Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 19

Chromosome 19 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Leukaemia     

t(1;19)(q23;p13)
t(1;19)(p13;p13.1)
t(2;19)(p11;p13)
t(3;19)(q27;q13) (NHL; BCL6 and NAPA; rare)
t(7;19)(q34;p13)
t(8;19) (p11;q13)
t(8;19)(p12;q13)
t(11;19)(q23;p13.1)
t(11;19)(q23;p13.3)
t(14;19)(q32;q13)
t(14;19)(q32;q13) in acute lymphoblastic leukaemia
t(17;19)(q22;p13)
Trisomy 19
t(19;21)(q13.4;q22)

Solid Tumors     

t(2;19)(p23;p13)
t(2;19)(p23;p13.1)
t(2;19)(p23;p13.1)
t(11;19)(q21;p13)
t(11;19)(q21-22;p13)
t(15;19)(q14;p13)

Cancer prone diseases     

Congenital neutropenia
Diamond-Blackfan anemia (DBA)
Peutz-Jeghers syndrome

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 19 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 19 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 19 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 19 - Ensembl Project
  • Chromosome 19 - Map View - NCBI
  • Chromosome 19 - GDB (Genome Data Base)
  • Chromosome 19 - OMIM Gene map
  • Chromosome 19 - Genomic Variants
  • Chromosome 19 - HAPMAP Project
  • Chromosome 19 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 19 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 19 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 19 - SpliceNest
  • Human BAC Resource (NCBI)
  • FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Positional Cloning Project (Berlin Dahlem)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Cancer GeneWeb
  • GeneCards (Weizmann)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

    • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    STK11 1156.798 19p13.3
    TCF3 1560.295 19p13.3
    SH3GL1 4311.368 19p13.3
    MLLT1 6161.393 19p13.3
    VAV1 6723.722 19p13.2
    MUC16 8820.521 19p13.2
    DNMT1 10105.023 19p13.2
    SMARCA4 10932.606 19p13.2
    JUNB 12763.310 19p13.2
    LYL1 13070.848 19p13.2
    CD97 14353.213 19p13
    NOTCH3 15131.444 19p13.2-p13.1
    BRD4 15209.302 19p13.1
    TPM4 16048.325 19p13.1
    JAK3 17797.961 19p13.1
    JUND 18251.571 19p13.2
    GDF15 18357.968 19p13.11
    ELL 18414.474 19p13.1
    CRTC1 18655.425 19p13.11
    CEBPA 38482.776 19q13.1
    ZNF146 41397.344 19q13.1
    AKT2 45428.064 19q13.1-q13.2
    CBLC 49972.988 19q13.2
    RELB 50196.552 19q13.32
    MARK4 50446.682 19q13.3
    ERCC2 50546.686 19q13.3
    PPP1R13L 50574.739 19q13.32
    ERCC1 50608.533 19q13.2-q13.3
    BBC3 52415.925 19q13.3-q13.4
    LIG1 53310.515 19q13.2-q13.3
    CARD8 53403.325 19q13.32
    KLK10 56207.812 19q13.3-q13.4
    KLK11 56217.301 19q13.3-q13.4
    TFPT 59302.142 19q13
    AMP19 61084.442 19q13
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    SHC2 367.583 19p13.3
    CDC34 482.733 19p13.3
    GZMM 495.027 19p13.3
    BSG 523.537 19p13.3
    FGF22 590.926 19p13.3
    RNF126 598.530 19p13.3
    FSTL3 627.389 19p13
    PTBP1 748.411 19p13.3
    PRG2 763.518 19p13.3
    AZU1 778.831 19p13.3
    PRTN3 791.985 19p13.3
    ELA2 803.291 19p13.3
    KISS1R 868.358 19p13.3
    ARID3A 877.037 19p13.3
    C19orf6 960.650 19p13.3
    GPX4 1055.649 19p13.3
    CIRBP 1220.347 19p13.3
    EFNA2 1237.168 19p13.3
    MUM1 1306.010 19p13.3
    RPS15 1389.363 19p13.3
    APC2 1401.148 19p13.3
    MEX3D 1505.668 19p13.3
    MBD3 1527.678 19p13.3
    CSNK1G2 1892.161 19p13.3
    MKNK2 1988.470 19p13.3
    AP3D1 2051.994 19p13.3
    DOT1L 2115.148 19p13.3
    LPSA 2187.816 19p13.2-q13.3
    AMH 2200.113 19p13.3
    OAZ1 2220.520 19p13.3
    SPPL2B 2279.629 19p13.3
    TIMM13 2376.622 19p13.3
    GADD45B 2427.135 19p13.3
    GNG7 2462.218 19p13.3
    DIRAS1 2665.565 19p13.3
    AES 3003.908 19p13.3
    GNA11 3045.408 19p13.3
    GNA15 3087.191 19p13.3
    FZR1 3473.954 19p13.3
    HMG20B 3523.943 19p13.3
    TBXA2R 3545.504 19p13.3
    PIP5K1C 3581.182 19p13.3
    MATK 3728.968 19p13.3
    ITGB1BP3 3884.101 19p13.3
    DAPK3 3909.452 19p13.3
    EEF2 3927.055 19pter-q12
    PIAS4 3958.749 19p13.3
    ZBTB7A 3996.218 19p13.3
    MAP2K2 4041.329 19p13.3
    SIRT6 4125.107 19p13.3
    SHD 4230.659 19p13.3
    FSD1 4255.691 19p13.3
    CHAF1A 4353.660 19p13.3
    TNFAIP8L1 4590.530 19p13.3
    DPP9 4626.237 19p13.3
    FEM1A 4742.728 19p13.3
    M6PRBP1 4789.346 19p13.3
    UHRF1 4861.566 19p13.3
    JMJD2B 4920.132 19p13.3
    PTPRS 5156.520 19p13.3
    SAFB2 5538.011 19p13.3
    SAFB 5574.164 19p13.3-p13.2
    NRTN 5774.818 19p13.3
    FUT6 5781.637 19p13.3
    FUT3 5793.899 19p13.3
    FUT5 5816.838 19p13.3
    RANBP3 5868.282 19p13.3
    CLPP 6312.463 19p13.3
    ALKBH7 6323.444 19p13.3
    GTF2F1 6330.580 19p13.3
    KHSRP 6364.119 19p13.3
    TNFSF9 6482.037 19p13.3
    CD70 6536.851 19p13
    TNFSF14 6615.566 19p13.3
    C3 6628.847 19p13.3-p13.2
    TRIP10 6690.707 19p13.3
    SH2D3A 6703.175 19p13.3
    MBD3L2 7000.351 19p13.2
    INSR 7063.266 19p13.3-p13.2
    ARHGEF18 7351.866 19p13.3
    XAB2 7590.412 19p13.2
    RETN 7639.972 19p13.2
    FCER2 7659.663 19p13.3
    CD209 7710.883 19p13
    MAP2K7 7874.765 19p13.3-p13.2
    TIMM44 7897.604 19p13.3-p13.2
    ELAVL1 7929.458 19p13.2
    ANGPTL4 8335.011 19p13.3
    RAB11B 8361.296 19p13.2
    PRAM1 8460.941 19p13.2
    MYO1F 8491.999 19p13.3-p13.2
    ADAMTS10 8551.126 19p13.3-p13.2
    MBD3L1 8814.332 19p13.2
    FBXL12 9781.945 19p13.2
    PIN1 9806.999 19p13
    ANGPTL6 10064.013 19p13.2
    PPAN 10077.965 19p13
    ICAM1 10242.779 19p13.3-p13.2
    ICAM4 10258.650 19p13.2-cen
    ICAM5 10261.655 19p13.2
    ICAM3 10305.454 19p13.3-p13.2
    TYK2 10322.209 19p13.2
    CDC37 10362.809 19p13.2
    PDE4A 10388.449 19p13.2
    KEAP1 10457.796 19p13.2
    EDG8 10484.623 19p13.2
    S1PR5 10484.623 19p13.2
    ATG4D 10515.647 19p13.2
    CDKN2D 10538.139 19p13
    AP1M2 10544.348 19p13.2
    CARM1 10843.253 19p13.2
    LOC55908 11209.817 19p13.2
    RAB3D 11296.094 19p13.2
    EPOR 11349.475 19p13.3-p13.2
    RGL3 11366.001 19p13.2
    PRKCSH 11407.269 19p13.2
    CNN1 11510.579 19p13.2-p13.1
    ACP5 11546.477 19p13.3-p13.2
    MORG1 12641.517 19p13.13
    PRDX2 12772.427 19p13.2
    MAST1 12810.348 19p13.2
    FARSA 12894.284 19p13.2
    CALR 12910.423 19p13.3-p13.2
    RAD23A 12917.654 19p13.2
    GADD45GIP1 12925.973 19p13.13
    BTBD14B 13090.109 19p13.13
    IER2 13122.282 19p13.13
    C19orf53 13746.257 19p13.13
    RFX1 13933.353 19p13.1
    TWIST2 13998.501 2q37.3
    IL27RA 14003.262 19p13.11
    PRKACA 14063.509 19p13.1
    ASF1B 14091.322 19p13.12
    DDX39 14380.631 19p13.12
    PKN1 14412.086 19p13.1-p12
    PTGER1 14444.279 19p13.1
    GIPC1 14449.572 19p13.1
    DNAJB1 14486.582 19p13.2
    CASP14 15024.015 19p13.1
    ABHD9 15198.731 19p13.12
    AKAP8 15325.341 19p13.1
    UCA1 15801.171 19p13
    RAB8A 16083.490 19p13.1
    CIB3 16133.180 19p13.12
    CALR3 16450.888 19p13.11
    SIN3B 16801.218 19p13.11
    F2RL3 16860.826 19p12
    NY-SAR-48 17021.573 19p13.11
    NR2F6 17203.695 19p13.1
    PLVAP 17323.264 19p13.2
    INSL3 17788.322 19p13.2-p12
    SLC5A5 17843.782 19p13.2-p12
    IL12RB1 18042.373 19p13.1
    MAST3 18069.603 19p13.11
    IFI30 18145.579 19p13.1
    RAB3A 18168.611 19p13.2
    LSM4 18278.718 19p13.11
    PGPEP1 18312.408 19p13.11
    ISYNA1 18406.625 19p13.11
    FKBP8 18503.568 19p12
    COMP 18754.583 19p13.1
    GDF1 18840.361 19p12
    DDX49 18891.494 19p12
    SLC25A42 19035.808 19p13.11
    RFXANK 19164.008 19p12
    PBX4 19533.524 19p12
    EDG4 19595.477 19p12
    ZNF85 20897.934 19p13.1-p12
    ZNF43 21779.594 19p13.1-p12
    UQCRFS1 34390.007 19q12-q13.1
    CCNE1 34995.401 19q12
    PDCD5 37763.944 19q12-q13.1
    C19orf40 38155.018 19q13.11
    CEBPG 38556.449 19q13.11
    PEPD 38569.703 19q12-q13.2
    GPI 39547.909 19q13.1
    WTIP 39664.720 19q13.11
    HPN 40223.250 19q11-q13.2
    FXYD3 40298.639 19q13.11-q13.12
    FXYD5 40337.467 19q12-q13.1
    LSR 40431.399 19q13.12
    USF2 40451.736 19q13
    CD22 40511.919 19q13.1
    FFAR1 40534.295 19q13.1
    GAPDHS 40716.154 19q13.12
    ETV2 40824.487 19q13.12
    COX6B1 40830.995 19q13.1
    UPK1A 40849.555 19q13.13
    MLL4 40900.761 19q13.1
    PSENEN 40928.334 19q13.12
    HSPB6 40937.310 19q13.12
    HCST 41085.222 19q13.1
    ALKBH6 41191.863 19q13.12
    COX7A1 41333.664 19q13.1
    HKR1 42517.420 19q13.12
    PPP1R14A 43433.719 19q13.1
    SPINT2 43447.042 19q13.1
    C19orf33 43486.644 19q13.2
    RASGRP4 43591.538 19q13.1
    RYR1 43616.180 19q13.1
    MAP4K1 43770.121 19q13.1-q13.4
    ACTN4 43830.167 19q13
    LGALS7 43971.694 19q13.2
    LGALS4 43984.155 19q13.2
    SIRT2 44061.040 19q13
    NFKBIB 44082.455 19q13.1
    PAK4 44308.260 19q13.2
    IL28A 44450.997 19q13.13
    IL29 44478.805 19q13.13
    PAF1 44568.112 19q13.1
    MED29 44573.803 19q13.2
    PLEKHG2 44595.590 19q13.2
    SUPT5H 44628.164 19q13
    DLL3 44681.427 19q13
    LGALS13 44785.009 19q13.1
    CLC 44913.736 19q13.1
    FBL 45016.938 19q13.1
    MAP3K10 45389.491 19q13.2
    HIPK4 45577.019 19q13.2
    SERTAD1 45620.249 19q13.1-q13.2
    SERTAD3 45638.591 19q13.2
    LTBP4 45799.117 19q13.1-q13.2
    NUMBL 45863.654 19q13.13-q13.2
    ADCK4 45889.274 19q13.2
    MIA 45973.140 19q13.32-q13.33
    RAB4B 45976.011 19q13.2
    EGLN2 45998.021 19q13.2
    CYP2A6 46041.284 19q13.2
    CYP2B6 46189.044 19q13.2
    CYP2A13 46286.208 19q13.2
    CYP2F1 46312.193 19q13.2
    CYP2S1 46390.955 19q13.1
    AXL 46416.948 19q13.1
    TGFB1 46528.491 19q13.2|19q13.1
    B3GNT8 46623.105 19q13.2
    CEACAM4 46817.184 19q13.2
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    TDGF2 55124.272 2q37
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    SIGLEC9 56319.977 19q13.41
    SIGLEC7 56337.370 19q13.3
    CD33 56420.147 19q13.3
    DISC2 56646.064 1q42.1
    NRC1 56646.064 3p12
    HAS1 56908.177 19q13.4
    FPR1 56940.839 19q13.4
    FPR2 56958.454 19q13.3-q13.4
    FRA1M 56990.228 1p21.3
    ZNF649 57084.301 19q13.33
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    BIRC8 58484.668 -
    ZNF331 58750.373 19q13.41
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    PRPF31 59310.649 19q13.42
    MBOAT7 59368.921 -
    RPS9 59396.538 19q13.4
    LILRB4 59865.936 19q13.4
    KIR2DL1 59973.077 19q13.4
    KIR3DL1 60019.705 19q13.4
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    KIR3DL2 60053.710 19q13.4
    FCAR 60077.361 19q13.2-q13.4
    NCR1 60109.338 19q13.42
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    SYT5 60376.281 19q|11p
    PTPRH 60384.428 19q13.4
    HSPBP1 60465.520 19q13.42
    BRSK1 60487.346 19q13.4
    SUV420H2 60543.076 19q13.42
    COX6B2 60552.888 19q13.42
    IL11 60567.569 19q13.3-q13.4
    RPL28 60589.112 19q13.4
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    ISOC2 60656.168 19q13.42
    PEG3 62015.615 19q13.4
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    ZNF606 63180.259 19q13.4
    ZSCAN22 63530.197 19q13.43
    RPS5 63590.448 19q13.4
    TRIM28 63747.648 19q13.4
    CHMP2A 63754.746 19q
    UBE2M 63758.891 19q13.43

    GeneCards   GDB - List of genes

    This page should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL Chromosome 19.