Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumours   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

LYZ (lysozyme)

Identity

Alias_nameslysozyme (renal amyloidosis)
Other aliasLYZF1
LZM
HGNC (Hugo) LYZ
LocusID (NCBI) 4069
Atlas_Id 46133
Location 12q15  [Link to chromosome band 12q15]
Location_base_pair Starts at 69742134 and ends at 69748013 bp from pter ( according to hg19-Feb_2009)
Fusion genes
(updated 2016)
ALCAM (3q13.11) / LYZ (12q15)CUL1 (7q36.1) / LYZ (12q15)FRS2 (12q15) / LYZ (12q15)
LCN1 (9q34.3) / LYZ (12q15)LEMD3 (12q14.3) / LYZ (12q15)LILRB1 (19q13.42) / LYZ (12q15)
LYZ (12q15) / ABHD2 (15q26.1)LYZ (12q15) / AFF1 (4q21.3)LYZ (12q15) / AP4M1 (7q22.1)
LYZ (12q15) / DDOST (1p36.12)LYZ (12q15) / HINT3 (6q22.32)LYZ (12q15) / MS4A7 (11q12.2)
LYZ (12q15) / RSAD2 (2p25.2)LYZ (12q15) / ZNF667 (19q13.43)LYZ (12q15) / ZZZ3 (1p31.1)
MRPS30 (5p12) / LYZ (12q15)NAALADL2 (3q26.31) / LYZ (12q15)NFU1 (2p13.3) / LYZ (12q15)
PRKCA (17q24.2) / LYZ (12q15)RFK (9q21.13) / LYZ (12q15)TMEM63A (1q42.12) / LYZ (12q15)
YEATS4 (12q15) / LYZ (12q15)FRS2 12q15 / LYZ 12q15LEMD3 12q14.3 / LYZ 12q15
YEATS4 12q15 / LYZ 12q15

Note

Non-annotated gene. Preliminary data : if you are an author
who wish to write a full paper/card on this gene, go to  How to contribute

DNA/RNA

 


External links

Nomenclature
HGNC (Hugo)LYZ   6740
LRG (Locus Reference Genomic)LRG_768
Cards
Entrez_Gene (NCBI)LYZ  4069  lysozyme
AliasesLYZF1; LZM
GeneCards (Weizmann)LYZ
Ensembl hg19 (Hinxton)ENSG00000090382 [Gene_View]  chr12:69742134-69748013 [Contig_View]  LYZ [Vega]
Ensembl hg38 (Hinxton)ENSG00000090382 [Gene_View]  chr12:69742134-69748013 [Contig_View]  LYZ [Vega]
ICGC DataPortalENSG00000090382
TCGA cBioPortalLYZ
AceView (NCBI)LYZ
Genatlas (Paris)LYZ
WikiGenes4069
SOURCE (Princeton)LYZ
Genetics Home Reference (NIH)LYZ
Genomic and cartography
GoldenPath hg19 (UCSC)LYZ  -     chr12:69742134-69748013 +  12q15   [Description]    (hg19-Feb_2009)
GoldenPath hg38 (UCSC)LYZ  -     12q15   [Description]    (hg38-Dec_2013)
EnsemblLYZ - 12q15 [CytoView hg19]  LYZ - 12q15 [CytoView hg38]
Mapping of homologs : NCBILYZ [Mapview hg19]  LYZ [Mapview hg38]
OMIM105200   153450   
Gene and transcription
Genbank (Entrez)AK130127 AK130149 AK310930 AK311779 BC004147
RefSeq transcript (Entrez)NM_000239
RefSeq genomic (Entrez)NC_000012 NC_018923 NG_008195 NT_029419 NW_004929384
Consensus coding sequences : CCDS (NCBI)LYZ
Cluster EST : UnigeneHs.524579 [ NCBI ]
CGAP (NCI)Hs.524579
Alternative Splicing GalleryENSG00000090382
Gene ExpressionLYZ [ NCBI-GEO ]   LYZ [ EBI - ARRAY_EXPRESS ]   LYZ [ SEEK ]   LYZ [ MEM ]
Gene Expression Viewer (FireBrowse)LYZ [ Firebrowse - Broad ]
SOURCE (Princeton)Expression in : [Datasets]   [Normal Tissue Atlas]  [carcinoma Classsification]  [NCI60]
GenevisibleExpression in : [tissues]  [cell-lines]  [cancer]  [perturbations]  
BioGPS (Tissue expression)4069
GTEX Portal (Tissue expression)LYZ
Protein : pattern, domain, 3D structure
UniProt/SwissProtP61626   [function]  [subcellular_location]  [family_and_domains]  [pathology_and_biotech]  [ptm_processing]  [expression]  [interaction]
NextProtP61626  [Sequence]  [Exons]  [Medical]  [Publications]
With graphics : InterProP61626
Splice isoforms : SwissVarP61626
Catalytic activity : Enzyme3.2.1.17 [ Enzyme-Expasy ]   3.2.1.173.2.1.17 [ IntEnz-EBI ]   3.2.1.17 [ BRENDA ]   3.2.1.17 [ KEGG ]   
PhosPhoSitePlusP61626
Domaine pattern : Prosite (Expaxy)LACTALBUMIN_LYSOZYME_1 (PS00128)    LACTALBUMIN_LYSOZYME_2 (PS51348)   
Domains : Interpro (EBI)Glyco_hydro_22    Glyco_hydro_22_CS    Glyco_hydro_22_lys    Lysozyme-like_dom   
Domain families : Pfam (Sanger)Lys (PF00062)   
Domain families : Pfam (NCBI)pfam00062   
Domain families : Smart (EMBL)LYZ1 (SM00263)  
Conserved Domain (NCBI)LYZ
DMDM Disease mutations4069
Blocks (Seattle)LYZ
