Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 19

chr19:1-59128983 (59128.983 Kb)

Chromosome 19 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 19 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

19 19p 19q 19p13 19p12 19p11 19p10 19q10 19q11 19q12 19q13

Leukaemia     

+19 or trisomy 19
inv(19)(p13q13)
t(1;19)(p13;p13)
t(1;19)(q23;p13) TCF3/PBX1
t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK
t(2;19)(p12;q13) IGK/BCL3
t(2;19)(p11;p13)
t(3;19)(q27;q13) NAPA/BCL6
t(7;19)(q34;p13) TRB/LYL1
t(8;19)(p11;q13) KAT6A/?
t(8;19)(p11;q13) ERVK-6/FGFR1
t(11;19)(q13;p13) FSTL3/CCND1
t(11;19)(q23;p13.1) KMT2A/ELL
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/MLLT1
t(11;19)(q23;p13) KMT2A/SH3GL1
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/ACER1
t(12;19)(p13;p13) TCF3/ZNF384
t(12;19)(q13;q13)
t(13;19)(q14;p13) TCF3/?
t(14;19)(q32;q13) IGH/BCL3
t(14;19)(q32;q13) IGH/CEBPA
t(17;19)(q22;p13) TCF3/HLF
t(19;19)(p13;q13) TCF3/TFPT
t(19;21)(q13.4;q22) RUNX1 truncated
t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL

Solid Tumors     

del(19q)
del(19)(p13p13) DNM2/KCNN1
del(19)(q13q13) PPP1R37/KLC3
inv(19)(p13p13) GIPC1/PKN1
t(1;19)(p36;q13) UBE4B/TBCB
t(1;19)(q10;q10)
t(1;19)(q23;p13) TCF3/PBX1
t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK
t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK
t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK
t(2;19)(q11;q13) XRCC1/MAL
t(3;19)(q27;q13) ACTN4/IGF2BP2
t(4;19)(q35;q13) CIC/DUX4
t(4;19)(q35;q13) CIC/DUX4
t(7;19)(q22;q13)SERPINE1/FOSB
t(9;19)(p13;p13) FAM219A/S1PR5
t(10;19)(q22;q13) FTL/SFTPA2
t(11;19)(p15;p13) H19/CALR
t(11;19)(q11;q13) MALAT1
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2
t(14;19)(q13;q13) AXL/MBIP
t(15;19)(q14;p13) BRD4/NUTM1
t(17;19)(q21;q13) KLK2/ETV4
t(19;19)(p13;p13) C19ORF25/APC2
t(19;19)(p13;p13) MIER2/NMRK2
t(19;19)(p13;p13) OAZ1/SF3A2
t(19;19)(p13;p13) DNM2/ILF3
t(19;19)(p13;p13) NFIX/GATAD2A
t(19;19)(p13;p12) UNC13A/ZNF492
t(19;19)(p13;q13) STRN4/TECR
t(19;19)(q13;q13) ZNF649/ZNF577
t(19;19)(q13;q13) LSM14A/SIPA1L3
t(19;19)(q13;q13) RHPN2/ANKRD27
t(19;19)(q13;q13) BCL3/HIPK4
t(19;19)(q13;q13) SIPA1L3/CD22
t(19;21)(p13;q22) ITSN1/ZNF490
t(19;22)(p12;q11) MMP11/ZNF714
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444

Cancer prone diseases     

Congenital neutropenia
Diamond-Blackfan anemia (DBA)
Peutz-Jeghers syndrome

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 19 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 19 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 19 - GoldenPath - UCSC
  • Chromosome 19 - Ensembl Project
  • Chromosome 19 - Map View - NCBI
  • Chromosome 19 - Genome Home Reference
  • Chromosome 19 - DECIPHER
  • Chromosome 19 - OMIM Gene map
  • Chromosome 19 - Genomic Variants
  • Chromosome 19 - HAPMAP Project
  • Chromosome 19 - 1000 Genomes
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 19 Cancer GeneWeb

  • Chromosome 19 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 19 - Human UniProtKB

    FISH probes

  • Chromosome 19 - FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Chromosome 19 - Empire Genomics FISH clones [ chromosome ]  [ genes ]
  • Chromosome 19 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 19 - Cytogenetic marker FISH (Abbott)
  • FISH Probes DAKO (Agilent)
  • SureFISH Probes (Agilent)
  • CytoCell  [ haematology ]  [ pathology ]
  • Kreatech Diagnostic
  • Metasystems

    • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ACTN4 39138.267     19q13
    ADGRE5 14491.956     19p13.12
    AKT1S1 50372.290     19q13.33
    AKT2 40736.224     19q13.1-q13.2
    ATF5 50432.400     19q13.33
    AXL 41732.660     19q13.1
    BAX 49458.117     19q13.3-q13.4
    BBC3 47724.079     19q13.32
    BCL2L12 50168.399     19q13.3
    BRD4 15357.847     19p13.12
    CADM4 44126.522     19q13.32
    CARD8 48711.343     19q13.33
    CBLC 45281.126     19q13.2
    CEACAM1 43011.458     19q13.2
    CEACAM5 42212.504     19q13.1-q13.2
    CEBPA 33790.840     19q13.1
    CIC 42772.689     19q13.2
    CRTC1 18794.425     19p13
    CXCL17 42932.690     19q13.2
    CYP2A6 41349.443     19q13.2
    DNMT1 10244.020     19p13.2
    DYRK1B 40315.987     19q13.2
    ELAVL1 8023.457     19p13.2
    ELL 18553.473     19p13.1
    EMP3 48829.256     19q13.3
    ERCC1 45910.591     19q13.32
    ERCC2 45854.649     19q13.3
    FCER2 7753.643     19p13.3
    FKBP8 18642.562     19p12
    FPR1 52249.023     19q13.41
    FSTL3 676.389     19p13
    FXYD3 35606.732     19q13.12
    FXYD5 35645.845     19q13.12
    GADD45GIP1 13064.970     19p13.2
    GDF15 18496.968     19p13.11
    GLTSCR2 48248.793     19q13.3
    GNA11 3094.408     19p13.3
    ICAM1 10381.517     19p13.2
    JAK3 17935.593     19p13-p12
    JUNB 12902.310     19p13.13
    JUND 18390.504     19p13.2
    KLK10 51516.000     19q13
    KLK11 51525.487     19q13.33
    KLK4 51409.608     19q13.41
    KLK5 51446.559     19q13.33
    KLK7 51479.735     19q13.33
    KLK8 51499.264     19q13
    LPAR2 19734.466     19p12
    LYL1 13209.842     19p13.13
    LYPD3 43964.946     19q13.31
    MARK4 45754.516     19q13.32
    MIR125A 52196.507     19q13.41
    MIR23A 13947.401     19p13.13
    MIR27A 13947.254     19p13.13
    MIR373 54291.959     19q13.42
    MLLT1 6210.392     19p13.3
    MUC16 8959.520     19p13.2
    NACC1 13229.102     19p13.13
    NAPA 47990.891     19q13.33
    NDUFA13 19627.019     19p13.11
    NOTCH3 15270.444     19p13.12
    PAF1 39876.270     19q13.1
    PCSK4 1481.427     19p13.3
    PDCD5 33072.094     19q13.11
    PEG3 57321.445     19q13.4
    PLAUR 44150.247     19q13
    PPP1R13L 45882.892     19q13.32
    PPP2R1A 52693.055     19q13
    PTBP1 797.392     19p13.3
    RELB 45504.707     19q13.32
    RUVBL2 49497.156     19q13.33
    SCAF1 50145.382     19q13.3-q13.4
    SH3GL1 4360.364     19p13.3
    SLC1A5 47278.140     19q13.32
    SLC5A5 17982.782     19p13.11
    SMARCA4 11071.598     19p13.3
    STK11 1205.798     19p13.3
    TCF3 1609.289     19p13.3
    TFPT 54610.320     19q13
    TGFB1 41836.436     19q13.1
    TPM4 16178.317     19p13.1
    VAV1 6772.679     19p13.3
    ZBTB7A 4043.302     19p13.3
    ZNF146 36705.504     19q13.1

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    1060P11.3 55266.474     -
    A1BG 58858.172     19q13.43
    A1BG-AS1 58863.336     19q13.4
    ABCA7 1040.102     19p13.3
    ABHD17A 1876.975     19p13.3
    ABHD17AP6 1876.978     17p11.2
    ABHD8 17402.940     19p13.11
    ACER1 6306.510     19p13.3
    ACP5 11685.475     19p13.2
    ACP7 39574.945     19q13.2
    ACPT 51293.672     19q13.33
    ACSBG2 6135.644     19p13.3
    ACTL9 8807.747     19p13.2
    ADAMTS10 8645.124     19p13.2
    ADAMTSL5 1505.017     19p13.3
    ADAT3 1905.371     19p13.3
    ADCK4 41197.434     19q13.2
    ADGRE1 6887.560     19p13.3
    ADGRE2 14843.509     19p13.12
    ADGRE3 14729.929     19p13.12
    ADGRE4P 6952.511     19p13.3
    ADGRL1 14258.549     19p13.2
    ADM5 50191.942     19q13.33
    AES 3052.908     19p13.3
    AKAP8 15464.332     19p13.12
    AKAP8L 15490.859     19p13.12
    ALDH16A1 49956.473     19q13.33
    ALKBH6 36500.018     19q13.12
    ALKBH7 6372.444     19p13.3
    AMH 2249.113     19p13.3
    ANGPTL4 8429.011     19p13.3
    ANGPTL6 10203.013     19p13.2
    ANGPTL8 11350.295     19p13.2
    ANKLE1 17392.454     19p13.11
    ANKRD24 4183.351     19p13.3
    ANKRD27 33087.907     19q13.12
    ANO8 17434.032     19p13.11
    AP1M1 16308.665     19p13.12
    AP1M2 10683.347     19p13.2
    AP2A1 50270.180     19q13.33
    AP2S1 47341.415     19q13.32
    AP3D1 2100.987     19p13.3
    APBA3 3750.771     19p13.3
    APC2 1450.148     19p13.3
    APLP1 36359.401     19q13.12
    APOC1 45417.921     19q13.2
    APOC1P1 45430.060     19q13.2
    APOC2 45449.239     19q13.2
    APOC4 45445.495     19q13.2
    APOC4-APOC2 45445.495     19q
    APOE 45409.006     19q13.31
    ARHGAP33 36266.417     19q13.12
    ARHGAP35 47421.933     19q13.32
    ARHGAP45 1065.922     19p13.3
    ARHGEF1 42387.267     19q13.13
    ARHGEF18 7504.574     19p13.3
    ARID3A 926.037     19p13.3
    ARMC6 19144.387     19p13.11
    ARRDC2 18111.941     19p13.11
    ARRDC5 4890.449     19p13.3
    ASF1B 14230.321     19p13.12
    ASNA1 12848.306     19p13.13
    ASPDH 51014.857     19q13.33
    ATCAY 3880.618     19p13.3
    ATG4D 10654.570     19p13.2
    ATP13A1 19756.010     19p13.11
    ATP1A3 42470.734     19q13.2
    ATP4A 36041.095     19q13.1
    ATP5D 1241.749     19p13.3
    ATP5SL 41937.223     19q13.2
    ATP8B3 1782.074     19p13.3
    AURKC 57742.428     19q13.43
    AZU1 827.826     19p13.3
    B3GNT3 17905.919     19p13.1
    B3GNT8 41931.264     19q13
    B9D2 41860.322     19q13.2
    BABAM1 17378.185     19p13.11
    BCAM 45312.316     19q13.32
    BCAT2 49298.319     19q13
    BCKDHA 41903.694     19q13.1-q13.2
    BCL3 45251.978     19q13.32
    BEST2 12863.407     19p13.2
    BIRC8 53792.854     19q13.42
    BISPR 17516.495     -
    BLOC1S3 45682.003     19q13.32
    BLVRB 40953.691     19q13.1-q13.2
    BORCS8 19292.685     19p13.11
    BORCS8-MEF2B 19256.376     19p13.11
    BRSK1 55795.534     19q13.4
    BSG 572.454     19p13.3
    BSPH1 48471.303     19q13.33
    BST2 17513.748     19p13.2
    BTBD2 1985.447     19p13.3
    C19orf12 30189.793     19q12
    C19orf18 58469.805     19q13.43
    C19orf24 1275.520     19p13.3
    C19orf25 1473.200     19p13.3
    C19orf33 38794.801     19q13.2
    C19orf35 2274.631     19p13.3
    C19orf38 10959.106     19p13.2
    C19orf43 12841.454     19p13.2
    C19orf44 16607.122     19p13.11
    C19orf45 7562.445     19p13.2
    C19orf47 40826.967     19q13.2
    C19orf48 51300.950     19q13.33
    C19orf52 11039.424     19p13.2
    C19orf53 13885.257     19p13.2
    C19orf54 41246.761     19q13.2
    C19orf57 13993.168     19p13.12
    C19orf60 18699.495     19p13.11
    C19orf66 10196.795     19p13.2
    C19orf67 14192.444     19p13.12
    C19orf68 48673.949     19q13.33
    C19orf70 5678.425     19p13.3
    C19orf71 3539.155     19p13.3
    C19orf73 49621.654     19q13.33
    C19orf81 51152.702     19q13.33
    C19orf84 51891.543     19q13.41
    C2CD4C 405.443     19p13.3
    C3 6677.846     19p13.3-p13.2
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    ZSWIM4 13906.274     19p13.13

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedSep 2016Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_19.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Sep 2016 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_19.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Fri Sep 30 19:29:48 CEST 2016

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