Into Functions (Entrez)
CoreMineH3C1
EVEXH3C1
GoPubMedH3C1
Genes in titleautomatic search in PubMed
REVIEW articlesautomatic search in PubMed
Last year publicationsautomatic search in PubMed

Search in all EBI   NCBI

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Mon Sep 14 14:13:48 CEST 2020

Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

For comments and suggestions or contributions, please contact us

jlhuret@AtlasGeneticsOncology.org.