Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Identity

Other alias
Fusion genes
(updated 2017)
Data from Atlas, Mitelman, Cosmic Fusion, Fusion Cancer, TCGA fusion databases with official HUGO symbols (see references in chromosomal bands)


Other Leukemias implicated (Data extracted from papers in the Atlas) [ 249 ]
  Burkitt's lymphoma (BL)
i(6)(p10)
Plasma Cell Neoplasms: an overview
t(1;5)(p32;q31) ?/TAL1
t(1;11)(q24;p15) NUP98/PRRX1
t(2;11)(p21;q24) MIR125B1/?

t(7;14)(q34;q11) TRA/TRB
t(8;19)(p11;q13) KAT6A/?
t(X;14)(p22;q32) or t(Y;14)(p11;q32) IGH/CRLF2
t(11;17)(q23;q21) KMT2A/ACACA
del(6)(q23) LIN28B/STX07
dic(9;20)(p13;q11 ZCCHC7/LOC1499503
ins(15;17)(q22;q21q21) PML/CDC6/RARA
ins(15;17)(q22;q21q26) PML/ADAMTS17/RARA
inv(14)(q11q32) TRA-D/IGH
inv(14)(q11.2q32.31) BCL11B/TRDC
t(1;1)(p33;q25) DHX09/TAL1
t(1;1)(p36;p36) CDK11B/SLC35E2
t(1;1)(q21;q21) NOTCH2NL/NBPF10
t(1;1)(q25;q25) DHX09/NPL
t(2;13)(q36;q14) PAX07/FOXO1
t(3;7)(q26;q34) MECOM/TCRB1
t(3;10)(q27;p15) BCL6/FBXO18
t(3;11)(q13;q23) KMT2A/CIP2A
t(3;20)(q26;q11) TBL1XR1/C20orf24
t(3;21)(q22;q22) RYK/ATP5PO
t(5;7)(p13;q34) IL7R/TRBC2
t(5;11)(q11;q23) MTREX/SIK3
t(6;12)(q22-23;p13) STL/ETV6
t(6;21)(p22;q22) RUNX1/SUMO2P13
t(7;7)(p15;q21) CDK6/RPL35P4
t(7;8)(q34;q12) PLAG1/TRBJ2-7
t(7;11)(q34;p15) RIC3/TRBC2
t(7;21)(q11;q22) RUNX1/UPK3B/DTX2
t(8;9)(p21;q21) TMEM2/PTK2B
t(9;9)(p21;p21) CDKN2A/IFNWP19
t(9;22)(q34;q11) BCR/RALGPS1/ABL1
t(10;10)(q11;q11) TIMM23B/LINC00843
t(10;10)(q23;q24) MGEA5/RNLS
t(10;14)(q24;q11) TLX1NB/TRDC
t(11;19)(q23;p13) KMT2A/MYOF1
t(12;14)(q23;q11.2) TRDREC/C12orf42
t(14;14)(q11;q13) SFTA3/TRDC
t(16;16)(p13;p13) CIITA/???
t(17;17)(q21;q21) DHX08/ETV4
t(X;2)(q22;p11) IGKV3-20/RNA28S5
t(X;14)(q22;q32) RNA28S5/BCL11B
t(X;17)(q22;q25) COG1/RNA28S5
t(16;16)(p13;p13) CIITA/???
t(14;14)(q23;q31) ACTR10/GALC
t(7;13)(p21;q14) RB1/AGMO
t(7;13)(q34;q14) ZC3HAV1/AKAP11
t(1;8)(q25;p11) ANKRD45/HOOK3
t(3;3)(p21;p21) UQCRC1/ANO10
t(17;17)(q21;q21) KANSL1/ARL17A
t(12;19)(p13;p13) PLK5/ATN1
t(3;21)(q22;q22) RYK/ATP5PO
t(7;20)(q36;p13) ESYT2/ATRN
t(9;22)(q34;q11) BCR/RALGPS1/ABL1
t(5;6)(q13;q23) MYB/BDP1
t(2;4)(q31;q21) BMP2K/HOXD10
t(4;12)(q21;p13) BMP2K/ZNF384
t(10;10)(q11;q11) PARG/BMS1
t(12;12)(p13;p13) ETV6/BORCS5
t(5;15)(p15;q14) BRD9/NUTM1
t(1;1)(q25;q25) LHX4/BRINP2
t(10;10)(q24;q24) C10orf76/PSD
t(14;14)(q23;q23) C14orf37/ARID4A
t(14;14)(q23;q23) PRKCH/C14orf37
