Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 15

Chromosome 15 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 15 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

dic(1;15)(p11;p11)
+15 or trisomy 15 (as sole autosomal abnormality)
t(5;15)(q33;q22) TP53BP1/PDGFRB
t(9;15)(p13;q24) PAX5/PML
t(9;15)(p13;q24) PAX5/GOLGA6A
t(11;15)(q23;q14) KMT2A/CASC5
t(12;15)(p13;q25) ETV6/NTRK3
t(14;15)(q32;q11) IGH/NBEAP1
t(15;17)(q22;q21) in treatment related leukemia
t(15;17)(q24;q21) PML/RARA
t(15;21)(q22;q22) RUNX1/?

Solid Tumors     

t(7;15)(p21;q21) C15ORF21/ETV1
t(9;15)(q22;q21) TCF12/NR4A3
t(9;15)(q22;q21) TCF12/NR4A3
t(12;15)(p13;q25) ETV6/NTRK3
t(12;15)(p13;q25) ETV6/NTRK3
t(12;15)(p13;q26) ETV6/NTRK3
t(15;15)(q21;q21) SPG11/SORD
t(15;15)(q22;q24) CYP1A2/SPG21
t(15;19)(q14;p13) BRD4/NUTM1
t(15;22)(q21;q12) MCM5/TRPM7

Cancer prone diseases     

Bloom syndrome

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 15 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE



External links     

  • Chromosome 15 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 15 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 15 - Ensembl Project
  • Chromosome 15 - Map View - NCBI
  • Chromosome 15 - OMIM Gene map
  • Chromosome 15 - Genomic Variants
  • Chromosome 15 - HAPMAP Project
  • Chromosome 15 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 15 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 15 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 15 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 15 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 15 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 15 Cancer GeneWeb
  • Human Proteomics Initiative (UniProt)
  • Cytogenetic marker FISH (Abbott)
  • FISH Probes DAKO
  • SureFISH Probes
  • CytoCell
  • Kreatech Diagnostic/

  • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ADAM10 58887.403 15q2
    ANP32A 69070.875 15q23
    AVEN 34158.428 15q13.1
    BLM 91260.558 15q26.1
    BUB1B 40453.210 15q15
    CASC5 40886.447 15q14
    CEMIP 81071.684 15q25.1
    COPS2 49417.471 15q21.2
    CTSH 79214.092 15q25.1
    FURIN 91414.769 15q26.1
    GCNT3 59903.982 15q22
    IGF1R 99191.768 15q26.3
    ITGA11 68594.042 15q22.3-q23
    KIAA0101 64657.211 15q22
    MAPK6 52311.411 15q21
    MIR211 31357.235 15q13.3
    NBEAP1 20874.797 15q11.2
    NEIL1 75639.960 15q33.33
    NTRK3 88520.596 15q24-q25
    NUTM1 34635.516 15q14
    PIAS1 68346.572 15q
    PKM 72491.370 15q23
    PLCB2 40580.098 15q15.1
    PML 74287.014 15q24.1
    RASGRF1 79252.289 15q24
    SHC4 49115.934 15q21.1-q21.2
    SPINT1 41136.643 15q13.3
    TCF12 57210.833 15q21
    THBS1 39873.280 15q15
    TRPM1 31293.264 15q13.3
    TYRO3 41851.220 15q15.1-q21.1
    UBE3A 25582.396 15q11.2
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    AAGAB 67493.013 15q22.33-q23
    ABHD17C 80987.652 15q25.1
    ABHD2 89631.381 15q26.1
    ACAN 89346.674 15q26.1
    ACSBG1 78463.187 15q23-q24
    ACTC1 35080.297 15q14
    ADAL 43622.554 15q15.3
    ADAMTS17 100511.643 15q24
    ADAMTS7 79051.545 15q25.1
    ADAMTS7P1 82585.621 15q25.2
    ADAMTSL3 84322.838 15q25.2
    ADPGK 73043.708 15q24.1
    ADPGK-AS1 73075.176 15q24.1
    AEN 89164.527 15q26.1
    AGBL1 86685.242 15q25.3
    AGBL1-AS1 86840.065 15q25.3
    AGVR6190 93257.424 15q26.1
    AKAP13 86163.181 15q24-q25
    ALDH1A2 58245.622 15q21.2
    ALDH1A3 101419.897 15q26
    ALPK3 85359.911 15q25.2
    ANKDD1A 65204.101 15q22.31
    ANKRD34C 79575.146 15q25.1
    ANKRD63 40573.645 15q15.1
    ANP32A-IT1 69096.160 15q23
    ANP32AP1 35529.527 15q14
    ANPEP 90328.126 15q25-q26
    ANXA2 60639.350 15q22.2
    AP3B2 83328.033 15q
    AP3S2 90373.831 15q26.1
    AP4E1 51200.869 15q21.2
    APBA2 29213.840 15q11-q12
    APH1B 63569.749 15q22.2
    AQP9 58430.408 15q
    AQR 35148.552 15q13
    ARHGAP11A 32907.345 15q13.3
    ARHGAP11B 30918.879 15q13.2
    ARID3B 74833.548 15q24
    ARIH1 72766.667 15q24
    ARNT2 80696.692 15q25.1
    ARPIN 90439.764 15q26.1
    ARPP19 52839.432 15q11.2
    ARRDC4 98503.933 15q26.2
    ASB7 101142.755 15q26.3
    ASB9P1 93338.714 15q26.1
    ATP10A 25923.860 15q12
    ATP8B4 50150.435 15q21.2
    B2M 45003.685 15q21-q22.2
    BAHD1 40731.920 15q14
    BBS4 72978.520 15q22.3-q23
    BCL2A1 80253.232 15q24.3
    BCL2L10 52401.822 15q21
    BLOC1S6 45879.417 15q21.1
    BMF 40380.092 15q14
    BMS1P15 20362.688 15q11.1
    BNC1 83924.655 15q25.1
    BNIP2 59955.062 15q21.3
    BTBD1 83685.181 15q24
    C15orf26 81426.644 15q25.1
    C15orf27 76352.299 15q23-q24.1
    C15orf32 93014.907 15q26.1
    C15orf38-AP3S2 90373.831 15q26.1
    C15orf39 75494.221 15q23
    C15orf40 83676.702 15q25.2
    C15orf41 36871.804 15q14
    C15orf43 45248.900 15q21.1
    C15orf48 45722.727 15q21.1
    C15orf52 40623.653 15q15.1
    C15orf53 38988.799 15q14
    C15orf54 39542.885 15q14
    C15orf56 40542.866 15q15.1
    C15orf57 40845.112 15q15.1
    C15orf59 74032.141 15q24.1
    C15orf61 67813.522 15q23
    C15orf62 41062.159 15q15.1
    C15orf65 55700.723 15q21.3
    C2CD4A 62359.176 15q22.2
    C2CD4B 62455.737 15q22.2
    CA12 63615.730 15q22
    CALML4 68483.043 15q22.31
    CAPN3 42651.698 15q15.1
    CASC4 44580.909 15q15.1
    CATSPER2 43922.760 15q15.3
    CATSPER2P1 44028.146 15q15.3
    CCDC33 74610.882 15q24.1
    CCNB2 59397.284 15q21.3
    CCNDBP1 43477.466 15q14-q15
    CCPG1 55647.421 15q21.1
    CD276 73976.622 15q23-q24
    CDAN1 43015.760 15q15.2
    CELF6 72577.068 15q24
    CEP152 49030.135 15q21.1
    CERS3 100940.600 15q26.3
    CGNL1 57668.703 15q21.3
    CHAC1 41245.636 15q15.1
    CHD2 93443.551 15q26
    CHEK2P2 20487.997 15q11.1
    CHP1 41523.437 15q13.3
    CHRFAM7A 30653.443 15q13.2
    CHRM5 34261.089 15q26
    CHRNA3 78887.647 15q24
    CHRNA5 78857.862 15q24
    CHRNA7 32322.686 15q13.3
    CHRNB4 78916.636 15q24
    CHST14 40763.160 15q15.1
    CHSY1 101715.928 15q26.3
    CIB1 90773.477 15q25.3-q26
    CIB2 78396.948 15q24
    CILP 65488.337 15q22
    CKMT1A 43985.084 15q15
    CKMT1B 43885.252 15q15
    CLK3 74907.335 15q24
    CLN6 68499.330 15q23
    CLPX 65442.784 15q22.31
    COMMD4 75628.337 15q24.2
    CORO2B 68908.879 15q22.31
    COX5A 75212.617 15q25
    CPEB1 83211.951 15q25.1
    CPLX3 75118.951 15q24.1
    CRABP1 78632.666 15q24
    CRTC3 91073.118 15q26.1
    CSK 75074.425 15q24.1
    CSNK1A1P1 37091.301 15q13.3
    CSNK1G1 64457.716 15q22.1-q22.31
    CSPG4 75966.663 15q24.2
    CSPG4P5 84953.014 15q25.2
    CT62 71402.583 15q23
    CTDSPL2 44719.579 15q15.3-q21.1
    CTXN2 48483.867 15q21.1
    CXADRP2 22014.420 15q11.2
    CYFIP1 22955.755 15q11
    CYP11A1 74630.103 15q23-q24
    CYP19A1 51500.254 15q21.1
    CYP1A1 75011.883 15q24.1
    CYP1A2 75041.184 15q24.1
    DAPK2 64199.235 15q22.1
    DCAF13P3 51236.326 15q21.2
    DDX11L12 102516.808 -
    DDX11L3 102516.761 3q29
    DDX11L4 102516.808 6p25.3
    DDX11L9 102516.761 15q26.3
    DENND4A 65952.957 15q22.31
    DET1 89055.714 15q25.3
    DIS3L 66585.920 15q22.31
    DISP2 40650.434 15q14
    DKFZP434L187 30488.239 15q13.2
    DKFZP547L112 22011.369 15q11.2
    DLL4 41221.531 15q14
    DMXL2 51739.921 15q21.2
    DNAJA4 78556.989 15q24.1
    DNAJC17 41060.067 15q15.1
    DNM1P35 76020.011 15q24.2
    DNM1P41 85045.806 15q25.2
    DNM1P46 100330.361 15q26.3
    DPH6 35812.474 15q14
    DPH6-AS1 35838.396 15q14
    DPP8 65737.998 15q22
    DTWD1 49913.226 15q21.2
    DUOX1 45422.192 15q21
    DUOX2 45384.852 15q15.3-q21
    DUOXA1 45409.564 15q21.1
    DUOXA2 45406.523 15q21.1
    DUT 48623.621 15q21.1
    DYX1C1 55722.506 15q21.1
    DYX1C1-CCPG1 55647.421 15q21.3
    EDC3 74922.899 15q24.1
    EFTUD1 82422.561 15q25.2
    EFTUD1P1 84748.939 15q25.2
    EHD4 42191.639 15q11.1
    EID1 49170.290 15q21.1
    EIF2AK4 40226.325 15q13.3
    EIF3J 44829.266 15q21.1
    EIF3J-AS1 44826.703 15q21.1
    ELL3 44064.798 15q15.1
    EMC4 34517.198 15q14
    EMC7 34376.224 15q14
    EPB42 43489.426 15q15-q21
    ERV18-1 54202.966 15q21.3
    ETFA 76508.629 15q23-q25
    EXD1 41474.931 15q15.1
    FAH 80445.233 15q25.1
    FAM103A1 83654.955 15q25.2
    FAM138E 102495.088 15q26.3
    FAM154B 82555.152 15q25.2
    FAM169B 98980.391 15q26.3
    FAM174B 93160.679 15q26.1
    FAM189A1 29412.455 15q12
    FAM214A 52873.518 15q21.2-q21.3
    FAM219B 75192.328 15q23
    FAM227B 49620.592 15q21.2
    FAM63B 59063.393 15q21.3
    FAM81A 59730.372 15q22.2
    FAM96A 64364.758 15q22.31
    FAM98B 38746.328 15q14
    FAN1 31196.076 15q13.2-q13.3
    FANCI 89787.194 15q26.1
    FBN1 48700.503 15q21.1
    FBXL22 63889.552 15q22.1
    FBXO22 76196.200 15q23
    FBXO22-AS1 76225.024 15q23
    FEM1B 68570.141 15q22
    FES 91428.276 15q25-qter
    FGF7 49715.375 15q21.2
    FLJ10038 50645.598 15q21.2
    FLJ42022 74933.789 15q24.1
    FMN1 33057.745 15q13.3
    FOXB1 60296.421 15q22
    FRMD5 44162.959 15q15.3
    FSD2 83424.117 15q25.2
    FSIP1 39892.232 15q14
    GABARAPL3 90889.763 15q26.1
    GABPB1 50578.077 15q21.2
    GABPB1-AS1 50646.371 15q21.2
    GABRA5 27111.866 15q12
    GABRB3 26788.694 15q12
    GABRG3 27216.429 15q12
