Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 19

chr19:1-58617616 (58617.616 Kb)

Chromosome 19 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 19 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

19 19p 19q 19p13 19p12 19p11 19q11 19q12 19q13

Leukaemia     

+19 or trisomy 19
inv(19)(p13q13) TCF3/TFPT
t(1;19)(p13;p13.1)
t(1;19)(q23;p13) TCF3/PBX1
t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK
t(2;19)(p12;q13.3) IGK/BCL3
t(2;19)(p11;p13)
t(3;19)(q27;q13) NAPA/BCL6
t(7;19)(q34;p13) TRB/LYL1
t(8;19)(p11;q13) KAT6A/?
t(8;19)(p11;q13) ERVK-6/FGFR1
t(11;19)(q13;p13) FSTL3/CCND1
t(11;19)(q23;p13.1) KMT2A/ELL
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/MLLT1
t(11;19)(q23;p13) KMT2A/SH3GL1
t(11;19)(q23;p13.3) KMT2A/ACER1
t(12;19)(p13;p13) TCF3/ZNF384
t(12;19)(q13;q13)
t(13;19)(q14;p13) TCF3/?
t(14;19)(q32;p13) IGH/BRD4 ?
t(14;19)(q32;p13) IGH/EPOR
t(14;19)(q32;q13.3) IGH/BCL3
t(14;19)(q32;q13) IGH/CEBPA
t(17;19)(q22;p13) TCF3/HLF
t(19;19)(p13;q13) TCF3/TFPT
t(19;21)(q13.4;q22) RUNX1 truncated
t(19;22)(q13.3;q11) BCL3/IGL

Solid Tumors     

Fallopian tube tumors: an overview
Pancreatic tumors: an overview
Penile tumors: an overview
Head and Neck: Thymus: Thymoma: an overview
del(19q) (Nervous System)
t(1;19)(q10;q10) (Nervous System)
t(1;19)(p36;q13) UBE4B/TBCB (Lung)
t(1;19)(q23;p13) TCF3/PBX1 (Lung)
t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK (Soft Tissues)
t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK (Soft tissue tumors)
t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK (Soft Tissues)
t(2;19)(q11;q13) XRCC1/MAL (Lung)
t(3;19)(q25;q13) WWTR1/FOSB (Bone)
t(3;19)(q27;q13) ACTN4/IGF2BP2 (Lung)
t(4;19)(q35;q13) CIC/DUX4 (Soft tissue tumors)
t(4;19)(q35;q13) CIC/DUX4 (Soft Tissues)
t(7;19)(q22;q13) SERPINE1/FOSB (Pseudomyogenic hemangioendothelioma)
t(9;19)(p13;p13) FAM219A/S1PR5 (Lung)
t(10;19)(q22;q13) FTL/SFTPA2 (Lung)
t(11;19)(p15;p13) H19/CALR (Lung)
t(11;19)(q11;q13) MALAT1 (Liver)
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2 (Skin)
t(11;19)(q21;p13) CRTC1/MAML2 (Head and Neck)
t(14;19)(q13;q13) AXL/MBIP (Lung)
t(15;19)(q14;p13) BRD4/NUTM1 (Midline Carcinoma)
t(17;19)(q21;q13) KLK2/ETV4 (Prostate tumors)
t(19;19)(p13;p13) C19ORF25/APC2 (Prostate tumors)
t(19;19)(p13;p13) MIER2/NMRK2 (Lung)
t(19;19)(p13;p13) OAZ1/SF3A2 (Lung)
t(19;19)(p13;p13) DNM2/ILF3 (Lung)
t(19;19)(p13;p13) NFIX/GATAD2A (Lung)
t(19;19)(p13;p12) UNC13A/ZNF492 (Lung)
t(19;19)(p13;q13) STRN4/TECR (Prostate tumors)
t(19;19)(q13;q13) ZNF649/ZNF577 (Prostate tumors)
t(19;19)(q13;q13) LSM14A/SIPA1L3 (Lung)
t(19;19)(q13;q13) RHPN2/ANKRD27 (Lung)
t(19;19)(q13;q13) BCL3/HIPK4 (Lung)
t(19;19)(q13;q13) SIPA1L3/CD22 (Lung)
t(19;19)(q13;q13) ZFP36/FOSB (Bone)
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444 (Soft Tissues)

Cancer prone diseases     

Congenital neutropenia
Diamond-Blackfan anemia (DBA)
Peutz-Jeghers syndrome

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 19 by location

External links     

  • Chromosome 19 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 19 - GoldenPath - UCSC
  • Chromosome 19 - Ensembl Project
  • Chromosome 19 - Map View - NCBI
  • Chromosome 19 - Genomics Home Reference
  • Chromosome 19 - DECIPHER
  • Chromosome 19 - OMIM Gene map
  • Chromosome 19 - Genomic Variants
  • Chromosome 19 - HAPMAP Project
  • Chromosome 19 - 1000 Genomes
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 19 Cancer GeneWeb

  • Chromosome 19 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 19 - Human UniProtKB

    FISH probes

  • Chromosome 19 - FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Chromosome 19 - Empire Genomics FISH clones [ chromosome ]  [ genes ]
  • Chromosome 19 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 19 - Vysis FISHCytogenetic marker (Abbott)
  • FISH Probes DAKO (Agilent)
  • SureFISH Probes (Agilent)
  • CytoCell  [ haematology ]  [ pathology ]
  • Kreatech Diagnostic
  • Metasystems

    • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ACTN4 38647.616     19q13.2
    ADGRE5 14381.144     19p13.12
    AKT1S1 49869.033     19q13.33
    AKT2 40230.317     19q13.2
    ATF5 49929.143     19q13.33
    AXL 41226.755     19q13.2
    BAX 48954.860     19q13.33
    BBC3 47220.822     19q13.32
    BCL2L12 49665.142     19q13.33
    BRD4 15252.995     19p13.12
    CADM4 43622.370     19q13.31
    CARD8 48208.086     19q13.33
    CBLC 44777.869     19q13.32
    CEACAM1 42507.306     19q13.2
    CEACAM5 41708.585     19q13.2
    CEBPA 33299.934     19q13.11
    CIC 42268.537     19q13.2
    CRTC1 18683.615     19p13.11
    CXCL17 42428.538     19q13.2
    CYP2A6 40843.538     19q13.2
    DNMT1 10133.344     19p13.2
    DYRK1B 39825.347     19q13.2
    ELAVL1 7958.573     19p13.2
    ELL 18442.663     19p13.11
    EMP3 48325.999     19q13.33
    ERCC1 45407.333     19q13.32
    ERCC2 45351.391     19q13.32
    FCER2 7688.757     19p13.2
    FKBP8 18531.752     19p13.11
    FPR1 51745.770     19q13.41
    FSTL3 676.389     19p13.3
    FXYD3 35115.828     19q13.12
    FXYD5 35154.942     19q13.12
    GADD45GIP1 12954.156     19p13.13
    GDF15 18385.960     19p13.11
    GNA11 3094.410     19p13.3
    ICAM1 10270.841     19p13.2
    JAK3 17824.784     19p13.11
    JUNB 12791.496     19p13.13
    JUND 18279.694     19p13.11
    KLK10 51012.744     19q13.41
    KLK11 51022.231     19q13.41
    KLK12 51029.092     19q13.41
    KLK13 51055.626     19q13.41
    KLK14 51077.495     19q13.41
    KLK4 50906.352     19q13.41
    KLK5 50943.303     19q13.41
    KLK7 50976.479     19q13.41
    KLK8 50996.008     19q13.41
    KLK9 51002.513     19q13.41
    LPAR2 19623.656     19p13.11
    LYL1 13099.028     19p13.13
    LYPD3 43460.794     19q13.31
    MARK4 45251.258     19q13.32
    MIR125A 51693.254     19q13.41
    MIR150 49500.785     19q13.33
    MIR23A 13836.587     19p13.12
    MIR27A 13836.440     19p13.12
    MIR373 53788.705     19q13.42
    MLLT1 6210.381     19p13.3
    MUC16 8848.844     19p13.2
    NACC1 13118.288     19p13.13
    NAPA 47487.634     19q13.32-q13.33
    NDUFA13 19516.210     19p13.11
    NOP53 47745.536     19q13.33
    NOTCH3 15159.633     19p13.12
    PAF1 39385.630     19q13.2
    PCSK4 1481.428     19p13.3
    PDCD5 32581.188     19q13.11
    PEG3 56810.077     19q13.43
    PLAUR 43646.095     19q13.31
    PPP1R13L 45379.634     19q13.32
    PPP2R1A 52189.802     19q13.41
    PTBP1 797.392     19p13.3
    RELB 45001.449     19q13.32
    RUVBL2 48993.448     19q13.33
    SCAF1 49642.125     19q13.33
    SH3GL1 4360.367     19p13.3
    SLC1A5 46774.883     19q13.32
    SLC5A5 17871.973     19p13.11
    SMARCA4 10960.922     19p13.2
    STK11 1205.799     19p13.3
    TCF3 1609.290     19p13.3
    TFPT 54107.013     19q13.42
    TGFB1 41330.323     19q13.2
    TPM4 16067.507     19p13.12-p13.11
    VAV1 6772.668     19p13.3
    ZBTB7A 4043.304     19p13.3
    ZNF146 36214.602     19q13.12

