Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 22

Chromosome 22 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 22 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

t(1;22)(q21;q11)
t(1;22)(q21;q11)
t(1;22)(p13;q13)
t(2;22)(p13;q11) (NHL; REL and IgL; rare)
t(2;22)(p23;q11.2)
t(2;22)(p23;q11.2)
t(3;22)(q27;q11)
t(4;22)(q12;q11.2)
t(7;22)(q21;q11)
t(8;22)(q24;q11)
t(8;22)(p11;q11)
t(8;22) (p11;q13)
t(9;22)(q34;q11) in ALL
t(9;22)(q34;q11) in ANLL
t(9;22)(q34;q11) in CML
t(9;22)(p24;q11.2)
t(9;22)(q34;q11) in treatment related leukemia
t(11;12)(p15;q13)
t(11;22)(q23;q11.2)
t(11;22)(q23;q13)
t(12;22)(p13;q11) (NHL; CCND2 and IgL; rare)
t(12;22)(p13;q11) (AML; MN1 and ETV6; rare)
t(12;22)(p13;q12)
t(12;22)(p13;q11-12)
t(14;22)(q32;q11) (MPD, AML, ALL, T-NHL, CLD; -; not rare)
t(14;22)(q32;q11)
t(18;22)(q21;q11)
t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL
+22 or trisomy 22 (solely?)

Solid Tumors     

t(2;22)(q23;q12)
t(7;22)(p22;q12)
t(7;22)(p22;q12)
t(9;22)(q22;q12)
t(11;22)(p13;q11)
t(11;22)(q24;q12)
t(11;22)(p13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;22)(q13;q12)
t(12;16)(q13;p11)
t(17;22)(q22;q13)
t(12;22)(q13;q12)
t(21;22)(q12;q12)
t(17;22)(q12;q12)
del(22)(q13.1)
del(22q)
t(17;22)(q22;q13)
t(21;22)(q22;q12)

Cancer prone diseases     

Neurofibromatosis type 2 (NF2)
Rhabdoid predisposition syndrome
Schwannomatosis

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 22 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 22 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 22 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 22 - Ensembl Project
  • Chromosome 22 - Map View - NCBI
  • Chromosome 22 - OMIM Gene map
  • Chromosome 22 - Genomic Variants
  • Chromosome 22 - HAPMAP Project
  • Chromosome 22 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 22 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 22 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 22 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 22 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 22 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 22 Cancer GeneWeb
  • Chromosome 22 GeneCards (Weizmann)
  • IMGT, the international ImMunoGeneTics database (Montpellier,France)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

    • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ATF4 39916.568 22q13.1
    BCR 23522.805 22q11|22q11.23
    CHEK2 29083.887 22q11|22q12.1
    CLTCL1 19166.988 22q11.2|22q11.21
    EWSR1 29664.325 22q12.2
    IGL@ 22712.135 22q11.2
    MAPK12 50692.212 22q13.33
    MIF 24236.661 22q11.23
    MKL1 40806.292 22q13
    MMP11 24115.035 22q11.2|22q11.23
    MN1 28146.904 22q11|22q12.1
    MYH9 36677.326 22q13.1
    NF2 30093.555 22q12.2
    PARVB 44420.210 22q13.2-q13.33
    PDGFB 39619.688 22q12.3-q13.1|22q13.1
    RAC2 37621.301 22q13.1
    RBX1 41347.421 22q13.2
    SMARCB1 24129.356 22q11.23|22q11
    SOX10 38368.475 22q13.1
    TYMP 50966.220 22q13|22q13.33
    XRCC6 42017.298 22q13.2
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    A4GALT 43088.127 22q13.2
    ADM2 50920.274 22q13.33
    ADORA2A 24823.536 22q11.23
    ADRBK2 26123.530 22q11|22q12.1
    ADSL 40742.506 22q13.1|22q13.2
    AIFM3 21319.433 22q11.21
    APOBEC3A 39353.636 22q13.1-q13.2
    APOBEC3B 39378.404 22q13.1-q13.2
    APOBEC3C 39410.299 22q13.1
    APOBEC3G 39473.366 22q13.1-q13.2
    APOBEC3H 39493.243 22q13.1
    APOL3 36536.378 22q13.1
    APOL6 36059.292 22q12.3
    ARHGAP8 45182.407 22q13.31
    BCL2L13 18189.221 22q11.1
    BID 18217.977 22q11.1
    BIK 43506.773 22q13.31
    BRD1 50166.925 22q13.33
    C1QTNF6 37576.210 22q13.1
    CARD10 37887.282 22q13.1
    CBX6 39265.576 22q13.1
    CBX7 39526.789 22q13.1
    CBY1 39067.071 22q12
    CDC45 19467.467 22q11.21
    CERK 47080.307 22q13.31
    CHKB 51017.392 22q13.33
    CLDN5 19510.549 22q11.21
    COMT 19929.315 22q11.21-q11.23|22q11.21
    CSF2RB 37319.798 22q13.1
    CSNK1E 38687.923 22q13.1
    CYP2D7P1 42537.251 22q13
    CYTH4 37678.494 22q12.3-q13.1
    DDT 24313.584 22q11.23
    DGCR6L 20301.808 22q11
    DMC1 38915.084 22q13.1
    DNAJB7 41255.554 22q13.2
    DRG1 31795.608 22q12.2
    FBLN1 45898.855 22q13.31
    GAL3ST1 30950.940 22q12.2
    GALR3 38219.413 22q13.1
    GCAT 38203.971 22q13.1
    GGT1 24999.113 22q11.23
    GNAZ 23437.882 22q11.22
    GNB1L 19770.746 22q11.2
    GRAP2 40297.156 22q13.2
    GSTT1 24376.423 22q11.23
    GTSE1 46693.284 22q13.2-q13.3
    HDAC10 50683.878 22q13.31
    HIC2 21771.692 22q11.21
    HMOX1 35779.103 22q12|22q13.1
    HSCB 29138.069 22q12.1
    IL2RB 37524.135 22q13|22q13.1
    INPP5J 31518.951 22q12.2
    KCNJ4 38822.959 22q13.1
    LARGE 33669.074 22q12.3
    LDOC1L 44888.463 22q13.31
    LGALS1 38071.660 22q13.1
    LGALS2 37966.253 22q12-q13|22q13.1
    LIF 30639.639 22q12.2
    LIMK2 31608.394 22q12.2
    MAFF 38598.107 22q13.1
    MAPK11 50703.377 22q13.33
    MAPK8IP2 51039.130 22q13.33
    MB 36002.816 22q13.1
    MCM5 35806.401 22q13.1
    MED15 20861.888 22q11.2
    MGAT3 39885.802 22q13.1
    MOV10L1 50528.493 22q13.33
    MRPL40 19420.065 22q11.21
    MTMR3 30279.238 22q12.2
    MYO18B 26165.993 22q12.1
    NAGA 42455.769 22q13-qter|22q11
    NHP2L1 42070.812 22q13
    OSBP2 31090.884 22q12.2
    OSM 30659.928 22q12.2
    P2RX6 21369.448 22q11.21
    PANX2 50609.189 22q13.33
    PARVG 44576.856 22q13.31
    PATZ1 31721.795 22q12.2
    PES1 30973.035 22q12.1
    PIK3IP1 31685.023 22q12.2
    PIM3 50354.160 22q13
    PITPNB 28247.657 22q12.1
    PLA2G3 31530.794 22q12.2
    PLA2G6 38507.501 22q13.1
    PLXNB2 50713.409 22q13.33
    POLR2F 38349.705 22q13.1
    POM121L1P 22981.647 22q11.22
    POTEM 16251.594 14q11.2
    PPARA 46635.711 22q12-q13.1|22q13.31
    PPM1F 22277.360 22q11.22
    PRAME 22890.123 22q11.22
    PRAMEL 22345.496 22q11.22
    PRR5 45098.133 22q13
    RAB36 23487.512 22q11.22
    RABL2B 51205.936 22q13.33
    RASD2 35942.820 22q13.1
    RASL10A 29708.922 22q12.2
    RGL4 24030.322 22q11.23
    RTDR1 23401.593 22q11.2
    RTN4R 20229.226 22q11.21
    SBF1 50900.134 22q13.33
    SCO2 50961.998 22q13.33
    SDF2L1 21996.605 22q11.21
    SEC14L2 30793.030 22q12.2
    SEPT3 42383.273 22q13.2
    SEZ6L 26565.479 22q12.1
    SMTN 31484.498 22q12.2
    SREBF2 42229.253 22q13
    SSTR3 37602.151 22q13.1
    ST13 41220.602 22q13.2
    SYN3 32909.399 22q12.3
    TAB1 39795.788 22q13.1
    TBX1 19744.225 22q11.21
    TCN2 31003.273 22q12.2
    TEF 41763.478 22q13|22q13.2
    THOC5 29901.867 22q12.2
    TIMP3 33257.579 22q12.1-q13.2|22q12.3
    TMPRSS6 37462.084 22q12.3
    TNFRSF13C 42321.035 22q13.1-q13.31
    TOB2 41832.241 22q13.2
    TOM1 35743.074 22q13.1
    TOP3B 22311.403 22q11.22
    TSPO 43555.321 22q13.31
    TXNRD2 19863.039 22q11.21
    UBE2L3 21922.018 22q11.21
    UFD1L 19438.194 22q11.21
    UPK3A 45681.865 22q13.31
    USP18 18640.421 22q11.21
    VPREB1 22599.199 22q11.2|22q11.22
    VPREB3 24094.933 22q11.23|22q11
    WNT7B 46317.658 22q13
    XBP1 29190.556 22q12.1|22q12
    YPEL1 22051.837 22q11.2
    YWHAH 32340.636 22q12.3
    ZNF74 20748.692 22q11.2|22q11.21

    GeneCards  

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    Updated Jean-Loup Huret, Philippe Dessen

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Wed Sep 1 08:32:02 CEST 2010
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