Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case reports   Journals   Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

Chromosome 18

chr18:1-80373285 (80373.285 Kb)

Chromosome 18 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 18 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

18 18p 18q 18p11 18q11 18q12 18q21 18q22 18q23

Leukaemia     

der(9;18)(p10;q10)
dic(9;18)(p13;q11) PAX5/ZNF521
del(18)(p11)
+18 or trisomy 18 in lymphoproliferative disorders
i(18)(q10)
inv(18)(p11q21)
t(1;18)(q10;q10)
der(18)t(1;18)(q10-25;q11-23)
t(1;18)(q25;q23)
t(2;18)(p11;q21) IGK/BCL2
t(2;18)(q11;q21) AFF3/BCL2
t(3;18)(q26;q11) ?/MECOM
t(11;18)(p15;q12) NUP98/SETBP1
t(11;18)(q21;q21) BIRC3/MALT1
t(12;18)(p13;q12) ETV6/SETBP1
t(14;18)(q32;q21) IGH/BCL2
t(14;18)(q32;q21) IGH/MALT1
t(18;21)(p11;q11)
t(18;21)(q21;q22) RUNX1/?
t(18;22)(q21;q11) IGL/BCL2

Solid Tumors     

Pancreatic tumors: an overview
Penile tumors: an overview
t(2;18)(p24;q11) KLHL29/PSMA8 (Lung)
t(8;18)(q24;q12) PVT1/NOL4 (Lung)
t(X;18)(p11;q11) SS18/SSX1 (Prostate tumors)
t(X;18)(p11;q11) SS18/SSX2 (Prostate tumors)
t(X;18)(p11;q11) SS18/SSX (Prostate tumors)
t(X;18)(p11;q11) SS18/? (Soft tissue tumors)
t(X;18)(p11;q11) SS18/ (Soft Tissues)
t(18;18)(p11;q12) TWSG1/PIK3C3 (Lung)
t(18;18)(q11;q11) LAMA3/RIOK3 (Lung)

Cancer prone diseases     

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 18 by location


External links     

  • Chromosome 18 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 18 - GoldenPath - UCSC
  • Chromosome 18 - Ensembl Project
  • Chromosome 18 - Map View - NCBI
  • Chromosome 18 - Genomics Home Reference
  • Chromosome 18 - DECIPHER
  • Chromosome 18 - OMIM Gene map
  • Chromosome 18 - Genomic Variants
  • Chromosome 18 - HAPMAP Project
  • Chromosome 18 - 1000 Genomes
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 18 Cancer GeneWeb

  • Chromosome 18 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 18 - Human UniProtKB

    FISH probes

  • Chromosome 18 - FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Chromosome 18 - Empire Genomics FISH clones [ chromosome ]  [ genes ]
  • Chromosome 18 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 18 - Vysis FISHCytogenetic marker (Abbott)
  • FISH Probes DAKO (Agilent)
  • SureFISH Probes (Agilent)
  • CytoCell  [ haematology ]  [ pathology ]
  • Kreatech Diagnostic
  • Metasystems

  • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ADCYAP1 904.943     18p11.32
    AQP4 26852.038     18q11.2
    BCL2 63123.346     18q21.33
    CYB5A 74253.292     18q22.3
    DCC 52340.172     18q21.2
    DSG2 31498.004     18q12.1
    EPB41L3 5392.381     18p11.31
    GATA6 22169.437     18q11.2
    MALT1 58671.386     18q21.32
    MAPK4 50560.114     18q21.1-q21.2
    MBD2 54151.601     18q21.2
    MIR122 58451.074     18q21.31
    PHLPP1 62715.439     18q21.33
    RBBP8 22933.332     18q11.2
    SERPINB3 63655.197     18q21.33
    SERPINB5 63476.911     18q21.33
    SETBP1 44680.173     18q12.3
    SLC39A6 36111.000     18q12.2
    SMAD2 47833.095     18q21.1
    SMAD4 51030.213     18q21.2
    SOCS6 70288.901     18q22.2
    SS18 26016.253     18q11.2

