Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 20

Chromosome 20 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 20 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

dic(9;20)(p11-13;q11) PAX5/Various
dic(17;20)(p11.2;q11.2)
del(20q)
+20 or trisomy 20 (solely)
ider(20q) in Myeloid Malignancies
t(6;20)(q13;q12) LMBRD1/CHD6
t(6;20)(q15;q11.2) BACH2/BCL2L1
t(8;20)(p11;q13) KAT6A/NCOA3
t(X;20)(q13;q13.3)
t(11;20)(p15;q11) NUP98/TOP1
t(11;20)(q23;q11) KTM2A/MAPRE1
t(12;20)(q15;q11.2) HMGA2 truncated
t(14;20)(q32;q13) IGH/CEBPA
t(20;21)(q11;q22) RUNX1/?
t(20;21)(q13;q22) RUNX1/?
t(20;21)(q13.2;q22.12) ZFP64/RUNX1

Solid Tumors     

t(X;20)(p11;q13) SS18L1/SSX1
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2

Cancer prone diseases     

Alagille syndrome (AGS)
McCune Albright syndrome

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 20 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE



External links     

  • Chromosome 20 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 20 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 20 - Ensembl Project
  • Chromosome 20 - Map View - NCBI
  • Chromosome 20 - OMIM Gene map
  • Chromosome 20 - Genomic Variants
  • Chromosome 20 - HAPMAP Project
  • Chromosome 20 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 20 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 20 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 20 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 20 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 20 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 20 Cancer GeneWeb
  • Chromosome 20 GeneCards (Weizmann)
  • Human Proteomics Initiative (UniProt)
  • Cytogenetic marker FISH (Abbott)
  • FISH Probes DAKO
  • SureFISH Probes
  • CytoCell
  • Kreatech Diagnostic/
  • Pathology Outlines
  • PubMed Search Chromosome 20

  • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ASXL1 30946.147 20q11
    AURKA 54944.445 20q13
    BCAS4 49411.467 20q13
    BCL2L1 30252.261 20q11.21
    BLCAP 36145.819 20q11.23
    CSE1L 47662.783 20q13
    DNMT3B 31350.191 20q11.2
    E2F1 32263.292 20q11
    EEF1A2 62119.365 20q13.3
    GNAS 57466.426 20q13.2-q13.3
    ID1 30193.086 20q11
    JAG1 10618.332 20p12.1-p11.23
    MAPRE1 31407.699 20q11.1-q11.3
    MIR296 57392.670 20q13.32
    MMP9 44637.547 20q12-q13
    MYBL2 42295.659 20q13.1
    NCOA3 46130.601 20q12
    NFATC2 50003.494 20q13.2
    NKX2-2 21491.660 20p11.22
    PCNA 5095.599 20pter-p12
    PLAGL2 30780.307 20q11.21
    PLCB1 8112.912 20p12
    PLCG1 39766.161 20q12-q13.1
    PRNP 4666.797 20p13
    PTGIS 48120.411 20q13
    PTPN1 49126.858 20q13.1-q13.2
    RASSF2 4760.670 20p13
    SNAI1 48599.513 20q13.2
    SRC 35973.088 20q12-q13
    SRXN1 627.268 20p13
    SS18L1 60718.822 20q13.3
    STK4 43595.120 20q11.2-q13.2
    SULF2 46286.150 20q13.12-q13.13
    TFAP2C 55204.358 20q13.2
    TGM2 36756.864 20q12
    TNFRSF6B 62328.004 20q13.33
    TOP1 39657.462 20q12-q13.1
    TPX2 30326.904 20q11.2
    UBE2C 44441.215 20q13.12
    WISP2 43343.885 20q13.12
    ZNF217 52183.610 20q13.2
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ACOT8 44470.360 20q13.12
    ACSS2 33464.328 20q11.22
    ACTR5 37377.097 20q12
    ADA 43248.163 20q13.12
    ADAM33 3648.620 20p13
    ADNP 49505.455 20q13.13
    ADRM1 60877.952 20q13.33
    AHCY 32868.071 20q11.22
    ANGPT4 853.297 20p13
    AP5S1 3801.171 20p13
    APCDD1L 57034.426 20q13.32
    APMAP 24943.580 20p11.2
    ARFGEF2 47538.275 20q13.13
    ARFRP1 62329.995 20q13.3
    ASIP 32848.171 20q11.2-q12
    ATP5E 57603.733 20q13.3
    ATP9A 50213.314 20q13.2
    AVP 3063.202 20p13
    B4GALT5 48249.483 20q13.1-q13.2
    BCAS1 52560.079 20q13.2
    BIRC7 61867.235 20q13.3
    BMP2 6748.745 20p12
    BMP7 55743.809 20q13
    BPI 36932.552 20q11.23
    BPIFA1 31823.802 20q11.21
    BPIFA4P 31781.411 20q11.21
    BPIFB1 31870.941 20q11.21
    BPIFB2 31595.384 20q11.21
    C20orf85 56725.983 20q13.32
    CASC20 6407.379 -
    CASS4 54987.314 20q13.31
    CBFA2T2 32077.928 20q11
    CD40 44746.906 20q12-q13.2
    CD93 23059.993 20p11.21
    CDC25B 3776.401 20p13
    CDH22 44802.372 20q13.1
    CDH4 60074.477 20q13.3
    CDK5RAP1 31946.645 20q11.21
    CDS2 5107.407 20p13
    CEBPB 48807.120 20q13.1
    CENPB 3764.498 20p13
    CHD6 40030.743 20q12
    CHGB 5891.974 20pter-p12
    CHRNA4 61974.662 20
    COMMD7 31290.493 20q11
    COX4I2 30225.691 20q11.21
    CPNE1 34213.953 20q11.22
    CSNK2A1 463.338 20p13
    CST1 23728.190 20p11.2
    CST3 23614.294 20p11.2
    CST5 23856.572 20p11.21
    CST7 24929.866 20p11.21
    CSTF1 54967.427 20q13.31
    CTCFL 56072.224 20q13.31
    CTNNBL1 36322.357 20q11.23-q12
    CTSA 44519.591 20q13.12
    CTSZ 57570.242 20q13.32
    CYP24A1 52769.988 20q13
    DDX27 47835.832 20q13.13
    DHX35 37590.981 20q11.22-q12
    DIDO1 61509.090 20q13.33
    DNAJC5 62526.455 20q13.33
    DSTN 17550.599 20p12.1
    DUSP15 30448.870 20q11.21
    DYNLRB1 33104.189 20q11.21
    EDN3 57875.499 20q13.2-q13.3
    EIF2S2 32676.115 20q11.2
    EIF6 33866.709 20q11.2
    EMILIN3 39988.606 20q12
    EPPIN 44169.265 20q13.12
    ERGIC3 34129.778 20pter-q12
    EYA2 45523.263 20q13.1
    FERMT1 6055.492 20p12.3
    FKBP1A 1349.621 20p13
    FOXA2 22561.642 20p11
    FOXS1 30432.103 20q11.1-q11.2
    GATA5 61038.553 20q13.33
    GDF5 34021.149 20q11.2
    GGT7 33432.523 20q11.22
    GHRH 35879.490 20q11.2
    GINS1 25388.323 20p11.21
    GNRH2 3024.268 20p13
    GSS 33516.236 20q11.2
    HCK 30639.991 20q11-q12
    HNF4A 43029.896 20q13.12
    HRH3 60790.017 20pter-p12.1
    HSPA12B 3713.317 20p13
    IDH3B 2639.661 20p13
    INSM1 20348.765 20p11.2
    ITCH 32951.041 20q11.22
    ITPA 3190.006 20p
    KIF3B 30865.454 20q11.21
    L3MBTL1 42143.076 20q13.12
    LAMA5 60884.116 20q13.2-q13.3
    LBP 36974.814 20q11.23
    LZTS3 3143.263 20p13
    MAFB 39314.488 20q11.1-q13.1
    MAP1LC3A 33146.501 20q11.22
    MAVS 3827.446 20p13
    MCM8 5931.298 20p12.3
    MGME1 17949.762 20p11.23
    MIR1-1 61151.513 20q13.33
    MIR124-3 61809.852 20q13.33
    MIR133A2 61162.119 20q13.33
    MIR298 57393.281 20q13.32
    MIR499A 33578.179 20q11.22
    MIR663A 26188.822 20p11.1
    MLLT10P1 29637.584 20q11.21
    MMP24 33814.539 20q11.2
    MRGBP 61427.805 20q13.33
    MYL9 35169.887 20q11.23
    MYLK2 30407.178 20q13.31
    MYT1 62795.827 20q13.33
    NAA20 19997.934 20p11.23
    NCOA5 44689.626 20q12-q13.12
    NCOA6 33302.578 20q11
    NDRG3 35280.169 20q11.21-q11.23
    NELFCD 57556.263 20q13
    NEURL2 44517.111 20q13.12
    NINL 25433.338 20p11.22-p11.1
    NNAT 36149.607 20q11.2-q12
    NOL4L 31030.862 20q11.21
    NRSN2 327.370 20p13
    NTSR1 61340.189 20q13
    OCSTAMP 45169.670 20q13.12
    OGFR 61436.177 20q13.3
    OTOR 16728.998 20p12.1-p11.23
    OXT 3052.266 20p13
    PAK7 9518.037 20p12
    PAX1 21686.297 20p11.22
    PCK1 56136.137 20q13.31
    PCSK2 17206.752 20p11.2
    PDRG1 30532.758 20q11.21
    PDYN 1959.402 20p13
    PFDN4 52824.502 20q13.2
    PHACTR3 58152.564 20q13.32-q13.33
    PHF20 34359.923 20q11.22-q11.23
    PI3 43803.540 20q13.12
    PIGT 44044.707 20q12-q13.12
    PIGU 33148.346 20q11.22
    PLCB4 9288.447 20p12
    PLTP 44527.259 20q13.12
    PMEPA1 56223.448 20q13.31-q13.33
    POFUT1 30795.696 20q11
    PPP1R16B 37434.348 20q11.23
    PPP1R3D 58511.887 20q13.3
    PPP4R1L 56812.975 20q13.32
    PREX1 47240.793 20q13.13
    PROCR 33759.740 20q11.2
    PRPF6 62612.431 20q13.33
    PSMA7 60711.783 20q13.33
    PTK6 62159.776 20q13.3
    PTPRA 2844.841 20p13
    PTPRT 40701.392 20q12-q13
    PYGB 25228.706 20p11.21
    RAB22A 56884.771 20q13
    RAD21L1 1206.764 20p13
    RALGAPA2 20370.272 20p11.23
    RBBP9 18467.188 20p11.2
    RBCK1 388.709 20p13
    RBL1 35624.755 20q11.23
    RBM38 55966.454 20q13.31
    RBM39 34291.531 20q11.22
    RGS19 62704.535 20q13.33
    RIN2 19867.165 20p11.22
    RNF24 3912.069 20p13
    ROMO1 34287.232 20q11.22
    RPN2 35807.456 20q12-q13.1
    RPRD1B 36661.948 20q11.21-q12
    RRBP1 17594.323 20p12
    RTEL1 62289.163 20q13.3
    SALL4 50400.583 20q13.2
    SAMHD1 35520.227 20pter-q12
    SDC4 43953.929 20q12
    SEMG1 43835.638 20q12-q13.2
    SEMG2 43850.010 20q12-q13.1
    SERINC3 43127.901 20q13.12
    SGK2 42193.755 20q13.2
    SIGLEC1 3667.617 20p13
    SIRPA 1874.813 20p13
    SIRPB1 1545.029 20p13
    SIRPB2 1455.236 20p13
    SIRPG 1609.798 20p13
    SLA2 35240.924 20q11.23
    SLC12A5 44650.329 20q13.12
    SLC23A2 4833.002 20p13
    SLC35C2 44978.167 20q13.12
    SLC52A3 740.724 20p13
    SLC9A8 48429.250 20q13.13
    SLPI 43880.880 20q13.12
    SMOX 4129.426 20p13
    SNAP25 10199.477 20p12-p11.2
    SNTA1 31995.763 20q11.2
    SNX5 17922.240 20p11
    SOX18 62679.079 20q13.33
    SPAG4 34203.809 20q11.2
    SPATA2 48519.929 20q13.13
    SPTLC3 12989.627 20p12.1
    SRMS 62171.277 20q13.33
    SRSF6 42086.504 20q12-q13.1
    SSTR4 23016.057 20
    STAU1 47729.876 20q13.1
    STK35 2082.528 20p13
    TASP1 13370.036 20p12
    TCF15 584.637 20p13
    TGIF2 35201.876 20q11.23
    TGM3 2276.613 20q11.2
    THBD 23026.270 20p11.2
    TM9SF4 30697.309 20q11.21
    TMEM189-UBE2V1 48697.661 20q13.13
    TOMM34 43570.771 20q12-q13.1
    TOX2 42544.782 20q13.12
    TP53INP2 33292.148 20q11.22
    TP53RK 45313.004 20q13.2
    TPD52L2 62496.581 20q13.2-q13.3
    TRIB3 361.308 20p13-p12.2
    TSHZ2 51801.822 20q13.2
    TTLL9 30458.505 20q11
    TUBB1 57594.309 20q13.32
    UBE2V1 48697.661 20q13.2
    UBOX5 3088.219 20p13
    UCKL1 62571.182 20q13.33
    UQCC1 33890.369 20q11.22
    VAPB 56964.175 20q13
    WFDC2 44098.394 20q13.12
    WFDC5 43738.093 20q13.11
    XRN2 21283.942 20p11.2-p11.1
    YWHAB 43514.240 20q13.1
    ZBP1 56178.902 20q13.31
    ZFAS1 47894.715 20q13.13
    ZFP64 50767.817 20q13.11-q13.13
    ZGPAT 62338.794 20q13.3
    ZMYND8 45926.870 20q13.12
    ZNF335 44577.292 20q13.12
    ZNFX1 47862.439 20q13.13

    GeneCards  

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedJul 2014Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_20.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2014 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_20.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Fri Jul 11 17:37:33 CEST 2014


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