Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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Head and Neck Tumors

Section Editor - Cécile Badoual and Hélène Blons
cecile.badoual@egp.aphp.fr   helene.blons@parisdescartes.fr   

Atlas classification and Phylum
Eye: Posterior uveal melanoma
Eye: Retinoma
Eye tumors: an overview
Head and Neck: Ear: Endolymphatic Sac Tumor (ELST)
Head and Neck: Epidermoid carcinoma
Head and Neck: Iris Hamartomas
Head and Neck: Laryngeal squamous cell carcinoma
Head and Neck: Laryngeal tumors: an overview
Head and Neck: Odontogenic tumor: Ameloblastoma
Head and Neck: Oral leukoplakia
Head and Neck: Oral squamous cell carcinoma
Head and Neck: Paraganglioma: an overview
Head and Neck: Pleomorphic salivary gland adenoma with ins(8)(q12;q11q11) TCEA1/PLAG1
Head and Neck: Pleomorphic salivary gland adenoma with inv(8)(q12q12) CHCHD7/PLAG1
Head and Neck: Primary oral mucosal melanoma
Head and neck: Retinoblastoma
Head and Neck: Salivary gland tumors: Adenoid cystic carcinoma with t(6;9)(q23;p24) MYB/PDCD1LG2
Head and Neck: Salivary gland tumors: an overview
Head and Neck: Salivary gland tumors: Mucoepidermoid carcinoma with t(6;22)(p21;q12) EWSR1/POU5F1
Head and Neck: Salivary gland tumors: Warthin's tumors
Head and Neck: Squamous cell carcinoma: an overview
Head and Neck: Thymus: Thymoma: an overview
 
ABCB9/MPHOSPH9 (12q24)
ABL1/EXOSC2 (9q34)
AGAP1/UBE2F (2q37)
AK3/RCL1 (9p24)
ANKRD39/FAM178B (2q11)
AP2A2/TRIM22 (11p15)
ARNTL/TEAD1 (11p15)
ASCC1/MICU1 (10q22)
ASH2L/C8orf86 (8p11)
AZGP1/GJC3 (7q22)
BAIAP2L2/PLA2G6 (22q13)
BAIAP2/TBCD (17q25)
BCR/UPB1 (22q11)
C1orf21/LAMC1 (1q25)
CBFA2T2/HM13 (20q11)
CBFB/CES4A (16q22)
CCAR2/SORBS3 (8p21)
CELSR1/PACSIN2 (22q13)
CHM/KLHL4 (Xq21)
CHST11/HCFC2 (12q23)
CHST11/RFX4 (12q23)
CPT1A/FGF3 (11q13)
CS/MUCL1 (12q13)
CSNK1D/SECTM1 (17q25)
DCAKD/MAP3K14 (17q21)
del(12)(q12q21) NELL2/ATXN7L3B
del(6)(q22q23) MAN1A1/MYB
del(9)(q34q34) VAV2/QSOX2
DGCR8/SGSM1 (22q11)
DHX15/RBPJ (4p15)
DNM1/LCN2 (9q34)
DTD1/RALGAPA2 (20p11)
DYNLL1/COQ5 (12q24)
DYRK1A/RUNX1 (21q22)
EBPL/LPAR6 (13q14)
EFTUD2/KRT24 (17q21)
EIF4G3/LIN28A (1p36)
EPS15/OSBPL9 (1p32)
ESPN/FBLIM1 (1p36)
EXT1/SAMD12 (8q24)
FAM69A/LRRC8D (1p22)
FAM83G/GRAP (17p11)
FANCC/C9orf3 (9q22)
FAT1/ACSL1 (4q35)
FAT1/CFAP97 (4q35)
FHOD3/MOCOS (18q12)
FILIP1L/IMPG2 (3q12)
FLT3LG/ALDH16A1 (19q13)
FUS/PRSS36 (16p11)
GRK5/PDZD8 (10q26)
GTF2H3/DDX55 (12q24)
GTF2I/CLIP2 (7q11)
HBG2/TRIM22 (11p15)
HERC4/CTNNA3 (10q21)
HIRA/BCL2L13 (22q11)
HMGA2/WIF1 (12q14)
HSD11B1L/SAFB (19p13)
HSD17B12/TP53I11 (11p11)
HSPB11/ZCCHC11 (1p32)
IL20RB/NCK1 (3q22)
ins(3;12)(p14;q14q14) HMGA2/FHIT
IP6K1/TRAIP (3p21)
IRAK2/SRGAP3 (3p25)
ITCH/DEFB118 (20q11)
JAK2/GLDC (9p24)
LDLR/DNM2 (19p13)
LMAN2L/FAM178B (2q11)
LRP5/CLPB (11q13)
LYPD1/NCKAP5 (2q21)
LYST/DISC1 (1q42)
MACF1/AKIRIN1 (1p34)
MAPKAPK2/SRGAP2 (1q32)
MFF/COL4A3 (2q36)
MGRN1/SNX29 (16p13)
MIRLET7BHG/SCUBE1 (22q13)
MPP6/OSBPL3 (7p15)
MTURN/PLEKHA8 (7p14)
MVP/ZNF267 (16p11)
MYO1B/STAT4 (2q32)
NCEH1/SPATA16 (3q26)
NFX1/ARHGEF39 (9p13)
NIPBL/SPEF2 (5p13)
NOL9/DNAJC11 (1p36)
NR2F6/USHBP1 (19p13)
NRP2/PARD3B (2q33)
NUAK2/LEMD1 (1q32)
NXN/WRAP53 (17p13)
OLFM2/COL5A3 (19p13)
OPA3/EML2 (19q13)
OSBPL1A/RIOK3 (18q11)
OSGIN2/RIPK2 (8q21)
PEMT/RAI1 (17p11)
PHACTR2/PLAGL1 (6q24)
PHLDB2/CD96 (3q13)
PIK3R3/ZSWIM5 (1p34)
PIP5K1C/MATK (19p13)
PITX1/P4HA2 (5q31)
PLA2R1/ITGB6 (2q24)
PPIL2/KIAA1671 (22q11)
PPP1R37/ZNF224 (19q13)
PPP1R37/ZNF225 (19q13)
PPP3CC/PIWIL2 (8p21)
PRKAA1/TTC33 (5p13)
PTGES3/NACA (12q13)
RAB9A/EGFL6 (Xp22)
RACGAP1/CERS5 (12q13)
RAI1/PEMT (17p11)
RAP1A/CD2 (1p13)
RASSF5/IKBKE (1q32)
RBBP8/TAF4B (18q11)
RCC1/SERINC2 (1p35)
RCL1/PLGRKT (9p24)
RIOK3/TAF4B (18q11)
RNF150/TTC29 (4q31)
RNF152/PIGN (18q21)
RNH1/HRAS (11p15)
SCAF1/FLT3LG (19q13)
SCAP/SMARCC1 (3p21)
SCNN1A/DCP1B (12p13)
SETX/TTF1 (9q34)
SH3BP1/CACNA1I (22q13)
SIK1/HUNK (21q22)
SKAP2/SNX10 (7p15)
SLBP/LETM1 (4p16)
SLC16A9/ANK3 (10q21)
SLC2A12/SGK1 (6q23)
SLC3A2/POLR2G (11q12)
SLX4IP/CDS2 (20p12)
SMARCA2/DMRT1 (9p24)
SMU1/B4GALT1 (9p21)
SMURF1/AZGP1 (7q22)
SNRNP40/EPB41 (1p35)
SNTB2/TANGO6 (16q22)
SNX14/SYNCRIP (6q14)
SRGAP3/ATP2B2 (3p25)
SRPK2/ATXN7L1 (7q22)
SRRM2/PRSS33 (16p13)
SUPT7L/RBKS (2p23)
t(10;10)(p11;p12) PARD3/ARMC4
t(10;10)(p11;q25) ARHGAP12/SORCS3
t(10;10)(q11;q23) SGMS1/GRID1
t(10;11)(p15;q23) DIP2C/TECTA
t(10;11)(q22;p15) VCL/ABCC8
t(10;16)(q26;q22) LHPP/TANGO6
t(10;17)(p12;q24) GNA13/BMI1
t(10;17)(q23;q21) KRT14/CYP2C18
t(10;17)(q26;q12) MYO19/STK32C
t(1;10)(q42;p11) FBXO28/LYZL2
t(1;10)(q42;q11) CDC42BPA/PRKG1
t(11;11)(q12;q13) MS4A7/C2CD3
t(11;11)(q12;q14) AAMDC/SCGB1D1
t(11;11)(q13;q14) ALG8/FGF19
t(11;11)(q13;q22) FCHSD2/GUCY1A2
t(11;11)(q13;q22) SART1/CNTN5
t(11;11)(q21;q22) PANX1/CEP126
t(11;11)(q21;q22) YAP1/MAML2
t(11;13)(q23;q32) CLDN10/TTC12
t(11;15)(q13;q26) LTBP3/CERS3
t(11;15)(q21;q26) CRTC3/MAML2
t(11;16)(q12;q13) GLYAT/NLRC5
t(11;17)(q13;p13) FCHSD2/GLOD4
t(11;17)(q23;q25) OAF/SLC26A11
t(11;17)(q23;q25) SLC26A11/OAF
t(11;18)(p11;q23) PARD6G/CHST1
t(11;18)(q12;q12) FHOD3/MS4A15
t(11;18)(q22;q21) BIRC3/MALT1
t(11;18)(q22;q21) BIRC3/MALT1
t(11;18)(q22;q21) BIRC3/MALT1
t(11;19)(q13;p13) HNRNPM/PC
t(11;19)(q13;p13) LRP5/ZNF317
t(11;19)(q24;q13) CKM/SIAE
t(1;11)(p36;q13) NUMA1/SFN
t(11;20)(q13;q11) MARK2/BPIFA2
t(11;21)(q13;q22) CTTN/CBS
t(11;22)(q13;q11) DGCR2/ANO1
t(1;12)(p36;q23) SFN/ELK3
t(1;12)(q21;p13) NCAPD2/PRPF3
t(1;12)(q25;q21) LAMC2/POC1B
t(1;14)(p36;q12) ARID1A/PRKD1
t(1;15)(p32;q14) DHCR24/THBS1
t(1;19)(q21;p13) R3HDM4/S100A9
t(1;1)(p32;p35) YIPF1/YTHDF2
t(1;1)(p35;p36) DNAJC8/KDF1
t(1;1)(p35;p36) KPNA6/RHCE
t(1;1)(p35;p36) WDTC1/TMEM39B
t(1;1)(p36;q42) OBSCN/CASZ1
t(12;12)(q12;q13) ALG10B/IGFBP6
t(12;12)(q12;q13) HOXC4/ADAMTS20
t(12;12)(q12;q21) KIF21A/TSPAN8
t(12;12)(q13;q14) SLC16A7/CALCOCO1
t(12;13)(p12;q12) HSPH1/PLEKHA5
t(12;13)(q23;q34) COL4A1/ELK3
t(12;14)(q24;q13) NAA25/SLC25A21
t(12;17)(p13;q25) P4HB/YBX3
t(12;19)(q23;p13) AES/ELK3
t(12;20)(q12;q11) ADAMTS20/CBFA2T2
t(12;20)(q13;q13) MYL6/ZNFX1
t(12;20)(q24;q13) NCOR2/DDX27
t(12;20)(q24;q13) PTPN1/P2RX4
t(12;21)(q23;q22) COL6A2/ELK3
t(1;22)(p13;q11) IGSF3/GGT1
t(1;22)(q23;q13) TRABD/DDR2
t(1;22)(q24;q12) MGST3/ZMAT5
t(1;22)(q44;q13) TEF/KIF26B
t(1;2)(p22;q12) IL18R1/MCOLN2
t(1;2)(q32;q32) LAMB3/NAB1
t(1;3)(p34;p21) SCMH1/SHISA5
t(1;3)(q21;q25) ENSA/AADACL2
t(14;14)(q22;q32) VRK1/SAMD4A
t(14;14)(q23;q24) RAD51B/DACT1
t(14;14)(q23;q32) SYNE2/ITPK1
t(14;18)(q32;q21) IGH/MALT1
t(14;18)(q32;q21) IGH/MALT1
t(14;19)(q11;p13) FARSA/AP1G2
t(14;20)(q22;q11) FRMD6/BPIFB1
t(1;4)(p35;q12) PUM1/KIAA1211
t(15;15)(q14;q25) THBS1/AGBL1
t(15;15)(q15;q21) SPG11/JMJD7
t(15;15)(q15;q25) EIF2AK4/ANKRD34C
t(15;15)(q21;q23) MAP2K5/RAB27A
t(15;16)(q26;p11) CLN3/C15orf32
t(1;5)(p35;q31) RCC1/UBE2D2
t(1;5)(q41;p15) TAF1A/SLC12A7
t(16;19)(q12;q12) FTO/ZNF536
t(1;6)(p36;p21) PRRC2A/SFN
t(1;6)(q21;q14) S100A8/MYO6
t(17;17)(q11;q12) NLK/RAD51D
t(17;18)(q11;q21) SUPT6H/MRO
t(17;20)(q21;q13) KRT14/ARFGEF2
t(17;22)(p13;q12) EWSR1/ABR
t(1;7)(p31;p11) EGFR/ACADM
t(18;18)(q11;q12) ROCK1/B4GALT6
t(18;18)(q11;q21) ROCK1/DCC
t(18;18)(q21;q22) NEDD4L/CDH19
t(18;19)(q23;p13) ZNF236/ZNF627
t(1;8)(p21;q11) SPIDR/SNX7
t(19;19)(p13;q13) NDUFA7/PRKCG
t(19;19)(p13;q13) TNFSF14/GRAMD1A
t(19;19)(q12;q13) TSHZ3/IFNL1
t(19;20)(q13;q11) SAMHD1/YIF1B
t(20;20)(p11;p12) SLX4IP/SLC24A3
t(20;20)(p11;q11) KIF3B/NINL
t(20;20)(p12;p13) FKBP1A/CDS2
t(20;20)(p13;q11) EPB41L1/TGM3
t(20;21)(q11;q21) USP16/CNBD2
t(2;10)(p23;q23) EXOC6/DTNB
t(2;10)(q32;p11) NCKAP1/PARD3
t(21;21)(q21;q22) USP25/PCNT
t(2;12)(q11;q14) TMBIM4/TMEM131
t(2;13)(q32;q32) PCCA/FSIP2
t(2;14)(q37;q24) NCL/RBM25
t(2;17)(q37;q23) TUBD1/INPP5D
t(2;18)(q33;q23) PARD6G/RFTN2
t(2;19)(q32;q12) MYO1B/ZNF536
t(2;21)(p21;q21) ATP6V1E2/GRIK1
t(22;22)(q11;q12) BCR/TOM1
t(22;22)(q11;q13) CBX7/VPREB1
t(22;22)(q12;q13) LIMK2/ATXN10
t(22;22)(q12;q13) PRR14L/SOX10
t(22;22)(q12;q13) TBC1D10A/POLR3H
t(2;2)(p16;p23) FOXN2/PLB1
t(2;2)(p22;q37) HDLBP/BIRC6
t(2;2)(q12;q13) ANAPC1/RGPD3
t(2;2)(q22;q23) MBD5/ACVR2A
t(2;2)(q31;q33) METTL8/RFTN2
t(2;2)(q31;q33) NFE2L2/RFTN2
t(2;3)(q32;q26) GOLIM4/SLC40A1
t(2;3)(q37;q22) PSMD1/ATP2C1
t(2;4)(q36;q31) PAX3/MAML3
t(2;5)(q11;q35) CANX/IL1R2
t(2;7)(p23;q33) DTNB/CNOT4
t(2;7)(q32;q11) HSPB1/MYO1B
t(2;8)(q31;q24) SP3/PTK2
t(2;8)(q34;q24) ATAD2/ERBB4
t(2;9)(p12;p24) GLIS3/CTNNA2
t(3;10)(q26;q22) DNAJC19/ADK
t(3;12)(q22;q13) IL20RB/NR4A1
t(3;12)(q22;q13) NR4A1/IL20RB
t(3;14)(q26;q13) EAPP/USP13
t(3;16)(q29;q22) CBFB/ATP13A3
t(3;21)(p21;q22) PCNT/POC1A
t(3;3)(p11;p14) CGGBP1/MITF
t(3;3)(p14;p25) MAGI1/DPH3
t(3;3)(p25;p26) VGLL4/CHL1
t(3;3)(q13;q26) NAALADL2/DRD3
t(3;3)(q21;q25) HACD2/RSRC1
t(3;3)(q26;q27) ACTL6A/ALG3
t(3;3)(q26;q29) ATP11B/TFRC
t(3;4)(q28;p16) FGFR3/TPRG1
t(3;5)(p21;p15) ARIH2/TRIO
t(3;7)(q26;q21) CACNA2D1/NAALADL2
t(3;8)(p13;q11) FOXP1/PXDNL
t(4;10)(p16;q22) ADD1/ADK
t(4;11)(q23;q23) ADH7/CXCR5
t(4;13)(p16;q14) TSC22D1/LETM1
t(4;4)(q12;q13) TMPRSS11D/SPINK2
t(4;4)(q21;q22) MAPK10/CCSER1
t(4;6)(q31;q23) MAP3K5/ARFIP1
t(5;10)(q13;q25) IQGAP2/ATRNL1
t(5;11)(q32;q13) HMGXB3/CAPN1
t(5;14)(p15;q23) TRIO/PPP2R5E
t(5;16)(q14;p13) CREBBP/ATG10
t(5;20)(p15;q13) CLPTM1L/ARFGEF2
t(5;5)(q12;q23) KIF2A/ADAMTS19
t(5;5)(q33;q35) SGCD/LCP2
t(5;6)(p14;p21) NUDT3/CDH12
t(5;6)(q32;p21) HLA-C/TCOF1
t(5;7)(q34;p22) RARS/MAD1L1
t(5;8)(p15;p11) SLC20A2/ANKH
t(5;9)(q13;p24) PIK3R1/KANK1
t(5;9)(q14;p22) NFIB/XRCC4
t(6;13)(q12;q12) SACS/PHF3
t(6;14)(p12;q32) DST/FBLN5
t(6;14)(p21;q23) MAX/RUNX2
t(6;14)(p21;q23) RUNX2/MAX
t(6;14)(p21;q32) IGH/CCND3
t(6;19)(p21;q13) RPL18/ABCF1
t(6;19)(p21;q13) RPL18/CFB
t(6;6)(p21;p22) ATF6B/CMAHP
t(6;6)(p21;p22) TNXB/CMAHP
t(6;6)(p22;p23) RANBP9/CDKAL1
t(6;6)(p24;p25) FARS2/PHACTR1
t(6;7)(q25;p22) MTHFD1L/RNF216
t(6;7)(q25;p22) RNF216/MTHFD1L
t(6;8)(p12;q11) COL21A1/EFCAB1
t(6;8)(q26;q24) NSMCE2/PACRG
t(6;9)(q14;p22) MYO6/NFIB
t(6;9)(q22;p22) NFIB/MAN1A1
t(6;9)(q23;p22) MAP3K5/NFIB
t(6;9)(q24;p22) NFIB/AIG1
t(7;11)(p22;p15) FSCN1/FAR1
t(7;11)(p22;p15) MAD1L1/SERGEF
t(7;11)(q34;q23) TTC12/LUC7L2
t(7;12)(p22;p13) CD9/IQCE
t(7;13)(q21;q32) ABCC4/ABCB4
t(7;17)(p15;p13) HNRNPA2B1/RABEP1
t(7;18)(p11;q21) EGFR/DYM
t(7;19)(p14;p13) VPS41/AES
t(7;7)(p14;p22) DPY19L1/SDK1
t(7;7)(p21;q22) CUX1/THSD7A
t(7;7)(q11;q21) MTERF1/PHTF2
t(7;7)(q11;q36) KMT2C/GTF2IRD1
t(7;7)(q21;q22) SRPK2/KIAA1324L
t(7;7)(q22;q31) LAMB1/ATXN7L1
t(7;7)(q22;q31) LAMB1/PUS7
t(7;7)(q31;q32) PTPRZ1/TSPAN33
t(8;12)(q22;q24) RITA1/GRHL2
t(8;13)(q22;q14) GRHL2/KCNRG
t(8;13)(q22;q14) GRHL2/TRIM13
t(8;14)(q13;q24) MYBL1/RAD51B
t(8;15)(q12;q25) LYN/NTRK3
t(8;16)(q22;q12) UBR5/ZNF423
t(8;17)(q24;p13) RPL8/RABEP1
t(8;20)(p12;q11) TPX2/UNC5D
t(8;20)(q24;q11) SAMD12/SAMHD1
t(8;22)(q22;q13) GRHL2/CDPF1
t(8;8)(p12;q13) PDE7A/NRG1
t(8;8)(q12;q13) MYBL1/YTHDF3
t(8;9)(p11;p23) PTPRD/IDO1
t(8;9)(q13;p22) MYBL1/NFIB
t(8;9)(q21;q21) MAMDC2/MRPS28
t(8;9)(q21;q21) MAMDC2/TPD52
t(9;10)(q33;q25) TNC/COL17A1
t(9;10)(q34;p12) KIAA1217/FCN1
t(9;11)(q31;q13) ERP44/CHRDL2
t(9;13)(q21;q12) PAN3/NTRK2
t(9;14)(p24;q32) IGH/KDM4C
t(9;14)(p24;q32) IGH/KDM4C
t(9;17)(p13;p11) TMEM11/UBAP1
t(9;17)(p23;q25) PTPRD/CYGB
t(9;19)(q33;p13) NFIX/RALGPS1
t(9;20)(q33;q13) GSN/DDX27
t(9;21)(q33;q22) COL18A1/HSPA5
t(9;9)(p13;p21) APTX/NOL6
t(9;9)(p21;p22) ZDHHC21/ELAVL2
t(9;9)(p22;p24) RIC1/BNC2
t(9;9)(p22;q32) SNX30/CNTLN
t(9;9)(q33;q34) DENND1A/PRRX2
TBC1D19/ANAPC4 (4p15)
TBC1D22A/GCAT (22q13)
TBC1D23/ABI3BP (3q12)
TIAM1/PCBP3 (21q22)
TIMM23B/LINC00843 (10q11)
TMED10/TTLL5 (14q24)
TMEM51/KAZN (1p36)
TOM1L2/ATPAF2 (17p11)
TPX2/DUSP15 (20q11)
TPX2/RALY (20q11)
TRAF3/CDC42BPB (14q32)
TRAPPC9/PTK2 (8q24)
TSC1/DOLPP1 (9q34)
TTC7B/PPP2R5C (14q32)
TUFT1/CGN (1q21)
t(X;13)(p11;q14) USP9X/MRPS31
t(X;14)(p11;q12) DDX3X/PRKD1
t(X;2)(q28;q31) BGN/TTN
t(X;4)(p11;p12) HUWE1/GUF1
t(X;4)(q13;p14) KLHL5/SLC16A2
t(X;6)(q28;p24) TMLHE/NEDD9
t(X;9)(q11;p24) MSN/RLN2
UBE3C/PTPRN2 (7q36)
USP39/CD8B (2p11)
VCL/SEC24C (10q22)
VMP1/PTRH2 (17q23)
WDR36/NREP (5q22)
WDR82/NT5DC2 (3p21)
XPR1/TOR3A (1q25)
ZNF385B/FKBP7 (2q31)
ZNF609/PDCD7 (15q22)

Nosology, Thesaurus and Census of Solid Tumors
Head and Neck

Contributor(s)

WrittenApr 2017Cécile Badoual and Hélène Blons and Jean-Loup Huret

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Tue Dec 18 12:31:20 CET 2018

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