Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Neuro-Endocrine/Endocrine Tumors

Atlas classification and Phylum
del(11)(q23q23) KMT2A/FOXR1
del(11)(q23q23) PAFAH1B2/FOXR1
inv(10)(p12q11) ACBD5/RET
inv(12)(p13p13) WNK1/B4GALNT3
inv(15)(q21q25) AKAP13/DMXL2
Neuro-Endocrine/Endocrine system: Adrenal cortical carcinoma
Neuro-Endocrine/Endocrine system: Carcinoid tumors
Neuro-Endocrine/Endocrine system: Phaeochromocytoma
Neuro-Endocrine/Endocrine system: Pituitary adenomas
t(10;10)(q11;q11) TIMM23B/LINC00843
t(10;10)(q11;q11) TIMM23B/LINC00843
t(10;10)(q11;q21) CSGALNACT2/SLC16A9
t(10;10)(q11;q21) RET/ANK3
t(10;10)(q11;q21) RET/CCDC6
t(10;10)(q22;q22) MRPS16/CFAP70
t(10;10)(q22;q26) VCL/FGFR2
t(10;10)(q23;q23) PAPSS2/MINPP1
t(10;10)(q24;q24) ARHGAP19/RRP12
t(10;14)(p11;q32) WARS/CCNY
t(10;15)(q11;q25) AKAP13/RET
t(10;16)(p12;p13) TXNDC11/BAMBI
t(10;17)(q11;p13) MYH13/RET
t(10;17)(q24;q12) GGNBP2/ZDHHC16
t(10;22)(q11;q11) SPECC1L/RET
t(11;11)(p11;p11) AMBRA1/LRP4
t(11;11)(p11;p11) CELF1/FNBP4
t(11;11)(p11;q23) MADD/POU2AF1
t(11;11)(p13;p15) CAPRIN1/CD151
t(11;11)(p15;p15) AP2A2/DRD4
t(11;11)(p15;p15) EIF4G2/NUCB2
t(11;11)(q12;q12) GANAB/LBHD1
t(11;11)(q12;q12) UBXN1/BSCL2
t(11;11)(q13;q13) RPS6KA4/CCDC88B
t(11;11)(q14;q14) CTSC/RAB38
t(11;11)(q14;q14) CTSC/RAB38
t(11;11)(q23;q23) SIDT2/TAGLN
t(11;12)(q24;q22) APLP2/EEA1
t(11;13)(q24;q14) TPT1/SIAE
t(11;14)(p15;q24) IGF2/SNW1
t(11;14)(q24;q32) DYNC1H1/SIAE
t(11;16)(p11;p13) GLIS2/PHF21A
t(11;17)(p15;q25) FN3KRP/KCNQ1
t(11;17)(q13;q22) RNF121/TRIM37
t(11;18)(q22;q21) BIRC3/MALT1
t(11;19)(q13;p13) SCAMP4/COX8A
t(1;11)(p36;q23) SIK3/CTNNBIP1
t(11;20)(q24;q13) APLP2/CD40
t(11;22)(p15;q12) CCDC117/TNNI2
t(1;12)(q21;q24) PEBP1/DENND4B
t(1;12)(q21;q24) S100A6/BCL7A
t(1;17)(q42;p11) NCOR1/RHOU
t(1;19)(q42;p13) RPS15/COA6
t(1;1)(p22;p22) CTBS/GNG5
t(1;1)(p22;p22) CTBS/GNG5
t(1;1)(p22;q23) PRCC/TMED5
t(1;1)(p34;p36) SCMH1/CA6
t(1;1)(p36;p36) CTNNBIP1/CLSTN1
t(1;1)(p36;p36) EXOSC10/MTOR
t(1;1)(p36;p36) KIF1B/PGD
t(1;1)(p36;p36) SPSB1/H6PD
t(1;1)(q21;q21) INTS3/CHTOP
t(1;1)(q21;q21) NOTCH2NL/NBPF10
t(1;1)(q21;q21) VPS45/PLEKHO1
t(1;1)(q23;q23) SLAMF1/CD1A
t(1;1)(q23;q42) IRF2BP2/NTRK1
t(12;12)(q13;q13) HDAC7/VDR
t(12;12)(q13;q13) RNF41/CS
t(12;12)(q13;q14) RASSF3/DAZAP2
t(12;12)(q13;q21) SPATS2/TSPAN8
t(12;12)(q22;q23) NTN4/PAH
t(12;12)(q22;q23) PAH/METAP2
t(12;12)(q24;q24) MAPKAPK5/ALDH2
t(12;12)(q24;q24) PXN/PLA2G1B
t(12;15)(p13;q25) NTRK3/ETV6
t(12;19)(q22;p13) BSG/EEA1
t(12;19)(q23;p13) C3/ELK3
t(1;21)(q32;q22) CHI3L1/CBS
t(12;20)(q23;q13) COL9A3/ELK3
t(1;2)(p32;q13) LRP8/PAX8
t(1;2)(p32;q13) PAX8/GLIS1
t(13;13)(q13;q13) EEF1DP3/FRY
t(13;13)(q13;q13) EEF1DP3/FRY
t(14;14)(q13;q32) BRMS1L/ZNF839
t(14;14)(q24;q24) DLST/YLPM1
t(14;14)(q24;q24) FLVCR2/BATF
t(14;14)(q24;q24) MAP3K9/MED6
t(14;14)(q24;q31) GTF2A1/POMT2
t(14;14)(q32;q32) RCOR1/PPP2R5C
t(14;17)(q24;q21) CIPC/NGFR
t(14;18)(q24;q12) FHOD3/ESRRB
t(15;15)(q15;q15) ITPKA/NUSAP1
t(15;15)(q15;q15) MGA/NUSAP1
t(15;15)(q15;q23) UACA/LTK
t(15;15)(q22;q22) HERC1/DAPK2
t(15;15)(q26;q26) IQGAP1/ZNF774
t(1;5)(p34;p13) MMACHC/TTC23L
t(1;5)(q23;q14) SSBP2/NTRK1
t(1;5)(q23;q35) SQSTM1/NTRK1
t(16;16)(p13;p13) KCTD5/TSC2
t(16;16)(q22;q22) CYB5B/TERF2
t(16;16)(q22;q23) PSMD7/PDPR
t(16;16)(q23;q23) CMIP/BCO1
t(16;16)(q23;q24) GAS8/WDR59
t(16;16)(q24;q24) ANKRD11/DPEP1
t(16;18)(p12;q11) SS18/SLC5A11
t(16;19)(q24;p13) NFIC/SPATA33
t(17;17)(p11;p11) LLGL1/ALKBH5
t(17;17)(p13;q22) CHD3/RAD51C
t(17;17)(q11;q11) NF1/RAB11FIP4
t(17;17)(q21;q21) KANSL1/ARL17A
t(17;17)(q21;q21) KANSL1/ARL17A
t(17;17)(q21;q21) KANSL1/ARL17B
t(17;17)(q21;q21) KANSL1/ARL17B
t(17;17)(q21;q21) KAT7/IGF2BP1
t(17;17)(q21;q25) RECQL5/CACNA1G
t(17;17)(q21;q25) SEPT9/KRT32
t(17;17)(q23;q23) ERN1/TEX2
t(17;17)(q23;q24) TLK2/CEP112
t(17;17)(q25;q25) ASPSCR1/HGS
t(17;19)(q21;q13) WNK4/ZNF787
t(17;19)(q25;p13) SEPT9/VAV1
t(17;20)(p13;q11) WRAP53/AHCY
t(17;20)(q12;p11) ACACA/MGME1
t(1;7)(p31;p14) DNAJC6/PDE1C
t(1;7)(p34;q34) BRAF/MACF1
t(1;7)(p34;q34) MACF1/BRAF
t(1;7)(p36;p22) AJAP1/CYTH3
t(1;7)(q23;p14) TRG/NTRK1
t(18;18)(q12;q12) FHOD3/ELP2
t(18;18)(q12;q12) RNF138/RNF125
t(18;19)(q12;q13) ZNF616/TRAPPC8
t(19;19)(p13;p13) DNM2/QTRT1
t(19;19)(p13;p13) FKBP8/HAUS8
t(19;19)(p13;p13) LDLR/ZGLP1
t(19;19)(p13;p13) MBD3/PALM
t(19;19)(p13;p13) MED16/R3HDM4
t(19;19)(p13;p13) RAB8A/PLVAP
t(19;19)(p13;p13) ZGLP1/LDLR
t(19;19)(q13;q13) BCKDHA/TMEM91
t(19;19)(q13;q13) HSD17B14/PLEKHA4
t(19;19)(q13;q13) PRX/BLVRB
t(19;19)(q13;q13) TGFB1/HNRNPUL1
t(19;20)(p13;p12) CDS2/MAST3
t(19;20)(q13;p12) PLCB1/WTIP
t(19;22)(q13;q11) KIAA1671/CLPTM1
t(20;20)(p11;q13) RALGAPA2/ZNFX1
t(20;20)(q11;q11) PHF20/SPAG4
t(2;11)(p23;q13) MALAT1/ALK
t(2;11)(q35;q24) IGFBP5/SIAE
t(21;21)(q22;q22) IFNAR1/IL10RB
t(21;21)(q22;q22) WRB/SH3BGR
