Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 20

Chromosome 20 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 20 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

20 20p 20q 20p13 20p12 20p11 20p10 20q10 20q11 20q12 20q13

Leukaemia     

dic(9;20)(p11;q11) PAX5/Various
dic(17;20)(p11.2;q11.2)
del(20q)
+20 or trisomy 20 (solely)
ider(20q) in Myeloid Malignancies
t(6;20)(q13;q12) LMBRD1/CHD6
t(6;20)(q15;q11.2) BACH2/BCL2L1
t(8;20)(p11;q13) KAT6A/NCOA3
t(X;20)(q13;q13.3)
t(11;20)(p15;q11) NUP98/TOP1
t(11;20)(q23;q11) KMT2A/MAPRE1
t(12;20)(q15;q11.2) HMGA2 truncated
t(14;20)(q32;q13) IGH/CEBPB
t(20;21)(q11;q22) RUNX1/?
t(20;21)(q13;q22) RUNX1/?
t(20;21)(q13.2;q22.12) ZFP64/RUNX1

Solid Tumors     

inv(20)(q11q13) CEP250/DPM1
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/BMP8B
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/DEM1
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/RIMS3
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/RLF
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/ZNF643
t(1;20)(p34;q11) BCL2L1/ZNF684
t(1;20)(p34;q11) PPT1/BCL2L1
t(1;20)(p34;q11) RLF/HM13
t(3;20)(q21;q13) SLC12A8/BCAS1
t(6;20)(p21;p12) CRLS1/KCNK17
t(6;20)(q22;q12) SDC4/ROS1
t(X;20)(p11;p12) SPTLC3/MAOA
t(X;20)(p11;q13) SS18L1/SSX1
t(10;20)(q23;q13) WAPAL/PTPRT
t(12;20)(q12;q13) TAF4/ALG10B
t(13;20)(q12;p12) MACROD2/MPHOSPH8
t(18;20)(p11;q13) PHACTR3/PTPRM
t(20;20)(q11;q11) BCL2L1/HM13
t(20;20)(q11;q11) TPX2/HM13
t(20;20)(q11;q13) ADNP/DLGAP4
t(20;22)(q11;q12) PISD/RBL1
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2

Cancer prone diseases     

Alagille syndrome (AGS)
McCune Albright syndrome

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 20 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE



External links     

  • Chromosome 20 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 20 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 20 - Ensembl Project
  • Chromosome 20 - Map View - NCBI
  • Chromosome 20 - Genome Home Reference
  • Chromosome 20 - OMIM Gene map
  • Chromosome 20 - Genomic Variants
  • Chromosome 20 - HAPMAP Project
  • Chromosome 20 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 20 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 20 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 20 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 20 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 20 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 20 Cancer GeneWeb
  • Human Proteomics Initiative (UniProt)
  • Cytogenetic marker FISH (Abbott)
  • FISH Probes DAKO
  • SureFISH Probes
  • CytoCell
  • Kreatech Diagnostic/

  • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ASXL1 30946.147     20q11
    AURKA 54944.445     20q13
    BCAS4 49411.431     20q13.13
    BCL2L1 30252.261     20q11.21
    BLCAP 36145.819     20q11.23
    CHD6 40030.743     20q12
    CSE1L 47662.783     20q13
    DNMT3B 31350.191     20q11.2
    E2F1 32263.292     20q11.2
    EEF1A2 62119.365     20q13.3
    ERGIC3 34129.778     20pter-q12
    EYA2 45523.263     20q13.1
    GNAS 57466.426     20q13.3
    ID1 30193.086     20q11
    JAG1 10618.332     20p12.1-p11.23
    MAFB 39314.488     20q12
    MAPRE1 31407.699     20q11.1-q11.23
    MIR296 57392.670     20q13.32
    MMP9 44637.547     20q13.12
    MYBL2 42295.659     20q13.1
    NCOA3 46130.601     20q12
    NFATC2 50003.494     20q13.2
    NKX2-2 21491.660     20p11.22
    NTSR1 61340.189     20q13
    PCNA 5095.599     20pter-p12
    PLAGL2 30780.307     20q11.21
    PLCB1 8112.912     20p12
    PLCG1 39766.161     20q12-q13.1
    PRND 4702.500     20p13
    PTGIS 48120.411     20q13.13
    PTK6 62159.776     20q13.3
    PTPN1 49126.858     20q13.1-q13.2
    PTPRA 2844.841     20p13
    RASSF2 4760.670     20p13
    SNAI1 48599.513     20q13.2
    SRC 35973.088     20q12-q13
    SRXN1 627.268     20p13
    SS18L1 60718.776     20q13.3
    STK4 43595.120     20q11.2-q13.2
    SULF2 46286.150     20q13.12
    TFAP2C 55204.358     20q13.2
    TGM2 36756.864     20q12
    TNFRSF6B 62328.004     20q13.3
    TOP1 39657.462     20q12-q13.1
    TPX2 30326.904     20q11.2
    UBE2C 44441.215     20q13.12
    WISP2 43343.885     20q13.12
    ZNF217 52183.610     20q13.2