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ABHD3 21650.897     18q11.2
    ACAA2 49783.504     18q21.1
    ADNP2 80109.031     18q23
    AFG3L2 12328.944     18p11.21
    AKAIN1 5143.673     18p11.31
    ALPK2 58481.250     18q21.31-q21.32
    ANKRD12 9136.753     18p11.22
    ANKRD20A5P 14183.941     18p11.21
    ANKRD29 23598.926     18q11.2
    ANKRD30B 14748.240     18p11.21
    ANKRD62 12093.849     18p11.21
    APCDD1 10454.628     18p11.22
    AQP4-AS1 26865.308     18q11.2
    ARHGAP28 6834.433     18p11.31
    ASXL3 33578.577     18q12.1
    ATP5A1 46084.144     18q21.1
    ATP8B1 57646.426     18q21.31
    ATP9B 79069.275     18q23
    B4GALT6 31621.036     18q12.1
    BOD1L2 57147.062     18q21.31
    C18orf12 48252.301     18q21.1
    C18orf15 13239.543     18p11.21
    C18orf21 35972.625     18q12.2
    C18orf25 46174.022     18q21.1
    C18orf32 49481.178     18q21.1
    C18orf54 54357.917     18q21.2
    C18orf61 12200.779     18p11.21
    C18orf63 74315.875     18q22.3
    C18orf65 76495.521     18q23
    C18orf8 23503.470     18q11.2
    CABLES1 23135.763     18q11.2
    CABYR 24138.956     18q11.2
    CBLN2 72536.680     18q22.3
    CBX3P2 2652.170     18p11.32
    CCBE1 59430.939     18q21.32
    CCDC102B 68715.254     18q22.1-q22.2
    CCDC178 32937.402     18q12.1
    CCDC68 54901.509     18q21.2
    CD226 69862.956     18q22.2
    CDH19 66501.187     18q22.1
    CDH20 61333.582     18q21.33
    CDH2 27950.963     18q12.1
    CDH7 65750.652     18q22.1
    CELF4 37243.045     18q12.2
    CEP192 12991.362     18p11.21
    CEP76 12672.627     18p11.21
    CETN1 580.343     18p11.32
    CFAP53 50227.194     18q21.1
    CHMP1B 11851.390     18p11.21
    CHST9 26915.631     18q11.2
    CIDEA 12254.319     18p11.21|18
    CLUL1 596.998     18p11.32
    CNDP1 74534.457     18q22.3
    CNDP2 74499.588     18q22.3
    COLEC12 319.355     18p11.32
    CPLX4 59295.404     18q21.32
    CTAGE1 22413.601     18q11.2
    CTDP1 79681.430     18q23
    CTIF 48539.056     18q21.1
    CXADRP3 14477.955     18p11.21
    CXXC1 50282.343     18q21.1
    CYP4F35P 14337.423     18p11.21
    DLGAP1 3496.032     18p11.31
    DLGAP1-AS2 3604.970     18p11.31
    DLGAP1-AS3 3878.180     18p11.31
    DLGAP1-AS4 3962.353     18p11.31
    DLGAP1-AS5 4264.602     18p11.31
    DOK6 69401.048     18q22.2
    DSC1 31129.251     18q12.1
    DSC2 31065.974     18q12.1
    DSC3 30989.365     18q12.1
    DSCAS 31101.588     18q12.1
    DSEL 67506.582     18q22.1
    DSG1 31318.089     18q12.1
    DSG1-AS1 31343.368     18q12.1
    DSG2-AS1 31542.146     18q12.1
    DSG3 31447.769     18q12.1
    DSG4 31376.777     18q12.1
    DTNA 34593.318     18q12.1
    DYM 49043.802     18q21.1
    DYNAP 54587.759     18q21.2
    ELAC1 50968.017     18q21.2
    ELOA2 47032.572     18q21.1
    ELOA3B 46962.768     18q21.1
    ELOA3D 46962.768     18q21.1
    ELP2 36129.874     18q12.2
    EMILIN2 2847.030     18p11.32-p11.31
    ENOSF1 670.324     18p11.32
    EPG5 45847.609     18q12.3-q21.1
    ESCO1 21529.301     18q11.2
    FAM210A 13663.347     18p11.21
    FAM69C 74435.728     18q22.3
    FBXO15 74073.353     18q22.3
    FECH 57544.841     18q21.31
    FHOD3 36297.696     18q12.2
    FLJ34223 10243.288     18p11.22
    GACAT2 8695.856     18p11.22
    GALNT1 35654.569     18q12.2
    GALR1 77250.052     18q23
    GAPLINC 3466.250     18p11.31
    GAREM1 32263.521     18q12.1
    GATA6-AS1 22166.898     18q11.2
    GNAL 11751.472     18p11.21
    GREB1L 21242.242     18q11.1-q11.2
    GRP 59220.168     18q21.32
    GTSCR1 70630.519     18q22.2
    HAUS1 46104.332     18q21.1
    HDHD2 47107.402     18q21.1
    HMSD 63949.354     18q22.1
    HRH4 24460.629     18q11.2
    HSBP1L1 79964.582     18q23
    IER3IP1 47155.019     18q21.1
    IMPA2 11981.428     18p11.21
    IMPACT 24426.645     18q11.2
    INO80C 35468.327     18q12.2
    KATNAL2 46946.824     18q21.1
    KC6 41480.271     -
    KCNG2 79863.668     18q23
    KCTD1 26454.911     18q11.2
    KDSR 63327.738     18q21.33
    KIAA1328 36829.106     18q12.2
    KIAA1468 62187.291     18q21.33
    KLHL14 32672.673     18q12.1
    L3MBTL4 5954.706     18p11.31
    L3MBTL4-AS1 6256.744     18p11.31
    LAMA1 6941.744     18p11.31
    LAMA3 23873.020     18q11.2
    LDLRAD4 13611.464     18p11.21
    LDLRAD4-AS1 13419.499     18p11.21
    LINC00305 64080.302     18q22.1
    LINC00470 1269.823     18p11.32
    LINC00526 5237.130     18p11.31
    LINC00667 5238.100     18p11.31
    LINC00668 6925.478     18p11.31
    LINC00683 76619.777     18q23
    LINC00907 42186.668     18q12.3
    LINC00908 76528.655     18q23
    LINC00909 74592.926     18q22.3
    LINC01029 77971.296     18q23
    LINC01254 10405.133     18p11.22
    LINC01255 11490.048     18p11.21
    LINC01415 55774.601     18q21.2
    LINC01416 55881.688     18q21.2
    LINC01443 14946.267     18p11.21
    LINC01444 14969.607     18p11.21
    LINC01477 40066.286     18q12.3
    LINC01478 44323.435     18q12.3
    LINC01538 64213.083     18q22.1
    LINC01539 56083.356     18q21.2
    LINC01541 71519.964     18q22.3
    LINC01543 26422.995     18q11.2
    LINC01544 61748.176     18q21.33
    LINC01601 44531.779     18q12.3
    LINC01630 51392.042     18q21.2
    LINC-ROR 57054.573     18q21.31
    LIPG 49562.031     18q21.1
    LMAN1 59327.824     18q21.32
    LOC100130468 10476.543     18p11.22
    LOC100131655 76794.732     18q23
    LOC100192426 8360.820     18p11.23
    LOC100286986 5629.869     18p11.31
    LOC100505549 57630.302     18q21.31
    LOC100505797 72869.040     18q22.3
    LOC100505817 73324.941     18q22.3
    LOC100996333 12073.232     18p11.21
    LOC101926997 2517.269     -
    LOC101927044 3190.397     18p11.31
    LOC101927168 6728.927     18p11.31
    LOC101927188 6954.677     18p11.31
    LOC101927322 58670.009     18q21.32
    LOC101927410 10661.933     18p11.22
    LOC101927571 22723.491     18q11.2
    LOC101927809 36180.001     18q12.2
    LOC101927943 44676.931     18q12.3
    LOC101927989 76491.652     18q23
    LOC101928144 49499.390     18q21.1
    LOC104968399 3255.437     18p11.31
    LOC105371967 3653.410     18p11.31
    LOC105371998 12432.774     18p11.21
    LOC105372028 24725.781     18q11.2
    LOC105372038 27336.991     18q11.2
    LOC105372068 37274.460     18q12.2
    LOC105372069 36901.945     18q12.2
    LOC105372071 36660.389     18q12.2
    LOC105372129 55293.964     -
    LOC105372179 69469.931     18q22.2
    LOC284241 79638.928     18q23
    LOC284263 45483.345     18q21.1
    LOC339298 76122.998     18q23
    LOC400655 73154.058     18q22.3
    LOC400662 78137.217     18q23
    LOC642484 56003.613     18q21.2
    LOC643542 67516.546     18q22.1
    LOC644669 15313.556     18p11.21
    LOC727896 2943.215     18p11.31
    LOC732210 14856.969     18p11.21
    LOXHD1 46476.972     18q21.1
    LPIN2 2916.994     18p11.31
    LRRC30 7231.139     18p11.23
    LRRC37A7P 31724.198     18q12.1
    MAPRE2 34976.928     18q12.1-q12.2
    MBD1 50268.846     18q21.1
    MBP 76978.833     18q23
    MC2R 13882.044     18p11.21
    MC4R 60371.331     18q21.32
    MC5R 13825.544     18p11.21
    ME2 50879.062     18q21.2
    MEP1B 32190.024     18q12.1
    METTL4 2537.525     18p11.32
    MEX3C 51174.550     18q21.2
    MIB1 21741.329     18q11.2
    MIR1-2 21829.004     18q11.2
    MIR133A1 21825.698     18q11.2
    MIR133A1HG 21825.479     18q11.2
    MIR1539 49487.373     18q21.1
    MIR187 35904.818     18q12.2
    MIR302F 30298.910     18q12.1
    MIR3156-2 14830.166     18p11.21
    MIR320C1 21683.510     18q11.2
    MIR320C2 24321.686     18q11.2
    MIR3591 58451.080     18q21.31
    MIR3929 35934.088     18q12.2
    MIR3975 35591.737     18q12.2
    MIR3976 5840.695     18p11.31
    MIR3976HG 5748.819     18p11.31
    MIR4317 6374.361     18p11.31
    MIR4318 37657.135     18q12.2
    MIR4319 44970.082     18q12.3
    MIR4320 50126.499     18q21.1
    MIR4526 13611.114     18p11.21
    MIR4527 47380.496     18q21.1
    MIR4528 53237.101     18q21.2
    MIR4529 55479.221     18q21.2
    MIR4741 22933.349     18q11.2
    MIR4743 48670.600     18q21.1
    MIR4744 49049.687     18q21.1
    MIR5011 67081.584     18q22.1
    MIR5190 13459.947     18p11.21
    MIR548AV 72853.321     18q22.3
    MIR5583-1 39676.721     18q12.3
    MIR5583-2 39676.719     18q12.3
    MIR6718 3885.353     18p11.31
    MIR6788 10759.584     18p11.22
    MIR7153 11654.885     18p11.21
    MIR8057 26591.467     18q11.2
    MIR8078 112.256     18p11.32
    MIR924 39622.123     18q12.3
    MIR924HG 39206.924     18q12.2-q12.3
    MOCOS 36187.517     18q12.2
    MPPE1 11883.471     18p11.21
    MRO 50795.120     18q21.2
    MTCL1 8717.371     18p11.22
    MYL12A 3247.530     18p11.31
    MYL12B 3262.613     18p11.31
    MYO5B 49822.786     18q21.1
    MYOM1 3066.807     18p11.31
    NAPG 10525.876     18p11.22
    NARS 57600.661     18q21.31
    NARS 57600.661     18q21.31
    NDC80 2571.511     18p11.32
    NDUFV2 9102.630     18p11.22
    NDUFV2-AS1 9121.265     18p11.22
    NEDD4L 58047.226     18q21.31
    NETO1 72742.314     18q22.3
    NFATC1 79395.772     18q23
    NOL4 33851.100     18q12.1
    NPC1 23531.499     18q11.2
    OACYLP 59035.679     18q21.32
    ONECUT2 57435.685     18q21.31
    OSBPL1A 24162.046     18q11.2
    PARD6G 80157.234     18q23
    PARD6G-AS1 80148.049     18q23
    PCAT18 26687.621     18q11.2
    PIAS2 46803.225     18q21.1
    PIEZO2 10670.247     18p11.22-p11.21
    PIGN 62044.225     18q21.33
    PIK3C3 41955.198     18q12.3
    PMAIP1 59899.960     18q21.32
    POLI 54269.479     18q21.2
    POTEC 14511.738     18p11.21
    PPP4R1 9546.791     18p11.22
    PPP4R1-AS1 9614.807     18p11.22
    PQLC1 79902.420     18q23
    PRELID3A 12407.896     18p11.21
    PSMA8 26133.852     18q11.2
    PSMG2 12702.988     18p11.21
    PSTPIP2 45983.536     18q21.1|tdb7990
    PTPN2 12785.478     18p11.21
    PTPRM 7567.316     18p11.23
    RAB12 8609.445     18p11.22
    RAB27B 54828.477     18q21.2
    RAB31 9708.231     18p11.22
    RALBP1 9475.532     18p11.22
    RAX 59267.035     18q21.32
    RBFA 80034.346     18q23
    RBFADN 80067.256     18q23
    RIOK3 23453.221     18q11.2
    RIT2 42743.218     18q12.3
    RNF125 32018.482     18q12.1
    RNF138 32092.606     18q12.1
    RNF152 61815.071     18q21.33
    RNF165 46334.224     18q21.1
    RNMT 13726.660     18p11.21