t(14;14)(q22;q23) PELI2/C14orf39
t(16;16)(p13;q22) ABCC6/C16orf70
t(12;17)(p13;q12) ING4/C17orf50
t(3;20)(q26;q11) TBL1XR1/C20orf24
t(22;22)(q13;q13) C22orf34/BRD1
t(22;22)(q13;q13) C22orf34/ZBED4
t(7;8)(p15;q24) C8orf76/HOXA11-AS
t(10;12)(p12;q21) MLLT10/CAPS2
t(11;15)(q23;q14) KMT2A/CASC5
t(4;11)(q21;q23) AFF1/CCDC84
t(12;12)(p13;p13) VAMP1/CD27-AS1
t(4;4)(q26;q35) DUX4/CEP170P1
t(5;5)(q14;q33) CLINT1/MEF2C
t(9;10)(p11;p12) MLLT10/CNTNAP3B
t(X;17)(q22;q25) COG1/RNA28S5
t(3;3)(p25;p25) HACL1/COLQ
t(16;16)(p13;p13) CRAMP1/CLCN7
t(1;1)(p22;p22) CTBS/GNG5
t(9;11)(p13;p15) DBX1/PAX5
t(5;14)(q22;q23) DCP2/HIF1A
t(5;14)(q22;q32) IGH/DCP2
t(22;22)(q11;q11) DDTL/CABIN1
t(1;9)(q31;p13) DENND1B/ZCCHC7
t(10;13)(q21;q14) CDK1/DGKH
t(17;17)(q21;q21) DHX08/ETV4
t(1;1)(p33;q25) DHX09/TAL1
t(1;1)(q25;q25) DHX09/NPL
t(7;7)(p14;p15) DPY19L1/HOXA11
t(21;21)(q22;q22) RUNX1/DSCAM
t(7;21)(q11;q22) RUNX1/UPK3B/DTX2
t(13;13)(q13;q13) EEF1DP3/FRY
t(12;22)(p13;q12) ETV6/EMID1
t(8;8)(p21;p22) ENTPD4/PSD3
t(6;6)(q21;q23) EPB41L2/OSTM1
t(8;19)(p11;q13) ERVK3-1/FGFR1
t(7;20)(q36;p13) ESYT2/ATRN
t(15;15)(q15;q15) INO80/EXD1
t(6;11)(q23;q12) FAM111A/MYB
t(17;21)(q21;q22) RUNX1/FAM117A
t(15;19)(q21;p13) COPS2/FAM129C
t(15;19)(q21;p13) FAM129C/COPS2
t(7;7)(q21;q21) FAM133B/CDK6
t(10;10)(p12;p13) MLLT10/FAM171A1
inv(4)(q32q32) FAM198B/TMEM144
t(11;17)(p15;q22) MPO/FAR1
t(9;12)(p13;q24) FBRSL1/PAX5
t(9;12)(p13;q24) PAX5/FBRSL1
t(12;12)(q24;q24) NOC4L/FBRSL1
t(12;12)(q24;q24) POLE/FBRSL1
t(3;10)(q27;p15) BCL6/FBXO18
t(9;9)(p13;q32) PAX5/FKBP15
t(13;13)(q14;q14) RB1/FNDC3A
dic(9;20)(p13;q11) ZCCHC7/FRG1BP
t(4;10)(q35;q26) DUX4/FRG2B
t(13;13)(q13;q13) EEF1DP3/FRY
t(7;7)(p22;p22) GET4/TNRC18
t(1;1)(p33;q42) GNPAT/TAL1
t(X;X)(q25;q26) STAG2/GPR119
t(7;15)(p14;q21) GPR141/ONECUT1
t(2;7)(q35;q21) GTPBP10/BARD1
t(7;19)(q21;p13) DNM2/HEPACAM2
t(7;14)(p15;q32)
t(15;17)(q15;q11) WSB1/HYPK
t(9;9)(p21;p21) CDKN2A/IFNWP19
t(X;2)(q22;p11) IGKV3-20/RNA28S5
t(2;18)(p16;q11) KCTD1/SPTBN1
t(3;11)(q13.13;q23) KMT2A/KIAA1524
t(11;21)(p14;q22) RUNX1/KIAA1549L
t(9;11)(p13;p14) PAX5/KIAA1549L
t(11;21)(p13;q22) RUNX1/KIAA1549L
t(15;15)(q26;q26) PRC1/KIF7
t(6;6)(q22;q23) L3MBTL3/PTPRK
t(2;2)(p24;p25) RNF144A/LAPTM4A
t(8;19)(p11;q13) KAT6A/LEUTX
t(10;10)(q23;q24) LINC00502/TLX1
t(10;10)(q11;q11) TIMM23B/LINC00843
dic(9;20)(p13;q11 ZCCHC7/LOC1499503
t(8;8)(p11;q24) POLB/LRRC6
t(9;15)(q34;q15) MAP1A/NUP188
t(10;10)(q23;q24) MGEA5/RNLS

