Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Chromosome 22

Chromosome 22 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 22 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

+22 or trisomy 22 (solely?)
t(1;22)(p13;q13) RBM15/MKL1
t(1;22)(q21;q11) IGL/BCL9
t(1;22)(q21;q11)
t(2;22)(p23;q11) CLTCL1/ALK
t(2;22)(p23;q11) MYH9/ALK
t(3;22)(q27;q11) IGL/BCL6
t(4;22)(q12;q11.2) BCR/PDGFRA
t(6;22)(p25;q11) IRF4/IGL
t(6;22)(p21;q11)
t(7;22)(q21;q11) IGL/CDK6
t(8;22)(p11;q11) BCR/FGFR1
t(8;22)(p11;q13) KAT6A/EP300
t(8;22)(q24;q11) IGL/MYC
t(9;22)(p24;q11.2)
t(9;22)(p13;q13) PAX5/BRD1
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in ALL
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in AML
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in CML
t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 in treatment related leukemia
t(11;22)(q23;q11.2) KMT2A/SEPT5
t(11;22)(q23;q13) KMT2A/EP300
t(12;22)(p13;q11) IGL/CCND2
t(12;22)(p13;q12) MN1/ETV6
t(12;22)(p13;q12) EWSR1/ZNF384
t(14;22)(q32;q11) IGH/IGL
t(18;22)(q21;q11)
t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL

Solid Tumors     

del(22)(q13)
inv(22)(q12q12) EWSR1/PATZ1
inv(22)(q12q12) EWSR1/PATZ1
inv(22)(q13q13) TTLL1/TSPO
t(1;22)(p36;q11) SMARCB1/WASF2
t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1
t(1;22)(q23;q12) EWSR1/PBX1
t(2;22)(q31;q12) EWSR1/SP3
t(2;22)(q31;q12) EWSR1/SP3
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1
t(2;22)(q34;q12) EWSR1/CREB1
t(2;22)(q36;q12) EWSR1/FEV
t(2;22)(q36;q12) EWSR1/FEV
t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4
t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4
t(4;22)(q35;q12) EWSR1/DUX4
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
t(7;22)(p22;q12) EWSR1/ETV1
t(7;22)(p22;q12) EWSR1/ETV1
t(7;22)(p21;q11) HERVK22Q11/ETV1
t(9;22)(q22;q12) EWSR1/NR4A3
t(9;22)(q22;q12) EWSR1/NR4A3
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
t(11;22)(p13;q11) EWSR1/WT1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/DDIT3
t(12;22)(q13;q12) EWSR1/ATF1
t(14;22)(q32;q12) EWSR1/YY1
t(15;22)(q21;q12) MCM5/TRPM7
t(17;22)(p13;q12) USP6/MYH9
t(17;22)(q21;q12) EWSR1/ETV4
t(17;22)(q21;q12) EWSR1/ETV4
t(17;22)(q22;q13) COL1A1-PDGFB
t(17;22)(q22;q13) COL1A1/PDGFB
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444
t(19;22)(q13;q12) EWSR1/ZNF444
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2
t(20;22)(q13;q12) EWSR1/NFATC2
t(21;22)(q21;q12) EWSR1/ERG
t(21;22)(q21;q12) EWSR1/ERG

Cancer prone diseases     

Neurofibromatosis type 2 (NF2)
Rhabdoid predisposition syndrome
Schwannomatosis

All Genes by Location (Kb)

Chromosome 22 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE



External links     

  • Chromosome 22 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 22 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 22 - Ensembl Project
  • Chromosome 22 - Map View - NCBI
  • Chromosome 22 - OMIM Gene map
  • Chromosome 22 - Genomic Variants
  • Chromosome 22 - HAPMAP Project
  • Chromosome 22 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 22 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 22 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 22 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 22 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 22 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 22 Cancer GeneWeb
  • IMGT, the international ImMunoGeneTics database (Montpellier,France)
  • Human Proteomics Initiative (UniProt)
  • Cytogenetic marker FISH (Abbott)
  • FISH Probes DAKO
  • SureFISH Probes
  • CytoCell
  • Kreatech Diagnostic/

  • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ATF4 39916.564 22q13.1
    BCR 23522.552 22q11
    CARD10 37886.400 22q13.1
    CBX7 39526.779 22q13.1
    CHEK2 29083.731 22q12.1
    CLTCL1 19166.987 22q11.2
    EP300 41488.614 22q13.2
    EWSR1 29663.998 22q12.2
    FBLN1 45898.719 22q13.31
    IGL 22712.136 22q11.2
    MAPK1 22113.947 22q11.2
    MAPK12 50691.331 22q13.3
    MCM5 35796.116 22q13.1-q13.2
    MIF 24236.565 22q11.23
    MKL1 40806.285 22q13
    MMP11 24115.036 22q11.23
    MN1 28144.265 22q12.1
    MYH9 36677.323 22q13.1
    NF2 29999.545 22q12.2
    PARVB 44395.091 22q13.2-q13.33
    PDGFB 39619.685 22q13.1
    PRAME 22890.118 22q11.22
    RAC2 37621.301 22q13.1
    RBX1 41347.351 22q13.2
    SEPT5 19705.958 22q11.2
    SMARCB1 24129.150 22q11.23
    SOX10 38368.319 22q13.1
    TYMP 50964.181 22q13
    XRCC6 42017.346 22q13.2
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    A4GALT 43088.127 22q13.2
    ACO2 41865.129 22q13.2
    ACR 51176.652 22q13.33
    ADM2 50920.153 22q13.33
    ADORA2A 24823.530 22q11.23
    ADORA2A-AS1 24825.178 22q11.23
    ADRBK2 25960.861 22q11
    ADSL 40742.504 22q13.1
    AIFM3 21319.418 22q11.21
    ALG12 50296.854 22q13.33
    ANKRD54 38226.862 22q13.1
    ANKRD62P1-PARP4P3 17134.599 22q11.1
    AP1B1 29723.669 22q12.2
    AP1B1P1 32517.964 22q12.3
    APOBEC3A 39353.527 22q13.1-q13.2
    APOBEC3A_B 39353.527 22q13 GRCh37 novel patch
    APOBEC3B 39378.404 22q13.1-q13.2
    APOBEC3B-AS1 39387.564 22q13.1
    APOBEC3C 39410.265 22q13.1-q13.2
    APOBEC3D 39417.118 22q13.1
    APOBEC3F 39436.673 22q13.1-q13.2
    APOBEC3G 39473.010 22q13.1-q13.2
    APOBEC3H 39493.229 22q13.1
    APOL1 36649.117 22q13.1
    APOL2 36622.255 22
    APOL3 36536.371 22q13.1
    APOL4 36585.176 22q11.2-q13.2
    APOL5 36113.919 22q12.3
    APOL6 36044.424 22q12.3
    ARFGAP3 43192.532 22q13.2
    ARHGAP8 45148.438 22q13.3
    ARSA 51061.182 22q13.31-qter
    ARVCF 19957.402 22q11.21
    ASCC2 30184.597 22q12.1
    ASPHD2 26825.280 22q12.1
    ATP5L2 43035.809 22q13.2
    ATP6V1E1 18074.903 22q11.2
    ATXN10 46067.678 22q13
    BAIAP2L2 38480.896 22q13.1
    BCL2L13 18121.350 22q11
    BCRP2 21457.305 22q11
    BCRP3 25028.882 22q11
    BID 18216.906 22q11.1
    BIK 43506.754 22q13.31
    BMS1P20 22652.523 22q11.22
    BPIFC 32809.834 22q12.3
    BRD1 50166.937 22q13.33
    C1QTNF6 37576.206 22q13.1
    C22orf15 24105.208 22q11.23
    C22orf23 38339.057 22q13.1
    C22orf24 32329.507 22q12.1-q12.3
    C22orf29 19833.661 22q11.21
    C22orf31 29454.660 22q12.1
    C22orf34 50014.104 22q13.33
    C22orf39 19428.410 22q11.21
    C22orf42 32545.519 22q12.3
    C22orf46 42086.547 22q13.2
    CABIN1 24407.820 22q11.23
    CABP7 30116.344 22q12.2
    CACNA1I 39966.758 22q13.1
    CACNG2 36956.916 22q13.1
    CBX6 39260.248 22q13.1
    CBY1 39052.658 22q12
    CCDC116 21987.086 22q11.21
    CCDC117 29168.662 22q12.1
    CCDC134 42196.678 22q13.2
    CCDC157 30752.627 22q12.2
    CCT8L2 17071.648 22q11.1
    CDC42EP1 37956.471 22q13.1
    CDC45 19467.349 22q11.21
    CDPF1 46639.910 22q13.31
    CECR1 17659.680 22q11.2
    CECR2 17840.839 22q11.2
    CECR3 17737.750 22q11.2
    CECR5 17618.410 22q11.2
    CECR5-AS1 17640.279 22q11.2
    CECR6 17597.189 22q11.2
    CECR7 17517.460 22q11.2
    CECR9 17809.924 22q11.2
    CELSR1 46756.731 22q13.31
    CENPM 42334.741 22q13.2
    CERK 47080.307 22q13.31
    CES5AP1 23701.793 22q11.23
    CHADL 41625.514 22q13.2
    CHCHD10 24108.021 22q11.23
    CHKB 51017.387 22q13.33
    CHKB-AS1 51021.455 22q13.33
    CHKB-CPT1B 51007.290 22q13.33
    CLDN5 19510.547 22q11.21
    COMT 19929.263 22q11.21
    CPT1B 51007.290 22q13.33
    CRELD2 50312.278 22q13.33
    CRKL 21271.714 22q11.21
    CRYBA4 27017.928 22q12.1
    CRYBB1 26995.362 22q12.1
    CRYBB2 25615.612 22q11.23
    CRYBB2P1 25844.054 22q11.2-q12.1
    CRYBB3 25595.817 22q11.23
    CSDC2 41957.014 22q13.2
    CSF2RB 37309.675 22q12.2-q13.1
    CSNK1E 38686.697 22q13.1
    CYAT1 23222.938 -
    CYB5R3 43013.846 22q13.2
    CYP2D6 42522.501 22q13.1
    CYP2D7 42536.214 22q13.2
    CYTH4 37678.495 22q12.3-q13.1
    DDT 24313.554 22q11.23
    DDTL 24309.026 22q11.23
    DDX17 38879.443 22q13.1
    DENND6B 50750.392 22q13.33
    DEPDC5 32150.009 22q12.3
    DERL3 24176.690 22q11.23
    DESI1 41994.032 22q13.2
    DGCR10 19010.137 22q11
    DGCR11 19033.675 22q11.21
    DGCR12 19048.554 22q11.21
    DGCR14 19117.792 22q11.21
    DGCR2 19023.795 22q11.21
    DGCR5 18958.027 22q11
    DGCR6 18893.736 22q11.21
    DGCR6L 20301.761 22q11.21
    DGCR7 19014.355 22q11
    DGCR8 20067.755 22q11.2
    DGCR9 19005.347 22q11.21
    DMC1 38914.954 22q13.1
    DNAJB7 41255.554 22q13.2
    DNAL4 39174.513 22q13.1
    DRG1 31795.539 22q12.2
    DRICH1 23950.639 22q11.2
    DUSP18 31058.039 22q12.2
    DUXAP10 16150.260 14q11.2
    DUXAP8 16150.529 22q11.21
    EFCAB6 43924.624 22q13.2
    EFCAB6-AS1 43912.134 -
    EIF3D 36906.897 22q13.1
    EIF3L 38245.379 22q
    EIF4ENIF1 31835.345 22q11.2
    ELFN2 37764.000 22q13.1
    EMID1 29601.901 22q12.2
    ENTHD1 40139.049 22q13.1
    EP300-AS1 41581.219 22q13.2
    FAM109B 42470.255 22q13.2
    FAM118A 45705.081 22q13.3
    FAM19A5 48885.272 22q13.32
    FAM227A 38974.125 22q13.1
    FAM230A 20326.436 22q11.21
    FAM230B 21537.203 22q11.21
    FAM83F 40390.953 22q13.1
    FBXO7 32871.224 22q11.2-qter
    FBXW4P1 23604.954 22q11
    FLJ30901 43593.289 22q13.31
    FLJ41941 18512.151 22q11.21
    FLJ44385 49942.329 22q13.33
    FLJ90680 37242.075 22q12.3
    FOXRED2 36883.233 22q12.3
    GAB4 17442.827 22q11.2
    GAL3ST1 30950.624 22q12.2
    GALR3 38219.389 22q113.1
    GAS2L1 29702.985 22q12.2
    GATSL3 30681.107 22q12
    GCAT 38203.912 22q13.1
    GGA1 38004.481 22q13.31
    GGT1 24999.124 22q11.23
    GGT2 21562.262 22q11.21
    GGT3P 18761.202 22q11.21
    GGT5 24615.622 22q11.23
    GGTLC2 22987.091 22q11.21
    GNAZ 23412.669 22q11.1-q11.2
    GNB1L 19775.934 22q11.2
    GP1BB 19711.066 22q11.21-q11.23
    GRAMD4 47022.658 22q13.31
    GRAP2 40322.595 22q13.2
    GSC2 19136.504 22q11.21
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    RTCB 32783.562 22q12.3
    RTDR1 23401.593 22q11.2
    RTN4R 20228.938 22q11
    SAMM50 44351.261 22q13.31
    SBF1 50883.431 22q13.33
    SCARF2 20778.874 22q11.21
    SCO2 50961.997 22q13.33
    SCUBE1 43599.229 22q13
    SDC4P 30877.277 22q12.2
    SDF2L1 21996.542 22q11.21
    SEC14L2 30792.930 22q12.2
    SEC14L3 30855.216 22
    SEC14L4 30884.898 22q12.1
    SEC14L6 30920.917 22q12.2
    SELM 31500.763 22q12.2
    SELO 50639.408 22q13.33
    SEPT3 42372.931 22q13.2
    SEPT5-GP1BB 19704.743 22q11.21
    SERHL2 42949.868 22q13
    SERHL 42896.585 22q13.2-q13.31
    SERPIND1 21128.383 22q11.21
    SEZ6L 26565.440 22q12.1
    SF3A1 30727.977 22q12.2
    SFI1 31892.125 22q12.2
    SGSM1 25202.136 22q11.23
    SGSM3 40766.595 22q13.1-q13.2
    SH3BP1 38035.684 22q13.1
    SHANK3 51113.070 22q13.3
    SHISA8 42305.558 22q13.2
    SLC16A8 38474.144 22q12.3-q13.2
    SLC25A1 19163.088 22q11
    SLC25A17 41165.634 22q13.2
    SLC25A18 18043.183 22q11.2
    SLC2A11 24198.890 22q11.23
    SLC35E4 31031.793 22q12.2
    SLC5A1 32439.019 22q12.3
    SLC5A4 32614.463 22q12.3
    SLC7A4 21383.007 22q11.21
    SMC1B 45739.945 22q13
    SMDT1 42475.695 22q13.2
    SMTN 31478.846 22q12
    SNAP29 21213.292 22q11.21
    SNORD125 29729.152 22q12.2
    SNORD43 39715.057 22q13.1
    SNORD83A 39711.218 22q13.1
    SNORD83B 39709.824 22q13.1
    SNRPD3 24951.618 22q11.23
    SPECC1L 24666.785 22q11.23
    SPECC1L-ADORA2A 24666.785 22q11.23
    SREBF2 42229.083 22q13.2
    SRRD 26879.850 22q12.1
    SSTR3 37600.277 22q13.1
    ST13 41220.539 22q13.2
    SULT4A1 44220.387 22q13.2
    SUN2 39130.719 22q12-q13
    SUSD2 24577.444 22q11-q12
    SYCE3 50989.541 22q13.33
    SYN3 32908.540 22q12.3
    SYNGR1 39745.954 22q13
    TAB1 39795.759 22q13.1
    TANGO2 20004.523 22q11.21
    TBC1D10A 30687.979 22q12.2
    TBC1D22A 47158.514 22q13
    TBC1D22A-AS1 47309.988 22q13.31
    TBX1 19744.226 22q11.21
    TCF20 42556.019 22q13.3
    TCN2 31003.070 22q12.2
    TEF 41763.337 22q13.2
    TEX33 37387.160 22q12.3
    TFIP11 26887.894 22q12.1
    THAP7 21354.061 22q11.2
    THAP7-AS1 21356.211 22q11.21
    THOC5 29904.156 22q12
    TIMP3 33196.802 22q12.3
    TMEM184B 38615.298 22q12
    TMEM191A 21055.220 22q11.21
    TMEM191B 20377.669 22q11.21
    TMEM191C 21821.459 22q11.21
    TMEM211 25331.208 22q11.23
    TMPRSS6 37461.476 22q13.1
    TNFRSF13C 42321.036 22q13.1-q13.3
    TNRC6B 40440.821 22q13
    TOB2 41829.492 22q13.2
    TOM1 35695.268 22q13.1
    TOMM22 39077.954 22q12-q13
    TOP1P2 25160.468 22q11.23
    TOP3B 22311.397 22q11.22
    TPST2 26921.714 22q12.1
    TPTEP1 17082.801 22q11.1
    TRABD 50624.360 22q13.33
    TRIOBP 38092.995 22q13.1
    TRMT2A 20099.389 22q11.21
    TRMU 46731.298 22q13
    TSPO 43547.520 22q13.3
    TSSK2 19118.321 22q11.21
    TST 37406.900 22q13.1
    TTC28 28374.002 22q12.1
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    TTC38 46663.861 22q13
    TTLL12 43562.628 22q13.31
    TTLL1 43435.523 22q13.1
    TUBA3FP 21362.496 22q11.21
    TUBA8 18593.453 22q11
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    TUG1 31365.197 22q12.2
    TXN2 36863.093 22q13.1
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    UBE2L3 21903.736 22q11.2
    UFD1L 19437.464 22q11.2
    UPB1 24891.251 22q11.2
    UPK3A 45680.868 22q13.31
    UQCR10 30163.358 22q12.2
    USP18 18632.758 22q11.21
    USP41 20717.911 22q11.22
    VPREB1 22599.200 22q11.2
    VPREB3 24094.930 22q11.23
    WBP2NL 42394.729 22q13.2
    WNT7B 46316.248 22q13
    XBP1 29190.548 22q12.1
    XKR3 17264.306 22q11.1
    XPNPEP3 41253.085 22q13.2
    YDJC 21982.378 22q11.21
    YPEL1 22051.826 22q11.2
    YWHAH 32340.479 22q12.1-q13.1
    ZBED4 50247.497 22q13.33
    ZC3H7B 41697.507 22q13.2
    ZDHHC8 20119.364 22q11.21
    ZMAT5 30126.945 22cen-q12.3
    ZNF280A 22868.061 22q11.21
    ZNF280B 22838.772 22q11.2
    ZNF70 24083.772 22q11.23
    ZNF74 20748.405 22q11.2
    ZNRF3 29279.755 22q12.1
    ZNRF3-AS1 29420.987 -

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedDec 2014Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Dec 2014 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_22.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Sun Dec 21 03:39:04 CET 2014


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