Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumours   Cancer-Prone   Deep Insight   Case reports   Journals   Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

Chromosome 18

Chromosome 18 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 18 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

18 18p 18q 18p11 18p10 18q10 18q11 18q12 18q21 18q22 18q23

Leukaemia     

dic(9;18)(p13;q11) PAX5/ZNF521
der(9;18)(p10;q10)
+18 or trisomy 18 in lymphoproliferative disorders
inv(18)(p11q21)
t(1;18)(q10;q10)
t(1;18)(q25;q23)
t(2;18)(p11;q21) IGK/BCL2
t(2;18)(q11;q21) AFF3/BCL2
t(3;18)(q26;q11) ?/MECOM
t(11;18)(p15;q12) NUP98/SETBP1
t(11;18)(q21;q21) BIRC3/MALT1
t(12;18)(p13;q12) ETV6/SETBP1
t(14;18)(q32;q21)
t(14;18)(q32;q21) IGH/MALT1
t(18;21)(q21;q22) RUNX1/?
t(18;22)(q21;q11)

Solid Tumors     

t(2;18)(p24;q11) KLHL29/PSMA8
t(8;18)(q24;q12) PVT1/NOL4
t(X;18)(p11;q11) SS18/SSX
t(X;18)(p11;q11) SS18/SSX1
t(X;18)(p11;q11) SS18/SSX2
t(X;18)(p11;q11) SS18/?
t(X;18)(p11;q11) SS18/
t(18;18)(p11;q12) TWSG1/PIK3C3
t(18;18)(q11;q11) LAMA3/RIOK3
t(18;20)(p11;q13) PHACTR3/PTPRM
t(18;22)(q12;q11) CDC45/RIT2

Cancer prone diseases     

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 18 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE



External links     

  • Chromosome 18 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 18 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 18 - Ensembl Project
  • Chromosome 18 - Map View - NCBI
  • Chromosome 18 - Genome Home Reference
  • Chromosome 18 - OMIM Gene map
  • Chromosome 18 - Genomic Variants
  • Chromosome 18 - HAPMAP Project
  • Chromosome 18 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 18 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 18 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 18 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 18 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 18 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 18 Cancer GeneWeb
  • Human Proteomics Initiative (UniProt)
  • Cytogenetic marker FISH (Abbott)
  • FISH Probes DAKO
  • SureFISH Probes
  • CytoCell
  • Kreatech Diagnostic/

  • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ADCYAP1 904.944     18p11
    AQP4 24432.008     18q11.2-q12.1
    BCL2 60790.579     18q21.3
    DCC 49866.542     18q21.3
    DSG2 29078.027     18q12.1
    EPB41L3 5392.380     18p11.32
    GATA6 19749.398     18q11.1-q11.2
    MALT1 56338.618     18q21
    MAPK4 48086.484     18q21.1
    MBD2 51677.971     18q21
    MIR122 56118.306     18q21.31
    PHLPP1 60382.672     18q21.33
    RBBP8 20513.295     18q11.2
    SERPINB3 61322.431     18q21.3
    SERPINB5 61144.144     18q21.33
    SETBP1 42260.138     18q21.1
    SLC39A6 33690.963     18q12.2
    SMAD2 45359.466     18q21.1
    SMAD4 48556.583     18q21.1
    SOCS6 67956.137     18q22.2
    SS18 23596.217     18q11.2