t(6;11)(q27;q23) KMT2A/AFDN
t(5;11)(q11;q23) MTREX/SIK3
t(11;19)(q23;p13) KMT2A/MYOF1
t(19;19)(p13;p13) PALM/NCLN
t(1;21)(p32;q22) RUNX1/NDC1
t(7;7)(p21;p21) NDUFA4/SCIN
t(14;14)(q11;q13) NKX2-1-AS1/TRD
t(1;1)(q21;q21) NOTCH2NL/NBPF10
t(1;1)(q25;q25) DHX09/NPL
DHX9/NPL (1q25)
t(9;15)(q34;q15) MAP1A/NUP188
t(X;9)(p22;p24) OFD1/JAK2
t(6;11)(q13;q12) EEF1G/OOEP
t(20;20)(q13;q13) PABPC1L/YWHAB
t(X;X)(p11;p11) PAGE2B/ALAS2
t(19;19)(p13;p13) PALM/NCLN
t(2;13)(q36;q14) PAX07/FOXO1
t(7;8)(p22;q11) PCMTD1/PRKAR1B
t(10;12)(q24;p13) PDZD7/ETV6
t(10;21)(q24;q22) RUNX1/PDZD7
t(2;2)(p23;p23) ASXL2/PFN4
ins(15;17)(q22;q21q26) PML/ADAMTS17/RARA
ins(15;17)(q22;q21q21) PML/CDC6/RARA
t(14;19)(q23;q13) UBA2/PPP1R36
t(19;19)(q13;q13) PPP1R37/PPP6R1
t(19;21)(p13;q22) MAP2K7/PRDM15
t(1;11)(q44;q24) ZNF124/PUS3
t(21;21)(q11;q11) RBM11/LIPI
t(14;14)(q24;q24) SUSD6/RBM25
t(8;21)(q21;q22) PDE9A/REXO1L1P
t(9;9)(p24;p24) RFX3/JAK2
t(7;11)(q34;p15) RIC3/TRBC2
t(7;11)(q34;p15) RIC3/TRB
t(X;2)(q22;p11) IGKV3-20/RNA28S5
t(X;14)(q22;q32) RNA28S5/BCL11B
t(X;17)(q22;q25) COG1/RNA28S5
t(12;15)(p13;q22) ETV6/RNU6-19P
t(7;7)(p15;q21) CDK6/RPL35P4
t(7;21)(q11;q22) RUNX1/UPK3B/DTX2
t(7;7)(p11;p12) SEPT7P2/PSPH
t(3;7)(p25;p12) IKZF1/SETD5
t(3;7)(p25;p12) SETD5/IKZF1
t(14;14)(q11;q13) SFTA3/TRDC
t(6;7)(q23;q22) SLC12A9/MYB
t(1;1)(p36;p36) CDK11B/SLC35E2
t(17;19)(p13;p13) SLC35G6/FBN3
t(14;14)(q23;q32) PPP2R5C/SLC38A6
t(9;9)(p21;p24) SMU1/JAK2
t(6;6)(q14;q14) SNHG5/SNX14
t(6;12)(q22-23;p13) STL/ETV6
del(6)(q23) LIN28B/STX07
t(6;21)(p22;q22) RUNX1/SUMO2P13
t(9;10)(p13;p14) PAX5/TAF3
t(3;7)(q26;q34) MECOM/TCRB1
t(10;10)(q11;q11) TIMM23B/LINC00843
t(10;14)(q24;q11) TLX1NB/TRDC
t(10;14)(q24;q11) TLX1NB/TRD
t(8;9)(p21;q21) TMEM2/PTK2B
t(8;9)(q24;q31) NRBP2/TMEM245
t(3;3)(p25;p25) RAF1/TMEM40
t(19;19)(q13;q13) TGFB1/TMEM91
t(9;19)(p13;p13) TMPRSS9/PAX5
t(14;14)(q22;q22) NIN/TMX1
inv(14)(q11q32) TRA-D/IGH
t(5;7)(p13;q34) IL7R/TRBC2
t(7;11)(q34;p15) RIC3/TRBC2
t(7;8)(q34;q12) PLAG1/TRBJ2-7
t(7;16)(q34;p13) CREBBP/TRBV23-1
inv(14)(q11.2q32.31) BCL11B/TRDC
t(10;14)(q24;q11) TLX1NB/TRDC
t(14;14)(q11;q13) SFTA3/TRDC
t(12;14)(q23;q11.2) TRDREC/C12orf42
t(15;16)(q21;p13) CREBBP/TRIM69
t(5;5)(p13;p13) PRKAA1/TTC33
t(14;14)(q23;q32) TTC7B/SYNE2
t(7;7)(p22;p22) TTYH3/MAD1L1
t(15;21)(q24;q22) RUNX1/UBL7
t(14;14)(q22;q32) NIN/UNC79
t(3;9)(p22;q34) VILL/ABCA2
t(X;8)(q25;q22) VPS13B/STAG2
t(16;16)(p13;p13) TRAF7/WDR24
Multiple Myeloma
t(8;11)(p11;p15) NUP98/WHSC1L1
t(18;21)(q22;q22) RUNX1/ZADH2
t(22;22)(q13;q13) C22orf34/ZBED4
t(11;13)(q23;q14) KMT2A/ZC3H13
t(11;13)(q23;q14) KMT2A/ZC3H13
t(13;13)(q12;q12) ZMYM5/PSPC1
t(1;11)(q44;q24) ZNF124/PUS3
t(14;14)(q11;q11) HNRNPC/ZNF219
t(14;14)(q11;q11) ZNF219/HNRNPC
t(9;19)(p24;q13) ZNF274/JAK2
t(9;16)(p13;q24) PAX5/ZNF276
t(1;9)(p35;p24) SMARCA2/ZNF362
t(1;9)(p35;p24) ZNF362/SMARCA2
t(7;7)(q22;q36) CUX1/ZNF398
t(9;19)(p24;p12) ZNF430/JAK2
t(19;19)(p12;p13) ZNF430/TYK2


Other Solid tumors implicated (Data extracted from papers in the Atlas)

Solid Tumors breastID5018 GastricTumOverviewID5410 GliomaOverviewID5763 LungSmallCellID5142 LymphangioLeiomyoID5135
PenileTumorID5278 RenalCellt0611ID5011 AmeloblastomID5945 MedulloblastomaID5065 rhabID5004
bladID5001 breastID5018 colonID5006 EmbryoRhabdomyoID5193 IrisHamartomaID5100
MedullaryThyroidCarcID5080 OvaryEpithTumID5230 rhabID5004 SkinMelanomID5416 SpermatSeminID5119
SpitzTumorID6241 ConvOsteoID5344 neurobID5002 OvarianGermCellID5067 AlvRhabdomyosarcID5194
bladID5001 breastID5018 rhabID5004 SalivGlandOverviewID5328 softissuTumID5042
TranslocLungSmallCellCarcID6651 TranslocLungSquamCellCarcID6819 AstrocytID5007 BoneTumorID5143 ConvOsteoID5344
LaryngealOverviewID5087


Other Cancer prone implicated (Data extracted from papers in the Atlas) [ 26 ]
  Oculocutaneous Albinism Porokeratosis of Mibelli Bloom syndrome Familial Myeloproliferative Disorders Oculocutaneous Albinism Familial clear cell renal cancer Xeroderma pigmentosum Glycogen storage disease type I (GSD I) Glycogen storage disease type I (GSD I) Familial Myeloproliferative Disorders Glycogen storage disease type I (GSD I) Beckwith-Wiedemann syndrome Hereditary paraganglioma (PGL) Dyskeratosis congenita (DKC) Weaver syndrome Simpson-Golabi-Behmel syndrome Glycogen storage disease type I (GSD I) Diamond-Blackfan anemia (DBA) Diamond-Blackfan anemia (DBA) Diamond-Blackfan anemia (DBA) Oculocutaneous Albinism Diamond-Blackfan anemia (DBA) Xeroderma pigmentosum Xeroderma pigmentosum Xeroderma pigmentosum Xeroderma pigmentosum
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