Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

NCOA2 (nuclear receptor coactivator 2)

Identity

Alias_symbol (synonym)TIF2
GRIP1
NCoA-2
KAT13C
bHLHe75
Other aliasSRC2
HGNC (Hugo) NCOA2
LocusID (NCBI) 10499
Atlas_Id 141
Location 8q13.3  [Link to chromosome band 8q13]
Location_base_pair Starts at 70109762 and ends at 70403840 bp from pter ( according to hg38-Dec_2013)
Fusion genes
(updated 2017)
Data from Atlas, Mitelman, Cosmic Fusion, Fusion Cancer, TCGA fusion databases with official HUGO symbols (see references in chromosomal bands)
AHRR (5p15.33) / NCOA2 (8q13.3)AKAP13 (15q25.3) / NCOA2 (8q13.3)ETV6 (12p13.2) / NCOA2 (8q13.3)
GTF2I (7q11.23) / NCOA2 (8q13.3)HEY1 (8q21.13) / NCOA2 (8q13.3)HMGN3 (6q14.1) / NCOA2 (8q13.3)
KAT6A (8p11.21) / NCOA2 (8q13.3)NCOA2 (8q13.3) / ARFGEF1 (8q13.2)NCOA2 (8q13.3) / CAPZB (1p36.13)
NCOA2 (8q13.3) / HEY1 (8q21.13)NCOA2 (8q13.3) / KAT6A (8p11.21)NCOA2 (8q13.3) / KLHL28 (14q21.2)
NCOA2 (8q13.3) / LEPROTL1 (8p12)NCOA2 (8q13.3) / MAP2K3 (17p11.2)NCOA2 (8q13.3) / NCALD (8q22.3)
NCOA2 (8q13.3) / NCOA2 (8q13.3)NCOA2 (8q13.3) / PTPRE (10q26.2)NCOA2 (8q13.3) / RHOB (2p24.1)
NCOA2 (8q13.3) / RUNXBP2 ()NCOA2 (8q13.3) / SLC35B4 (7q33)NCOA2 (8q13.3) / SLC7A1 (13q12.3)
NCOA2 (8q13.3) / SNTG1 (8q11.21)NCOA2 (8q13.3) / ST18 (8q11.23)NCOA2 (8q13.3) / XKR9 (8q13.3)
NCOA2 (8q13.3) / ZNF704 (8q21.13)PAX3 (2q36.1) / NCOA2 (8q13.3)SH2D6 (2p11.2) / NCOA2 (8q13.3)
SRF (6p21.1) / NCOA2 (8q13.3)TEAD1 (11p15.3) / NCOA2 (8q13.3)THSD7B (2q22.1) / NCOA2 (8q13.3)
HEY1 NCOA2PAX3 NCOA2NCOA2 8q13.3 / ARFGEF1 8q13.2
NCOA2 8q13.3 / LEPROTL1 8p12NCOA2 8q13.3 / NCALD 8q22.3NCOA2 8q13.3 / ST18 8q11.23
NCOA2 8q13.3 / XKR9 8q13.3SH2D6 2p11.2 / NCOA2 8q13.3

Note

Non-annotated gene. Preliminary data : if you are an author
who wish to write a full paper/card on this gene, go to  How to contribute

DNA/RNA

 

Breakpoints

 


Other Leukemias implicated (Data extracted from papers in the Atlas) [ 3 ]
  inv(8)(p11q13) KAT6A/NCOA2
t(8;12)(q13;p13) ETV6/NCOA2
t(8;16)(p11;p13) KAT6A/CREBBP


Other Solid tumors implicated (Data extracted from papers in the Atlas) [ 20 ]
  Soft Tissues: Alveolar rhabdomyosarcoma
Soft Tissues: Angiofibroma
Soft Tissues: Rhabdomyosarcoma
Soft tissue tumors: an overview
Soft Tissues: Alveolar rhabdomyosarcoma with t(2;2)(p23;q35) PAX3/NCOA1
GTF2I/NCOA2 ()
t(2;8)(p11;q13) SH2D6/NCOA2
t(2;8)(q36;q13) PAX3/NCOA2
t(6;8)(p21;q13) SRF/NCOA2
t(6;8)(q22;q13) VGLL2/NCOA2
t(8;8)(p12;q13) NCOA2/LEPROTL1
t(8;8)(q11;q13) NCOA2/ST18
LACTB2/NCOA2 (8q13)
NCOA2/ARFGEF1 (8q13)
NCOA2/XKR9 (8q13)
t(8;8)(q13;q21) NCOA2/ZNF704
t(8;8)(q13;q21) HEY1/NCOA2
t(8;8)(q13;q22) NCOA2/NCALD
t(8;11)(q13;p15) TEAD1/NCOA2
t(8;17)(q13;q21) NCOA2/ETV4