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ABHD3 19230.858     18q11.2
    ACAA2 47309.874     18q21.1
    ADNP2 77866.915     18q23
    AFG3L2 12328.943     18p11
    ALPK2 56148.482     18q21.31
    ANKRD12 9136.751     18p11.22
    ANKRD20A5P 14183.940     18p11.21
    ANKRD29 21178.890     18q11.2
    ANKRD30B 14748.239     18p11.21
    ANKRD62 12093.848     18p11.21
    APCDD1 10454.625     18p11.22
    AQP4-AS1 24445.272     18q11.2
    ARHGAP28 6834.432     18p11.31
    ASXL3 31158.541     18q11
    ATP5A1 43664.110     18q21
    ATP8B1 55313.659     18q21.31
    ATP9B 76829.275     18q23
    B4GALT6 29202.209     18q11
    BOD1L2 54814.293     18q21.31
    C18orf12 45778.672     18q21.1
    C18orf15 13239.542     18p11.21
    C18orf21 33552.588     18q12.2
    C18orf25 43753.988     18q21.1
    C18orf32 47007.548     18q21.1
    C18orf42 5143.672     18p11.31
    C18orf54 51884.287     18q21.2
    C18orf61 12200.778     18p11.22
    C18orf63 71983.110     18q22.3
    C18orf65 74207.477     18q23
    C18orf8 21083.434     18q11.2
    CABLES1 20715.727     18q11.2
    CABYR 21718.920     18q11.2
    CBLN2 70203.915     18q22.3
    CBX3P2 2652.169     18p11.32
    CCBE1 57098.171     18q21.32
    CCDC102B 66382.491     18q22.1
    CCDC178 30517.366     18q12.1
    CCDC68 52568.740     18q21
    CD226 67530.193     18q22.3
    CDH19 64168.424     18q22.1
    CDH20 59157.775     18q21.33
    CDH2 25530.927     18q11.2
    CDH7 63418.157     18q22.1
    CELF4 34823.008     18q12
    CEP192 12991.361     18p11.21
    CEP76 12672.626     18p11.21
    CETN1 580.343     18p11.32
    CFAP53 47753.563     18q21.1
    CHMP1B 11851.389     18p11.21
    CHST9 24495.595     18q11.2
    CIDEA 12254.318     18p11.21|18
    CLUL1 596.998     18p11.32
    CNDP1 72201.692     18q22.3
    CNDP2 72166.823     18q22.3
    COLEC12 319.355     18p11.32
    CPLX4 56962.636     18q21.32
    CTAGE1 19993.564     18p11.2
    CTDP1 77441.430     18q23
    CTIF 46065.427     18q21.1
    CXADRP3 14477.954     18p11.21
    CXXC1 47808.713     18q12
    CYB5A 71920.527     18q23
    CYP4F35P 14337.422     18p11.21
    DLGAP1 3496.030     18p11.31
    DLGAP1-AS2 3604.968     18p11.31
    DLGAP1-AS3 3878.180     18p11.31
    DLGAP1-AS4 3962.353     18p11.31
    DLGAP1-AS5 4264.602     18p11.31
    DOK6 67068.284     18q22.2
    DSC1 28709.214     18q12.1
    DSC2 28645.940     18q12.1
    DSC3 28569.331     18q12.1
    DSCAS 28681.551     18q12.1
    DSEL 65173.819     18q22.1
    DSG1 28898.052     18q12.1
    DSG1-AS1 28923.331     18q12.1
    DSG2-AS1 29122.109     -
    DSG3 29027.732     18q12.1
    DSG4 28956.740     18q12.1
    DTNA 32173.282     18q12
    DYM 46570.172     18q21.1
    DYNAP 52254.990     18q21.2
    ELAC1 48494.387     18q21
    ELP2 33709.837     18q12.2
    EMILIN2 2847.028     18p11.3
    ENOSF1 670.324     18p11.32
    EPG5 43427.574     18q12.3
    ESCO1 19109.262     18q11.2
    FAM210A 13663.346     18p11.21
    FAM69C 72102.963     18q22.3
    FBXO15 71740.588     18q22.3
    FECH 55212.073     18q21.3
    FHOD3 33877.659     18q12
    FLJ34223 10243.285     18p11.22
    GACAT2 8695.854     18p11.22
    GALNT1 33234.533     18q12.1
    GALR1 74962.008     18q23
    GAPLINC 3466.248     -
    GAREM 29843.484     18q12.1
    GATA6-AS1 19746.859     18q11.2
    GNAL 11751.471     18p11.22-p11.21
    GREB1L 18822.203     18q11.2
    GRP 56887.400     18q21.1-q21.32
    GTSCR1 68297.755     18q22.2
    HAUS1 43684.298     18q21.1