    GALK2 49447.956 15
    GANC 42565.856 15q15.2
    GATM 45653.322 15q15.1
    GCHFR 41056.285 15q15
    GCOM1 57884.102 15q21.3
    GDPGP1 90777.487 15q26.1
    GJD2 35044.642 15q13.1
    GLCE 69452.973 15q23
    GLDN 51633.713 15q15.3
    GNB5 52413.123 15q21.2
    GOLGA2P10 85746.686 15q25.2
    GOLGA2P11 62534.728 15q22.2
    GOLGA2P7 84868.064 15q25.2
    GOLGA6A 74362.198 15q24.1
    GOLGA6B 72947.038 15q24.1
    GOLGA6C 75550.899 15q24.2
    GOLGA6D 75575.182 15q24.2
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    ST20 80191.182 15q25.1
    ST20-AS1 80215.113 15q25.1
    ST20-MTHFS 80135.889 15q25.1
    ST8SIA2 92937.140 15q26
    STARD5 81605.007 15q26
    STARD9 42867.857 15q14
    STOML1 74275.559 15q24-q25
    STRA6 74471.808 15q24.1
    STRC 43891.761 15q15.3
    SV2B 91643.182 15q26.1
    SYNM 99645.286 15q26.3
    TARSL2 102193.955 15q26.3
    TBC1D21 74165.927 15q24
    TBC1D2B 78287.327 15q24.3-q25.1
    TEX9 56657.622 15q21.3
    TGM5 43524.793 15q15
    TGM7 43568.479 15q15.2
    THAP10 71173.681 15q22.32
    THSD4 71839.541 15q23
    TICRR 90118.818 15q26.1
    TIPIN 66629.008 15q22.31
    TJP1 29992.357 15q13
    TLE3 70340.130 15q22
    TLN2 62939.510 15q15-q21
    TM2D3 102182.049 15q26.3
    TM6SF1 83776.324 15q24-q26
    TMC3 81624.760 15q24.3
    TMCO5A 38227.457 15q14
    TMCO5B 33528.677 15q13.3
    TMED3 79603.491 15q24-q25
    TMEM202 72690.668 15q24.1
    TMEM62 43425.722 15q15.2
    TMEM87A 42549.095 15q15.1
    TMOD2 52043.758 15q21.2
    TMOD3 52121.825 15q21.1-q21.2
    TNFAIP8L3 51348.799 15q21.2
    TP53BP1 43699.412 15q15-q21
    TPM1 63334.838 15q22.1
    TRIM69 45028.560 15q21.1
    TRIP4 64680.003 15q22.1
    TRPM7 50849.352 15q21
    TSPAN3 77336.360 15q23
    TTBK2 43036.542 15q15.2
    TTC23 99676.528 15q26.3
    TTLL13 90792.788 15q26.1
    TUBGCP4 43663.257 15q15
    TUBGCP5 22833.395 15q11.1
    TYRO3P 76551.630 15q24.2
    UACA 70946.893 15q22-q24
    UBAP1L 65385.342 15q22.31
    UBE2Q2 76136.385 15q24.2
    UBE2Q2L 84841.242 -
    UBE2Q2P1 85070.427 15q25.2
    UBE2Q2P2 82647.354 15q25.2
    UBL7 74738.318 15q23
    UBL7-AS1 74753.606 15q24.1
    UBR1 43235.098 15q13
    ULK3 75128.457 15q24.1
    ULK4P1 30864.758 15q13.3
    ULK4P2 30864.758 15q13.2
    ULK4P3 30395.935 15q13.2
    UNC13C 54305.101 15q21.3
    UNC45A 91473.410 15q26.1
    USP3 63796.710 15q22.3
    USP3-AS1 63879.909 15q22.31
    USP50 50792.759 15q21.1
    USP8 50716.574 15q21.1
    VIMP 101812.387 15q26.3
    VPS13C 62156.505 15q21.3
    VPS18 41186.628 15q14-q15
    VPS33B 91541.646 15q26.1
    VPS39 42450.899 15q14
    VWA9 65871.096 15q22.31
    WASH3P 102501.165 15q26.3
    WDR61 78575.578 15q25.1
    WDR72 53805.938 15q21.3
    WDR73 85186.012 15q25.2
    WDR76 44119.112 15q15.3
    WDR93 90234.028 15q26.1
    WHAMM 83478.380 15q25.2
    WHAMMP1 32812.049 15q13.3
    WHAMMP2 28982.729 15q13.1
    WHAMMP3 23187.729 15q11.2
    ZFAND6 80351.910 15q24.3
    ZFYVE19 41099.274 15q14
    ZNF106 42704.635 15q15.1
    ZNF280D 56922.374 15q21.2
    ZNF592 85291.818 15q25.2
    ZNF609 64791.619 15q22.1
    ZNF710 90544.723 15q26.1
    ZNF770 35270.542 15q14
    ZNF774 90895.477 15q26.1
    ZSCAN2 85144.249 15q25.2
    ZSCAN29 43650.370 15q15.3
    ZWILCH 66797.421 15q22.31

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedDec 2014Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_15.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Dec 2014 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_15.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Sun Dec 21 03:38:59 CET 2014


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