Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 22

Chromosome 22 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 22 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

22 22p 22q 22p13 22p12 22p11 22p10 22q10 22q11 22q12 22q13

Leukaemia     

+22 or trisomy 22 (solely?)
t(1;22)(p13;q13) RBM15/MKL1
t(1;22)(q21;q11) IGL/BCL9
t(1;22)(q21;q11)
t(2;22)(p23;q11) CLTCL1/ALK
t(2;22)(p23;q11) MYH9/ALK
t(3;22)(q27;q11) IGL/BCL6
t(4;22)(q12;q11) BCR/PDGFRA
t(6;22)(p25;q11) IRF4/IGL
t(6;22)(p21;q11)
t(7;22)(q21;q11) IGL/CDK6
t(8;22)(p11;q11) BCR/FGFR1
t(8;22)(p11;q13) KAT6A/EP300
t(8;22)(q24;q11) IGL/MYC
t(9;22)(p24;q11.2)
t(9;22)(p13;q13) PAX5/BRD1
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in ALL
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in AML
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in CML
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in treatment related leukemia
t(11;22)(q13;q13) HRASLS5/PHF21B
t(11;22)(q23;q11.2) KMT2A/SEPT5
t(11;22)(q23;q13) KMT2A/EP300
t(12;22)(p13;q11) IGL/CCND2
t(12;22)(p13;q12) MN1/ETV6
t(12;22)(p13;q12) EWSR1/ZNF384
t(14;22)(q32;q11) IGH/IGL
t(18;22)(q21;q11)
t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL

Solid Tumors     

del(22)(q13)
inv(22)(q12q12) EWSR1/PATZ1
inv(22)(q12q12) EWSR1/PATZ1
inv(22)(q13q13) TTLL1/TSPO
t(1;22)(p36;q11) SMARCB1/WASF2
t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1
t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1
t(2;22)(p12;q12) EVA1A/TTC28
t(2;22)(q31;q12) EWSR1/SP3
t(2;22)(q31;q12) EWSR1/SP3
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1
t(2;22)(q36;q12) EWSR1/FEV
t(2;22)(q36;q12) EWSR1/FEV
t(3;22)(q26;q11) ATP11B/TPTEP1
t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4
t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4
t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
t(7;22)(p22;q12) EWSR1/ETV1
t(7;22)(p22;q12) EWSR1/ETV1
t(7;22)(p21;q11) HERVK22Q11/ETV1
t(9;22)(q22;q12) EWSR1/NR4A3
t(9;22)(q22;q12) EWSR1/NR4A3
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(12;22)(q14;q12) SLC16A7/TTC28
t(14;22)(q32;q12) EWSR1/YY1
t(15;22)(q21;q12) MCM5/TRPM7
t(16;22)(p12;q11) POM121L4P/LCMT1
t(17;22)(p13;q12) USP6/MYH9
t(17;22)(q21;q12) EWSR1/ETV4
t(17;22)(q21;q12) EWSR1/ETV4
t(17;22)(q22;q13) COL1A1-PDGFB
t(17;22)(q22;q13) COL1A1/PDGFB
t(18;22)(q12;q11) CDC45/RIT2
t(19;22)(p12;q11) MMP11/ZNF714
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444
t(20;22)(q11;q12) PISD/RBL1
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2
t(21;22)(q21;q12) EWSR1/ERG
t(21;22)(q21;q12) EWSR1/ERG
t(22;22)(q11;q11) THAP7/PRODH
t(22;22)(q12;q12) APOL3/ISX
t(22;22)(q12;q12) MCM5/TOM1

Cancer prone diseases     

Neurofibromatosis type 2 (NF2)
Rhabdoid predisposition syndrome
Schwannomatosis

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 22 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE



External links     

  • Chromosome 22 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 22 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 22 - Ensembl Project
  • Chromosome 22 - Map View - NCBI
  • Chromosome 22 - Genome Home Reference
  • Chromosome 22 - OMIM Gene map
  • Chromosome 22 - Genomic Variants
  • Chromosome 22 - HAPMAP Project
  • Chromosome 22 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 22 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 22 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 22 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 22 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 22 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 22 Cancer GeneWeb
  • IMGT, the international ImMunoGeneTics database (Montpellier,France)
  • Human Proteomics Initiative (UniProt)
  • Cytogenetic marker FISH (Abbott)
  • FISH Probes DAKO
  • SureFISH Probes
  • CytoCell
  • Kreatech Diagnostic/

  • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ATF4 39916.564     22q13.1
    BCR 23522.552     22q11.23
    CARD10 37886.400     22q13.1
    CBX7 39526.779     22q13.1
    CHEK2 29083.731     22q12.1
    CLTCL1 19166.987     22q11.21
    EP300 41488.614     22q13.2
    EWSR1 29663.998     22q12.2
    FBLN1 45898.719     22q13.31
    IGL 22712.136     22q11.2
    MAPK1 22113.947     22q11.21
    MAPK12 50691.331     22q13.33
    MCM5 35796.116     22q13.1
    MIF 24236.565     22q11.23
    MKL1 40806.285     22q13
    MMP11 24115.036     22q11.23
    MN1 28144.265     22q12.1
    MYH9 36677.323     22q13.1
    NF2 29999.545     22q12.2
    PARVB 44395.091     22q13.2-q13.33
    PDGFB 39619.685     22q13.1
    PRAME 22890.118     22q11.22
    RAC2 37621.301     22q13.1
    RBX1 41347.351     22q13.2
    SEPT5 19705.958     22q11.21
    SMARCB1 24129.150     22q11.23|22q11
    SOX10 38368.319     22q13.1
    TYMP 50964.181     22q13.33
    XRCC6 42017.346     22q13.2

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg19 (Kb)(↓)    Band(↓)
    A4GALT 43088.127     22q13.2
    ACO2 41865.129     22q13.2
    ACR 51176.652     22q13.33
    ADM2 50920.153     22q13.33
    ADORA2A 24823.530     22q11.23
    ADORA2A-AS1 24825.178     22q11.23
    ADRBK2 25960.861     22q12.1
    ADSL 40742.504     22q13.2
    AIFM3 21319.418     22q11.21
    ALG12 50296.854     22q13.33
    ANKRD54 38226.862     22q13.1
    ANKRD62P1-PARP4P3 17134.599     22q11.1
    AP1B1 29723.669     22q12.2
    AP1B1P1 32517.964     22q12.3
    APOBEC3A 39353.527     22q13.1-q13.2
    APOBEC3A_B 39353.527     22q13 alternate reference locus
    APOBEC3B 39378.404     22q13.1-q13.2
    APOBEC3B-AS1 39387.564     22q13.1
    APOBEC3C 39410.265     22q13.1
    APOBEC3D 39417.118     22q13.1
    APOBEC3F 39436.673     22q13.1
    APOBEC3G 39473.010     22q13.1-q13.2
    APOBEC3H 39493.229     22q13.1
    APOL1 36649.117     22q13.1
    APOL2 36622.255     22q12
    APOL3 36536.377     22q13.1
    APOL4 36585.176     22q11.2-q13.2
    APOL5 36113.919     22q12.3
    APOL6 36044.424     22q12.3
    ARFGAP3 43192.532     22q13.2
    ARHGAP8 45148.438     22q13.31
    ARSA 51061.182     22q13.33
    ARVCF 19957.402     22q11.21
    ASCC2 30184.597     22q12.1
    ASPHD2 26825.280     22q12.1
    ATP5L2 43035.809     22q13.2
    ATP6V1E1 18074.903     22q11.1
    ATXN10 46067.678     22q13.31
    BAIAP2L2 38480.896     22q13.1
    BCL2L13 18121.350     22q11.1
    BCRP2 21457.305     22q11.21
    BCRP3 25028.882     22q11.23
    BID 18216.906     22q11.1
    BIK 43506.754     22q13.31
    BMS1P20 22677.030     22q11.22
    BPIFC 32809.834     22q12.3
    BRD1 50166.926     22q13.33
    C1QTNF6 37576.206     22q13.1
    C22orf15 24105.208     22q11.23
    C22orf23 38339.057     22q13.1
    C22orf24 32329.507     22q12.1-q12.3
    C22orf29 19833.661     22q11.21
    C22orf31 29454.660     22q12.1
    C22orf34 50014.104     22q13.33
    C22orf39 19428.410     22q11.21
    C22orf42 32545.519     22q12.3
    C22orf46 42086.547     22q13.2
    CABIN1 24407.820     22q11.23
    CABP7 30116.344     22q12.2
    CACNA1I 39966.758     22q13.1
    CACNG2 36956.916     22q13.1
    CBX6 39257.432     22q13.1
    CBY1 39052.658     22q12
    CCDC116 21987.086     22q11.21
    CCDC117 29168.662     22q12.1
    CCDC134 42196.626     22q13.2
    CCDC157 30752.627     22q12.2
    CCT8L2 17071.648     22q11.1
    CDC42EP1 37956.471     22q13.1
    CDC45 19467.349     22q11.21
    CDPF1 46639.910     22q13.31
    CECR1 17659.680     22q11.2
    CECR2 17840.839     22q11.2
    CECR3 17737.750     -
    CECR5 17618.410     -
    CECR5-AS1 17640.279     22q11.1
    CECR6 17597.189     -
    CECR7 17517.460     22q11.1
    CECR9 17809.924     -
    CELSR1 46756.731     22q13.3
    CENPM 42334.725     22q13.2
    CERK 47080.307     22q13.31
    CES5AP1 23701.793     22q11.23
    CHADL 41625.514     22q13.2
    CHCHD10 24108.021     22q11.23
    CHKB 51017.387     22q13.33
    CHKB-AS1 51021.455     22q13.33
    CHKB-CPT1B 51007.290     22q13.33
    CLDN5 19510.547     22q11.21
    COMT 19929.263     22q11.21
    CPT1B 51007.290     22q13.33
    CRELD2 50312.278     22q13.33
    CRKL 21271.714     22q11.21
    CRYBA4 27017.928     22q12.1
    CRYBB1 26995.362     22q12.1
    CRYBB2 25615.612     22q11.23
    CRYBB2P1 25844.054     22q11.2-q12.1
    CRYBB3 25595.817     22q11.23
    CSDC2 41957.014     22q13.2
    CSF2RB 37309.675     22q13.1
    CSNK1E 38686.697     22q13.1
    CYAT1 23222.938     -
    CYB5R3 43013.846     22q13.2
    CYP2D6 42522.501     22q13.1
    CYP2D7 42536.214     22q13
    CYTH4 37678.495     22q12.3-q13.1
    DDT 24313.554     22q11.23
    DDTL 24309.026     22q11.23
    DDX17 38879.443     22q13.1
    DENND6B 50750.392     22q13.33
    DEPDC5 32150.009     22q12.3
    DERL3 24176.690     22q11.23
    DESI1 41994.032     22q13.2
    DGCR10 19010.137     22q11
    DGCR11 19033.675     22q11.21
    DGCR12 19048.554     22q11.21
    DGCR14 19117.792     22q11.21|22q11.2
    DGCR2 19023.795     22q11.21
    DGCR5 18958.011     22q11
    DGCR6 18893.736     22q11.21|22q11
    DGCR6L 20301.761     22q11.21
    DGCR7 19014.355     22q11
    DGCR8 20067.755     22q11.2
    DGCR9 19005.347     22q11.21
    DMC1 38914.954     22q13.1
    DNAJB7 41255.554     22q13.2
    DNAL4 39174.513     22q13.1
    DRG1 31795.539     22q12.2
    DRICH1 23950.639     22q11.2
    DUSP18 31057.445     22q12.2
    DUXAP10 16150.260     14q11.2
    DUXAP8 16150.529     22q11.21
    EFCAB6 43924.624     22q13.2
    EFCAB6-AS1 43912.134     -
    EIF3D 36906.897     22q13.1
    EIF3L 38245.379     22q
    EIF4ENIF1 31835.345     22q11.2
    ELFN2 37764.000     22q13.1
    EMID1 29601.901     22q12.2
    ENTHD1 40139.049     22q13.1
    EP300-AS1 41581.219     22q13.2
    FAM109B 42470.255     22q13.2
    FAM118A 45705.081     22q13
    FAM19A5 48885.272     22q13.32
    FAM227A 38974.125     22q13.1
    FAM230A 20326.436     22q11.21
    FAM230B 21537.203     22q11.21
    FAM83F 40390.953     22q13.1
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    SMC1B 45739.945     22q13.31
    SMDT1 42475.695     22q13.2
    SMTN 31478.846     22q12.2
    SNAP29 21213.292     22q11.21
    SNORD125 29729.152     22q12.2
    SNORD43 39715.057     22q13
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    SNRPD3 24951.618     22q11.23
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    SPECC1L-ADORA2A 24666.785     22q11.23
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    ZNRF3-AS1 29420.987     -

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedJul 2015Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2015 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Fri Jul 24 14:51:41 CEST 2015


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