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    AAR2 34824.339     20pter-q12
    ABALON 30309.310     20q11.21
    ABHD12 25280.834     20p11.21
    ABHD16B 62492.566     20q13.33
    ACOT8 44470.360     20q13.12
    ACSS1 24986.866     20p11.21
    ACSS2 33464.328     20q11.22
    ACTL10 32254.304     20q11.22
    ACTR5 37377.097     20q11.23
    ADA 43248.163     20q13.12
    ADAM33 3648.620     20p13
    ADIG 37209.838     20q11.23
    ADNP 49505.455     20q13.13
    ADNP-AS1 49547.521     -
    ADRA1D 4201.278     20p13
    ADRM1 60877.952     20q13.33
    AHCY 32868.071     20q11.22
    ANGPT4 853.297     20p13
    ANKEF1 10015.647     20p12.2
    ANKRD60 56791.182     20q13.32
    AP5S1 3801.171     20p13
    APCDD1L 57034.160     20q13.32
    APCDD1L-AS1 57090.435     20q13.32
    APMAP 24943.580     20p11.2
    ARFGAP1 61904.137     20q13.33
    ARFGEF2 47538.275     20q13.13
    ARFRP1 62329.995     20q13.3
    ARHGAP40 37230.577     20q11.23
    ASIP 32848.171     20q11.2-q12
    ATP5E 57603.733     20q13.32
    ATP9A 50213.314     20q13.2
    ATRN 3451.665     20p13
    AVP 3063.202     20p13
    B4GALT5 48249.483     20q13.1-q13.2
    BANF2 17680.593     20p12.1
    BCAS1 52560.079     20q13.2
    BFSP1 17474.550     20p12.1
    BHLHE23 61637.331     20q13.33
    BIRC7 61867.235     20q13.3
    BMP2 6748.745     20p12
    BMP7 55743.809     20q13
    BMP7-AS1 55788.752     20q13.31
    BPI 36932.552     20q11.23
    BPIFA1 31823.802     20q11.2
    BPIFA2 31755.960     20q11.21
    BPIFA3 31805.116     20q11.21
    BPIFA4P 31781.411     20q11.21
    BPIFB1 31870.941     20q11.21
    BPIFB2 31595.384     20q11.21
    BPIFB3 31643.137     20q11.21
    BPIFB4 31669.318     20q11.21
    BPIFB6 31619.454     20q11.21
    BTBD3 11873.141     20p12.2
    C20orf141 2795.633     20p13
    C20orf144 32250.092     20q11.22
    C20orf166-AS1 61141.754     20q13.33
    C20orf173 34114.799     20q11.22
    C20orf181 62474.788     20q13.33
    C20orf194 3229.948     20p13
    C20orf195 62184.373     20q13.33
    C20orf196 5731.033     20p12.3
    C20orf197 58630.980     20q13.33
    C20orf202 1184.098     20p13
    C20orf203 31219.427     20q11.21
    C20orf24 35234.137     20q11.23
    C20orf27 3734.146     20p13
    C20orf57 30435.440     20q11.21
    C20orf62 43090.403     20q13.12
    C20orf78 18789.995     20p11.23
    C20orf85 56725.983     20q13.32
    C20orf96 251.504     20p13
    CABLES2 60963.686     20q13.33
    CASC20 6407.379     -
    CASS4 54987.314     20q13.31
    CBFA2T2 32077.928     20q11
    CBLN4 54572.413     20q13
    CCM2L 30598.245     20q11.2
    CD40 44746.893     20q12-q13.2
    CD93 23059.993     20p11.21
    CDC25B 3767.419     20p13
    CDH22 44802.372     20q13.1
    CDH26 58571.417     20q13.33
    CDH4 60074.477     20q13.3
    CDK5RAP1 31946.645     20q11.21
    CDS2 5107.407     20p13
    CEBPB 48807.120     20q13.1
    CEBPB-AS1 48801.140     20q13.13
    CENPB 3764.498     20p13
    CEP250 34043.223     20q11.22
    CFAP61 20037.290     20p11.23
    CHGB 5891.974     20p12.3
    CHMP4B 32399.110     20q11.22
    CHRNA4 61974.662     20q13.33
    CNBD2 34556.503     20q11.23
    COL20A1 61924.538     20q13.33
    COL9A3 61448.414     20q13.3
    COMMD7 31290.493     20q11.21
    COX4I2 30225.691     20q11.21
    CPNE1 34213.953     20q11.22
    CPXM1 2774.715     20p13
    CRLS1 5987.898     20p13-p12.3
    CRNKL1 20015.005     20p11.2
    CSE1L-AS1 47657.000     20q13.13
    CSNK2A1 463.338     20p13
    CSRP2BP 18122.868     20p11.23
    CST11 23431.041     20p11.21
    CST1 23728.190     20p11.21
    CST13P 23499.783     20p11.21
    CST2 23804.404     20p11.21
    CST3 23614.294     20p11.21
    CST4 23666.277     20p11.21
    CST5 23856.572     20p11.21
    CST7 24929.866     20p11.21
    CST8 23471.738     20p11.21
    CST9 23583.047     20p11.21
    CST9L 23545.370     20p11.21
    CSTF1 54967.427     20q13.2
    CSTL1 23420.322     20p11.21
    CTCFL 56072.224     20q13.31
    CTNNBL1 36322.357     20q11.23-q12
    CTSA 44519.591     20q13.1
    CTSZ 57570.242     20q13.32
    CYP24A1 52769.988     20q13
    DBNDD2 44034.655     20q13.12
    DDRGK1 3171.012     20p13
    DDX27 47835.832     20q13.13
    DEFB115 29845.467     20q11.21
    DEFB116 29891.015     20q11.21
    DEFB117 29948.578     20q11.21
    DEFB118 29956.421     20q11.21
    DEFB119 29976.771     20q11.21
    DEFB121 29992.648     20q11.21
    DEFB122 30009.242     20q11.21
    DEFB123 30028.322     20q11.1
    DEFB124 30053.309     20q11.1
    DEFB125 68.313     20p13
    DEFB126 123.194     20p13
    DEFB127 138.111     20p13
    DEFB128 168.494     20p13
    DEFB129 207.899     20p13
    DEFB132 238.377     20p13
    DHX35 37590.981     20q11.22-q12
    DIDO1 61509.090     20q13.33
    DLGAP4 35089.818     20q11.23
    DLGAP4-AS1 35136.105     -
    DNAJC5 62526.455     20q13.33
    DNTTIP1 44420.576     20q13.12
    DOK5 53092.011     20q13.2
    DPH3P1 61475.918     20q13.33
    DPM1 49551.405     20q13.13
    DSN1 35380.194     20q11.23
    DSTN 17550.599     20p12.1
    DTD1 18568.556     20p11.23
    DUSP15 30448.870     20q11.21
    DYNLRB1 33104.189     20q11.21
    DZANK1 18364.011     20p11.23
    EBF4 2673.524     20p13
    EDEM2 33703.160     20q11.22
    EDN3 57875.482     20q13.2-q13.3
    EIF2S2 32676.115     20q11.2
    EIF6 33866.709     20q12
    ELMO2 44994.690     20q13
    EMILIN3 39988.606     20q12
    ENTPD6 25176.339     20p11.21
    EPB41L1 34680.632     20q11.2-q12
    EPPIN 44170.484     20q13.12
    EPPIN-WFDC6 44164.919     20q
    ESF1 13694.969     20p12.1
    FAM110A 814.340     20p13
    FAM182A 26035.291     20p11.1
    FAM182B 25750.234     20p11.1
    FAM209A 55099.785     20q13.31
    FAM209B 55108.302     20q13.31
    FAM210B 54933.983     20q13.2
    FAM217B 58508.819     20q13.33
    FAM65C 49202.645     20q13.13
    FAM83C 33873.534     20q11.22
    FAM83C-AS1 33873.054     20q11.22
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    ZNF335 44577.292     20q13.12
    ZNF337 25653.831     20p11.1
    ZNF337-AS1 25604.681     20p11.1
    ZNF341 32319.566     20q11.22
    ZNF341-AS1 32375.179     20q11.22
    ZNF343 2462.466     20p13
    ZNF512B 62588.057     20q13.33
    ZNF663P 45042.867     20q13.12
    ZNF831 57766.075     20q13.32
    ZNFX1 47862.439     20q13.13
    ZSWIM1 44509.848     20q13.12
    ZSWIM3 44486.220     20q13.12

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedJul 2015Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_20.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2015 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_20.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Fri Jul 24 14:51:39 CEST 2015


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