Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 11

chr11:1-135086622 (135086.622 Kb)

Chromosome 11 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 11 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

11 11p 11q 11p15 11p14 11p13 11p12 11p11 11q11 11q12 11q13 11q14 11q21 11q22 11q23 11q24 11q25

Leukaemia     

dup (11q) in myeloid malignancies
MLL amplification in leukemia
11p15 rearrangements (NUP98) in treatment related leukemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in childhood acute lymphoblastic leukemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in de novo childhood acute myeloid leukemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in leukaemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in therapy related leukaemias
Multiple Myeloma
del(11q) in non-Hodgkin's lymphoma (NHL)
del(11)(p12p13) LMO2
del(11)(q23q23) KMT2A/CBL
del(11)(q23q23) KMT2A/ARHGEF12
+11 or trisomy 11 (solely) KMT2A
ins(5;11)(q31;q13q23) KMT2A/AFF4
ins(X;11)(q26;q23q23)
inv(11)(p15q22) NUP98/DDX10
inv(11)(p15q23) NUP98/KMT2A
inv(11)(q13q23) KMT2A/BTBD18
inv(11)(q14q23) KMT2A/PICALM
inv(11)(q21q23) KMT2A/MAML2 in therapy related leukemias
t(1;11)(p32;q23) KMT2A/EPS15
der(11)t(1;11)(q11-23;q14-25)
t(1;11)(q21;q23) KMT2A/MLLT11
t(1;11)(q23;p15) NUP98/PRRX1
t(2;11)(p21;q23) KMT2A/?
t(2;11)(p21;q23) without KMT2A (MLL) rearrangement
t(2;11)(q11;q23) KMT2A/AFF3
t(2;11)(q31;p15) (MDS, AML; NUP98 and HOXD13; rare)
t(2;11)(q31;p15) NUP98/HOXD11
t(2;11)(q31;p15) NUP98/HOXD13
t(2;11)(q33;q23) KMT2A/ABI2
t(2;11)(q37;q23) KMT2A/SEPT2
t(3;11)(p25;p15) ANKRD28/NUP98
t(3;11)(p24;p15) (AML; NUP98 and TOP2B; rare)
t(3;11)(p21;q23) KMT2A/NCKIPSD
t(3;11)(q12;p15) NUP98/LNP1
t(3;11)(q13.13;q23) KMT2A/KIAA1524
t(3;11)(q21;q23) KMT2A/EEFSEC
t(3;11)(q25;q23) KMT2A/GMPS
t(3;11)(q26;p15) ?/MECOM
t(3;11)(q27;q23) POU2AF1/BCL6
t(3;11)(q28;q23) KMT2A/LPP
t(3;11)(q29;p15) NUP98/IQCG
t(4;11)(p12;q23) KMT2A/FRYL
t(4;11)(q21;p15) NUP98/RAP1GDS1
t(4;11)(q21;q23) KMT2A/AFF1
t(4;11)(q23;p15) NUP98/RAP1GDS1
t(4;11)(q35;q23) KMT2A/SORBS2
t(5;11)(q31;q23) KMT2A/ARHGAP26
t(5;11)(q33;p13) CAPRIN1/PDGFRB
t(5;11)(q33;q13) NUMA1/PDGFRB a novel fusion
t(5;11)(q35;p15.5) NUP98/NSD1
t(5;11)(q35;q12) NSD1/FEN1
t(6;11)(q13;q23) KMT2A/SMAP1
t(6;11)(q15;q23) KMT2A/?
t(6;11)(q21;q23) KMT2A/FOXO3
t(6;11)(q24.1;p15.5) NUP98/CCDC28A
t(6;11)(q27;q23) KMT2A/AFDN
t(7;11)(p15;p15) NUP98/HOXA9
t(7;11)(p15;p15) NUP98/HOXA13
t(7;11)(q35;p13) TRB/LMO2
t(8;11)(p12;p15) ?/FGFR1
t(8;11)(p11;p15) NUP98/WHSC1L1
t(9;11)(p22;p15) NUP98/PSIP1
t(9;11)(p21;q23) KMT2A/MLLT3
t(9;11)(q34;p15) NUP98/PRRX2
t(9;11)(q34;q23) FNBP1/KMT2A
t(9;11)(q34;q23) KMT2A/DAB2IP
t(X;11)(q13;q23) KMT2A/FOXO4
t(X;11)(q21;q23) BRWD3/ARHGAP20
t(X;11)(q22;q23) KMT2A/?
t(X;11)(q24;q23) KMT2A/SEPT6
t(X;11)(q26;q23)
t(X;11)(q28;p15) NUP98/HMGB3
t(10;11)(p13;q21) PICALM/MLLT10
t(10;11)(p12;q23) KMT2A/MLLT10
t(10;11)(p12;q23) KMT2A/NEBL
t(10;11)(p11.2;q23) KMT2A/ABI1
t(10;11)(q22;q23) KMT2A/TET1
t(10;11)(q25;p15) NUP98/ADD3
t(11;11)(p15;q22) NUP98/DDX10
t(11;11)(q13;q23) KMT2A/ARHGEF17
t(11;11)(q14;q23) KMT2A/PICALM
t(11;11)(q23;q23) KMT2A/CBL
t(11;12)(p15;p13) NUP98/KDM5A
t(11;12)(p15;q13) NUP98/?
t(11;12)(q23;q13) /HMGA2
t(11;12)(q23;q13) KMT2A/SARNP
t(11;14)(p15;q11) TRD/LMO1
t(11;14)(p15;q22) AP2A2/NID2
t(11;14)(p13;q11) TRD/LMO2
t(11;14)(p11;q32)
t(11;14)(q13;q32) IGH/CCND1
t(11;14)(q13;q32) IGH/CCND1 in multiple myeloma
t(11;14)(q23;q24) KMT2A/GPHN
t(11;14)(q23;q32) KMT2A/CEP170B
t(11;14)(q24;q32) IGH/MIR125B1
t(11;15)(q23;q14) KMT2A/CASC5
t(11;15)(q23;q14) KMT2A/ZFYVE19
t(11;16)(q23;p13.3) KMT2A/CREBBP
t(11;17)(p15;p13) NUP98/PHF23
t(11;17)(p15;q21) NUP98/?
t(11;17)(q13;q21) NUMA1/RARA
t(11;17)(q23;p13) KMT2A/GAS7
t(11;17)(q23;q12) KMT2A/RARA
t(11;17)(q23;q12-21) KMT2A/MMLT6
t(11;17)(q23;q12-21) KMT2A/LASP1
t(11;17)(q23;q21) ZBTB16/RARA
t(11;17)(q23;q25) KMT2A/SEPT9
t(11;18)(p15;q12) NUP98/SETBP1
t(11;18)(q21;q21) BIRC3/MALT1
t(11;19)(q13;p13) FSTL3/CCND1
t(11;19)(q23;p13.1) KMT2A/ELL
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/MLLT1
t(11;19)(q23;p13) KMT2A/SH3GL1
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/ACER1
t(11;20)(p15;q11) NUP98/TOP1
t(11;20)(q23;q11) KMT2A/MAPRE1
t(11;21)(p14;q22) RUNX1/KIAA1549L
t(11;21)(q13;q22) RUNX1/MACROD1
t(11;21)(q21;q22) RUNX1/LPXN
t(11;22)(q13;q13) HRASLS5/PHF21B
t(11;22)(q23;q11.2) KMT2A/SEPT5
t(11;22)(q23;q13) KMT2A/EP300

Solid Tumors     

Soft Tissues: Embryonal rhabdomyosarcoma
Head and Neck: Squamous cell carcinoma: an overview
Soft tissue: Hibernomas
Thyroid: Medullary carcinoma
Pancreatic tumors: an overview
Neuro-Endocrine/Endocrine System: Phaeochromocytoma
Testis: Spermatocytic seminoma
Skin: Spitz tumors
Head and Neck: Thymus: Thymoma: an overview
t(1;11)(p31;q24) ETS1/NEGR1 (Lung)
t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK (Soft Tissues)
t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK (Soft tissue tumors)
t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK (Soft Tissues)
t(2;11)(q32;q13) FOSL1 (Soft tissue tumors)
t(2;11)(q37;q13) (Bone)
t(3;11)(p24;p15) NGLY1/CCKBR (Lung)
t(3;11)(p22;q14) DLEC1/ODZ4 (Lung)
t(3;11)(p21;p15) SFMBT1/AP2A2 (Lung)
t(3;11)(q26;p15) PDE3B/ATP11B (Lung)
t(5;11)(q14;q22) FAM151B/CASP12 (Lung)
t(5;11)(q35;q14) KCNIP1/KCTD14 (Lung)
t(6;11)(p21;q12) MALAT1/TFEB (Kidney)
t(6;11)(p21;q12) MALAT1/TFEB (Kidney)
t(8;11)(q13;p15) TEAD1/NCOA2 (Soft Tissues)
t(8;11)(q13;p15) TEAD1/NCOA2 (Soft tissue tumors)
t(8;11)(q21;p15) HTATIP2/CA1 (Lung)
t(9;11)(q22;q24) HSPA8/NR4A3 (Soft Tissues)
t(X;11)(p11;q22) YAP1/TFE3 (Soft tissue tumors)
t(X;11)(p11;q22) YAP1/TFE3 (Bone)
t(10;11)(q21;p15) CTNNA3/IGF2 (Lung)
t(10;11)(q22;q14) P4HA1/TRIM77P (Lung)
t(11;11)(p15;q23) ATP5L/TEAD1 (Lung)
t(11;11)(p14;p13) EIF3M/MPPED2 (Lung)
t(11;11)(p11;q12) OR9Q1/OR4C46 (Lung)
t(11;11)(q12;q12) P2RX3/RTN4RL2 (Lung)
t(11;11)(q12;q13) EEF1G/PPP6R3 (Lung)
t(11;11)(q12;q13) SHANK2/MS4A8B (Lung)
t(11;11)(q13;q13) RBM14/FGF3 (Lung)
t(11;11)(q13;q22) PPP6R3/CNTN5 (Lung)
t(11;11)(q14;q14) GAB2/NARS2 (Lung)
t(11;11)(q14;q14) PICALM/CCDC81 (Lung)
t(11;11)(q23;q23) HYOU1/C11ORF93 (Lung)
t(11;12)(q23;q15) HMGA2 (Soft Tissues)
t(11;16)(p11;p11) FUS/CREB3L1 (Soft Tissues)
t(11;16)(q13;p13) C11orf95/MKL2 (Soft Tissues)
t(11;19)(q11;q13) MALAT1 (Liver)
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2 (Skin)
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2 (Head and Neck)
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1 (Soft Tissues)
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 (Bone)
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 (Pancreas)
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 (Soft Tissues)

Cancer prone diseases     

Ataxia telangiectasia (A-T)
Beckwith-Wiedemann syndrome
Denys-Drash syndrome (DDS)
Frasier syndrome (FS)
Glycogen storage disease type I (GSD I)
Hemihyperplasia isolated
Multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1)
Multiple endocrine neoplasia type 2 (MEN2)
Mosaic variegated aneuploidy syndrome
WAGR (Wilms' tumor/aniridia/genitourinary anomalies/mental retardation syndrome)

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 11 by location


External links     

  • Chromosome 11 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 11 - GoldenPath - UCSC
  • Chromosome 11 - Ensembl Project
  • Chromosome 11 - Map View - NCBI
  • Chromosome 11 - Genomics Home Reference
  • Chromosome 11 - DECIPHER
  • Chromosome 11 - OMIM Gene map
  • Chromosome 11 - Genomic Variants
  • Chromosome 11 - HAPMAP Project
  • Chromosome 11 - 1000 Genomes
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 11 Cancer GeneWeb

  • Chromosome 11 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 11 - Human UniProtKB

    FISH probes

  • Chromosome 11 - FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Chromosome 11 - Empire Genomics FISH clones [ chromosome ]  [ genes ]
  • Chromosome 11 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 11 - Vysis FISHCytogenetic marker (Abbott)
  • FISH Probes DAKO (Agilent)
  • SureFISH Probes (Agilent)
  • CytoCell  [ haematology ]  [ pathology ]
  • Kreatech Diagnostic
  • Metasystems

  • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ADAMTS15 130448.974     11q24.3
    AIP 67483.516     11q13.2
    APLNR 57233.578     11q12.1
    ARHGAP20 110577.035     11q22.3-q23.1
    ARHGEF12 120336.909     11q23.3
    ATM 108222.832     11q22.3
    B3GNT6 77034.341     11q13.5
    BAD 64269.828     11q13.1
    BIRC2 102347.182     11q22.2
    BIRC3 102317.450     11q22.2
    BRMS1 66337.333     11q13.2
    CARS 3000.922     11p15.4
    CASP1 105025.510     11q22.3
    CBL 119206.276     11q23.3
    CCND1 69641.105     11q13.3
    CD151 832.952     11p15.5
    CD248 66314.487     11q13.2
    CD44 35138.870     11p13
    CD59 33703.010     11p13
    CD82 44565.591     11p11.2
    CEP57 95790.461     11q21
    CHKA 68052.859     11q13.2
    CRYAB 111908.620     11q23.1
    CST6 66011.991     11q13.1
    CTNND1 57761.762     11q12.1
    DDB2 47214.942     11p11.2
    DDX10 108665.025     11q22.3
    DDX25 125903.376     11q24.2
    DKK3 11962.996     11p15.3
    EHF 34621.041     11p13
    EIF3F 7987.320     11p15.4
    EMSY 76445.025     11q13.5
    ESRRA 64306.227     11q13.1
    ETS1 128458.761     11q24.3
    EXT2 44096.197     11p11.2
    FANCF 22622.533     11p14.3
    FAU 65120.627     11q13.1
    FEN1 61792.637     11q12.2
    FLI1 128693.916     11q24.3
    FOSL1 65892.136     11q13.1
    GAB2 78215.290     11q14.1
    H2AFX 119093.875     11q23.3
    HRAS 532.242     11p15.5
    HSPA8 123057.492     11q24.1
    HTATIP2 20363.743     11p15.1
    ILK 6603.708     11p15.4
    INPPL1 72224.838     11q13.4
    KAT5 65712.002     11q13.1
    KMT2A 118436.490     11q23.3
    LMO1 8224.304     11p15.4
    LMO2 33858.576     11p13
    LRP5 68312.609     11q13.2
    MACROD1 63998.558     11q13.1
    MAML2 95976.593     11q21
    MCAM 119308.524     11q23.3
    MEN1 64803.514     11q13.1
    MIR100 122152.229     11q24.1
    MIR125B1 122099.757     11q24.1
    MMP26 4988.191     11p15.4
    MRE11 94417.301     11q21
    MUC2 1074.875     11p15.5
    MUC5AC 1157.953     11p15.5
    MUC6 1012.824     11p15.5
    MYEOV 69294.138     11q13.3
    NEU3 74988.905     11q13.4
    NNMT 114295.813     11q23.2
    NUMA1 72002.864     11q13.4
    NUP98 3711.554     11p15.4
    OPCML 132414.665     11q25
    ORAOV1 69665.564     11q13.3
    PAK1 77322.015     11q13.5-q14.1
    PAX6 31784.792     11p13
    PGR 101029.624     11q22.1
    PICALM 85957.171     11q14.2
    POU2AF1 111352.256     11q23.1
    PTPRJ 47980.558     11p11.2
    RAD9A 67393.305     11q13.2
    RARRES3 63536.801     11q12.3
    RELA 65653.596     11q13.1
    RRM1 4094.685     11p15.4
    RSF1 77666.229     11q14.1
    SDHD 112086.824     11q23.1
    SIPA1 65638.107     11q13.1
    SPA17 124673.844     11q24.2
    SPI1 47354.858     11p11.2
    TAGLN 117199.324     11q23.3
    TALDO1 747.432     11p15.5
    THRSP 78063.861     11q14.1
    THY1 119417.941     11q23.3
    TMPRSS4 118077.012     11q23.3
    TYR 89177.872     11q14.3
    WT1 32387.776     11p13
    YAP1 102110.461     11q22.1
    ZBTB16 114060.566     11q23.2

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    AAMDC 77821.114     11q14.1
    AASDHPPT 106077.565     11q22.3
    ABCC8 17392.885     11p15.1
    ABCG4 119149.589     11q23.3
    ABTB2 34150.987     11p13
    ACAD8 134253.540     11q25
    ACAT1 108121.531     11q22.3
    ACCS 44066.179     11p11.2
    ACCSL 44047.981     11p11.2
    ACER3 76860.873     11q13.5
    ACP2 47239.302     11p11.2|11p12-p11
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    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Jean-Loup Huret
    UpdatedSep 2017Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_11.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Sep 2017 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Tue Sep 19 16:23:02 CEST 2017


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