Chromosome

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case reports   Journals   Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

Chromosome Y

chrY:1-57227415 (57227.415 Kb)

Chromosome Y : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Chromosome Y diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

ENTITIES: by Chromosome band

Y Yp Yq Yp11 Yq11 Yq12

Leukaemia     

Y loss in leukemia
t(Y;1)(q12;q12)

Solid Tumors     

Pancreatic tumors: an overview

Cancer prone diseases     

All Genes by Location (Kb)

Chromosome Y by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE


External links     

  • Chromosome Y - HUGO Chromosomes
  • Chromosome Y - GoldenPath - UCSC
  • Chromosome Y - Ensembl Project
  • Chromosome Y - Map View - NCBI
  • Chromosome Y - Genomics Home Reference
  • Chromosome Y - DECIPHER
  • Chromosome Y - OMIM Gene map
  • Chromosome Y - Genomic Variants
  • Chromosome Y - HAPMAP Project
  • Chromosome Y - 1000 Genomes
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome Y Cancer GeneWeb

  • Chromosome Y - Human Protein Atlas
  • Chromosome Y - Human UniProtKB

    FISH probes

  • Chromosome Y - FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Chromosome Y - Empire Genomics FISH clones [ chromosome ]  [ genes ]
  • Chromosome Y - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome Y - Vysis FISHCytogenetic marker (Abbott)
  • FISH Probes DAKO (Agilent)
  • SureFISH Probes (Agilent)
  • CytoCell  [ haematology ]  [ pathology ]
  • Kreatech Diagnostic
  • Metasystems

  • Genes

    Annotated genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    TSPY1 9466.955     Yp11.2

    Other genes
    Symbol(↓)Location hg38 (Kb)(↓)    Band(↓)
    AMELY 6865.918     Yp11.2
    ASMTL-AS1 1402.043     Xp22.33 and Yp11.2
    BCORP1 19455.431     Yq11.222
    BPY2B 22984.263     Yq11.23
    BPY2C 22984.263     Yq11.23
    BPY2 22984.263     Yq11.223
    CD24P4 18991.033     Yq11.222
    CDY1B 24045.793     Yq11.23
    CDY1 24045.230     Yq11.23
    CDY2A 17878.261     Yq11.222
    CDY2B 17878.260     Yq11.222
    CSPG4P1Y 24183.434     Yq11.23
    DAZ1 23129.355     Yq11.223
    DAZ2 23219.457     Yq11.223
    DAZ3 23219.434     Yq11.23
    DAZ4 23129.355     Yq11.23
    DDX3Y 12903.999     Yq11.221
    EIF1AY 20575.711     Yq11.223
    FAM197Y2 9349.580     Yp11.2
    FAM197Y5 9349.580     Yp11.2
    FAM224A 17575.185     Yq11.222
    FAM224B 17575.161     Yq11.222
    FAM41AY1 17500.958     Yq11.222
    FAM41AY2 17500.958     Yq11.222
    GOLGA2P2Y 24209.967     Yq11.23
    GOLGA2P3Y 24209.967     Yq11.23
    GYG2P1 12406.116     Yq11.221
    HSFY1 18546.688     Yq11.222
    HSFY2 18546.691     Yq11.222
    KDM5D 19705.415     Yq11.223
    LINC00278 3002.996     Yp11.2
    LINC00279 8638.294     Yp11.2
    LINC00280 6357.219     Yp11.2
    LOC100652931 22316.678     Yq11.223
    LOC101929148 22101.692     Yq11.223
    LOC107987345 19041.681     Yq11.222
    NLGN4Y-AS1 14793.642     Yq11.221
    NLGN4Y 14622.021     Yq11.221
    PCDH11Y 5000.226     Yp11.2
    PRORY 21382.974     Yq11.223
    PRY2 22071.756     Yq11.223
    PRYP4 25975.549     Yq11.23
    PRY 22071.756     Yq11.223
    RBMY1A1 21511.338     Yq11.223
    RBMY1A3P 9317.061     Yp11.2
    RBMY1B 21511.338     Yq11.223
    RBMY1D 21511.338     Yq11.223
    RBMY1E 21511.378     Yq11.223
    RBMY1F 22168.542     Yq11.223
    RBMY1J 22168.774     Yq11.223
    RBMY2EP 21395.148     Yq11.223
    RBMY2FP 22308.859     Yq11.223
    RBMY3AP 9610.721     Yp11.2
    RPS4Y1 2841.582     Yp11.2
    RPS4Y2 20756.068     Yq11.223
    SRY 2786.855     Yp11.2
    TBL1Y 6910.686     Yp11.2
    TGIF2LY 3579.085     Yp11.2
    TMSB4Y 13703.567     Yq11.221
    TSPY10 9337.464     Yp11.2
    TSPY2 6246.223     Yp11.2
    TSPY3 9337.464     Yp11.2
    TSPY4 9337.510     Yp11.2
    TSPY8 9337.510     Yp11.2
    TTTY10 20465.668     Yq11.223
    TTTY11 8783.320     Yp11.2
    TTTY12 7804.924     Yp11.2
    TTTY13 21583.600     Yq11.223
    TTTY14 18932.699     Yq11.222
    TTTY15 12662.367     Yq11.221
    TTTY16 7699.357     Yp11.2
    TTTY17A 22851.584     Yq11.223
    TTTY17B 22851.584     Yq11.23
    TTTY17C 22851.584     Yq11.23
    TTTY18 8683.370     Yp11.2
    TTTY19 8704.472     Yp11.2
    TTTY1B 6390.401     Yp11.2
    TTTY1 6390.401     Yp11.2
    TTTY20 9329.880     Yp11.2
    TTTY21B 6443.434     Yp11.2
    TTTY21 6443.434     Yp11.2
    TTTY22 9801.153     Yp11.2
    TTTY23B 6242.446     Yp11.2
    TTTY23 6242.446     Yp11.2
    TTTY2B 6406.244     Yp11.2
    TTTY2 6406.244     Yp11.2
    TTTY3B 23936.727     Yq11.23
    TTTY3 23936.727     Yq11.23
    TTTY4B 22936.455     Yq11.23
    TTTY4C 22936.455     Yq11.23
    TTTY4 22936.455     Yq11.223
    TTTY5 22296.798     Yq11.223
    TTTY6B 22144.987     Yq11.223
    TTTY6 22144.965     Yq11.223
    TTTY7B 6449.468     Yp11.2
    TTTY7 6449.468     Yp11.2
    TTTY8B 6471.031     Yp11.2
    TTTY8 6471.031     Yp11.2
    TTTY9A 18581.206     Yq11.222
    TTTY9B 18581.206     Yq11.222
    TXLNGY 19567.382     Yq11.222-q11.223
    USP9Y 12701.231     Yq11.221
    UTY 13248.379     Yq11.221
    VCY1B 13985.772     Yq11.221
    VCY 13985.772     Yq11.221
    WASH2P 57208.210     2q14.1
    WASH6P 57209.887     Xq28 and Yq12
    XKRY2 17768.980     Yq11.222
    XKRY 17768.980     Yq11.222
    ZFY 2935.477     Yp11.2

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    UpdatedMay 2017Philippe Dessen, Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_Y.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. May 2017 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_Y.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Wed May 24 18:34:10 CEST 2017


    Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case reports   Journals   Portal   Teaching   

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA