Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 22

Chromosome 22 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 22 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

t(1;22)(q21;q11) IGL/BCL9
t(1;22)(q21;q11)
t(1;22)(p13;q13) RBM15/MKL1
t(2;22)(p13;q11) (NHL; REL and IgL; rare)
t(2;22)(p23;q11) CLTCL1/ALK
t(2;22)(p23;q11) MYH9-ALK
t(3;22)(q27;q11) IGL/BCL6
t(4;22)(q12;q11.2) BCR/PDGFRA
t(6;22)(p21;q11)
t(6;22)(p25;q11) IRF4/IGL
t(7;22)(q21;q11) IGL/CDK6
t(8;22)(q24;q11) IGL/MYC
t(8;22)(p11;q11) BCR/FGFR1
t(8;22)(p11;q13)
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in ALL
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in AML
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in CML
t(9;22)(p24;q11.2)
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in treatment related leukemia
t(11;12)(p15;q13) NUP98/?
t(11;22)(q23;q11.2) KTM2A/SEPT5
t(11;22)(q23;q13) KTM2A/EP300
t(12;22)(p13;q11) IGL/CCND2
t(12;22)(p13;q12) EWSR1/ZNF384
t(12;22)(p13;q12) MN1/ETV6
t(14;22)(q32;q11) IGH/IGL
t(18;22)(q21;q11) IGL/BCL2
t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL
+22 or trisomy 22 (solely?)

Solid Tumors     

t(1;22)(q23;q12)
t(2;22)(q23;q12)
t(2;22)(q31;q12)
t(2;22)(q34;q12)
t(4;22)(q35;q12)
t(6;22)(p21;q12)
t(6;22)(p21;q12)
t(6;22)(p21;q12)
t(7;22)(p22;q12)
t(7;22)(p21.2;q11.23)
t(7;22)(p22;q12)
t(9;22)(q22;q12)
t(11;22)(p13;q11)
t(11;22)(q24;q12)
t(11;22)(p13;q12)
t(11;22)(q24;q12)
t(11;22)(q24;q12)
t(11;22)(q24;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;16)(q13;p11)
t(12;22)(q13;q12)
t(17;22)(q22;q13)
t(12;22)(q13;q12)
t(19;22)(q13;q12)
t(21;22)(q12;q12)
t(17;22)(q12;q12)
del(22)(q13.1)
del(22q)
t(17;22)(q22;q13)

Cancer prone diseases     

Neurofibromatosis type 2 (NF2)
Rhabdoid predisposition syndrome
Schwannomatosis

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 22 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE



External links     

  • Chromosome 22 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 22 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 22 - Ensembl Project
  • Chromosome 22 - Map View - NCBI
  • Chromosome 22 - OMIM Gene map
  • Chromosome 22 - Genomic Variants
  • Chromosome 22 - HAPMAP Project
  • Chromosome 22 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 22 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 22 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 22 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 22 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 22 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 22 Cancer GeneWeb
  • Chromosome 22 GeneCards (Weizmann)
  • IMGT, the international ImMunoGeneTics database (Montpellier,France)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

  • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ATF4 39916.569 22q13.1
    BCR 23522.552 22q11
    CBX7 39526.779 22q13.1
    CHEK2 29083.731 22q12.1
    CLTCL1 19166.987 22q11.2
    EP300 41488.614 22q13.2
    EWSR1 29663.998 22q12.2
    FBLN1 45898.719 22q13.31
    IGL 22712.136 22q11.2
    MAPK1 22113.947 22q11.2
    MAPK12 50691.331 22q13.3
    MCM5 35796.116 22q13.1-q13.2
    MIF 24236.565 22q11.23
    MKL1 40806.285 22q13
    MMP11 24115.036 22q11.23
    MN1 28144.265 22q12.1
    MYH9 36677.323 22q13.1
    NF2 29999.545 22q12.2
    PARVB 44395.091 22q13.2-q13.33
    PDGFB 39619.685 22q13.1
    RAC2 37621.301 22q13.1
    RBX1 41347.351 22q13.2
    SEPT5 19705.958 22q11.2
    SMARCB1 24129.150 22q11.23
    SOX10 38368.319 22q13.1
    TYMP 50964.181 22q13
    XRCC6 42017.295 22q13.2
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    A4GALT 43088.127 22q13.2
    ACO2 41865.129 22q13.2
    ADM2 50920.153 22q13.33
    ADORA2A 24823.530 22q11.23
    ADRBK2 25960.861 22q11
    AIFM3 21319.418 22q11.21
    AP1B1 29723.669 22q12.2
    APOBEC3A 39353.527 22q13.1-q13.2
    APOBEC3B 39378.404 22q13.1-q13.2
    APOBEC3C 39410.265 22q13.1-q13.2
    APOBEC3G 39473.010 22q13.1-q13.2
    APOBEC3H 39493.229 22q13.1
    APOL1 36649.117 22q13.1
    APOL2 36622.255 22
    APOL3 36536.371 22q13.1
    APOL6 36044.424 22q12.3
    ARFGAP3 43192.532 22q13.2
    ARHGAP8 45148.438 22q13.3
    ARVCF 19957.402 22q11.21
    BCL2L13 18121.350 22q11
    BID 18216.906 22q11.1
    BIK 43506.754 22q13.31
    BRD1 50166.937 22q13.33
    C1QTNF6 37576.206 22q13.1
    CABIN1 24407.820 22q11.23
    CARD10 37886.400 22q13.1
    CBX6 39260.248 22q13.1
    CBY1 39052.658 22q12
    CCDC134 42196.678 22q13.2
    CDC42EP1 37956.471 22q13.1
    CDC45 19467.349 22q11.21
    CECR1 17659.680 22q11.2
    CECR2 17956.628 22q11.2
    CERK 47080.307 22q13.31
    CHKB 51017.387 22q13.33
    CLDN5 19510.547 22q11.21
    COMT 19929.263 22q11.21
    CRKL 21271.714 22q11.21
    CSF2RB 37309.675 22q12.2-q13.1
    CSNK1E 38686.697 22q13.1
    CYP2D6 42522.501 22q13.1
    CYTH4 37678.495 22q12.3-q13.1
    DDT 24313.554 22q11.23
    DDX17 38879.443 22q13.1
    DEPDC5 32150.009 22q12.3
    DGCR6L 20301.761 22q11.21
    DGCR8 20067.755 22q11.2
    DMC1 38914.954 22q13.1
    DNAJB7 41255.554 22q13.2
    DRG1 31795.539 22q12.2
    GAL3ST1 30950.624 22q12.2
    GALR3 38219.389 22q113.1
    GCAT 38203.912 22q13.1
    GGT1 24999.124 22q11.23
    GNAZ 23412.669 22q11.1-q11.2
    GNB1L 19775.934 22q11.2
    GRAMD4 47022.658 22q13.31
    GRAP2 40297.086 22q13.2
    GSTT1 24376.139 22q11.23
    GSTT2 24322.314 22q11.23
    GTSE1 46692.638 22q13.2-q13.3
    H1F0 38201.114 22q13.1
    HDAC10 50683.613 22q13.31
    HIC2 21771.693 22q11.21
    HIRA 19318.224 22q11.2
    HMGXB4 35653.445 22q13
    HMOX1 35777.060 22q12
    HORMAD2 30476.453 22q12.2
    HSCB 29138.043 22q12.1
    IFT27 37154.246 22q13.1
    IGLV@ 23101.407 22q11.2
    IL17RA 17565.849 22q11.1
    IL2RB 37521.880 22q13.1
    INPP5J 31518.909 22q12.2
    KCNJ4 38822.333 22q13.1
    KIAA1671 25423.941 22q11.23
    KLHDC7B 50986.462 22q13.33
    LARGE 33669.062 22q12.3
    LDOC1L 44888.450 22q13.3
    LGALS1 38071.613 22q13.1
    LGALS2 37966.253 22q13.1
    LIF 30636.436 22q12.2
    LIMK2 31644.348 22q12
    MAFF 38597.939 22q13.1
    MAPK11 50702.142 22q13.33
    MAPK8IP2 51039.131 22q13.33
    MB 36002.811 22q13.1
    MED15 20861.886 22q11.2
    MFNG 37865.101 22q13.1
    MGAT3 39883.229 22q13.1
    MIR130B 22007.593 22
    MIR185 20020.662 22q11.21
    MIR33A 42296.948 22q13.2
    MIR650 23165.270 22q11.22
    MIRLET7A3 46508.629 22q13.31
    MIRLET7B 46509.566 22q13.31
    MORC2 31322.600 22q12.2
    MOV10L1 50528.435 22q13.33
    MRPL40 19420.036 22q11.2
    MTMR3 30279.158 22q12.2
    MYO18B 26138.120 22q12.1
    NAGA 42454.338 22q13.2
    NCF4 37257.030 22q13.1
    NEFH 29876.181 22q12.2
    NHP2L1 42069.937 22q13
    OSBP2 31089.769 22q12.2
    OSM 30658.819 22q12.2
    P2RX6 21369.442 22q11.21
    PANX2 50609.160 22q13.33
    PARVG 44568.836 22q13.31
    PATZ1 31721.790 22q12.2
    PES1 30972.612 22q12.1
    PICK1 38453.262 22q13.1
    PIK3IP1 31677.579 22q12.2
    PIM3 50354.143 22q13
    PITPNB 28247.657 22q12.1
    PLA2G3 31530.793 22q12.2
    PLA2G6 38507.502 22q13.1
    PLXNB2 50713.408 22q13.33
    PNPLA3 44319.619 22q13.31
    POLR2F 38349.674 22q13.1
    POM121L1P 22974.028 22q11.22
    PPARA 46546.499 22q12-q13.1
    PPIL2 22020.273 22q11.21
    PPM1F 22273.792 22q11.22
    PRAME 22890.123 22q11.22
    PRODH 18900.287 22q11.2
    PRR5 45064.427 22q13.3
    RAB36 23487.513 22q11.22
    RABL2B 51205.920 22q13.33
    RANBP1 20103.461 22q11.21
    RASD2 35937.352 22q13.1
    RASL10A 29708.922 22q12.2
    RBFOX2 36134.783 22q12-q13
    RGL4 24033.048 22q11.23
    RTDR1 23401.593 22q11.2
    RTN4R 20228.938 22q11
    SBF1 50883.431 22q13.33
    SCO2 50961.997 22q13.33
    SCUBE1 43599.229 22q13
    SDF2L1 21996.542 22q11.21
    SEC14L2 30792.930 22q12.2
    SEPT3 42372.931 22q13.2
    SEZ6L 26565.440 22q12.1
    SGSM3 40766.595 22q13.1-q13.2
    SHANK3 51113.070 22q13.3
    SLC2A11 24198.890 22q11.23
    SLC5A1 32439.019 22q12.3
    SMC1B 45739.945 22q13
    SMTN 31478.846 22q12
    SREBF2 42229.083 22q13.2
    SSTR3 37600.277 22q13.1
    ST13 41220.539 22q13.2
    SUSD2 24577.444 22q11-q12
    SYN3 32908.540 22q12.3
    TAB1 39795.759 22q13.1
    TBX1 19744.226 22q11.21
    TCN2 31003.070 22q12.2
    TEF 41763.337 22q13.2
    THOC5 29904.156 22q12
    TIMP3 33196.802 22q12.3
    TMPRSS6 37461.479 22q13.1
    TNFRSF13C 42321.036 22q13.1-q13.3
    TOB2 41829.492 22q13.2
    TOM1 35695.268 22q13.1
    TOMM22 39077.954 22q12-q13
    TOP3B 22311.397 22q11.22
    TRMT2A 20099.389 22q11.21
    TSPO 43547.520 22q13.3
    TTLL12 43562.628 22q13.31
    TUG1 31365.634 22q12.2
    TXN2 36863.093 22q13.1
    TXNRD2 19881.781 22q11.21
    UBE2L3 21903.736 22q11.2
    UFD1L 19437.464 22q11.2
    UPK3A 45680.868 22q13.31
    USP18 18632.758 22q11.21
    VPREB1 22599.200 22q11.2
    VPREB3 24094.930 22q11.23
    WNT7B 46316.248 22q13
    XBP1 29190.548 22q12.1
    YPEL1 22051.826 22q11.2
    YWHAH 32340.479 22q12.1-q13.1
    ZNF74 20748.405 22q11.2

    GeneCards  

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedApr 2014Jean-Loup Huret, Philippe Dessen

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Apr 2014 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Fri Apr 18 17:44:27 CEST 2014

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