PDB (SRS)133L    134L    1B5U    1B5V    1B5W    1B5X    1B5Y    1B5Z    1B7L    1B7M    1B7N    1B7O    1B7P    1B7Q    1B7R    1B7S    1BB3    1BB4    1BB5    1C43    1C45    1C46    1C7P    1CJ6    1CJ7    1CJ8    1CJ9    1CKC    1CKD    1CKF    1CKG    1CKH    1D6P    1D6Q    1DI3    1DI4    1DI5    1EQ4    1EQ5    1EQE    1GAY    1GAZ    1GB0    1GB2    1GB3    1GB5    1GB6    1GB7    1GB8    1GB9    1GBO    1GBW    1GBX    1GBY    1GBZ    1GDW    1GDX    1GE0    1GE1    1GE2    1GE3    1GE4    1GEV    1GEZ    1GF0    1GF3    1GF4    1GF5    1GF6    1GF7    1GF8    1GF9    1GFA    1GFE    1GFG    1GFH    1GFJ    1GFK    1GFR    1GFT    1GFU    1GFV    1HNL    1I1Z    1I20    1I22    1INU    1IOC    1IP1    1IP2    1IP3    1IP4    1IP5    1IP6    1IP7    1IWT    1IWU    1IWV    1IWW    1IWX    1IWY    1IWZ    1IX0    1IY3    1IY4    1JKA    1JKB    1JKC    1JKD    1JSF    1JWR    1LAA    1LHH    1LHI    1LHJ    1LHK    1LHL    1LHM    1LMT    1LOZ    1LYY    1LZ1    1LZ4    1LZ5    1LZ6    1LZR    1LZS    1OP9    1OUA    1OUB    1OUC    1OUD    1OUE    1OUF    1OUG    1OUH    1OUI    1OUJ    1QSW    1RE2    1REM    1REX    1REY    1REZ    1TAY    1TBY    1TCY    1TDY    1UBZ    1W08    1WQM    1WQN    1WQO    1WQP    1WQQ    1WQR    1YAM    1YAN    1YAO    1YAP    1YAQ    207L    208L    2BQA    2BQB    2BQC    2BQD    2BQE    2BQF    2BQG    2BQH    2BQI    2BQJ    2BQK    2BQL    2BQM    2BQN    2BQO    2HEA    2HEB    2HEC    2HED    2HEE    2HEF    2LHM    2MEA    2MEB    2MEC    2MED    2MEE    2MEF    2MEG    2MEH    2MEI    2NWD    2ZIJ    2ZIK    2ZIL    2ZWB    3EBA    3FE0    3LHM    3LN2    4I0C    4ML7    4R0P   
PDB (PDBSum)133L    134L    1B5U    1B5V    1B5W    1B5X    1B5Y    1B5Z    1B7L    1B7M    1B7N    1B7O    1B7P    1B7Q    1B7R    1B7S    1BB3    1BB4    1BB5    1C43    1C45    1C46    1C7P    1CJ6    1CJ7    1CJ8    1CJ9    1CKC    1CKD    1CKF    1CKG    1CKH    1D6P    1D6Q    1DI3    1DI4    1DI5    1EQ4    1EQ5    1EQE    1GAY    1GAZ    1GB0    1GB2    1GB3    1GB5    1GB6    1GB7    1GB8    1GB9    1GBO    1GBW    1GBX    1GBY    1GBZ    1GDW    1GDX    1GE0    1GE1    1GE2    1GE3    1GE4    1GEV    1GEZ    1GF0    1GF3    1GF4    1GF5    1GF6    1GF7    1GF8    1GF9    1GFA    1GFE    1GFG    1GFH    1GFJ    1GFK    1GFR    1GFT    1GFU    1GFV    1HNL    1I1Z    1I20    1I22    1INU    1IOC    1IP1    1IP2    1IP3    1IP4    1IP5    1IP6    1IP7    1IWT    1IWU    1IWV    1IWW    1IWX    1IWY    1IWZ    1IX0    1IY3    1IY4    1JKA    1JKB    1JKC    1JKD    1JSF    1JWR    1LAA    1LHH    1LHI    1LHJ    1LHK    1LHL    1LHM    1LMT    1LOZ    1LYY    1LZ1    1LZ4    1LZ5    1LZ6    1LZR    1LZS    1OP9    1OUA    1OUB    1OUC    1OUD    1OUE    1OUF    1OUG    1OUH    1OUI    1OUJ    1QSW    1RE2    1REM    1REX    1REY    1REZ    1TAY    1TBY    1TCY    1TDY    1UBZ    1W08    1WQM    1WQN    1WQO    1WQP    1WQQ    1WQR    1YAM    1YAN    1YAO    1YAP    1YAQ    207L    208L    2BQA    2BQB    2BQC    2BQD    2BQE    2BQF    2BQG    2BQH    2BQI    2BQJ    2BQK    2BQL    2BQM    2BQN    2BQO    2HEA    2HEB    2HEC    2HED    2HEE    2HEF    2LHM    2MEA    2MEB    2MEC    2MED    2MEE    2MEF    2MEG    2MEH    2MEI    2NWD    2ZIJ    2ZIK    2ZIL    2ZWB    3EBA    3FE0    3LHM    3LN2    4I0C    4ML7    4R0P   
