Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 19

Chromosome 19 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 19 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

t(1;19)(p13;p13.1)
t(1;19)(q23;p13) TCF3/PBX1
t(2;19)(p11;p13)
t(2;19)(p23;p13) TPM4/ALK
t(2;19)(p12;q13) IGK/BCL3
t(3;19)(q27;q13) NAPA/BCL6
t(7;19)(q34;p13)
t(8;19)(p11;q13)
t(8;19)(p12;q13)
t(11;19)(q23;p13.1)
t(11;19)(q23;p13.3)
t(11;19)(q23;p13.3) MLL/ACER1
t(12;19)(p13;p13)
t(12;19)(q13;q13)
t(13;19)(q14;p13)
t(14;19)(q32;q13) IGH/BCL3
t(14;19)(q32;q13) IGH/CEBPA
t(17;19)(q22;p13)
inv(19)(p13q13) TCF3/TFPT
Trisomy 19
t(19;21)(q13.4;q22)
t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL

Solid Tumors     

t(2;19)(p23;p13)
t(2;19)(p23;p13.1)
t(2;19)(p23;p13.1)
t(4;19)(q35;q13)
t(11;19)(q21;p13)
t(11;19)(q11;q13.4)
t(11;19)(q21-22;p13)
t(15;19)(q14;p13)
t(17;17)(q24;q21)
del(1p)
t(19;22)(q13;q12)

Cancer prone diseases     

Congenital neutropenia
Diamond-Blackfan anemia (DBA)
Peutz-Jeghers syndrome

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 19 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 19 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 19 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 19 - Ensembl Project
  • Chromosome 19 - Map View - NCBI
  • Chromosome 19 - OMIM Gene map
  • Chromosome 19 - Genomic Variants
  • Chromosome 19 - HAPMAP Project
  • Chromosome 19 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 19 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 19 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 19 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 19 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 19 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 19 Cancer GeneWeb
  • Chromosome 19 GeneCards (Weizmann)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

    • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ACTN4 39138.267 19q13
    AKT2 40736.224 19q13.1-q13.2
    ATF5 50432.400 19q13.3
    AXL 41732.660 19q13.1
    BAX 49458.117 19q13.3-q13.4
    BBC3 47724.079 19q13.3-q13.4
    BCL2L12 50168.399 19q13.3
    BRD4 15357.847 19
    CARD8 48711.343 19q13.33
    CBLC 45281.126 19q13.2
    CD97 14491.956 19p13
    CEACAM1 43011.458 19q13.2
    CEBPA 33790.840 19q13.1
    CRTC1 18794.425 19p13
    CYP2A6 41349.443 19q13.2
    DNMT1 10244.022 19p13.2
    DYRK1B 40315.990 19q13.2
    ELAVL1 8023.457 19p13.2
    ELL 18553.473 19p13.1
    ERCC1 45910.591 19q13.32
    ERCC2 45854.649 19q13.3
    FCER2 7753.643 19p13.3
    FKBP8 18642.568 19p12
    FPR1 52249.023 19q13.41
    FSTL3 676.389 19p13
    FXYD3 35606.732 19q13.11-q13.12
    FXYD5 35645.845 19q13.12
    GADD45GIP1 13064.970 19p13.2
    GDF15 18496.968 19p13.11
    GLTSCR2 48248.793 19q13.3
    GNA11 3094.408 19p13.3
    ICAM1 10381.517 19p13.3-p13.2
    JAK3 17935.593 19p13-p12
    JUNB 12902.310 19p13.13
    JUND 18390.563 19p13.2
    KLK10 51516.000 19q13
    KLK11 51525.487 19q13.33
    KLK4 51409.608 19q13.3-q13.4
    KLK5 51446.559 19q13.33
    KLK7 51479.735 19q13.33
    KLK8 51499.264 19q13
    LPAR2 19734.466 19p12
    LYL1 13209.842 19p13.2
    LYPD3 43964.946 19q13.31
    MARK4 45754.516 19q13.2
    MIR125A 52196.507 19q13.41
    MIR23A 13947.401 19p13.13
    MIR27A 13947.254 19p13.13
    MIR373 54291.959 19q13.42
    MLLT1 6210.392 19p13.3
    MUC16 8959.520 19p13.2
    NACC1 13229.102 19p13.13
    NOTCH3 15270.444 19p13.2-p13.1
    PAF1 39876.270 19q13.1
    PEG3 57321.445 19q13.4
    PLAUR 44150.247 19q13
    PPP1R13L 45882.892 19q13.32
    PTBP1 797.392 19p13.3
    RELB 45504.707 19q13.32
    RUVBL2 49497.156 19q13.3
    SCAF1 50145.382 19q13.3-q13.4
    SH3GL1 4360.364 19p13.3
    SLC5A5 17982.782 19p13.11
    SMARCA4 11071.598 19p13.3
    STK11 1205.798 19p13.3
    TCF3 1609.289 19p13.3
    TFPT 54610.320 19q13
    TGFB1 41836.436 19q13.1
    TPM4 16178.317 19p13.1
    VAV1 6772.679 19p13.2
    ZBTB7A 4045.216 19p13.3
    ZNF146 36705.504 19q13.1
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    A1BG 58858.172 19q
    ACP5 11685.475 19p13.2
    ACPT 51293.672 19q13.33
    ADAMTS10 8645.124 19p13.3
    ADCK4 41197.434 19q13.2
    AES 3052.908 19p13.3
    AKAP8 15464.332 19p13.12
    AKT1S1 50372.290 19q13.33
    ALKBH6 36500.022 19q13.12
    ALKBH7 6372.444 19p13.3
    AMH 2249.113 19p13.3
    ANGPTL4 8429.011 19p13.3
    ANGPTL6 10203.013 19p13.2
    AP1M2 10683.347 19p13.2
    AP2A1 50270.180 19q13.3
    AP3D1 2100.987 19p13.3
    APC2 1450.148 19p13.3
    APLP1 36359.401 19q
    APOC1 45417.921 19q13.2
    APOE 45409.039 19q13.31
    ARHGAP35 47421.933 19q13.32
    ARHGEF1 42387.267 19q13.13
    ARHGEF18 7504.574 19p13.3
    ARID3A 926.037 19p13.3
    ASF1B 14230.321 19p13.12
    ASNA1 12848.306 19p13.13
    ATG4D 10654.570 19p13.2
    ATP1A3 42470.734 19q13.2
    ATP4A 36041.095 19q13.1
    ATP8B3 1782.074 19p13.3
    AURKC 57742.428 19q13.3-qter
    AZU1 827.831 19p13.3
    B3GNT8 41931.264 19q13
    BABAM1 17378.232 19p13.11
    BCAM 45312.316 19q12-q13
    BCL3 45251.978 19q13.1-q13.2
    BIRC8 53792.854 19q13.3-q13.4
    BRSK1 55795.534 19q13.4
    BSG 572.454 19p13.3
    BST2 17513.748 19p13.2
    BTBD2 1985.447 19p13.3-p12
    C19orf33 38794.804 19q13.2
    C19orf40 33463.148 19q13.11
    C19orf48 51300.961 19q13.33
    C19orf53 13885.257 19p13.2
    C19orf80 11350.295 19p13.2
    C3 6677.846 19p13.3-p13.2
    C5AR1 47813.104 19q13.3-q13.4
    C5AR2 47835.404 19q13.33
    CACTIN 3610.627 19p13.3
    CADM4 44126.522 19q13.32
    CALM3 47104.512 19q13.2-q13.3
    CALR 13049.414 19p13.3-p13.2
    CALR3 16589.868 19p13.11
    CAPNS1 36630.918 19q13.1
    CARM1 10982.253 19p13.2
    CASP14 15160.291 19p13.1
    CC2D1A 14016.956 19p13.12
    CCL25 8117.646 19p13.2
    CCNE1 30302.901 19q12
    CD209 7804.881 19p13
    CD22 35820.072 19q13.1
    CD33 51728.335 19q13.3
    CD37 49838.677 19q13.3
    CD3EAP 45909.467 19q13.3
    CD70 6585.850 19p13
    CD79A 42381.190 19q13.2
    CDC34 531.733 19p13.3
    CDC37 10501.809 19p13.2
    CDKN2D 10677.138 19p13
    CEACAM19 45174.724 19q13.31
    CEACAM3 42300.522 19q13.2
    CEACAM4 42125.344 19q13.2
    CEACAM5 42212.530 19q13.1-q13.2
    CEACAM6 42259.398 19q13.1-q13.2
    CEACAM7 42177.235 19q13.2
    CEACAM8 43084.395 19q13.2
