Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumours   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

HBA2 (hemoglobin, alpha 2)

Identity

Other namesHBA-T2
HBH
HGNC (Hugo) HBA2
LocusID (NCBI) 3040
Location 16p13.3
Location_base_pair Starts at 222846 and ends at 223709 bp from pter ( according to hg19-Feb_2009)
Note

Non-annotated gene. Preliminary data : if you are an author
who wish to write a full paper/card on this gene, go to  How to contribute

External links

Nomenclature
HGNC (Hugo)HBA2   4824
Cards
Entrez_Gene (NCBI)HBA2  3040  hemoglobin, alpha 2
GeneCards (Weizmann)HBA2
Ensembl (Hinxton)ENSG00000188536 [Gene_View]  chr16:222846-223709 [Contig_View]  HBA2 [Vega]
ICGC DataPortalENSG00000188536
AceView (NCBI)HBA2
Genatlas (Paris)HBA2
WikiGenes3040
SOURCE (Princeton)NM_000517
Genomic and cartography
GoldenPath (UCSC)HBA2  -  16p13.3   chr16:222846-223709 +  16p13.3   [Description]    (hg19-Feb_2009)
EnsemblHBA2 - 16p13.3 [CytoView]
Mapping of homologs : NCBIHBA2 [Mapview]
OMIM140700   141850   604131   613978   
Gene and transcription
Genbank (Entrez)AF097635 AF105974 AF147332 AF281258 AF349571
RefSeq transcript (Entrez)NM_000517
RefSeq genomic (Entrez)AC_000148 NC_000016 NC_018927 NG_000006 NT_010393 NW_001838339 NW_004929400
Consensus coding sequences : CCDS (NCBI)HBA2
Cluster EST : UnigeneHs.654744 [ NCBI ]
CGAP (NCI)Hs.654744
Alternative Splicing GalleryENSG00000188536
Gene ExpressionHBA2 [ NCBI-GEO ]     HBA2 [ SEEK ]   HBA2 [ MEM ]
Protein : pattern, domain, 3D structure
UniProt/SwissProtP69905 (Uniprot)
NextProtP69905  [Medical]
With graphics : InterProP69905
Splice isoforms : SwissVarP69905 (Swissvar)
Domaine pattern : Prosite (Expaxy)GLOBIN (PS01033)   
Domains : Interpro (EBI)Globin    Globin-like    Globin_dom    Haemoglobin_a    Haemoglobin_pi   
Related proteins : CluSTrP69905
Domain families : Pfam (Sanger)Globin (PF00042)   
Domain families : Pfam (NCBI)pfam00042   
DMDM Disease mutations3040
Blocks (Seattle)P69905
PDB (SRS)1A00    1A01    1A0U    1A0Z    1A3N    1A3O    1A9W    1ABW    1ABY    1AJ9    1B86    1BAB    1BBB    1BIJ    1BUW    1BZ0    1BZ1    1BZZ    1C7B    1C7C    1C7D    1CLS    1CMY    1COH    1DKE    1DXT    1DXU    1DXV    1FDH    1FN3    1G9V    1GBU    1GBV    1GLI    1GZX    1HAB    1HAC    1HBA    1HBB    1HBS    1HCO    1HDB    1HGA    1HGB    1HGC    1HHO    1IRD    1J3Y    1J3Z    1J40    1J41    1J7S    1J7W    1J7Y    1JY7    1K0Y    1K1K    1KD2    1LFL    1LFQ    1LFT    1LFV    1LFY    1LFZ    1LJW    1M9P    1MKO    1NEJ    1NIH    1NQP    1O1I    1O1J    1O1K    1O1L    1O1M    1O1N    1O1O    1O1P    1QI8    1QSH    1QSI    1QXD    1QXE    1R1X    1R1Y    1RPS    1RQ3    1RQ4    1RQA    1RVW    1SDK    1SDL    1SHR    1SI4    1THB    1UIW    1VWT    1XXT    1XY0    1XYE    1XZ2    1XZ4    1XZ5    1XZ7    1XZU    1XZV    1Y01    1Y09    1Y0A    1Y0C    1Y0D    1Y0T    1Y0W    1Y22    1Y2Z    1Y31    1Y35    1Y45    1Y46    1Y4B    1Y4F    1Y4G    1Y4P    1Y4Q    1Y4R    1Y4V    1Y5F    1Y5J    1Y5K    1Y7C    1Y7D    1Y7G    1Y7Z    1Y83    1Y85    1Y8W    1YDZ    1YE0    1YE1    1YE2    1YEN    1YEO    1YEQ    1YEU    1YEV    1YFF    1YG5    1YGD    1YGF    1YH9    1YHE    1YHR    1YIE    1YIH    1YVQ    1YVT    1YZI    1Z8U    2D5Z    2D60    2DN1    2DN2    2DN3    2DXM    2H35    2HBC    2HBD    2HBE    2HBF    2HBS    2HCO    2HHB    2HHD    2HHE    2M6Z    2W6V    2W72    2YRS    3B75    3D17    3D7O    3DUT    3HHB    3HXN    3IA3    3IC0    3IC2    3KMF    3NL7    3NMM    3ODQ    3ONZ    3OO4    3OO5    3OVU    3P5Q    3QJB    3QJC    3QJD    3QJE    3R5I    3S48    3S65    3S66    3SZK    3WCP    4FC3    4HHB    4IJ2    4L7Y    4MQC    4MQG    4MQH    4MQI    4MQJ    4MQK    4N7N    4N7O    4N7P    6HBW   
PDB (PDBSum)1A00    1A01    1A0U    1A0Z    1A3N    1A3O    1A9W    1ABW    1ABY    1AJ9    1B86    1BAB    1BBB    1BIJ    1BUW    1BZ0    1BZ1    1BZZ    1C7B    1C7C    1C7D    1CLS    1CMY    1COH    1DKE    1DXT    1DXU    1DXV    1FDH    1FN3    1G9V    1GBU    1GBV    1GLI    1GZX    1HAB    1HAC    1HBA    1HBB    1HBS    1HCO    1HDB    1HGA    1HGB    1HGC    1HHO    1IRD    1J3Y    1J3Z    1J40    1J41    1J7S    1J7W    1J7Y    1JY7    1K0Y    1K1K    1KD2    1LFL    1LFQ    1LFT    1LFV    1LFY    1LFZ    1LJW    1M9P    1MKO    1NEJ    1NIH    1NQP    1O1I    1O1J    1O1K    1O1L    1O1M    1O1N    1O1O    1O1P    1QI8    1QSH    1QSI    1QXD    1QXE    1R1X    1R1Y    1RPS    1RQ3    1RQ4    1RQA    1RVW    1SDK    1SDL    1SHR    1SI4    1THB    1UIW    1VWT    1XXT    1XY0    1XYE    1XZ2    1XZ4    1XZ5    1XZ7    1XZU    1XZV    1Y01    1Y09    1Y0A    1Y0C    1Y0D    1Y0T    1Y0W    1Y22    1Y2Z    1Y31    1Y35    1Y45    1Y46    1Y4B    1Y4F    1Y4G    1Y4P    1Y4Q    1Y4R    1Y4V    1Y5F    1Y5J    1Y5K    1Y7C    1Y7D    1Y7G    1Y7Z    1Y83    1Y85    1Y8W    1YDZ    1YE0    1YE1    1YE2    1YEN    1YEO    1YEQ    1YEU    1YEV    1YFF    1YG5    1YGD    1YGF    1YH9    1YHE    1YHR    1YIE    1YIH    1YVQ    1YVT    1YZI    1Z8U    2D5Z    2D60    2DN1    2DN2    2DN3    2DXM    2H35    2HBC    2HBD    2HBE    2HBF    2HBS    2HCO    2HHB    2HHD    2HHE    2M6Z    2W6V    2W72    2YRS    3B75    3D17    3D7O    3DUT    3HHB    3HXN    3IA3    3IC0    3IC2    3KMF    3NL7    3NMM    3ODQ    3ONZ    3OO4    3OO5    3OVU    3P5Q    3QJB    3QJC    3QJD    3QJE    3R5I    3S48    3S65    3S66    3SZK    3WCP    4FC3    4HHB    4IJ2    4L7Y    4MQC    4MQG    4MQH    4MQI    4MQJ    4MQK    4N7N    4N7O    4N7P    6HBW   
PDB (IMB)1A00    1A01    1A0U    1A0Z    1A3N    1A3O    1A9W    1ABW    1ABY    1AJ9    1B86    1BAB    1BBB    1BIJ    1BUW    1BZ0    1BZ1    1BZZ    1C7B    1C7C    1C7D    1CLS    1CMY    1COH    1DKE    1DXT    1DXU    1DXV    1FDH    1FN3    1G9V    1GBU    1GBV    1GLI    1GZX    1HAB    1HAC    1HBA    1HBB    1HBS    1HCO    1HDB    1HGA    1HGB    1HGC    1HHO    1IRD    1J3Y    1J3Z    1J40    1J41    1J7S    1J7W    1J7Y    1JY7    1K0Y    1K1K    1KD2    1LFL    1LFQ    1LFT    1LFV    1LFY    1LFZ    1LJW    1M9P    1MKO    1NEJ    1NIH    1NQP    1O1I    1O1J    1O1K    1O1L    1O1M    1O1N    1O1O    1O1P    1QI8    1QSH    1QSI    1QXD    1QXE    1R1X    1R1Y    1RPS    1RQ3    1RQ4    1RQA    1RVW    1SDK    1SDL    1SHR    1SI4    1THB    1UIW    1VWT    1XXT    1XY0    1XYE    1XZ2    1XZ4    1XZ5    1XZ7    1XZU    1XZV    1Y01    1Y09    1Y0A    1Y0C    1Y0D    1Y0T    1Y0W    1Y22    1Y2Z    1Y31    1Y35    1Y45    1Y46    1Y4B    1Y4F    1Y4G    1Y4P    1Y4Q    1Y4R    1Y4V    1Y5F    1Y5J    1Y5K    1Y7C    1Y7D    1Y7G    1Y7Z    1Y83    1Y85    1Y8W    1YDZ    1YE0    1YE1    1YE2    1YEN    1YEO    1YEQ    1YEU    1YEV    1YFF    1YG5    1YGD    1YGF    1YH9    1YHE    1YHR    1YIE    1YIH    1YVQ    1YVT    1YZI    1Z8U    2D5Z    2D60    2DN1    2DN2    2DN3    2DXM    2H35    2HBC    2HBD    2HBE    2HBF    2HBS    2HCO    2HHB    2HHD    2HHE    2M6Z    2W6V    2W72    2YRS    3B75    3D17    3D7O    3DUT    3HHB    3HXN    3IA3    3IC0    3IC2    3KMF    3NL7    3NMM    3ODQ    3ONZ    3OO4    3OO5    3OVU    3P5Q    3QJB    3QJC    3QJD    3QJE    3R5I    3S48    3S65    3S66    3SZK    3WCP    4FC3    4HHB    4IJ2    4L7Y    4MQC    4MQG    4MQH    4MQI    4MQJ    4MQK    4N7N    4N7O    4N7P    6HBW   
PDB (RSDB)1A00    1A01    1A0U    1A0Z    1A3N    1A3O    1A9W    1ABW    1ABY    1AJ9    1B86    1BAB    1BBB    1BIJ    1BUW    1BZ0    1BZ1    1BZZ    1C7B    1C7C    1C7D    1CLS    1CMY    1COH    1DKE    1DXT    1DXU    1DXV    1FDH    1FN3    1G9V    1GBU    1GBV    1GLI    1GZX    1HAB    1HAC    1HBA    1HBB    1HBS    1HCO    1HDB    1HGA    1HGB    1HGC    1HHO    1IRD    1J3Y    1J3Z    1J40    1J41    1J7S    1J7W    1J7Y    1JY7    1K0Y    1K1K    1KD2    1LFL    1LFQ    1LFT    1LFV    1LFY    1LFZ    1LJW    1M9P    1MKO    1NEJ    1NIH    1NQP    1O1I    1O1J    1O1K    1O1L    1O1M    1O1N    1O1O    1O1P    1QI8    1QSH    1QSI    1QXD    1QXE    1R1X    1R1Y    1RPS    1RQ3    1RQ4    1RQA    1RVW    1SDK    1SDL    1SHR    1SI4    1THB    1UIW    1VWT    1XXT    1XY0    1XYE    1XZ2    1XZ4    1XZ5    1XZ7    1XZU    1XZV    1Y01    1Y09    1Y0A    1Y0C    1Y0D    1Y0T    1Y0W    1Y22    1Y2Z    1Y31    1Y35    1Y45    1Y46    1Y4B    1Y4F    1Y4G    1Y4P    1Y4Q    1Y4R    1Y4V    1Y5F    1Y5J    1Y5K    1Y7C    1Y7D    1Y7G    1Y7Z    1Y83    1Y85    1Y8W    1YDZ    1YE0    1YE1    1YE2    1YEN    1YEO    1YEQ    1YEU    1YEV    1YFF    1YG5    1YGD    1YGF    1YH9    1YHE    1YHR    1YIE    1YIH    1YVQ    1YVT    1YZI    1Z8U    2D5Z    2D60    2DN1    2DN2    2DN3    2DXM    2H35    2HBC    2HBD    2HBE    2HBF    2HBS    2HCO    2HHB    2HHD    2HHE    2M6Z    2W6V    2W72    2YRS    3B75    3D17    3D7O    3DUT    3HHB    3HXN    3IA3    3IC0    3IC2    3KMF    3NL7    3NMM    3ODQ    3ONZ    3OO4    3OO5    3OVU    3P5Q    3QJB    3QJC    3QJD    3QJE    3R5I    3S48    3S65    3S66    3SZK    3WCP    4FC3    4HHB    4IJ2    4L7Y    4MQC    4MQG    4MQH    4MQI    4MQJ    4MQK    4N7N    4N7O    4N7P    6HBW   
Human Protein AtlasENSG00000188536
Peptide AtlasP69905
HPRD00785
Protein Interaction databases
DIP (DOE-UCLA)P69905
IntAct (EBI)P69905
FunCoupENSG00000188536
BioGRIDHBA2
IntegromeDBHBA2
STRING (EMBL)HBA2
Ontologies - Pathways
QuickGOP69905
Ontology : AmiGOperoxidase activity  oxygen transporter activity  iron ion binding  protein binding  extracellular region  cytosol  hemoglobin complex  hemoglobin complex  positive regulation of cell death  oxygen transport  bicarbonate transport  membrane  oxygen binding  heme binding  cytosolic small ribosomal subunit  haptoglobin binding  haptoglobin-hemoglobin complex  response to hydrogen peroxide  hydrogen peroxide catabolic process  small molecule metabolic process  protein heterooligomerization  oxidation-reduction process  extracellular vesicular exosome  endocytic vesicle lumen  blood microparticle  
Ontology : EGO-EBIperoxidase activity  oxygen transporter activity  iron ion binding  protein binding  extracellular region  cytosol  hemoglobin complex  hemoglobin complex  positive regulation of cell death  oxygen transport  bicarbonate transport  membrane  oxygen binding  heme binding  cytosolic small ribosomal subunit  haptoglobin binding  haptoglobin-hemoglobin complex  response to hydrogen peroxide  hydrogen peroxide catabolic process  small molecule metabolic process  protein heterooligomerization  oxidation-reduction process  extracellular vesicular exosome  endocytic vesicle lumen  blood microparticle  
Pathways : BIOCARTAHemoglobin's Chaperone [Genes]   
Pathways : KEGGAfrican trypanosomiasis    Malaria   
Protein Interaction DatabaseHBA2
Wikipedia pathwaysHBA2
Gene fusion - rearrangments
Polymorphisms : SNP, mutations, diseases
SNP Single Nucleotide Polymorphism (NCBI)HBA2
SNP (GeneSNP Utah)HBA2
SNP : HGBaseHBA2
Genetic variants : HAPMAPHBA2
1000_GenomesHBA2 
ICGC programENSG00000188536 
CONAN: Copy Number AnalysisHBA2 
Somatic Mutations in Cancer : COSMICHBA2 
LOVD (Leiden Open Variation Database)Whole genome datasets
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD - Leiden Open Variation Database
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD 3.0 shared installation
LOVD (Leiden Open Variation Database)The Globin Gene Server
DECIPHER (Syndromes)16:222846-223709
Mutations and Diseases : HGMDHBA2
OMIM140700    141850    604131    613978   
MedgenHBA2
GENETestsHBA2
Disease Genetic AssociationHBA2
Huge Navigator HBA2 [HugePedia]  HBA2 [HugeCancerGEM]
Genomic VariantsHBA2  HBA2 [DGVbeta]
Exome VariantHBA2
dbVarHBA2
ClinVarHBA2
snp3D : Map Gene to Disease3040
General knowledge
Homologs : HomoloGeneHBA2
Homology/Alignments : Family Browser (UCSC)HBA2
Phylogenetic Trees/Animal Genes : TreeFamHBA2
Chemical/Protein Interactions : CTD3040
Chemical/Pharm GKB GenePA29199
Clinical trialHBA2
Cancer Resource (Charite)ENSG00000188536
Other databases
Probes
Litterature
PubMed221 Pubmed reference(s) in Entrez
CoreMineHBA2
GoPubMedHBA2
iHOPHBA2
Genes in titleautomatic search in PubMed
REVIEW articlesautomatic search in PubMed
Last year publicationsautomatic search in PubMed

Search in all EBI   NCBI

Contributor(s)

Written09-2002Dessen P, Le Minor S
Updated12-2013Dessen P

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Sat Nov 8 17:30:43 CET 2014

Home   Genes   Leukemias   Solid Tumours   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

For comments and suggestions or contributions, please contact us

jlhuret@AtlasGeneticsOncology.org.