Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 5

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Chromosome 5 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome 5 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

List of all genes in the Atlas by location on chromosome 5

ENTITIES: by Chromosome band

5 5p 5q 5p15 5p14 5p13 5p12 5p11 5q11 5q12 5q13 5q14 5q15 5q21 5q22 5q23 5q31 5q32 5q33 5q34 5q35
Leukemias  Tumors  Kprones  External links  Genes  

Leukaemia     

Annotated Leukemias
del (5q) solely in Myelodysplastic syndrome
del(5q) in acute lymphoblastic leukemia (ALL)
del(5q) in myeloid neoplasms
del(5)(q32q33) EBF1::PDGFRB
dic(5;17)(q11-14;p11-13)
+5 or trisomy 5
i(5)(p10) in hematological malignancies
i(5)(p10) in acute myeloid leukemia
ins(5;11)(q31;q13q23) KMT2A::AFF4
t(1;5)(p32;q31) ?::TAL1
t(1;5)(p32;q31) without TAL1 rearrangement
der(5)t(1;5)(q12-q25;q13-q35)
t(1;5)(q21-23;q31-33)
t(1;5)(q21-23;q32) TPM3::PDGFRB
t(1;5)(q21;q32) PDE4DIP::PDGFRB
t(2;5)(p23;q35) NPM1::ALK
t(2;5)(p23;q35) SQSTM1::ALK
t(2;5)(p21;q33) SPTBN1::PDGFRB
t(3;5)(p21;q32) RBM6::CSF1R
t(3;5)(q21;q31)
t(3;5)(q25;q34) NPM1::MLF1
t(3;5)(q26;q31) H2AFY::MECOM
t(3;5)(q26;q34) ?::MECOM
t(4;5)(q21;q33) PRKG2::PDGFRB
t(4;5)(q31;q31)
t(5;6)(q33;q23) CEP85L::PDGFRB
t(5;7)(q33;q11) HIP1::PDGFRB
t(5;7)(q35;q21) TLX3::CDK6
t(5;9)(q14.1;p24) SSBP2::JAK2
t(5;9)(q32;p24) KANK1::PDGFRB
t(5;9)(q33;q22) ITK::SYK
t(5;9)(q35;q34) SQSTM1::NUP214
t(5;10)(q33;q21) CCDC6::PDGFRB
t(5;11)(q31;q23) KMT2A::ARHGAP26
t(5;11)(q33;p13) CAPRIN1::PDGFRB
t(5;11)(q33;q13) NUMA1::PDGFRB a novel fusion
t(5;11)(q35;p15.5) NUP98::NSD1
t(5;11)(q35;q12) NSD1::FEN1
t(5;12)(p13;p13) NIPBL::ETV6
t(5;12)(q13;p13) ?::ETV6
t(5;12)(q31;p13) ETV6::ACSL6 in MDS,AML and AEL
t(5;12)(q33;p13) ETV6::PDGFRB
t(5;12)(q33;p13) ERC1::PDGFRB
t(5;12)(q33;p13) ATF7IP::PDGFRB
t(5;12)(q33;q24) GIT2::PDGFRB
t(5;14)(q31;q32) IGH::IL3
t(5;14)(q33;q24) NIN::PDGFRB
t(5;14)(q33;q32) PDGFRB::TRIP11
t(5;14)(q33;q32) PDGFRB::CCDC88C
t(5;14)(q35;q11) RANBP17 (or TLX3)::TRD
t(5;14)(q35;q11) TRD::NKX2-5
t(5;14)(q35;q32) BCL11B::TLX3
t(5;14)(q35;q32.2) BCL11B::TLX3 and NKX2-5
t(5;15)(p15;q11)
t(5;15)(q33;q22) TP53BP1::PDGFRB
t(5;16)(q32;p13) NDE1::PDGFRB
t(5;16)(q33;q22)
t(5;17)(p11;q11)
t(5;17)(q11-12;q11-12)
t(5;17)(q13;q21)
t(5;17)(q33;p13) RABEP1::PDGFRB
t(5;17)(q33;p11.2) SPECC1::PDGFRB
t(5;17)(q35;q21) without RARA involvement in non-M3 AML
t(5;17)(q35;q21) NPM1::RARA
t(5;21)(q13;q22) RUNX1::?
Other Leukemias
PRKAA1::TTC33 (5p13)
HARS2::ZMAT2 (5q31)
SKP1::AFF4 (5q31)
YIPF5::NR3C1 (5q31)
LMAN2::NSD1 (5q35)
PDGFRB::MYO18A ()
t(1;5)(p36;q21) CHD1::MTOR
t(1;5)(p36;q21) MTOR::CHD1
t(1;5)(q21;q32) TPM3::PDGFRB
t(1;5)(q22;q33) MEF2D::CSF1R
t(1;5)(q31;q15) CDC73::FAM172A
t(1;5)(q31;q15) FAM172A::CDC73
t(2;5)(q37;p13) HDAC4::GHR
t(3;5)(p22;q32) GOLGA4::PDGFRB
t(3;5)(q13;q32) GOLGB1::PDGFRB
t(3;5)(q26;q32) TBL1XR1::CSF1R
t(5;5)(q14;q21) SSBP2::FER
t(5;5)(q14;q32) SSBP2::CSF1R
t(5;5)(q14;q33) CLINT1::MEF2C
t(5;5)(q32;q33) TNIP1::PDGFRB
t(5;5)(q32;q33) CD74::PDGFRB
t(5;6)(q13;q23) MYB::BDP1
t(5;7)(p13;p15) NIPBL::HOXA9
t(5;7)(p13;q34) IL7R::TRBC2
t(5;7)(q14;q32) EDIL3::MKLN1
t(5;7)(q31;q34) FCHSD1::BRAF
t(5;8)(q35;p11) FGFR1::SQSTM1
t(5;8)(q35;p11) SQSTM1::FGFR1
t(5;9)(q23;q34) SNX2::ABL1
t(5;9)(q33;p24) EBF1::JAK2
t(5;9)(q33;p24) JAK2::EBF1
t(5;10)(q35;p12) HNRNPH1::MLLT10
t(5;11)(q11;q23) MTREX::SIK3
t(5;11)(q12;q23) CENPK::KMT2A
t(5;11)(q14;q23) MEF2C::KMT2A
t(5;11)(q23;q23) KMT2A::PRRC1
t(5;11)(q31;p11) TCF7::SPI1
t(5;11)(q31;q23) KMT2A::MATR3
t(5;11)(q33;q23) KMT2A::CCNJL
t(5;11)(q35;p15) STIM1::NSD1
t(5;12)(q12;p13) ZNF384::RNF180
t(5;12)(q31;q24) KDM2B::AFF4
t(5;12)(q32;q13) BIN2::PDGFRB
t(5;12)(q32;q23) SART3::PDGFRB
t(5;12)(q33;p13) ETV6::EBF1
t(5;12)(q35;q14) ATP6V0E1::USP15
t(5;14)(p15;q32) IGH::TERT
t(5;14)(q22;q23) DCP2::HIF1A
t(5;14)(q22;q32) IGH::DCP2
t(5;14)(q33;q32) IGH::EBF1
t(5;14)(q35;q11) TRD::RANBP17
t(5;14)(q35;q11) TRD::TLX3
t(5;14)(q35;q32) BCL11B::NKX2-5
t(5;14)(q35;q32) CREBRF::AK7
t(5;14)(q35;q32) LMAN2::PAPOLA
t(5;15)(p15;q14) BRD9::NUTM1
t(5;15)(q12;q25) RNF180::AKAP13
t(5;16)(q11;q21) MAP3K1::CSNK2A2
t(5;16)(q33;p13) HBA1::CD74
t(5;17)(p13;q21) NIPBL::HOXB9
t(5;17)(q32;p11) MPRIP::PDGFRB
t(5;17)(q32;q11) MYO18A::PDGFRB
t(5;18)(q33;p11) PTPN2::UBLCP1
t(5;19)(q35;p13) NPM1::TYK2
t(5;20)(q32;p11) DTD1::PDGFRB
t(5;20)(q32;p11) PDGFRB::DTD1
t(5;20)(q32;q13) ZMYND8::PDGFRB
t(5;21)(q21;q22) CHD1::RUNX1
t(5;21)(q23;q22) RUNX1::ADAMTS19
t(5;21)(q23;q22) RUNX1::PRRC1
t(5;21)(q35;q22) HNRNPH1::ERG

Solid Tumors     

Annotated Tumors
Esophagus: Barrett's esophagus, dysplasia and adenocarcinoma
Colon: Colorectal adenocarcinoma
Soft Tissues: Desmoid-type fibromatosis
Liver: Hepatoblastoma
Thyroid: Medullary carcinoma
Pancreatic tumors: an overview
t(1;5)(p34;q31) CTNNA1::HEYL (Lung)
t(1;5)(q25;p13) DARS2::ZFR (Lung)
t(1;5)(q42;q32) IRF2BP2::CDX1 (Soft tissue tumors)
t(2;5)(p22;q14) BIRC6::BHMT2 (Lung)
t(2;5)(p16;p15) NRXN1::PLEKHG4B (Lung)
t(2;5)(p11;p12) HCN1::FUNDC2P2 (Lung)
t(2;5)(q35;p13) USP37::OSMR (Lung)
t(5;5)(p15;p15) MARCH6::IRX4 (Lung)
t(5;5)(p15;p15) ROPN1L::SEMA5A (Lung)
t(5;5)(p12;p13) RICTOR::FGF10 (Lung)
t(5;5)(q12;q12) ERBB2IP::MAST4 (Lung)
t(5;5)(q13;q13) ARHGEF28::UTP15 (Lung)
t(5;5)(q13;q13) NAIP::OCLN (Lung)
t(5;5)(q23;q35) LMAN2::AP3S1 (Prostate tumors)
t(5;5)(q31;q31) WDR55::DND1 (Prostate tumors)
t(5;5)(q31;q31) UBE2D2::MATR3 (Lung)
t(5;5)(q31;q31) JADE2::UBE2B (Lung)
t(5;5)(q31;q31) SKP1::CDKL3 (Lung)
t(5;5)(q31;q35) SPOCK1::TBC1D9B (Prostate tumors)
t(5;8)(p15;q13) AHRR::NCOA2 (Soft Tissues)
t(5;17)(q33;p13) RABEP1::PDGFRB (Bone)
Other Tumors
del(5)(p15p15) IRX2::TERT
del(5)(q31q31) SEPT8::AFF4
t(1;5)(p36;p13) ARID1A::NIPBL
t(1;5)(p36;q14) MIIP::CMYA5
t(1;5)(p36;q32) RBM27::SLC35E2B
t(1;5)(p35;p13) SDC3::SLC1A3
t(1;5)(p35;q31) RCC1::UBE2D2
t(1;5)(p34;p13) MMACHC::TTC23L
t(1;5)(p34;p13) NIPBL::CLSPN
t(1;5)(p34;q14) HOMER1::MAST2
t(1;5)(p34;q31) CTNNA1::HEYL
t(1;5)(p32;q14) OSBPL9::SERINC5
t(1;5)(p32;q14) SERINC5::TTC39A
t(1;5)(p32;q35) STC2::RNF11
t(1;5)(p31;p15) MYO10::ST6GALNAC3
t(1;5)(p31;p15) TTLL7::TERT
t(1;5)(p22;p15) ADCY2::RPAP2
t(1;5)(p22;p15) MTF2::CTNND2
t(1;5)(p21;q14) DPYD::EDIL3
t(1;5)(p21;q15) RNPC3::KIAA0825
t(1;5)(q23;q14) SSBP2::NTRK1
t(1;5)(q23;q35) SQSTM1::NTRK1
t(1;5)(q23;q35) SQSTM1::NTRK1
t(1;5)(q25;p15) CMBL::DARS2
t(1;5)(q25;p13) ZFR::DARS2
t(1;5)(q25;p13) DARS2::ZFR
t(1;5)(q25;q14) DMGDH::NMNAT2
t(1;5)(q25;q35) DHX9::PRELID1
t(1;5)(q32;q31) ATP2B4::H2AFY
t(1;5)(q41;p15) TAF1A::SLC12A7
t(1;5)(q41;q31) FNIP1::SUSD4
t(1;5)(q42;p13) NUP133::CDH6
t(1;5)(q42;q31) ARF1::HSPA9
t(1;5)(q42;q32) IRF2BP2::CDX1
t(1;5)(q42;q35) NPM1::RAB4A
t(2;5)(p25;q31) AFF4::SNTG2
t(2;5)(p25;q34) WWC1::SNTG2
t(2;5)(p23;q12) ASXL2::PPWD1
t(2;5)(p23;q31) NCOA1::PSD2
t(2;5)(p23;q35) SQSTM1::ALK
t(2;5)(p23;q35) SQSTM1::ALK
t(2;5)(p22;q14) BIRC6::BHMT2
t(2;5)(p16;p15) NRXN1::PLEKHG4B
t(2;5)(p15;p13) OXCT1::TMEM17
t(2;5)(p11;p12) HCN1::FUNDC2P2
t(2;5)(q11;q35) CANX::IL1R2
t(2;5)(q12;p13) TMEM182::ADAMTS12
t(2;5)(q21;p13) OSMR::NCKAP5
t(2;5)(q32;q31) ITGAV::ANKHD1
t(2;5)(q35;p13) USP37::OSMR
t(2;5)(q35;q31) FN1::FGF1
t(2;5)(q35;q31) TXNDC15::ARPC2
t(2;5)(q37;q11) HDAC4::SNX18
t(2;5)(q37;q33) GALNT10::IQCA1
t(2;5)(q37;q35) NCL::SQSTM1
t(3;5)(p25;p15) PAPD7::RAF1
t(3;5)(p25;q13) AGGF1::RAF1
t(3;5)(p25;q13) AGGF1::RAF1
t(3;5)(p25;q13) RAF1::AGGF1
t(3;5)(p21;p15) ARIH2::TRIO
t(3;5)(p21;q31) TWF2::FSTL4
t(3;5)(p14;p13) GOLPH3::LRTM1
t(3;5)(p14;q13) MAP1B::C3orf67
t(3;5)(p14;q15) CAST::FAM19A1
t(3;5)(p14;q15) FAM172A::FHIT
t(3;5)(p14;q22) FHIT::CAMK4
t(3;5)(p14;q22) MCC::PSMD6
t(3;5)(p14;q31) RAD50::CADPS
t(3;5)(p13;p13) FOXP1::C5orf51
t(3;5)(p13;q35) FOXP1::RUFY1
t(3;5)(q13;p13) CD47::ZFR
t(3;5)(q13;q15) MCTP1::CBLB
t(3;5)(q21;q22) APC::ALDH1L1
t(3;5)(q21;q33) CCDC14::ADAM19
t(3;5)(q22;q12) ACAD11::TRAPPC13
t(3;5)(q22;q31) CLDN18::ARHGAP26
t(3;5)(q23;q14) ADGRV1::ATR
t(3;5)(q25;q15) CAST::PLCH1
t(3;5)(q26;p15) ATP11B::MED10
t(3;5)(q26;p15) MTRR::NMD3
t(3;5)(q26;q35) DUSP1::MFN1
t(3;5)(q27;p15) MCCC1::MED10
t(3;5)(q27;p15) MED10::MCCC1
t(3;5)(q27;p15) TRA2B::DNAH5
t(3;5)(q27;q12) SREK1::ST6GAL1
t(3;5)(q29;p13) FAM157A::C9
t(4;5)(p16;q21) S100P::CHD1
t(4;5)(p14;q13) MARVELD2::WDR19
t(4;5)(p13;p13) NIPBL::SLC30A9
t(4;5)(q13;p13) NIPBL::ANKRD17
t(4;5)(q22;q22) BMPR1B::MCC
t(4;5)(q24;p15) ANKH::ARHGEF38
t(4;5)(q24;p15) ARHGEF38::ANKH
t(4;5)(q24;q31) P4HA2::TBCK
t(4;5)(q24;q31) TBCK::P4HA2
t(4;5)(q31;q23) SEMA6A::LSM6
t(5;5)(p15;p15) BRD9::CEP72
t(5;5)(p15;p15) CCDC127::TERT
t(5;5)(p15;p15) CEP72::TPPP
t(5;5)(p15;p15) CLPTM1L::PDCD6
t(5;5)(p15;p15) CTNND2::TRIO
t(5;5)(p15;p15) LPCAT1::CLPTM1L
t(5;5)(p15;p15) LPCAT1::DAP
t(5;5)(p15;p15) LPCAT1::SDHA
t(5;5)(p15;p15) MYO10::DNAH5
t(5;5)(p15;p15) PAPD7::SRD5A1
t(5;5)(p15;p15) PDCD6::TERT
t(5;5)(p15;p15) SEMA5A::ROPN1L
t(5;5)(p15;p15) SRD5A1::ADAMTS16
t(5;5)(p15;p15) TRIO::DNAH5
t(5;5)(p15;p15) TRIO::FBXL7
t(5;5)(p15;p15) TRIO::MARCH11
t(5;5)(p15;p15) TRIO::TERT
t(5;5)(p15;p15) MARCH6::IRX4
t(5;5)(p15;p15) ROPN1L::SEMA5A
t(5;5)(p15;q11) GPBP1::MTRR
t(5;5)(p15;q14) ADGRV1::CLPTM1L
t(5;5)(p15;q31) CTNND2::P4HA2
t(5;5)(p15;q33) CLINT1::MARCH11
t(5;5)(p15;q34) ANKH::TENM2
t(5;5)(p15;q35) ANKH::MXD3
t(5;5)(p15;q35) CLPTM1L::CDHR2
t(5;5)(p15;q35) EXOC3::ERGIC1
t(5;5)(p15;q35) SLC12A7::RASGEF1C
t(5;5)(p15;q35) ZDHHC11::RNF130
t(5;5)(p15;q35) ZNF354A::SLC12A7
t(5;5)(p13;p15) DROSHA::TERT
t(5;5)(p13;p15) MTMR12::TERT
t(5;5)(p13;p15) NIPBL::MYO10
t(5;5)(p13;p15) NIPBL::TAS2R1
t(5;5)(p13;p15) NUP155::TRIO
t(5;5)(p13;p13) ADAMTS12::C1QTNF3
t(5;5)(p13;p13) ADAMTS12::ZFR
t(5;5)(p13;p13) LIFR::C9
t(5;5)(p13;p13) MTMR12::ZFR
t(5;5)(p13;p13) NIPBL::SLC1A3
t(5;5)(p13;p13) NIPBL::SPEF2
t(5;5)(p13;p13) PRKAA1::TTC33
t(5;5)(p13;p13) PRKAA1::TTC33
t(5;5)(p13;p13) PRKAA1::TTC33
t(5;5)(p13;p13) PRKAA1::TTC33
t(5;5)(p13;p13) PRKAA1::TTC33
t(5;5)(p13;p13) PRLR::PLCXD3
t(5;5)(p13;p13) RICTOR::RANBP3L
t(5;5)(p13;p13) SLC45A2::AMACR
t(5;5)(p13;p13) SLC45A2::AMACR
t(5;5)(p13;p13) SPEF2::NADK2
t(5;5)(p13;p13) WDR70::ADAMTS12
t(5;5)(p13;p13) WDR70::PLCXD3
t(5;5)(p13;p13) ZFR::TARS
t(5;5)(p13;q13) RICTOR::ANKRD31
t(5;5)(p13;q14) DAB2::ARSB
t(5;5)(p13;q31) PRLR::KDM3B
t(5;5)(p13;q33) TTC33::ADAM19
t(5;5)(p13;q35) LMBRD2::KCNMB1
t(5;5)(p12;p13) HMGCS1::OXCT1
t(5;5)(p12;p13) MROH2B::MRPS30
t(5;5)(p12;p13) NIPBL::FGF10
t(5;5)(p12;p13) PAIP1::DAB2
t(5;5)(p12;p13) RICTOR::HCN1
t(5;5)(p12;p13) RICTOR::FGF10
t(5;5)(q11;q11) ARL15::MOCS2
t(5;5)(q11;q11) CDC20B::DHX29
t(5;5)(q11;q11) IL6ST::ANKRD55
t(5;5)(q11;q11) PARP8::ANKRD55
t(5;5)(q11;q11) SNX18::ANKRD55
t(5;5)(q11;q23) ARL15::CDC42SE2
t(5;5)(q11;q31) CTNNA1::SLC38A9
t(5;5)(q11;q31) HSPA9::ARL15
t(5;5)(q11;q31) NDUFS4::UBE2D2
t(5;5)(q11;q35) SLC38A9::KCNIP1
t(5;5)(q12;q12) CWC27::RNF180
t(5;5)(q12;q12) DEPDC1B::ELOVL7
t(5;5)(q12;q12) MAST4::NLN
t(5;5)(q12;q12) NDUFAF2::MAST4
t(5;5)(q12;q12) PDE4D::DEPDC1B
t(5;5)(q12;q12) PDE4D::ELOVL7
t(5;5)(q12;q12) PDE4D::ERCC8
t(5;5)(q12;q12) PDE4D::RGS7BP
t(5;5)(q12;q12) ERBB2IP::MAST4
t(5;5)(q12;q13) BDP1::CWC27
t(5;5)(q12;q13) MAST4::MRPS27
t(5;5)(q12;q13) NDUFAF2::ANKRD31
t(5;5)(q12;q23) IPO11::TNFAIP8
t(5;5)(q12;q23) KIF2A::ADAMTS19
t(5;5)(q12;q31) NDFIP1::NDUFAF2
t(5;5)(q12;q35) PDE4D::C5orf47
t(5;5)(q12;q35) PDE4D::RAB24
t(5;5)(q13;q13) CDK7::CCNB1
t(5;5)(q13;q13) FAM169A::ANKRD31
t(5;5)(q13;q13) NSA2::HEXB
t(5;5)(q13;q13) SERF1A::SMN2
t(5;5)(q13;q13) NAIP::OCLN
t(5;5)(q13;q13) ARHGEF28::UTP15
t(5;5)(q13;q14) IQGAP2::ACOT12
t(5;5)(q13;q14) TNPO1::MEF2C
t(5;5)(q13;q22) TMEM232::ANKRA2
t(5;5)(q13;q22) TRIM36::HEXB
t(5;5)(q13;q31) RAD17::SEC24A
t(5;5)(q13;q33) PWWP2A::IQGAP2
t(5;5)(q14;q14) ARSB::DMGDH
t(5;5)(q14;q14) JMY::DMGDH
t(5;5)(q14;q14) SERINC5::ZFYVE16
t(5;5)(q14;q14) SSBP2::SERINC5
t(5;5)(q14;q15) TMEM161B::FAM81B
t(5;5)(q14;q21) PJA2::ADGRV1
t(5;5)(q14;q23) LMNB1::HOMER1
t(5;5)(q14;q31) RASA1::FNIP1
t(5;5)(q14;q31) RASA1::VDAC1
t(5;5)(q14;q33) AP3B1::DCTN4
t(5;5)(q15;q21) FAM172A::EFNA5
t(5;5)(q15;q22) PGGT1B::KIAA0825
t(5;5)(q15;q33) SLC36A1::TTC37
t(5;5)(q15;q35) SCGB3A1::CAST
t(5;5)(q21;q21) MAN2A1::FER
t(5;5)(q21;q21) MAN2A1::FER
t(5;5)(q21;q21) MAN2A1::FER
t(5;5)(q21;q21) MAN2A1::FER
t(5;5)(q21;q21) MAN2A1::FER
t(5;5)(q21;q21) MAN2A1::FER
t(5;5)(q21;q21) ST8SIA4::PAM
t(5;5)(q21;q35) NSD1::EFNA5
t(5;5)(q22;q22) WDR36::NREP
t(5;5)(q22;q23) NREP::COMMD10
t(5;5)(q22;q31) APC::REEP2
t(5;5)(q22;q32) DCP2::IL17B
t(5;5)(q22;q32) EPB41L4A::PLAC8L1
t(5;5)(q23;q23) ADAMTS19::SLC27A6
t(5;5)(q23;q23) COMMD10::AP3S1
t(5;5)(q23;q23) COMMD10::AP3S1
t(5;5)(q23;q23) SEMA6A::DTWD2
t(5;5)(q23;q23) SNX24::SNCAIP
t(5;5)(q23;q33) PRDM6::NIPAL4
t(5;5)(q23;q34) ATP10B::COMMD10
t(5;5)(q23;q35) SLIT3::HSD17B4
t(5;5)(q23;q35) LMAN2::AP3S1
t(5;5)(q31;q31) AFF4::FSTL4
t(5;5)(q31;q31) ANKHD1::CYSTM1
t(5;5)(q31;q31) ANKHD1::CYSTM1
t(5;5)(q31;q31) ANKHD1::PCDH1
t(5;5)(q31;q31) FAM13B::CDC25C
t(5;5)(q31;q31) H2AFY::HMHB1
t(5;5)(q31;q31) HARS::FAM53C
t(5;5)(q31;q31) HARS2::ZMAT2
t(5;5)(q31;q31) HARS2::ZMAT2
t(5;5)(q31;q31) MATR3::CTNNA1
t(5;5)(q31;q31) MATR3::KDM3B
t(5;5)(q31;q31) MATR3::PCDHA2
t(5;5)(q31;q31) NR3C1::HMHB1
t(5;5)(q31;q31) NRG2::CYSTM1
t(5;5)(q31;q31) PAIP2::CDC25C
t(5;5)(q31;q31) PCDHA11::ANKHD1
t(5;5)(q31;q31) PITX1::P4HA2
t(5;5)(q31;q31) PPP2CA::CDKL3
t(5;5)(q31;q31) RAD50::PDLIM4
t(5;5)(q31;q31) SIL1::NRG2
t(5;5)(q31;q31) SPOCK1::ARHGAP26
t(5;5)(q31;q31) UBE2D2::PAIP2
t(5;5)(q31;q31) VDAC1::SKP1
t(5;5)(q31;q31) WDR55::DND1
t(5;5)(q31;q31) SKP1::CDKL3
t(5;5)(q31;q31) JADE2::UBE2B
t(5;5)(q31;q31) UBE2D2::MATR3
t(5;5)(q31;q32) RAD50::TCOF1
t(5;5)(q31;q33) HARS::CLINT1
t(5;5)(q31;q35) CLTB::SIL1
t(5;5)(q31;q35) FSTL4::SLIT3
t(5;5)(q31;q35) H2AFY::CNOT6
t(5;5)(q31;q35) SIL1::STK10
t(5;5)(q31;q35) SPOCK1::TBC1D9B
t(5;5)(q32;q33) NDST1::TCOF1
t(5;5)(q32;q35) CPEB4::STK32A
t(5;5)(q32;q35) PRELID2::MAPK9
t(5;5)(q33;q33) G3BP1::GLRA1
t(5;5)(q33;q33) GALNT10::FAXDC2
t(5;5)(q33;q35) GPX3::SQSTM1
t(5;5)(q33;q35) NSD1::FAT2
t(5;5)(q33;q35) SGCD::LCP2
t(5;5)(q33;q35) SQSTM1::GRIA1
t(5;5)(q34;q35) TBC1D9B::TENM2
t(5;5)(q35;q35) B4GALT7::NSD1
t(5;5)(q35;q35) COL23A1::FAM193B
t(5;5)(q35;q35) CREBRF::SLIT3
t(5;5)(q35;q35) ERGIC1::RANBP17
t(5;5)(q35;q35) HNRNPH1::RNF130
t(5;5)(q35;q35) LMAN2::F12
t(5;5)(q35;q35) LMAN2::MXD3
t(5;5)(q35;q35) MGAT1::FLT4
t(5;5)(q35;q35) NSD1::UNC5A
t(5;5)(q35;q35) NSD1::ZNF346
t(5;5)(q35;q35) NSD1::ZNF346
t(5;5)(q35;q35) RANBP17::GABRP
t(5;5)(q35;q35) RANBP17::SPDL1
t(5;5)(q35;q35) RNF130::RASGEF1C
t(5;5)(q35;q35) STK10::SH3PXD2B
t(5;5)(q35;q35) TLX3::RANBP17
t(5;5)(q35;q35) UBTD2::SH3PXD2B
t(5;5)(q35;q35) UIMC1::DBN1
t(5;6)(p15;p21) DAP::RGL2
t(5;6)(p15;q25) DAP::SNX9
t(5;6)(p15;q25) SNX9::DAP
t(5;6)(p14;p21) NUDT3::CDH12
t(5;6)(p13;p22) RICTOR::DTNBP1
t(5;6)(p13;p21) HSPA1B::SLC1A3
t(5;6)(q11;q15) AKIRIN2::ANKRD55
t(5;6)(q14;p22) HIST1H2AC::LHFPL2
t(5;6)(q14;p22) LHFPL2::HIST1H2AC
t(5;6)(q31;p21) BRD8::PHF1
t(5;6)(q31;q15) GNPDA1::RNGTT
t(5;6)(q31;q23) HBS1L::IL9
t(5;6)(q31;q23) MYB::PCDHGA1
t(5;6)(q31;q25) ANKHD1::TIAM2
t(5;6)(q31;q26) PCDHGC3::QKI
t(5;6)(q32;p21) HLA-C::TCOF1
t(5;6)(q33;q21) GPX3::SEC63
t(5;6)(q33;q22) PWWP2A::ROS1
t(5;6)(q33;q22) ROS1::CD74
t(5;6)(q33;q22) CD74::ROS1
t(5;7)(p15;p22) NDUFS6::ACTB
t(5;7)(p15;q34) SLC12A7::BRAF
t(5;7)(p13;p22) SDK1::AMACR
t(5;7)(p13;q21) RAI14::ASB4
t(5;7)(p13;q31) LIFR::PNPLA8
t(5;7)(p13;q32) ZFR::SND1
t(5;7)(q13;q21) OCLN::CDK14
t(5;7)(q14;q34) AP3B1::BRAF
t(5;7)(q14;q34) BRAF::AP3B1
t(5;7)(q15;q22) CAST::CDHR3
t(5;7)(q23;q33) COMMD10::DGKI
t(5;7)(q23;q34) ALDH7A1::PIP
t(5;7)(q31;q11) ANKHD1-EIF4EBP3::GTF2I
t(5;7)(q31;q32) UBE2D2::SND1
t(5;7)(q33;q34) BRAF::FAM114A2
t(5;7)(q33;q34) FAM114A2::BRAF
t(5;7)(q34;p22) RARS::MAD1L1
t(5;7)(q35;q34) RNF130::BRAF
t(5;8)(p15;p11) CEP72::FNTA
t(5;8)(p15;p11) SLC20A2::ANKH
t(5;8)(p15;q21) MRPS28::ADAMTS16
t(5;8)(p15;q24) CLPTM1L::PVT1
t(5;8)(p13;p22) DNAJC21::SGCZ
t(5;8)(p13;p11) EIF4EBP1::PRKAA1
t(5;8)(p13;q24) HSF1::ADAMTS12
t(5;8)(q11;p21) NDUFS4::EXTL3
t(5;8)(q12;p21) PDE4D::INTS10
t(5;8)(q13;p11) TNPO1::IKBKB
t(5;8)(q13;q11) CDK7::RGS20
t(5;8)(q21;q11) ATP6V1H::ST8SIA4
t(5;8)(q21;q23) GIN1::PKHD1L1
t(5;8)(q23;q11) CDC42SE2::SPIDR
t(5;8)(q32;q24) HTR4::ST3GAL1
t(5;8)(q33;p12) CD74::NRG1
t(5;8)(q33;q23) SPARC::TRPS1
t(5;8)(q35;q23) TRPS1::TBC1D9B
t(5;8)(q35;q24) WDYHV1::CDHR2
t(5;9)(p15;p24) TRIO::UHRF2
t(5;9)(p13;q32) PDZD2::COL27A1
t(5;9)(p13;q34) PRRC2B::NUP155
t(5;9)(q11;q32) RGS3::MIER3
t(5;9)(q13;p24) PIK3R1::KANK1
t(5;9)(q14;p22) NFIB::XRCC4
t(5;9)(q22;q33) CAMK4::DENND1A
t(5;9)(q31;q34) AFF4::LAMC3
t(5;9)(q32;q34) MIR143::NOTCH1
t(5;9)(q35;q21) SQSTM1::NTRK2
t(5;9)(q35;q32) BSPRY::NPM1
t(5;10)(p15;q23) FAS::CTNND2
t(5;10)(p13;p11) MAP3K8::MROH2B
t(5;10)(p13;q11) WDR70::C10orf25
t(5;10)(q11;q22) KAT6B::DDX4
t(5;10)(q13;q25) ABLIM1::PTCD2
t(5;10)(q13;q25) IQGAP2::ATRNL1
t(5;10)(q15;q23) PTEN::NR2F1
t(5;10)(q34;q21) CISD1::GABRA1
t(5;10)(q35;q11) SQSTM1::RET
t(5;10)(q35;q11) SGMS1::STK10
t(5;10)(q35;q22) CDH23::NSD1
t(5;10)(q35;q22) NSD1::CDH23
t(5;10)(q35;q24) WBP1L::ADAMTS2
t(5;10)(q35;q26) FGFR2::NPM1
t(5;10)(q35;q26) FGFR2::NPM1
t(5;10)(q35;q26) ZNF346::PAOX
t(5;11)(p15;p15) CLPTM1L::TEAD1
t(5;11)(p15;q14) SLC12A7::AAMDC
t(5;11)(p13;p14) SLC1A3::METTL15
t(5;11)(p13;q14) TTC33::GRM5
t(5;11)(q11;p14) GPBP1::BDNF
t(5;11)(q13;p15) TNPO1::GTF2H1
t(5;11)(q13;q22) POC5::CUL5
t(5;11)(q14;q22) FAM151B::CASP12
t(5;11)(q32;p15) PDGFRB::FAR1
t(5;11)(q32;q13) HMGXB3::CAPN1
t(5;11)(q35;q14) KCNIP1::KCTD14
t(5;12)(p15;p13) ADAMTS16::ETV6
t(5;12)(p15;q12) SLC12A7::TMEM117
t(5;12)(p15;q12) SLC2A13::TERT
t(5;12)(p13;p13) WDR70::CACNA2D4
t(5;12)(p13;q24) NIPBL::ATP2A2
t(5;12)(p13;q24) SCARB1::SUB1
t(5;12)(p12;q13) NNT::AMIGO2
t(5;12)(q13;q14) PPM1H::SV2C
t(5;12)(q22;q13) APC::KRT6A
t(5;12)(q23;p13) CHSY3::NINJ2
t(5;12)(q32;q13) NAB2::PDGFRB
t(5;12)(q33;p13) GPX3::CHD4
t(5;12)(q33;q13) CD74::MBD6
t(5;12)(q33;q14) EBF1::RPSAP52
t(5;12)(q33;q14) GRIP1::TNIP1
t(5;12)(q35;p12) UIMC1::PTPRO
t(5;12)(q35;q24) MED13L::COL23A1
t(5;13)(p15;q31) MYO10::GPC5
t(5;13)(p15;q34) ARHGEF7::ZDHHC11
t(5;13)(q15;q12) KIAA0825::HSPH1
t(5;13)(q31;q14) ITM2B::MATR3
t(5;14)(p15;q22) NAA30::TERT
t(5;14)(p15;q23) TRIO::PPP2R5E
t(5;14)(p13;q24) NUP155::ZFYVE26
t(5;14)(p13;q32) RCOR1::WDR70
t(5;14)(q13;q32) CDK7::RIN3
t(5;14)(q31;q11) NDRG2::KIF3A
t(5;14)(q33;q11) RPS14::AP1G2
t(5;14)(q35;q11) SQSTM1::AP1G2
t(5;14)(q35;q12) NUBPL::DOCK2
t(5;15)(p13;q23) PKM::SLC1A3
t(5;15)(q11;q26) SNX18::WDR93
t(5;15)(q12;q25) PDE4D::CRABP1
t(5;15)(q13;q21) MAP1B::SLC27A2
t(5;15)(q13;q21) USP8::BDP1
t(5;15)(q21;q23) CLN6::FBXL17
t(5;15)(q23;q21) GABPB1::CSNK1G3
t(5;15)(q23;q25) AKAP13::CHSY3
t(5;15)(q31;q26) ADAMTS17::PCDHA8
t(5;15)(q31;q26) PLIN1::ACSL6
t(5;15)(q33;q25) ARNT2::NDST1
t(5;15)(q35;q24) MAPK9::UBL7
t(5;16)(p12;p13) CREBBP::HCN1
t(5;16)(q11;p13) MAP3K1::PARN
t(5;16)(q11;q22) ZFHX3::ARL15
t(5;16)(q14;p13) CREBBP::ATG10
t(5;16)(q14;q23) SERINC5::CDYL2
t(5;16)(q21;p11) FUS::CHD1
t(5;16)(q31;p13) KLHL3::C16orf45
t(5;16)(q31;q22) CDH1::CDKL3
t(5;16)(q31;q22) PPP2CA::CDH3
t(5;16)(q35;p13) UIMC1::PMM2
t(5;17)(p15;q21) COL1A1::BASP1
t(5;17)(p15;q21) ETV4::AHRR
t(5;17)(p13;p13) SLC1A3::RABEP1
t(5;17)(p13;q12) WDR70::PGAP3
t(5;17)(p12;q23) HEATR6::FGF10
t(5;17)(q12;q12) ACACA::SGTB
t(5;17)(q13;p13) TP53::CCNB1
t(5;17)(q21;q12) RAD51D::SLCO6A1
t(5;17)(q23;p13) STX8::HSD17B4
t(5;17)(q31;q11) ALDOC::KIF3A
t(5;17)(q31;q24) GNA13::NR3C1
t(5;17)(q35;q23) CYB561::SQSTM1
t(5;17)(q35;q25) ARHGDIA::SQSTM1
t(5;18)(p13;q23) MBP::SLC1A3
t(5;18)(q35;p11) HNRNPH1::VAPA
t(5;18)(q35;q11) SS18::DOCK2
t(5;18)(q35;q21) MBD2::DOCK2
t(5;19)(p13;p13) TNFAIP8L1::SPEF2
t(5;19)(q13;p13) PIK3R1::NDUFB7
t(5;19)(q21;q13) CAPNS1::CHD1
t(5;19)(q23;p13) STK11::SRFBP1
t(5;19)(q32;p13) MIR143::NOTCH3
t(5;19)(q35;q13) RPL18::SQSTM1
t(5;20)(p15;p12) DSTN::CCDC127
t(5;20)(p15;q13) CLPTM1L::ARFGEF2
t(5;20)(p15;q13) TRIO::IFT52
t(5;20)(p13;p12) SLC1A3::C20orf196
t(5;20)(p13;q11) UQCC1::ADAMTS12
t(5;20)(q15;p11) RHOBTB3::CRNKL1
t(5;22)(q11;q13) GPX8::TTLL1
t(5;22)(q14;q13) SSBP2::LGALS2
t(5;22)(q31;q12) TGFBI::MYH9
t(5;22)(q35;q12) LIMK2::RUFY1
t(5;22)(q35;q13) FAM19A5::ZFP2
t(5;22)(q35;q13) HNRNPAB::SAMM50
t(5;22)(q35;q13) UNC5A::TTC38
t(X;5)(p22;q21) GPM6B::CHD1
t(X;5)(p22;q35) TRIM41::ASB9
t(X;5)(p11;q31) TBC1D25::HSPA9
t(X;5)(q22;q14) COL4A5::XRCC4
t(X;5)(q22;q35) RNF44::NXF3

Cancer prone diseases

APC-associated polyposis conditions
Cockayne syndrome
Familial Myeloproliferative Disorders
Hereditary desmoid disease.
Oculocutaneous Albinism
Paget's disease of bone
Sotos syndrome (SOS)

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  • Metasystems

    • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    ADAMTS12 33523.535     5p13.3-p13.2
    ADRB2 148826.611     5q32
    AFF4 132875.396     5q31.1
    ANKHD1 140401.833     5q31.3
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    ZNF879 179023.804     5q35.3
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    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Jean-Loup Huret
    Updated01 2022Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_5.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. 01 2022 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_5.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Thu Jan 20 18:15:05 CET 2022

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