    HDHD2 44633.781     18q21.1
    HMSD 61616.588     18q22.1
    HRH4 22040.593     18q11.2
    HSBP1L1 77724.582     18q23
    IER3IP1 44681.390     18q12
    IMPA2 11981.427     18p11.2
    IMPACT 22006.609     18q11.2-q12.1
    INO80C 33048.291     18q12.2
    KATNAL2 44526.787     18q21.1
    KC6 39060.236     -
    KCNG2 77623.668     18q23
    KCTD1 24034.874     18q11.2
    KDSR 60994.971     18q21.3
    KIAA1328 34409.080     18q12.2
    KIAA1468 59854.524     18q21.33
    KLHL14 30252.634     18q12.1
    L3MBTL4 5954.705     18p11.31
    L3MBTL4-AS1 6256.743     18p11.31
    LAMA1 6941.743     18p11.3
    LAMA3 21452.984     18q11.2
    LDLRAD4 13611.463     18p11.21
    LDLRAD4-AS1 13419.498     18p11.21
    LINC00305 61747.536     18q22.1
    LINC00526 5237.129     18p11.31
    LINC00667 5238.099     18p11.31
    LINC00668 6925.477     18p11.31
    LINC00669 36786.888     18q12.2-q12.3
    LINC00683 74331.734     18q23
    LINC00907 39766.633     18q12.3
    LINC00908 74240.612     18q23
    LINC00909 72260.162     18q22.3
    LINC01029 75683.253     18q23
    LINC01254 10405.130     18p11.22
    LINC01255 11490.047     18p11.21
    LINC01415 53443.958     18q21.2
    LINC01416 53548.919     -
    LINC01443 14946.266     18p11.21
    LINC01444 14969.606     18p11.21
    LINC01477 37646.250     18q12.3
    LINC01478 41903.400     18q12.3
    LINC01538 61880.318     18q22.1
    LINC01539 53750.587     18q21.2
    LINC01541 69187.200     -
    LINC01543 24002.959     18p11.21
    LINC01544 59415.409     -
    LINC01601 42111.744     -
    LINC-ROR 54721.804     18q21.31
    LIPG 47088.401     18q21.1
    LMAN1 56995.056     18q21.3-q22
    LOC100127909 45659.988     18q21.1
    LOC100127994 77256.058     18q23
    LOC100128219 7943.241     18p11.23
    LOC100129089 74714.805     18q23
    LOC100129408 55324.560     18q21.31
    LOC100130453 77514.711     18q23
    LOC100130468 10476.540     18p11.22
    LOC100131655 74506.688     -
    LOC100192426 8360.818     18p11.23
    LOC100286986 5629.868     18p11.31
    LOC100287225 48918.412     18q21.2
    LOC100289533 21977.240     18q11.2
    LOC100505549 55297.534     -
    LOC100505817 70992.176     -
    LOC100505853 73408.034     -
    LOC100996324 12739.485     18p11.21
    LOC100996333 12073.231     -
    LOC101060542 68047.376     18q22.2
    LOC101926997 2517.268     -
    LOC101927044 3190.395     -
    LOC101927188 6954.676     -
    LOC101927229 52773.135     -
    LOC101927322 56337.241     -
    LOC101927410 10661.930     18p11.22
    LOC101927430 65475.744     -
    LOC101927481 68002.675     18q22.2
    LOC101927571 20303.454     18q11.2
    LOC101927606 72076.683     -
    LOC101927651 74334.738     18q23
    LOC101927809 33759.965     -
    LOC101927943 42256.896     -
    LOC101928144 47025.760     -
    LOC101928167 51105.993     18q21.2
    LOC102723376 12.075     10p15
    LOC102724651 51094.817     18q21.2
    LOC102724913 69399.852     18q22.3
    LOC104968399 3255.435     18p11.31
    LOC105371967 3653.410     -
    LOC105371998 12443.295     -
    LOC105372069 34481.908     -
    LOC105372129 52961.195     -
    LOC284219 8765.374     18p11.22
    LOC284240 77338.063     18q23
    LOC284241 77398.928     18q23
    LOC284242 29522.538     18q12.1
    LOC284244 31329.600     18q12.1
    LOC284263 43063.310     18q21.1
    LOC284294 61771.325     18q22.1
    LOC339298 73834.953     18q23
    LOC388456 926.084     18p11.32
    LOC400655 70821.293     18q22.3
    LOC400661 74401.986     18q23