    CEBPG 33865.430 19q13.2
    CERS1 18979.361 19p12
    CGB 49526.126 19q13.3
    CGB5 49547.102 19q13.32
    CHAF1A 4402.660 19p13.3
    CHMP2A 59062.933 19q13.43
    CIB3 16272.179 19p13.12
    CIC 42788.817 19q13.2
    CIRBP 1269.267 19p13.3
    CLC 40221.893 19q13.1
    CLEC11A 51226.605 19q13.3
    CLEC4G 7793.843 19p13.2
    CLPP 6361.463 19
    CLPTM1 45458.250 19q13.3
    CNN1 11649.579 19p13.2-p13.1
    CNOT3 54641.436 19q13.4
    COMP 18893.583 19p13.1
    COPE 19010.323 19p13.11
    COX6B1 36139.125 19q13.1
    COX6B2 55861.070 19q13.42
    COX7A1 36641.824 19q13.1
    CRX 48325.099 19q13.3
    CSNK1G2 1941.161 19p13.3
    CXCL17 42932.695 19q13.2
    CYP2A13 41594.356 19q13.2
    CYP2B6 41497.204 19q13.2
    CYP2F1 41620.353 19q13.1-q13.2
    CYP2S1 41699.115 19q13.1
    CYP4F3 15751.707 19p13.12
    CYP4F8 15726.029 19p13.1
    CYTH2 48972.465 19q13.32
    DACT3 47150.869 19q13.32
    DAND5 13080.432 19p13
    DAPK3 3958.452 19p13.3
    DAZAP1 1407.568 19p13.3
    DBP 49133.817 19
    DDA1 17420.337 19p13.11
    DDX39A 14519.610 19p13.12
    DDX49 19030.484 19p12
    DHDH 49436.939 19q13.3
    DHX34 47852.538 19q13.3
    DIRAS1 2714.565 19p13.3
    DLL3 39989.557 19q13.2
    DMKN 35988.119 19q13.12
    DMPK 46272.976 19q13.3
    DNAJB1 14625.582 19p13.2
    DNM2 10828.729 19p
    DOHH 3490.819 19p13.3
    DOT1L 2164.148 19p13.3
    DPP9 4675.244 19p13.3
    EBI3 4229.540 19p13
    EEF2 3976.054 19p13.3
    EFNA2 1286.153 19p13
    EGLN2 41305.334 19q13.2
    EHD2 48216.601 19q13.3
    EID2 40029.447 19q13.2
    EIF3K 39109.722 19q13.2
    ELANE 852.291 19p13.3
    EMP3 48828.629 19q13.3
    EMR2 14843.509 19p13.1
    EPHX3 15337.733 19p13.13
    EPOR 11487.881 19p13.3-p13.2
    ERF 42751.717 19q13
    ETV2 36132.647 19q13.11
    EXOC3L2 45715.879 19q13.32
    EXOSC5 41892.276 19q13.1
    F2RL3 16999.826 19p12
    FARSA 13033.284 19p13.2
    FBL 40325.093 19q13.1
    FBXL12 9920.943 19p13.2
    FBXO46 46213.887 19q13.3
    FCAR 55385.549 19q13.42
    FCGBP 40353.963 19
    FEM1A 4791.728 19p13.3
    FFAR1 35842.445 19q13.1
    FFAR2 35940.617 19q13.1
    FGF21 49259.344 19q13.33
    FGF22 639.926 19p13.3
    FLT3LG 49977.466 19q13.3
    FOSB 45971.253 19q13.3
    FOXA3 46367.518 19q13.2-q13.4
    FPR2 52264.453 19q13.3-q13.4
    FSD1 4304.591 19p13.3
    FTL 49468.566 19q13.33
    FUT1 49251.268 19q13.33
    FUT2 49199.228 19q13.33
    FUT3 5842.899 19p13.3
    FUT5 5865.837 19p13.3
    FUT6 5830.637 19p13.3
    FZR1 3522.954 19p13.3
    GADD45B 2476.123 19p13.3
    GAPDHS 36024.314 19q13.1
    GDF1 18979.361 19p13.11
    GIPC1 14588.571 19p13.1
    GIPR 46171.502 19q13.2-q13.3
    GLTSCR1 48111.453 19q13.3
    GNA15 3136.191 19p13.3
    GNG7 2511.218 19p13.3
    GNG8 47137.333 19q13.32
    GPI 34856.032 19q13.1
    GPR4 46093.023 19q13.3
    GPX4 1103.936 19p13.3
    GRIN2D 48898.132 19q13.33
    GSK3A 42734.338 19q13
    GTF2F1 6379.580 19p13.3
    GYS1 49471.382 19q13.3
    GZMM 544.034 19p13.3
    HAMP 35773.410 19q13.1
    HAPLN4 19366.452 19p13.1
    HAS1 52216.365 19q13.3-q13.4
    HAUS8 17160.571 19p13.11
    HCCAT3 52452.387 19q13.41
    HCST 36393.382 19q13.1
    HIF3A 46801.633 19q13
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    WDR83 12777.618 19p13.13
    WTIP 34972.880 19q13.11
    XAB2 7684.411 19p13.3
    XRCC1 44047.464 19q13.2
    ZBTB32 36203.830 19q13.1
    ZFP28 57050.317 19q13.43
    ZFP36 39897.487 19q13.1
    ZFP82 36882.861 19q13.13
    ZGLP1 10415.479 19p13.2
    ZNF132 58944.181 19q13.4
    ZNF134 58125.830 19q13.4
    ZNF154 58211.810 19q13.4
    ZNF224 44598.482 19q13.2
    ZNF296 45574.758 19q13.32
    ZNF320 53379.425 19q13.41
    ZNF331 54041.333 19q13
    ZNF350 52467.593 19q13.41
    ZNF382 37096.207 19q13.13
    ZNF420 37569.382 19q13.12
    ZNF43 21987.751 19p13.1-p12
    ZNF444 56652.535 19q13.43
    ZNF577 52374.551 19
    ZNF580 56153.463 19
    ZNF606 58488.441 19q13.43
    ZNF649 52392.488 19q13.41
    ZNF675 23835.708 19p12
    ZNF83 53115.618 19q13.3
    ZNF85 21106.059 19p12
    ZSCAN22 58838.385 19q13.43

    GeneCards  

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    Updated Jean-Loup Huret, Philippe Dessen

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_19.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_19.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
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