Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 11

Chromosome 11 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 11 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

11 11p 11q 11p15 11p14 11p13 11p12 11p11 11p10 11q10 11q11 11q12 11q13 11q14 11q21 11q22 11q23 11q24 11q25

Leukaemia     

11p15 rearrangements (NUP98) in treatment related leukemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in childhood acute lymphoblastic leukemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in de novo childhood acute myeloid leukemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in leukaemia
11q23 rearrangements (KMT2A) in therapy related leukaemias
del(11q) in non-Hodgkin's lymphoma (NHL)
del(11)(p12p13) LMO2
del(11)(q23q23) KMT2A/CBL
del(11)(q23q23) KMT2A/ARHGEF12
+11 or trisomy 11 (solely) KMT2A
ins(5;11)(q31;q13q23) KMT2A/AFF4
inv(11)(p15q22) NUP98/DDX10
inv(11)(q13q23) KMT2A/BTBD18
inv(11)(q21q23) KMT2A/MAML2 in therapy related leukemias
t(1;11)(p32;q23) KMT2A/EPS15
t(1;11)(q21;q23) KMT2A/MLLT11
t(1;11)(q23;p15) NUP98/PRRX1
t(2;11)(p21;q23) KMT2A/?
t(2;11)(q11;q23) KMT2A/AFF3
t(2;11)(q31;p15) NUP98/HOXD11
t(2;11)(q31;p15) NUP98/HOXD13
t(2;11)(q37;q23) KMT2A/SEPT2
t(3;11)(p25;p15) ANKRD28/NUP98
t(3;11)(p21;q23) KMT2A/NCKIPSD
t(3;11)(q12;p15) NUP98/LNP1
t(3;11)(q13.13;q23) KMT2A/KIAA1524
t(3;11)(q21;q23) KMT2A/EEFSEC
t(3;11)(q25;q23) KMT2A/GMPS
t(3;11)(q26;p15) ?/MECOM
t(3;11)(q27;q23) POU2AF1/BCL6
t(3;11)(q28;q23) KMT2A/LPP
t(3;11)(q29;p15) NUP98/IQCG
t(4;11)(p12;q23) KMT2A/FRYL
t(4;11)(q21;p15) NUP98/RAP1GDS1
t(4;11)(q21;q23) KMT2A/AFF1
t(4;11)(q35;q23) KMT2A/SORBS2
t(5;11)(q31;q23) KMT2A/ARHGAP26
t(5;11)(q33;p13) CAPRIN1/PDGFRB
t(5;11)(q35;p15.5) NUP98/NSD1
t(5;11)(q35;q12) NSD1/FEN1
t(6;11)(q13;q23) KMT2A-SMAP1
t(6;11)(q15;q23) KMT2A/?
t(6;11)(q21;q23) KMT2A/FOXO3
t(6;11)(q27;q23) KMT2A/MLLT4
t(7;11)(p15;p15) NUP98/HOXA9
t(7;11)(q35;p13) TBB/LMO2
t(8;11)(p12;p15) ?/FGFR1
t(8;11)(p11;p15) NUP98/WHSC1L1
t(9;11)(p22;p15) NUP98/PSIP1
t(9;11)(p22;q23) KMT2A/MLLT3
t(9;11)(q34;p15) NUP98/PRRX2
t(9;11)(q34;q23) FNBP1/KMT2A
t(9;11)(q34;q23) KMT2A/DAB2IP
t(X;11)(q13;q23) KMT2A/FOXO4
t(X;11)(q21;q23) BRWD3/ARHGAP20
t(X;11)(q22;q23) KMT2A/?
t(X;11)(q24;q23) KMT2A/SEPT6
t(10;11)(p13;q21) PICALM/MLLT10
t(10;11)(p12;q23) KMT2A/MLLT10
t(10;11)(p12;q23) KMT2A/NEBL
t(10;11)(p11.2;q23) KMT2A/ABI1
t(10;11)(q22;q23) KMT2A/TET1
t(10;11)(q25;p15) NUP98/ADD3
t(11;11)(p15;q22) NUP98/DDX10
t(11;11)(q13;q23) KMT2A/ARHGEF17
t(11;11)(q23;q23) KMT2A/CBL
t(11;12)(p15;p13) NUP98/KDM5A
t(11;12)(p15;q13) NUP98/?
t(11;12)(q23;q13) /HMGA2
t(11;12)(q23;q13) KMT2A/SARNP
t(11;14)(p15;q11) TRD/LMO1
t(11;14)(p15;q22) AP2A2/NID2
t(11;14)(p13;q11) TRD/LMO2
t(11;14)(p11;q32)
t(11;14)(q13;q32) IGH/CCND1
t(11;14)(q13;q32) IGH/CCND1 in multiple myeloma
t(11;14)(q23;q24) KMT2A/GPHN
t(11;14)(q23;q32) KMT2A/CEP170B
t(11;14)(q24;q32) IGH/MIR125B1
t(11;15)(q23;q14) KMT2A/CASC5
t(11;15)(q23;q14) KMT2A/ZFYVE19
t(11;16)(q23;p13.3) KMT2A/CREBBP
t(11;17)(p15;p13) NUP98/PHF23
t(11;17)(q13;q21) NUMA1/RARA
t(11;17)(q23;p13) KMT2A/GAS7
t(11;17)(q23;q12) KMT2A/RARA
t(11;17)(q23;q12) KMT2A/MMLT6
t(11;17)(q23;q12) KMT2A/LASP1
t(11;17)(q23;q21) ZBTB16/RARA
t(11;17)(q23;q25) KMT2A/SEPT9
t(11;18)(p15;q12) NUP98/SETBP1
t(11;18)(q21;q21) BIRC3/MALT1
t(11;19)(q13;p13) FSTL3/CCND1
t(11;19)(q23;p13.1) KMT2A/ELL
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/MLLT1
t(11;19)(q23;p13) KMT2A/SH3GL1
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/ACER1
t(11;20)(p15;q11) NUP98/TOP1
t(11;20)(q23;q11) KMT2A/MAPRE1
t(11;21)(p14;q22) RUNX1/KIAA1549L
t(11;21)(q13;q22) RUNX1/MACROD1
t(11;21)(q21;q22) RUNX1/LPXN
t(11;22)(q13;q13) HRASLS5/PHF21B
t(11;22)(q23;q11.2) KMT2A/SEPT5
t(11;22)(q23;q13) KMT2A/EP300