    ROCK1 20949.742     18q11.1
    ROCK1P1 109.065     18p11.32
    RPL17 49488.481     18q21.1
    RPL17-C18orf32 49481.178     18q21.1
    RPL6P27 25259.525     18p11.31
    RPRD1A 35989.824     18q12.2
    RTTN 70003.806     18q22.2
    SALL3 78980.275     18q23
    SCARNA17 49814.023     18q21.1
    SEC11C 59139.857     18q21.32
    SEH1L 12947.984     18p11.21
    SERPINB10 63907.990     18q22.1
    SERPINB11 63702.959     18q21.33
    SERPINB12 63556.160     18q21.33
    SERPINB13 63587.300     18q21.33
    SERPINB2 63887.705     18q21.33-q22.1
    SERPINB4 63637.259     18q21.33
    SERPINB7 63753.047     18q21.33
    SERPINB8 63970.029     18q22.1
    SIGLEC15 45825.580     18q12.3
    SKA1 50375.022     18q21.1
    SKOR2 47231.123     18q21.1
    SLC14A1 45724.127     18q12.3
    SLC14A2 45212.982     18q12.3
    SLC14A2-AS1 45438.184     18q12.3
    SLC25A52 31759.696     18q12.1
    SLC35G4 11609.558     18p11.21
    SMAD7 48919.853     18q21.1
    SMCHD1 2655.887     18p11.32
    SMIM21 75409.476     18q23
    SNHG22 49814.023     18q21.1
    SNORA108 58600.620     18q21.32
    SNORA111 37466.339     18q12.2
    SNORA37 54222.284     18q21.2
    SNORD58A 49491.283     18q21.1
    SNORD58B 49491.664     18q21.1
    SNORD58C 49489.235     18q21.1
    SNRPD1 21612.269     18q11.2
    SPIRE1 12446.512     18p11.21
    ST8SIA3 57352.490     18q21.31
    ST8SIA5 46679.118     18q21.1
    STARD6 54324.692     18q21.2
    SYT4 43267.892     18q12.3
    TAF4B 26226.883     18q11.2
    TCEB3C 47022.287     18q21.1
    TCF4 55222.331     18q21.2
    TCF4-AS1 55452.533     18q21.2
    TGIF1 3449.413     18p11.31
    THOC1 214.520     18p11.32
    TIMM21 74148.511     18q22.3
    TMEM200C 5889.413     18p11.31
    TMEM241 23296.015     18q11.2
    TMX3 68696.936     18q22.1
    TNFRSF11A 62325.287     18q21.33
    TPGS2 36794.106     18q12.2
    TRAPPC8 31829.173     18q12.1
    TSHZ1 75211.529     18q22.3
    TTC39C 24014.420     18q11.2
    TTC39C-AS1 23994.215     18q11.2
    TTR 31591.767     18q12.1
    TUBB6 12307.669     18p11.21
    TWSG1 9334.767     18p11.22
    TXNDC2 9885.726     18p11.22
    TXNL1 56602.822     18q21.31
    TXNL4A 79972.867     18q23
    TYMS 657.604     18p11.32
    TYMSOS 649.620     18p11.32
    USP14 158.483     18p11.32
    VAPA 9913.958     18p11.22
    VPS4B 63389.192     18q21.33
    WBP11P1 32511.663     18q12.1
    WDR7 56651.385     18q21.31
    YES1 721.592     18p11.32
    ZADH2 75195.110     18q22.3
    ZBTB14 5289.019     18p11.31
    ZBTB7C 48027.268     18q21.1
    ZCCHC2 62523.425     18q21.33
    ZNF236 76822.607     18q23
    ZNF24 35338.883     18q12.2
    ZNF271P 35290.336     18q12.2
    ZNF396 35366.697     18q12.2
    ZNF397 35241.030     18q12.2
    ZNF407 74630.963     18q22.3
    ZNF516 76357.682     18q23
    ZNF519 14099.943     18p11.21
    ZNF521 25061.924     18q11.2
    ZNF532 58862.600     18q21.32
    ZSCAN30 35251.058     18q12.2

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Jean-Loup Huret
    UpdatedAug 2017Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_18.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Aug 2017 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_18.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Mon Aug 14 13:42:03 CEST 2017


    Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case reports   Journals   Portal   Teaching   

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA