Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 22

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Chromosome 22 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 22 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

22 22p 22q 22p13 22p12 22p11 22q11 22q12 22q13

Leukaemia     

+22 or trisomy 22 (solely?)
t(1;22)(p36;q11) IGL/PRDM16
t(1;22)(p13;q13) RBM15/MKL1
t(1;22)(q21;q11) IGL/BCL9
t(1;22)(q21;q11)
t(2;22)(p23;q11) CLTCL1/ALK
t(2;22)(p23;q11) MYH9/ALK
t(2;22)(p13;q11) (NHL; REL and IgL; rare)
t(3;22)(q27;q11) IGL/BCL6
t(4;22)(q12;q11) BCR/PDGFRA
t(6;22)(p25;q11) IRF4/IGL
t(6;22)(p21;q11)
t(7;22)(q21;q11) IGL/CDK6
t(8;22)(p11;q11) BCR/FGFR1
t(8;22)(p11;q13) KAT6A/EP300
t(8;22)(q24;q11) IGL/MYC
t(9;22)(p24;q11.2)
t(9;22)(p13;q13) PAX5/BRD1
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in ALL
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in AML
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in CML
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in treatment related leukemia
t(11;22)(q13;q13) HRASLS5/PHF21B
t(11;22)(q23;q11.2) KMT2A/SEPT5
t(11;22)(q23;q13) KMT2A/EP300
t(12;22)(p13;q11) IGL/CCND2
t(12;22)(p13;q11) (AML; MN1 and ETV6; rare)
t(12;22)(p13;q12) MN1/ETV6
t(12;22)(p13;q12) EWSR1/ZNF384
t(14;22)(q32;q11) IGH/IGL
t(18;22)(q21;q11) IGL/BCL2
t(19;22)(q13.3;q11) BCL3/IGL

Solid Tumors     

Pancreatic tumors: an overview
del(22)(q13) (Bone)
inv(22)(q12q12) EWSR1/PATZ1 (Soft Tissues)
t(1;22)(p36;q11) SMARCB1/WASF2 (Soft tissue tumors)
t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1 (Soft Tissues)
t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1 (Soft tissue tumors)
t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1 (Soft Tissues)
t(2;22)(p12;q12) EVA1A/TTC28 (Lung)
t(2;22)(q31;q12) EWSR1/SP3 (Soft tissue tumors)
t(2;22)(q31;q12) EWSR1/SP3 (Soft Tissues)
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1 (Soft Tissues)
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1 (Soft Tissues)
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1 (Soft tissue tumors)
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1 (Soft Tissues)
t(2;22)(q36;q12) EWSR1/FEV (Soft Tissues)
t(2;22)(q36;q12) EWSR1/FEV (Soft tissue tumors)
t(3;22)(q26;q11) ATP11B/TPTEP1 (Lung)
t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4 (Soft Tissues)
t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4 (Soft tissue tumors)
t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4 (Soft Tissues)
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1 (Soft Tissues)
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1 (Soft tissue tumors)
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1 (Skin)
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1 (Head and Neck)
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1 (Soft Tissues)
t(7;22)(p22;q12) EWSR1/ETV1 (Soft Tissues)
t(7;22)(p22;q12) EWSR1/ETV1 (Soft tissue tumors)
t(7;22)(p21;q11) HERVK22Q11/ETV1 (Prostate tumors)
t(9;22)(q22;q12) EWSR1/NR4A3 (Bone)
t(9;22)(q22;q12) EWSR1/NR4A3 (Soft Tissues)
t(9;22)(q22;q12) EWSR1/NR4A3 (Soft tissue tumors)
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1 (Soft Tissues)
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1 (Soft tissue tumors)
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 (Soft Tissues)
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 (Prostate tumors)
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 (Soft tissue tumors)
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 (Bone)
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 (Pancreas)
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1 (Soft Tissues)
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1 (Soft Tissues)
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1 (Soft Tissues)
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3 (Soft Tissues)
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1 (Soft Tissues)
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3 (Soft Tissues)
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1 (Soft tissue tumors)
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3 (Soft tissue tumors)
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1 (Soft Tissues)
t(12;22)(q14;q12) SLC16A7/TTC28 (Lung)
t(14;22)(q32;q12) EWSR1/YY1 (Mesothelioma)
t(15;22)(q21;q12) MCM5/TRPM7 (Lung)
t(16;22)(p12;q11) POM121L4P/LCMT1 (Lung)
t(17;22)(p13;q12) USP6/MYH9 (Soft tissue tumors)
t(17;22)(q21;q12) EWSR1/ETV4 (Soft Tissues)
t(17;22)(q21;q12) EWSR1/ETV4 (Soft tissue tumors)
t(17;22)(q22;q13) COL1A1/PDGFB (Soft Tissues)
t(17;22)(q22;q13) COL1A1/PDGFB (Soft tissue tumors)
t(18;22)(q12;q11) CDC45/RIT2 (Lung)
t(19;22)(p12;q11) MMP11/ZNF714 (Lung)
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444 (Soft Tissues)
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444 (Soft tissue tumors)
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444 (Soft Tissues)
t(20;22)(q11;q12) PISD/RBL1 (Lung)
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2 (Soft Tissues)
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2 (Soft tissue tumors)
t(21;22)(q21;q12) EWSR1/ERG (Soft Tissues)
t(21;22)(q21;q12) EWSR1/ERG (Soft tissue tumors)
t(22;22)(q11;q11) THAP7/PRODH (Lung)
t(22;22)(q12;q12) APOL3/ISX (Lung)
t(22;22)(q12;q12) MCM5/TOM1 (Lung)

Cancer prone diseases     

Neurofibromatosis type 2 (NF2)
Rhabdoid predisposition syndrome
Schwannomatosis

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 22 by location


External links     

  • Chromosome 22 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 22 - GoldenPath - UCSC
  • Chromosome 22 - Ensembl Project
  • Chromosome 22 - Map View - NCBI
  • Chromosome 22 - Genomics Home Reference
  • Chromosome 22 - DECIPHER
  • Chromosome 22 - OMIM Gene map
  • Chromosome 22 - Genomic Variants
  • Chromosome 22 - HAPMAP Project
  • Chromosome 22 - 1000 Genomes
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 22 Cancer GeneWeb
  • IMGT, the international ImMunoGeneTics database (Montpellier,France)

  • Chromosome 22 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 22 - Human UniProtKB

    FISH probes

  • Chromosome 22 - FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Chromosome 22 - Empire Genomics FISH clones [ chromosome ]  [ genes ]
  • Chromosome 22 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 22 - Vysis FISHCytogenetic marker (Abbott)
  • FISH Probes DAKO (Agilent)
  • SureFISH Probes (Agilent)
  • CytoCell  [ haematology ]  [ pathology ]
  • Kreatech Diagnostic
  • Metasystems

  • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ATF4 39520.559     22q13.1
    BCR 23180.365     22q11.23
    CARD10 37490.362     22q13.1
    CBX7 39130.774     22q13.1
    CHEK2 28687.743     22q12.1
    CLTCL1 19179.474     22q11.21
    EP300 41092.610     22q13.2
    EWSR1 29268.009     22q12.2
    FBLN1 45502.839     22q13.31
    IGL 21919.419     22q11.2
    MAPK1 21759.658     22q11.22
    MAPK12 50252.901     22q13.33
    MCM5 35400.123     22q12.3
    MIF 23894.378     22q11.23
    MKL1 40410.281     22q13.1-q13.2
    MMP11 23772.819     22q11.23
    MN1 27748.277     22q12.1
    MYH9 36281.277     22q12.3
    NF2 29603.556     22q12.2
    PARVB 43999.211     22q13.31
    PDGFB 39223.359     22q13.1
    PRAME 22547.696     22q11.22
    RAC2 37225.261     22q13.1
    RBX1 40951.347     22q13.2
    SEPT5 19718.435     22q11.21
    SMARCB1 23786.931     22q11.23
    SOX10 37972.312     22q13.1
    TYMP 50525.753     22q13.33
    XRCC6 41621.342     22q13.2

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    A4GALT 42692.112     22q13.2
    ACO2 41469.125     22q13.2
    ACR 50738.224     22q13.33
    ACTR3BP6 16487.003     22q11.1
    ADA2 17178.790     22q11.1
    ADM2 50481.724     22q13.33
    ADORA2A 24427.562     22q11.23
    ADORA2A-AS1 24429.210     22q11.23
    ADSL 40346.500     22q13.1
    AIFM3 20965.130     22q11.21
    ALG12 49903.206     22q13.33
    ANKRD54 37830.855     22q13.1
    ANKRD62P1-PARP4P3 16653.709     22q11.1
    AP1B1 29327.680     22q12.2
    AP1B1P1 32121.977     22q12.3
    APOBEC3A 38957.522     22q13.1
    APOBEC3A_B 38957.522     22q13 alternate reference locus
    APOBEC3B 38982.399     22q13.1
    APOBEC3B-AS1 38961.614     22q13.1
    APOBEC3C 39014.260     22q13.1
    APOBEC3D 39021.113     22q13.1
    APOBEC3F 39040.668     22q13.1
    APOBEC3G 39077.005     22q13.1
    APOBEC3H 39097.224     22q13.1
    APOL1 36253.071     22q12.3
    APOL2 36226.209     22q12.3
    APOL3 36140.329     22q12.3
    APOL4 36189.128     22q12.3
    APOL5 35717.872     22q12.3
    APOL6 35648.377     22q12.3
    ARFGAP3 42796.526     22q13.2
    ARHGAP8 44752.558     22q13.31
    ARSA 50622.754     22q13.33
    ARVCF 19969.879     22q11.21
    ASCC2 29788.608     22q12.2
    ASPHD2 26429.314     22q12.1
    ATP5L2 42639.803     22q13.2
    ATP6V1E1 17592.136     22q11.21
    ATXN10 45671.798     22q13.31
    BAIAP2L2 38084.889     22q13.1
    BCL2L13 17638.584     22q11.21
    BCRP2 21103.016     22q11.21
    BCRP3 24632.915     22q11.23
    BID 17734.140     22q11.21
    BIK 43110.748     22q13.2
    BMS1P20 22322.674     22q11.22
    BMS1P22 19083.134     22q11.1
    BPIFC 32413.847     22q12.3
    BRD1 49773.278     22q13.33
    C1QTNF6 37180.166     22q12.3
    C22orf15 23763.014     22q11.23
    C22orf23 37943.050     22q13.1
    C22orf24 31933.521     22q12.3
    C22orf31 29058.672     22q12.1
    C22orf34 49620.456     22q13.33
    C22orf39 19440.887     22q11.21
    C22orf42 32149.532     22q12.3
    C22orf46 41690.543     22q13.2
    CABIN1 24011.370     22q11.23
    CABP7 29720.355     22q12.2
    CACNA1I 39570.753     22q13.1
    CACNG2 36560.869     22q12.3
    CASTOR1 30285.118     22q12.2
    CBX6 38861.427     22q13.1
    CBY1 38656.653     22q13.1
    CCDC116 21632.729     22q11.21
    CCDC117 28772.674     22q12.1
    CCDC134 41800.622     22q13.2
    CCDC157 30356.635     22q12.2
    CCDC188 20148.586     22q11.21
    CCT8L2 16590.758     22q11.1
    CDC42EP1 37560.464     22q13.1
    CDC45 19479.826     22q11.21
    CDPF1 46244.013     22q13.31
    CECR2 17359.949     22q11.1-q11.21
    CECR3 17256.860     22q11.1
    CECR6 17116.299     22q11.1
    CECR7 17036.570     22q11.1
    CECR9 17329.034     -
    CELSR1 46360.834     22q13.31
    CENPM 41938.721     22q13.2
    CERK 46684.410     22q13.31
    CES5AP1 23359.606     22q11.23
    CHADL 41229.510     22q13.2
    CHCHD10 23765.834     22q11.23
    CHKB 50578.958     22q13.33
    CHKB-AS1 50583.026     22q13.33
    CHKB-CPT1B 50568.861     22q13.33
    CLDN5 19523.024     22q11.21
    COMT 19941.740     22q11.21
    CPT1B 50568.861     22q13.33
    CRELD2 49918.630     22q13.33
    CRKL 20917.426     22q11.21
    CRYBA4 26621.964     22q12.1
    CRYBB1 26599.398     22q12.1
    CRYBB2 25219.645     22q11.23
    CRYBB2P1 25448.087     22q11.23
    CRYBB3 25199.850     22q11.23
    CSDC2 41561.010     22q13.2
    CSF2RB 36913.633     22q12.3
    CSNK1E 38290.691     22q13.1
    CYB5R3 42617.840     22q13.2
    CYP2D6 42126.499     22q13.2
    CYP2D7 42139.591     22q13.2
    CYTH4 37282.383     22q13.1
    DDT 23971.365     22q11.23
    DDTL 23966.838     22q11.23
    DDX17 38483.438     22q13.1
    DENND6B 50311.963     22q13.33
    DEPDC5 31754.023     22q12.2-q12.3
    DERL3 23834.503     22q11.23
    DESI1 41598.028     22q13.2
    DGCR10 19022.624     22q11.21
    DGCR11 19046.162     22q11.21
    DGCR12 19061.041     22q11.21
    DGCR14 19130.279     22q11.21|22q11.2
    DGCR2 19036.282     22q11.21
    DGCR5 18970.498     22q11.21
    DGCR6 18906.223     22q11.21|22q11
    DGCR6L 20314.238     22q11.21
    DGCR8 20080.232     22q11.21
    DGCR9 19017.834     22q11.21
    DMC1 38518.949     22q13.1
    DNAJB7 40859.550     22q13.2
    DNAL4 38778.508     22q13.1
    DRG1 31399.553     22q12.2
    DRICH1 23608.452     22q11.23
    DUSP18 30661.458     22q12.2
    DUXAP8 15784.954     22q11.1
    EFCAB6 43528.744     22q13.2-q13.31
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    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Jean-Loup Huret
    UpdatedDec 2017Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Dec 2017 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Wed Dec 6 14:48:58 CET 2017


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