Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 20

chr20:1-64444167 (64444.167 Kb)

Chromosome 20 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 20 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

20 20p 20q 20p13 20p12 20p11 20q11 20q12 20q13

Leukaemia     

Multiple Myeloma
dic(9;20)(p11-13;q11) PAX5/Various
dic(17;20)(p11.2;q11.2)
del(20q) in myeloid malignancies
+20 or trisomy 20 (solely)
ider(20q) in Myeloid Malignancies
der(20)t(1;20)(q10-21;q11-13)
t(6;20)(q13;q12) LMBRD1/CHD6
t(6;20)(q15;q11.2) BACH2/BCL2L1
t(8;20)(p11;q13) KAT6A/NCOA3
t(X;20)(q13;q13.3)
t(11;20)(p15;q11) NUP98/TOP1
t(11;20)(q23;q11) KMT2A/MAPRE1
t(12;20)(q15;q11.2) HMGA2 truncated
t(14;20)(q32;q13) IGH/CEBPB
t(17;20)(q21;q11)
t(20;21)(q11;q22) RUNX1/?
t(20;21)(q13;q22) RUNX1/?
t(20;21)(q13.2;q22.12) ZFP64/RUNX1

Solid Tumors     

Soft Tissues: Desmoid-type fibromatosis
Pancreatic tumors: an overview
Penile tumors: an overview
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/BMP8B (Lung)
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/DEM1 (Lung)
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/RIMS3 (Lung)
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/RLF (Lung)
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/ZNF643 (Lung)
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/ZNF684 (Lung)
t(1;20)(p34;q11) PPT1/BCL2L1 (Lung)
t(1;20)(p34;q11) RLF/HM13 (Lung)
t(3;20)(q21;q13) SLC12A8/BCAS1 (Lung)
t(6;20)(p21;p12) CRLS1/KCNK17 (Lung)
t(6;20)(q22;q12) SDC4/ROS1 (Lung)
t(X;20)(p11;p12) SPTLC3/MAOA (Lung)
t(X;20)(p11;q13) SS18L1/SSX1 (Soft Tissues)
t(10;20)(q23;q13) WAPAL/PTPRT (Lung)
t(12;20)(q12;q13) TAF4/ALG10B (Lung)
t(13;20)(q12;p12) MACROD2/MPHOSPH8 (Lung)
t(18;20)(p11;q13) PHACTR3/PTPRM (Lung)
t(20;20)(q11;q11) BCL2L1/HM13 (Lung)
t(20;20)(q11;q11) TPX2/HM13 (Lung)
t(20;20)(q11;q13) ADNP/DLGAP4 (Lung)

Cancer prone diseases     

Alagille syndrome (AGS)
McCune Albright syndrome

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 20 by location


External links     

  • Chromosome 20 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 20 - GoldenPath - UCSC
  • Chromosome 20 - Ensembl Project
  • Chromosome 20 - Map View - NCBI
  • Chromosome 20 - Genomicq Homd Zeference
  • Chromosome 20 - DECIPHER
  • Chromosome 20 - OMIM Gene map
  • Chromosome 20 - Genomic Variants
  • Chromosome 20 - HAPMAP Project
  • Chromosome 20 - 1000 Genomes
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 20 Cancer GeneWeb

  • Chromosome 20 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 20 - Human UniProtKB

    FISH probes

  • Chromosome 20 - FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Chromosome 20 - Empire Genomics FISH clones [ chromosome ]  [ genes ]
  • Chromosome 20 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 20 - Vysis FISHCytogenetic marker (Abbott)
  • FISH Probes DAKO (Agilent)
  • SureFISH Probes (Agilent)
  • CytoCell  [ haematology ]  [ pathology ]
  • Kreatech Diagnostic
  • Metasystems

  • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ASXL1 32358.344     20q11.21
    AURKA 56369.389     20q13.2
    BCAS4 50794.894     20q13.13
    BCL2L1 31664.452     20q11.21
    BLCAP 37517.417     20q11.23
    CHD6 41402.103     20q12
    CSE1L 49046.246     20q13.13
    DNMT3B 32762.385     20q11.21
    E2F1 33675.486     20q11.22
    EEF1A2 63488.012     20q13.33
    ERGIC3 35542.029     20q11.22
    EYA2 46894.624     20q13.12
    GNAS 58891.303     20q13.32
    HNF4A 44401.256     20q13.12
    ID1 31605.283     20q11.21
    JAG1 10637.684     20p12.2
    MAFB 40685.848     20q12
    MAPRE1 32819.893     20q11.21
    MIR296 58817.615     20q13.32
    MMP9 46008.908     20q13.12
    MYBL2 43667.019     20q13.12
    NCOA3 47501.857     20q13.12
    NFATC2 51386.957     20q13.2
    NKX2-2 21511.022     20p11.22
    NTSR1 62708.837     20q13.33
    PCNA 5114.953     20p12.3
    PLAGL2 32192.504     20q11.21
    PLCB1 8132.265     20p12.3
    PLCG1 41137.521     20q12
    PRND 4721.854     20p13
    PTGIS 49503.874     20q13.13
    PTK6 63528.423     20q13.33
    PTPN1 50510.321     20q13.13
    PTPRA 2864.195     20p13
    RASSF2 4780.024     20p13
    SLPI 45253.002     20q13.12
    SNAI1 49982.976     20q13.13
    SRC 37344.685     20q11.23
    SRXN1 646.624     20p13
    SS18L1 62143.720     20q13.33
    STK4 44966.474     20q13.12
    SULF2 47657.406     20q13.12
    TFAP2C 56629.302     20q13.31
    TGM2 38127.387     20q11.23
    TNFRSF6B 63696.651     20q13.33
    TOP1 41028.818     20q12
    TPX2 31739.101     20q11.21
    UBE2C 45812.576     20q13.12
    WISP2 44714.844     20q13.12
    ZNF217 53567.071     20q13.2

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    AAR2 36236.417     20q11.23
    ABALON 31721.507     20q11.21
    ABHD12 25300.198     20p11.21
    ABHD16B 63861.213     20q13.33
    ACOT8 45841.721     20q13.12
    ACSS1 25006.230     20p11.21
    ACSS2 34876.525     20q11.22
    ACTL10 33666.498     20q11.22
    ACTR5 38748.454     20q11.23
    ADA 44619.519     20q13.12
    ADAM33 3667.965     20p13
    ADIG 38581.195     20q11.23
    ADNP 50888.918     20q13.13
    ADNP-AS1 50930.984     20q13.13
    ADRA1D 4220.631     20p13
    ADRM1 62302.896     20q13.33
    AHCY 34280.265     20q11.22
    ANGPT4 869.899     20p13
    ANKEF1 10034.999     20p12.2
    ANKRD20A21P 30719.816     20q11.21
    ANKRD60 58216.126     20q13.32
    AP5S1 3820.524     20p13
    APCDD1L 58459.101     20q13.32
    APCDD1L-AS1 58515.379     20q13.32
    APMAP 24962.944     20p11.21
    ARFGAP1 63272.785     20q13.33
    ARFGEF2 48921.738     20q13.13
    ARFRP1 63698.642     20q13.33
    ARHGAP40 38601.934     20q11.23
    ASIP 34260.365     20q11.22
    ATP5E 59028.678     20q13.32
    ATP9A 51596.775     20q13.2
    ATRN 3471.018     20p13
    AVP 3082.556     20p13
    B4GALT5 49632.946     20q13.13
    BANF2 17699.948     20p12.1
    BCAS1 53943.538     20q13.2
    BFSP1 17493.905     20p12.1
    BHLHE23 63005.979     20q13.33
    BIRC7 63235.883     20q13.33
    BMP2 6768.098     20p12.3
    BMP7 57168.753     20q13.31
    BMP7-AS1 57213.696     20q13.31
    BPI 38304.150     20q11.23
    BPIFA1 33235.996     20q11.21
    BPIFA2 33161.848     20q11.21
    BPIFA3 33217.310     20q11.21
    BPIFA4P 33193.605     20q11.21
    BPIFB1 33283.135     20q11.21
    BPIFB2 33007.578     20q11.21
    BPIFB3 33055.331     20q11.21
    BPIFB4 33081.512     20q11.21
    BPIFB6 33031.648     20q11.21
    BTBD3 11892.493     20p12.2
    C20orf141 2814.987     20p13
    C20orf144 33662.286     20q11.22
    C20orf166-AS1 62544.547     20q13.33
    C20orf173 35526.971     20q11.22
    C20orf181 63843.435     20q13.33
    C20orf187 11026.544     20p12.2
    C20orf194 3249.302     20p13
    C20orf196 5750.387     20p12.3
    C20orf197 60055.925     20q13.33
    C20orf202 1203.454     20p13
    C20orf203 32631.625     20q11.21
    C20orf204 64033.727     20q13.33
    C20orf24 36605.734     20q11.23
    C20orf27 3753.499     20p13
    C20orf78 18809.351     20p11.23
    C20orf85 58150.927     20q13.32
    C20orf96 270.863     20p13
    CABLES2 62388.630     20q13.33
    CASC20 6426.732     20p12.3
    CASS4 56412.258     20q13.31
    CBFA2T2 33490.122     20q11.21-q11.22
    CBLN4 55997.357     20q13.2
    CCM2L 32010.442     20q11.21
    CD40 46118.254     20q13.12
    CD93 23079.356     20p11.21
    CDC25B 3786.772     20p13
    CDH22 46173.733     20q13.12
    CDH26 59996.362     20q13.33
    CDH4 61499.421     20q13.33
    CDK5RAP1 33358.839     20q11.21
    CDS2 5126.761     20p12.3
    CEBPB 50190.583     20q13.13
    CEBPB-AS1 50184.603     20q13.13
    CENPB 3783.851     20p13
    CEP250 35459.983     20q11.22
    CFAP61 20056.646     20p11.23
    CHGB 5911.328     20p12.3
    CHMP4B 33811.304     20q11.22
    CHRNA4 63343.310     20q13.33
    CNBD2 35968.581     20q11.23
    COL20A1 63293.186     20q13.33
    COL9A3 62817.062     20q13.33
    COMMD7 32702.691     20q11.21
    COX4I2 31637.888     20q11.21
    CPNE1 35626.031     20q11.22
    CPXM1 2794.069     20p13
    CRLS1 6007.252     20p12.3
    CRNKL1 20034.361     20p11.23
    CSE1L-AS1 49040.463     20q13.13
    CSNK2A1 482.694     20p13
    CST11 23450.404     20p11.21
    CST1 23747.553     20p11.21
    CST13P 23519.146     20p11.21
    CST2 23823.767     20p11.21
    CST3 23633.657     20p11.21
    CST4 23685.640     20p11.21
    CST5 23875.935     20p11.21
    CST7 24949.230     20p11.21
    CST8 23491.101     20p11.21
    CST9 23602.410     20p11.21
    CST9L 23564.733     20p11.21
    CSTF1 56392.371     20q13.2-q13.31
    CSTL1 23439.685     20p11.21
    CTCFL 57497.168     20q13.31
    CTNNBL1 37693.955     20q11.23
    CTSA 45890.144     20q13.12
    CTSZ 58995.187     20q13.32
    CYP24A1 54153.449     20q13.2
    DBNDD2 45406.015     20q13.12
    DDRGK1 3190.350     20p13
    DDX27 49219.295     20q13.13
    DEFB115 31257.664     20q11.21
    DEFB116 31303.212     20q11.21
    DEFB117 31360.775     20q11.21
    DEFB118 31368.618     20q11.21
    DEFB119 31388.968     20q11.21
    DEFB121 31404.845     20q11.21
    DEFB122 31421.439     20q11.21
    DEFB123 31440.519     20q11.21
    DEFB124 31465.506     20q11.21
    DEFB125 87.672     20p13
    DEFB126 142.553     20p13
    DEFB127 157.470     20p13
    DEFB128 187.853     20p13
    DEFB129 227.258     20p13
    DEFB132 257.736     20p13
    DHX35 38962.338     20q11.23-q12
    DIDO1 62877.738     20q13.33
    DLGAP4 36461.415     20q11.23
    DLGAP4-AS1 36507.702     20q11.23
    DNAJC5 63895.102     20q13.33
    DNTTIP1 45791.937     20q13.12
    DOK5 54475.472     20q13.2
    DPH3P1 62844.566     20q13.33
    DPM1 50934.855     20q13.13
    DSN1 36751.791     20q11.23
    DSTN 17569.954     20p12.1
    DTD1 18587.893     20p11.23
    DUSP15 31861.067     20q11.21
    DYNLRB1 34516.384     20q11.22
    DZANK1 18383.367     20p11.23
    EBF4 2692.878     20p13
    EDEM2 35115.357     20q11.22
    EDN3 59300.427     20q13.32
    EFCAB8 32858.923     20q11.21
    EIF2S2 34088.298     20q11.22
    EIF6 35278.906     20q11.22
    ELMO2 46366.045     20q13.12
    EMILIN3 41359.966     20q12
    ENTPD6 25195.670     20p11.21
    EPB41L1 36092.710     20q11.23
    EPPIN 45541.845     20q13.12
    EPPIN-WFDC6 45536.280     20q13.12
    ERVK3-8 25398.853     20p11.21
    ESF1 13714.322     20p12.1
    FAM110A 833.697     20p13
    FAM182A 26054.655     20p11.1
    FAM182B 25769.598     20p11.1
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    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Jean-Loup Huret
    UpdatedNov 2017Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_20.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Nov 2017 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_20.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Tue Nov 21 15:14:23 CET 2017


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