t(2;16)(p23;p13) TXNDC11/CIB4
t(22;22)(q11;q12) HPS4/CABIN1
t(22;22)(q12;q12) ZNRF3/EMID1
t(22;22)(q13;q13) MKL1/SLC25A17
t(22;22)(q13;q13) RRP7A/PACSIN2
t(2;2)(p13;p23) GFPT1/ALK
t(2;2)(p22;p22) SOS1/MAP4K3
t(2;2)(p23;p23) PPP1CB/PLB1
t(2;2)(p24;q21) NBAS/CCNT2
t(2;2)(p24;q23) FAM49A/RIF1
t(2;2)(p24;q24) NBAS/BAZ2B
t(2;2)(p24;q32) MYCN/GULP1
t(2;2)(q13;q31) PAX8/NFE2L2
t(2;2)(q21;q35) IGFBP5/ARHGEF4
t(2;2)(q22;q32) LRP1B/GULP1
t(2;2)(q33;q33) PGAP1/HSPD1
t(2;2)(q37;q37) DGKD/SAG
t(2;5)(p23;q12) ASXL2/PPWD1
t(2;6)(p22;q25) IYD/BIRC6
t(2;6)(p25;p21) CNPY3/TPO
t(2;7)(p11;q11) TMEM248/ATOH8
t(2;7)(p21;p15) IGF2BP3/THADA
t(2;7)(p21;p15) RPS2P32/THADA
t(2;7)(p21;p15) THADA/IGF2BP3
t(2;7)(p21;p15) TRA2A/THADA
t(2;7)(p23;q11) GTF2IRD1/ALK
t(2;7)(q24;q34) TANK/BRAF
t(2;8)(p21;q24) TG/THADA
t(2;8)(q33;q24) CLK1/NAPRT
t(3;10)(p21;q24) ARHGAP19/ELP6
t(3;10)(q26;q11) TBL1XR1/RET
t(3;15)(q26;q25) PLD1/AGBL1
t(3;19)(p13;p13) PLVAP/FOXP1
t(3;3)(p14;p14) FAM19A4/TMF1
t(3;3)(p14;p14) PXK/RPP14
t(3;3)(p21;p21) PRKAR2A/SLC25A20
t(3;3)(p22;p22) ITGA9/GOLGA4
t(3;3)(p25;p25) BRK1/FANCD2
t(3;3)(p25;p25) HACL1/COLQ
t(3;3)(q12;q12) TFG/ADGRG7
t(3;3)(q13;q22) LSAMP/STAG1
t(3;3)(q21;q21) ZXDC/UROC1
t(3;4)(q21;p12) MYLK/TXK
t(3;5)(p25;q13) AGGF1/RAF1
t(3;5)(p25;q13) RAF1/AGGF1
t(3;6)(q27;p21) SENP2/MSH5
t(3;6)(q27;q21) AP2M1/SEC63
t(3;7)(p24;q34) RBMS3/BRAF
t(3;7)(q12;q31) MET/TFG
t(3;7)(q12;q31) TFG/MET
t(3;8)(q27;p23) CTSB/EIF4A2
t(3;9)(p21;p21) CACNA2D3/IFT74
t(3;9)(p21;p21) IFT74/CACNA2D3
t(3;9)(p22;q33) GSN/CTNNB1
t(4;17)(p15;p13) SLC34A2/CLDN7
t(4;17)(q31;q21) UBTF/MAML3
t(4;18)(q31;q21) TCF4/MAML3
t(4;4)(q31;q31) DCLK2/LRBA
t(5;10)(q35;q11) SQSTM1/RET
t(5;12)(q33;p13) GPX3/CHD4
t(5;5)(p13;p13) PRKAA1/TTC33
t(5;5)(p13;p15) MTMR12/TERT
t(5;5)(p13;q13) RICTOR/ANKRD31
t(5;5)(p13;q14) DAB2/ARSB
t(5;5)(p15;p15) CTNND2/TRIO
t(5;5)(p15;q14) ADGRV1/CLPTM1L
t(5;5)(p15;q34) ANKH/TENM2
t(5;5)(p15;q35) EXOC3/ERGIC1
t(5;5)(q11;q11) PARP8/ANKRD55
t(5;5)(q13;q13) SERF1A/SMN2
t(5;5)(q13;q14) TNPO1/MEF2C
t(5;5)(q21;q35) NSD1/EFNA5
t(5;5)(q22;q31) APC/REEP2
t(5;5)(q22;q32) DCP2/IL17B
t(5;5)(q32;q35) PRELID2/MAPK9
t(5;5)(q33;q35) GPX3/SQSTM1
t(5;5)(q35;q35) NSD1/ZNF346
t(5;5)(q35;q35) UIMC1/DBN1
t(5;6)(q33;q21) GPX3/SEC63
t(5;7)(q14;q34) AP3B1/BRAF
t(5;7)(q14;q34) BRAF/AP3B1
t(5;7)(q33;q34) BRAF/FAM114A2
t(5;7)(q33;q34) FAM114A2/BRAF
t(5;8)(p13;p22) DNAJC21/SGCZ
t(6;10)(q25;p14) TAF3/ZDHHC14
t(6;11)(p21;q12) MSH5/BSCL2
t(6;13)(p21;q14) HLA-B/RNASEH2B
t(6;13)(q25;q14) SCAF8/VWA8
t(6;19)(p21;p13) PLVAP/ABCF1
t(6;19)(q21;p13) GPX4/SEC63
t(6;19)(q21;p13) JUNB/SEC63
t(6;20)(q25;q13) IGF2R/ARFGEF2
t(6;21)(q21;q21) APP/SEC63
t(6;6)(p12;p21) NFKBIE/FBXO9
t(6;6)(p21;p21) AARS2/SPATS1
t(6;6)(p21;p21) SLC29A1/HSP90AB1
t(6;6)(p21;p21) UBR2/PXT1
t(6;6)(q21;q25) TMEM242/PREP
t(6;6)(q22;q22) NT5DC1/SLC35F1
t(6;6)(q23;q23) MAP7/AHI1
t(6;6)(q25;q25) ZDHHC14/TMEM242
t(6;7)(p21;q11) EIF4H/AARS2
t(6;9)(p21;q33) GSN/HLA-DPB1
t(7;10)(p13;q26) FGFR2/OGDH
t(7;10)(q34;p11) CCNY/BRAF
t(7;11)(q36;q24) PDIA4/SIAE
t(7;12)(q34;p13) ERC1/BRAF
t(7;13)(q11;q22) POR/PIBF1
t(7;16)(q34;p13) BRAF/CIITA
t(7;17)(q34;q21) RUNDC1/BRAF
t(7;7)(p14;p14) TRGC2/TRGJP1
t(7;7)(p14;q32) RBM28/AOAH
t(7;7)(p14;q32) VPS41/CEP41
t(7;7)(p14;q34) BRAF/SUGCT
t(7;7)(p15;q34) KLHL7/BRAF
t(7;7)(q21;q21) DYNC1I1/ASB4
t(7;7)(q22;q22) SRPK2/PUS7
t(7;7)(q32;q33) CREB3L2/CPA2
t(7;7)(q32;q34) BRAF/SND1
t(7;7)(q32;q34) SND1/BRAF
t(8;10)(q22;q21) VPS13B/CCDC6
t(8;15)(p12;q25) NTRK3/RBPMS
t(8;15)(p12;q25) RBPMS/NTRK3
t(8;21)(p23;q22) CTSB/CBS
t(9;10)(q32;q11) FKBP15/RET
t(9;15)(q33;q25) GSN/AKAP13
t(9;16)(q34;p11) YPEL3/EXD3
t(9;16)(q34;q24) QSOX2/CTU2
t(9;17)(p13;q25) TBCD/GLIPR2
t(9;17)(p24;q23) INTS2/GLIS3
t(9;9)(q21;q21) GKAP1/KIF27
t(9;9)(q22;q22) COL15A1/ANKS6
t(9;9)(q33;q33) NR5A1/NR6A1
t(9;9)(q34;q34) NCS1/GPR107
t(9;9)(q34;q34) NUP188/PHYHD1
t(9;9)(q34;q34) SEC16A/NOTCH1
t(9;9)(q34;q34) ZMYND19/ARRDC1
Thyroid: Anaplastic (undifferentiated) carcinoma
Thyroid: Medullary carcinoma
Thyroid: Oncocytic tumors
Thyroid: Papillary carcinoma/Adenocarcinoma
Thyroid: Papillary carcinoma with inv(10)(p12.1q11.2) ACBD5/RET
Thyroid: Papillary Carcinoma with inv(7)(q21q34) AKAP9/BRAF
t(X;10)(p22;q26) FGFR2/OFD1
t(X;10)(p22;q26) FGFR2/OFD1
t(X;10)(p22;q26) OFD1/FGFR2
t(X;X)(p11;p11) HSD17B10/USP11
t(X;X)(p11;p11) JADE3/SSX2
t(X;X)(p11;p11) KDM6A/FUNDC1
t(X;X)(p11;p21) KDM6A/DMD
t(X;X)(p22;p22) REPS2/APOO
t(X;X)(p22;p22) REPS2/TXLNG
t(X;X)(q22;q22) TRMT2B/ARL13A
t(X;X)(q26;q26) HTATSF1/BRS3

Nosology, Thesaurus and Census of Solid Tumors
Neuro-Endocrine/Endocrine system

Contributor(s)

WrittenApr 2017Jean-Loup Huret

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Fri Jun 15 17:44:14 CEST 2018

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