Solid Tumors     

del(11)(p15p15) PIK3C2A/TEAD1
t(1;11)(p31;q24) ETS1/NEGR1
t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK
t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK
t(2;11)(p23;p15) CARS/ALK
t(2;11)(q32;q13) FOSL1
t(2;11)(q37;q13)
t(3;11)(p24;p15) NGLY1/CCKBR
t(3;11)(p22;q14) DLEC1/ODZ4
t(3;11)(p21;p15) SFMBT1/AP2A2
t(3;11)(q26;p15) PDE3B/ATP11B
t(5;11)(q14;q22) FAM151B/CASP12
t(5;11)(q35;q14) KCNIP1/KCTD14
t(6;11)(p21;q12) TFEB truncated
t(8;11)(q13;p15) TEAD1/NCOA2
t(8;11)(q13;p15) TEAD1/NCOA2
t(8;11)(q21;p15) HTATIP2/CA1
t(X;11)(p11;q22) YAP1/TFE3
t(10;11)(q21;p15) CTNNA3/IGF2
t(10;11)(q22;q14) P4HA1/TRIM77P
t(11;11)(p15;q23) ATP5L/TEAD1
t(11;11)(p14;p13) EIF3M/MPPED2
t(11;11)(p11;q12) OR9Q1/OR4C46
t(11;11)(q12;q12) P2RX3/RTN4RL2
t(11;11)(q12;q13) EEF1G/PPP6R3
t(11;11)(q12;q13) SHANK2/MS4A8B
t(11;11)(q13;q13) RBM14/FGF3
t(11;11)(q13;q22) PPP6R3/CNTN5
t(11;11)(q14;q14) GAB2/NARS2
t(11;11)(q14;q14) PICALM/CCDC81
t(11;11)(q23;q23) HYOU1/C11ORF93
t(11;12)(p11;p13) ERC1/SPI1
t(11;12)(q23;q15) HMGA2
t(11;12)(q23;q15) HMGA2
t(11;13)(q24;q14) APLP2/TNFSF11
t(11;14)(p15;q11) MMP14/H19
t(11;16)(p11;p11) FUS/CREB3L1
t(11;16)(p11;p11) FUS/CREB3L1
t(11;16)(q13;p13) C11orf95/MKL2
t(11;16)(q13;p13) C11orf95/MKL2
t(11;19)(p15;p13) H19/CALR
t(11;19)(q11;q13) MALAT1
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1

Cancer prone diseases     

Ataxia telangiectasia
Beckwith-Wiedemann syndrome
Frasier syndrome (FS)
Glycogen storage disease type I (GSD I)
Hemihyperplasia isolated
Multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1)
Multiple endocrine neoplasia type 2 (MEN2)
Mosaic variegated aneuploidy syndrome
WAGR (Wilms' tumor/aniridia/genitourinary anomalies/mental retardation syndrome)

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 11 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE



External links     

  • Chromosome 11 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 11 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 11 - Ensembl Project
  • Chromosome 11 - Map View - NCBI
  • Chromosome 11 - Genome Home Reference
  • Chromosome 11 - OMIM Gene map
  • Chromosome 11 - Genomic Variants
  • Chromosome 11 - HAPMAP Project
  • Chromosome 11 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 11 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 11 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 11 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 11 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 11 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 11 Cancer GeneWeb
  • Human Proteomics Initiative (UniProt)
  • Cytogenetic marker FISH (Abbott)
  • FISH Probes DAKO
  • SureFISH Probes
  • CytoCell
  • Kreatech Diagnostic/

  • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ADAMTS15 130318.869     11q25
    AIP 67250.987     11q13.3
    APLNR 57001.052     11q12
    ARHGAP20 110447.759     11q23.1
    ARHGEF12 120207.618     11q23.3
    ATM 108093.559     11q22-q23
    B3GNT6 76745.385     11q13.4
    BAD 64037.300     11q13.1
    BIRC2 102217.913     11q22
    BIRC3 102188.181     11q22
    BRMS1 66104.804     11q13.2
    C11orf30 76156.069     11q13.5
    CARS 3022.152     11p15.5
    CASP1 104896.237     11q23
    CBL 119076.986     11q23.3
    CCND1 69455.873     11q13
    CD151 832.952     11p15.5
    CD248 66081.958     11q13
    CD44 35160.417     11p13
    CD59 33724.556     11p13
    CD82 44587.141     11p11.2
    CEP57 95523.625     11q21
    CHKA 67820.326     11q13.2
    CRYAB 111779.344     11q22.3-q23.1
    CST6 65779.462     11q13
    CTNND1 57529.234     11q11
    DDB2 47236.493     11p12-p11
    DDX10 108535.752     11q22-q23
    DDX25 125774.261     11q24
    DKK3 11984.543     11p15.2
    EHF 34642.588     11p12
    EIF3F 8008.867     11p15.4
    ESRRA 64073.699     11q13
    ETS1 128328.656     11q23.3
    EXT2 44117.747     11p12-p11
    FANCF 22644.079     11p15
    FAU 64888.099     11q13
    FEN1 61560.109     11q12
    FLI1 128563.811     11q24.1-q24.3
    FOSL1 65659.607     11q13
    GAB2 77926.336     11q14.1
    H2AFX 118964.585     11q23.3
    HRAS 532.242     11p15.5
    HSPA8 122928.200     11q24.1
    HTATIP2 20385.289     11p15.1
    INPPL1 71935.882     11q13
    KAT5 65479.473     11q13
    KMT2A 118307.205     11q23
    LMO1 8245.851     11p15
    LMO2 33880.123     11p13
    LRP5 68080.077     11q13.4
    MACROD1 63766.030     11q11
    MAML2 95709.757     11q21
    MCAM 119179.234     11q23.3
    MEN1 64570.986     11q13
    MIR100 122022.937     11q24.1
    MIR125B1 121970.465     11q24.1
    MMP26 5009.424     11p15
    MRE11A 94150.469     11q21
    MUC2 1074.875     11p15.5
    MUC5AC 1151.580     11p15.5
    MUC6 1012.824     11p15.5
    MYEOV 69061.605     11q13
    NEU3 74699.950     11q13.5
    NNMT 114166.535     11q23.1
    NUMA1 71713.910     11q13
    NUP98 3733.059     11p15.5
    OPCML 132284.875     11q25
    ORAOV1 69480.332     11q13.3
    PAK1 77033.060     11q13-q14
    PAX6 31806.340     11p13
    PICALM 85668.214     11q14
    POU2AF1 111222.981     11q23.1
    PTPRJ 48002.110     11p11.2
    RAD9A 67160.776     11q13.1-q13.2
    RARRES3 63304.273     11q23
    RELA 65421.067     11q13
    RRM1 4115.924     11p15.5
    RSF1 77377.274     11q14.1
    SDHD 111957.548     11q23
    SIPA1 65405.578     11q13
    SPA17 124543.740     11q24.2
    SPI1 47376.409     11p11.2
    TAGLN 117070.040     11q23.2
    TALDO1 747.432     11p15.5-p15.4
    THRSP 77774.907     11q14.1
    THY1 119288.655     11q23.3
    TMPRSS4 117947.727     11q23.3
    TYR 88911.040     11q14.3
    WT1 32409.322     11p13
    YAP1 101981.192     11q13
    ZBTB16 113931.288     11q23.1

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    AAMDC 77532.208     11q14.1
    AASDHPPT 105948.292     11q22
    ABCC8 17414.432     11p15.1
    ABCG4 119020.299     11q23.3
    ABTB2 34172.534     11p13
    ACAD8 134123.434     11q25
    ACAT1 107992.258     11q22.3
    ACCS 44087.729     11p11
    ACCSL 44069.531     11p11.2
    ACER3 76571.917     11q13.5
    ACP2 47260.853     11p11.2|11p12-p11
    ACRV1 125542.229     11q24.2
    ACTN3 66314.312     11q13.1
    ACY3 67410.026     11q13.2
    ADAMTS8 130274.818     11q25
    ADM 10326.527     11p15.4
    ADRBK1 67033.905     11q13.1
    AGBL2 47681.143     11p11.2
    AHNAK 62283.374     11q12.2
    AKIP1 8932.701     11p15.3
    ALDH3B1 67777.775     11q13
    ALDH3B2 67429.633     11q13
    ALG1L9P 71505.409     11q13.4
    ALG8 77811.988     11q14.1
    ALG9 111652.919     11q23
    ALKBH3 43902.357     11p11.2
    ALKBH3-AS1 43930.839     -
    ALKBH8 107373.453     11q22.3
    ALX4 44282.278     11p11.2
    AMBRA1 46417.962     11p11.2
    AMICA1 118064.442     11q23.3
    AMOTL1 94501.508     11q14.3
    AMPD3 10472.224     11p15
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    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedJul 2015Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_11.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2015 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Fri Jul 24 14:51:30 CEST 2015


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