Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Digestive Organ Tumors

Atlas classification and Phylum
Colon: Colorectal adenocarcinoma
Esophagus: Barrett's esophagus, dysplasia and adenocarcinoma
Gallbladder: Carcinoma of the gallbladder and extrahepatic bile ducts
Gallbladder: Intrahepatic cholangiocarcinoma
Gastric Tumors: an overview
Inflammatory fibroid polyps
Liver: Adenoma
Liver: Combined hepatocellular and cholangiocarcinoma
Liver: Fibrolamellar carcinoma
Liver: Hepatoblastoma
Liver: Hepatocellular carcinoma
Liver: Mesenchymal hamartoma with t(11;19)(q11;q13) MALAT1/MHLB1
Liver: Nested stromal epithelial tumor
Liver tumors: an overview
Liver: Undifferentiated carcinoma
Pancreas: Solid pseudopapillary tumour of the pancreas with t(11;22)(q24;q12) EWSR1/FLI1
Pancreatic tumors: an overview
 
ACSBG1/IDH3A (15q25)
ADSL/SGSM3 (22q13)
AKAP13/PDE8A (15q25)
ANXA2/RORA (15q22)
ARL6IP1/RPS15A (16p12)
ATG7/RAF1 (3p25)
AZGP1/GJC3 (7q22)
AZGP1/GJC3 (7q22)
B4GALT5/EYA2 (20q13)
CAD/ALK (2p23)
CAPN1/SPDYC (11q13)
CAPZA2/MET (7q31)
CASZ1/MTOR (1p36)
COG8/TERF2 (16q22)
COMMD10/AP3S1 (5q23)
CPNE3/PSKH2 (8q21)
CTBS/GNG5 (1p22)
CTBS/GNG5 (1p22)
CTNNBIP1/CLSTN1 (1p36)
CWC27/RNF180 (5q12)
del(10)(q23q23) PLCE1/CYP2C19
del(10)(q24) NT5C2/ASAH2
del(10)(q25q25) VTI1A/TCF7L2
del(13)(q12q13) PAN3/RFC3
del(19)(p13p13) DNAJB1/PRKACA
DUS4L/BCAP29 (7q22)
E2F3/CDKAL1 (6p22)
EEF1DP3/FRY (13q13)
EIF3A/SFXN4 (10q26)
EIF3E/RSPO2 (8q23)
ESCO1/ABHD3 (18q11)
FGFR2/TACC2 (10q26)
FNDC3B/PRKCI (3q26)
GPR160/SLC7A14 (3q26)
HACL1/COLQ (3p25)
HIST1H4E/HIST1H4B (6p22)
HLA-E/HLA-B (6p21)
HM13/DEFB123 (20q11)
inv(10)(p11p12) ACBD5/ZEB1
inv(12)(p13q24) MED13L/CD4
inv(12)(p13q24) MED13L/LAG3
inv(13)(q13q34) TUBGCP3/PDS5B
inv(20)(q13q13) ATP9A/ARFGEF2
inv(22)(q12q12) SFI1/TPST2
inv(22)(q12q13) CHEK2/PARVB
inv(2)(p23q35) FN1/ALK
inv(3)(p24q13) CFAP44/TGFBR2
IPP/GPBP1L1 (1p34)
KANSL1/ARL17A (17q21)
KANSL1/ARL17A (17q21)
KANSL1/ARL17B (17q21)
KANSL1/ARL17B (17q21)
KIF16B/PCSK2 (20p12)
LACTB2/NCOA2 (8q13)
MAN2A1/FER (5q21)
MAN2A1/FER (5q21)
MAPRE3/ALK (2p23)
NEDD4L/SERPINB5 (18q21)
NOTCH2NL/NBPF10 (1q21)
NRBP2/VPS28 (8q24)
PHACTR4/RCC1 (1p35)
PHC3/EIF5A2 (3q26)
PRKAA1/TTC33 (5p13)
PRMT1/FLT3LG (19q13)
PRR12/PRRG2 (19q13)
PTPRK/RSPO3 (6q22)
PVT1/MYC (8q24)
RHOA/COL7A1 (3p21)
SCNN1A/TNFRSF1A (12p13)
SIDT2/TAGLN (11q23)
SIDT2/TAGLN (11q23)
SIDT2/TAGLN (11q23)
SIPA1L3/SYMPK (19q13)
SLC29A1/HSP90AB1 (6p21)
SLC39A1/CRTC2 (1q21)
SLC39A1/CRTC2 (1q21)
SMARCE1/KRT222 (17q21)
SPAG9/MBTD1 (17q21)
STAG1/MSL2 (3q22)
STRBP/DENND1A (9q33)
t(10;10)(p11;q26) FGFR2/CCDC7
t(10;10)(q21;q26) BICC1/FGFR2
t(10;10)(q21;q26) FGFR2/BICC1
t(10;10)(q25;q26) FGFR2/SHTN1
t(10;11)(q26;p13) CD44/FGFR2
t(10;12)(q26;q12) FGFR2/PPHLN1
t(10;18)(q26;q12) FGFR2/NOL4
t(10;20)(q11;p12) RRBP1/RET
t(1;10)(p13;q26) FGFR2/AHCYL1
t(11;12)(q13;q13) MALAT1/GLI1
t(11;15)(p15;q22) FAM96A/STIM1
t(11;17)(p11;q12) MDK/ERBB2
t(11;18)(q22;q21) BIRC3/MALT1
t(11;18)(q22;q21) BIRC3/MALT1
t(11;18)(q22;q21) BIRC3/MALT1
t(11;18)(q22;q21) BIRC3/MALT1
t(1;11)(p32;q13) CCND1/TACSTD2
t(1;11)(p32;q13) CCND1/TACSTD2
t(11;22)(p12;q12) TTC17/TTC28
t(1;14)(p22;q32) IGH/BCL10
t(1;1)(p12;p13) PTGFRN/NOTCH2
t(1;1)(q22;q23) LMNA/NTRK1
t(1;1)(q23;q25) RABGAP1L/NTRK1
t(12;12)(p13;q13) CD9/ARHGEF25
t(12;19)(p13;p13) GRIN2B/CYP4F3
t(12;22)(q22;q13) ACO2/CRADD
t(1;22)(q21;q12) PDE4DIP/TTC28
t(1;2)(p22;p11) IGK/BCL10
t(1;2)(q41;p23) CENPF/ALK
t(13;13)(q14;q21) KPNA3/PCDH9
t(14;18)(q32;q21) IGH/BCL2
t(14;18)(q32;q21) IGH/BCL2
t(14;18)(q32;q21) IGH/BCL2
t(14;18)(q32;q21) IGH/MALT1
t(14;18)(q32;q21) IGH/MALT1
t(15;20)(q15;q13) NCOA3/SPINT1
t(17;17)(q11;q12) CPD/ERBB2
t(17;17)(q11;q12) NOS2/ERBB2
t(17;17)(q11;q12) ZNF207/ERBB2
t(17;17)(q12;q21) ERBB2/JUP
t(17;19)(q12;p13) TADA2A/MEF2B
t(17;20)(q24;q11) HELZ/SNTA1
t(1;7)(p36;q34) AGTRAP/BRAF
t(18;19)(q21;p13) DYM/DAZAP1
t(19;21)(p13;q21) ARHGEF18/CHODL-AS1
t(2;11)(p11;p15) NAV2/TCF7L1
t(2;15)(p21;q25) EML4/NTRK3
t(2;19)(p13;p13) ANXA4/PKN1
t(2;2)(p16;p23) PPP1R21/ALK
t(2;2)(p23;q35) FN1/ALK
t(2;7)(p23;p22) PRKAR1B/ALK
t(3;22)(q26;q12) SPATA16/TTC28
t(3;5)(q22;q31) CLDN18/ARHGAP26
t(3;7)(p22;q34) MYRIP/BRAF
t(4;10)(p16;q26) FGFR2/TACC3
t(4;4)(p15;q13) ANKRD17/HS3ST1
t(5;10)(q35;q26) FGFR2/NPM1
t(5;5)(q14;q23) LMNB1/HOMER1
t(5;5)(q23;q34) ATP10B/COMMD10
t(5;8)(q23;q11) CDC42SE2/SPIDR
t(6;6)(q22;q23) MAP7/TPD52L1
t(6;6)(q23;q27) EPB41L2/FRMD1
t(6;7)(q21;q31) SOBP/MET
t(7;15)(q34;q24) ETFA/BRAF
t(7;16)(q34;q24) ZC3HAV1L/CHMP1A
t(7;7)(p11;p12) SEPT7P2/PSPH
t(7;7)(q32;q34) SND1/BRAF
t(7;7)(q34;q36) AGAP3/BRAF
t(7;8)(q31;q23) OXR1/MET
t(8;10)(p21;q22) SLC39A14/TSPAN15
t(8;10)(q24;q26) PVT1/ATE1
t(8;11)(q24;p13) APIP/PVT1
t(8;11)(q24;p13) PVT1/PDHX
t(8;8)(p11;p12) GTF2E2/ADAM32
t(8;8)(q21;q24) SAMD12/ZBTB10
t(9;9)(q32;q33) TTLL11/SNX30
TFEB/TRERF1 (6p21)
TFG/ADGRG7 (3q12)
THAP3/TCEA3 (1p36)
TIMM23B/LINC00843 (10q11)
TIMM23B/LINC00843 (10q11)
TIMM23B/LINC00843 (10q11)
TIMM23B/LINC00843 (10q11)
TIMM23B/LINC00843 (10q11)
TIMM23B/LINC00843 (10q11)
TRIM59/IFT80 (3q25)
TSC1/RAPGEF1 (9q34)
t(X;22)(p22;q12) EWSR1/BEND2
t(X;22)(q26;q12) TTC28/HS6ST2
t(X;22)(q28;q12) TTC28/CD99L2
t(X;3)(p22;q22) CLDN18/ARHGAP6
UBA2/WTIP (19q13)
UBE3C/WDR60 (7q36)
USP9X/ERAS (Xp11)
VAMP1/CD27-AS1 (12p13)
VPS45/PLEKHO1 (1q21)

Nosology, Thesaurus and Census of Solid Tumors
Digestive organs

Contributor(s)

WrittenApr 2017Jean-Loup Huret

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Tue Sep 4 13:00:38 CEST 2018

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