External links

Nomenclature
HGNC (Hugo)NCOA2   7669
Cards
Entrez_Gene (NCBI)NCOA2  10499  nuclear receptor coactivator 2
AliasesGRIP1; KAT13C; NCoA-2; SRC2; 
TIF2; bHLHe75
GeneCards (Weizmann)NCOA2
Ensembl hg19 (Hinxton)ENSG00000140396 [Gene_View]
Ensembl hg38 (Hinxton)ENSG00000140396 [Gene_View]  ENSG00000140396 [Sequence]  chr8:70109762-70403840 [Contig_View]  NCOA2 [Vega]
ICGC DataPortalENSG00000140396
TCGA cBioPortalNCOA2
AceView (NCBI)NCOA2
Genatlas (Paris)NCOA2
WikiGenes10499
SOURCE (Princeton)NCOA2
Genetics Home Reference (NIH)NCOA2
Genomic and cartography
GoldenPath hg38 (UCSC)NCOA2  -     chr8:70109762-70403840 -  8q13.3   [Description]    (hg38-Dec_2013)
GoldenPath hg19 (UCSC)NCOA2  -     8q13.3   [Description]    (hg19-Feb_2009)
EnsemblNCOA2 - 8q13.3 [CytoView hg19]  NCOA2 - 8q13.3 [CytoView hg38]
Mapping of homologs : NCBINCOA2 [Mapview hg19]  NCOA2 [Mapview hg38]
OMIM601993   
Gene and transcription
Genbank (Entrez)AI652063 AK298528 AK308426 AL712418 AW504723
RefSeq transcript (Entrez)NM_001321703 NM_001321707 NM_001321711 NM_001321712 NM_001321713 NM_006540
RefSeq genomic (Entrez)
Consensus coding sequences : CCDS (NCBI)NCOA2
Cluster EST : UnigeneHs.595378 [ NCBI ]
CGAP (NCI)Hs.595378
Alternative Splicing GalleryENSG00000140396
Gene ExpressionNCOA2 [ NCBI-GEO ]   NCOA2 [ EBI - ARRAY_EXPRESS ]   NCOA2 [ SEEK ]   NCOA2 [ MEM ]
Gene Expression Viewer (FireBrowse)NCOA2 [ Firebrowse - Broad ]
SOURCE (Princeton)Expression in : [Datasets]   [Normal Tissue Atlas]  [carcinoma Classsification]  [NCI60]
GenevestigatorExpression in : [tissues]  [cell-lines]  [cancer]  [perturbations]  
BioGPS (Tissue expression)10499
GTEX Portal (Tissue expression)NCOA2
Human Protein AtlasENSG00000140396-NCOA2 [pathology]   [cell]   [tissue]
Protein : pattern, domain, 3D structure
UniProt/SwissProtQ15596   [function]  [subcellular_location]  [family_and_domains]  [pathology_and_biotech]  [ptm_processing]  [expression]  [interaction]
NextProtQ15596  [Sequence]  [Exons]  [Medical]  [Publications]
With graphics : InterProQ15596
Splice isoforms : SwissVarQ15596
PhosPhoSitePlusQ15596
Domaine pattern : Prosite (Expaxy)BHLH (PS50888)    PAS (PS50112)   
Domains : Interpro (EBI)bHLH_dom    DUF1518    DUF4927    HLH_DNA-bd_sf    NCOA2    Nuc_rcpt_coact    Nuc_rcpt_coact_Ncoa-typ    Nuc_rcpt_coact_Ncoa_int_sf    Nuclear_rcpt_coactivator    PAS    PAS-like_dom_sf    PAS_fold    SRC/p160_LXXLL   
Domain families : Pfam (Sanger)DUF1518 (PF07469)    DUF4927 (PF16279)    Nuc_rec_co-act (PF08815)    PAS (PF00989)    SRC-1 (PF08832)   
Domain families : Pfam (NCBI)pfam07469    pfam16279    pfam08815    pfam00989    pfam08832   
Domain families : Smart (EMBL)DUF1518 (SM01151)  HLH (SM00353)  PAS (SM00091)  
Conserved Domain (NCBI)NCOA2
DMDM Disease mutations10499
Blocks (Seattle)NCOA2
PDB (SRS)1GWQ    1GWR    1M2Z    1MV9    1MVC    1MZN    1P93    1T63    1T65    1UHL    1YOK    1ZDT    1ZDU    1ZKY    2AO6    2B1V    2B1Z    2B23    2FAI    2G44    2G5O    2LDC    2P15    2P1T    2P1U    2P1V    2Q7J    2Q7L    2YJD    2ZXZ    2ZY0    3A9E    3CLD    3DZU    3DZY    3E00    3E7C    3E94    3ERD    3FUG    3GN8    3K22    3K23    3KWY    3KYT    3L0E    3L0J    3L0L    3O1D    3O1E    3OAP    3OZJ    3PCU    3PLZ    3Q95    3R5M    3UP0    3UP3    4CSJ    4DOS    4E2J    4FHH    4FHI    4IA1    4IA2    4IA3    4IA7    4IQR    4IU7    4IUI    4IV2    4IV4    4IVW    4IVY    4IW6    4IW8    4IWC    4IWF    4K4J    4K6I    4M8E    4M8H    4NIE    4NQA    4OC7    4P6W    4P6X    4PLD    4PLE    4POH    4POJ    4PP3    4PP5    4PP6    4PPP    4PPS    4PXM    4Q0A    4Q13    4QE6    4QE8    4RFW    4RMC    4RMD    4RME    4RUO    4UDC    4UDD    4WG0    4ZN7    4ZN9    4ZNH    4ZNS    4ZNT    4ZNU    4ZNV    4ZNW    4ZO1    4ZSH    5APH    5APJ    5DI7    5DID    5DIE    5DIG    5DK9    5DKB    5DKE    5DKG    5DKS    5DL4    5DLR    5DMC    5DMF    5DP0    5DRJ    5DRM    5DTV    5DU5    5DUE    5DUG    5DUH    5DVS    5DVV    5DWE    5DWG    5DWI    5DWJ    5DX3    5DXB    5DXE    5DXG    5DXK    5DXM    5DXP    5DXQ    5DXR    5DY8    5DYB    5DYD    5DZ0    5DZ1    5DZ3    5DZH    5DZI    5E0W    5E0X    5E14    5E15    5E19    5E1C    5EC9    5EGV    5EHJ    5EI1    5EIT    5G3J    5G42    5G43    5G44    5G45    5G46    5G5W    5H1E    5HYR    5I4V    5IAW    5ICK    5KCC    5KCD    5KCE    5KCF    5KCT    5KCU    5KCW    5KD9    5KR9    5KRA    5KRC    5KRF    5KRH    5KRI    5KRJ    5KRK    5KRL    5KRM    5KRO    5L11    5LGA    5LYQ    5MK4    5NFP    5NFT    5Q17    5SYZ    5T1Z    5TLD    5TLF    5TLG    5TLL    5TLM    5TLO    5TLP    5TLT    5TLU    5TLV    5TLX    5TLY    5TM1    5TM2    5TM3    5TM4    5TM5    5TM6    5TM7    5TM8    5TM9    5TML    5TMM    5TMO    5TMQ    5TMR    5TMS    5TMT    5TMU    5TMV    5TMW    5TMZ    5TN1    5TN3    5TN4    5TN5    5TN6    5TN7    5TN8    5U2D    5UAN    5VB3    5VB5    5VB6    5VB7    5WZX    6EL6    6EL7    6EL9   
PDB (PDBSum)1GWQ    1GWR    1M2Z    1MV9    1MVC    1MZN    1P93    1T63    1T65    1UHL    1YOK    1ZDT    1ZDU    1ZKY    2AO6    2B1V    2B1Z    2B23    2FAI    2G44    2G5O    2LDC    2P15    2P1T    2P1U    2P1V    2Q7J    2Q7L    2YJD    2ZXZ    2ZY0    3A9E    3CLD    3DZU    3DZY    3E00    3E7C    3E94    3ERD    3FUG    3GN8    3K22    3K23    3KWY    3KYT    3L0E    3L0J    3L0L    3O1D    3O1E    3OAP    3OZJ    3PCU    3PLZ    3Q95    3R5M    3UP0    3UP3    4CSJ    4DOS    4E2J    4FHH    4FHI    4IA1    4IA2    4IA3    4IA7    4IQR    4IU7    4IUI    4IV2    4IV4    4IVW    4IVY    4IW6    4IW8    4IWC    4IWF    4K4J    4K6I    4M8E    4M8H    4NIE    4NQA    4OC7    4P6W    4P6X    4PLD    4PLE    4POH    4POJ    4PP3    4PP5    4PP6    4PPP    4PPS    4PXM    4Q0A    4Q13    4QE6    4QE8    4RFW    4RMC    4RMD    4RME    4RUO    4UDC    4UDD    4WG0    4ZN7    4ZN9    4ZNH    4ZNS    4ZNT    4ZNU    4ZNV    4ZNW    4ZO1    4ZSH    5APH    5APJ    5DI7    5DID    5DIE    5DIG    5DK9    5DKB    5DKE    5DKG    5DKS    5DL4    5DLR    5DMC    5DMF    5DP0    5DRJ    5DRM    5DTV    5DU5    5DUE    5DUG    5DUH    5DVS    5DVV    5DWE    5DWG    5DWI    5DWJ    5DX3    5DXB    5DXE    5DXG    5DXK    5DXM    5DXP    5DXQ    5DXR    5DY8    5DYB    5DYD    5DZ0    5DZ1    5DZ3    5DZH    5DZI    5E0W    5E0X    5E14    5E15    5E19    5E1C    5EC9    5EGV    5EHJ    5EI1    5EIT    5G3J    5G42    5G43    5G44    5G45    5G46    5G5W    5H1E    5HYR    5I4V    5IAW    5ICK    5KCC    5KCD    5KCE    5KCF    5KCT    5KCU    5KCW    5KD9    5KR9    5KRA    5KRC    5KRF    5KRH    5KRI    5KRJ    5KRK    5KRL    5KRM    5KRO    5L11    5LGA    5LYQ    5MK4    5NFP    5NFT    5Q17    5SYZ    5T1Z    5TLD    5TLF    5TLG    5TLL    5TLM    5TLO    5TLP    5TLT    5TLU    5TLV    5TLX    5TLY    5TM1    5TM2    5TM3    5TM4    5TM5    5TM6    5TM7    5TM8    5TM9    5TML    5TMM    5TMO    5TMQ    5TMR    5TMS    5TMT    5TMU    5TMV    5TMW    5TMZ    5TN1    5TN3    5TN4    5TN5    5TN6    5TN7    5TN8    5U2D    5UAN    5VB3    5VB5    5VB6    5VB7    5WZX    6EL6    6EL7    6EL9   
PDB (IMB)1GWQ    1GWR    1M2Z    1MV9    1MVC    1MZN    1P93    1T63    1T65    1UHL    1YOK    1ZDT    1ZDU    1ZKY    2AO6    2B1V    2B1Z    2B23    2FAI    2G44    2G5O    2LDC    2P15    2P1T    2P1U    2P1V    2Q7J    2Q7L    2YJD    2ZXZ    2ZY0    3A9E    3CLD    3DZU    3DZY    3E00    3E7C    3E94    3ERD    3FUG    3GN8    3K22    3K23    3KWY    3KYT    3L0E    3L0J    3L0L    3O1D    3O1E    3OAP    3OZJ    3PCU    3PLZ    3Q95    3R5M    3UP0    3UP3    4CSJ    4DOS    4E2J    4FHH    4FHI    4IA1    4IA2    4IA3    4IA7    4IQR    4IU7    4IUI    4IV2    4IV4    4IVW    4IVY    4IW6    4IW8    4IWC    4IWF    4K4J    4K6I    4M8E    4M8H    4NIE    4NQA    4OC7    4P6W    4P6X    4PLD    4PLE    4POH    4POJ    4PP3    4PP5    4PP6    4PPP    4PPS    4PXM    4Q0A    4Q13    4QE6    4QE8    4RFW    4RMC    4RMD    4RME    4RUO    4UDC    4UDD    4WG0    4ZN7    4ZN9    4ZNH    4ZNS    4ZNT    4ZNU    4ZNV    4ZNW    4ZO1    4ZSH    5APH    5APJ    5DI7    5DID    5DIE    5DIG    5DK9    5DKB    5DKE    5DKG    5DKS    5DL4    5DLR    5DMC    5DMF    5DP0    5DRJ    5DRM    5DTV    5DU5    5DUE    5DUG    5DUH    5DVS    5DVV    5DWE    5DWG    5DWI    5DWJ    5DX3    5DXB    5DXE    5DXG    5DXK    5DXM    5DXP    5DXQ    5DXR    5DY8    5DYB    5DYD    5DZ0    5DZ1    5DZ3    5DZH    5DZI    5E0W    5E0X    5E14    5E15    5E19    5E1C    5EC9    5EGV    5EHJ    5EI1    5EIT    5G3J    5G42    5G43    5G44    5G45    5G46    5G5W    5H1E    5HYR    5I4V    5IAW    5ICK    5KCC    5KCD    5KCE    5KCF    5KCT    5KCU    5KCW    5KD9    5KR9    5KRA    5KRC    5KRF    5KRH    5KRI    5KRJ    5KRK    5KRL    5KRM    5KRO    5L11    5LGA    5LYQ    5MK4    5NFP    5NFT    5Q17    5SYZ    5T1Z    5TLD    5TLF    5TLG    5TLL    5TLM    5TLO    5TLP    5TLT    5TLU    5TLV    5TLX    5TLY    5TM1    5TM2    5TM3    5TM4    5TM5    5TM6    5TM7    5TM8    5TM9    5TML    5TMM    5TMO    5TMQ    5TMR    5TMS    5TMT    5TMU    5TMV    5TMW    5TMZ    5TN1    5TN3    5TN4    5TN5    5TN6    5TN7    5TN8    5U2D    5UAN    5VB3    5VB5    5VB6    5VB7    5WZX    6EL6    6EL7    6EL9   
PDB (RSDB)1GWQ    1GWR    1M2Z    1MV9    1MVC    1MZN    1P93    1T63    1T65    1UHL    1YOK    1ZDT    1ZDU    1ZKY    2AO6    2B1V    2B1Z    2B23    2FAI    2G44    2G5O    2LDC    2P15    2P1T    2P1U    2P1V    2Q7J    2Q7L    2YJD    2ZXZ    2ZY0    3A9E    3CLD    3DZU    3DZY    3E00    3E7C    3E94    3ERD    3FUG    3GN8    3K22    3K23    3KWY    3KYT    3L0E    3L0J    3L0L    3O1D    3O1E    3OAP    3OZJ    3PCU    3PLZ    3Q95    3R5M    3UP0    3UP3    4CSJ    4DOS    4E2J    4FHH    4FHI    4IA1    4IA2    4IA3    4IA7    4IQR    4IU7    4IUI    4IV2    4IV4    4IVW    4IVY    4IW6    4IW8    4IWC    4IWF    4K4J    4K6I    4M8E    4M8H    4NIE    4NQA    4OC7    4P6W    4P6X    4PLD    4PLE    4POH    4POJ    4PP3    4PP5    4PP6    4PPP    4PPS    4PXM    4Q0A    4Q13    4QE6    4QE8    4RFW    4RMC    4RMD    4RME    4RUO    4UDC    4UDD    4WG0    4ZN7    4ZN9    4ZNH    4ZNS    4ZNT    4ZNU    4ZNV    4ZNW    4ZO1    4ZSH    5APH    5APJ    5DI7    5DID    5DIE    5DIG    5DK9    5DKB    5DKE    5DKG    5DKS    5DL4    5DLR    5DMC    5DMF    5DP0    5DRJ    5DRM    5DTV    5DU5    5DUE    5DUG    5DUH    5DVS    5DVV    5DWE    5DWG    5DWI    5DWJ    5DX3    5DXB    5DXE    5DXG    5DXK    5DXM    5DXP    5DXQ    5DXR    5DY8    5DYB    5DYD    5DZ0    5DZ1    5DZ3    5DZH    5DZI    5E0W    5E0X    5E14    5E15    5E19    5E1C    5EC9    5EGV    5EHJ    5EI1    5EIT    5G3J    5G42    5G43    5G44    5G45    5G46    5G5W    5H1E    5HYR    5I4V    5IAW    5ICK    5KCC    5KCD    5KCE    5KCF    5KCT    5KCU    5KCW    5KD9    5KR9    5KRA    5KRC    5KRF    5KRH    5KRI    5KRJ    5KRK    5KRL    5KRM    5KRO    5L11    5LGA    5LYQ    5MK4    5NFP    5NFT    5Q17    5SYZ    5T1Z    5TLD    5TLF    5TLG    5TLL    5TLM    5TLO    5TLP    5TLT    5TLU    5TLV    5TLX    5TLY    5TM1    5TM2    5TM3    5TM4    5TM5    5TM6    5TM7    5TM8    5TM9    5TML    5TMM    5TMO    5TMQ    5TMR    5TMS    5TMT    5TMU    5TMV    5TMW    5TMZ    5TN1    5TN3    5TN4    5TN5    5TN6    5TN7    5TN8    5U2D    5UAN    5VB3    5VB5    5VB6    5VB7    5WZX    6EL6    6EL7    6EL9   
Structural Biology KnowledgeBase1GWQ    1GWR    1M2Z    1MV9    1MVC    1MZN    1P93    1T63    1T65    1UHL    1YOK    1ZDT    1ZDU    1ZKY    2AO6    2B1V    2B1Z    2B23    2FAI    2G44    2G5O    2LDC    2P15    2P1T    2P1U    2P1V    2Q7J    2Q7L    2YJD    2ZXZ    2ZY0    3A9E    3CLD    3DZU    3DZY    3E00    3E7C    3E94    3ERD    3FUG    3GN8    3K22    3K23    3KWY    3KYT    3L0E    3L0J    3L0L    3O1D    3O1E    3OAP    3OZJ    3PCU    3PLZ    3Q95    3R5M    3UP0    3UP3    4CSJ    4DOS    4E2J    4FHH    4FHI    4IA1    4IA2    4IA3    4IA7    4IQR    4IU7    4IUI    4IV2    4IV4    4IVW    4IVY    4IW6    4IW8    4IWC    4IWF    4K4J    4K6I    4M8E    4M8H    4NIE    4NQA    4OC7    4P6W    4P6X    4PLD    4PLE    4POH    4POJ    4PP3    4PP5    4PP6    4PPP    4PPS    4PXM    4Q0A    4Q13    4QE6    4QE8    4RFW    4RMC    4RMD    4RME    4RUO    4UDC    4UDD    4WG0    4ZN7    4ZN9    4ZNH    4ZNS    4ZNT    4ZNU    4ZNV    4ZNW    4ZO1    4ZSH    5APH    5APJ    5DI7    5DID    5DIE    5DIG    5DK9    5DKB    5DKE    5DKG    5DKS    5DL4    5DLR    5DMC    5DMF    5DP0    5DRJ    5DRM    5DTV    5DU5    5DUE    5DUG    5DUH    5DVS    5DVV    5DWE    5DWG    5DWI    5DWJ    5DX3    5DXB    5DXE    5DXG    5DXK    5DXM    5DXP    5DXQ    5DXR    5DY8    5DYB    5DYD    5DZ0    5DZ1    5DZ3    5DZH    5DZI    5E0W    5E0X    5E14    5E15    5E19    5E1C    5EC9    5EGV    5EHJ    5EI1    5EIT    5G3J    5G42    5G43    5G44    5G45    5G46    5G5W    5H1E    5HYR    5I4V    5IAW    5ICK    5KCC    5KCD    5KCE    5KCF    5KCT    5KCU    5KCW    5KD9    5KR9    5KRA    5KRC    5KRF    5KRH    5KRI    5KRJ    5KRK    5KRL    5KRM    5KRO    5L11    5LGA    5LYQ    5MK4    5NFP    5NFT    5Q17    5SYZ    5T1Z    5TLD    5TLF    5TLG    5TLL    5TLM    5TLO    5TLP    5TLT    5TLU    5TLV    5TLX    5TLY    5TM1    5TM2    5TM3    5TM4    5TM5    5TM6    5TM7    5TM8    5TM9    5TML    5TMM    5TMO    5TMQ    5TMR    5TMS    5TMT    5TMU    5TMV    5TMW    5TMZ    5TN1    5TN3    5TN4    5TN5    5TN6    5TN7    5TN8    5U2D    5UAN    5VB3    5VB5    5VB6    5VB7    5WZX    6EL6    6EL7    6EL9   
SCOP (Structural Classification of Proteins)1GWQ    1GWR    1M2Z    1MV9    1MVC    1MZN    1P93    1T63    1T65    1UHL    1YOK    1ZDT    1ZDU    1ZKY    2AO6    2B1V    2B1Z    2B23    2FAI    2G44    2G5O    2LDC    2P15    2P1T    2P1U    2P1V    2Q7J    2Q7L    2YJD    2ZXZ    2ZY0    3A9E    3CLD    3DZU    3DZY    3E00    3E7C    3E94    3ERD    3FUG    3GN8    3K22    3K23    3KWY    3KYT    3L0E    3L0J    3L0L    3O1D    3O1E    3OAP    3OZJ    3PCU    3PLZ    3Q95    3R5M    3UP0    3UP3    4CSJ    4DOS    4E2J    4FHH    4FHI    4IA1    4IA2    4IA3    4IA7    4IQR    4IU7    4IUI    4IV2    4IV4    4IVW    4IVY    4IW6    4IW8    4IWC    4IWF    4K4J    4K6I    4M8E    4M8H    4NIE    4NQA    4OC7    4P6W    4P6X    4PLD    4PLE    4POH    4POJ    4PP3    4PP5    4PP6    4PPP    4PPS    4PXM    4Q0A    4Q13    4QE6    4QE8    4RFW    4RMC    4RMD    4RME    4RUO    4UDC    4UDD    4WG0    4ZN7    4ZN9    4ZNH    4ZNS    4ZNT    4ZNU    4ZNV    4ZNW    4ZO1    4ZSH    5APH    5APJ    5DI7    5DID    5DIE    5DIG    5DK9    5DKB    5DKE    5DKG    5DKS    5DL4    5DLR    5DMC    5DMF    5DP0    5DRJ    5DRM    5DTV    5DU5    5DUE    5DUG    5DUH    5DVS    5DVV    5DWE    5DWG    5DWI    5DWJ    5DX3    5DXB    5DXE    5DXG    5DXK    5DXM    5DXP    5DXQ    5DXR    5DY8    5DYB    5DYD    5DZ0    5DZ1    5DZ3    5DZH    5DZI    5E0W    5E0X    5E14    5E15    5E19    5E1C    5EC9    5EGV    5EHJ    5EI1    5EIT    5G3J    5G42    5G43    5G44    5G45    5G46    5G5W    5H1E    5HYR    5I4V    5IAW    5ICK    5KCC    5KCD    5KCE    5KCF    5KCT    5KCU    5KCW    5KD9    5KR9    5KRA    5KRC    5KRF    5KRH    5KRI    5KRJ    5KRK    5KRL    5KRM    5KRO    5L11    5LGA    5LYQ    5MK4    5NFP    5NFT    5Q17    5SYZ    5T1Z    5TLD    5TLF    5TLG    5TLL    5TLM    5TLO    5TLP    5TLT    5TLU    5TLV    5TLX    5TLY    5TM1    5TM2    5TM3    5TM4    5TM5    5TM6    5TM7    5TM8    5TM9    5TML    5TMM    5TMO    5TMQ    5TMR    5TMS    5TMT    5TMU    5TMV    5TMW    5TMZ    5TN1    5TN3    5TN4    5TN5    5TN6    5TN7    5TN8    5U2D    5UAN    5VB3    5VB5    5VB6    5VB7    5WZX    6EL6    6EL7    6EL9   
CATH (Classification of proteins structures)1GWQ    1GWR    1M2Z    1MV9    1MVC    1MZN    1P93    1T63    1T65    1UHL    1YOK    1ZDT    1ZDU    1ZKY    2AO6    2B1V    2B1Z    2B23    2FAI    2G44    2G5O    2LDC    2P15    2P1T    2P1U    2P1V    2Q7J    2Q7L    2YJD    2ZXZ    2ZY0    3A9E    3CLD    3DZU    3DZY    3E00    3E7C    3E94    3ERD    3FUG    3GN8    3K22    3K23    3KWY    3KYT    3L0E    3L0J    3L0L    3O1D    3O1E    3OAP    3OZJ    3PCU    3PLZ    3Q95    3R5M    3UP0    3UP3    4CSJ    4DOS    4E2J    4FHH    4FHI    4IA1    4IA2    4IA3    4IA7    4IQR    4IU7    4IUI    4IV2    4IV4    4IVW    4IVY    4IW6    4IW8    4IWC    4IWF    4K4J    4K6I    4M8E    4M8H    4NIE    4NQA    4OC7    4P6W    4P6X    4PLD    4PLE    4POH    4POJ    4PP3    4PP5    4PP6    4PPP    4PPS    4PXM    4Q0A    4Q13    4QE6    4QE8    4RFW    4RMC    4RMD    4RME    4RUO    4UDC    4UDD    4WG0    4ZN7    4ZN9    4ZNH    4ZNS    4ZNT    4ZNU    4ZNV    4ZNW    4ZO1    4ZSH    5APH    5APJ    5DI7    5DID    5DIE    5DIG    5DK9    5DKB    5DKE    5DKG    5DKS    5DL4    5DLR    5DMC    5DMF    5DP0    5DRJ    5DRM    5DTV    5DU5    5DUE    5DUG    5DUH    5DVS    5DVV    5DWE    5DWG    5DWI    5DWJ    5DX3    5DXB    5DXE    5DXG    5DXK    5DXM    5DXP    5DXQ    5DXR    5DY8    5DYB    5DYD    5DZ0    5DZ1    5DZ3    5DZH    5DZI    5E0W    5E0X    5E14    5E15    5E19    5E1C    5EC9    5EGV    5EHJ    5EI1    5EIT    5G3J    5G42    5G43    5G44    5G45    5G46    5G5W    5H1E    5HYR    5I4V    5IAW    5ICK    5KCC    5KCD    5KCE    5KCF    5KCT    5KCU    5KCW    5KD9    5KR9    5KRA    5KRC    5KRF    5KRH    5KRI    5KRJ    5KRK    5KRL    5KRM    5KRO    5L11    5LGA    5LYQ    5MK4    5NFP    5NFT    5Q17    5SYZ    5T1Z    5TLD    5TLF    5TLG    5TLL    5TLM    5TLO    5TLP    5TLT    5TLU    5TLV    5TLX    5TLY    5TM1    5TM2    5TM3    5TM4    5TM5    5TM6    5TM7    5TM8    5TM9    5TML    5TMM    5TMO    5TMQ    5TMR    5TMS    5TMT    5TMU    5TMV    5TMW    5TMZ    5TN1    5TN3    5TN4    5TN5    5TN6    5TN7    5TN8    5U2D    5UAN    5VB3    5VB5    5VB6    5VB7    5WZX    6EL6    6EL7    6EL9   
SuperfamilyQ15596
Human Protein Atlas [tissue]ENSG00000140396-NCOA2 [tissue]
Peptide AtlasQ15596
HPRD09066
IPIIPI00018251   IPI00985123   IPI00983197   IPI00976503   IPI00974076   
Protein Interaction databases
DIP (DOE-UCLA)Q15596
IntAct (EBI)Q15596
FunCoupENSG00000140396
BioGRIDNCOA2
STRING (EMBL)NCOA2
ZODIACNCOA2
Ontologies - Pathways
QuickGOQ15596
Ontology : AmiGOnegative regulation of transcription by RNA polymerase II  RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding  RNA polymerase II transcription factor activity, sequence-specific DNA binding  RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  chromatin binding  transcription coactivator activity  transcription coactivator activity  protein binding  nucleus  nucleoplasm  nucleoplasm  cytoplasm  transcription, DNA-templated  regulation of transcription, DNA-templated  regulation of glucose metabolic process  bile acid and bile salt transport  nuclear body  nuclear receptor binding  nuclear receptor binding  aryl hydrocarbon receptor binding  regulation of lipid metabolic process  protein domain specific binding  nuclear receptor transcription coactivator activity  nuclear receptor transcription coactivator activity  thyroid hormone receptor coactivator activity  response to progesterone  cellular response to hormone stimulus  circadian regulation of gene expression  protein-containing complex  nuclear hormone receptor binding  nuclear hormone receptor binding  locomotor rhythm  positive regulation of transcription by RNA polymerase II  protein dimerization activity  cellular response to Thyroglobulin triiodothyronine  
Ontology : EGO-EBInegative regulation of transcription by RNA polymerase II  RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding  RNA polymerase II transcription factor activity, sequence-specific DNA binding  RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  chromatin binding  transcription coactivator activity  transcription coactivator activity  protein binding  nucleus  nucleoplasm  nucleoplasm  cytoplasm  transcription, DNA-templated  regulation of transcription, DNA-templated  regulation of glucose metabolic process  bile acid and bile salt transport  nuclear body  nuclear receptor binding  nuclear receptor binding  aryl hydrocarbon receptor binding  regulation of lipid metabolic process  protein domain specific binding  nuclear receptor transcription coactivator activity  nuclear receptor transcription coactivator activity  thyroid hormone receptor coactivator activity  response to progesterone  cellular response to hormone stimulus  circadian regulation of gene expression  protein-containing complex  nuclear hormone receptor binding  nuclear hormone receptor binding  locomotor rhythm  positive regulation of transcription by RNA polymerase II  protein dimerization activity  cellular response to Thyroglobulin triiodothyronine  
Pathways : KEGGThyroid hormone signaling pathway   
NDEx NetworkNCOA2
Atlas of Cancer Signalling NetworkNCOA2
Wikipedia pathwaysNCOA2
Orthology - Evolution
OrthoDB10499
GeneTree (enSembl)ENSG00000140396
Phylogenetic Trees/Animal Genes : TreeFamNCOA2
HOVERGENQ15596
HOGENOMQ15596
Homologs : HomoloGeneNCOA2
Homology/Alignments : Family Browser (UCSC)NCOA2
Gene fusions - Rearrangements
Fusion : MitelmanAHRR/NCOA2 [5p15.33/8q13.3]  [t(5;8)(p15;q13)]  
Fusion : MitelmanETV6/NCOA2 [12p13.2/8q13.3]  [t(8;12)(q13;p13)]  
Fusion : MitelmanGTF2I/NCOA2 [7q11.23/8q13.3]  [t(7;8;14)(q11;q13;q31)]  
Fusion : MitelmanHEY1/NCOA2 [8q21.13/8q13.3]  [t(8;8)(q13;q21)]  
Fusion : MitelmanKAT6A/NCOA2 [8p11.21/8q13.3]  [inv(8)(p11q13)]  
Fusion : MitelmanNCOA2/ARFGEF1 [8q13.3/8q13.2]  [t(8;8)(q13;q13)]  
Fusion : MitelmanNCOA2/LEPROTL1 [8q13.3/8p12]  [t(8;8)(p12;q13)]  
Fusion : MitelmanNCOA2/NCALD [8q13.3/8q22.3]  [t(8;8)(q13;q22)]  
Fusion : MitelmanNCOA2/ST18 [8q13.3/8q11.23]  [t(8;8)(q11;q13)]  
Fusion : MitelmanNCOA2/XKR9 [8q13.3/8q13.3]  [t(8;8)(q13;q13)]  
Fusion : MitelmanNCOA2/ZNF704 [8q13.3/8q21.13]  [t(8;8)(q13;q21)]  
Fusion : MitelmanPAX3/NCOA2 [2q36.1/8q13.3]  [t(2;8)(q36;q13)]  
Fusion : MitelmanSH2D6/NCOA2 [2p11.2/8q13.3]  [t(2;8)(p11;q13)]  
Fusion : MitelmanSRF/NCOA2 [6p21.1/8q13.3]  [t(6;8)(p21;q13)]  
Fusion : MitelmanTEAD1/NCOA2 [11p15.3/8q13.3]  [t(8;11)(q13;p15)]  
Fusion PortalNCOA2 8q13.3 ARFGEF1 8q13.2 BRCA
Fusion PortalNCOA2 8q13.3 LEPROTL1 8p12 LUAD
Fusion PortalNCOA2 8q13.3 NCALD 8q22.3 BRCA
Fusion PortalNCOA2 8q13.3 ST18 8q11.23 SKCM
Fusion PortalNCOA2 8q13.3 XKR9 8q13.3 LUAD
Fusion PortalSH2D6 2p11.2 NCOA2 8q13.3 BLCA
Fusion : QuiverNCOA2
Polymorphisms : SNP and Copy number variants
NCBI Variation ViewerNCOA2 [hg38]
dbSNP Single Nucleotide Polymorphism (NCBI)NCOA2
dbVarNCOA2
ClinVarNCOA2
1000_GenomesNCOA2 
Exome Variant ServerNCOA2
ExAC (Exome Aggregation Consortium)ENSG00000140396
GNOMAD BrowserENSG00000140396
Varsome BrowserNCOA2
Genetic variants : HAPMAP10499
Genomic Variants (DGV)NCOA2 [DGVbeta]
DECIPHERNCOA2 [patients]   [syndromes]   [variants]   [genes]  
CONAN: Copy Number AnalysisNCOA2 
Mutations
ICGC Data PortalNCOA2 
TCGA Data PortalNCOA2 
Broad Tumor PortalNCOA2
OASIS PortalNCOA2 [ Somatic mutations - Copy number]
Cancer Gene: CensusNCOA2 
Somatic Mutations in Cancer : COSMICNCOA2  [overview]  [genome browser]  [tissue]  [distribution]  
Mutations and Diseases : HGMDNCOA2
LOVD (Leiden Open Variation Database)Whole genome datasets
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD - Leiden Open Variation Database
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD 3.0 shared installation
BioMutasearch NCOA2
DgiDB (Drug Gene Interaction Database)NCOA2
DoCM (Curated mutations)NCOA2 (select the gene name)
CIViC (Clinical Interpretations of Variants in Cancer)NCOA2 (select a term)
intoGenNCOA2
Cancer3DNCOA2(select the gene name)
Impact of mutations[PolyPhen2] [Provean] [Buck Institute : MutDB] [Mutation Assessor] [Mutanalyser]
Diseases
OMIM601993   
Orphanet
DisGeNETNCOA2
MedgenNCOA2
Genetic Testing Registry NCOA2
NextProtQ15596 [Medical]
TSGene10499
GENETestsNCOA2
Target ValidationNCOA2
Huge Navigator NCOA2 [HugePedia]
snp3D : Map Gene to Disease10499
BioCentury BCIQNCOA2
ClinGenNCOA2
Clinical trials, drugs, therapy
Chemical/Protein Interactions : CTD10499
Chemical/Pharm GKB GenePA31471
Clinical trialNCOA2
Miscellaneous
canSAR (ICR)NCOA2 (select the gene name)
Probes
Litterature
PubMed226 Pubmed reference(s) in Entrez
GeneRIFsGene References Into Functions (Entrez)
CoreMineNCOA2
EVEXNCOA2
GoPubMedNCOA2
iHOPNCOA2
Genes in titleautomatic search in PubMed
REVIEW articlesautomatic search in PubMed
Last year publicationsautomatic search in PubMed

Search in all EBI   NCBI

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Mon Aug 27 11:40:04 CEST 2018

Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

For comments and suggestions or contributions, please contact us

jlhuret@AtlasGeneticsOncology.org.