    LOC400662 75897.217     18q23
    LOC642484 53670.844     18q21.2
    LOC643542 65183.783     18q22.1
    LOC644669 15313.555     18p11.21
    LOC646778 29265.618     18q12.1
    LOC647983 14990.706     18p11.21
    LOC727896 2943.213     18p11.31
    LOC729950 22208.146     18q11.2
    LOC732210 14856.968     18p11.21
    LOXHD1 44056.935     18q21.1
    LPIN2 2916.992     18p11.31
    LRRC30 7231.137     18p11.23
    LRRC37A7P 29304.161     -
    MAPRE2 32556.892     18q12.1
    MBD1 47795.216     18q21
    MBP 74690.789     18q23
    MC2R 13882.043     18p11.2
    MC4R 58038.564     18q22
    MC5R 13825.543     18p11.2
    ME2 48405.432     18q21
    MEP1B 29769.987     18q12.2-q12.3
    METTL4 2537.524     18p11.32
    MEX3C 48700.920     18q21.2
    MIB1 19321.290     18q11.2
    MIR1-2 19408.965     18q11.2
    MIR133A1 19405.659     18q11.2
    MIR133A1HG 19405.440     18q11.2
    MIR1539 47013.743     -
    MIR187 33484.781     18q12.2
    MIR302F 27878.876     18q12.1
    MIR3156-2 14830.165     -
    MIR320C1 19263.471     -
    MIR320C2 21901.650     18q11.2
    MIR3591 56118.312     -
    MIR3929 33514.051     -
    MIR3975 33171.701     -
    MIR3976 5840.694     -
    MIR3976HG 5748.818     18p11.31
    MIR4317 6374.360     -
    MIR4318 35237.098     -
    MIR4319 42550.047     -
    MIR4320 47652.869     -
    MIR4526 13611.113     -
    MIR4527 44906.867     -
    MIR4528 50763.471     -
    MIR4529 53146.452     -
    MIR4741 20513.312     -
    MIR4743 46196.971     -
    MIR4744 46576.057     -
    MIR5011 64748.821     -
    MIR5190 13459.946     -
    MIR5583-1 37256.685     -
    MIR5583-2 37256.683     -
    MIR6718 3885.353     -
    MIR6788 10759.582     -
    MIR7153 11654.884     -
    MIR8057 24171.431     -
    MIR8078 112.256     -
    MIR924 37202.087     18q12.3
    MOCOS 33767.480     18q12
    MPPE1 11883.472     18p11.21
    MRO 48321.490     18q21
    MTCL1 8717.369     18p11.22
    MYL12A 3247.528     18p11.31
    MYL12B 3262.611     18p11.31
    MYO5B 47349.156     18q21
    MYOM1 3066.805     18p11.31
    NAPG 10525.873     18p11.22
    NARS 55267.894     18q21.31
    NDC80 2571.510     18p11.32
    NDUFV2 9102.628     18p11.22
    NDUFV2-AS1 9121.263     18p11.22
    NEDD4L 55714.458     18q21.31
    NETO1 70409.549     18q22.2
    NFATC1 77155.772     18q23
    NOL4 31431.064     18q12
    NPC1 21111.463     18q11.2
    OACYLP 56702.911     18q21.32
    ONECUT2 55102.917     18q21.31
    ORF1 77275.798     18q23
    OSBPL1A 21742.011     18q11.1
    PARD6G 77915.117     18q23
    PARD6G-AS1 77905.932     18q23
    PCAT18 24267.585     18q11.2
    PIAS2 44390.023     18q21.1
    PIEZO2 10670.244     18p11.22
    PIGN 59711.458     18q21.33
    PIK3C3 39535.163     18q12.3
    PMAIP1 57567.192     18q21.32
    POLI 51795.849     18q21.1
    POTEC 14511.737     18p11.21
    PPP4R1 9546.789     18p11.22
    PPP4R1-AS1 9614.805     18p11.22
    PQLC1 77662.420     18q23
    PSMA8 23713.816     18q11.2
    PSMG2 12702.987     18p11.21
    PSTPIP2 43563.502     18q12|tdb7990
    PTPN2 12785.477     18p11.3-p11.2
    PTPRM 7567.314     18p11.2
    RAB12 8609.443     18p11.22
    RAB27B 52495.708     18q21.2
    RAB31 9708.228     18p11.3
    RALBP1 9475.530     18p11.3
    RAX 56934.267     18q21.32
    RBFA 77794.346     18q23
    RBFADN 77827.256     -
    RIOK3 21032.787     18q11.2
    RIT2 40323.183     18q12.3
    RNF125 29598.445     18q12.1
    RNF138 29672.569     18q12.1
    RNF152 59482.304     18q21.33
    RNF165 43914.187     18q21.1
    RNMT 13726.659     18p11.21
    RNU5B-1 22458.092     15q22.31
    ROCK1 18529.703     18q11.1
    ROCK1P1 109.065     18p11.32
    RPL17 47014.851     18q21
    RPL17-C18orf32 47007.548     18q
    RPRD1A 33569.787     18q12.2
    RTTN 67671.043     18q22.2
    SALL3 76740.275     18q23
    SCARNA17 47340.393     18q21.1
    SEC11C 56807.089     18q21.32
    SEH1L 12947.983     18p11.21
    SERPINB10 61582.745     18q21.3
    SERPINB11 61370.193     18q21.33
    SERPINB12 61223.393     18q21.33
    SERPINB13 61254.534     18q21.33
    SERPINB2 61554.939     18q21.3
    SERPINB4 61304.493     18q21.3
    SERPINB7 61420.281     18q21.33
    SERPINB8 61637.263     18q22.1
    SIGLEC15 43405.545     18q12.3
    SKA1 47901.392     18q21.1
    SKOR2 44757.494     18q21.1
    SLC14A1 43304.092     18q11-q12
    SLC14A2 42792.947     18q12.1-q21.1
    SLC14A2-AS1 43018.149     18q12.3
    SLC25A52 29339.659     18q12.1
    SLC35G4 11609.557     18p11.21
    SLMO1 12407.895     18p11.21
    SMAD7 46446.223     18q21.1
    SMCHD1 2655.886     18p11.32
    SMIM21 73121.431     18q23
    SNHG22 47340.393     18q21.1
    SNORA37 51748.654     18q21.2
    SNORD58A 47017.653     18q21
    SNORD58B 47018.034     18q21
    SNORD58C 47015.605     18q21.1
    SNRPD1 19192.230     18q11.2
    SPIRE1 12446.511     18p11.21
    ST8SIA3 55019.721     18q21.31
    ST8SIA5 44259.081     18q21.1
    STARD6 51851.062     18q21.2
    SYT4 40847.857     18q12.3
    TAF4B 23806.847     18q11.2
    TCEB3B 44558.943     18q21.1
    TCEB3C 44548.658     18q21.1
    TCEB3CL 44542.731     18q21.1
    TCEB3CL2 44542.731     18q21.1
    TCF4 52889.562     18q21.1
    TGIF1 3449.411     18p11.3
    THOC1 214.520     18p11.32
    TIMM21 71815.746     18q22.3
    TMEM200C 5890.184     18p11.31
    TMEM241 20875.979     18q11.2
    TMX3 66340.925     18q22
    TNFRSF11A 59992.520     18q22.1
    TPGS2 34374.069     18q12.2
    TRAPPC8 29409.136     18q12.1
    TSHZ1 72923.484     18q22.3
    TTC39C 21594.384     18q11.2
    TTC39C-AS1 21574.179     18q11.2
    TTR 29171.730     18q12.1
    TUBB6 12307.668     18p11.21
    TWSG1 9334.765     18p11.3
    TXNDC2 9885.723     -
    TXNL1 54270.053     18q21.31
    TXNL4A 77732.867     18q23
    TYMS 657.604     18p11.32
    TYMSOS 649.620     18p11.32
    USP14 158.483     18p11.32
    VAPA 9913.955     18p11.22
    VPS4B 61056.425     18q21.33
    WBP11P1 30091.626     18q12.1
    WDR7 54318.616     18q21.31
    YES1 721.592     18p11.31-p11.21
    ZADH2 72907.065     18q22.3
    ZBTB14 5289.018     18p11.31
    ZBTB7C 45553.639     18q21.1
    ZCCHC2 60190.658     18q21.33
    ZNF236 74534.563     18q22-q23
    ZNF24 32918.847     18q12
    ZNF271P 32870.300     18q12
    ZNF396 32946.661     18q12
    ZNF397 32820.994     18q12.2
    ZNF407 72342.919     18q23
    ZNF516 74069.637     18q23
    ZNF519 14099.942     18p11.21
    ZNF521 22641.888     18q11.2
    ZNF532 56530.061     18q21.32
    ZSCAN30 32831.022     18q12.2

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedJul 2015Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_18.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2015 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_18.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Fri Jul 24 14:51:37 CEST 2015


    Home   Genes   Leukemias   Solid Tumours   Cancer-Prone   Deep Insight   Case reports   Journals   Portal   Teaching   

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA