Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 11

Chromosome 11 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 11 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

11p15 rearrangements (NUP98) in treatment related leukemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in childhood acute lymphoblastic leukemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in de novo childhood acute myeloid leukemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in leukaemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in therapy related leukaemias
del(11q) in non-Hodgkin's lymphoma (NHL)
del(11)(p12p13) LMO2
del(11)(q23q23) KMT2A/CBL
del(11)(q23q23) KMT2A/ARHGEF12
+11 or trisomy 11 (solely) KMT2A
ins(5;11)(q31;q13q23) KMT2A/AFF4
inv(11)(p15q22) NUP98/DDX10
inv(11)(q13q23) KMT2A/BTBD18
inv(11)(q21q23) KMT2A/MAML2 in therapy related leukemias
t(1;11)(p32;q23) KMT2A/EPS15
t(1;11)(q21;q23) KMT2A/MLLT11
t(1;11)(q23;p15) NUP98/PRRX1
t(2;11)(p21;q23) KMT2A/?
t(2;11)(q11;q23) KMT2A/AFF3
t(2;11)(q31;p15) NUP98/HOXD11
t(2;11)(q31;p15) NUP98/HOXD13
t(2;11)(q37;q23) KMT2A/SEPT2
t(3;11)(p25;p15) ANKRD28/NUP98
t(3;11)(p21;q23) KMT2A/NCKIPSD
t(3;11)(q12;p15) NUP98/LNP1
t(3;11)(q13.13;q23) KMT2A/KIAA1524
t(3;11)(q21;q23) KMT2A/EEFSEC
t(3;11)(q25;q23) KMT2A/GMPS
t(3;11)(q26;p15) ?/MECOM
t(3;11)(q27;q23) (NHL; BCL6 and OBF1, rare)
t(3;11)(q28;q23) KMT2A/LPP
t(3;11)(q29;p15) NUP98/IQCG
t(4;11)(p12;q23) KMT2A/FRYL
t(4;11)(q21;p15) NUP98/RAP1GDS1
t(4;11)(q21;q23) KMT2A/AFF1
t(4;11)(q35;q23) KMT2A/SORBS2
t(5;11)(q31;q23) KMT2A/ARHGAP26
t(5;11)(q33;p13) CAPRIN1/PDGFRB
t(5;11)(q35;p15.5) NUP98/NSD1
t(5;11)(q35;q12) NSD1/FEN1
t(6;11)(q13;q23) KMT2A-SMAP1
t(6;11)(q15;q23) KMT2A/?
t(6;11)(q27;q23) KMT2A/MLLT4
t(7;11)(p15;p15) NUP98/HOXA9
t(7;11)(q35;p13) TBB/LMO2
t(8;11)(p12;p15) ?/FGFR1
t(8;11)(p11;p15) NUP98/WHSC1L1
t(9;11)(p22;p15) NUP98/PSIP1
t(9;11)(p22;q23) KMT2A/MLLT3
t(9;11)(q34;p15) NUP98/PRRX2
t(9;11)(q34;q23) FNBP1/KMT2A
t(9;11)(q34;q23) KMT2A/DAB2IP
t(X;11)(q13;q23) KMT2A/FOXO4
t(X;11)(q21;q23) BRWD3/ARHGAP20
t(X;11)(q22;q23) KMT2A/?
t(X;11)(q24;q23) KMT2A/SEPT6
t(10;11)(p13;q21) PICALM/MLLT10
t(10;11)(p12;q23) KMT2A/MLLT10
t(10;11)(p11.2;q23) KMT2A/ABI1
t(10;11)(q22;q23) KMT2A/TET1
t(10;11)(q25;p15) NUP98/ADD3
t(11;11)(p15;q22) NUP98/DDX10
t(11;11)(q13;q23) KMT2A/ARHGEF17
t(11;11)(q23;q23) KMT2A/CBL
t(11;12)(p15;p13) NUP98/KDM5A
t(11;12)(p15;q13) NUP98/?
t(11;12)(q23;q13) /HMGA2
t(11;12)(q23;q13) KMT2A/SARNP
t(11;14)(p15;q11) TRD/LMO1
t(11;14)(p13;q11) TRD/LMO2
t(11;14)(p11;q32)
t(11;14)(q13;q32) IGH/CCND1
t(11;14)(q13;q32) IGH/CCND1 in multiple myeloma
t(11;14)(q23;q24) KMT2A/GPHN
t(11;14)(q23;q32) KMT2A/CEP170B
t(11;14)(q24;q32) IGH/MIR125B1
t(11;15)(q23;q14) KMT2A/CASC5
t(11;16)(q23;p13.3) KMT2A/CREBBP
t(11;17)(p15;p13) NUP98/PHF23
t(11;17)(q13;q21) NUMA1/RARA
t(11;17)(q23;p13) KMT2A/GAS7
t(11;17)(q23;q12) KMT2A/RARA
t(11;17)(q23;q21) ZBTB16/RARA
t(11;17)(q23;q25) KMT2A/SEPT9
t(11;18)(p15;q12) NUP98/SETBP1
t(11;18)(q21;q21) BIRC3/MALT1
t(11;19)(q23;p13.1) KMT2A/ELL
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/MLLT1
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/ACER1
t(11;20)(p15;q11) NUP98/TOP1
t(11;20)(q23;q11) KMT2A/MAPRE1
t(11;21)(q13;q22) RUNX1/MACROD1
t(11;21)(q21;q22) RUNX1/LPXN
t(11;22)(q23;q11.2) KMT2A/SEPT5
t(11;22)(q23;q13) KMT2A/EP300

Solid Tumors     

del(11)(p15p15) PIK3C2A/TEAD1
t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK
t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK
t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK
t(2;11)(q32;q13) FOSL1
t(2;11)(q37;q13)
t(6;11)(p21;q12) TFEB truncated
t(8;11)(q13;p15) TEAD1/NCOA2
t(8;11)(q13;p15) TEAD1/NCOA2
t(X;11)(p11;q22) YAP1/TFE3
t(11;12)(q23;q15) HMGA2
t(11;12)(q23;q15) HMGA2
t(11;16)(p11;p11) FUS/CREB3L1
t(11;16)(p11;p11) FUS/CREB3L1
t(11;16)(q13;p13) C11orf95/MKL2
t(11;16)(q13;p13) C11orf95/MKL2
t(11;19)(q11;q13) MALAT1
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1

Cancer prone diseases     

Ataxia telangiectasia
Beckwith-Wiedemann syndrome
Frasier syndrome (FS)
Glycogen storage disease type I (GSD I)
Hemihyperplasia isolated
Multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1)
Multiple endocrine neoplasia type 2 (MEN2)
Mosaic variegated aneuploidy syndrome
WAGR (Wilms' tumor/aniridia/genitourinary anomalies/mental retardation syndrome)

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 11 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE



External links     

  • Chromosome 11 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 11 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 11 - Ensembl Project
  • Chromosome 11 - Map View - NCBI
  • Chromosome 11 - OMIM Gene map
  • Chromosome 11 - Genomic Variants
  • Chromosome 11 - HAPMAP Project
  • Chromosome 11 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 11 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 11 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 11 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 11 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 11 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 11 Cancer GeneWeb
  • Human Proteomics Initiative (UniProt)
  • Cytogenetic marker FISH (Abbott)
  • FISH Probes DAKO
  • SureFISH Probes
  • CytoCell
  • Kreatech Diagnostic/

  • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ADAMTS15 130318.869 11q25
    AIP 67250.505 11q13.3
    APLNR 57001.052 11q12.1
    ARHGAP20 110447.759 11q23.2
    ARHGEF12 120207.618 11q23.3
    ATM 108093.559 11q22-q23
    B3GNT6 76745.385 11q13.4
    BAD 64037.300 11q13.1
    BIRC2 102217.913 11q22
    BIRC3 102188.181 11q22
    BRMS1 66104.804 11q13-q13.2
    C11orf30 76156.069 11q13.5
    CARS 3022.152 11p15.5
    CASP1 104896.237 11q23
    CBL 119076.986 11q23.3-qter
    CCND1 69455.873 11q13
    CD151 832.952 11p15.5
    CD248 66081.958 11q13
    CD44 35160.417 11p13
    CD59 33724.556 11p13
    CD82 44587.141 11p11.2
    CEP57 95523.625 11q21
    CHKA 67820.326 11q13.1
    CRYAB 111779.344 11q22.3-q23.1
    CST6 65779.462 11q13
    CTNND1 57529.234 11q12.1
    DDB2 47236.493 11p12-p11
    DDX10 108535.752 11q22-q23
    DDX25 125774.261 11q24
    DKK3 11984.543 11p15.3
    EHF 34642.588 11p12
    EIF3F 8008.867 11p15.4
    ESRRA 64073.699 11q12
    ETS1 128328.656 11q23.3
    EXT2 44117.747 11p12-p11
    FANCF 22644.079 11p15
    FAU 64888.099 11q13
    FEN1 61560.109 11q12
    FLI1 128563.811 11q24.1-q24.3
    FOSL1 65659.692 11q13
    GAB2 77926.336 11q13.4-q13.5
    H2AFX 118964.585 11q23.3
    HRAS 532.242 11p15.5
    HSPA8 122928.200 11q24.1
    HTATIP2 20385.289 11p15.1
    INPPL1 71935.882 11q23
    KAT5 65479.473 11q13
    KMT2A 118307.205 11q23
    LMO1 8245.851 11p15
    LMO2 33880.123 11p13
    LRP5 68080.077 11q13.4
    MACROD1 63766.030 11q13.1
    MAML2 95709.757 11q
    MCAM 119179.234 11q23.3
    MEN1 64570.986 11q13
    MIR100 122022.937 11q24.1
    MIR125B1 121970.465 11q24.1
    MMP26 5009.424 11p15
    MRE11A 94150.469 11q21
    MUC2 1074.875 11p15.5
    MUC5AC 1151.580 11p15.5
    MUC6 1012.824 11p15.5
    MYEOV 69061.605 11q13.2
    NEU3 74699.950 11q13.5
    NNMT 114166.535 11q23.1
    NUMA1 71713.910 11q13
    NUP98 3733.059 11p15
    OPCML 132284.875 11q25
    ORAOV1 69480.332 11q13.2
    PAK1 77033.060 11q13-q14
    PAX6 31806.340 11p13
    PICALM 85668.214 11q14
    POU2AF1 111222.981 11q23.1
    PTPRJ 48002.110 11p11.2
    RAD9A 67160.776 11q13.1-q13.2
    RARRES3 63304.273 11q23
    RELA 65421.067 11q13
    RRM1 4115.924 11p15.5
    RSF1 77377.274 11q14.1
    SDHD 111957.548 11q23
    SIPA1 65405.578 11q13.3
    SPA17 124543.740 11q24.2
    SPI1 47376.409 11p12-p11.22
    TAGLN 117070.040 11q23.2
    TALDO1 747.432 11p15.5-p15.4
    THRSP 77774.907 11q14.1
    THY1 119288.655 11q23.3
    TMPRSS4 117947.727 11q23.3
    TYR 88911.040 11q14.3
    WT1 32409.322 11p13
    YAP1 101981.192 11q13
    ZBTB16 113931.288 11q23
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ABCC8 17414.432 11p15.1
    ACAT1 107992.258 11q22.3
    ACCS 44087.729 11p11
    ACP2 47267.070 11p11.2
    ACTN3 66314.312 11q13-q14
    ADAMTS8 130274.818 11q25
    ADM 10326.642 11p15.4
    ADRBK1 67033.905 11q13
    AGBL2 47681.143 11p11.2
    AHNAK 62283.374 11q12-q13
    AKIP1 8932.701 11p15.3
    ALDH3B2 67429.633 11q13
    ALKBH3 43902.357 11p11.2
    ALKBH8 107373.453 11q22.3
    ALX4 44282.278 11p11.2
    AMBRA1 46417.962 11p11.2
    AMOTL1 94501.508 11q21
    AMPD3 10472.224 11p15
    ANKK1 113258.513 11q23.2
    ANO1 69924.408 11q13.2
    ANO9 417.930 11p15.5
    AP2A2 925.809 11p15.5
    APBB1 6416.354 11p15
    API5 43333.505 11p12
    APIP 34903.843 11p13
    APLP2 129939.716 11q24
    APOA1 116706.469 11q23-q24
    APOA4 116691.418 11q23.3
    APOC3 116700.624 11q23.3
    ARAP1 72396.114 11q13.3
    ARCN1 118443.102 11q23.3
    ARFIP2 6495.913 11p15
    ARHGAP1 46698.625 11p11.2
    ARHGAP32 128834.955 11q24.3
    ARHGEF17 73019.663 11q13.3
    ARL2 64781.585 11q13
    ARNTL 13299.325 11p15
    ARRB1 74971.166 11q13
    ART1 3666.361 11p15
    ASCL2 2289.728 11p15.5
    ASRGL1 62104.774 11q12.3
    ATG16L2 72525.451 11q13.4
    ATP5L 118272.104 11q23.3
    B3GAT1 134248.398 11q25
    B3GNT1 66112.843 11q13.2
    BACE1 117156.402 11q23-q24
    BARX2 129245.881 11q24.3
    BATF2 64755.417 11q13.1
    BCL9L 118766.851 11q23.3
    BDNF 27676.442 11p14.1
    BET1L 202.924 11p15.5
    BLID 121986.062 11q24.1
    BRSK2 1411.129 11p15.5
    BTBD18 57510.986 11q12.1
    BTG4 111338.256 11q23
    BUD13 116618.886 11q23.3
    C11orf1 111749.948 11q23.1
    C11orf68 65684.283 11q13.1
    C11orf73 86013.253 11q14.2
    C11orf95 63527.364 11q13
    C1QTNF4 47611.216 11q11
    C1QTNF5 119209.644 11q23.3
    C2CD2L 118978.060 11q23.3
    C2CD3 73723.759 11q13.4
    CADM1 115044.345 11q23.2
    CALCA 14990.048 11p15.2
    CAPN1 64948.686 11q13
    CAPN5 76777.992 11q14
    CAPRIN1 34073.230 11p13
    CARD16 104912.053 11q23
    CARD18 105008.448 11q22.3
    CASC23 8032.825 11p15.4
    CASP12 104756.445 11q22.3
    CASP4 104813.594 11q22.2-q22.3
    CASP5 104864.967 11q22.2-q22.3
    CAT 34460.472 11p13
    CCDC67 93063.883 11q21
    CCDC73 32623.626 11p13
    CCDC81 86085.778 11q14.2
    CCDC83 85566.144 11q14.1-q14.2
    CCKBR 6280.904 11p15.4
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    ZNF215 6947.654 11p15.4
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    GeneCards  

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedOct 2014Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_11.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Oct 2014 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Mon Oct 13 15:22:57 CEST 2014


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