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    A1BG 58346.806     19q13.43
    A1BG-AS1 58351.970     19q13.43
    ABCA7 1040.103     19p13.3
    ABHD17A 1876.976     19p13.3
    ABHD8 17292.131     19p13.11
    ACER1 6306.499     19p13.3
    ACP5 11574.660     19p13.2
    ACP7 39084.305     19q13.2
    ACPT 50790.415     19q13.33
    ACSBG2 6135.633     19p13.3
    ACTL9 8697.397     19p13.2
    ADAMTS10 8580.240     19p13.2
    ADAMTSL5 1505.018     19p13.3
    ADAT3 1905.214     19p13.3
    ADGRE1 6887.549     19p13.3-p13.2
    ADGRE2 14732.697     19p13.12
    ADGRE3 14619.117     19p13.12
    ADGRE4P 6952.500     19p13.2
    ADGRL1 14147.737     19p13.12
    ADM5 49688.685     19q13.33
    AES 3052.910     19p13.3
    AKAP8 15353.521     19p13.12
    AKAP8L 15380.048     19p13.12
    ALDH16A1 49453.216     19q13.33
    ALKBH6 36009.116     19q13.12
    ALKBH7 6372.433     19p13.3
    AMH 2249.279     19p13.3
    ANGPTL4 8364.127     19p13.2
    ANGPTL6 10092.339     19p13.2
    ANGPTL8 11239.619     19p13.2
    ANKLE1 17281.645     19p13.11
    ANKRD24 4183.354     19p13.3
    ANKRD27 32597.001     19q13.11
    ANO8 17323.223     19p13.11
    AP1M1 16197.854     19p13.11
    AP1M2 10572.671     19p13.2
    AP2A1 49766.923     19q13.33
    AP2S1 46838.158     19q13.32
    AP3D1 2100.988     19p13.3
    APBA3 3750.773     19p13.3
    APC2 1450.149     19p13.3
    APLP1 35868.445     19q13.12
    APOC1 44914.247     19q13.32
    APOC1P1 44926.803     19q13.32
    APOC2 44945.982     19q13.32
    APOC4 44942.238     19q13.32
    APOC4-APOC2 44942.238     19q13.32
    APOE 44905.749     19q13.32
    ARHGAP33 35775.515     19q13.12
    ARHGAP35 46918.676     19q13.32
    ARHGAP45 1065.923     19p13.3
    ARHGEF1 41883.200     19q13.2
    ARHGEF18 7439.688     19p13.2
    ARID3A 926.037     19p13.3
    ARMC6 19033.578     19p13.11
    ARRDC2 18001.132     19p13.11
    ARRDC5 4890.437     19p13.3
    ASF1B 14119.509     19p13.12
    ASNA1 12737.459     19p13.13
    ASPDH 50511.600     19q13.33
    ATCAY 3880.620     19p13.3
    ATG4D 10543.894     19p13.2
    ATP13A1 19645.201     19p13.11
    ATP1A3 41966.582     19q13.2
    ATP4A 35550.193     19q13.12
    ATP5D 1241.750     19p13.3
    ATP5SL 41431.318     19q13.2
    ATP8B3 1782.075     19p13.3
    AURKC 57231.060     19q13.43
    AZU1 827.826     19p13.3
    B3GNT3 17795.110     19p13.11
    B3GNT8 41425.359     19q13.2
    B9D2 41354.417     19q13.2
    BABAM1 17267.376     19p13.11
    BCAM 44809.059     19q13.32
    BCAT2 48795.062     19q13.33
    BCAT2 48795.062     19q13.33
    BCKDHA 41397.789     19q13.2
    BCL3 44748.721     19q13.32
    BEST2 12752.593     19p13.13
    BHMG1 45733.251     19q13.32
    BICRA 47608.196     19q13.33
    BIRC8 53289.601     19q13.42
    BISPR 17405.686     19p13.11
    BLOC1S3 45178.745     19q13.32
    BLVRB 40447.784     19q13.2
    BORCS8 19181.876     19p13.11
    BORCS8-MEF2B 19145.567     19p13.11
    BRSK1 55284.166     19q13.42
    BSG 572.454     19p13.3
    BSPH1 47968.046     19q13.33
    BST2 17402.939     19p13.11
    BTBD2 1985.448     19p13.3
    C19orf12 29698.886     19q12
    C19orf18 57958.437     19q13.43
    C19orf24 1275.521     19p13.3
    C19orf25 1473.201     19p13.3
    C19orf33 38304.161     19q13.2
    C19orf35 2274.632     19p13.3
    C19orf38 10848.430     19p13.2
    C19orf43 12730.640     19p13.13
    C19orf44 16496.311     19p13.11
    C19orf47 40321.060     19q13.2
    C19orf48 50797.693     19q13.33
    C19orf53 13774.443     19p13.13
    C19orf54 40740.856     19q13.2
    C19orf57 13882.348     19p13.12
    C19orf60 18588.685     19p13.11
    C19orf66 10086.119     19p13.2
    C19orf67 14081.632     19p13.12
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    ZSWIM4 13795.460     19p13.13-p13.12

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Jean-Loup Huret
    UpdatedAug 2017Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_19.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Aug 2017 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_19.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Mon Aug 14 13:42:03 CEST 2017

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