Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Identity

Fusion genes
(updated 2017)
Data from Atlas, Mitelman, Cosmic Fusion, Fusion Cancer, TCGA fusion databases with official HUGO symbols (see references in chromosomal bands)



Other Leukemias implicated (Data extracted from papers in the Atlas) [ 252 ]
  Burkitt's lymphoma (BL)
i(6)(p10)
Plasma Cell Neoplasms: an overview
t(1;5)(p32;q31) ?/TAL1
t(1;11)(q24;p15) NUP98/PRRX1
t(2;11)(p21;q24) MIR125B1/?
t(6;10)(q22;q24) NFKB2/ROS1
t(6;11)(q13;q12) EEF1G/OOEP
t(7;14)(q34;q11) TRA/TRB
t(7;14)(q34;q11) TRA/TRB
t(8;19)(p11;q13) KAT6A/?
t(X;14)(p22;q32) or t(Y;14)(p11;q32) IGH/CRLF2
t(11;17)(q23;q21) KMT2A/ACACA
dic(9;20)(p13;q11 ZCCHC7/LOC1499503
ins(15;17)(q22;q21q21) PML/CDC6/RARA
ins(15;17)(q22;q21q26) PML/ADAMTS17/RARA
inv(14)(q11q32) TRA-D/IGH
t(1;1)(p33;q25) DHX09/TAL1
t(1;1)(p36;p36) CDK11B/SLC35E2
t(1;1)(q21;q21) NOTCH2NL/NBPF10
t(1;1)(q25;q25) DHX09/NPL
t(3;7)(q26;q34) MECOM/TCRB1
t(3;10)(q27;p15) BCL6/FBXO18
t(3;11)(q13;q23) KMT2A/CIP2A
t(3;20)(q26;q11) TBL1XR1/C20orf24
t(3;21)(q22;q22) RYK/ATP5PO
t(5;7)(p13;q34) IL7R/TRBC2
t(5;11)(q11;q23) MTREX/SIK3
t(6;12)(q22-23;p13) STL/ETV6
t(6;21)(p22;q22) RUNX1/SUMO2P13
t(7;7)(p15;q21) CDK6/RPL35P4
t(7;8)(q34;q12) PLAG1/TRBJ2-7
t(7;11)(q34;p15) RIC3/TRBC2
t(7;21)(q11;q22) RUNX1/UPK3B/DTX2
t(8;9)(p21;q21) TMEM2/PTK2B
t(9;9)(p21;p21) CDKN2A/IFNWP19
t(9;22)(q34;q11) BCR/RALGPS1/ABL1
t(10;10)(q11;q11) TIMM23B/LINC00843
t(10;10)(q23;q24) MGEA5/RNLS
t(10;14)(q24;q11) TLX1NB/TRDC
t(12;14)(q23;q11.2) TRDREC/C12orf42
t(14;14)(q11;q13) SFTA3/TRDC
t(16;16)(p13;p13) CIITA/???
t(17;17)(q21;q21) DHX08/ETV4
t(X;2)(q22;p11) IGKV3-20/RNA28S5
t(X;14)(q22;q32) RNA28S5/BCL11B
t(X;17)(q22;q25) COG1/RNA28S5
t(16;16)(p13;p13) CIITA/???
t(14;14)(q23;q31) ACTR10/GALC
t(7;13)(p21;q14) RB1/AGMO
t(7;13)(q34;q14) ZC3HAV1/AKAP11
t(9;9)(q31;q31) PALM2/AKAP2
t(1;8)(q25;p11) ANKRD45/HOOK3
t(3;3)(p21;p21) UQCRC1/ANO10
t(17;17)(q21;q21) KANSL1/ARL17A
t(12;19)(p13;p13) PLK5/ATN1
t(3;21)(q22;q22) RYK/ATP5PO
t(7;20)(q36;p13) ESYT2/ATRN
t(9;22)(q34;q11) BCR/RALGPS1/ABL1
t(5;6)(q13;q23) MYB/BDP1
t(2;4)(q31;q21) BMP2K/HOXD10
t(4;12)(q21;p13) BMP2K/ZNF384
t(10;10)(q11;q11) PARG/BMS1
t(1;1)(q25;q25) LHX4/BRINP2
t(10;10)(q24;q24) C10orf76/PSD
t(14;14)(q23;q23) C14orf37/ARID4A
t(14;14)(q23;q23) PRKCH/C14orf37
t(14;14)(q22;q23) PELI2/C14orf39
t(16;16)(p13;q22) ABCC6/C16orf70
t(12;17)(p13;q12) ING4/C17orf50
t(3;20)(q26;q11) TBL1XR1/C20orf24
t(22;22)(q13;q13) C22orf34/BRD1
t(22;22)(q13;q13) C22orf34/ZBED4
t(7;8)(p15;q24) C8orf76/HOXA11-AS
t(10;12)(p12;q21) MLLT10/CAPS2
t(11;15)(q23;q14) KMT2A/CASC5
t(4;11)(q21;q23) AFF1/CCDC84
t(12;12)(p13;p13) VAMP1/CD27-AS1
t(4;4)(q26;q35) DUX4/CEP170P1
t(5;5)(q14;q33) CLINT1/MEF2C
t(9;10)(p11;p12) MLLT10/CNTNAP3B
t(X;17)(q22;q25) COG1/RNA28S5
t(3;3)(p25;p25) HACL1/COLQ
t(16;16)(p13;p13) CRAMP1/CLCN7
t(1;1)(p22;p22) CTBS/GNG5
t(9;11)(p13;p15) DBX1/PAX5
t(5;14)(q22;q23) DCP2/HIF1A
t(5;14)(q22;q32) IGH/DCP2
t(22;22)(q11;q11) DDTL/CABIN1
t(1;9)(q31;p13) DENND1B/ZCCHC7
t(10;13)(q21;q14) CDK1/DGKH
t(17;17)(q21;q21) DHX08/ETV4
t(1;1)(p33;q25) DHX09/TAL1
t(1;1)(q25;q25) DHX09/NPL
t(7;7)(p14;p15) DPY19L1/HOXA11
t(21;21)(q22;q22) RUNX1/DSCAM
t(7;21)(q11;q22) RUNX1/UPK3B/DTX2
t(13;13)(q13;q13) EEF1DP3/FRY
t(12;22)(p13;q12) ETV6/EMID1
t(8;8)(p21;p22) ENTPD4/PSD3
t(6;6)(q21;q23) EPB41L2/OSTM1
t(8;19)(p11;q13) ERVK3-1/FGFR1
t(7;20)(q36;p13) ESYT2/ATRN
t(15;15)(q15;q15) INO80/EXD1
t(6;11)(q23;q12) FAM111A/MYB
t(17;21)(q21;q22) RUNX1/FAM117A
t(15;19)(q21;p13) COPS2/FAM129C
t(15;19)(q21;p13) FAM129C/COPS2
t(7;7)(q21;q21) FAM133B/CDK6
t(10;10)(p12;p13) MLLT10/FAM171A1
inv(4)(q32q32) FAM198B/TMEM144
t(11;17)(p15;q22) MPO/FAR1
t(9;12)(p13;q24) FBRSL1/PAX5
t(9;12)(p13;q24) PAX5/FBRSL1
t(12;12)(q24;q24) NOC4L/FBRSL1
t(12;12)(q24;q24) POLE/FBRSL1
t(3;10)(q27;p15) BCL6/FBXO18
t(6;8)(q27;p12) FGFR1OP/FGFR1
t(6;10)(q27;q11) FGFR1OP/RET
t(6;10)(q27;q11) FGFR1OP/RET
t(9;9)(p13;q32) PAX5/FKBP15
t(13;13)(q14;q14) RB1/FNDC3A
dic(9;20)(p13;q11) ZCCHC7/FRG1BP
t(4;10)(q35;q26) DUX4/FRG2B
t(13;13)(q13;q13) EEF1DP3/FRY
t(7;7)(p22;p22) GET4/TNRC18
t(1;1)(p33;q42) GNPAT/TAL1
t(X;X)(q25;q26) STAG2/GPR119
t(7;15)(p14;q21) GPR141/ONECUT1
t(2;7)(q35;q21) GTPBP10/BARD1
t(11;19)(q23;p13) H2AFX/WDR18
t(11;19)(q23;p13) WDR18/H2AFX
t(3;5)(q26;q31) H2AFY/MECOM
t(7;19)(q21;p13) DNM2/HEPACAM2
t(6;7)(p22;p14) MPLKIP/HIST1H1B
t(3;6)(q27;p22) HIST1H4I/BCL6
t(7;14)(p15;q32)
t(15;17)(q15;q11) WSB1/HYPK
t(9;9)(p21;p21) CDKN2A/IFNWP19
t(X;2)(q22;p11) IGKV3-20/RNA28S5
t(2;18)(p16;q11) KCTD1/SPTBN1
t(3;11)(q13.13;q23) KMT2A/KIAA1524
t(11;21)(p14;q22) RUNX1/KIAA1549L
t(9;11)(p13;p14) PAX5/KIAA1549L
t(15;15)(q26;q26) PRC1/KIF7
t(6;6)(q22;q23) L3MBTL3/PTPRK
t(2;2)(p24;p25) RNF144A/LAPTM4A
t(8;19)(p11;q13) KAT6A/LEUTX
t(10;10)(q23;q24) LINC00502/TLX1
t(10;10)(q11;q11) TIMM23B/LINC00843
dic(9;20)(p13;q11 ZCCHC7/LOC1499503
t(8;8)(p11;q24) POLB/LRRC6
t(9;15)(q34;q15) MAP1A/NUP188
t(10;10)(q23;q24) MGEA5/RNLS

t(6;11)(q27;q23) KMT2A/AFDN
t(5;11)(q11;q23) MTREX/SIK3
t(19;19)(p13;p13) PALM/NCLN
t(14;14)(q11;q13) NKX2-1-AS1/TRD
t(1;1)(q21;q21) NOTCH2NL/NBPF10
t(1;1)(q25;q25) DHX09/NPL
DHX9/NPL (1q25)
t(9;15)(q34;q15) MAP1A/NUP188
t(X;9)(p22;p24) OFD1/JAK2
t(6;11)(q13;q12) EEF1G/OOEP
t(20;20)(q13;q13) PABPC1L/YWHAB
t(X;X)(p11;p11) PAGE2B/ALAS2
t(19;19)(p13;p13) PALM/NCLN
t(3;9)(q25;q31) KPNA4/PALM2
t(9;9)(q31;q31) PALM2/AKAP2
t(7;8)(p22;q11) PCMTD1/PRKAR1B
t(10;12)(q24;p13) PDZD7/ETV6
t(10;21)(q24;q22) RUNX1/PDZD7
t(2;2)(p23;p23) ASXL2/PFN4
ins(15;17)(q22;q21q26) PML/ADAMTS17/RARA
ins(15;17)(q22;q21q21) PML/CDC6/RARA
t(14;19)(q23;q13) UBA2/PPP1R36
t(19;19)(q13;q13) PPP1R37/PPP6R1
t(19;21)(p13;q22) MAP2K7/PRDM15
t(1;11)(q44;q24) ZNF124/PUS3
t(14;14)(q24;q24) SUSD6/RBM25
t(8;21)(q21;q22) PDE9A/REXO1L1P
t(9;9)(p24;p24) RFX3/JAK2
t(7;11)(q34;p15) RIC3/TRBC2
t(7;11)(q34;p15) RIC3/TRB
t(X;2)(q22;p11) IGKV3-20/RNA28S5
t(X;14)(q22;q32) RNA28S5/BCL11B
t(X;17)(q22;q25) COG1/RNA28S5
t(12;15)(p13;q22) ETV6/RNU6-19P
t(7;7)(p15;q21) CDK6/RPL35P4
t(7;21)(q11;q22) RUNX1/UPK3B/DTX2
t(4;11)(q21;q23) KMT2A/SEPT11
t(2;11)(q37;q23) KMT2A/SEPT2
t(11;22)(q23;q11.2) KMT2A/SEPT5
t(X;11)(q24;q23) KMT2A/SEPT6
t(7;7)(p11;p12) SEPT7P2/PSPH
t(11;17)(q23;q25) KMT2A/SEPT9
t(12;17)(p11;q25) SINHCAF/SEPT9
t(3;7)(p25;p12) IKZF1/SETD5
t(3;7)(p25;p12) SETD5/IKZF1
t(14;14)(q11;q13) SFTA3/TRDC
t(6;7)(q23;q22) SLC12A9/MYB
t(1;1)(p36;p36) CDK11B/SLC35E2
t(17;19)(p13;p13) SLC35G6/FBN3
t(14;14)(q23;q32) PPP2R5C/SLC38A6
t(9;9)(p21;p24) SMU1/JAK2
t(6;6)(q14;q14) SNHG5/SNX14
t(6;12)(q22-23;p13) STL/ETV6
t(6;21)(p22;q22) RUNX1/SUMO2P13
t(9;10)(p13;p14) PAX5/TAF3
t(3;7)(q26;q34) MECOM/TCRB1
t(10;10)(q11;q11) TIMM23B/LINC00843
t(10;14)(q24;q11) TLX1NB/TRDC
t(10;14)(q24;q11) TLX1NB/TRD
t(8;9)(p21;q21) TMEM2/PTK2B
t(8;9)(q24;q31) NRBP2/TMEM245
t(19;19)(q13;q13) TGFB1/TMEM91
t(9;19)(p13;p13) TMPRSS9/PAX5
t(14;14)(q22;q22) NIN/TMX1
inv(14)(q11q32) TRA-D/IGH
t(5;7)(p13;q34) IL7R/TRBC2
t(7;11)(q34;p15) RIC3/TRBC2
t(7;8)(q34;q12) PLAG1/TRBJ2-7
t(7;16)(q34;p13) CREBBP/TRBV23-1
t(10;14)(q24;q11) TLX1NB/TRDC
t(14;14)(q11;q13) SFTA3/TRDC
t(12;14)(q23;q11.2) TRDREC/C12orf42
t(15;16)(q21;p13) CREBBP/TRIM69
t(5;5)(p13;p13) PRKAA1/TTC33
t(14;14)(q23;q32) TTC7B/SYNE2
t(7;7)(p22;p22) TTYH3/MAD1L1
t(15;21)(q24;q22) RUNX1/UBL7
t(14;14)(q22;q32) NIN/UNC79
t(3;9)(p22;q34) VILL/ABCA2
t(X;8)(q25;q22) VPS13B/STAG2
t(16;16)(p13;p13) TRAF7/WDR24
Multiple Myeloma
t(8;11)(p11;p15) NUP98/WHSC1L1
t(18;21)(q22;q22) RUNX1/ZADH2
t(22;22)(q13;q13) C22orf34/ZBED4
t(11;13)(q23;q14) KMT2A/ZC3H13
t(13;13)(q12;q12) ZMYM5/PSPC1
t(1;11)(q44;q24) ZNF124/PUS3
t(14;14)(q11;q11) HNRNPC/ZNF219
t(14;14)(q11;q11) ZNF219/HNRNPC
t(9;19)(p24;q13) ZNF274/JAK2
t(9;16)(p13;q24) PAX5/ZNF276
t(1;9)(p35;p24) SMARCA2/ZNF362
t(1;9)(p35;p24) ZNF362/SMARCA2
t(7;7)(q22;q36) CUX1/ZNF398
t(9;19)(p24;p12) ZNF430/JAK2
t(19;19)(p12;p13) ZNF430/TYK2



Other Cancer prone implicated (Data extracted from papers in the Atlas) [ 26 ]
  Oculocutaneous Albinism Porokeratosis of Mibelli Bloom syndrome Familial Myeloproliferative Disorders Oculocutaneous Albinism Familial clear cell renal cancer Xeroderma pigmentosum Glycogen storage disease type I (GSD I) Glycogen storage disease type I (GSD I) Familial Myeloproliferative Disorders Glycogen storage disease type I (GSD I) Beckwith-Wiedemann syndrome Hereditary paraganglioma (PGL) Dyskeratosis congenita (DKC) Weaver syndrome Simpson-Golabi-Behmel syndrome Glycogen storage disease type I (GSD I) Diamond-Blackfan anemia (DBA) Diamond-Blackfan anemia (DBA) Diamond-Blackfan anemia (DBA) Oculocutaneous Albinism Diamond-Blackfan anemia (DBA) Xeroderma pigmentosum Xeroderma pigmentosum Xeroderma pigmentosum Xeroderma pigmentosum
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