PDB (IMB)133L    134L    1B5U    1B5V    1B5W    1B5X    1B5Y    1B5Z    1B7L    1B7M    1B7N    1B7O    1B7P    1B7Q    1B7R    1B7S    1BB3    1BB4    1BB5    1C43    1C45    1C46    1C7P    1CJ6    1CJ7    1CJ8    1CJ9    1CKC    1CKD    1CKF    1CKG    1CKH    1D6P    1D6Q    1DI3    1DI4    1DI5    1EQ4    1EQ5    1EQE    1GAY    1GAZ    1GB0    1GB2    1GB3    1GB5    1GB6    1GB7    1GB8    1GB9    1GBO    1GBW    1GBX    1GBY    1GBZ    1GDW    1GDX    1GE0    1GE1    1GE2    1GE3    1GE4    1GEV    1GEZ    1GF0    1GF3    1GF4    1GF5    1GF6    1GF7    1GF8    1GF9    1GFA    1GFE    1GFG    1GFH    1GFJ    1GFK    1GFR    1GFT    1GFU    1GFV    1HNL    1I1Z    1I20    1I22    1INU    1IOC    1IP1    1IP2    1IP3    1IP4    1IP5    1IP6    1IP7    1IWT    1IWU    1IWV    1IWW    1IWX    1IWY    1IWZ    1IX0    1IY3    1IY4    1JKA    1JKB    1JKC    1JKD    1JSF    1JWR    1LAA    1LHH    1LHI    1LHJ    1LHK    1LHL    1LHM    1LMT    1LOZ    1LYY    1LZ1    1LZ4    1LZ5    1LZ6    1LZR    1LZS    1OP9    1OUA    1OUB    1OUC    1OUD    1OUE    1OUF    1OUG    1OUH    1OUI    1OUJ    1QSW    1RE2    1REM    1REX    1REY    1REZ    1TAY    1TBY    1TCY    1TDY    1UBZ    1W08    1WQM    1WQN    1WQO    1WQP    1WQQ    1WQR    1YAM    1YAN    1YAO    1YAP    1YAQ    207L    208L    2BQA    2BQB    2BQC    2BQD    2BQE    2BQF    2BQG    2BQH    2BQI    2BQJ    2BQK    2BQL    2BQM    2BQN    2BQO    2HEA    2HEB    2HEC    2HED    2HEE    2HEF    2LHM    2MEA    2MEB    2MEC    2MED    2MEE    2MEF    2MEG    2MEH    2MEI    2NWD    2ZIJ    2ZIK    2ZIL    2ZWB    3EBA    3FE0    3LHM    3LN2    4I0C    4ML7    4R0P   
PDB (RSDB)133L    134L    1B5U    1B5V    1B5W    1B5X    1B5Y    1B5Z    1B7L    1B7M    1B7N    1B7O    1B7P    1B7Q    1B7R    1B7S    1BB3    1BB4    1BB5    1C43    1C45    1C46    1C7P    1CJ6    1CJ7    1CJ8    1CJ9    1CKC    1CKD    1CKF    1CKG    1CKH    1D6P    1D6Q    1DI3    1DI4    1DI5    1EQ4    1EQ5    1EQE    1GAY    1GAZ    1GB0    1GB2    1GB3    1GB5    1GB6    1GB7    1GB8    1GB9    1GBO    1GBW    1GBX    1GBY    1GBZ    1GDW    1GDX    1GE0    1GE1    1GE2    1GE3    1GE4    1GEV    1GEZ    1GF0    1GF3    1GF4    1GF5    1GF6    1GF7    1GF8    1GF9    1GFA    1GFE    1GFG    1GFH    1GFJ    1GFK    1GFR    1GFT    1GFU    1GFV    1HNL    1I1Z    1I20    1I22    1INU    1IOC    1IP1    1IP2    1IP3    1IP4    1IP5    1IP6    1IP7    1IWT    1IWU    1IWV    1IWW    1IWX    1IWY    1IWZ    1IX0    1IY3    1IY4    1JKA    1JKB    1JKC    1JKD    1JSF    1JWR    1LAA    1LHH    1LHI    1LHJ    1LHK    1LHL    1LHM    1LMT    1LOZ    1LYY    1LZ1    1LZ4    1LZ5    1LZ6    1LZR    1LZS    1OP9    1OUA    1OUB    1OUC    1OUD    1OUE    1OUF    1OUG    1OUH    1OUI    1OUJ    1QSW    1RE2    1REM    1REX    1REY    1REZ    1TAY    1TBY    1TCY    1TDY    1UBZ    1W08    1WQM    1WQN    1WQO    1WQP    1WQQ    1WQR    1YAM    1YAN    1YAO    1YAP    1YAQ    207L    208L    2BQA    2BQB    2BQC    2BQD    2BQE    2BQF    2BQG    2BQH    2BQI    2BQJ    2BQK    2BQL    2BQM    2BQN    2BQO    2HEA    2HEB    2HEC    2HED    2HEE    2HEF    2LHM    2MEA    2MEB    2MEC    2MED    2MEE    2MEF    2MEG    2MEH    2MEI    2NWD    2ZIJ    2ZIK    2ZIL    2ZWB    3EBA    3FE0    3LHM    3LN2    4I0C    4ML7    4R0P   
Structural Biology KnowledgeBase133L    134L    1B5U    1B5V    1B5W    1B5X    1B5Y    1B5Z    1B7L    1B7M    1B7N    1B7O    1B7P    1B7Q    1B7R    1B7S    1BB3    1BB4    1BB5    1C43    1C45    1C46    1C7P    1CJ6    1CJ7    1CJ8    1CJ9    1CKC    1CKD    1CKF    1CKG    1CKH    1D6P    1D6Q    1DI3    1DI4    1DI5    1EQ4    1EQ5    1EQE    1GAY    1GAZ    1GB0    1GB2    1GB3    1GB5    1GB6    1GB7    1GB8    1GB9    1GBO    1GBW    1GBX    1GBY    1GBZ    1GDW    1GDX    1GE0    1GE1    1GE2    1GE3    1GE4    1GEV    1GEZ    1GF0    1GF3    1GF4    1GF5    1GF6    1GF7    1GF8    1GF9    1GFA    1GFE    1GFG    1GFH    1GFJ    1GFK    1GFR    1GFT    1GFU    1GFV    1HNL    1I1Z    1I20    1I22    1INU    1IOC    1IP1    1IP2    1IP3    1IP4    1IP5    1IP6    1IP7    1IWT    1IWU    1IWV    1IWW    1IWX    1IWY    1IWZ    1IX0    1IY3    1IY4    1JKA    1JKB    1JKC    1JKD    1JSF    1JWR    1LAA    1LHH    1LHI    1LHJ    1LHK    1LHL    1LHM    1LMT    1LOZ    1LYY    1LZ1    1LZ4    1LZ5    1LZ6    1LZR    1LZS    1OP9    1OUA    1OUB    1OUC    1OUD    1OUE    1OUF    1OUG    1OUH    1OUI    1OUJ    1QSW    1RE2    1REM    1REX    1REY    1REZ    1TAY    1TBY    1TCY    1TDY    1UBZ    1W08    1WQM    1WQN    1WQO    1WQP    1WQQ    1WQR    1YAM    1YAN    1YAO    1YAP    1YAQ    207L    208L    2BQA    2BQB    2BQC    2BQD    2BQE    2BQF    2BQG    2BQH    2BQI    2BQJ    2BQK    2BQL    2BQM    2BQN    2BQO    2HEA    2HEB    2HEC    2HED    2HEE    2HEF    2LHM    2MEA    2MEB    2MEC    2MED    2MEE    2MEF    2MEG    2MEH    2MEI    2NWD    2ZIJ    2ZIK    2ZIL    2ZWB    3EBA    3FE0    3LHM    3LN2    4I0C    4ML7    4R0P   
SCOP (Structural Classification of Proteins)133L    134L    1B5U    1B5V    1B5W    1B5X    1B5Y    1B5Z    1B7L    1B7M    1B7N    1B7O    1B7P    1B7Q    1B7R    1B7S    1BB3    1BB4    1BB5    1C43    1C45    1C46    1C7P    1CJ6    1CJ7    1CJ8    1CJ9    1CKC    1CKD    1CKF    1CKG    1CKH    1D6P    1D6Q    1DI3    1DI4    1DI5    1EQ4    1EQ5    1EQE    1GAY    1GAZ    1GB0    1GB2    1GB3    1GB5    1GB6    1GB7    1GB8    1GB9    1GBO    1GBW    1GBX    1GBY    1GBZ    1GDW    1GDX    1GE0    1GE1    1GE2    1GE3    1GE4    1GEV    1GEZ    1GF0    1GF3    1GF4    1GF5    1GF6    1GF7    1GF8    1GF9    1GFA    1GFE    1GFG    1GFH    1GFJ    1GFK    1GFR    1GFT    1GFU    1GFV    1HNL    1I1Z    1I20    1I22    1INU    1IOC    1IP1    1IP2    1IP3    1IP4    1IP5    1IP6    1IP7    1IWT    1IWU    1IWV    1IWW    1IWX    1IWY    1IWZ    1IX0    1IY3    1IY4    1JKA    1JKB    1JKC    1JKD    1JSF    1JWR    1LAA    1LHH    1LHI    1LHJ    1LHK    1LHL    1LHM    1LMT    1LOZ    1LYY    1LZ1    1LZ4    1LZ5    1LZ6    1LZR    1LZS    1OP9    1OUA    1OUB    1OUC    1OUD    1OUE    1OUF    1OUG    1OUH    1OUI    1OUJ    1QSW    1RE2    1REM    1REX    1REY    1REZ    1TAY    1TBY    1TCY    1TDY    1UBZ    1W08    1WQM    1WQN    1WQO    1WQP    1WQQ    1WQR    1YAM    1YAN    1YAO    1YAP    1YAQ    207L    208L    2BQA    2BQB    2BQC    2BQD    2BQE    2BQF    2BQG    2BQH    2BQI    2BQJ    2BQK    2BQL    2BQM    2BQN    2BQO    2HEA    2HEB    2HEC    2HED    2HEE    2HEF    2LHM    2MEA    2MEB    2MEC    2MED    2MEE    2MEF    2MEG    2MEH    2MEI    2NWD    2ZIJ    2ZIK    2ZIL    2ZWB    3EBA    3FE0    3LHM    3LN2    4I0C    4ML7    4R0P   
CATH (Classification of proteins structures)133L    134L    1B5U    1B5V    1B5W    1B5X    1B5Y    1B5Z    1B7L    1B7M    1B7N    1B7O    1B7P    1B7Q    1B7R    1B7S    1BB3    1BB4    1BB5    1C43    1C45    1C46    1C7P    1CJ6    1CJ7    1CJ8    1CJ9    1CKC    1CKD    1CKF    1CKG    1CKH    1D6P    1D6Q    1DI3    1DI4    1DI5    1EQ4    1EQ5    1EQE    1GAY    1GAZ    1GB0    1GB2    1GB3    1GB5    1GB6    1GB7    1GB8    1GB9    1GBO    1GBW    1GBX    1GBY    1GBZ    1GDW    1GDX    1GE0    1GE1    1GE2    1GE3    1GE4    1GEV    1GEZ    1GF0    1GF3    1GF4    1GF5    1GF6    1GF7    1GF8    1GF9    1GFA    1GFE    1GFG    1GFH    1GFJ    1GFK    1GFR    1GFT    1GFU    1GFV    1HNL    1I1Z    1I20    1I22    1INU    1IOC    1IP1    1IP2    1IP3    1IP4    1IP5    1IP6    1IP7    1IWT    1IWU    1IWV    1IWW    1IWX    1IWY    1IWZ    1IX0    1IY3    1IY4    1JKA    1JKB    1JKC    1JKD    1JSF    1JWR    1LAA    1LHH    1LHI    1LHJ    1LHK    1LHL    1LHM    1LMT    1LOZ    1LYY    1LZ1    1LZ4    1LZ5    1LZ6    1LZR    1LZS    1OP9    1OUA    1OUB    1OUC    1OUD    1OUE    1OUF    1OUG    1OUH    1OUI    1OUJ    1QSW    1RE2    1REM    1REX    1REY    1REZ    1TAY    1TBY    1TCY    1TDY    1UBZ    1W08    1WQM    1WQN    1WQO    1WQP    1WQQ    1WQR    1YAM    1YAN    1YAO    1YAP    1YAQ    207L    208L    2BQA    2BQB    2BQC    2BQD    2BQE    2BQF    2BQG    2BQH    2BQI    2BQJ    2BQK    2BQL    2BQM    2BQN    2BQO    2HEA    2HEB    2HEC    2HED    2HEE    2HEF    2LHM    2MEA    2MEB    2MEC    2MED    2MEE    2MEF    2MEG    2MEH    2MEI    2NWD    2ZIJ    2ZIK    2ZIL    2ZWB    3EBA    3FE0    3LHM    3LN2    4I0C    4ML7    4R0P   
SuperfamilyP61626
Human Protein AtlasENSG00000090382
Peptide AtlasP61626
HPRD01085
IPIIPI00019038   IPI01022818   IPI01023021   
Protein Interaction databases
DIP (DOE-UCLA)P61626
IntAct (EBI)P61626
FunCoupENSG00000090382
BioGRIDLYZ
STRING (EMBL)LYZ
ZODIACLYZ
Ontologies - Pathways
QuickGOP61626
Ontology : AmiGOretina homeostasis  lysozyme activity  extracellular region  extracellular space  extracellular space  inflammatory response  cytolysis  defense response to bacterium  identical protein binding  cellular protein metabolic process  extracellular exosome  
Ontology : EGO-EBIretina homeostasis  lysozyme activity  extracellular region  extracellular space  extracellular space  inflammatory response  cytolysis  defense response to bacterium  identical protein binding  cellular protein metabolic process  extracellular exosome  
Pathways : KEGGSalivary secretion   
NDEx NetworkLYZ
Atlas of Cancer Signalling NetworkLYZ
Wikipedia pathwaysLYZ
Orthology - Evolution
OrthoDB4069
GeneTree (enSembl)ENSG00000090382
Phylogenetic Trees/Animal Genes : TreeFamLYZ
HOVERGENP61626
HOGENOMP61626
Homologs : HomoloGeneLYZ
Homology/Alignments : Family Browser (UCSC)LYZ
Gene fusions - Rearrangements
Fusion : MitelmanLEMD3/LYZ [12q14.3/12q15]  [t(12;12)(q14;q15)]  
Fusion: TCGAFRS2 12q15 LYZ 12q15 BRCA LUAD
Fusion: TCGALEMD3 12q14.3 LYZ 12q15 BRCA
Fusion: TCGAYEATS4 12q15 LYZ 12q15 BLCA
Polymorphisms : SNP and Copy number variants
NCBI Variation ViewerLYZ [hg38]
dbSNP Single Nucleotide Polymorphism (NCBI)LYZ
dbVarLYZ
ClinVarLYZ
1000_GenomesLYZ 
Exome Variant ServerLYZ
ExAC (Exome Aggregation Consortium)LYZ (select the gene name)
Genetic variants : HAPMAP4069
Genomic Variants (DGV)LYZ [DGVbeta]
DECIPHER (Syndromes)12:69742134-69748013  ENSG00000090382
CONAN: Copy Number AnalysisLYZ 
Mutations
ICGC Data PortalLYZ 
TCGA Data PortalLYZ 
Broad Tumor PortalLYZ
OASIS PortalLYZ [ Somatic mutations - Copy number]
Somatic Mutations in Cancer : COSMICLYZ  [overview]  [genome browser]  [tissue]  [distribution]  
Mutations and Diseases : HGMDLYZ
LOVD (Leiden Open Variation Database)Whole genome datasets
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD - Leiden Open Variation Database
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD 3.0 shared installation
BioMutasearch LYZ
DgiDB (Drug Gene Interaction Database)LYZ
DoCM (Curated mutations)LYZ (select the gene name)
CIViC (Clinical Interpretations of Variants in Cancer)LYZ (select a term)
intoGenLYZ
Cancer3DLYZ(select the gene name)
Impact of mutations[PolyPhen2] [SIFT Human Coding SNP] [Buck Institute : MutDB] [Mutation Assessor] [Mutanalyser]
Diseases
OMIM105200    153450   
Orphanet12403   
MedgenLYZ
Genetic Testing Registry LYZ
NextProtP61626 [Medical]
TSGene4069
GENETestsLYZ
Huge Navigator LYZ [HugePedia]
snp3D : Map Gene to Disease4069
BioCentury BCIQLYZ
ClinGenLYZ
Clinical trials, drugs, therapy
Chemical/Protein Interactions : CTD4069
Chemical/Pharm GKB GenePA30503
Clinical trialLYZ
Miscellaneous
canSAR (ICR)LYZ (select the gene name)
Probes
Litterature
PubMed102 Pubmed reference(s) in Entrez
GeneRIFsGene References Into Functions (Entrez)
CoreMineLYZ
EVEXLYZ
GoPubMedLYZ
iHOPLYZ
Genes in titleautomatic search in PubMed
REVIEW articlesautomatic search in PubMed
Last year publicationsautomatic search in PubMed

Search in all EBI   NCBI

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Tue Mar 14 13:14:03 CET 2017

Home   Genes   Leukemias   Solid Tumours   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

For comments and suggestions or contributions, please contact us

jlhuret@AtlasGeneticsOncology.org.